MAP kinase-activated protein kinase 2
Homo sapiens
当前结构中的状态
| Assembly | 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与共同组分 | 实验方法与环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白拷贝数一致 | 链 A; UniProt 41–400 | 未记录 | Mitogen-activated protein kinase 14 × 1 (Q16539) 39G N-[5-(dimethylsulfamoyl)-2-methylphenyl]-1-phenyl-5-propyl-1H-pyrazole-4-carboxamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件:VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.3;295 K;100mM HEPES pH 7.3, 3.5% PEG 8000, 1% MPD, 1% DMSO. 1.0 M(NH4)2SO4 in the reservoir | 分辨率 3.70 Å R-free 0.297 |
| 2 | 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白拷贝数一致 | 链 C; UniProt 41–400 | 未记录 | Mitogen-activated protein kinase 14 × 1 (Q16539) 39G N-[5-(dimethylsulfamoyl)-2-methylphenyl]-1-phenyl-5-propyl-1H-pyrazole-4-carboxamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件:VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.3;295 K;100mM HEPES pH 7.3, 3.5% PEG 8000, 1% MPD, 1% DMSO. 1.0 M(NH4)2SO4 in the reservoir | 分辨率 3.70 Å R-free 0.297 |
| 3 | 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白拷贝数一致 | 链 E; UniProt 41–400 | 未记录 | Mitogen-activated protein kinase 14 × 1 (Q16539) 39G N-[5-(dimethylsulfamoyl)-2-methylphenyl]-1-phenyl-5-propyl-1H-pyrazole-4-carboxamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件:VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.3;295 K;100mM HEPES pH 7.3, 3.5% PEG 8000, 1% MPD, 1% DMSO. 1.0 M(NH4)2SO4 in the reservoir | 分辨率 3.70 Å R-free 0.297 |
| 4 | 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白拷贝数一致 | 链 G; UniProt 41–400 | 未记录 | Mitogen-activated protein kinase 14 × 1 (Q16539) 39G N-[5-(dimethylsulfamoyl)-2-methylphenyl]-1-phenyl-5-propyl-1H-pyrazole-4-carboxamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件:VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.3;295 K;100mM HEPES pH 7.3, 3.5% PEG 8000, 1% MPD, 1% DMSO. 1.0 M(NH4)2SO4 in the reservoir | 分辨率 3.70 Å R-free 0.297 |
数据库中的同蛋白其他状态
以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。
| 其他 PDB | 相对当前条目 6TCA | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法与环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1KWP Crystal Structure of MAPKAP2 提交 2002-01-30 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
1–400(400 aa)
|
未记录 | HG MERCURY (II) ION × 7 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 5.15;298 K;2 M Na/K phosphate, pH 5.15, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 2.80 Å R-free 0.245 |
| 1KWP Crystal Structure of MAPKAP2 提交 2002-01-30 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 B
1–400(400 aa)
|
未记录 | HG MERCURY (II) ION × 7 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 5.15;298 K;2 M Na/K phosphate, pH 5.15, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 2.80 Å R-free 0.245 |
| 1KWP Crystal Structure of MAPKAP2 提交 2002-01-30 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 3 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 6 PDB 声明:hexameric |
链 A
1–400(400 aa)
链 B
1–400(400 aa)
|
未记录 | HG MERCURY (II) ION × 42 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 5.15;298 K;2 M Na/K phosphate, pH 5.15, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 2.80 Å R-free 0.245 |
| 1NXK Crystal structure of staurosporine bound to MAP KAP kinase 2 提交 2003-02-10 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
1–400(400 aa)
片段:MK2
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | STU STAUROSPORINE × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.5;296 K;2M ammonium sulfate, 100 mM HEPES pH 7.5, 2% PEG 400, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 296K
|
分辨率 2.70 Å R-free 0.274 |
| 1NXK Crystal structure of staurosporine bound to MAP KAP kinase 2 提交 2003-02-10 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 B
1–400(400 aa)
片段:MK2
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | STU STAUROSPORINE × 1 SO4 SULFATE ION × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.5;296 K;2M ammonium sulfate, 100 mM HEPES pH 7.5, 2% PEG 400, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 296K
|
分辨率 2.70 Å R-free 0.274 |
| 1NXK Crystal structure of staurosporine bound to MAP KAP kinase 2 提交 2003-02-10 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 3 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 C
1–400(400 aa)
片段:MK2
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | STU STAUROSPORINE × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.5;296 K;2M ammonium sulfate, 100 mM HEPES pH 7.5, 2% PEG 400, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 296K
|
分辨率 2.70 Å R-free 0.274 |
| 1NXK Crystal structure of staurosporine bound to MAP KAP kinase 2 提交 2003-02-10 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 4 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 D
1–400(400 aa)
片段:MK2
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | STU STAUROSPORINE × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.5;296 K;2M ammonium sulfate, 100 mM HEPES pH 7.5, 2% PEG 400, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 296K
|
分辨率 2.70 Å R-free 0.274 |
| 1NXK Crystal structure of staurosporine bound to MAP KAP kinase 2 提交 2003-02-10 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 5 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 12 PDB 声明:dodecameric |
链 A
1–400(400 aa)
片段:MK2
链 B
1–400(400 aa)
片段:MK2
链 C
1–400(400 aa)
片段:MK2
链 D
1–400(400 aa)
片段:MK2
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | STU STAUROSPORINE × 12 SO4 SULFATE ION × 6 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.5;296 K;2M ammonium sulfate, 100 mM HEPES pH 7.5, 2% PEG 400, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 296K
|
分辨率 2.70 Å R-free 0.274 |
| 1NY3 Crystal structure of ADP bound to MAP KAP kinase 2 提交 2003-02-11 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
1–400(400 aa)
|
未记录 | ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;296 K;2.0M Ammonium Sulfate, pH unbuffered, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 296K
|
分辨率 3.00 Å R-free 0.292 |
| 1NY3 Crystal structure of ADP bound to MAP KAP kinase 2 提交 2003-02-11 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 12 PDB 声明:dodecameric |
链 A
1–400(400 aa)
|
未记录 | ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 12 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;296 K;2.0M Ammonium Sulfate, pH unbuffered, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 296K
|
分辨率 3.00 Å R-free 0.292 |
| 2JBO Protein kinase MK2 in complex with an inhibitor (crystal form-1, soaking) 提交 2006-12-09 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
41–364(324 aa)
片段:KINASE DOMAIN, RESIDUES 41-364
|
未记录 | PO4 PHOSPHATE ION × 1 P4O 2-(2-QUINOLIN-3-YLPYRIDIN-4-YL)-1,5,6,7-TETRAHYDRO-4H-PYRROLO[3,2-C]PYRIDIN-4-ONE × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 4.5;1.5-1.6M SODIUM POTASSIUM PHOSPHATE PH 4.5, 0.014M DEOXY-BIGCHAP. THE INHIBITOR WAS SOAKED INTO CRYSTALS GROWN INITIALLY FROM MK2-ADP
|
分辨率 3.10 Å R-free 0.274 |
| 2JBP Protein kinase MK2 in complex with an inhibitor (crystal form-2, co- crystallization) 提交 2006-12-09 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
41–364(324 aa)
片段:KINASE DOMAIN, RESIDUES 41-364
|
未记录 | P4O 2-(2-QUINOLIN-3-YLPYRIDIN-4-YL)-1,5,6,7-TETRAHYDRO-4H-PYRROLO[3,2-C]PYRIDIN-4-ONE × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 7.5;1.8-2.0M SODIUM POTTASIUM PHOSPHATE PH 7.5, 0.0003M INHIBITOR
|
分辨率 3.31 Å R-free 0.279 |
| 2JBP Protein kinase MK2 in complex with an inhibitor (crystal form-2, co- crystallization) 提交 2006-12-09 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 10 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 J
41–364(324 aa)
片段:KINASE DOMAIN, RESIDUES 41-364
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 7.5;1.8-2.0M SODIUM POTTASIUM PHOSPHATE PH 7.5, 0.0003M INHIBITOR
|
分辨率 3.31 Å R-free 0.279 |
| 2JBP Protein kinase MK2 in complex with an inhibitor (crystal form-2, co- crystallization) 提交 2006-12-09 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 11 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 K
41–364(324 aa)
片段:KINASE DOMAIN, RESIDUES 41-364
|
未记录 | P4O 2-(2-QUINOLIN-3-YLPYRIDIN-4-YL)-1,5,6,7-TETRAHYDRO-4H-PYRROLO[3,2-C]PYRIDIN-4-ONE × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 7.5;1.8-2.0M SODIUM POTTASIUM PHOSPHATE PH 7.5, 0.0003M INHIBITOR
|
分辨率 3.31 Å R-free 0.279 |
| 2JBP Protein kinase MK2 in complex with an inhibitor (crystal form-2, co- crystallization) 提交 2006-12-09 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 12 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 L
41–364(324 aa)
片段:KINASE DOMAIN, RESIDUES 41-364
|
未记录 | P4O 2-(2-QUINOLIN-3-YLPYRIDIN-4-YL)-1,5,6,7-TETRAHYDRO-4H-PYRROLO[3,2-C]PYRIDIN-4-ONE × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 7.5;1.8-2.0M SODIUM POTTASIUM PHOSPHATE PH 7.5, 0.0003M INHIBITOR
|
分辨率 3.31 Å R-free 0.279 |
| 2JBP Protein kinase MK2 in complex with an inhibitor (crystal form-2, co- crystallization) 提交 2006-12-09 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 B
41–364(324 aa)
片段:KINASE DOMAIN, RESIDUES 41-364
|
未记录 | P4O 2-(2-QUINOLIN-3-YLPYRIDIN-4-YL)-1,5,6,7-TETRAHYDRO-4H-PYRROLO[3,2-C]PYRIDIN-4-ONE × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 7.5;1.8-2.0M SODIUM POTTASIUM PHOSPHATE PH 7.5, 0.0003M INHIBITOR
|
分辨率 3.31 Å R-free 0.279 |
| 2JBP Protein kinase MK2 in complex with an inhibitor (crystal form-2, co- crystallization) 提交 2006-12-09 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 3 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 C
41–364(324 aa)
片段:KINASE DOMAIN, RESIDUES 41-364
|
未记录 | P4O 2-(2-QUINOLIN-3-YLPYRIDIN-4-YL)-1,5,6,7-TETRAHYDRO-4H-PYRROLO[3,2-C]PYRIDIN-4-ONE × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 7.5;1.8-2.0M SODIUM POTTASIUM PHOSPHATE PH 7.5, 0.0003M INHIBITOR
|
分辨率 3.31 Å R-free 0.279 |
| 2JBP Protein kinase MK2 in complex with an inhibitor (crystal form-2, co- crystallization) 提交 2006-12-09 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 4 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 D
41–364(324 aa)
片段:KINASE DOMAIN, RESIDUES 41-364
|
未记录 | P4O 2-(2-QUINOLIN-3-YLPYRIDIN-4-YL)-1,5,6,7-TETRAHYDRO-4H-PYRROLO[3,2-C]PYRIDIN-4-ONE × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 7.5;1.8-2.0M SODIUM POTTASIUM PHOSPHATE PH 7.5, 0.0003M INHIBITOR
|
分辨率 3.31 Å R-free 0.279 |
| 2JBP Protein kinase MK2 in complex with an inhibitor (crystal form-2, co- crystallization) 提交 2006-12-09 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 5 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 E
41–364(324 aa)
片段:KINASE DOMAIN, RESIDUES 41-364
|
未记录 | P4O 2-(2-QUINOLIN-3-YLPYRIDIN-4-YL)-1,5,6,7-TETRAHYDRO-4H-PYRROLO[3,2-C]PYRIDIN-4-ONE × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 7.5;1.8-2.0M SODIUM POTTASIUM PHOSPHATE PH 7.5, 0.0003M INHIBITOR
|
分辨率 3.31 Å R-free 0.279 |
| 2JBP Protein kinase MK2 in complex with an inhibitor (crystal form-2, co- crystallization) 提交 2006-12-09 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 6 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 F
41–364(324 aa)
片段:KINASE DOMAIN, RESIDUES 41-364
|
未记录 | P4O 2-(2-QUINOLIN-3-YLPYRIDIN-4-YL)-1,5,6,7-TETRAHYDRO-4H-PYRROLO[3,2-C]PYRIDIN-4-ONE × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 7.5;1.8-2.0M SODIUM POTTASIUM PHOSPHATE PH 7.5, 0.0003M INHIBITOR
|
分辨率 3.31 Å R-free 0.279 |
| 2JBP Protein kinase MK2 in complex with an inhibitor (crystal form-2, co- crystallization) 提交 2006-12-09 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 7 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 G
41–364(324 aa)
片段:KINASE DOMAIN, RESIDUES 41-364
|
未记录 | P4O 2-(2-QUINOLIN-3-YLPYRIDIN-4-YL)-1,5,6,7-TETRAHYDRO-4H-PYRROLO[3,2-C]PYRIDIN-4-ONE × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 7.5;1.8-2.0M SODIUM POTTASIUM PHOSPHATE PH 7.5, 0.0003M INHIBITOR
|
分辨率 3.31 Å R-free 0.279 |
| 2JBP Protein kinase MK2 in complex with an inhibitor (crystal form-2, co- crystallization) 提交 2006-12-09 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 8 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 H
41–364(324 aa)
片段:KINASE DOMAIN, RESIDUES 41-364
|
未记录 | P4O 2-(2-QUINOLIN-3-YLPYRIDIN-4-YL)-1,5,6,7-TETRAHYDRO-4H-PYRROLO[3,2-C]PYRIDIN-4-ONE × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 7.5;1.8-2.0M SODIUM POTTASIUM PHOSPHATE PH 7.5, 0.0003M INHIBITOR
|
分辨率 3.31 Å R-free 0.279 |
| 2JBP Protein kinase MK2 in complex with an inhibitor (crystal form-2, co- crystallization) 提交 2006-12-09 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 9 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 I
41–364(324 aa)
片段:KINASE DOMAIN, RESIDUES 41-364
|
未记录 | P4O 2-(2-QUINOLIN-3-YLPYRIDIN-4-YL)-1,5,6,7-TETRAHYDRO-4H-PYRROLO[3,2-C]PYRIDIN-4-ONE × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 7.5;1.8-2.0M SODIUM POTTASIUM PHOSPHATE PH 7.5, 0.0003M INHIBITOR
|
分辨率 3.31 Å R-free 0.279 |
| 2OKR Crystal Structure of the P38a-MAPKAP kinase 2 Heterodimer 提交 2007-01-17 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 C
370–393(24 aa)
片段:residues 370-393
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.2;298 K;25% Peg 3350, 250 mM Sodium Formate, pH 7.2, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.272 |
| 2OKR Crystal Structure of the P38a-MAPKAP kinase 2 Heterodimer 提交 2007-01-17 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 F
370–393(24 aa)
片段:residues 370-393
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.2;298 K;25% Peg 3350, 250 mM Sodium Formate, pH 7.2, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.272 |
| 2ONL Crystal Structure of the p38a-MAPKAP kinase 2 Heterodimer 提交 2007-01-24 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 C
1–400(400 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 7.5;298 K;3.75% Peg 2000, 100mM Hepes, Prior to crystallization, 1-s-nonyl-1-b-D-thioglucoside (1xcmc) and heptanetriol (1.5%) was added to the protein sample, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K, pH 7.50
|
分辨率 4.00 Å R-free 0.331 |
| 2ONL Crystal Structure of the p38a-MAPKAP kinase 2 Heterodimer 提交 2007-01-24 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 D
1–400(400 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 7.5;298 K;3.75% Peg 2000, 100mM Hepes, Prior to crystallization, 1-s-nonyl-1-b-D-thioglucoside (1xcmc) and heptanetriol (1.5%) was added to the protein sample, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K, pH 7.50
|
分辨率 4.00 Å R-free 0.331 |
| 2OZA Structure of p38alpha complex 提交 2007-02-25 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 A
47–400(354 aa)
片段:MK2
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6;298 K;5 to 20% PEG 4000, 100mM Na Citrate, 5mM DTT, pH 6.0, vapor diffusion, hanging drop, temperature 298K
|
分辨率 2.70 Å R-free 0.296 |
| 2P3G Crystal structure of a pyrrolopyridine inhibitor bound to MAPKAP Kinase-2 提交 2007-03-08 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 X
45–371(327 aa)
片段:N- and C-terminally truncated
|
未记录 | F10 2-[2-(2-FLUOROPHENYL)PYRIDIN-4-YL]-1,5,6,7-TETRAHYDRO-4H-PYRROLO[3,2-C]PYRIDIN-4-ONE × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 5.4;298 K;Protein solution (5 mg/ml) euqilibrated against 1.6 - 2.0 M sodium malonate at pH 5.4, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298.0K
|
分辨率 3.80 Å R-free 0.374 |
| 2PZY Structure of MK2 Complexed with Compound 76 提交 2007-05-18 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
41–364(324 aa)
片段:MAPK-Activated protein kinase 2
|
未记录 | B18 (4R)-N-[4-({[2-(DIMETHYLAMINO)ETHYL]AMINO}CARBONYL)-1,3-THIAZOL-2-YL]-4-METHYL-1-OXO-2,3,4,9-TETRAHYDRO-1H-BETA-CARBOLINE-6-CARBOXAMIDE × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.5;297 K;100 mM HEPES pH 7.5, 1.85 M AMMONIUM SULFATE, vapor diffusion, hanging drop, temperature 297K
|
分辨率 2.90 Å R-free 0.313 |
| 2PZY Structure of MK2 Complexed with Compound 76 提交 2007-05-18 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 B
41–364(324 aa)
片段:MAPK-Activated protein kinase 2
|
未记录 | B18 (4R)-N-[4-({[2-(DIMETHYLAMINO)ETHYL]AMINO}CARBONYL)-1,3-THIAZOL-2-YL]-4-METHYL-1-OXO-2,3,4,9-TETRAHYDRO-1H-BETA-CARBOLINE-6-CARBOXAMIDE × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.5;297 K;100 mM HEPES pH 7.5, 1.85 M AMMONIUM SULFATE, vapor diffusion, hanging drop, temperature 297K
|
分辨率 2.90 Å R-free 0.313 |
| 2PZY Structure of MK2 Complexed with Compound 76 提交 2007-05-18 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 3 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 C
41–364(324 aa)
片段:MAPK-Activated protein kinase 2
|
未记录 | STU STAUROSPORINE × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.5;297 K;100 mM HEPES pH 7.5, 1.85 M AMMONIUM SULFATE, vapor diffusion, hanging drop, temperature 297K
|
分辨率 2.90 Å R-free 0.313 |
| 2PZY Structure of MK2 Complexed with Compound 76 提交 2007-05-18 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 4 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 D
41–364(324 aa)
片段:MAPK-Activated protein kinase 2
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.5;297 K;100 mM HEPES pH 7.5, 1.85 M AMMONIUM SULFATE, vapor diffusion, hanging drop, temperature 297K
|
分辨率 2.90 Å R-free 0.313 |
| 2PZY Structure of MK2 Complexed with Compound 76 提交 2007-05-18 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 5 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 12 PDB 声明:dodecameric |
链 A
41–364(324 aa)
片段:MAPK-Activated protein kinase 2
链 B
41–364(324 aa)
片段:MAPK-Activated protein kinase 2
链 C
41–364(324 aa)
片段:MAPK-Activated protein kinase 2
链 D
41–364(324 aa)
片段:MAPK-Activated protein kinase 2
|
未记录 | B18 (4R)-N-[4-({[2-(DIMETHYLAMINO)ETHYL]AMINO}CARBONYL)-1,3-THIAZOL-2-YL]-4-METHYL-1-OXO-2,3,4,9-TETRAHYDRO-1H-BETA-CARBOLINE-6-CARBOXAMIDE × 6 STU STAUROSPORINE × 3 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.5;297 K;100 mM HEPES pH 7.5, 1.85 M AMMONIUM SULFATE, vapor diffusion, hanging drop, temperature 297K
|
分辨率 2.90 Å R-free 0.313 |
| 3A2C Crystal structure of a pyrazolopyrimidine inhibitor complex bound to MAPKAP Kinase-2 (MK2) 提交 2009-05-12 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 12 PDB 声明:dodecameric |
链 A
41–364(324 aa)
片段:kinase domaine, residues 41-364
链 B
41–364(324 aa)
片段:kinase domaine, residues 41-364
链 C
41–364(324 aa)
片段:kinase domaine, residues 41-364
链 D
41–364(324 aa)
片段:kinase domaine, residues 41-364
链 E
41–364(324 aa)
片段:kinase domaine, residues 41-364
链 F
41–364(324 aa)
片段:kinase domaine, residues 41-364
链 G
41–364(324 aa)
片段:kinase domaine, residues 41-364
链 H
41–364(324 aa)
片段:kinase domaine, residues 41-364
链 I
41–364(324 aa)
片段:kinase domaine, residues 41-364
链 J
41–364(324 aa)
片段:kinase domaine, residues 41-364
链 K
41–364(324 aa)
片段:kinase domaine, residues 41-364
链 L
41–364(324 aa)
片段:kinase domaine, residues 41-364
|
未记录 | PDY N~7~-(4-ethoxyphenyl)-6-methyl-N~5~-[(3S)-piperidin-3-yl]pyrazolo[1,5-a]pyrimidine-5,7-diamine × 24 SO4 SULFATE ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.90 Å R-free 0.335 |
| 3FPM Crystal Structure of a Squarate Inhibitor bound to MAPKAP Kinase-2 提交 2009-01-05 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
41–364(324 aa)
片段:Protein kinase domain
|
未记录 | 793 3-{[(1R)-1-phenylethyl]amino}-4-(pyridin-4-ylamino)cyclobut-3-ene-1,2-dione × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 5;296 K;1600 mM Sodium Malonate pH 5, 1 % MPD, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 296K
|
分辨率 3.30 Å R-free 0.337 |
| 3FPM Crystal Structure of a Squarate Inhibitor bound to MAPKAP Kinase-2 提交 2009-01-05 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 12 PDB 声明:dodecameric |
链 A
41–364(324 aa)
片段:Protein kinase domain
|
未记录 | 793 3-{[(1R)-1-phenylethyl]amino}-4-(pyridin-4-ylamino)cyclobut-3-ene-1,2-dione × 12 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 5;296 K;1600 mM Sodium Malonate pH 5, 1 % MPD, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 296K
|
分辨率 3.30 Å R-free 0.337 |
| 3FYJ Crystal structure of an optimzied benzothiophene inhibitor bound to MAPKAP Kinase-2 (MK-2) 提交 2009-01-22 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric |
链 X
45–371(327 aa)
片段:MK-2 kinase module and the auto-inhibitory domain
|
未记录 | B97 (10R)-10-methyl-3-(6-methylpyridin-3-yl)-9,10,11,12-tetrahydro-8H-[1,4]diazepino[5',6':4,5]thieno[3,2-f]quinolin-8-one × 3 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 5.4;298 K;MK-2 protein at 5 mg/ml is equilibrated against a well solution of 1.6 - 2.0 M Sodium malonate at pH 5.4, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 3.80 Å R-free 0.388 |
| 3FYJ Crystal structure of an optimzied benzothiophene inhibitor bound to MAPKAP Kinase-2 (MK-2) 提交 2009-01-22 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 X
45–371(327 aa)
片段:MK-2 kinase module and the auto-inhibitory domain
|
未记录 | B97 (10R)-10-methyl-3-(6-methylpyridin-3-yl)-9,10,11,12-tetrahydro-8H-[1,4]diazepino[5',6':4,5]thieno[3,2-f]quinolin-8-one × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 5.4;298 K;MK-2 protein at 5 mg/ml is equilibrated against a well solution of 1.6 - 2.0 M Sodium malonate at pH 5.4, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 3.80 Å R-free 0.388 |
| 3FYK Crystal structure of a benzthiophene lead bound to MAPKAP Kinase-2 (MK-2) 提交 2009-01-22 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric |
链 X
45–371(327 aa)
片段:MK-2 kinase module and the auto-inhibitory domain
|
未记录 | B98 (3R)-3-(aminomethyl)-9-methoxy-1,2,3,4-tetrahydro-5H-[1]benzothieno[3,2-e][1,4]diazepin-5-one × 3 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 5.4;298 K;MK-2 protein at 5 mg/ml equilibrated against a well solution of 1.6 - 2.0 M Sodium malonate at pH 5.4, vapor diffusion, hanging drop, temperature 298K
|
分辨率 3.50 Å R-free 0.296 |
| 3FYK Crystal structure of a benzthiophene lead bound to MAPKAP Kinase-2 (MK-2) 提交 2009-01-22 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 X
45–371(327 aa)
片段:MK-2 kinase module and the auto-inhibitory domain
|
未记录 | B98 (3R)-3-(aminomethyl)-9-methoxy-1,2,3,4-tetrahydro-5H-[1]benzothieno[3,2-e][1,4]diazepin-5-one × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 5.4;298 K;MK-2 protein at 5 mg/ml equilibrated against a well solution of 1.6 - 2.0 M Sodium malonate at pH 5.4, vapor diffusion, hanging drop, temperature 298K
|
分辨率 3.50 Å R-free 0.296 |
| 3GOK Binding site mapping of protein ligands 提交 2009-03-19 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 12 PDB 声明:dodecameric |
链 A
41–364(324 aa)
片段:Protein kinase domain
链 B
41–364(324 aa)
片段:Protein kinase domain
链 C
41–364(324 aa)
片段:Protein kinase domain
链 D
41–364(324 aa)
片段:Protein kinase domain
链 E
41–364(324 aa)
片段:Protein kinase domain
链 F
41–364(324 aa)
片段:Protein kinase domain
链 G
41–364(324 aa)
片段:Protein kinase domain
链 H
41–364(324 aa)
片段:Protein kinase domain
链 I
41–364(324 aa)
片段:Protein kinase domain
链 J
41–364(324 aa)
片段:Protein kinase domain
链 K
41–364(324 aa)
片段:Protein kinase domain
链 L
41–364(324 aa)
片段:Protein kinase domain
|
未记录 | P4O 2-(2-QUINOLIN-3-YLPYRIDIN-4-YL)-1,5,6,7-TETRAHYDRO-4H-PYRROLO[3,2-C]PYRIDIN-4-ONE × 12 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 4.2;273 K;40% ethanol, 5% PEG1000, 100mM phosphate-citrate, pH 4.2, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 273K
|
分辨率 3.20 Å R-free 0.258 |
| 3GOK Binding site mapping of protein ligands 提交 2009-03-19 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 10 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 E
41–364(324 aa)
片段:Protein kinase domain
|
未记录 | P4O 2-(2-QUINOLIN-3-YLPYRIDIN-4-YL)-1,5,6,7-TETRAHYDRO-4H-PYRROLO[3,2-C]PYRIDIN-4-ONE × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 4.2;273 K;40% ethanol, 5% PEG1000, 100mM phosphate-citrate, pH 4.2, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 273K
|
分辨率 3.20 Å R-free 0.258 |
| 3GOK Binding site mapping of protein ligands 提交 2009-03-19 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 11 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 F
41–364(324 aa)
片段:Protein kinase domain
|
未记录 | P4O 2-(2-QUINOLIN-3-YLPYRIDIN-4-YL)-1,5,6,7-TETRAHYDRO-4H-PYRROLO[3,2-C]PYRIDIN-4-ONE × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 4.2;273 K;40% ethanol, 5% PEG1000, 100mM phosphate-citrate, pH 4.2, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 273K
|
分辨率 3.20 Å R-free 0.258 |
| 3GOK Binding site mapping of protein ligands 提交 2009-03-19 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 12 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 G
41–364(324 aa)
片段:Protein kinase domain
|
未记录 | P4O 2-(2-QUINOLIN-3-YLPYRIDIN-4-YL)-1,5,6,7-TETRAHYDRO-4H-PYRROLO[3,2-C]PYRIDIN-4-ONE × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 4.2;273 K;40% ethanol, 5% PEG1000, 100mM phosphate-citrate, pH 4.2, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 273K
|
分辨率 3.20 Å R-free 0.258 |
| 3GOK Binding site mapping of protein ligands 提交 2009-03-19 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 13 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 H
41–364(324 aa)
片段:Protein kinase domain
|
未记录 | P4O 2-(2-QUINOLIN-3-YLPYRIDIN-4-YL)-1,5,6,7-TETRAHYDRO-4H-PYRROLO[3,2-C]PYRIDIN-4-ONE × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 4.2;273 K;40% ethanol, 5% PEG1000, 100mM phosphate-citrate, pH 4.2, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 273K
|
分辨率 3.20 Å R-free 0.258 |
| 3GOK Binding site mapping of protein ligands 提交 2009-03-19 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 14 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 I
41–364(324 aa)
片段:Protein kinase domain
|
未记录 | P4O 2-(2-QUINOLIN-3-YLPYRIDIN-4-YL)-1,5,6,7-TETRAHYDRO-4H-PYRROLO[3,2-C]PYRIDIN-4-ONE × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 4.2;273 K;40% ethanol, 5% PEG1000, 100mM phosphate-citrate, pH 4.2, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 273K
|
分辨率 3.20 Å R-free 0.258 |
| 3GOK Binding site mapping of protein ligands 提交 2009-03-19 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 15 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 J
41–364(324 aa)
片段:Protein kinase domain
|
未记录 | P4O 2-(2-QUINOLIN-3-YLPYRIDIN-4-YL)-1,5,6,7-TETRAHYDRO-4H-PYRROLO[3,2-C]PYRIDIN-4-ONE × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 4.2;273 K;40% ethanol, 5% PEG1000, 100mM phosphate-citrate, pH 4.2, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 273K
|
分辨率 3.20 Å R-free 0.258 |
| 3GOK Binding site mapping of protein ligands 提交 2009-03-19 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 16 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 K
41–364(324 aa)
片段:Protein kinase domain
|
未记录 | P4O 2-(2-QUINOLIN-3-YLPYRIDIN-4-YL)-1,5,6,7-TETRAHYDRO-4H-PYRROLO[3,2-C]PYRIDIN-4-ONE × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 4.2;273 K;40% ethanol, 5% PEG1000, 100mM phosphate-citrate, pH 4.2, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 273K
|
分辨率 3.20 Å R-free 0.258 |
| 3GOK Binding site mapping of protein ligands 提交 2009-03-19 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 17 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 L
41–364(324 aa)
片段:Protein kinase domain
|
未记录 | P4O 2-(2-QUINOLIN-3-YLPYRIDIN-4-YL)-1,5,6,7-TETRAHYDRO-4H-PYRROLO[3,2-C]PYRIDIN-4-ONE × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 4.2;273 K;40% ethanol, 5% PEG1000, 100mM phosphate-citrate, pH 4.2, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 273K
|
分辨率 3.20 Å R-free 0.258 |
| 3GOK Binding site mapping of protein ligands 提交 2009-03-19 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric |
链 A
41–364(324 aa)
片段:Protein kinase domain
链 B
41–364(324 aa)
片段:Protein kinase domain
链 C
41–364(324 aa)
片段:Protein kinase domain
|
未记录 | P4O 2-(2-QUINOLIN-3-YLPYRIDIN-4-YL)-1,5,6,7-TETRAHYDRO-4H-PYRROLO[3,2-C]PYRIDIN-4-ONE × 3 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 4.2;273 K;40% ethanol, 5% PEG1000, 100mM phosphate-citrate, pH 4.2, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 273K
|
分辨率 3.20 Å R-free 0.258 |
| 3GOK Binding site mapping of protein ligands 提交 2009-03-19 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 3 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric |
链 D
41–364(324 aa)
片段:Protein kinase domain
链 E
41–364(324 aa)
片段:Protein kinase domain
链 F
41–364(324 aa)
片段:Protein kinase domain
|
未记录 | P4O 2-(2-QUINOLIN-3-YLPYRIDIN-4-YL)-1,5,6,7-TETRAHYDRO-4H-PYRROLO[3,2-C]PYRIDIN-4-ONE × 3 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 4.2;273 K;40% ethanol, 5% PEG1000, 100mM phosphate-citrate, pH 4.2, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 273K
|
分辨率 3.20 Å R-free 0.258 |
| 3GOK Binding site mapping of protein ligands 提交 2009-03-19 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 4 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric |
链 G
41–364(324 aa)
片段:Protein kinase domain
链 H
41–364(324 aa)
片段:Protein kinase domain
链 I
41–364(324 aa)
片段:Protein kinase domain
|
未记录 | P4O 2-(2-QUINOLIN-3-YLPYRIDIN-4-YL)-1,5,6,7-TETRAHYDRO-4H-PYRROLO[3,2-C]PYRIDIN-4-ONE × 3 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 4.2;273 K;40% ethanol, 5% PEG1000, 100mM phosphate-citrate, pH 4.2, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 273K
|
分辨率 3.20 Å R-free 0.258 |
| 3GOK Binding site mapping of protein ligands 提交 2009-03-19 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 5 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric |
链 J
41–364(324 aa)
片段:Protein kinase domain
链 K
41–364(324 aa)
片段:Protein kinase domain
链 L
41–364(324 aa)
片段:Protein kinase domain
|
未记录 | P4O 2-(2-QUINOLIN-3-YLPYRIDIN-4-YL)-1,5,6,7-TETRAHYDRO-4H-PYRROLO[3,2-C]PYRIDIN-4-ONE × 3 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 4.2;273 K;40% ethanol, 5% PEG1000, 100mM phosphate-citrate, pH 4.2, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 273K
|
分辨率 3.20 Å R-free 0.258 |
| 3GOK Binding site mapping of protein ligands 提交 2009-03-19 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 6 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
41–364(324 aa)
片段:Protein kinase domain
|
未记录 | P4O 2-(2-QUINOLIN-3-YLPYRIDIN-4-YL)-1,5,6,7-TETRAHYDRO-4H-PYRROLO[3,2-C]PYRIDIN-4-ONE × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 4.2;273 K;40% ethanol, 5% PEG1000, 100mM phosphate-citrate, pH 4.2, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 273K
|
分辨率 3.20 Å R-free 0.258 |
| 3GOK Binding site mapping of protein ligands 提交 2009-03-19 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 7 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 B
41–364(324 aa)
片段:Protein kinase domain
|
未记录 | P4O 2-(2-QUINOLIN-3-YLPYRIDIN-4-YL)-1,5,6,7-TETRAHYDRO-4H-PYRROLO[3,2-C]PYRIDIN-4-ONE × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 4.2;273 K;40% ethanol, 5% PEG1000, 100mM phosphate-citrate, pH 4.2, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 273K
|
分辨率 3.20 Å R-free 0.258 |
| 3GOK Binding site mapping of protein ligands 提交 2009-03-19 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 8 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 C
41–364(324 aa)
片段:Protein kinase domain
|
未记录 | P4O 2-(2-QUINOLIN-3-YLPYRIDIN-4-YL)-1,5,6,7-TETRAHYDRO-4H-PYRROLO[3,2-C]PYRIDIN-4-ONE × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 4.2;273 K;40% ethanol, 5% PEG1000, 100mM phosphate-citrate, pH 4.2, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 273K
|
分辨率 3.20 Å R-free 0.258 |
| 3GOK Binding site mapping of protein ligands 提交 2009-03-19 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 9 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 D
41–364(324 aa)
片段:Protein kinase domain
|
未记录 | P4O 2-(2-QUINOLIN-3-YLPYRIDIN-4-YL)-1,5,6,7-TETRAHYDRO-4H-PYRROLO[3,2-C]PYRIDIN-4-ONE × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 4.2;273 K;40% ethanol, 5% PEG1000, 100mM phosphate-citrate, pH 4.2, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 273K
|
分辨率 3.20 Å R-free 0.258 |
| 3KA0 MK2 complex with inhibitor 6-(5-(2-aminopyrimidin-4-ylamino)-2-hydroxyphenyl)-N-methylbenzo[b]thiophene-2-carboxamide 提交 2009-10-16 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
47–366(320 aa)
片段:Kinase Domain
|
突变:T222E | MK3 6-{5-[(2-aminopyrimidin-4-yl)amino]-2-hydroxyphenyl}-N-methylidene-1-benzothiophene-2-carboxamide × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 5.5;291 K;2M Sodium Malonate
pH 5.5
Anapoe 80 , VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 291.0K
|
分辨率 2.90 Å R-free 0.265 |
| 3KC3 MK2 complexed to inhibitor N4-(7-(benzofuran-2-yl)-1H-indazol-5-yl)pyrimidine-2,4-diamine 提交 2009-10-20 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric |
链 A
41–364(324 aa)
片段:Kinase domain
链 F
41–364(324 aa)
片段:Kinase domain
链 H
41–364(324 aa)
片段:Kinase domain
|
未记录 | MK2 N~4~-[7-(1-benzofuran-2-yl)-1H-indazol-5-yl]pyrimidine-2,4-diamine × 3 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 8;291 K;1.75 M Ammonium Sulfate, 0.1 M Na Citrate, pH 8.0., VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 291.0K
|
分辨率 2.90 Å R-free 0.298 |
| 3KC3 MK2 complexed to inhibitor N4-(7-(benzofuran-2-yl)-1H-indazol-5-yl)pyrimidine-2,4-diamine 提交 2009-10-20 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric |
链 B
41–364(324 aa)
片段:Kinase domain
链 E
41–364(324 aa)
片段:Kinase domain
链 J
41–364(324 aa)
片段:Kinase domain
|
未记录 | MK2 N~4~-[7-(1-benzofuran-2-yl)-1H-indazol-5-yl]pyrimidine-2,4-diamine × 3 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 8;291 K;1.75 M Ammonium Sulfate, 0.1 M Na Citrate, pH 8.0., VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 291.0K
|
分辨率 2.90 Å R-free 0.298 |
| 3KC3 MK2 complexed to inhibitor N4-(7-(benzofuran-2-yl)-1H-indazol-5-yl)pyrimidine-2,4-diamine 提交 2009-10-20 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 3 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric |
链 C
41–364(324 aa)
片段:Kinase domain
链 I
41–364(324 aa)
片段:Kinase domain
链 L
41–364(324 aa)
片段:Kinase domain
|
未记录 | MK2 N~4~-[7-(1-benzofuran-2-yl)-1H-indazol-5-yl]pyrimidine-2,4-diamine × 3 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 8;291 K;1.75 M Ammonium Sulfate, 0.1 M Na Citrate, pH 8.0., VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 291.0K
|
分辨率 2.90 Å R-free 0.298 |
| 3KC3 MK2 complexed to inhibitor N4-(7-(benzofuran-2-yl)-1H-indazol-5-yl)pyrimidine-2,4-diamine 提交 2009-10-20 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 4 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric |
链 D
41–364(324 aa)
片段:Kinase domain
链 G
41–364(324 aa)
片段:Kinase domain
链 K
41–364(324 aa)
片段:Kinase domain
|
未记录 | MK2 N~4~-[7-(1-benzofuran-2-yl)-1H-indazol-5-yl]pyrimidine-2,4-diamine × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 8;291 K;1.75 M Ammonium Sulfate, 0.1 M Na Citrate, pH 8.0., VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 291.0K
|
分辨率 2.90 Å R-free 0.298 |
| 3KC3 MK2 complexed to inhibitor N4-(7-(benzofuran-2-yl)-1H-indazol-5-yl)pyrimidine-2,4-diamine 提交 2009-10-20 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 5 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 12 PDB 声明:dodecameric |
链 A
41–364(324 aa)
片段:Kinase domain
链 B
41–364(324 aa)
片段:Kinase domain
链 C
41–364(324 aa)
片段:Kinase domain
链 D
41–364(324 aa)
片段:Kinase domain
链 E
41–364(324 aa)
片段:Kinase domain
链 F
41–364(324 aa)
片段:Kinase domain
链 G
41–364(324 aa)
片段:Kinase domain
链 H
41–364(324 aa)
片段:Kinase domain
链 I
41–364(324 aa)
片段:Kinase domain
链 J
41–364(324 aa)
片段:Kinase domain
链 K
41–364(324 aa)
片段:Kinase domain
链 L
41–364(324 aa)
片段:Kinase domain
|
未记录 | MK2 N~4~-[7-(1-benzofuran-2-yl)-1H-indazol-5-yl]pyrimidine-2,4-diamine × 11 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 8;291 K;1.75 M Ammonium Sulfate, 0.1 M Na Citrate, pH 8.0., VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 291.0K
|
分辨率 2.90 Å R-free 0.298 |
| 3KGA Crystal structure of MAPKAP kinase 2 (MK2) complexed with a potent 3-aminopyrazole ATP site inhibitor 提交 2009-10-28 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
47–364(318 aa)
片段:Kinase domain
|
突变:DELTA216-236, P237G | MG MAGNESIUM ION × 1 LX9 6-{3-amino-1-[3-(1H-indol-6-yl)phenyl]-1H-pyrazol-4-yl}-3,4-dihydroisoquinolin-1(2H)-one × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 8.3;298 K;0.1M BICINE, 1.3M SODIUM MALONATE, pH 8.3, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 2.55 Å R-free 0.235 |
| 3M2W Crystal structure of MAPKAK kinase 2 (MK2) complexed with a spiroazetidine-tetracyclic ATP site inhibitor 提交 2010-03-08 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
47–364(318 aa)
片段:Kinase domain
|
突变:DELTA216-236, P237G | L8I 2'-(2-fluorophenyl)-1-methyl-6',8',9',11'-tetrahydrospiro[azetidine-3,10'-pyrido[3',4':4,5]pyrrolo[2,3-f]isoquinolin]-7'(5'H)-one × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 8.3;298 K;0.1M BICINE, 1.3M SODIUM MALONATE, pH 8.3, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 2.41 Å R-free 0.227 |
| 3M42 Crystal structure of MAPKAP kinase 2 (MK2) complexed with a tetracyclic ATP site inhibitor 提交 2010-03-10 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
47–364(318 aa)
片段:Kinase domain
|
突变:DELTA216-236, P237G | MG MAGNESIUM ION × 1 HGF 2-[5-(2-methoxyethoxy)pyridin-3-yl]-8,9,10,11-tetrahydro-7H-pyrido[3',4':4,5]pyrrolo[2,3-f]isoquinolin-7-one × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 5.6;298 K;3.0M Na Formate, 0.1M Na Citrate, pH 5.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 2.68 Å R-free 0.232 |
| 3R2B MK2 kinase bound to Compound 5b 提交 2011-03-14 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
47–364(318 aa)
片段:UNP residues 47-364
|
未记录 | 05B 2'-[2-(1,3-benzodioxol-5-yl)pyrimidin-4-yl]-5',6'-dihydrospiro[piperidine-4,7'-pyrrolo[3,2-c]pyridin]-4'(1'H)-one × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 8.5;293 K;100 mM Tris, 2.3 M AmSO4, pH 8.5, vapor diffusion, hanging drop, temperature 293K
|
分辨率 2.90 Å R-free 0.316 |
| 3R2B MK2 kinase bound to Compound 5b 提交 2011-03-14 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 10 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 J
47–364(318 aa)
片段:UNP residues 47-364
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 8.5;293 K;100 mM Tris, 2.3 M AmSO4, pH 8.5, vapor diffusion, hanging drop, temperature 293K
|
分辨率 2.90 Å R-free 0.316 |
| 3R2B MK2 kinase bound to Compound 5b 提交 2011-03-14 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 11 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 K
47–364(318 aa)
片段:UNP residues 47-364
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 8.5;293 K;100 mM Tris, 2.3 M AmSO4, pH 8.5, vapor diffusion, hanging drop, temperature 293K
|
分辨率 2.90 Å R-free 0.316 |
| 3R2B MK2 kinase bound to Compound 5b 提交 2011-03-14 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 12 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 L
47–364(318 aa)
片段:UNP residues 47-364
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 8.5;293 K;100 mM Tris, 2.3 M AmSO4, pH 8.5, vapor diffusion, hanging drop, temperature 293K
|
分辨率 2.90 Å R-free 0.316 |
| 3R2B MK2 kinase bound to Compound 5b 提交 2011-03-14 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 B
47–364(318 aa)
片段:UNP residues 47-364
|
未记录 | 05B 2'-[2-(1,3-benzodioxol-5-yl)pyrimidin-4-yl]-5',6'-dihydrospiro[piperidine-4,7'-pyrrolo[3,2-c]pyridin]-4'(1'H)-one × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 8.5;293 K;100 mM Tris, 2.3 M AmSO4, pH 8.5, vapor diffusion, hanging drop, temperature 293K
|
分辨率 2.90 Å R-free 0.316 |
| 3R2B MK2 kinase bound to Compound 5b 提交 2011-03-14 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 3 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 C
47–364(318 aa)
片段:UNP residues 47-364
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 8.5;293 K;100 mM Tris, 2.3 M AmSO4, pH 8.5, vapor diffusion, hanging drop, temperature 293K
|
分辨率 2.90 Å R-free 0.316 |
| 3R2B MK2 kinase bound to Compound 5b 提交 2011-03-14 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 4 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 D
47–364(318 aa)
片段:UNP residues 47-364
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 8.5;293 K;100 mM Tris, 2.3 M AmSO4, pH 8.5, vapor diffusion, hanging drop, temperature 293K
|
分辨率 2.90 Å R-free 0.316 |
| 3R2B MK2 kinase bound to Compound 5b 提交 2011-03-14 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 5 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 E
47–364(318 aa)
片段:UNP residues 47-364
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 8.5;293 K;100 mM Tris, 2.3 M AmSO4, pH 8.5, vapor diffusion, hanging drop, temperature 293K
|
分辨率 2.90 Å R-free 0.316 |
| 3R2B MK2 kinase bound to Compound 5b 提交 2011-03-14 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 6 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 F
47–364(318 aa)
片段:UNP residues 47-364
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 8.5;293 K;100 mM Tris, 2.3 M AmSO4, pH 8.5, vapor diffusion, hanging drop, temperature 293K
|
分辨率 2.90 Å R-free 0.316 |
| 3R2B MK2 kinase bound to Compound 5b 提交 2011-03-14 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 7 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 G
47–364(318 aa)
片段:UNP residues 47-364
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 8.5;293 K;100 mM Tris, 2.3 M AmSO4, pH 8.5, vapor diffusion, hanging drop, temperature 293K
|
分辨率 2.90 Å R-free 0.316 |
| 3R2B MK2 kinase bound to Compound 5b 提交 2011-03-14 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 8 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 H
47–364(318 aa)
片段:UNP residues 47-364
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 8.5;293 K;100 mM Tris, 2.3 M AmSO4, pH 8.5, vapor diffusion, hanging drop, temperature 293K
|
分辨率 2.90 Å R-free 0.316 |
| 3R2B MK2 kinase bound to Compound 5b 提交 2011-03-14 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 9 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 I
47–364(318 aa)
片段:UNP residues 47-364
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 8.5;293 K;100 mM Tris, 2.3 M AmSO4, pH 8.5, vapor diffusion, hanging drop, temperature 293K
|
分辨率 2.90 Å R-free 0.316 |
| 3R2Y MK2 kinase bound to Compound 1 提交 2011-03-15 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
46–364(319 aa)
片段:Kinase domain, UNP residues 46-364
|
未记录 | MLI MALONATE ION × 2 P4O 2-(2-QUINOLIN-3-YLPYRIDIN-4-YL)-1,5,6,7-TETRAHYDRO-4H-PYRROLO[3,2-C]PYRIDIN-4-ONE × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 5;293 K;1.6 M Sodium Malonate, pH 5.0, vapor diffusion, hanging drop, temperature 293K
|
分辨率 3.00 Å R-free 0.334 |
| 3R30 MK2 kinase bound to Compound 2 提交 2011-03-15 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
46–364(319 aa)
片段:Kinase domain, UNP residues 46-364
|
未记录 | CD2 1-(2-aminoethyl)-3-[2-(quinolin-3-yl)pyridin-4-yl]-1H-pyrazole-5-carboxylic acid × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 5;293 K;1.8 M Sodium Malonate, pH 5.0, vapor diffusion, hanging drop, temperature 293K
|
分辨率 3.20 Å R-free 0.332 |
| 3R30 MK2 kinase bound to Compound 2 提交 2011-03-15 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric |
链 A
46–364(319 aa)
片段:Kinase domain, UNP residues 46-364
|
未记录 | CD2 1-(2-aminoethyl)-3-[2-(quinolin-3-yl)pyridin-4-yl]-1H-pyrazole-5-carboxylic acid × 3 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 5;293 K;1.8 M Sodium Malonate, pH 5.0, vapor diffusion, hanging drop, temperature 293K
|
分辨率 3.20 Å R-free 0.332 |
| 3R30 MK2 kinase bound to Compound 2 提交 2011-03-15 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 3 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric |
链 A
46–364(319 aa)
片段:Kinase domain, UNP residues 46-364
|
未记录 | CD2 1-(2-aminoethyl)-3-[2-(quinolin-3-yl)pyridin-4-yl]-1H-pyrazole-5-carboxylic acid × 3 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 5;293 K;1.8 M Sodium Malonate, pH 5.0, vapor diffusion, hanging drop, temperature 293K
|
分辨率 3.20 Å R-free 0.332 |
| 3WI6 Crystal structure of MAPKAP Kinase-2 (MK2) in complex with non-selective inhibitor 提交 2013-09-06 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 12 PDB 声明:dodecameric |
链 A
41–364(324 aa)
片段:UNP residues 41-364
链 B
41–364(324 aa)
片段:UNP residues 41-364
链 C
41–364(324 aa)
片段:UNP residues 41-364
链 D
41–364(324 aa)
片段:UNP residues 41-364
链 E
41–364(324 aa)
片段:UNP residues 41-364
链 F
41–364(324 aa)
片段:UNP residues 41-364
|
未记录 | YRZ N-[(3S)-piperidin-3-yl]-7,8-dihydro-6H-pyrazolo[1,5-a]pyrrolo[3,2-e]pyrimidin-5-amine × 12 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 5;293 K;0.1M Na-Acetate, 1.6M Ammonium Sulphate, 200mM NaCl, 1.4mM Deoxi Big Chap, pH 5.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293.0K
|
分辨率 2.99 Å R-free 0.283 |
| 4TYH Ternary complex of P38 and MK2 with a P38 inhibitor 提交 2014-07-08 | 构建体不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 A
51–400(350 aa)
片段:UNP residues 51-400
|
未记录 | 39G N-[5-(dimethylsulfamoyl)-2-methylphenyl]-1-phenyl-5-propyl-1H-pyrazole-4-carboxamide × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION;298 K;9% PEG 4K, 100mM NaCit, pH 5.6
|
分辨率 3.00 Å R-free 0.313 |
| 6T8X Crystal structure of MAPKAPK2 (MK2) complexed with PF-3644022 and 5-(4-bromophenyl)-N-[4-(1-piperazinyl)phenyl]-N-(2-pyridinylmethyl)-2-furancarboxamide 提交 2019-10-25 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 6 PDB 声明:hexameric |
链 A
41–338(298 aa)
链 B
41–338(298 aa)
链 C
41–338(298 aa)
链 D
41–338(298 aa)
链 E
41–338(298 aa)
链 F
41–338(298 aa)
|
突变:T222E, T334E 突变:T222E, T334E 突变:T222E, T334E 突变:T222E, T334E 突变:T222E, T334E 突变:T222E, T334E | B97 (10R)-10-methyl-3-(6-methylpyridin-3-yl)-9,10,11,12-tetrahydro-8H-[1,4]diazepino[5',6':4,5]thieno[3,2-f]quinolin-8-one × 6 CL CHLORIDE ION × 6 MW8 5-(4-bromophenyl)-~{N}-(4-piperazin-1-ylphenyl)-~{N}-(pyridin-2-ylmethyl)furan-2-carboxamide × 6 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6;295 K;1.3M NaMalonate, 0.1M Hepes pH6.0, 0.5% jeffamine ED2003
|
分辨率 2.81 Å R-free 0.247 |
| 7NRY Re-refinement of MAPKAP kinase-2/inhibitor complex 3fyj 提交 2021-03-04 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric |
链 X
45–371(327 aa)
|
未记录 | B97 (10R)-10-methyl-3-(6-methylpyridin-3-yl)-9,10,11,12-tetrahydro-8H-[1,4]diazepino[5',6':4,5]thieno[3,2-f]quinolin-8-one × 3 CL CHLORIDE ION × 3 MLA MALONIC ACID × 3 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 5.4;298 K;MK-2 protein at 5 mg/ml is equilibrated against a well solution of 1.6 - 2.0 M Sodium malonate at pH 5.4, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 3.80 Å R-free 0.275 |
| 8XU4 The Crystal Structure of MAPK2 from Biortus. 提交 2024-01-12 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
47–364(318 aa)
|
突变:S216G | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293 K;1.1M Sodium malonate dibasic monohydrate, 0.1M HEPES pH7, 0.5% v/v Jeffamine ED2003
|
分辨率 3.40 Å R-free 0.263 |
| 8XU4 The Crystal Structure of MAPK2 from Biortus. 提交 2024-01-12 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 10 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 J
47–364(318 aa)
|
突变:S216G | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293 K;1.1M Sodium malonate dibasic monohydrate, 0.1M HEPES pH7, 0.5% v/v Jeffamine ED2003
|
分辨率 3.40 Å R-free 0.263 |
| 8XU4 The Crystal Structure of MAPK2 from Biortus. 提交 2024-01-12 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 11 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 K
47–364(318 aa)
|
突变:S216G | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293 K;1.1M Sodium malonate dibasic monohydrate, 0.1M HEPES pH7, 0.5% v/v Jeffamine ED2003
|
分辨率 3.40 Å R-free 0.263 |
| 8XU4 The Crystal Structure of MAPK2 from Biortus. 提交 2024-01-12 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 12 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 L
47–364(318 aa)
|
突变:S216G | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293 K;1.1M Sodium malonate dibasic monohydrate, 0.1M HEPES pH7, 0.5% v/v Jeffamine ED2003
|
分辨率 3.40 Å R-free 0.263 |
| 8XU4 The Crystal Structure of MAPK2 from Biortus. 提交 2024-01-12 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 B
47–364(318 aa)
|
突变:S216G | MLA MALONIC ACID × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293 K;1.1M Sodium malonate dibasic monohydrate, 0.1M HEPES pH7, 0.5% v/v Jeffamine ED2003
|
分辨率 3.40 Å R-free 0.263 |
| 8XU4 The Crystal Structure of MAPK2 from Biortus. 提交 2024-01-12 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 3 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 C
47–364(318 aa)
|
突变:S216G | MLA MALONIC ACID × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293 K;1.1M Sodium malonate dibasic monohydrate, 0.1M HEPES pH7, 0.5% v/v Jeffamine ED2003
|
分辨率 3.40 Å R-free 0.263 |
| 8XU4 The Crystal Structure of MAPK2 from Biortus. 提交 2024-01-12 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 4 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 D
47–364(318 aa)
|
突变:S216G | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293 K;1.1M Sodium malonate dibasic monohydrate, 0.1M HEPES pH7, 0.5% v/v Jeffamine ED2003
|
分辨率 3.40 Å R-free 0.263 |
| 8XU4 The Crystal Structure of MAPK2 from Biortus. 提交 2024-01-12 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 5 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 E
47–364(318 aa)
|
突变:S216G | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293 K;1.1M Sodium malonate dibasic monohydrate, 0.1M HEPES pH7, 0.5% v/v Jeffamine ED2003
|
分辨率 3.40 Å R-free 0.263 |
| 8XU4 The Crystal Structure of MAPK2 from Biortus. 提交 2024-01-12 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 6 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 F
47–364(318 aa)
|
突变:S216G | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293 K;1.1M Sodium malonate dibasic monohydrate, 0.1M HEPES pH7, 0.5% v/v Jeffamine ED2003
|
分辨率 3.40 Å R-free 0.263 |
| 8XU4 The Crystal Structure of MAPK2 from Biortus. 提交 2024-01-12 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 7 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 G
47–364(318 aa)
|
突变:S216G | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293 K;1.1M Sodium malonate dibasic monohydrate, 0.1M HEPES pH7, 0.5% v/v Jeffamine ED2003
|
分辨率 3.40 Å R-free 0.263 |
| 8XU4 The Crystal Structure of MAPK2 from Biortus. 提交 2024-01-12 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 8 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 H
47–364(318 aa)
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突变:S216G | MLA MALONIC ACID × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293 K;1.1M Sodium malonate dibasic monohydrate, 0.1M HEPES pH7, 0.5% v/v Jeffamine ED2003
|
分辨率 3.40 Å R-free 0.263 |
| 8XU4 The Crystal Structure of MAPK2 from Biortus. 提交 2024-01-12 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 9 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 I
47–364(318 aa)
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突变:S216G | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293 K;1.1M Sodium malonate dibasic monohydrate, 0.1M HEPES pH7, 0.5% v/v Jeffamine ED2003
|
分辨率 3.40 Å R-free 0.263 |
| 8XX1 The Crystal Structure of MAPKAP kinase 2 domain from Biortus 提交 2024-01-17 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
47–364(318 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293 K;1.1M Sodium malonate dibasic monohydrate, 0.1M HEPES pH 7, 0.5% v/v Jeffamine ED2003
|
分辨率 2.55 Å R-free 0.245 |
| 9R59 Crystal structure of MAPKAPK2 with a covalent compound GCL334 targeting lysine 提交 2025-05-08 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
48–364(317 aa)
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未记录 | A1JH4 5-[3-[bis(oxidanyl)-$l^{3}-sulfanyl]oxy-4-chloranyl-phenyl]-~{N}-(4-piperazin-1-ylphenyl)-~{N}-(pyridin-2-ylmethyl)furan-2-carboxamide × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;277.15 K;1M succinic acid, 1% PEG2000 MME, 0.1M HEPES pH 7.0
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分辨率 3.00 Å R-free 0.229 |
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查看构建体与数据证据
| UniProt名称 | MAPK2_HUMAN |
| Isoform | — |
| PDB实体 | 1 |
| 链与序列区间 | 作者链 A; PDB构建体 3–362; UniProt 41–400 作者链 C; PDB构建体 3–362; UniProt 41–400 作者链 E; PDB构建体 3–362; UniProt 41–400 作者链 G; PDB构建体 3–362; UniProt 41–400 |