SAXSdb — 6tvu

▼

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Env polyprotein (Fragment)

物种未注明

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 6	Transmembrane protein gp41 × 3 （P04582） water × 6	待复核

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	C7F3P9_9HIV1
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 AaA； PDB构建体 2–39； UniProt 9–46

Transmembrane protein gp41

物种未注明

UniProt P04582

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 6	Env polyprotein (Fragment) × 3 （C7F3P9） water × 6	待复核

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	ENV_HV1B8
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 BBB； PDB构建体 1–30； UniProt 616–645

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

▼

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	6tvu
沉积日期 deposition_date	2020-01-10
结构标题 title	Structure of native gp41 derived peptide fusion inhibitor
关键词 keywords	Inhibitor, helix bundle, HIV, viral protein; VIRAL PROTEIN
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

▼

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

6tvu__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

6tvu__assembly_1__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

6tvu__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	19.29 Å
Rg（电子密度）	18.09 Å
总 Rg	19.18 Å
原子数	3438
残基数	198
排除体积	30636 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`6tvu__assembly_1__model_1`	nonameric （9）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

▶

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

▶

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (3)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	Env polyprotein (Fragment)
分子量 formula_weight	4515.3 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	AaA
原子数 atom_count	1333

XNNLLRAIEAQQHLLQLTVWGIKQLQARILAVERYLKDQX

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	Transmembrane protein gp41
分子量 formula_weight	3792.1 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	BBB

QIWNNMTWMEWDREXNNYTSLIHSLIEESQ

实体 3 Entity 3 water

描述 description	water
分子量 formula_weight	18.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	87

▶

晶胞边长 a length_a	44.963 Å
晶胞边长 b length_b	44.963 Å
晶胞边长 c length_c	209.010 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	120.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	18

空间群 space_group	H 3 2
空间群编号 int_tables_number	155
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	1.250 Å
最低分辨率 resolution_low	38.280 Å
R 因子 r_factor	—
R_work r_work	0.1620
R_free r_free	0.2104

Structure of native gp41 derived peptide fusion inhibitor

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Env polyprotein (Fragment)

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Transmembrane protein gp41

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

6tvu__assembly_1__model_1

6tvu__assembly_1__model_1 | I(q)

6tvu__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (3)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

实体 3 Entity 3 water

7. 引用文献 (1)

Structure of native gp41 derived peptide fusion inhibitor

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Env polyprotein (Fragment)

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Transmembrane protein gp41

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

6tvu__assembly_1__model_1

6tvu__assembly_1__model_1 | I(q)

6tvu__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (3)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

实体 3 Entity 3 water

7. 引用文献 (1)