6uot

Cryo-EM structure of the PrgHK periplasmic ring from the Salmonella SPI-1 type III secretion needle complex solved at 3.3 angstrom resolution

Method: ELECTRON MICROSCOPY

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Protein PrgH

物种未注明

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 48	Lipoprotein PrgK × 24 （P41786）	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	PRGH_SALTY
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–392； UniProt 1–392 作者链 B； PDB构建体 1–392； UniProt 1–392 作者链 C； PDB构建体 1–392； UniProt 1–392 作者链 D； PDB构建体 1–392； UniProt 1–392 作者链 E； PDB构建体 1–392； UniProt 1–392 作者链 F； PDB构建体 1–392； UniProt 1–392 作者链 G； PDB构建体 1–392； UniProt 1–392 作者链 H； PDB构建体 1–392； UniProt 1–392 作者链 I； PDB构建体 1–392； UniProt 1–392 作者链 J； PDB构建体 1–392； UniProt 1–392 作者链 K； PDB构建体 1–392； UniProt 1–392 作者链 L； PDB构建体 1–392； UniProt 1–392 作者链 M； PDB构建体 1–392； UniProt 1–392 作者链 N； PDB构建体 1–392； UniProt 1–392 作者链 O； PDB构建体 1–392； UniProt 1–392 作者链 P； PDB构建体 1–392； UniProt 1–392 作者链 Q； PDB构建体 1–392； UniProt 1–392 作者链 R； PDB构建体 1–392； UniProt 1–392 作者链 S； PDB构建体 1–392； UniProt 1–392 作者链 T； PDB构建体 1–392； UniProt 1–392 作者链 U； PDB构建体 1–392； UniProt 1–392 作者链 V； PDB构建体 1–392； UniProt 1–392 作者链 W； PDB构建体 1–392； UniProt 1–392 作者链 X； PDB构建体 1–392； UniProt 1–392

Lipoprotein PrgK

物种未注明

UniProt P41786

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 48	Protein PrgH × 24 （P41783）	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	PRGK_SALTY
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 Y； PDB构建体 1–252； UniProt 1–252 作者链 Z； PDB构建体 1–252； UniProt 1–252 作者链 a； PDB构建体 1–252； UniProt 1–252 作者链 b； PDB构建体 1–252； UniProt 1–252 作者链 c； PDB构建体 1–252； UniProt 1–252 作者链 d； PDB构建体 1–252； UniProt 1–252 作者链 e； PDB构建体 1–252； UniProt 1–252 作者链 f； PDB构建体 1–252； UniProt 1–252 作者链 g； PDB构建体 1–252； UniProt 1–252 作者链 h； PDB构建体 1–252； UniProt 1–252 作者链 i； PDB构建体 1–252； UniProt 1–252 作者链 j； PDB构建体 1–252； UniProt 1–252 作者链 k； PDB构建体 1–252； UniProt 1–252 作者链 l； PDB构建体 1–252； UniProt 1–252 作者链 m； PDB构建体 1–252； UniProt 1–252 作者链 n； PDB构建体 1–252； UniProt 1–252 作者链 o； PDB构建体 1–252； UniProt 1–252 作者链 p； PDB构建体 1–252； UniProt 1–252 作者链 q； PDB构建体 1–252； UniProt 1–252 作者链 r； PDB构建体 1–252； UniProt 1–252 作者链 s； PDB构建体 1–252； UniProt 1–252 作者链 t； PDB构建体 1–252； UniProt 1–252 作者链 u； PDB构建体 1–252； UniProt 1–252 作者链 v； PDB构建体 1–252； UniProt 1–252

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	6uot
沉积日期 deposition_date	2019-10-15
结构标题 title	Cryo-EM structure of the PrgHK periplasmic ring from the Salmonella SPI-1 type III secretion needle complex solved at 3.3 angstrom resolution
关键词 keywords	BACTERIAL NANOMACHINE, TYPE III SECRETION SYSTEM, MEMBRANE PROTEIN; MEMBRANE PROTEIN
实验方法 method	ELECTRON MICROSCOPY

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

6uot__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

6uot__assembly_1__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

6uot__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	85.29 Å
Rg（电子密度）	85.08 Å
总 Rg	85.22 Å
原子数	72744
残基数	9072
排除体积	1288800 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`6uot__assembly_1__model_1`	48-meric （48）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (2)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	Protein PrgH
分子量 formula_weight	44509.4 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	24

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N,O,P,Q,R,S,T,U,V,W,X
原子数 atom_count	72744

METSKEKTITSPGPYIVRLLNSSLNGCEFPLLTGRTLFVVGQSDALTASGQLPDIPADSFFIPLDHGGVNFEIQVDTDATEIILHELKEGNSESRSVQLNTPIQVGELLILIRPESEPWVPEQPEKLETSAKKNEPRFKNGIVAALAGFFILGIGTVGTLWILNSPQRQAAELDSLLGQEKERFQVLPGRDKMLYVAAQNERDTLWARQVLARGDYDKNARVINENEENKRISIWLDTYYPQLAYYRIHFDEPRKPVFWLSRQRNTMSKKELEVLSQKLRALMPYADSVNITLMDDVTAAGQAEAGLKQQALPYSRRNHKGGVTFVIQGALDDVEILRARQFVDSYYRTWGGRYVQFAIELKDDWLKGRSFQYGAEGYIKMSPGHWYFPSPL

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	Lipoprotein PrgK
分子量 formula_weight	28245.3 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	24

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	Y,Z,a,b,c,d,e,f,g,h,i,j,k,l,m,n,o,p,q,r,s,t,u,v

MIRRYLYTFLLVMTLAGCKDKDLLKGLDQEQANEVIAVLQMHNIEANKIDSGKLGYSITVAEPDFTAAVYWIKTYQLPPRPRVEIAQMFPADSLVSSPRAEKARLYSAIEQRLEQSLQTMEGVLSARVHISYDIDAGENGRPPKPVHLSALAVYERGSPLAHQISDIKRFLKNSFADVDYDNISVVLSERSDAQLQAPGTPVKRNSFATSWIVLIILLSVMSAGFGVWYYKNHYARNKKGITADDKAKSSNE

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6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 72 domains

CATH v4.4 (72 domains)

结构域编号 domain_id	6uotA01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	70 — Alpha-Beta Plaits
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	1780 —

结构域编号 domain_id	6uotA02
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	300 — GMP Synthetase; Chain A, domain 3
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	170 —

结构域编号 domain_id	6uotA03
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	70 — Alpha-Beta Plaits
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	1770 —

结构域编号 domain_id	6uotB01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	70 — Alpha-Beta Plaits
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	1780 —

结构域编号 domain_id	6uotB02
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	300 — GMP Synthetase; Chain A, domain 3
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	170 —

结构域编号 domain_id	6uotB03
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	70 — Alpha-Beta Plaits
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	1770 —

结构域编号 domain_id	6uotC01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	70 — Alpha-Beta Plaits
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	1780 —

结构域编号 domain_id	6uotC02
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	300 — GMP Synthetase; Chain A, domain 3
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	170 —

结构域编号 domain_id	6uotC03
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	70 — Alpha-Beta Plaits
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	1770 —

结构域编号 domain_id	6uotD01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	70 — Alpha-Beta Plaits
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	1780 —

结构域编号 domain_id	6uotD02
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	300 — GMP Synthetase; Chain A, domain 3
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	170 —

结构域编号 domain_id	6uotD03
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	70 — Alpha-Beta Plaits
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	1770 —

结构域编号 domain_id	6uotE01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	70 — Alpha-Beta Plaits
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	1780 —

结构域编号 domain_id	6uotE02
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	300 — GMP Synthetase; Chain A, domain 3
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	170 —

结构域编号 domain_id	6uotE03
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	70 — Alpha-Beta Plaits
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	1770 —

结构域编号 domain_id	6uotF01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	70 — Alpha-Beta Plaits
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	1780 —

结构域编号 domain_id	6uotF02
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	300 — GMP Synthetase; Chain A, domain 3
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	170 —

结构域编号 domain_id	6uotF03
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	70 — Alpha-Beta Plaits
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	1770 —

结构域编号 domain_id	6uotG01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	70 — Alpha-Beta Plaits
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	1780 —

结构域编号 domain_id	6uotG02
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	300 — GMP Synthetase; Chain A, domain 3
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	170 —

结构域编号 domain_id	6uotG03
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	70 — Alpha-Beta Plaits
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	1770 —

结构域编号 domain_id	6uotH01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	70 — Alpha-Beta Plaits
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	1780 —

结构域编号 domain_id	6uotH02
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	300 — GMP Synthetase; Chain A, domain 3
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	170 —

结构域编号 domain_id	6uotH03
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	70 — Alpha-Beta Plaits
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	1770 —

结构域编号 domain_id	6uotI01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	70 — Alpha-Beta Plaits
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	1780 —

结构域编号 domain_id	6uotI02
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	300 — GMP Synthetase; Chain A, domain 3
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	170 —

结构域编号 domain_id	6uotI03
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	70 — Alpha-Beta Plaits
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	1770 —

结构域编号 domain_id	6uotJ01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	70 — Alpha-Beta Plaits
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	1780 —

结构域编号 domain_id	6uotJ02
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	300 — GMP Synthetase; Chain A, domain 3
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	170 —

结构域编号 domain_id	6uotJ03
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	70 — Alpha-Beta Plaits
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	1770 —

结构域编号 domain_id	6uotK01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	70 — Alpha-Beta Plaits
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	1780 —

结构域编号 domain_id	6uotK02
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	300 — GMP Synthetase; Chain A, domain 3
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	170 —

结构域编号 domain_id	6uotK03
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	70 — Alpha-Beta Plaits
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	1770 —

结构域编号 domain_id	6uotL01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	70 — Alpha-Beta Plaits
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	1780 —

结构域编号 domain_id	6uotL02
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	300 — GMP Synthetase; Chain A, domain 3
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	170 —

结构域编号 domain_id	6uotL03
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	70 — Alpha-Beta Plaits
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	1770 —

结构域编号 domain_id	6uotM01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	70 — Alpha-Beta Plaits
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	1780 —

结构域编号 domain_id	6uotM02
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	300 — GMP Synthetase; Chain A, domain 3
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	170 —

结构域编号 domain_id	6uotM03
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	70 — Alpha-Beta Plaits
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	1770 —

结构域编号 domain_id	6uotN01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	70 — Alpha-Beta Plaits
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	1780 —

结构域编号 domain_id	6uotN02
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	300 — GMP Synthetase; Chain A, domain 3
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	170 —

结构域编号 domain_id	6uotN03
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	70 — Alpha-Beta Plaits
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	1770 —

结构域编号 domain_id	6uotO01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	70 — Alpha-Beta Plaits
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	1780 —

结构域编号 domain_id	6uotO02
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	300 — GMP Synthetase; Chain A, domain 3
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	170 —

结构域编号 domain_id	6uotO03
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	70 — Alpha-Beta Plaits
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	1770 —

结构域编号 domain_id	6uotP01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	70 — Alpha-Beta Plaits
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	1780 —

结构域编号 domain_id	6uotP02
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	300 — GMP Synthetase; Chain A, domain 3
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	170 —

结构域编号 domain_id	6uotP03
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	70 — Alpha-Beta Plaits
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	1770 —

结构域编号 domain_id	6uotQ01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	70 — Alpha-Beta Plaits
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	1780 —

结构域编号 domain_id	6uotQ02
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	300 — GMP Synthetase; Chain A, domain 3
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	170 —

结构域编号 domain_id	6uotQ03
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	70 — Alpha-Beta Plaits
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	1770 —

结构域编号 domain_id	6uotR01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	70 — Alpha-Beta Plaits
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	1780 —

结构域编号 domain_id	6uotR02
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	300 — GMP Synthetase; Chain A, domain 3
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	170 —

结构域编号 domain_id	6uotR03
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	70 — Alpha-Beta Plaits
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	1770 —

结构域编号 domain_id	6uotS01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	70 — Alpha-Beta Plaits
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	1780 —

结构域编号 domain_id	6uotS02
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	300 — GMP Synthetase; Chain A, domain 3
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	170 —

结构域编号 domain_id	6uotS03
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	70 — Alpha-Beta Plaits
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	1770 —

结构域编号 domain_id	6uotT01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	70 — Alpha-Beta Plaits
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	1780 —

结构域编号 domain_id	6uotT02
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	300 — GMP Synthetase; Chain A, domain 3
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	170 —

结构域编号 domain_id	6uotT03
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	70 — Alpha-Beta Plaits
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	1770 —

结构域编号 domain_id	6uotU01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	70 — Alpha-Beta Plaits
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	1780 —

结构域编号 domain_id	6uotU02
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	300 — GMP Synthetase; Chain A, domain 3
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	170 —

结构域编号 domain_id	6uotU03
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	70 — Alpha-Beta Plaits
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	1770 —

结构域编号 domain_id	6uotV01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	70 — Alpha-Beta Plaits
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	1780 —

结构域编号 domain_id	6uotV02
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	300 — GMP Synthetase; Chain A, domain 3
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	170 —

结构域编号 domain_id	6uotV03
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	70 — Alpha-Beta Plaits
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	1770 —

结构域编号 domain_id	6uotW01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	70 — Alpha-Beta Plaits
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	1780 —

结构域编号 domain_id	6uotW02
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	300 — GMP Synthetase; Chain A, domain 3
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	170 —

结构域编号 domain_id	6uotW03
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	70 — Alpha-Beta Plaits
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	1770 —

结构域编号 domain_id	6uotX01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	70 — Alpha-Beta Plaits
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	1780 —

结构域编号 domain_id	6uotX02
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	300 — GMP Synthetase; Chain A, domain 3
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	170 —

结构域编号 domain_id	6uotX03
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	70 — Alpha-Beta Plaits
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	1770 —

▶

晶胞边长 a length_a	1.000 Å
晶胞边长 b length_b	1.000 Å
晶胞边长 c length_c	1.000 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	—

空间群 space_group	P 1
空间群编号 int_tables_number	1
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	3.30 Å
分辨率测定方法 resolution_method	—
颗粒数 num_particles	23433

Cryo-EM structure of the PrgHK periplasmic ring from the Salmonella SPI-1 type III secretion needle complex solved at 3.3 angstrom resolution

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Protein PrgH

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Lipoprotein PrgK

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

6uot__assembly_1__model_1

6uot__assembly_1__model_1 | I(q)

6uot__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

冷冻电镜 EM 3D

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (2)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 72 domains

CATH v4.4 (72 domains)

7. 引用文献 (1)

Cryo-EM structure of the PrgHK periplasmic ring from the Salmonella SPI-1 type III secretion needle complex solved at 3.3 angstrom resolution

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Protein PrgH

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Lipoprotein PrgK

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

6uot__assembly_1__model_1

6uot__assembly_1__model_1 | I(q)

6uot__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

冷冻电镜 EM 3D

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (2)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 72 domains

CATH v4.4 (72 domains)

7. 引用文献 (1)