6uov

Cryo-EM reconstruction of the PrgHK periplasmic ring from Salmonella's needle complex assembled in the absence of the export apparatus

Method: ELECTRON MICROSCOPY
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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Lipoprotein PrgK

物种未注明

UniProt P41786

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 46 Protein PrgH × 23 (P41783) 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 PRGK_SALTY
Isoform —
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A; PDB构建体 1–252; UniProt 1–252 作者链 C; PDB构建体 1–252; UniProt 1–252 作者链 E; PDB构建体 1–252; UniProt 1–252 作者链 G; PDB构建体 1–252; UniProt 1–252 作者链 I; PDB构建体 1–252; UniProt 1–252 作者链 K; PDB构建体 1–252; UniProt 1–252 作者链 M; PDB构建体 1–252; UniProt 1–252 作者链 O; PDB构建体 1–252; UniProt 1–252 作者链 Q; PDB构建体 1–252; UniProt 1–252 作者链 S; PDB构建体 1–252; UniProt 1–252 作者链 U; PDB构建体 1–252; UniProt 1–252 作者链 W; PDB构建体 1–252; UniProt 1–252 作者链 Y; PDB构建体 1–252; UniProt 1–252 作者链 a; PDB构建体 1–252; UniProt 1–252 作者链 c; PDB构建体 1–252; UniProt 1–252 作者链 e; PDB构建体 1–252; UniProt 1–252 作者链 g; PDB构建体 1–252; UniProt 1–252 作者链 i; PDB构建体 1–252; UniProt 1–252 作者链 k; PDB构建体 1–252; UniProt 1–252 作者链 m; PDB构建体 1–252; UniProt 1–252 作者链 o; PDB构建体 1–252; UniProt 1–252 作者链 q; PDB构建体 1–252; UniProt 1–252 作者链 s; PDB构建体 1–252; UniProt 1–252

Protein PrgH

物种未注明

UniProt P41783

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 46 Lipoprotein PrgK × 23 (P41786) 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 PRGH_SALTY
Isoform —
PDB实体 2
链与序列区间 作者链 B; PDB构建体 1–392; UniProt 1–392 作者链 D; PDB构建体 1–392; UniProt 1–392 作者链 F; PDB构建体 1–392; UniProt 1–392 作者链 H; PDB构建体 1–392; UniProt 1–392 作者链 J; PDB构建体 1–392; UniProt 1–392 作者链 L; PDB构建体 1–392; UniProt 1–392 作者链 N; PDB构建体 1–392; UniProt 1–392 作者链 P; PDB构建体 1–392; UniProt 1–392 作者链 R; PDB构建体 1–392; UniProt 1–392 作者链 T; PDB构建体 1–392; UniProt 1–392 作者链 V; PDB构建体 1–392; UniProt 1–392 作者链 X; PDB构建体 1–392; UniProt 1–392 作者链 Z; PDB构建体 1–392; UniProt 1–392 作者链 b; PDB构建体 1–392; UniProt 1–392 作者链 d; PDB构建体 1–392; UniProt 1–392 作者链 f; PDB构建体 1–392; UniProt 1–392 作者链 h; PDB构建体 1–392; UniProt 1–392 作者链 j; PDB构建体 1–392; UniProt 1–392 作者链 l; PDB构建体 1–392; UniProt 1–392 作者链 n; PDB构建体 1–392; UniProt 1–392 作者链 p; PDB构建体 1–392; UniProt 1–392 作者链 r; PDB构建体 1–392; UniProt 1–392 作者链 t; PDB构建体 1–392; UniProt 1–392

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中;数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护,因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id6uov
沉积日期 deposition_date2019-10-15
结构标题 titleCryo-EM reconstruction of the PrgHK periplasmic ring from Salmonella's needle complex assembled in the absence of the export apparatus
关键词 keywordsBACTERIAL NANOMACHINE, TYPE III SECRETION SYSTEM, MEMBRANE PROTEIN; MEMBRANE PROTEIN
实验方法 methodELECTRON MICROSCOPY
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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

6uov__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

6uov__assembly_1__model_1 | I(q)

10-2 10-1 105 106 107 108 109 1010 q (1/Angstrom) I(q)
100 个绘图点;横轴和纵轴均采用对数尺度。

6uov__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

新版 assembly/model P(r) 尚未计算 此处仅保留位置,不展示旧数据 r (Angstrom) P(r)
P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。
Rg(Guinier)82.62 Å
Rg(电子密度)82.44 Å
总 Rg82.57 Å
原子数69851
残基数8694
排除体积1237800 ų
最大 q0.500 Å⁻¹
Assembly Model 结构单元 聚集说明 状态 CRYSOL 操作
1 1 6uov__assembly_1__model_1 46-meric (46) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (2)

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6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 69 domains

CATH v4.4 (69 domains)

结构域编号 domain_id6uovB01
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology70 — Alpha-Beta Plaits
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily1780 —
结构域编号 domain_id6uovB02
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology300 — GMP Synthetase; Chain A, domain 3
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily170 —
结构域编号 domain_id6uovB03
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology70 — Alpha-Beta Plaits
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily1770 —
结构域编号 domain_id6uovD01
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology70 — Alpha-Beta Plaits
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily1780 —
结构域编号 domain_id6uovD02
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology300 — GMP Synthetase; Chain A, domain 3
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily170 —
结构域编号 domain_id6uovD03
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology70 — Alpha-Beta Plaits
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily1770 —
结构域编号 domain_id6uovF01
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology70 — Alpha-Beta Plaits
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily1780 —
结构域编号 domain_id6uovF02
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology300 — GMP Synthetase; Chain A, domain 3
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily170 —
结构域编号 domain_id6uovF03
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology70 — Alpha-Beta Plaits
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily1770 —
结构域编号 domain_id6uovH01
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology70 — Alpha-Beta Plaits
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily1780 —
结构域编号 domain_id6uovH02
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology300 — GMP Synthetase; Chain A, domain 3
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily170 —
结构域编号 domain_id6uovH03
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology70 — Alpha-Beta Plaits
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily1770 —
结构域编号 domain_id6uovJ01
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology70 — Alpha-Beta Plaits
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily1780 —
结构域编号 domain_id6uovJ02
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology300 — GMP Synthetase; Chain A, domain 3
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily170 —
结构域编号 domain_id6uovJ03
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology70 — Alpha-Beta Plaits
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily1770 —
结构域编号 domain_id6uovL01
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology70 — Alpha-Beta Plaits
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily1780 —
结构域编号 domain_id6uovL02
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology300 — GMP Synthetase; Chain A, domain 3
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily170 —
结构域编号 domain_id6uovL03
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology70 — Alpha-Beta Plaits
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily1770 —
结构域编号 domain_id6uovN01
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology70 — Alpha-Beta Plaits
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily1780 —
结构域编号 domain_id6uovN02
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology300 — GMP Synthetase; Chain A, domain 3
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily170 —
结构域编号 domain_id6uovN03
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology70 — Alpha-Beta Plaits
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily1770 —
结构域编号 domain_id6uovP01
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology70 — Alpha-Beta Plaits
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily1780 —
结构域编号 domain_id6uovP02
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology300 — GMP Synthetase; Chain A, domain 3
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily170 —
结构域编号 domain_id6uovP03
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology70 — Alpha-Beta Plaits
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily1770 —
结构域编号 domain_id6uovR01
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology70 — Alpha-Beta Plaits
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily1780 —
结构域编号 domain_id6uovR02
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology300 — GMP Synthetase; Chain A, domain 3
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily170 —
结构域编号 domain_id6uovR03
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology70 — Alpha-Beta Plaits
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily1770 —
结构域编号 domain_id6uovT01
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology70 — Alpha-Beta Plaits
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily1780 —
结构域编号 domain_id6uovT02
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology300 — GMP Synthetase; Chain A, domain 3
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily170 —
结构域编号 domain_id6uovT03
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology70 — Alpha-Beta Plaits
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily1770 —
结构域编号 domain_id6uovV01
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology70 — Alpha-Beta Plaits
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily1780 —
结构域编号 domain_id6uovV02
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology300 — GMP Synthetase; Chain A, domain 3
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily170 —
结构域编号 domain_id6uovV03
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology70 — Alpha-Beta Plaits
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily1770 —
结构域编号 domain_id6uovX01
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology70 — Alpha-Beta Plaits
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily1780 —
结构域编号 domain_id6uovX02
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology300 — GMP Synthetase; Chain A, domain 3
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily170 —
结构域编号 domain_id6uovX03
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology70 — Alpha-Beta Plaits
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily1770 —
结构域编号 domain_id6uovZ01
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology70 — Alpha-Beta Plaits
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily1780 —
结构域编号 domain_id6uovZ02
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology300 — GMP Synthetase; Chain A, domain 3
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily170 —
结构域编号 domain_id6uovZ03
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology70 — Alpha-Beta Plaits
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily1770 —
结构域编号 domain_id6uovb01
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology70 — Alpha-Beta Plaits
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily1780 —
结构域编号 domain_id6uovb02
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology300 — GMP Synthetase; Chain A, domain 3
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily170 —
结构域编号 domain_id6uovb03
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology70 — Alpha-Beta Plaits
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily1770 —
结构域编号 domain_id6uovd01
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology70 — Alpha-Beta Plaits
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily1780 —
结构域编号 domain_id6uovd02
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology300 — GMP Synthetase; Chain A, domain 3
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily170 —
结构域编号 domain_id6uovd03
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology70 — Alpha-Beta Plaits
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily1770 —
结构域编号 domain_id6uovf01
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology70 — Alpha-Beta Plaits
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily1780 —
结构域编号 domain_id6uovf02
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology300 — GMP Synthetase; Chain A, domain 3
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily170 —
结构域编号 domain_id6uovf03
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology70 — Alpha-Beta Plaits
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily1770 —
结构域编号 domain_id6uovh01
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology70 — Alpha-Beta Plaits
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily1780 —
结构域编号 domain_id6uovh02
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology300 — GMP Synthetase; Chain A, domain 3
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily170 —
结构域编号 domain_id6uovh03
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology70 — Alpha-Beta Plaits
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily1770 —
结构域编号 domain_id6uovj01
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology70 — Alpha-Beta Plaits
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily1780 —
结构域编号 domain_id6uovj02
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology300 — GMP Synthetase; Chain A, domain 3
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily170 —
结构域编号 domain_id6uovj03
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology70 — Alpha-Beta Plaits
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily1770 —
结构域编号 domain_id6uovl01
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology70 — Alpha-Beta Plaits
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily1780 —
结构域编号 domain_id6uovl02
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology300 — GMP Synthetase; Chain A, domain 3
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily170 —
结构域编号 domain_id6uovl03
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology70 — Alpha-Beta Plaits
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily1770 —
结构域编号 domain_id6uovn01
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology70 — Alpha-Beta Plaits
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily1780 —
结构域编号 domain_id6uovn02
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology300 — GMP Synthetase; Chain A, domain 3
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily170 —
结构域编号 domain_id6uovn03
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology70 — Alpha-Beta Plaits
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily1770 —
结构域编号 domain_id6uovp01
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology70 — Alpha-Beta Plaits
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily1780 —
结构域编号 domain_id6uovp02
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology300 — GMP Synthetase; Chain A, domain 3
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily170 —
结构域编号 domain_id6uovp03
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology70 — Alpha-Beta Plaits
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily1770 —
结构域编号 domain_id6uovr01
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology70 — Alpha-Beta Plaits
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily1780 —
结构域编号 domain_id6uovr02
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology300 — GMP Synthetase; Chain A, domain 3
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily170 —
结构域编号 domain_id6uovr03
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology70 — Alpha-Beta Plaits
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily1770 —
结构域编号 domain_id6uovt01
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology70 — Alpha-Beta Plaits
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily1780 —
结构域编号 domain_id6uovt02
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology300 — GMP Synthetase; Chain A, domain 3
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily170 —
结构域编号 domain_id6uovt03
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology70 — Alpha-Beta Plaits
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily1770 —
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7. 引用文献 (1)