6vq7

Mammalian V-ATPase from rat brain - composite model of rotational state 2 bound to ADP and SidK (built from focused refinement models)

Method: ELECTRON MICROSCOPY
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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

ATPase H+-transporting V1 subunit A

物种未注明

UniProt D4A133

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 34 V-type proton ATPase subunit B, brain isoform × 3 (P62815) V-type proton ATPase subunit C 1 × 1 (Q5FVI6) ATPase H+-transporting V1 subunit D × 1 (Q6P503) V-type proton ATPase subunit E 1 × 3 (Q6PCU2) V-type proton ATPase subunit F × 1 (P50408) V-type proton ATPase subunit G × 3 (Q8R2H0) Effector protein SidK × 3 (Q5ZWW6) V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 1 × 1 (P25286) ATPase, H+ transporting, V0 subunit B (Predicted), isoform CRA_a × 1 (B0K022) V-type proton ATPase subunit S1 × 1 (O54715) V-type proton ATPase subunit × 1 (Q5M7T6) V-type proton ATPase subunit e 2 × 1 (Q5EB76) Ribonuclease K × 1 (D3ZIM6) V-type proton ATPase 16 kDa proteolipid subunit × 9 (P63081) Renin receptor × 1 (Q6AXS4) ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MAGNESIUM ION × 1 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称 D4A133_RAT
Isoform —
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A; PDB构建体 1–617; UniProt 1–617 作者链 B; PDB构建体 1–617; UniProt 1–617 作者链 C; PDB构建体 1–617; UniProt 1–617

V-type proton ATPase subunit B, brain isoform

物种未注明

UniProt P62815

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 34 ATPase H+-transporting V1 subunit A × 3 (D4A133) V-type proton ATPase subunit C 1 × 1 (Q5FVI6) ATPase H+-transporting V1 subunit D × 1 (Q6P503) V-type proton ATPase subunit E 1 × 3 (Q6PCU2) V-type proton ATPase subunit F × 1 (P50408) V-type proton ATPase subunit G × 3 (Q8R2H0) Effector protein SidK × 3 (Q5ZWW6) V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 1 × 1 (P25286) ATPase, H+ transporting, V0 subunit B (Predicted), isoform CRA_a × 1 (B0K022) V-type proton ATPase subunit S1 × 1 (O54715) V-type proton ATPase subunit × 1 (Q5M7T6) V-type proton ATPase subunit e 2 × 1 (Q5EB76) Ribonuclease K × 1 (D3ZIM6) V-type proton ATPase 16 kDa proteolipid subunit × 9 (P63081) Renin receptor × 1 (Q6AXS4) ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MAGNESIUM ION × 1 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称 VATB2_RAT
Isoform —
PDB实体 2
链与序列区间 作者链 D; PDB构建体 1–511; UniProt 1–511 作者链 E; PDB构建体 1–511; UniProt 1–511 作者链 F; PDB构建体 1–511; UniProt 1–511

V-type proton ATPase subunit C 1

物种未注明

UniProt Q5FVI6

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 34 ATPase H+-transporting V1 subunit A × 3 (D4A133) V-type proton ATPase subunit B, brain isoform × 3 (P62815) ATPase H+-transporting V1 subunit D × 1 (Q6P503) V-type proton ATPase subunit E 1 × 3 (Q6PCU2) V-type proton ATPase subunit F × 1 (P50408) V-type proton ATPase subunit G × 3 (Q8R2H0) Effector protein SidK × 3 (Q5ZWW6) V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 1 × 1 (P25286) ATPase, H+ transporting, V0 subunit B (Predicted), isoform CRA_a × 1 (B0K022) V-type proton ATPase subunit S1 × 1 (O54715) V-type proton ATPase subunit × 1 (Q5M7T6) V-type proton ATPase subunit e 2 × 1 (Q5EB76) Ribonuclease K × 1 (D3ZIM6) V-type proton ATPase 16 kDa proteolipid subunit × 9 (P63081) Renin receptor × 1 (Q6AXS4) ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MAGNESIUM ION × 1 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称 VATC1_RAT
Isoform —
PDB实体 3
链与序列区间 作者链 G; PDB构建体 1–382; UniProt 1–382

ATPase H+-transporting V1 subunit D

物种未注明

UniProt Q6P503

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 34 ATPase H+-transporting V1 subunit A × 3 (D4A133) V-type proton ATPase subunit B, brain isoform × 3 (P62815) V-type proton ATPase subunit C 1 × 1 (Q5FVI6) V-type proton ATPase subunit E 1 × 3 (Q6PCU2) V-type proton ATPase subunit F × 1 (P50408) V-type proton ATPase subunit G × 3 (Q8R2H0) Effector protein SidK × 3 (Q5ZWW6) V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 1 × 1 (P25286) ATPase, H+ transporting, V0 subunit B (Predicted), isoform CRA_a × 1 (B0K022) V-type proton ATPase subunit S1 × 1 (O54715) V-type proton ATPase subunit × 1 (Q5M7T6) V-type proton ATPase subunit e 2 × 1 (Q5EB76) Ribonuclease K × 1 (D3ZIM6) V-type proton ATPase 16 kDa proteolipid subunit × 9 (P63081) Renin receptor × 1 (Q6AXS4) ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MAGNESIUM ION × 1 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称 Q6P503_RAT
Isoform —
PDB实体 4
链与序列区间 作者链 H; PDB构建体 1–247; UniProt 1–247

V-type proton ATPase subunit E 1

物种未注明

UniProt Q6PCU2

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 34 ATPase H+-transporting V1 subunit A × 3 (D4A133) V-type proton ATPase subunit B, brain isoform × 3 (P62815) V-type proton ATPase subunit C 1 × 1 (Q5FVI6) ATPase H+-transporting V1 subunit D × 1 (Q6P503) V-type proton ATPase subunit F × 1 (P50408) V-type proton ATPase subunit G × 3 (Q8R2H0) Effector protein SidK × 3 (Q5ZWW6) V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 1 × 1 (P25286) ATPase, H+ transporting, V0 subunit B (Predicted), isoform CRA_a × 1 (B0K022) V-type proton ATPase subunit S1 × 1 (O54715) V-type proton ATPase subunit × 1 (Q5M7T6) V-type proton ATPase subunit e 2 × 1 (Q5EB76) Ribonuclease K × 1 (D3ZIM6) V-type proton ATPase 16 kDa proteolipid subunit × 9 (P63081) Renin receptor × 1 (Q6AXS4) ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MAGNESIUM ION × 1 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称 VATE1_RAT
Isoform —
PDB实体 5
链与序列区间 作者链 I; PDB构建体 1–226; UniProt 1–226 作者链 J; PDB构建体 1–226; UniProt 1–226 作者链 K; PDB构建体 1–226; UniProt 1–226

V-type proton ATPase subunit F

物种未注明

UniProt P50408

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 34 ATPase H+-transporting V1 subunit A × 3 (D4A133) V-type proton ATPase subunit B, brain isoform × 3 (P62815) V-type proton ATPase subunit C 1 × 1 (Q5FVI6) ATPase H+-transporting V1 subunit D × 1 (Q6P503) V-type proton ATPase subunit E 1 × 3 (Q6PCU2) V-type proton ATPase subunit G × 3 (Q8R2H0) Effector protein SidK × 3 (Q5ZWW6) V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 1 × 1 (P25286) ATPase, H+ transporting, V0 subunit B (Predicted), isoform CRA_a × 1 (B0K022) V-type proton ATPase subunit S1 × 1 (O54715) V-type proton ATPase subunit × 1 (Q5M7T6) V-type proton ATPase subunit e 2 × 1 (Q5EB76) Ribonuclease K × 1 (D3ZIM6) V-type proton ATPase 16 kDa proteolipid subunit × 9 (P63081) Renin receptor × 1 (Q6AXS4) ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MAGNESIUM ION × 1 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称 VATF_RAT
Isoform —
PDB实体 6
链与序列区间 作者链 L; PDB构建体 1–119; UniProt 1–119

V-type proton ATPase subunit G

物种未注明

UniProt Q8R2H0

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 34 ATPase H+-transporting V1 subunit A × 3 (D4A133) V-type proton ATPase subunit B, brain isoform × 3 (P62815) V-type proton ATPase subunit C 1 × 1 (Q5FVI6) ATPase H+-transporting V1 subunit D × 1 (Q6P503) V-type proton ATPase subunit E 1 × 3 (Q6PCU2) V-type proton ATPase subunit F × 1 (P50408) Effector protein SidK × 3 (Q5ZWW6) V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 1 × 1 (P25286) ATPase, H+ transporting, V0 subunit B (Predicted), isoform CRA_a × 1 (B0K022) V-type proton ATPase subunit S1 × 1 (O54715) V-type proton ATPase subunit × 1 (Q5M7T6) V-type proton ATPase subunit e 2 × 1 (Q5EB76) Ribonuclease K × 1 (D3ZIM6) V-type proton ATPase 16 kDa proteolipid subunit × 9 (P63081) Renin receptor × 1 (Q6AXS4) ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MAGNESIUM ION × 1 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称 Q8R2H0_RAT
Isoform —
PDB实体 7
链与序列区间 作者链 M; PDB构建体 1–118; UniProt 1–118 作者链 N; PDB构建体 1–118; UniProt 1–118 作者链 O; PDB构建体 1–118; UniProt 1–118

Effector protein SidK

Legionella pneumophila subsp. pneumophila (strain Philadelphia 1 / ATCC 33152 / DSM 7513)

UniProt Q5ZWW6

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 34 ATPase H+-transporting V1 subunit A × 3 (D4A133) V-type proton ATPase subunit B, brain isoform × 3 (P62815) V-type proton ATPase subunit C 1 × 1 (Q5FVI6) ATPase H+-transporting V1 subunit D × 1 (Q6P503) V-type proton ATPase subunit E 1 × 3 (Q6PCU2) V-type proton ATPase subunit F × 1 (P50408) V-type proton ATPase subunit G × 3 (Q8R2H0) V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 1 × 1 (P25286) ATPase, H+ transporting, V0 subunit B (Predicted), isoform CRA_a × 1 (B0K022) V-type proton ATPase subunit S1 × 1 (O54715) V-type proton ATPase subunit × 1 (Q5M7T6) V-type proton ATPase subunit e 2 × 1 (Q5EB76) Ribonuclease K × 1 (D3ZIM6) V-type proton ATPase 16 kDa proteolipid subunit × 9 (P63081) Renin receptor × 1 (Q6AXS4) ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MAGNESIUM ION × 1 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称 Q5ZWW6_LEGPH
Isoform —
PDB实体 8
链与序列区间 作者链 Q; PDB构建体 2–279; UniProt 1–278 作者链 R; PDB构建体 2–279; UniProt 1–278 作者链 S; PDB构建体 2–279; UniProt 1–278

V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 1

物种未注明

UniProt P25286

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 34 ATPase H+-transporting V1 subunit A × 3 (D4A133) V-type proton ATPase subunit B, brain isoform × 3 (P62815) V-type proton ATPase subunit C 1 × 1 (Q5FVI6) ATPase H+-transporting V1 subunit D × 1 (Q6P503) V-type proton ATPase subunit E 1 × 3 (Q6PCU2) V-type proton ATPase subunit F × 1 (P50408) V-type proton ATPase subunit G × 3 (Q8R2H0) Effector protein SidK × 3 (Q5ZWW6) ATPase, H+ transporting, V0 subunit B (Predicted), isoform CRA_a × 1 (B0K022) V-type proton ATPase subunit S1 × 1 (O54715) V-type proton ATPase subunit × 1 (Q5M7T6) V-type proton ATPase subunit e 2 × 1 (Q5EB76) Ribonuclease K × 1 (D3ZIM6) V-type proton ATPase 16 kDa proteolipid subunit × 9 (P63081) Renin receptor × 1 (Q6AXS4) ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MAGNESIUM ION × 1 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称 VPP1_RAT
Isoform —
PDB实体 9
链与序列区间 作者链 a; PDB构建体 1–838; UniProt 1–838

ATPase, H+ transporting, V0 subunit B (Predicted), isoform CRA_a

物种未注明

UniProt B0K022

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 34 ATPase H+-transporting V1 subunit A × 3 (D4A133) V-type proton ATPase subunit B, brain isoform × 3 (P62815) V-type proton ATPase subunit C 1 × 1 (Q5FVI6) ATPase H+-transporting V1 subunit D × 1 (Q6P503) V-type proton ATPase subunit E 1 × 3 (Q6PCU2) V-type proton ATPase subunit F × 1 (P50408) V-type proton ATPase subunit G × 3 (Q8R2H0) Effector protein SidK × 3 (Q5ZWW6) V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 1 × 1 (P25286) V-type proton ATPase subunit S1 × 1 (O54715) V-type proton ATPase subunit × 1 (Q5M7T6) V-type proton ATPase subunit e 2 × 1 (Q5EB76) Ribonuclease K × 1 (D3ZIM6) V-type proton ATPase 16 kDa proteolipid subunit × 9 (P63081) Renin receptor × 1 (Q6AXS4) ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MAGNESIUM ION × 1 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称 B0K022_RAT
Isoform —
PDB实体 10
链与序列区间 作者链 b; PDB构建体 1–205; UniProt 1–205

V-type proton ATPase subunit S1

物种未注明

UniProt O54715

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 34 ATPase H+-transporting V1 subunit A × 3 (D4A133) V-type proton ATPase subunit B, brain isoform × 3 (P62815) V-type proton ATPase subunit C 1 × 1 (Q5FVI6) ATPase H+-transporting V1 subunit D × 1 (Q6P503) V-type proton ATPase subunit E 1 × 3 (Q6PCU2) V-type proton ATPase subunit F × 1 (P50408) V-type proton ATPase subunit G × 3 (Q8R2H0) Effector protein SidK × 3 (Q5ZWW6) V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 1 × 1 (P25286) ATPase, H+ transporting, V0 subunit B (Predicted), isoform CRA_a × 1 (B0K022) V-type proton ATPase subunit × 1 (Q5M7T6) V-type proton ATPase subunit e 2 × 1 (Q5EB76) Ribonuclease K × 1 (D3ZIM6) V-type proton ATPase 16 kDa proteolipid subunit × 9 (P63081) Renin receptor × 1 (Q6AXS4) ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MAGNESIUM ION × 1 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称 VAS1_RAT
Isoform —
PDB实体 11
链与序列区间 作者链 c; PDB构建体 1–463; UniProt 1–463

V-type proton ATPase subunit

物种未注明

UniProt Q5M7T6

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 34 ATPase H+-transporting V1 subunit A × 3 (D4A133) V-type proton ATPase subunit B, brain isoform × 3 (P62815) V-type proton ATPase subunit C 1 × 1 (Q5FVI6) ATPase H+-transporting V1 subunit D × 1 (Q6P503) V-type proton ATPase subunit E 1 × 3 (Q6PCU2) V-type proton ATPase subunit F × 1 (P50408) V-type proton ATPase subunit G × 3 (Q8R2H0) Effector protein SidK × 3 (Q5ZWW6) V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 1 × 1 (P25286) ATPase, H+ transporting, V0 subunit B (Predicted), isoform CRA_a × 1 (B0K022) V-type proton ATPase subunit S1 × 1 (O54715) V-type proton ATPase subunit e 2 × 1 (Q5EB76) Ribonuclease K × 1 (D3ZIM6) V-type proton ATPase 16 kDa proteolipid subunit × 9 (P63081) Renin receptor × 1 (Q6AXS4) ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MAGNESIUM ION × 1 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称 Q5M7T6_RAT
Isoform —
PDB实体 12
链与序列区间 作者链 d; PDB构建体 1–351; UniProt 1–351

V-type proton ATPase subunit e 2

物种未注明

UniProt Q5EB76

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 34 ATPase H+-transporting V1 subunit A × 3 (D4A133) V-type proton ATPase subunit B, brain isoform × 3 (P62815) V-type proton ATPase subunit C 1 × 1 (Q5FVI6) ATPase H+-transporting V1 subunit D × 1 (Q6P503) V-type proton ATPase subunit E 1 × 3 (Q6PCU2) V-type proton ATPase subunit F × 1 (P50408) V-type proton ATPase subunit G × 3 (Q8R2H0) Effector protein SidK × 3 (Q5ZWW6) V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 1 × 1 (P25286) ATPase, H+ transporting, V0 subunit B (Predicted), isoform CRA_a × 1 (B0K022) V-type proton ATPase subunit S1 × 1 (O54715) V-type proton ATPase subunit × 1 (Q5M7T6) Ribonuclease K × 1 (D3ZIM6) V-type proton ATPase 16 kDa proteolipid subunit × 9 (P63081) Renin receptor × 1 (Q6AXS4) ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MAGNESIUM ION × 1 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称 VA0E2_RAT
Isoform —
PDB实体 13
链与序列区间 作者链 e; PDB构建体 1–81; UniProt 1–81

Ribonuclease K

物种未注明

UniProt D3ZIM6

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 34 ATPase H+-transporting V1 subunit A × 3 (D4A133) V-type proton ATPase subunit B, brain isoform × 3 (P62815) V-type proton ATPase subunit C 1 × 1 (Q5FVI6) ATPase H+-transporting V1 subunit D × 1 (Q6P503) V-type proton ATPase subunit E 1 × 3 (Q6PCU2) V-type proton ATPase subunit F × 1 (P50408) V-type proton ATPase subunit G × 3 (Q8R2H0) Effector protein SidK × 3 (Q5ZWW6) V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 1 × 1 (P25286) ATPase, H+ transporting, V0 subunit B (Predicted), isoform CRA_a × 1 (B0K022) V-type proton ATPase subunit S1 × 1 (O54715) V-type proton ATPase subunit × 1 (Q5M7T6) V-type proton ATPase subunit e 2 × 1 (Q5EB76) V-type proton ATPase 16 kDa proteolipid subunit × 9 (P63081) Renin receptor × 1 (Q6AXS4) ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MAGNESIUM ION × 1 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称 D3ZIM6_RAT
Isoform —
PDB实体 14
链与序列区间 作者链 f; PDB构建体 1–98; UniProt 1–98

V-type proton ATPase 16 kDa proteolipid subunit

物种未注明

UniProt P63081

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 34 ATPase H+-transporting V1 subunit A × 3 (D4A133) V-type proton ATPase subunit B, brain isoform × 3 (P62815) V-type proton ATPase subunit C 1 × 1 (Q5FVI6) ATPase H+-transporting V1 subunit D × 1 (Q6P503) V-type proton ATPase subunit E 1 × 3 (Q6PCU2) V-type proton ATPase subunit F × 1 (P50408) V-type proton ATPase subunit G × 3 (Q8R2H0) Effector protein SidK × 3 (Q5ZWW6) V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 1 × 1 (P25286) ATPase, H+ transporting, V0 subunit B (Predicted), isoform CRA_a × 1 (B0K022) V-type proton ATPase subunit S1 × 1 (O54715) V-type proton ATPase subunit × 1 (Q5M7T6) V-type proton ATPase subunit e 2 × 1 (Q5EB76) Ribonuclease K × 1 (D3ZIM6) Renin receptor × 1 (Q6AXS4) ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MAGNESIUM ION × 1 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称 VATL_RAT
Isoform —
PDB实体 15
链与序列区间 作者链 g; PDB构建体 1–155; UniProt 1–155 作者链 h; PDB构建体 1–155; UniProt 1–155 作者链 i; PDB构建体 1–155; UniProt 1–155 作者链 j; PDB构建体 1–155; UniProt 1–155 作者链 k; PDB构建体 1–155; UniProt 1–155 作者链 l; PDB构建体 1–155; UniProt 1–155 作者链 m; PDB构建体 1–155; UniProt 1–155 作者链 n; PDB构建体 1–155; UniProt 1–155 作者链 o; PDB构建体 1–155; UniProt 1–155

Renin receptor

物种未注明

UniProt Q6AXS4

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 34 ATPase H+-transporting V1 subunit A × 3 (D4A133) V-type proton ATPase subunit B, brain isoform × 3 (P62815) V-type proton ATPase subunit C 1 × 1 (Q5FVI6) ATPase H+-transporting V1 subunit D × 1 (Q6P503) V-type proton ATPase subunit E 1 × 3 (Q6PCU2) V-type proton ATPase subunit F × 1 (P50408) V-type proton ATPase subunit G × 3 (Q8R2H0) Effector protein SidK × 3 (Q5ZWW6) V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 1 × 1 (P25286) ATPase, H+ transporting, V0 subunit B (Predicted), isoform CRA_a × 1 (B0K022) V-type proton ATPase subunit S1 × 1 (O54715) V-type proton ATPase subunit × 1 (Q5M7T6) V-type proton ATPase subunit e 2 × 1 (Q5EB76) Ribonuclease K × 1 (D3ZIM6) V-type proton ATPase 16 kDa proteolipid subunit × 9 (P63081) ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MAGNESIUM ION × 1 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称 RENR_RAT
Isoform —
PDB实体 16
链与序列区间 作者链 p; PDB构建体 1–350; UniProt 1–350

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中;数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护,因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id6vq7
沉积日期 deposition_date2020-02-04
结构标题 titleMammalian V-ATPase from rat brain - composite model of rotational state 2 bound to ADP and SidK (built from focused refinement models)
关键词 keywordsmembrane protein complex, rotary atpase, PROTON TRANSPORT; PROTON TRANSPORT
实验方法 methodELECTRON MICROSCOPY
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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

6vq7__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

6vq7__assembly_1__model_1 | I(q)

10-2 10-1 106 107 108 109 q (1/Angstrom) I(q)
100 个绘图点;横轴和纵轴均采用对数尺度。

6vq7__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

新版 assembly/model P(r) 尚未计算 此处仅保留位置,不展示旧数据 r (Angstrom) P(r)
P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。
Rg(Guinier)80.04 Å
Rg(电子密度)81.15 Å
总 Rg81.13 Å
原子数62325
残基数8454
排除体积1113100 ų
最大 q0.500 Å⁻¹
Assembly Model 结构单元 聚集说明 状态 CRYSOL 操作
1 1 6vq7__assembly_1__model_1 34-meric (34) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (18)

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6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 16 domains

CATH v4.4 (16 domains)

结构域编号 domain_id6vq7A02
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology50 — Rossmann fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily300 — P-loop containing nucleotide triphosphate hydrolases
结构域编号 domain_id6vq7A03
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture40 — Beta Barrel
拓扑 Topology topology50 — OB fold (Dihydrolipoamide Acetyltransferase, E2P)
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily100 — RNA polymerase II/Efflux pump adaptor protein, barrel-sandwich hybrid domain
结构域编号 domain_id6vq7B02
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology50 — Rossmann fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily300 — P-loop containing nucleotide triphosphate hydrolases
结构域编号 domain_id6vq7B03
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture40 — Beta Barrel
拓扑 Topology topology50 — OB fold (Dihydrolipoamide Acetyltransferase, E2P)
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily100 — RNA polymerase II/Efflux pump adaptor protein, barrel-sandwich hybrid domain
结构域编号 domain_id6vq7C02
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology50 — Rossmann fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily300 — P-loop containing nucleotide triphosphate hydrolases
结构域编号 domain_id6vq7C03
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture40 — Beta Barrel
拓扑 Topology topology50 — OB fold (Dihydrolipoamide Acetyltransferase, E2P)
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily100 — RNA polymerase II/Efflux pump adaptor protein, barrel-sandwich hybrid domain
结构域编号 domain_id6vq7D00
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology50 — Rossmann fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily12240 —
结构域编号 domain_id6vq7E00
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology50 — Rossmann fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily12240 —
结构域编号 domain_id6vq7F00
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology50 — Rossmann fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily12240 —
结构域编号 domain_id6vq7G02
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology1460 — subunit c (vma5p) of the yeast v-atpase, domain 2
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — subunit c (vma5p) of the yeast v-atpase, domain 2
结构域编号 domain_id6vq7G03
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology70 — Alpha-Beta Plaits
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily100 —
结构域编号 domain_id6vq7H01
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology287 — Helix Hairpins
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily3240 —
结构域编号 domain_id6vq7I01
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology2320 — hypothetical protein PF0899 fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily30 — ATP synthase, E subunit, C-terminal
结构域编号 domain_id6vq7J01
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology2320 — hypothetical protein PF0899 fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily30 — ATP synthase, E subunit, C-terminal
结构域编号 domain_id6vq7K01
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology2320 — hypothetical protein PF0899 fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily30 — ATP synthase, E subunit, C-terminal
结构域编号 domain_id6vq7L00
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology50 — Rossmann fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10580 — ATPase, V1 complex, subunit F
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7. 引用文献 (1)