Tubulin alpha-1B chain
物种未注明
当前结构中的状态
| Assembly | 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与共同组分 | 实验方法与环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白拷贝数一致 | 链 A； UniProt 1–451 链 C； UniProt 1–451 | 未记录 | Tubulin beta chain × 2 （P02554） Stathmin-4 × 1 （P63043） Tubulin-Tyrosine Ligase × 1 （E1BQ43） GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3 MG MAGNESIUM ION × 5 CA CALCIUM ION × 2 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 1 O9B (2~{R})-1-methylpiperidine-2-carboxylic acid × 1 O9K [(1~{R},3~{R})-1-(4-methanoyl-1,3-thiazol-2-yl)-4-methyl-3-(methylamino)pentyl] ethanoate × 1 O9N methyl (2~{S},4~{S})-2,4-bis(azanyl)-5-phenyl-pentanoate × 1 PGE TRIETHYLENE GLYCOL × 1 VAL VALINE × 1 P6S benzyl hydrogen carbonate × 1 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 ACP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID ADENYLATE ESTER × 1 | X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；293 K；30 mM calcium chloride, 30 mM magnesium chloride, 0.10 M MES pH 6.0, 2.0% w/v PEG 4000, 5.0% w/v glycerol | 分辨率 2.85 Å R-free 0.220 |
数据库中的同蛋白其他状态
以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。
| 其他 PDB | 相对当前条目 6Y4N | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法与环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 3J8X High-resolution structure of no-nucleotide kinesin on microtubules 提交 2014-11-20 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric |
链 A
1–451（451 aa）
|
未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
25 mM PIPES, 25 mM NaCl, 2 mM MgCl2, 1 mM EGTA；pH 6.8；25 mM PIPES, 25 mM NaCl, 2 mM MgCl2, 1 mM EGTA
cryo-EM玻璃化条件
No glow discharge was applied. After sample application to grid, liquid was mostly 'wicked' away by edgewise application of filter paper. Subsequently, blotting and plunge freezing were performed with ~0.5 second delay after blotting but prior to plunging.；冷冻剂 ETHANE；No glow discharge was applied. After sample application to grid, liquid was mostly 'wicked' away by edgewise application of filter paper. Subsequently, blotting and plunge freezing were performed with ~0.5 second delay after blotting but prior to plunging into liquid ethane.
|
分辨率 5.00 Å |
| 3J8Y High-resolution structure of ATP analog-bound kinesin on microtubules 提交 2014-11-20 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric |
链 A
1–451（451 aa）
|
未记录 | ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
25 mM PIPES, 25 mM NaCl, 2 mM MgCl2, 1 mM EGTA；pH 6.8；25 mM PIPES, 25 mM NaCl, 2 mM MgCl2, 1 mM EGTA
cryo-EM玻璃化条件
No glow discharge was applied. After sample application to grid, liquid was mostly 'wicked' away by edgewise application of filter paper. Subsequently, blotting and plunge freezing were performed with ~0.5 second delay after blotting but prior to plunging.；冷冻剂 ETHANE；No glow discharge was applied. After sample application to grid, liquid was mostly 'wicked' away by edgewise application of filter paper. Subsequently, blotting and plunge freezing were performed with ~0.5 second delay after blotting but prior to plunging into liquid ethane.
|
分辨率 5.00 Å |
| 3JAK Cryo-EM structure of GTPgammaS-microtubule co-polymerized with EB3 (merged dataset with and without kinesin bound) 提交 2015-06-16 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：tetradecameric |
链 A
1–451（451 aa）
链 C
1–451（451 aa）
链 E
1–451（451 aa）
链 J
1–451（451 aa）
链 K
1–451（451 aa）
链 L
1–451（451 aa）
|
未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 6 MG MAGNESIUM ION × 6 GSP 5'-GUANOSINE-DIPHOSPHATE-MONOTHIOPHOSPHATE × 6 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
BRB80；pH 6.8；80 mM PIPES, 1 mM EGTA, 1 mM MgCl2, 1 mM DTT, 0.05% Nonidet P-40
cryo-EM玻璃化条件
Blot once for 4 seconds before plunging.；90.4 K；冷冻剂 ETHANE；Blot once for 4 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK II).
|
分辨率 3.30 Å |
| 3JAL Cryo-EM structure of GMPCPP-microtubule co-polymerized with EB3 提交 2015-06-16 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：tetradecameric |
链 A
1–451（451 aa）
链 C
1–451（451 aa）
链 E
1–451（451 aa）
链 J
1–451（451 aa）
链 K
1–451（451 aa）
链 L
1–451（451 aa）
|
未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 6 MG MAGNESIUM ION × 6 G2P PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 6 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
BRB80；pH 6.8；80 mM PIPES, 1 mM EGTA, 1 mM MgCl2, 1 mM DTT, 0.05% Nonidet P-40
cryo-EM玻璃化条件
Blot once for 4 seconds before plunging；90.4 K；冷冻剂 ETHANE；Blot once for 4 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK II).
|
分辨率 3.50 Å |
| 3JAR Cryo-EM structure of GDP-microtubule co-polymerized with EB3 提交 2015-06-19 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：tetradecameric |
链 A
1–451（451 aa）
链 C
1–451（451 aa）
链 E
1–451（451 aa）
链 J
1–451（451 aa）
链 K
1–451（451 aa）
链 L
1–451（451 aa）
|
未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 6 MG MAGNESIUM ION × 6 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
BRB80；pH 6.8；80 mM PIPES, 1 mM EGTA, 1 mM MgCl2, 1 mM DTT, 0.05% Nonidet P-40
cryo-EM玻璃化条件
Blot once for 4 seconds before plunging/；90.4 K；冷冻剂 ETHANE；Blot once for 4 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK II).
|
分辨率 3.40 Å |
| 3JAS Cryo-EM structure of dynamic GDP-microtubule (14 protofilaments) decorated with kinesin 提交 2015-06-19 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric |
链 A
1–451（451 aa）
链 C
1–451（451 aa）
链 E
1–451（451 aa）
链 J
1–451（451 aa）
链 K
1–451（451 aa）
链 L
1–451（451 aa）
|
未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 6 MG MAGNESIUM ION × 6 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
BRB80；pH 6.8；80 mM PIPES, 1 mM EGTA, 1 mM MgCl2, 1 mM DTT, 0.05% Nonidet P-40
cryo-EM玻璃化条件
Blot once for 4 seconds before plunging.；90.4 K；冷冻剂 ETHANE；Blot once for 4 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK II).
|
分辨率 3.50 Å |
| 3JAT Cryo-EM structure of GMPCPP-microtubule (14 protofilaments) decorated with kinesin 提交 2015-06-20 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric |
链 A
1–451（451 aa）
链 C
1–451（451 aa）
链 E
1–451（451 aa）
链 J
1–451（451 aa）
链 K
1–451（451 aa）
链 L
1–451（451 aa）
|
未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 6 MG MAGNESIUM ION × 12 G2P PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 6 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
BRB80；pH 6.8；80 mM PIPES, 1 mM EGTA, 1 mM MgCl2, 1 mM DTT, 0.05% Nonidet P-40
cryo-EM玻璃化条件
Blot once for 4 seconds before plunging.；90.4 K；冷冻剂 ETHANE；Blot once for 4 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK II).
|
分辨率 3.50 Å |
| 3JAW Atomic model of a microtubule seam based on a cryo-EM reconstruction of the EB3-bound microtubule (merged dataset containing tubulin bound to GTPgammaS, GMPCPP, and GDP) 提交 2015-06-30 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
1–451（451 aa）
链 C
1–451（451 aa）
|
未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 GSP 5'-GUANOSINE-DIPHOSPHATE-MONOTHIOPHOSPHATE × 2 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
BRB80；pH 6.8；80 mM PIPES, 1 mM EGTA, 1 mM MgCl2, 1 mM DTT, 0.05% Nonidet P-40
cryo-EM玻璃化条件
Blot once for 4 seconds before plunging.；90.4 K；冷冻剂 ETHANE；Blot once for 4 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK II).
|
分辨率 3.90 Å |
| 4ZHQ Crystal structure of Tubulin-Stathmin-TTL-MMAE Complex 提交 2015-04-26 | 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric |
链 A
1–451（451 aa）
链 C
1–451（451 aa）
|
未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 4 CA CALCIUM ION × 3 GOL GLYCEROL × 8 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 2 4Q5 N-methyl-L-valyl-N-[(3R,4S,5S)-1-{(2S)-2-[(1R,2R)-3-{[(1S,2R)-1-hydroxy-1-phenylpropan-2-yl]amino}-1-methoxy-2-methyl-3-oxopropyl]pyrrolidin-1-yl}-3-methoxy-5-methyl-1-oxoheptan-4-yl]-N-methyl-L-valinamide × 1 ACP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID ADENYLATE ESTER × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 6.7；293 K；6% PEG, 5% glycerol, 0.1M MES, 30 mM CaCl2, 30 mM MgCl2
|
分辨率 2.55 Å R-free 0.245 |
| 4ZI7 CRYSTAL STRUCTURE OF TUBULIN-STATHMIN-TTL-HTI286 COMPLEX 提交 2015-04-27 | 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric |
链 A
1–451（451 aa）
链 C
1–451（451 aa）
|
未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 4 CA CALCIUM ION × 4 GOL GLYCEROL × 8 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 2 4SL N,beta,beta-trimethyl-L-phenylalanyl-N-[(3S,4Z)-5-carboxy-2-methylhex-4-en-3-yl]-N,3-dimethyl-L-valinamide × 1 ACP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID ADENYLATE ESTER × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；293 K；PEG, glycerol, MES, CaCl2, MgCl2
|
分辨率 2.51 Å R-free 0.239 |
| 4ZOL Crystal Structure of Tubulin-Stathmin-TTL-Tubulysin M Complex 提交 2015-05-06 | 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric |
链 A
1–451（451 aa）
链 C
1–451（451 aa）
|
未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 4 CA CALCIUM ION × 2 GOL GLYCEROL × 7 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 2 55Q (2R,4R)-4-{[(2-{(1R,3R)-1-(acetyloxy)-4-methyl-3-[methyl(N-{[(2S)-1-methylpiperidin-2-yl]carbonyl}-D-isoleucyl)amino]pentyl}-1,3-thiazol-4-yl)carbonyl]amino}-2-methyl-5-phenylpentanoic acid × 2 ACP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID ADENYLATE ESTER × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 6.7；293 K；6% PEG, 5% glycerol, 0.1M MES, 30 mM CaCl2, 30 mM MgCl2
|
分辨率 2.50 Å R-free 0.232 |
| 5CA0 Crystal structure of T2R-TTL-Lexibulin complex 提交 2015-06-29 | 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric |
链 A
1–451（451 aa）
链 C
1–451（451 aa）
|
未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 3 CA CALCIUM ION × 2 GOL GLYCEROL × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 1 LXL 1-ethyl-3-[2-methoxy-4-(5-methyl-4-{[(1S)-1-(pyridin-3-yl)butyl]amino}pyrimidin-2-yl)phenyl]urea × 2 ACP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID ADENYLATE ESTER × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.7；293 K；6% polyethylene glycol 4000, 8% glycerol, 0.1 M MES, 30 mM CaCl2, 30 mM MgCl2, pH 6.7
|
分辨率 2.50 Å R-free 0.237 |
| 5EZY Crystal structure of T2R-TTL-taccalonolide AJ complex 提交 2015-11-27 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric |
链 A
1–450（450 aa）
链 C
1–450（450 aa）
|
未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3 MG MAGNESIUM ION × 4 CA CALCIUM ION × 2 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 2 TAJ taccalonolide AJ × 2 ACP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID ADENYLATE ESTER × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；6% polyethylene glycol 4000, 8% glycerol, 0.1 M MES, 30 mM CaCl2, 30 mM MgCl2, pH 6.7
|
分辨率 2.05 Å R-free 0.208 |
| 5FNV a new complex structure of tubulin with an alpha-beta unsaturated lactone 提交 2015-11-16 | 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric |
链 A
1–451（451 aa）
链 C
1–451（451 aa）
|
未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3 MG MAGNESIUM ION × 4 CA CALCIUM ION × 3 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 2 X3H PIRONETIN × 1 ACP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID ADENYLATE ESTER × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 6.7；0.1M MES PH6.7;6% PEG4000 ;5% GLYCEROL;30MM CACL2;30MM MGCL2
|
分辨率 2.61 Å R-free 0.226 |
| 5H74 Crystal structure of T2R-TTL-14b complex 提交 2016-11-17 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric |
链 A
1–450（450 aa）
片段：UNP residues 1-450
链 C
1–450（450 aa）
片段：UNP residues 1-450
|
未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3 MG MAGNESIUM ION × 4 CA CALCIUM ION × 2 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 3 7LG (2~{S},4~{R})-4-[[2-[(1~{R},3~{R})-1-acetyloxy-3-[hexyl-[(2~{S},3~{S})-3-methyl-2-[[(2~{R})-1-methylpiperidin-2-yl]carbonylamino]pentanoyl]amino]-4-methyl-pentyl]-1,3-thiazol-4-yl]carbonylamino]-5-(4-fluorophenyl)-2-methyl-pentanoic acid × 2 ACP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID ADENYLATE ESTER × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；6% PEG, 5% glycerol, 0.1 M MES, 30 mM CaCl2, 30 mM MgCl2, pH 6.7
|
分辨率 2.60 Å R-free 0.248 |
| 5H7O Crystal structure of DJ-101 in complex with tubulin protein 提交 2016-11-20 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric |
链 A
1–450（450 aa）
链 C
1–450（450 aa）
|
未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3 MG MAGNESIUM ION × 4 CA CALCIUM ION × 2 GOL GLYCEROL × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 1 7Q7 2-(1H-indol-4-yl)-4-(3,4,5-trimethoxyphenyl)-1H-imidazo[4,5-c]pyridine × 2 ACP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID ADENYLATE ESTER × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；6% poly(ethylene glycol) 4000, 8% glycerol,
0.1 M Mes, 30 mM CaCl2 and 30 mM MgCl2 (pH 6.7)
|
分辨率 2.80 Å R-free 0.256 |
| 5JCB Microtubule depolymerizing agent podophyllotoxin derivative YJTSF1 提交 2016-04-14 | 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric |
链 A
1–451（451 aa）
链 C
1–451（451 aa）
|
未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 7 GOL GLYCEROL × 8 IMD IMIDAZOLE × 2 CA CALCIUM ION × 2 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 NA SODIUM ION × 2 MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 1 NV4 (5R,5aR,8aS,9R)-9-[(4H-1,2,4-triazol-3-yl)sulfanyl]-5-(3,4,5-trimethoxyphenyl)-5,8,8a,9-tetrahydro-2H-furo[3',4':6,7]naphtho[2,3-d][1,3]dioxol-6(5aH)-one × 2 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 ACP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID ADENYLATE ESTER × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；PEG 4000, Glycerol, Magnesium chloride, Calcium chloride
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.200 |
| 5JQG An apo tubulin-RB-TTL complex structure used for side-by-side comparison 提交 2016-05-04 | 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric |
链 A
1–451（451 aa）
链 C
1–451（451 aa）
|
未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3 MG MAGNESIUM ION × 4 CA CALCIUM ION × 3 CL CHLORIDE ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 2 ACP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID ADENYLATE ESTER × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 6.7；293 K；0.1M MES, 6% PEG4000, 5% Glycerol, 30mM CaCl2, 30mM MgCl2
|
分辨率 2.24 Å R-free 0.212 |
| 5KMG Near-atomic cryo-EM structure of PRC1 bound to the microtubule 提交 2016-06-27 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 42 PDB 声明：42-meric |
链 A
1–441（441 aa）
|
未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 14 MG MAGNESIUM ION × 14 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 14 POU Peloruside A × 14 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；blot for 4 seconds, blot force 10
|
分辨率 3.50 Å |
| 5KMG Near-atomic cryo-EM structure of PRC1 bound to the microtubule 提交 2016-06-27 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric |
链 A
1–441（441 aa）
|
未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 POU Peloruside A × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；blot for 4 seconds, blot force 10
|
分辨率 3.50 Å |
| 5KMG Near-atomic cryo-EM structure of PRC1 bound to the microtubule 提交 2016-06-27 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric |
链 A
1–441（441 aa）
|
未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 POU Peloruside A × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；blot for 4 seconds, blot force 10
|
分辨率 3.50 Å |
| 5XIW Crystal structure of T2R-TTL-Colchicine complex 提交 2017-04-27 | 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric |
链 A
1–451（451 aa）
链 C
1–451（451 aa）
|
未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3 MG MAGNESIUM ION × 4 CA CALCIUM ION × 2 GOL GLYCEROL × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 1 LOC N-[(7S)-1,2,3,10-tetramethoxy-9-oxo-6,7-dihydro-5H-benzo[d]heptalen-7-yl]ethanamide × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.7；293 K；6% polyethylene glycol 4000, 8% glycerol, 0.1 M MES, 30 mM CaCl2, 30 mM MgCl2, pH 6.7
|
分辨率 2.90 Å R-free 0.253 |
| 5XKE Crystal structure of T2R-TTL-Demecolcine complex 提交 2017-05-07 | 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric |
链 A
1–451（451 aa）
链 C
1–451（451 aa）
|
未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3 MG MAGNESIUM ION × 4 CA CALCIUM ION × 2 GOL GLYCEROL × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 1 LON (7S)-1,2,3,10-tetramethoxy-7-(methylamino)-6,7-dihydro-5H-benzo[a]heptalen-9-one × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.7；293 K；6% polyethylene glycol 4000, 8% glycerol, 0.1 M MES, 30 mM CaCl2, 30 mM MgCl2, pH 6.7
|
分辨率 2.60 Å R-free 0.264 |
| 5XKF Crystal structure of T2R-TTL-MPC6827 complex 提交 2017-05-07 | 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric |
链 A
1–451（451 aa）
链 C
1–451（451 aa）
|
未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3 MG MAGNESIUM ION × 4 CA CALCIUM ION × 2 GOL GLYCEROL × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 1 88U N-(4-methoxyphenyl)-N,2-dimethyl-quinazolin-4-amine × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.7；293 K；6% polyethylene glycol 4000, 8% glycerol, 0.1 M MES, 30 mM CaCl2, 30 mM MgCl2, pH 6.7
|
分辨率 2.80 Å R-free 0.259 |
| 5XKG Crystal structure of T2R-TTL-CH1 complex 提交 2017-05-07 | 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric |
链 A
1–451（451 aa）
链 C
1–451（451 aa）
|
未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3 MG MAGNESIUM ION × 4 CA CALCIUM ION × 2 GOL GLYCEROL × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 1 890 4-[(3-azanyl-4-methoxy-phenyl)-methyl-amino]chromen-2-one × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.7；293 K；6% polyethylene glycol 4000, 8% glycerol, 0.1 M MES, 30 mM CaCl2, 30 mM MgCl2, pH 6.7
|
分辨率 2.20 Å R-free 0.240 |
| 5XKH Crystal structure of T2R-TTL-CF1 complex 提交 2017-05-07 | 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric |
链 A
1–451（451 aa）
链 C
1–451（451 aa）
|
未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3 MG MAGNESIUM ION × 4 CA CALCIUM ION × 2 GOL GLYCEROL × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 1 89C 4-[(4-methoxy-3-oxidanyl-phenyl)-methyl-amino]chromen-2-one × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.7；293 K；6% polyethylene glycol 4000, 8% glycerol, 0.1 M MES, 30 mM CaCl2, 30 mM MgCl2, pH 6.7
|
分辨率 2.25 Å R-free 0.240 |
| 5XP3 Crystal structure of apo T2R-TTL 提交 2017-05-31 | 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric |
链 A
1–451（451 aa）
链 C
1–451（451 aa）
|
未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3 MG MAGNESIUM ION × 4 CA CALCIUM ION × 2 GOL GLYCEROL × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 1 ACP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID ADENYLATE ESTER × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.7；293 K；6% polyethylene glycol 4000, 8% glycerol, 0.1 M MES, 30 mM CaCl2, 30 mM MgCl2, pH 6.7
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.240 |
| 5YL2 Crystal structure of T2R-TTL-Y28 complex 提交 2017-10-16 | 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric |
链 A
1–451（451 aa）
链 C
1–451（451 aa）
|
未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3 MG MAGNESIUM ION × 4 CA CALCIUM ION × 2 GOL GLYCEROL × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 1 8WU (E)-1-(5-methoxy-2,2-dimethyl-chromen-8-yl)-3-(4-methoxy-3-oxidanyl-phenyl)prop-2-en-1-one × 2 ACP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID ADENYLATE ESTER × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.7；293 K；6% polyethylene glycol 4000, 8% glycerol, 0.1 M MES, 30 mM CaCl2, 30 mM MgCl2, pH 6.7
|
分辨率 2.09 Å R-free 0.254 |
| 5YLJ Crystal structure of T2R-TTL-Millepachine complex 提交 2017-10-17 | 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric |
链 A
1–451（451 aa）
链 C
1–451（451 aa）
|
未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3 MG MAGNESIUM ION × 4 CA CALCIUM ION × 2 GOL GLYCEROL × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 1 8X0 (E)-1-(5-methoxy-2,2-dimethyl-chromen-8-yl)-3-(4-methoxyphenyl)prop-2-en-1-one × 2 ACP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID ADENYLATE ESTER × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.7；293 K；6% polyethylene glycol 4000, 8% glycerol, 0.1 M MES, 30 mM CaCl2, 30 mM MgCl2, pH 6.7
|
分辨率 2.70 Å R-free 0.255 |
| 5YLS Crystal structure of T2R-TTL-Y50 complex 提交 2017-10-18 | 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric |
链 A
1–451（451 aa）
链 C
1–451（451 aa）
|
未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3 MG MAGNESIUM ION × 4 CA CALCIUM ION × 2 GOL GLYCEROL × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 1 Y50 E-3-(3-azanyl-4-methoxy-phenyl)-1-(5-methoxy-2,2-dimethyl-chromen-8-yl)prop-2-en-1-one × 2 ACP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID ADENYLATE ESTER × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；6% polyethylene glycol 4000, 8% glycerol, 0.1M MES, 30mM CaCl2, 30mM MgCl2, pH 6.7
|
分辨率 3.00 Å R-free 0.253 |
| 5Z4U Crystal Structure of T2R-TTL complex with 7a3 提交 2018-01-14 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric |
链 A
1–450（450 aa）
链 C
1–450（450 aa）
|
未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3 MG MAGNESIUM ION × 4 CA CALCIUM ION × 3 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 2 96C 4-(4-ethoxyphenyl)-1-methyl-3-(3,4,5-trimethoxyphenyl)-1H-pyrazole × 2 ACP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID ADENYLATE ESTER × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.7；293 K；6% poly(ethylene glycol) 4000, 8% glycerol, 0.1 M Mes, 30 mM CaCl2, 30 mM MgCl2 (pH 6.7)
|
分辨率 3.18 Å R-free 0.235 |
| 5ZXH The structure of MT189-tubulin complex 提交 2018-05-21 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric |
链 A
1–450（450 aa）
链 C
1–450（450 aa）
|
未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3 MG MAGNESIUM ION × 4 CA CALCIUM ION × 3 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 2 9LX 2-(6-fluoro-3-{[(4-methoxyphenyl)methyl]amino}imidazo[1,2-a]pyridin-2-yl)phenol × 2 ACP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID ADENYLATE ESTER × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.7；293 K；6% POLY(ETHYLENE GLYCOL) 4000, 8% GLYCEROL, 0.1 M MES, 30 MM CACL2, 30 MM MGCL2 (pH 6.7)
|
分辨率 2.80 Å R-free 0.259 |
| 6AGK The structure of CH-II-77-tubulin complex 提交 2018-08-13 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric |
链 A
1–450（450 aa）
链 C
1–450（450 aa）
|
未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3 MG MAGNESIUM ION × 3 CA CALCIUM ION × 3 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 2 9WR [6-(3-hydroxy-4-methylphenyl)pyridin-2-yl](3,4,5-trimethoxyphenyl)methanone × 2 ACP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID ADENYLATE ESTER × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；6% POLYETHYLENE GLYCOL 4000, 8% GLYCEROL, 0.1M MES, 30MM CACL2, 30MM MGCL2, PH 6.7,
|
分辨率 2.80 Å R-free 0.264 |
| 6B0C KLP10A-AMPPNP in complex with curved tubulin and a microtubule 提交 2017-09-14 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 175 PDB 声明：175-meric |
链 A
1–451（451 aa）
链 C
1–451（451 aa）
|
未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 70 MG MAGNESIUM ION × 105 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 70 TA1 TAXOL × 35 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 35 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.51 Å |
| 6B0C KLP10A-AMPPNP in complex with curved tubulin and a microtubule 提交 2017-09-14 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric |
链 A
1–451（451 aa）
链 C
1–451（451 aa）
|
未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 3 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 TA1 TAXOL × 1 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.51 Å |
| 6B0C KLP10A-AMPPNP in complex with curved tubulin and a microtubule 提交 2017-09-14 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric |
链 A
1–451（451 aa）
链 C
1–451（451 aa）
|
未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 3 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 TA1 TAXOL × 1 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.51 Å |
| 6B0I Apo KLP10A in complex with a microtubule 提交 2017-09-14 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 105 PDB 声明：105-meric |
链 A
1–451（451 aa）
|
未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 35 MG MAGNESIUM ION × 35 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 35 TA1 TAXOL × 35 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.8；with 20.10^(-3) unit of potato apyrase (Sigma-Aldrich, MO)
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.78 Å |
| 6B0I Apo KLP10A in complex with a microtubule 提交 2017-09-14 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric |
链 A
1–451（451 aa）
|
未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 TA1 TAXOL × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.8；with 20.10^(-3) unit of potato apyrase (Sigma-Aldrich, MO)
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.78 Å |
| 6B0I Apo KLP10A in complex with a microtubule 提交 2017-09-14 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric |
链 A
1–451（451 aa）
|
未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 TA1 TAXOL × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.8；with 20.10^(-3) unit of potato apyrase (Sigma-Aldrich, MO)
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.78 Å |
| 6B0L KLP10A-AMPPNP in complex with a microtubule 提交 2017-09-14 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 105 PDB 声明：105-meric |
链 A
1–451（451 aa）
|
未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 35 MG MAGNESIUM ION × 70 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 35 TA1 TAXOL × 35 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 35 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.98 Å |
| 6B0L KLP10A-AMPPNP in complex with a microtubule 提交 2017-09-14 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric |
链 A
1–451（451 aa）
|
未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 2 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 TA1 TAXOL × 1 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.98 Å |
| 6B0L KLP10A-AMPPNP in complex with a microtubule 提交 2017-09-14 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric |
链 A
1–451（451 aa）
|
未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 2 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 TA1 TAXOL × 1 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.98 Å |
| 6BJC TPX2_mini decorated GMPCPP-microtubule 提交 2017-11-05 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：tetradecameric |
链 A
1–451（451 aa）
链 C
1–451（451 aa）
链 E
1–451（451 aa）
链 J
1–451（451 aa）
链 K
1–451（451 aa）
链 L
1–451（451 aa）
|
未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 6 MG MAGNESIUM ION × 12 G2P PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 6 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.8；BRB80
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；blot for 4 seconds before plunging
|
分辨率 3.30 Å |
| 6BR1 Tubulin-RB3_SLD-TTL in complex with heterocyclic pyrimidine compound 4a 提交 2017-11-29 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric |
链 A
1–450（450 aa）
链 C
1–450（450 aa）
|
未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 CA CALCIUM ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 4 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 2 E3Y 2-chloro-4-(6-methoxy-3,4-dihydroquinolin-1(2H)-yl)pyrido[2,3-d]pyrimidine × 2 ACP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID ADENYLATE ESTER × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.7；293 K；6% PEG 4000, 5% Glycerol, 0.1 M MES, 30 mM CaCl2, 30 mM MgCl2, pH 6.7
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.235 |
| 6BRF Tubulin-RB3_SLD-TTL in complex with heterocyclic pyrimidine compound 4b 提交 2017-11-30 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric |
链 A
1–450（450 aa）
链 C
1–450（450 aa）
|
未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 CA CALCIUM ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 4 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 2 E44 2-chloro-4-(6-methoxy-3,4-dihydroquinolin-1(2H)-yl)pyrido[3,2-d]pyrimidine × 2 ACP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID ADENYLATE ESTER × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.7；293 K；6% PEG 4000, 5% Glycerol, 0.1 M MES, 30 mM CaCl2, 30 mM MgCl2, pH 6.7
|
分辨率 2.50 Å R-free 0.237 |
| 6BRY Tubulin-RB3_SLD-TTL in complex with heterocyclic pyrimidine compound 6a 提交 2017-12-01 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric |
链 A
1–450（450 aa）
链 C
1–450（450 aa）
|
未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 4 CA CALCIUM ION × 2 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 3 GK9 1-(2-chlorofuro[3,2-d]pyrimidin-4-yl)-6-methoxy-1,2,3,4-tetrahydroquinoline × 2 ACP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID ADENYLATE ESTER × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.7；293 K；6% PEG 4000, 5% Glycerol, 0.1 M MES, 30 mM CaCl2, 30 mM MgCl2, pH 6.7
|
分辨率 2.70 Å R-free 0.236 |
| 6BS2 Tubulin-RB3_SLD-TTL in complex with heterocyclic pyrimidine compound 8b 提交 2017-12-01 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric |
链 A
1–450（450 aa）
链 C
1–450（450 aa）
|
未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 CA CALCIUM ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 4 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 3 E9Y 1-(3,6-dimethyl[1,2]oxazolo[5,4-d]pyrimidin-4-yl)-6-methoxy-1,2,3,4-tetrahydroquinoline × 2 ACP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID ADENYLATE ESTER × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.7；293 K；6% PEG 4000, 5% Glycerol, 0.1 M MES, 30 mM CaCl2, 30 mM MgCl2, pH 6.7
|
分辨率 2.65 Å R-free 0.234 |
| 6CVJ Model of synthetic tau (four tandem repeats of first repeat sequence) bound to the microtubule 提交 2018-03-28 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 120 PDB 声明：120-meric |
链 A
1–451（451 aa）
|
未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 30 MG MAGNESIUM ION × 30 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 60 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；blot force 10 pN, 6 second blot time. used C-flat 1.2/1.3 holey grids. First 2 uL of microtubules were adhered to grid for 30 seconds, followed by 2 4 uL washes of tau with 30 second incubation for each wash
|
分辨率 3.20 Å |
| 6CVJ Model of synthetic tau (four tandem repeats of first repeat sequence) bound to the microtubule 提交 2018-03-28 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
1–451（451 aa）
|
未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；blot force 10 pN, 6 second blot time. used C-flat 1.2/1.3 holey grids. First 2 uL of microtubules were adhered to grid for 30 seconds, followed by 2 4 uL washes of tau with 30 second incubation for each wash
|
分辨率 3.20 Å |
| 6CVJ Model of synthetic tau (four tandem repeats of first repeat sequence) bound to the microtubule 提交 2018-03-28 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
1–451（451 aa）
|
未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；blot force 10 pN, 6 second blot time. used C-flat 1.2/1.3 holey grids. First 2 uL of microtubules were adhered to grid for 30 seconds, followed by 2 4 uL washes of tau with 30 second incubation for each wash
|
分辨率 3.20 Å |
| 6CVN Model of synthetic tau (R2x4) bound to the microtubule 提交 2018-03-28 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 120 PDB 声明：120-meric |
链 B
1–451（451 aa）
|
未记录 | GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 60 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 30 MG MAGNESIUM ION × 30 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；blot force 10 pN, 6 second blot time. used C-flat 1.2/1.3 holey grids. First 2 uL of microtubules were adhered to grid for 30 seconds, followed by 2 4 uL washes of tau with 30 second incubation for each wash.
|
分辨率 3.90 Å |
| 6CVN Model of synthetic tau (R2x4) bound to the microtubule 提交 2018-03-28 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 B
1–451（451 aa）
|
未记录 | GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；blot force 10 pN, 6 second blot time. used C-flat 1.2/1.3 holey grids. First 2 uL of microtubules were adhered to grid for 30 seconds, followed by 2 4 uL washes of tau with 30 second incubation for each wash.
|
分辨率 3.90 Å |
| 6CVN Model of synthetic tau (R2x4) bound to the microtubule 提交 2018-03-28 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 B
1–451（451 aa）
|
未记录 | GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；blot force 10 pN, 6 second blot time. used C-flat 1.2/1.3 holey grids. First 2 uL of microtubules were adhered to grid for 30 seconds, followed by 2 4 uL washes of tau with 30 second incubation for each wash.
|
分辨率 3.90 Å |
| 6D88 Tubulin-RB3_SLD-TTL in complex with compound 13f 提交 2018-04-26 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric |
链 A
1–450（450 aa）
链 C
1–450（450 aa）
|
未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 CA CALCIUM ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 3 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 2 G9K [2-(1H-indol-3-yl)-1H-imidazol-4-yl](8-methoxy-1,4-benzodioxin-6-yl)methanone × 2 ACP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID ADENYLATE ESTER × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.7；293 K；6% PEG 4000, 5% Glycerol, 0.1 M MES, 30 mM CaCl2, 30 mM MgCl2
|
分辨率 2.85 Å R-free 0.246 |
| 6DPU Undecorated GMPCPP microtubule 提交 2018-06-09 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric |
链 A
1–451（451 aa）
链 C
1–451（451 aa）
链 E
1–451（451 aa）
链 J
1–451（451 aa）
链 K
1–451（451 aa）
链 L
1–451（451 aa）
|
未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 6 MG MAGNESIUM ION × 12 G2P PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 6 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.8；BRB80 buffer (80 mM PIPES, pH 6.8, 1 mM EGTA, 1 mM MgCl2) supplemented with 1 mM GMPCPP, 1 mM DTT, and 0.05% Nonident P-40
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；Blot for 4 seconds before plunging.
|
分辨率 3.10 Å |
| 6DPV Undecorated GDP microtubule 提交 2018-06-09 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric |
链 A
1–451（451 aa）
链 C
1–451（451 aa）
链 E
1–451（451 aa）
链 J
1–451（451 aa）
链 K
1–451（451 aa）
链 L
1–451（451 aa）
|
未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 6 MG MAGNESIUM ION × 6 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.8；BRB80 buffer (80 mM PIPES pH 6.8, 1 mM EGTA, 1 mM MgCl2) supplemented with 1 mM GTP, 1 mM DTT, and 0.05% Nonident P-40
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；Blot for 4 seconds before plunging.
|
分辨率 3.30 Å |
| 6DPW Undecorated GTPgammaS microtubule 提交 2018-06-09 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric |
链 A
1–451（451 aa）
链 C
1–451（451 aa）
链 E
1–451（451 aa）
链 J
1–451（451 aa）
链 K
1–451（451 aa）
链 L
1–451（451 aa）
|
未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 6 MG MAGNESIUM ION × 6 GSP 5'-GUANOSINE-DIPHOSPHATE-MONOTHIOPHOSPHATE × 6 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.8；Modified BRB80 buffer (80 mM PIPES, pH 6.8, 1 mM EGTA, 0.2 mM MgCl2) supplemented with 1 mM GTPgammaS, 1 mM DTT, and 0.05% Nonident P-40
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；Blot for 4 seconds before plunging.
|
分辨率 3.50 Å |
| 6EG5 The structure of SB-1-202-tubulin complex 提交 2018-08-18 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric |
链 A
1–450（450 aa）
链 C
1–450（450 aa）
|
未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3 MG MAGNESIUM ION × 6 CA CALCIUM ION × 4 CL CHLORIDE ION × 1 GOL GLYCEROL × 2 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 2 J7S 4-(2-chloropyrido[2,3-d]pyrimidin-4-yl)-7-methoxy-3,4-dihydroquinoxalin-2(1H)-one × 2 ACP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID ADENYLATE ESTER × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；6% POLYETHYLENE GLYCOL 4000, 8% GLYCEROL, 0.1 M MES, 30 MM CACL2, 30 MM MGCL2, PH 6.7
|
分辨率 2.45 Å R-free 0.236 |
| 6EVW Cryo-EM structure of GMPCPP-microtubule co-polymerised with doublecortin 提交 2017-11-02 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric |
链 A
1–438（438 aa）
链 C
1–438（438 aa）
链 E
1–438（438 aa）
链 J
1–438（438 aa）
链 K
1–438（438 aa）
链 L
1–438（438 aa）
|
未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 6 MG MAGNESIUM ION × 12 G2P PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 6 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.40 Å |
| 6EVX Cryo-EM structure of GDP.Pi-microtubule rapidly co-polymerised with doublecortin 提交 2017-11-03 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric |
链 A
1–451（451 aa）
链 C
1–451（451 aa）
链 E
1–451（451 aa）
链 J
1–451（451 aa）
链 K
1–451（451 aa）
链 L
1–451（451 aa）
|
未记录 | GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 6 MG MAGNESIUM ION × 6 PO4 PHOSPHATE ION × 6 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.20 Å |
| 6EVY Cryo-EM structure of GTPgammaS-microtubule co-polymerised with doublecortin 提交 2017-11-03 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric |
链 A
1–451（451 aa）
链 C
1–451（451 aa）
链 E
1–451（451 aa）
链 J
1–451（451 aa）
链 K
1–451（451 aa）
链 L
1–451（451 aa）
|
未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 6 MG MAGNESIUM ION × 6 GSP 5'-GUANOSINE-DIPHOSPHATE-MONOTHIOPHOSPHATE × 6 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.40 Å |
| 6EVZ Cryo-EM structure of GDP-microtubule co-polymerised with doublecortin 提交 2017-11-03 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric |
链 A
1–451（451 aa）
链 C
1–451（451 aa）
链 E
1–451（451 aa）
链 J
1–451（451 aa）
链 K
1–451（451 aa）
链 L
1–451（451 aa）
|
未记录 | GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 6 MG MAGNESIUM ION × 6 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.80 Å |
| 6EW0 Cryo-EM structure of GDP-microtubule co-polymerised with doublecortin and supplemented with Taxol 提交 2017-11-03 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric |
链 A
1–451（451 aa）
链 C
1–451（451 aa）
链 E
1–451（451 aa）
链 J
1–451（451 aa）
链 K
1–451（451 aa）
链 L
1–451（451 aa）
|
未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 6 MG MAGNESIUM ION × 6 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6 TA1 TAXOL × 6 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.80 Å |
| 6JCJ Structure of crolibulin in complex with tubulin 提交 2019-01-29 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric |
链 A
1–450（450 aa）
链 C
1–450（450 aa）
|
未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3 MG MAGNESIUM ION × 3 CA CALCIUM ION × 2 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 BG0 (4R)-2,7,8-triamino-4-(3-bromo-4,5-dimethoxyphenyl)-4H-1-benzopyran-3-carbonitrile × 2 ACP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID ADENYLATE ESTER × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；6% POLYETHYLENE GLYCOL 4000, 8% GLYCEROL, 0.1 M MES, 30 MM CACL2, 30 MM MGCL2, PH 6.7
|
分辨率 2.50 Å R-free 0.282 |
| 6KPP BNC105 in complex with tubulin 提交 2019-08-15 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric |
链 A
1–450（450 aa）
链 C
1–450（450 aa）
|
未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 4 CA CALCIUM ION × 2 DO6 (6-methoxy-2-methyl-7-oxidanyl-1-benzofuran-3-yl)-(3,4,5-trimethoxyphenyl)methanone × 2 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 2 GOL GLYCEROL × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.7；277 K；6% PEG, 5% glycerol, 0.1M MES, 30 mM CaCl2, 30 mM MgCl2, pH 6.7
|
分辨率 2.75 Å R-free 0.235 |
| 6LS4 A novel anti-tumor agent S-40 in complex with tubulin 提交 2020-01-17 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric |
链 A
1–451（451 aa）
链 C
1–451（451 aa）
|
未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3 MG MAGNESIUM ION × 6 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 1 GOL GLYCEROL × 1 S40 3-[(4-cyclopropylphenyl)sulfonylamino]-4-methyl-N-(pyridin-3-ylmethyl)benzamide × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；6% PEG 4000, 6% GLYCEROL, 30mM MAGNESIUM CHLORIDE, 30mM CALCIUM CHLORIDE, 3.3% Jeffamin M-600, 100mM MES
|
分辨率 2.40 Å R-free 0.240 |
| 6LSM Tubulin Polymerization Inhibitors 提交 2020-01-17 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric |
链 A
1–450（450 aa）
链 C
1–450（450 aa）
|
未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 6 CA CALCIUM ION × 4 CL CHLORIDE ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 2 ERX 2-(4-methylphenyl)-7-(3,4,5-trimethoxyphenyl)pyrazolo[1,5-a]pyrimidine × 1 ACP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID ADENYLATE ESTER × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.7；277 K；6% PEG, 5% glycerol, 0.1M MES, 30 mM CaCl2, 30 mM MgCl2, pH 6.7
|
分辨率 2.75 Å R-free 0.227 |
| 6LSN Crystal structure of tubulin-inhibitor complex 提交 2020-01-17 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric |
链 A
1–450（450 aa）
链 C
1–450（450 aa）
|
未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 6 CA CALCIUM ION × 4 CL CHLORIDE ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 2 ERR 2-(1-methylindol-5-yl)-7-(3,4,5-trimethoxyphenyl)pyrazolo[1,5-a]pyrimidine × 1 ACP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID ADENYLATE ESTER × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.7；277 K；6% PEG, 5% glycerol, 0.1M MES, 30 mM CaCl2, 30 mM MgCl2, pH 6.7
|
分辨率 2.44 Å R-free 0.220 |
| 6N47 The structure of SB-2-204-tubulin complex 提交 2018-11-17 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric |
链 A
1–450（450 aa）
链 C
1–450（450 aa）
|
未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3 CA CALCIUM ION × 4 CL CHLORIDE ION × 1 MG MAGNESIUM ION × 4 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 2 KB4 4-(2-chloropyrido[3,2-d]pyrimidin-4-yl)-7-methoxy-3,4-dihydroquinoxalin-2(1H)-one × 2 ACP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID ADENYLATE ESTER × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；6% POLYETHYLENE GLYCOL 4000, 8% GLYCEROL, 0.1 M MES, 30 MM CACL2, 30 MM MGCL2, PH 6.7
|
分辨率 2.60 Å R-free 0.246 |
| 6NNG Tubulin-RB3_SLD-TTL in complex with compound DJ95 提交 2019-01-15 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric |
链 A
1–450（450 aa）
链 C
1–450（450 aa）
|
未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3 MG MAGNESIUM ION × 4 CA CALCIUM ION × 2 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 2 DJ9 2-(1H-indol-6-yl)-4-(3,4,5-trimethoxyphenyl)-1H-imidazo[4,5-c]pyridine × 1 ACP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID ADENYLATE ESTER × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.7；293 K；6% PEG 4000, 5% Glycerol, 0.1 M MES, 30 mM CaCl2, 30 mM MgCl2
|
分辨率 2.40 Å R-free 0.227 |
| 6O2Q Acetylated Microtubules 提交 2019-02-24 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric |
链 A
1–451（451 aa）
链 C
1–451（451 aa）
链 E
1–451（451 aa）
链 J
1–451（451 aa）
链 K
1–451（451 aa）
链 L
1–451（451 aa）
|
未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 6 MG MAGNESIUM ION × 6 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.8；Contains 80 mM PIPES, 1 mM MgCl2, 1 mM EGTA, pH 6.8 with KOH (stored at 4 degrees Celsius).
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；Blotted for 4 seconds at blot force 10.
|
分辨率 3.70 Å |
| 6O2R Deacetylated Microtubules 提交 2019-02-24 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric |
链 A
1–451（451 aa）
链 C
1–451（451 aa）
链 E
1–451（451 aa）
链 J
1–451（451 aa）
链 K
1–451（451 aa）
链 L
1–451（451 aa）
|
未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 6 MG MAGNESIUM ION × 6 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.8；Contains 80 mM PIPES, 1 mM MgCl2, 1 mM EGTA, pH 6.8 with KOH (stored at 4 degrees Celsius).
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；Blotted for 4 seconds at blot force 10.
|
分辨率 3.30 Å |
| 6O2S Deacetylated Microtubules 提交 2019-02-24 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 104 PDB 声明：104-meric |
链 1A
1–451（451 aa）
链 1B
1–451（451 aa）
链 1C
1–451（451 aa）
链 1D
1–451（451 aa）
链 1E
1–451（451 aa）
链 1F
1–451（451 aa）
链 1G
1–451（451 aa）
链 1I
1–451（451 aa）
链 1J
1–451（451 aa）
链 1K
1–451（451 aa）
链 1L
1–451（451 aa）
链 1M
1–451（451 aa）
链 1N
1–451（451 aa）
链 2A
1–451（451 aa）
链 2B
1–451（451 aa）
链 2C
1–451（451 aa）
链 2D
1–451（451 aa）
链 2E
1–451（451 aa）
链 2F
1–451（451 aa）
链 2G
1–451（451 aa）
链 2I
1–451（451 aa）
链 2J
1–451（451 aa）
链 2K
1–451（451 aa）
链 2L
1–451（451 aa）
链 2M
1–451（451 aa）
链 2N
1–451（451 aa）
链 3A
1–451（451 aa）
链 3B
1–451（451 aa）
链 3C
1–451（451 aa）
链 3D
1–451（451 aa）
链 3E
1–451（451 aa）
链 3F
1–451（451 aa）
链 3G
1–451（451 aa）
链 3I
1–451（451 aa）
链 3J
1–451（451 aa）
链 3K
1–451（451 aa）
链 3L
1–451（451 aa）
链 3M
1–451（451 aa）
链 3N
1–451（451 aa）
链 4A
1–451（451 aa）
链 4B
1–451（451 aa）
链 4C
1–451（451 aa）
链 4D
1–451（451 aa）
链 4E
1–451（451 aa）
链 4F
1–451（451 aa）
链 4G
1–451（451 aa）
链 4I
1–451（451 aa）
链 4J
1–451（451 aa）
链 4K
1–451（451 aa）
链 4L
1–451（451 aa）
链 4M
1–451（451 aa）
链 4N
1–451（451 aa）
|
未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 52 MG MAGNESIUM ION × 52 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 52 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.8；Contains 80 mM PIPES, 1 mM MgCl2, 1 mM EGTA, pH 6.8 with KOH (stored at 4 degrees Celsius).
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；Blotted for 4 seconds at blot force 10.
|
分辨率 4.00 Å |
| 6O2T Acetylated Microtubules 提交 2019-02-24 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 104 PDB 声明：104-meric |
链 1A
1–451（451 aa）
链 1B
1–451（451 aa）
链 1C
1–451（451 aa）
链 1D
1–451（451 aa）
链 1E
1–451（451 aa）
链 1F
1–451（451 aa）
链 1G
1–451（451 aa）
链 1I
1–451（451 aa）
链 1J
1–451（451 aa）
链 1K
1–451（451 aa）
链 1L
1–451（451 aa）
链 1M
1–451（451 aa）
链 1N
1–451（451 aa）
链 2A
1–451（451 aa）
链 2B
1–451（451 aa）
链 2C
1–451（451 aa）
链 2D
1–451（451 aa）
链 2E
1–451（451 aa）
链 2F
1–451（451 aa）
链 2G
1–451（451 aa）
链 2I
1–451（451 aa）
链 2J
1–451（451 aa）
链 2K
1–451（451 aa）
链 2L
1–451（451 aa）
链 2M
1–451（451 aa）
链 2N
1–451（451 aa）
链 3A
1–451（451 aa）
链 3B
1–451（451 aa）
链 3C
1–451（451 aa）
链 3D
1–451（451 aa）
链 3E
1–451（451 aa）
链 3F
1–451（451 aa）
链 3G
1–451（451 aa）
链 3I
1–451（451 aa）
链 3J
1–451（451 aa）
链 3K
1–451（451 aa）
链 3L
1–451（451 aa）
链 3M
1–451（451 aa）
链 3N
1–451（451 aa）
链 4A
1–451（451 aa）
链 4B
1–451（451 aa）
链 4C
1–451（451 aa）
链 4D
1–451（451 aa）
链 4E
1–451（451 aa）
链 4F
1–451（451 aa）
链 4G
1–451（451 aa）
链 4I
1–451（451 aa）
链 4J
1–451（451 aa）
链 4K
1–451（451 aa）
链 4L
1–451（451 aa）
链 4M
1–451（451 aa）
链 4N
1–451（451 aa）
|
未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 52 MG MAGNESIUM ION × 52 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 52 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.8；Contains 80 mM PIPES, 1 mM MgCl2, 1 mM EGTA, pH 6.8 with KOH (stored at 4 degrees Celsius).
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；Blotted for 4 seconds at blot force 10.
|
分辨率 4.10 Å |
| 6O5M Tubulin-RB3_SLD-TTL in complex with compound 10bb 提交 2019-03-04 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric |
链 A
1–450（450 aa）
链 C
1–450（450 aa）
|
未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3 CA CALCIUM ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 4 GOL GLYCEROL × 2 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 2 G8K [2-(1H-indol-4-yl)-1H-imidazol-4-yl](3,4,5-trimethoxyphenyl)methanone × 2 ACP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID ADENYLATE ESTER × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.7；293 K；6% PEG 4000, 5% Glycerol, 0.1 M MES, 30 mM CaCl2, 30 mM MgCl2
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.223 |
| 6O5N Tubulin-RB3_SLD-TTL in complex with compound 10ab 提交 2019-03-04 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric |
链 A
1–450（450 aa）
链 C
1–450（450 aa）
|
未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 3 CA CALCIUM ION × 2 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 2 QW9 [2-(4-methyl-1H-indol-3-yl)-1H-imidazol-5-yl](3,4,5-trimethoxyphenyl)methanone × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.7；293 K；6% PEG 4000, 5% Glycerol, 0.1 M MES, 30 mM CaCl2, 30 mM MgCl2
|
分辨率 3.00 Å R-free 0.245 |
| 6O61 Tubulin-RB3_SLD-TTL in complex with compound ABI-231 提交 2019-03-05 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric |
链 A
1–450（450 aa）
链 C
1–450（450 aa）
|
未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 3 CA CALCIUM ION × 2 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 2 KUM [2-(1H-indol-3-yl)-1H-imidazol-5-yl](3,4,5-trimethoxyphenyl)methanone × 2 ACP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID ADENYLATE ESTER × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.7；293 K；6% PEG 4000, 5% Glycerol, 0.1 M MES, 30 mM CaCl2, 30 mM MgCl2
|
分辨率 2.60 Å R-free 0.243 |
| 6PC4 Tubulin-RB3_SLD-TTL in complex with compound ABI-274 提交 2019-06-15 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric |
链 A
1–450（450 aa）
链 C
1–450（450 aa）
|
未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 3 CA CALCIUM ION × 2 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 2 O91 [2-(4-methylphenyl)-1H-imidazol-4-yl](3,4,5-trimethoxyphenyl)methanone × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.7；293 K；6% PEG 4000, 5% Glycerol, 0.1 M MES, 30 mM CaCl2, 30 mM MgCl2
|
分辨率 2.60 Å R-free 0.234 |
| 6RZA Cryo-EM structure of the human inner arm dynein DNAH7 microtubule binding domain bound to microtubules 提交 2019-06-13 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric |
链 A
1–437（437 aa）
链 C
1–437（437 aa）
|
未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 TA1 TAXOL × 2 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.50 Å |
| 6RZB Cryo-EM structure of mouse cytoplasmic dynein-1 microtubule binding domain bound to microtubules 提交 2019-06-13 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric |
链 A
1–437（437 aa）
|
未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 TA1 TAXOL × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.10 Å |
| 6TA3 Human kinesin-5 motor domain in the GSK-1 state bound to microtubules (Conformation 1) 提交 2019-10-29 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric |
链 A
1–438（438 aa）
|
未记录 | G2P PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 MZK 6-[4-(trifluoromethyl)phenyl]-3,4-dihydro-1~{H}-quinolin-2-one × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.80 Å |
| 6TA4 Human kinesin-5 motor domain in the AMPPNP state bound to microtubules 提交 2019-10-29 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric |
链 A
1–438（438 aa）
|
未记录 | G2P PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 3 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.2
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 6.10 Å |
| 6TIW Human kinesin-5 motor domain in the GSK state bound to microtubules (Conformation 2) 提交 2019-11-22 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric |
链 A
1–438（438 aa）
|
未记录 | MZK 6-[4-(trifluoromethyl)phenyl]-3,4-dihydro-1~{H}-quinolin-2-one × 1 G2P PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.80 Å |
| 6WWE Apo KIF14[391-772] in complex with a microtubule 提交 2020-05-09 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric |
链 A
1–451（451 aa）
|
未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 TA1 TAXOL × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.90 Å |
| 6WWF KIF14[391-772] - ADP in complex with a microtubule 提交 2020-05-09 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric |
链 A
1–451（451 aa）
|
未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 TA1 TAXOL × 1 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.30 Å |
| 6WWG KIF14[391-772] dimer two-heads-bound state - ADP-AlFx in complex with a microtubule 提交 2020-05-09 | 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric |
链 A
1–451（451 aa）
链 E
1–451（451 aa）
|
未记录 | AF3 ALUMINUM FLUORIDE × 1 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 3 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 TA1 TAXOL × 2 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.90 Å |
| 6WWH KIF14[391-772] dimer two-heads-bound state - AMP-PNP in complex with a microtubule 提交 2020-05-09 | 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric |
链 A
1–451（451 aa）
链 E
1–451（451 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 4 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 2 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 TA1 TAXOL × 2 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.80 Å |
| 6WWI Apo KIF14[391-755] in complex with a microtubule 提交 2020-05-09 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric |
链 A
1–451（451 aa）
|
未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 TA1 TAXOL × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.60 Å |
| 6WWJ KIF14[391-755] - ADP in complex with a microtubule 提交 2020-05-09 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric |
链 A
1–451（451 aa）
|
未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 TA1 TAXOL × 1 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.40 Å |
| 6WWK KIF14[391-755] dimer two-heads-bound state - ADP-AlFx in complex with a microtubule 提交 2020-05-09 | 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric |
链 A
1–451（451 aa）
链 E
1–451（451 aa）
|
未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 TA1 TAXOL × 2 AF3 ALUMINUM FLUORIDE × 1 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.00 Å |
| 6WWL KIF14[391-755] dimer two-heads-bound state - AMP-PNP in complex with a microtubule 提交 2020-05-09 | 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric |
链 A
1–451（451 aa）
链 E
1–451（451 aa）
|
未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 3 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 TA1 TAXOL × 2 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 2 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.10 Å |
| 6WWM KIF14[391-748] - ADP in complex with a microtubule 提交 2020-05-09 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric |
链 A
1–451（451 aa）
|
未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 TA1 TAXOL × 1 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.80 Å |
| 6WWN KIF14[391-748] - ADP-AlFx in complex with a microtubule 提交 2020-05-09 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric |
链 A
1–451（451 aa）
|
未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 2 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 TA1 TAXOL × 1 AF3 ALUMINUM FLUORIDE × 1 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.50 Å |
| 6WWO KIF14[391-748] - AMP-PNP in complex with a microtubule 提交 2020-05-09 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric |
链 A
1–451（451 aa）
|
未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 2 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 TA1 TAXOL × 1 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.80 Å |
| 6WWP Apo KIF14[391-743] in complex with a microtubule 提交 2020-05-09 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric |
链 A
1–451（451 aa）
|
未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 TA1 TAXOL × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.10 Å |
| 6WWQ KIF14[391-743] - ADP in complex with a microtubule 提交 2020-05-09 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric |
链 A
1–451（451 aa）
|
未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 TA1 TAXOL × 1 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.00 Å |
| 6WWR Kif14[391-743] - ADP-AlFx open state class in complex with a microtubule 提交 2020-05-09 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric |
链 A
1–451（451 aa）
|
未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 TA1 TAXOL × 1 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.70 Å |
| 6WWS Kif14[391-743] - AMP-PNP open state class in complex with a microtubule 提交 2020-05-09 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric |
链 A
1–451（451 aa）
|
未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 TA1 TAXOL × 1 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.70 Å |
| 6WWT Apo KIF14[391-735] in complex with a microtubule 提交 2020-05-09 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric |
链 A
1–451（451 aa）
|
未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 TA1 TAXOL × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.20 Å |
| 6WWU KIF14[391-735] - ADP-AlFx in complex with a microtubule 提交 2020-05-09 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric |
链 A
1–451（451 aa）
|
未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 TA1 TAXOL × 1 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.70 Å |
| 6WWV KIF14[391-735] - ANP-PNP in complex with a microtubule 提交 2020-05-09 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric |
链 A
1–451（451 aa）
|
未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 TA1 TAXOL × 1 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.10 Å |
| 6X1C Tubulin-RB3_SLD-TTL in complex with compound 5j 提交 2020-05-18 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric |
链 A
1–450（450 aa）
链 C
1–450（450 aa）
|
未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3 CA CALCIUM ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 5 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 2 Y5J 4-(2-chlorofuro[3,2-d]pyrimidin-4-yl)-7-methoxy-3,4-dihydroquinoxalin-2(1H)-one × 2 ACP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID ADENYLATE ESTER × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.7；293 K；6% PEG 4000, 5% glycerol, 0.1M MES, 30 mM CaCl2, 30 mM MgCl2, pH 6.7
|
分辨率 2.90 Å R-free 0.216 |
| 6X1E Tubulin-RB3_SLD-TTL in complex with compound 5l 提交 2020-05-18 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric |
链 A
1–450（450 aa）
链 C
1–450（450 aa）
|
未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3 CA CALCIUM ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 5 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 2 Y5L 4-(2-chloro-6,7-dihydro-5H-cyclopenta[d]pyrimidin-4-yl)-7-methoxy-3,4-dihydroquinoxalin-2(1H)-one × 2 ACP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID ADENYLATE ESTER × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.7；293 K；6% PEG 4000, 5% glycerol, 0.1M MES, 30 mM CaCl2, 30 mM MgCl2, pH 6.7
|
分辨率 2.90 Å R-free 0.224 |
| 6X1F Tubulin-RB3_SLD-TTL in complex with compound 5m 提交 2020-05-18 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric |
链 A
1–450（450 aa）
链 C
1–450（450 aa）
|
未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3 CA CALCIUM ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 3 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 2 Y5M 7-methoxy-4-(2-methyl-6,7-dihydro-5H-cyclopenta[d]pyrimidin-4-yl)-3,4-dihydroquinoxalin-2(1H)-one × 2 ACP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID ADENYLATE ESTER × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.7；293 K；6% PEG 4000, 5% glycerol, 0.1M MES, 30 mM CaCl2, 30 mM MgCl2, pH 6.7
|
分辨率 2.70 Å R-free 0.241 |
| 6XER Tubulin-RB3_SLD in complex with colchicine 提交 2020-06-13 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric |
链 A
1–438（438 aa）
链 C
1–438（438 aa）
|
未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3 MG MAGNESIUM ION × 2 SO4 SULFATE ION × 3 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 LOC N-[(7S)-1,2,3,10-tetramethoxy-9-oxo-6,7-dihydro-5H-benzo[d]heptalen-7-yl]ethanamide × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 5.6；293 K；PEG 4000, ammonium sulfate, tri-sodium citrate
|
分辨率 2.50 Å R-free 0.223 |
| 6XES Tubulin-RB3_SLD in complex with compound 40a 提交 2020-06-13 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric |
链 A
1–438（438 aa）
链 C
1–438（438 aa）
|
未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3 SO4 SULFATE ION × 3 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 TU3 [6-(3-hydroxy-4-methylphenyl)pyrazin-2-yl](3,4,5-trimethoxyphenyl)methanone × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.6；293 K；PEG 4000, ammonium sulfate, tri-sodium citrate
|
分辨率 2.32 Å R-free 0.226 |
| 6XET Tubulin-RB3_SLD in complex with compound 60c 提交 2020-06-13 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric |
链 A
1–438（438 aa）
链 C
1–438（438 aa）
|
未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3 SO4 SULFATE ION × 3 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 TU2 [3-fluoro-6-(3-hydroxy-4-methylphenyl)pyridin-2-yl](3,4,5-trimethoxyphenyl)methanone × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.6；293 K；PEG 4000, ammonium sulfate, tri-sodium citrate
|
分辨率 2.60 Å R-free 0.231 |
| 6Y4M Structure of Tubulin Tyrosine Ligase in Complex with Tb111 提交 2020-02-21 | 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric |
链 A
1–451（451 aa）
链 C
1–451（451 aa）
|
未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3 MG MAGNESIUM ION × 4 CA CALCIUM ION × 2 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 1 O9B (2~{R})-1-methylpiperidine-2-carboxylic acid × 1 O9H [(1~{R},3~{R})-1-acetyloxy-1-[4-methanoyl-5-(2-phenylmethoxyethyl)-2,3-dihydro-1,3-thiazol-2-yl]-4-methyl-pentan-3-yl]-methyl-azanium × 1 OH5 (2~{S},4~{R})-4-azanyl-2-methyl-5-phenyl-pentanoic acid × 1 PGE TRIETHYLENE GLYCOL × 1 VAL VALINE × 1 ACP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID ADENYLATE ESTER × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293 K；0.03 M calcium chloride, 0.03 M magnesium chloride, 0.10 M MES pH 6.50, 3.20% w/v
PEG 4000, 5.00% w/v glycerol
|
分辨率 3.34 Å R-free 0.234 |
| 6ZPI Microtubule complexed with Kif15 motor domain. Symmetrised asymmetric unit 提交 2020-07-08 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric |
链 A
1–437（437 aa）
|
未记录 | ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 2 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 TA1 TAXOL × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.50 Å |
| 7CBZ Crystal structure of T2R-TTL-A31 complex 提交 2020-06-15 | 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric |
链 A
1–451（451 aa）
链 C
1–451（451 aa）
|
未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 5 CA CALCIUM ION × 6 FUO 2-[5-[4-[2-[4-(2-cyclopropylethanoyl)piperazin-1-yl]ethoxy]phenyl]pyridin-2-yl]-N-(phenylmethyl)ethanamide × 2 MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；6% PEG4000, 8% glycerol, 0.1 M
MES (pH 6.7), 30 mM CaCl2, and 30 mM MgCl2.
|
分辨率 2.61 Å R-free 0.255 |
| 7CDA Crystal structure of T2R-TTL-PAC complex 提交 2020-06-19 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric |
链 A
1–450（450 aa）
链 C
1–450（450 aa）
|
未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3 MG MAGNESIUM ION × 4 CA CALCIUM ION × 2 GOL GLYCEROL × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 1 AEU N-[(3-phenoxyphenyl)methyl]-9H-beta-carbolin-3-amine × 2 ACP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID ADENYLATE ESTER × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；289 K；6% poly(ethylene glycol) 4000, 8% glycerol, 0.1 M MES (pH 6.7), 30 mM CaCl2 and 30 mM MgCl2.
|
分辨率 2.66 Å R-free 0.257 |
| 7CE6 Crystal structure of T2R-TTL-Compound9 complex 提交 2020-06-22 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric |
链 A
1–450（450 aa）
链 C
1–450（450 aa）
|
未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3 MG MAGNESIUM ION × 4 CA CALCIUM ION × 2 GOL GLYCEROL × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 1 AF6 N-benzyl-9H-beta-carbolin-3-amine × 2 ACP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID ADENYLATE ESTER × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；289 K；6% poly(ethylene glycol) 4000, 8% glycerol, 0.1 M MES (pH 6.7), 30 mM CaCl2 and 30 mM MgCl2.
|
分辨率 2.69 Å R-free 0.248 |
| 7CE8 Crystal structure of T2R-TTL-Compound11 complex 提交 2020-06-22 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric |
链 A
1–450（450 aa）
链 C
1–450（450 aa）
|
未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3 MG MAGNESIUM ION × 4 CA CALCIUM ION × 2 GOL GLYCEROL × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 2 AEX N-butyl-9H-beta-carbolin-3-amine × 2 ACP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID ADENYLATE ESTER × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；289 K；6% poly(ethylene glycol) 4000, 8% glycerol, 0.1 M MES (pH 6.7), 30 mM CaCl2 and 30 mM MgCl2
|
分辨率 2.73 Å R-free 0.242 |
| 7CEK Crystal structure of T2R-TTL-BML-284 complex 提交 2020-06-23 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric |
链 A
1–450（450 aa）
链 C
1–450（450 aa）
|
未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3 MG MAGNESIUM ION × 5 CA CALCIUM ION × 6 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 1 FW9 N4-(1,3-benzodioxol-5-ylmethyl)-6-(3-methoxyphenyl)pyrimidine-2,4-diamine × 2 CL CHLORIDE ION × 1 ACP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID ADENYLATE ESTER × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；289 K；6% poly(ethylene glycol) 4000, 8% glycerol, 0.1 M MES (pH 6.7), 30 mM CaCl2 and 30 mM MgCl2.
|
分辨率 2.70 Å R-free 0.271 |
| 7CLD Crystal structure of T2R-TTL-Cevipabulin complex 提交 2020-07-20 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric |
链 A
1–450（450 aa）
链 C
1–450（450 aa）
|
未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3 MG MAGNESIUM ION × 5 CA CALCIUM ION × 7 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 1 G2X 6-[2,6-bis(fluoranyl)-4-[3-(methylamino)propoxy]phenyl]-5-chloranyl-N-[(2S)-1,1,1-tris(fluoranyl)propan-2-yl]-[1,2,4]triazolo[1,5-a]pyrimidin-7-amine × 2 ACP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID ADENYLATE ESTER × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；6% poly(ethylene glycol) 4000, 8% glycerol, 0.1 M MES (pH 6.7), 30 mM CaCl2 and 30 mM MgCl2.
|
分辨率 2.61 Å R-free 0.258 |
| 7CNM YDX in complex with tubulin 提交 2020-08-02 | 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric |
链 A
1–451（451 aa）
链 C
1–451（451 aa）
|
未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 3 CA CALCIUM ION × 2 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 3 G70 (2~{S},4~{S})-4-[[2-[(1~{R},3~{R})-1-acetyloxy-4-methyl-3-[[(2~{S},3~{S})-3-methyl-2-[[(2~{R})-1-methylpiperidin-2-yl]carbonylamino]pentanoyl]amino]pentyl]-1,3-thiazol-4-yl]carbonylamino]-5-cyclohexyl-2-methyl-pentanoic acid × 2 ACP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID ADENYLATE ESTER × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.7；277 K；6% PEG, 5% glycerol, 0.1 M MES, 30 mM CaCl2, 30 mM MgCl2, pH 6.7
|
分辨率 2.44 Å R-free 0.237 |
| 7CNN vinorelbine in complex with tubulin 提交 2020-08-02 | 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric |
链 A
1–451（451 aa）
链 C
1–451（451 aa）
|
未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3 MG MAGNESIUM ION × 5 CA CALCIUM ION × 4 CL CHLORIDE ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 2 GDF Vinorelbine × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.7；277 K；6% PEG, 5% glycerol, 0.1 M MES, 30 mM CaCl2, 30 mM MgCl2, pH 6.7
|
分辨率 2.50 Å R-free 0.229 |
| 7CNO Phomopsin A in complex with tubulin 提交 2020-08-02 | 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric |
链 A
1–451（451 aa）
链 C
1–451（451 aa）
|
未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 4 CA CALCIUM ION × 4 CL CHLORIDE ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 2 HOS Phomopsin A × 2 ACP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID ADENYLATE ESTER × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.7；277 K；6% PEG, 5% glycerol, 0.1 M MES, 30 mM CaCL2, 30 mM MgCl2, pH 6.7
|
分辨率 2.50 Å R-free 0.239 |
| 7DAD EPD in complex with tubulin 提交 2020-10-16 | 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric |
链 A
1–451（451 aa）
链 C
1–451（451 aa）
|
未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3 MG MAGNESIUM ION × 5 CA CALCIUM ION × 4 CL CHLORIDE ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 2 EPD EPOTHILONE D × 1 ACP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID ADENYLATE ESTER × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.7；277 K；6% PEG, 5% glycerol, 0.1 M MES, 30 mM CaCl2, 30 mM MgCL2, pH 6.7
|
分辨率 2.85 Å R-free 0.226 |
| 7DAE EPB in complex with tubulin 提交 2020-10-16 | 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric |
链 A
1–451（451 aa）
链 C
1–451（451 aa）
|
未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 4 CA CALCIUM ION × 4 CL CHLORIDE ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 2 EPB 7,11-DIHYDROXY-8,8,10,12,16-PENTAMETHYL-3-[1-METHYL-2-(2-METHYL-THIAZOL-4-YL)VINYL]-4,17-DIOXABICYCLO[14.1.0]HEPTADECANE-5,9-DIONE × 1 ACP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID ADENYLATE ESTER × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.7；277 K；6% PEG, 5% glycerol, 0.1 M MES, 30 mM CaCl2, 30 mM MgCL2, pH 6.7
|
分辨率 2.39 Å R-free 0.222 |
| 7DAF IXA in complex with tubulin 提交 2020-10-16 | 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric |
链 A
1–451（451 aa）
链 C
1–451（451 aa）
|
未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 6 CA CALCIUM ION × 4 CL CHLORIDE ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 2 GZX (1~{S},3~{S},7~{S},10~{R},11~{S},12~{S},16~{R})-8,8,10,12,16-pentamethyl-3-[(~{E})-1-(2-methyl-1,3-thiazol-4-yl)prop-1-en-2-yl]-7,11-bis(oxidanyl)-17-oxa-4-azabicyclo[14.1.0]heptadecane-5,9-dione × 1 ACP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID ADENYLATE ESTER × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.7；277 K；6% PEG, 5% glycerol, 0.1 M MES, 30 mM CaCl2, 30 mM MgCL2, pH 6.7
|
分辨率 2.40 Å R-free 0.222 |
| 7DB9 IC1 in complex with tubulin 提交 2020-10-19 | 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric |
链 A
1–451（451 aa）
链 C
1–451（451 aa）
|
未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 5 CA CALCIUM ION × 4 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 2 IC1 3-[(2,4,6-TRIMETHOXY-PHENYL)-METHYLENE]-INDOLIN-2-ONE × 2 ACP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID ADENYLATE ESTER × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.7；277 K；6% PEG, 5% glycerol, 0.1 M MES, 30 mM CaCl2, 30 mM MgCL2, pH 6.7
|
分辨率 2.85 Å R-free 0.233 |
| 7DBA RYX in complex with tubulin 提交 2020-10-19 | 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric |
链 A
1–451（451 aa）
链 C
1–451（451 aa）
|
未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 4 CA CALCIUM ION × 2 CL CHLORIDE ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 2 H1O 2-(1-methylindol-4-yl)-7-(3,4,5-trimethoxyphenyl)-1~{H}-benzimidazole × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.7；277 K；6% PEG, 5% glycerol, 0.1 M MES, 30 mM CaCl2, 30 mM MgCL2, pH 6.7
|
分辨率 2.46 Å R-free 0.228 |
| 7DBB SSE in complex with tubulin 提交 2020-10-19 | 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric |
链 A
1–451（451 aa）
链 C
1–451（451 aa）
|
未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3 MG MAGNESIUM ION × 5 CA CALCIUM ION × 4 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 2 H1F 5-phenyl-3-(3,4,5-trimethoxyphenyl)-3,4-dihydropyrazole-2-carbothioamide × 1 ACP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID ADENYLATE ESTER × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.7；277 K；6% PEG, 5% glycerol, 0.1 M MES, 30 mM CaCl2, 30 mM MgCL2, pH 6.7
|
分辨率 2.81 Å R-free 0.230 |
| 7DBC PRA in complex with tubulin 提交 2020-10-19 | 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric |
链 A
1–451（451 aa）
链 C
1–451（451 aa）
|
未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3 MG MAGNESIUM ION × 5 CA CALCIUM ION × 2 H1C methyl ~{N}-(5-butyl-1~{H}-benzimidazol-2-yl)carbamate × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 1 ACP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID ADENYLATE ESTER × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.7；277 K；6% PEG, 5% glycerol, 0.1 M MES, 30 mM CaCl2, 30 mM MgCL2, pH 6.7
|
分辨率 2.40 Å R-free 0.234 |
| 7DBD 444 in complex with tubulin 提交 2020-10-19 | 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric |
链 A
1–451（451 aa）
链 C
1–451（451 aa）
|
未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 4 CA CALCIUM ION × 2 H0U ~{N}-[5-(5-cyanothiophen-2-yl)-2-methyl-phenyl]-4-methyl-benzenesulfonamide × 2 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 2 ACP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID ADENYLATE ESTER × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.7；277 K；6% PEG, 5% glycerol, 0.1 M MES, 30 mM CaCl2, 30 mM MgCL2, pH 6.7
|
分辨率 3.09 Å R-free 0.244 |
| 7DMZ GMPCPP microtubule complex 提交 2020-12-08 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric |
链 A
1–451（451 aa）
链 B
1–451（451 aa）
链 D
1–451（451 aa）
|
未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3 MG MAGNESIUM ION × 2 TAJ taccalonolide AJ × 3 G2P PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 3 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.30 Å |
| 7DN0 AJ-GMPCPP-MT-non-seam 提交 2020-12-08 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric |
链 A
1–451（451 aa）
链 B
1–451（451 aa）
链 C
1–451（451 aa）
链 D
1–451（451 aa）
|
未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 MG MAGNESIUM ION × 4 G2P PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 2 TAJ taccalonolide AJ × 2 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.50 Å |
| 7DP8 Crystal structure of T2R-TTL-Cevipabulin-eribulin complex 提交 2020-12-18 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric |
链 A
1–450（450 aa）
链 C
1–450（450 aa）
|
未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3 MG MAGNESIUM ION × 5 CA CALCIUM ION × 6 GOL GLYCEROL × 2 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 1 G2X 6-[2,6-bis(fluoranyl)-4-[3-(methylamino)propoxy]phenyl]-5-chloranyl-N-[(2S)-1,1,1-tris(fluoranyl)propan-2-yl]-[1,2,4]triazolo[1,5-a]pyrimidin-7-amine × 2 6K9 (1S,3S,6S,9S,12S,14R,16R,18S,20R,21R,22S,26R,29S,31R,32S,33R,35R,36S)-20-[(2S)-3-amino-2-hydroxypropyl]-21-methoxy-14-methyl-8,15-dimethylidene-2,19,30,34,37,39,40,41-octaoxanonacyclo[24.9.2.1~3,32~.1~3,33~.1~6,9~.1~12,16~.0~18,22~.0~29,36~.0~31,35~]hentetracontan-24-one (non-preferred name) × 1 ACP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID ADENYLATE ESTER × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；6% poly(ethylene glycol) 4000, 8% glycerol, 0.1 M MES (pH 6.7), 30 mM CaCl2 and 30 mM MgCl2
|
分辨率 2.45 Å R-free 0.264 |
| 7EMJ Crystal structure of T2R-TTL-Barbigerone complex 提交 2021-04-14 | 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric |
链 A
1–451（451 aa）
链 C
1–451（451 aa）
|
未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3 MG MAGNESIUM ION × 5 CA CALCIUM ION × 6 MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 1 J6L 8,8-dimethyl-3-(2,4,5-trimethoxyphenyl)pyrano[2,3-f]chromen-4-one × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ACP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID ADENYLATE ESTER × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；6% PEG 4000, 5% glycerol, 0.1 M MES, 30 mM CaCl2 and 30 mM MgCl2, pH 6.7
|
分辨率 2.33 Å R-free 0.241 |
| 7EN3 Crystal structure of tubulin in complex with Tubulysin analogue TGL 提交 2021-04-15 | 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric |
链 A
1–451（451 aa）
链 C
1–451（451 aa）
|
未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 3 CA CALCIUM ION × 2 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 3 J6R (2S,4R)-5-(4-fluorophenyl)-2-methyl-4-[[2-[(1R,3R)-4-methyl-3-[5-methylhexyl-[(2S,3S)-3-methyl-2-[[(2R)-1-methylpiperidin-2-yl]carbonylamino]pentanoyl]amino]-1-oxidanyl-pentyl]-1,3-thiazol-4-yl]carbonylamino]pentanoic acid × 2 ACP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID ADENYLATE ESTER × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.7；293 K；6% PEG, 5% glycerol, 0.1 M MES, 30 mM CaCl2, 30 mM MgCl2
|
分辨率 2.64 Å R-free 0.239 |
| 7EXC Crystal structure of T2R-TTL-1129A2 complex 提交 2021-05-26 | 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric |
链 A
1–451（451 aa）
链 C
1–451（451 aa）
|
未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3 MG MAGNESIUM ION × 4 CA CALCIUM ION × 2 GOL GLYCEROL × 1 MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 1 JEL N-[[3-(1,3-benzodioxol-5-yloxy)phenyl]methyl]-9H-pyrido[3,4-b]indol-3-amine × 2 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ACP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID ADENYLATE ESTER × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；6% poly(ethylene glycol) 4000, 8% glycerol, 0.1 M MES (pH 6.7), 30 mM CaCl2, 30 mM MgCl2
|
分辨率 2.39 Å R-free 0.264 |
| 7L05 Complex of novel maytansinoid M24 bound to T2R-TTL (two tubulin alpha/beta heterodimers, RB3 stathmin-like domain, and tubulin tyrosine ligase) 提交 2020-12-11 | 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric |
链 A
1–451（451 aa）
链 C
1–451（451 aa）
|
未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 5 CA CALCIUM ION × 4 CL CHLORIDE ION × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 3 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 1 XQ4 (1S,2R,3S,5S,6S,16E,18E,20R,21S)-11-chloro-21-hydroxy-12,20-dimethoxy-2,5,9,16-tetramethyl-8,23-dioxo-4,24-dioxa-9,22-diazatetracyclo[19.3.1.1~10,14~.0~3,5~]hexacosa-10(26),11,13,16,18-pentaen-6-yl (2S)-2-{methyl[3-(methylamino)propanoyl]amino}propanoate (non-preferred name) × 1 ACP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID ADENYLATE ESTER × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；298 K；PEG 3350, MES, CaCl2, MgCl2, glycerol
|
分辨率 2.21 Å R-free 0.217 |
| 7LVQ KIF14[391-743] - AMP-PNP closed state class in complex with a microtubule 提交 2021-02-26 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric |
链 A
1–451（451 aa）
|
未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 2 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 TA1 TAXOL × 1 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.90 Å |
| 7LVR KIF14[391-743] - ADP-AlFx closed state class in complex with a microtubule 提交 2021-02-26 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric |
链 A
1–451（451 aa）
|
未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 2 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 TA1 TAXOL × 1 AF3 ALUMINUM FLUORIDE × 1 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.90 Å |
| 7LZ7 Tubulin-RB3_SLD-TTL in complex with compound 5k 提交 2021-03-09 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric |
链 A
1–450（450 aa）
链 C
1–450（450 aa）
|
未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3 CA CALCIUM ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 5 YJ7 4-(3,6-dimethyl[1,2]oxazolo[5,4-d]pyrimidin-4-yl)-7-methoxy-3,4-dihydroquinoxalin-2(1H)-one × 2 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 2 ACP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID ADENYLATE ESTER × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.7；293 K；PEG 4000, glycerol, MES, CaCl2, MgCl2
|
分辨率 2.80 Å R-free 0.211 |
| 7LZ8 Tubulin-RB3_SLD-TTL in complex with compound 5t 提交 2021-03-09 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric |
链 A
1–450（450 aa）
链 C
1–450（450 aa）
|
未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3 CA CALCIUM ION × 4 MG MAGNESIUM ION × 4 CL CHLORIDE ION × 2 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 2 YJ4 4-[2-(ethylamino)pyrido[3,2-d]pyrimidin-4-yl]-7-methoxy-3,4-dihydroquinoxalin-2(1H)-one × 2 ACP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID ADENYLATE ESTER × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.7；293 K；PEG 4000, MES, glycerol, CaCl2, MgCl2, ethyl acetate
|
分辨率 2.92 Å R-free 0.228 |
| 7NB8 Plasmodium falciparum kinesin-5 motor domain without nucleotide, complexed with 14 protofilament microtubule. 提交 2021-01-25 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric |
链 A
1–451（451 aa）
|
未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 2 G2P PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；3.5 uM microtubules were incubated to the grid and incubated for 30 seconds. The grid was blotted, then 40 uM kinesin motor domain added and incubated for 30 seconds. The grid was again blotted and 40 uM kinesin motor domain added for 30 seconds. Then the grid was blotted and plunge frozen.
|
分辨率 4.40 Å |
| 7NBA Plasmodium falciparum kinesin-5 motor domain bound to AMPPNP, complexed with 14 protofilament microtubule. 提交 2021-01-25 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric |
链 A
1–451（451 aa）
|
未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 3 G2P PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；5 uM microtubules were applied to the grid and incubated for 30 seconds. The grid was blotted, then 40 uM kinesin motor domain added, incubated for 30 seconds, then blotted. 40 uM Kinesin motor domain was again added, incubated for 40 seconds, blotted, then plunge frozen.
|
分辨率 4.00 Å |
| 7PQC tau-microtubule structural ensemble based on CryoEM data 提交 2021-09-16 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：pentadecameric |
链 B
1–451（451 aa）
链 D
1–451（451 aa）
链 F
1–451（451 aa）
链 H
1–451（451 aa）
链 J
1–451（451 aa）
链 L
1–451（451 aa）
链 N
1–451（451 aa）
|
未记录 | GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 7 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 7 MG MAGNESIUM ION × 7 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.10 Å |
| 7PQP tau-microtubule structural ensemble based on CryoEM data 提交 2021-09-18 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：pentadecameric |
链 B
1–451（451 aa）
链 D
1–451（451 aa）
链 F
1–451（451 aa）
链 H
1–451（451 aa）
链 J
1–451（451 aa）
链 L
1–451（451 aa）
链 N
1–451（451 aa）
|
未记录 | GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 7 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 7 MG MAGNESIUM ION × 7 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.10 Å |
| 7RS6 Cryo-EM structure of Kip3 (AMPPNP) bound to GMPCPP-Stabilized Microtubules 提交 2021-08-11 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 27 PDB 声明：27-meric |
链 A
1–451（451 aa）
链 C
1–451（451 aa）
链 E
1–451（451 aa）
链 G
1–451（451 aa）
链 I
1–451（451 aa）
链 L
1–451（451 aa）
链 N
1–451（451 aa）
链 P
1–451（451 aa）
链 R
1–451（451 aa）
|
未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 9 MG MAGNESIUM ION × 27 G2P PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 9 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 9 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.8；BRB80 buffer (80 mM PIPES-KOH, pH 6.8; 1 mM MgCl2, 1 mM EGTA, 1 mM DTT)
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.10 Å |
| 7SGS Cryo-EM structure of full-length MAP7 bound to the microtubule 提交 2021-10-07 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 B
1–451（451 aa）
链 D
1–451（451 aa）
|
未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.30 Å |
| 7TQX CaKip3[2-482] - AMP-PNP in complex with a microtubule 提交 2022-01-27 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric |
链 A
1–451（451 aa）
|
未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 2 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 TA1 TAXOL × 1 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.80 Å |
| 7TQY CaKip3[2-482] - ADP-AlFx in complex with a microtubule 提交 2022-01-27 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric |
链 A
1–451（451 aa）
|
未记录 | AF3 ALUMINUM FLUORIDE × 1 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 2 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 TA1 TAXOL × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.60 Å |
| 7TQZ Apo CaKip3[2-482] in complex with a microtubule 提交 2022-01-27 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric |
链 A
1–451（451 aa）
|
未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 TA1 TAXOL × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.70 Å |
| 7TR0 CaKip3[2-436] - AMP-PNP in complex with a microtubule 提交 2022-01-27 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric |
链 A
1–451（451 aa）
|
未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 TA1 TAXOL × 1 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.70 Å |
| 7TR1 CaKip3[2-436]-L2-mutant(HsKHC) - AMP-PNP in complex with a microtubule 提交 2022-01-27 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric |
链 A
1–451（451 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 2 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 TA1 TAXOL × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.10 Å |
| 7TR2 Apo CaKip3[2-436]-L2-mutant(HsKHC) in complex with a microtubule 提交 2022-01-27 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric |
链 A
1–451（451 aa）
|
未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 TA1 TAXOL × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.00 Å |
| 7TR3 CaKip3[2-482] - AMP-PNP in complex with a dolastatin-10-stabilized tubulin ring 提交 2022-01-27 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric |
链 A
1–451（451 aa）
|
未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 SR6 dolastatin-10 × 1 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.90 Å |
| 7TTD Tubulin-RB3_SLD in complex with compound 12e 提交 2022-02-01 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric |
链 A
1–438（438 aa）
链 C
1–438（438 aa）
|
未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3 SO4 SULFATE ION × 4 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 JUL 7-methoxy-4-[2-(morpholin-4-yl)-6,7-dihydro-5H-cyclopenta[d]pyrimidin-4-yl]-3,4-dihydroquinoxalin-2(1H)-one × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 5.6；293 K；0.2M ammonium sulfate, 0.1 M tri-sodium citrate, pH 5.6, 12 ~14 % PEG 4K
|
分辨率 2.27 Å R-free 0.224 |
| 7TTE Tubulin-RB3_SLD in complex with compound 12j 提交 2022-02-01 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric |
链 A
1–438（438 aa）
链 C
1–438（438 aa）
|
未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3 SO4 SULFATE ION × 4 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 JVR 4-[2-(cyclopropylamino)-6,7-dihydro-5H-cyclopenta[d]pyrimidin-4-yl]-7-methoxy-3,4-dihydroquinoxalin-2(1H)-one × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 5.6；293 K；0.2M ammonium sulfate, 0.1 M tri-sodium citrate, pH 5.6, 14 % PEG 4K
|
分辨率 2.70 Å R-free 0.239 |
| 7TTF Tubulin-RB3_SLD in complex with compound 12k 提交 2022-02-01 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric |
链 A
1–438（438 aa）
链 C
1–438（438 aa）
|
未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3 SO4 SULFATE ION × 7 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 JV9 7-methoxy-4-[2-(methylamino)-6,7-dihydro-5H-cyclopenta[d]pyrimidin-4-yl]-3,4-dihydroquinoxalin-2(1H)-one × 2 GOL GLYCEROL × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 5.6；293 K；0.2M ammonium sulfate, 0.1 M tri-sodium citrate, pH 5.6, 14 % PEG 4K
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.238 |
| 7XQX Crystal structure of T2R-TTL-27a complex 提交 2022-05-09 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric |
链 A
1–450（450 aa）
链 C
1–450（450 aa）
|
未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 3 CA CALCIUM ION × 2 CL CHLORIDE ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 2 GXI 2-chloranyl-7-fluoranyl-N-(4-methoxyphenyl)-N-methyl-quinazolin-4-amine × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；6% PEG, 5% glycerol, 0.1 M MES, 30 mM CaCl2, 30 mM MgCl2, pH 6.7
|
分辨率 3.36 Å R-free 0.245 |
| 7XQY Crystal structure of T2R-TTL-15 complex 提交 2022-05-09 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric |
链 A
1–450（450 aa）
链 C
1–450（450 aa）
|
未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 3 CA CALCIUM ION × 2 CL CHLORIDE ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 2 GX5 2-chloranyl-N-(4-methoxyphenyl)-N-methyl-pyrido[3,2-d]pyrimidin-4-amine × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；6% PEG, 5% glycerol, 0.1 M MES, 30 mM CaCl2, 30 mM MgCl2, pH 6.7
|
分辨率 2.35 Å R-free 0.236 |
| 7XR0 Crystal structure of T2R-TTL-27a complex 提交 2022-05-09 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric |
链 A
1–450（450 aa）
链 C
1–450（450 aa）
|
未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 3 CA CALCIUM ION × 2 CL CHLORIDE ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 2 GWC 2-chloranyl-5-fluoranyl-N-(4-methoxyphenyl)-N-methyl-quinazolin-4-amine × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；6% PEG, 5% glycerol, 0.1 M MES, 30 mM CaCl2, 30 mM MgCl2, pH 6.7
|
分辨率 2.70 Å R-free 0.246 |
| 7XR1 Crystal structure of T2R-TTL-3a complex 提交 2022-05-09 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric |
链 A
1–450（450 aa）
链 C
1–450（450 aa）
|
未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 3 CA CALCIUM ION × 2 CL CHLORIDE ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 2 GY2 2-chloranyl-6-fluoranyl-N-(4-methoxyphenyl)-N-methyl-quinazolin-4-amine × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；6% PEG, 5% glycerol, 0.1 M MES, 30 mM CaCl2, 30 mM MgCl2, pH 6.7
|
分辨率 2.81 Å R-free 0.246 |
| 7YHN ANTI-TUMOR AGENT Y48 IN COMPLEX WITH TUBULIN 提交 2022-07-14 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric |
链 A
1–451（451 aa）
链 C
1–451（451 aa）
|
未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3 MG MAGNESIUM ION × 6 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 1 IUK 4-methyl-3-[(4-methylphenyl)sulfonylamino]-~{N}-[(6-methylpyridin-3-yl)methyl]benzamide × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；6% PEG 4000, 8% GLYCEROL, 30MM MAGNESIUM CHLORIDE, 30MM CALCIUM CHLORIDE, 100MM MES
|
分辨率 2.60 Å R-free 0.272 |
| 7YSN Tubulin heterodimer structure of GMPCPP state in solution 提交 2022-08-12 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 A
1–451（451 aa）
|
未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 G2P PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.50 Å |
| 7YSO Tubulin heterodimer structure of GDP-1 state in solution 提交 2022-08-12 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 A
1–451（451 aa）
|
未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.60 Å |
| 7YSP Tubulin heterodimer structure of GDP-2 state in solution 提交 2022-08-12 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 A
1–451（451 aa）
|
未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.90 Å |
| 7Z2A P. berghei kinesin-8B motor domain in no nucleotide state bound to tubulin dimer 提交 2022-02-26 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric |
链 A
1–437（437 aa）
|
未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 2 G2P PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.30 Å |
| 7Z2B P. berghei kinesin-8B motor domain in AMPPNP state bound to tubulin dimer 提交 2022-02-26 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric |
链 A
1–437（437 aa）
|
未记录 | ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 3 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 G2P PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.30 Å |
| 7Z2C P. falciparum kinesin-8B motor domain in no nucleotide bound to tubulin dimer 提交 2022-02-26 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric |
链 A
1–437（437 aa）
|
未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 2 G2P PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.10 Å |
| 8DIQ Tubulin-RB3_SLD-TTL in complex with SB226 提交 2022-06-29 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric |
链 A
1–450（450 aa）
链 C
1–450（450 aa）
|
未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3 CA CALCIUM ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 5 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 2 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 2 JVI 4-[2-(ethylamino)-6,7-dihydro-5H-cyclopenta[d]pyrimidin-4-yl]-7-methoxy-3,4-dihydroquinoxalin-2(1H)-one × 2 GOL GLYCEROL × 1 ACP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID ADENYLATE ESTER × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；PEG4K, MES, Glycerol, CaCl2, MgCl2
|
分辨率 2.40 Å R-free 0.209 |
| 8F18 Apo KIF20A[1-565] class-2 in complex with a microtubule 提交 2022-11-04 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric |
链 A
1–451（451 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 TA1 TAXOL × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.20 Å |
| 8F1A Apo KIF20A[1-565] class-1 in complex with a microtubule 提交 2022-11-04 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric |
链 A
1–451（451 aa）
|
未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 TA1 TAXOL × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.10 Å |
| 8JJB Crystal structure of T2R-TTL-Y61 complex 提交 2023-05-30 | 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric |
链 A
1–451（451 aa）
链 C
1–451（451 aa）
|
未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3 MG MAGNESIUM ION × 5 CA CALCIUM ION × 6 MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 1 USI ~{N}4-(1~{H}-indol-5-ylmethyl)-6-(3-methoxyphenyl)pyrimidine-2,4-diamine × 2 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 CL CHLORIDE ION × 1 ACP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID ADENYLATE ESTER × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；6% poly(ethylene glycol) 4000, 8% glycerol, 0.1 M MES (pH 6.7), 30 mM CaCl2, 30 mM MgCl2
|
分辨率 2.68 Å R-free 0.260 |
| 8JJC Tubulin-Y62 提交 2023-05-30 | 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric |
链 A
1–451（451 aa）
链 C
1–451（451 aa）
|
未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3 MG MAGNESIUM ION × 5 CA CALCIUM ION × 6 MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 1 UPO 4-(6,7-dimethoxy-3,4-dihydro-1~{H}-isoquinolin-2-yl)-6-(3-methoxyphenyl)pyrimidin-2-amine × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 CL CHLORIDE ION × 1 ACP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID ADENYLATE ESTER × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；6% poly(ethylene glycol) 4000, 8% glycerol, 0.1 M MES (pH 6.7), 30 mM CaCl2, 30 mM MgCl2
|
分辨率 2.76 Å R-free 0.264 |
| 8RC1 MAP7 MTBD (microtubule binding domain) decorated microtubule protofilament 提交 2023-12-05 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric |
链 A
1–451（451 aa）
链 C
1–451（451 aa）
|
未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.5；80mM PIPES, 2mM MgCl2, 1mM EGTA
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；Microtubules stabilised by MAP7 MTBD were applied to a glow discharged grid, incubated for 30 seconds at room temperature following which excess sample was wicked off and MAP7 MTBD was immediately added to the grid. After incubation for 60 seconds in a Vitrobot, excess liquid was blotted off and the grid was plunge frozen in liquid ethane.
|
分辨率 3.70 Å |
| 8RHB Microtubule-associated kinesin-1 tail complex bound to AMPPNP, single-headed state 提交 2023-12-15 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric |
链 A
1–451（451 aa）
|
未记录 | GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 TA1 TAXOL × 1 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 2 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.8；BRB80 + 5mM AMPPNP
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.00 Å |
| 8RHH Microtubule-associated kinesin-1 tail complex bound to AMPPNP, two-headed state 提交 2023-12-15 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：pentameric |
链 A
1–451（451 aa）
|
未记录 | GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 TA1 TAXOL × 1 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 2 MG MAGNESIUM ION × 3 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.8；BRB80 + 5mM AMPPNP
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.00 Å |
| 8RIK Microtubule-associated kinesin-1 tail complex bound to ADP, single-headed state 提交 2023-12-18 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：tetrameric |
链 A
1–451（451 aa）
|
未记录 | GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 TA1 TAXOL × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.8；BRB80 + 5 mM ADP
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.60 Å |
| 8RIZ Microtubule-associated kinesin-1 tail complex bound to ADP, two-headed state 提交 2023-12-19 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric |
链 A
1–451（451 aa）
|
未记录 | GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 TA1 TAXOL × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.8；BRB80 + 5mM ADP
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.60 Å |
| 8UTN KIF1A[1-393] AMP-PNP bound two-heads-bound state in complex with a microtubule (class T23L1) 提交 2023-10-31 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric |
链 A
1–451（451 aa）
链 E
1–451（451 aa）
链 S
1–451（451 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 4 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 2 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 TA1 TAXOL × 2 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.10 Å |
| 8UTO KIF1A[1-393] AMP-PNP bound two-heads-bound state in complex with a microtubule - class T2L1 提交 2023-10-31 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric |
链 A
1–451（451 aa）
链 E
1–451（451 aa）
链 S
1–451（451 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 4 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 2 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 TA1 TAXOL × 2 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.20 Å |
| 8UTP KIF1A[1-393] - AMP-PNP two-heads-bound state in complex with a microtubule - class T3L1 提交 2023-10-31 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric |
链 A
1–451（451 aa）
链 E
1–451（451 aa）
链 S
1–451（451 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 4 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 2 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 TA1 TAXOL × 2 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.20 Å |
| 8UTQ KIF1A[1-393] AMP-PNP bound one-head-bound state in complex with a microtubule - class T1L02* 提交 2023-10-31 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric |
链 A
1–451（451 aa）
链 E
1–451（451 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 3 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 TA1 TAXOL × 2 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.10 Å |
| 8UTR KIF1A[1-393] ADP bound in complex with a microtubule 提交 2023-10-31 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric |
链 A
1–451（451 aa）
|
未记录 | ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 TA1 TAXOL × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.30 Å |
| 8UTS KIF1A[1-393] APO in complex with a microtubule 提交 2023-10-31 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric |
链 A
1–451（451 aa）
|
未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 TA1 TAXOL × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.70 Å |
| 8UTT KIF1A[1-393] P305L mutant AMP-PNP bound two-heads-bound state in complex with a microtubule 提交 2023-10-31 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric |
链 A
1–451（451 aa）
链 E
1–451（451 aa）
链 S
1–451（451 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 4 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 2 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 TA1 TAXOL × 2 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.10 Å |
| 8UTU KIF1A[1-393] P305L mutant AMP-PNP bound one and two heads bound states merged, in complex with a microtubule 提交 2023-10-31 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
1–451（451 aa）
链 E
1–451（451 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 3 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 TA1 TAXOL × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.00 Å |
| 8UTV KIF1A[1-393] P305L mutant ADP bound in complex with a microtubule 提交 2023-10-31 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
1–451（451 aa）
链 E
1–451（451 aa）
|
未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 TA1 TAXOL × 1 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.00 Å |
| 8UTW KIF1A[1-393] P305L mutant APO in complex with a microtubule 提交 2023-10-31 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric |
链 A
1–451（451 aa）
|
未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 TA1 TAXOL × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.40 Å |
| 8UTY KIF1A[1-393] P364L mutant AMP-PNP bound two-heads-bound state in complex with a microtubule 提交 2023-10-31 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric |
链 A
1–451（451 aa）
链 E
1–451（451 aa）
链 S
1–451（451 aa）
|
未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3 MG MAGNESIUM ION × 4 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 TA1 TAXOL × 2 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 2 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.30 Å |
| 8V4K CCP5 in complex with microtubules class1 提交 2023-11-29 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric |
链 A
1–451（451 aa）
链 C
1–451（451 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 4 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 G2P PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 2 ZN ZINC ION × 1 GLU GLUTAMIC ACID × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.10 Å |
| 8V4L CCP5 in complex with microtubules class2 提交 2023-11-29 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：hexameric |
链 A
1–451（451 aa）
链 C
1–451（451 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 4 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 G2P PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 2 GLU GLUTAMIC ACID × 1 ZN ZINC ION × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.90 Å |
| 8V4M CCP5 in complex with microtubules class3 提交 2023-11-29 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：hexameric |
链 A
1–451（451 aa）
链 C
1–451（451 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 4 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 G2P PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 2 GLU GLUTAMIC ACID × 1 ZN ZINC ION × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.00 Å |
| 8WMO Crystal structure analysis of tubulin and heterocyclic podophyllotoxins complex for anticancer agents 提交 2023-10-04 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric |
链 A
1–440（440 aa）
链 C
1–440（440 aa）
|
未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3 MG MAGNESIUM ION × 4 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 8 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 1 WIW (5~{S},5~{a}~{R},8~{a}~{R},9~{R})-5-pyrimidin-2-ylsulfanyl-9-(3,4,5-trimethoxyphenyl)-5~{a},6,8~{a},9-tetrahydro-5~{H}-[2]benzofuro[5,6-f][1,3]benzodioxol-8-one × 1 CA CALCIUM ION × 1 ACP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID ADENYLATE ESTER × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；277 K；6% glycerol, 6% PEG4000, 30 mM MgCl2, 30 mM CaCl2, 100 mM MES-Na
|
分辨率 2.89 Å R-free 0.266 |
| 8WMU Structural basis of tubulin and heterocyclic podophyllotoxins complex for anticancer agents with dual-binding sites 提交 2023-10-04 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric |
链 A
1–440（440 aa）
链 C
1–440（440 aa）
|
未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3 MG MAGNESIUM ION × 3 CA CALCIUM ION × 2 GOL GLYCEROL × 1 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 1 A1D55 (5~{S},5~{a}~{S},8~{a}~{R},9~{R})-5-(quinolin-6-ylamino)-9-(3,4,5-trimethoxyphenyl)-5~{a},6,8~{a},9-tetrahydro-5~{H}-[2]benzofuro[6,5-f][1,3]benzodioxol-8-one × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 ACP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID ADENYLATE ESTER × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；277 K；6% PEG4000, 6% glycerol, 30 mM MgCl2, 30 mM CaCl2, 100 mM MES-Na
|
分辨率 2.70 Å R-free 0.245 |
| 8YEM Tubulin-RB3_SLD-TTL in complex with compound 9 提交 2024-02-22 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric |
链 A
1–440（440 aa）
链 C
1–440（440 aa）
|
未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 CA CALCIUM ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 3 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 2 A1D6D 4-(2-chloranyl-6-fluoranyl-quinazolin-4-yl)-7-methoxy-1,3-dihydroquinoxalin-2-one × 2 ACP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID ADENYLATE ESTER × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；6% PEG 4000, 5% Glycerol, 0.1 M MES, 30 mM CaCl2, 30 mM MgCl2
|
分辨率 2.74 Å R-free 0.284 |
| 8YER Tubulin-RB3_SLD-TTL in complex with compound 4 提交 2024-02-23 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric |
链 A
1–440（440 aa）
链 C
1–440（440 aa）
|
未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 CA CALCIUM ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 3 A1D6E 6-fluoranyl-4-(6-methoxy-3,4-dihydro-2~{H}-quinolin-1-yl)-~{N}-methyl-quinazolin-2-amine × 2 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 2 ACP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID ADENYLATE ESTER × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；6% PEG 4000, 5% Glycerol, 0.1 M MES, 30 mM CaCl2, 30 mM MgCl2
|
分辨率 2.71 Å R-free 0.286 |
| 8YEU Tubulin-RB3_SLD-TTL in complex with compound 2NH2 提交 2024-02-23 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric |
链 A
1–440（440 aa）
链 C
1–440（440 aa）
|
未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 CA CALCIUM ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 3 A1D6L 6-fluoranyl-4-(6-methoxy-3,4-dihydro-2~{H}-quinolin-1-yl)quinazolin-2-amine × 2 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 2 ACP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID ADENYLATE ESTER × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；6% PEG 4000, 5% Glycerol, 0.1 M MES, 30 mM CaCl2, 30 mM MgCl2
|
分辨率 3.05 Å R-free 0.268 |
| 8YRK Tubulin-Compound KY216: stathmin-like domain complex 提交 2024-03-21 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric |
链 A
1–450（450 aa）
链 C
1–450（450 aa）
|
未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 4 CA CALCIUM ION × 2 CL CHLORIDE ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 2 GOL GLYCEROL × 1 A1D62 (11R,16S)-11-(3,5-dichloro-4-methoxyphenyl)-4,7-dioxa-12,14-diazatetracyclo[8.7.0.03,8.012,16]heptadeca-1,3(8),9-triene-13,15-dione × 2 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 ACP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID ADENYLATE ESTER × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291.15 K；PEG,magnesium choride,calcium chloride,Ethylene glycol,MES
|
分辨率 2.74 Å R-free 0.226 |
| 8YTX Tubulin-RB3-TTL in complex with compound SI9 提交 2024-03-26 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric |
链 A
1–440（440 aa）
链 C
1–440（440 aa）
|
未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 CA CALCIUM ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 3 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 2 A1D68 2-chloranyl-~{N}-(4-methoxyphenyl)-~{N}-methyl-thieno[2,3-d]pyrimidin-4-amine × 2 ACP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID ADENYLATE ESTER × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；6% PEG 4000, 5% Glycerol, 0.1 M MES, 30 mM CaCl2, 30 mM MgCl2
|
分辨率 2.53 Å R-free 0.266 |
| 8YU9 Tubulin-RB3-TTL in complex with compound SI10 提交 2024-03-27 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric |
链 A
1–440（440 aa）
链 C
1–440（440 aa）
|
未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 CA CALCIUM ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 3 A1D7A 4-(2-chloranylthieno[3,2-d]pyrimidin-4-yl)-7-methoxy-1,3-dihydroquinoxalin-2-one × 2 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 2 ACP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID ADENYLATE ESTER × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；6% PEG 4000, 5% Glycerol, 0.1 M MES, 30 mM CaCl2, 30 mM MgCl2
|
分辨率 3.25 Å R-free 0.286 |
| 8YUA Tubulin-RB3-TTL in complex with compound SI10 提交 2024-03-27 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric |
链 A
1–440（440 aa）
链 C
1–440（440 aa）
|
未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 CA CALCIUM ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 3 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 2 A1D69 2-chloranyl-~{N}-(4-methoxyphenyl)-~{N}-methyl-thieno[3,2-d]pyrimidin-4-amine × 2 ACP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID ADENYLATE ESTER × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；6% PEG 4000, 5% Glycerol, 0.1 M MES, 30 mM CaCl2, 30 mM MgCl2
|
分辨率 2.37 Å R-free 0.254 |
| 8YY2 Kinesin-14 in nucleotide-free state bound to 13 PF Microtubule 提交 2024-04-03 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
1–451（451 aa）
|
未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.8；100 mM PIPES pH 6.8, 1 mM MgCl2, 1 mM EGTA, and 1 mM GTP
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.60 Å |
| 8YY3 Kinesin-14 in nucleotide-free state bound to 14 PF Microtubule 提交 2024-04-03 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
1–451（451 aa）
|
未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.8；100 mM PIPES pH 6.8, 1 mM MgCl2, 1 mM EGTA, and 1 mM GTP
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.24 Å |
| 8YY4 Kinesin-14 with AlF3 bound to 13 PF Microtubule 提交 2024-04-03 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
1–451（451 aa）
|
未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 ALF TETRAFLUOROALUMINATE ION × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.8；100 mM PIPES pH 6.8, 1 mM MgCl2, 1 mM EGTA, 1 mM GTP, 2 mM ADP, 2 mM AlCl3, and 8 mM NaF
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.02 Å |
| 8YY5 Kinesin-14 with AlF3 bound to 14 PF Microtubule 提交 2024-04-03 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
1–451（451 aa）
|
未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 ALF TETRAFLUOROALUMINATE ION × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.8；100 mM PIPES pH 6.8, 1 mM MgCl2, 1 mM EGTA, 1 mM GTP, 2 mM ADP, 2 mM AlCl3, and 8 mM NaF
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.99 Å |
| 8ZB8 Crystal structure of T2R-TTL-DPP21 complex 提交 2024-04-26 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric |
链 A
1–450（450 aa）
链 C
1–450（450 aa）
|
未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 3 CA CALCIUM ION × 2 GOL GLYCEROL × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 1 A1D8I ~{N},2-dimethyl-~{N}-(1-methylindol-5-yl)thieno[3,2-d]pyrimidin-4-amine × 2 ACP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID ADENYLATE ESTER × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；6% polyethylene glycol 4000, 8% glycerol, 0.1 M MES, 30 mM CaCl2, 30 mM MgCl2, pH 6.7
|
分辨率 2.94 Å R-free 0.259 |
| 9DA8 Tau-Microtubule structure in the presence of ATP 提交 2024-08-21 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric |
链 B
1–451（451 aa）
链 L
1–451（451 aa）
|
未记录 | GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 4 TA1 TAXOL × 4 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.9
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.94 Å |
| 9DHZ Cryo-EM structure of HURP bound to a microtubule 提交 2024-09-04 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric |
链 B
1–451（451 aa）
链 L
1–451（451 aa）
|
未记录 | TA1 TAXOL × 2 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.9
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.10 Å |
| 9DI0 Cryo-EM structure of Kif18A bound to a microtubule 提交 2024-09-04 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric |
链 L
1–451（451 aa）
|
未记录 | ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 2 TA1 TAXOL × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.9
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.10 Å |
| 9DUQ HURP(65-174) bound to GMPCPP-stabilized microtubule 提交 2024-10-03 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 27 PDB 声明：27-meric |
链 A
1–439（439 aa）
链 C
1–439（439 aa）
链 E
1–439（439 aa）
链 G
1–439（439 aa）
链 I
1–439（439 aa）
链 K
1–439（439 aa）
链 M
1–439（439 aa）
链 O
1–439（439 aa）
链 Q
1–439（439 aa）
|
未记录 | G2P PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 9 MG MAGNESIUM ION × 18 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 9 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.8；BRB80 (1X): 80 mM PIPES, 1 mM MgCl2, 1 mM EGTA, pH 6.8 with KOH
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.80 Å |
| 9DXC Model of tubulin dimers used for determining the dimer rise in a taxol-stabilized microtubule-HURP complex 提交 2024-10-11 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
1–451（451 aa）
链 C
1–451（451 aa）
|
未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.10 Å |
| 9DXE Model of tubulin dimers used for determining the dimer rise in a taxol-stabilized microtubule 提交 2024-10-11 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
1–451（451 aa）
链 C
1–451（451 aa）
|
未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.30 Å |
| 9GNQ Microtubule-associated Kif5B IAK tail mutant bound to ADP 提交 2024-09-03 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric |
链 A
1–451（451 aa）
|
未记录 | GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 TA1 TAXOL × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.8；BRB80 + 5mM AMPPNP
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.90 Å |
| 9IM5 Tubulin-RB3(MUT)-TTL-Y12 提交 2024-07-02 | 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric |
链 A
1–451（451 aa）
链 C
1–451（451 aa）
|
未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3 MG MAGNESIUM ION × 4 CA CALCIUM ION × 3 CL CHLORIDE ION × 1 MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 2 A1L2T ~{N}4-(1,3-benzodioxol-5-ylmethyl)-6-(1~{H}-indol-4-yl)pyrimidine-2,4-diamine × 2 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ACP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID ADENYLATE ESTER × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；6% PEG 4000, 5% glycerol, 0.1M MES, 30mM CaCl2, 30mM MgCl2, pH 6.7
|
分辨率 2.86 Å R-free 0.246 |
| 9IMO Crystal structure of Tubulin-RB3-TTL-Y12 提交 2024-07-04 | 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric |
链 A
1–451（451 aa）
链 C
1–451（451 aa）
|
未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 5 CA CALCIUM ION × 3 A1L2T ~{N}4-(1,3-benzodioxol-5-ylmethyl)-6-(1~{H}-indol-4-yl)pyrimidine-2,4-diamine × 4 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ACP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID ADENYLATE ESTER × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；6% PEG 4000, 5% glycerol, 0.1M MES, 30mM CaCl2, 30mM MgCl2, pH 6.7
|
分辨率 2.75 Å R-free 0.255 |
| 9IXB Structure of tubulin and nitrogen-containing heterocyclic substituted podophyllotoxin derivatives complex 提交 2024-07-27 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric |
链 A
1–440（440 aa）
链 C
1–440（440 aa）
|
未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 MG MAGNESIUM ION × 3 CA CALCIUM ION × 1 NA SODIUM ION × 1 MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 1 A1ECQ (5~{S},5~{a}~{S},8~{a}~{R},9~{R})-5-(1~{H}-indazol-5-ylamino)-9-(3,4,5-trimethoxyphenyl)-5~{a},6,8~{a},9-tetrahydro-5~{H}-[2]benzofuro[6,5-f][1,3]benzodioxol-8-one × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 IMD IMIDAZOLE × 1 ACP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID ADENYLATE ESTER × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；277 K；6% PEG4000, 6% glycerol, 30 mM MgCl2, 30 mM CaCl2, 100 mM MES-Na
|
分辨率 3.48 Å R-free 0.267 |
| 9K7E Crystal structure of T2R-TTL-taccalonolide Y8 complex 提交 2024-10-23 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric |
链 A
1–440（440 aa）
链 C
1–440（440 aa）
|
未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 CA CALCIUM ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 3 A1EE1 (4~{R})-5-(4-hydroxyphenyl)-3-(4-methylphenyl)-4-phenyl-2,4-dihydropyrrolo[3,4-c]pyrazol-6-one × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 2 ACP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID ADENYLATE ESTER × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；6% PEG, 5% glycerol, 0.1 M MES, 30 mM CaCl2, 30 mM MgCl2, pH 6.7
|
分辨率 2.45 Å R-free 0.267 |
| 9KBL Crystal structure of T2R-TTL-IKP104 提交 2024-10-31 | 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric |
链 A
1–451（451 aa）
链 C
1–451（451 aa）
|
未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3 MG MAGNESIUM ION × 5 CA CALCIUM ION × 7 MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 1 W4Q 1-(2-chloranyl-3,5-dimethoxy-phenyl)-2-(4-fluorophenyl)-3-methyl-6-phenyl-pyridin-4-one × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ACP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID ADENYLATE ESTER × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；6% poly(ethylene glycol) 4000, 8% glycerol, 0.1 M MES (pH 6.7), 30 mM CaCl2 and 30 mM MgCl2.
|
分辨率 3.14 Å R-free 0.238 |
| 9KBN Crystal structure of T2R-TTL-IKP104-Colchicine 提交 2024-10-31 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric |
链 A
1–450（450 aa）
链 C
1–450（450 aa）
|
未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3 MG MAGNESIUM ION × 5 CA CALCIUM ION × 7 MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 1 W4Q 1-(2-chloranyl-3,5-dimethoxy-phenyl)-2-(4-fluorophenyl)-3-methyl-6-phenyl-pyridin-4-one × 1 LOC N-[(7S)-1,2,3,10-tetramethoxy-9-oxo-6,7-dihydro-5H-benzo[d]heptalen-7-yl]ethanamide × 2 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ACP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID ADENYLATE ESTER × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；6% poly(ethylene glycol) 4000, 8% glycerol, 0.1 M MES (pH 6.7), 30 mM CaCl2 and 30 mM MgCl2.
|
分辨率 2.56 Å R-free 0.262 |
| 9KBW CryoEM structure of microtubule bound with GAS2-GAR domain. 提交 2024-10-31 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric |
链 C
1–439（439 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.8；80 mM PIPES, pH 6.8, 2 mM MgCl2, 1 mM EGTA, 1mM DTT
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.20 Å |
| 9L7M Nucleotide-free kinesin-1 motor domain bound to the microtubule 提交 2024-12-26 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric |
链 A
1–451（451 aa）
链 C
1–451（451 aa）
|
未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 MG MAGNESIUM ION × 4 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.48 Å |
| 9LNL Crystal structure of T2R-TTL-YQVB15 complex 提交 2025-01-21 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric |
链 A
1–450（450 aa）
链 C
1–450（450 aa）
|
未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 CA CALCIUM ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 A1EPQ 10',11'-difluoro-12'-methoxyvinblastine × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；6% PEG, 5% glycerol, 0.1 M MES, 30 mM CaCl2, 30 mM MgCl2, pH 6.7
|
分辨率 2.85 Å R-free 0.277 |
| 9LNV Crystal structure of T2R-TTL-YQVB6 Complex 提交 2025-01-22 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric |
链 A
1–450（450 aa）
链 C
1–450（450 aa）
|
未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 CA CALCIUM ION × 2 A1EPR 10'-fluorovinblastine × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；6% PEG, 5% glycerol, 0.1 M MES, 30 mM CaCl2, 30 mM MgCl2, pH 6.7
|
分辨率 2.67 Å R-free 0.288 |
| 9LNW Crystal structure of T2R-TTL-YQVB8 Complex 提交 2025-01-22 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric |
链 A
1–450（450 aa）
链 C
1–450（450 aa）
|
未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 CA CALCIUM ION × 2 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 A1EPS 10'-bromovinblastine × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；6% PEG, 5% glycerol, 0.1 M MES, 30 mM CaCl2, 30 mM MgCl2, pH 6.7
|
分辨率 2.55 Å R-free 0.292 |
| 9LNX Crystal structure of T2R-TTL-YQVB9 Complex 提交 2025-01-22 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric |
链 A
1–450（450 aa）
链 C
1–450（450 aa）
|
未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 CA CALCIUM ION × 2 A1EPT 10'-methoxyvinblastine × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；6% PEG, 5% glycerol, 0.1 M MES, 30 mM CaCl2, 30 mM MgCl2, pH 6.7
|
分辨率 2.59 Å R-free 0.296 |
| 9M1L Cryo-EM structure of the TBC-DE-Arl2-alpha-beta-tubulin complex with GTP 提交 2025-02-26 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric |
链 a
1–451（451 aa）
|
未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3 MG MAGNESIUM ION × 3 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.55 Å |
| 9M1M Cryo-EM structure of the TBC-DEC-Arl2-alpha-beta-tubulin complex with GDP-AlFx 提交 2025-02-26 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric |
链 a
1–451（451 aa）
|
未记录 | GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 AF3 ALUMINUM FLUORIDE × 1 MG MAGNESIUM ION × 3 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.21 Å |
| 9M1N Cryo-EM structure of the TBC-DC-Arl2-alpha-beta-tubulin complex with GDP-AlFx 提交 2025-02-26 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric |
链 a
1–451（451 aa）
|
未记录 | GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 AF3 ALUMINUM FLUORIDE × 1 MG MAGNESIUM ION × 3 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.24 Å |
| 9MLF TUBULIN-RB3_SLD IN COMPLEX WITH COMPOUND QW-4-183-llb 提交 2024-12-19 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric |
链 A
1–438（438 aa）
链 C
1–438（438 aa）
|
未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 A1BMG [(4M)-4-(1H-indol-4-yl)-1H-imidazol-2-yl](3,4,5-trimethoxyphenyl)methanone × 2 SO4 SULFATE ION × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.6；293.15 K；0.1 M trisodium citrate, pH 5.6, 0.2 M ammonium sulfate, 12.2% PEG 4000
|
分辨率 2.40 Å R-free 0.233 |
| 9N9E Cryo-EM structure of the SAH domain of Caenorhabditis elegans ICP-1 bound to the paclitaxel-stabilized microtubule 提交 2025-02-10 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
1–451（451 aa）
链 C
1–451（451 aa）
|
未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 3 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 TA1 TAXOL × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.60 Å |
| 9N9F Cryo-EM structure of the SAH domain of human INCENP bound to the paclitaxel-stabilized microtubule 提交 2025-02-10 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
1–451（451 aa）
链 C
1–451（451 aa）
|
未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 3 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 TA1 TAXOL × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.91 Å |
| 9N9G Cryo-EM structure of the human Hec1-Nuf2 dimer bound to the paclitaxel-stabilized microtubule 提交 2025-02-10 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric |
链 A
1–451（451 aa）
链 a
1–451（451 aa）
|
未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 4 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 TA1 TAXOL × 2 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.00 Å |
| 9N9H Cryo-EM structure of the Xenopus laevis mitotic centromere-associated kinesin (MCAK) bound to the paclitaxel-stabilized microtubule 提交 2025-02-10 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric |
链 A
1–451（451 aa）
链 a
1–451（451 aa）
|
未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 4 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 TA1 TAXOL × 2 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.31 Å |
| 9N9I Cryo-EM structure of the Xenopus laevis mitotic centromere-associated kinesin (MCAK) bound to the paclitaxel-stabilized microtubule 提交 2025-02-10 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric |
链 1
1–451（451 aa）
链 4
1–451（451 aa）
链 A
1–451（451 aa）
链 a
1–451（451 aa）
|
未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 MG MAGNESIUM ION × 8 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 4 TA1 TAXOL × 4 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.30 Å |
| 9NNL Bordetella filamentous hemagglutinin (FhaB) C-terminal domain bound to microtubules 提交 2025-03-05 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric |
链 A
1–451（451 aa）
链 E
1–451（451 aa）
|
未记录 | GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 4 TA1 TAXOL × 4 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.42 Å |
| 9O6I TUBULIN-RB3_SLD IN COMPLEX WITH COMPOUND QW-5-70 提交 2025-04-13 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric |
链 A
1–438（438 aa）
链 C
1–438（438 aa）
|
未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 A1B97 [(4M)-4-(1H-indazol-4-yl)-1H-imidazol-2-yl](3,4,5-trimethoxyphenyl)methanone × 2 SO4 SULFATE ION × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.6；293.15 K；0.1 M trisodium citrate, pH 5.6, 0.2 M ammonium sulfate, 12.2% PEG 4000
|
分辨率 2.51 Å R-free 0.244 |
| 9U6A Tubulin-DARPin D1 in complex with a flavone 提交 2025-03-22 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric |
链 A
1–451（451 aa）
|
未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 A1L8X 3-methoxy-2-(4-methoxy-3-oxidanyl-phenyl)-5,7-bis(oxidanyl)chromen-4-one × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；PEG 3000, ammonium sulfate, bis-tris methane
|
分辨率 1.92 Å R-free 0.224 |
| 9U6D Crystal structure of tubulin-RB3-TTL in complex with X8 提交 2025-03-23 | 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric |
链 A
1–451（451 aa）
链 C
1–451（451 aa）
|
未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 5 CA CALCIUM ION × 6 MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 A1L8Z 2-[2-fluoranyl-4-[4-[2-[4-[(1~{R},2~{S})-2-fluoranylcyclopropyl]carbonylpiperazin-1-yl]ethoxy]phenyl]phenyl]-~{N}-(phenylmethyl)ethanamide × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；6% PEG 4000, 5% glycerol, 0.1M MES, 30mM CaCl2, 30mM MgCl2, pH 6.7
|
分辨率 2.54 Å R-free 0.238 |
| 9U9Q Tubulin-RB3-TTL in complex with C38 提交 2025-03-29 | 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric |
链 A
1–451（451 aa）
链 C
1–451（451 aa）
|
未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3 MG MAGNESIUM ION × 5 CA CALCIUM ION × 7 MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 1 A1L80 2-(1-benzofuran-5-yl)-6-[2,6-bis(fluoranyl)-4-[3-(methylamino)propoxy]phenyl]-5-chloranyl-~{N}-[(2~{S})-1,1,1-tris(fluoranyl)propan-2-yl]-[1,2,4]triazolo[1,5-a]pyrimidin-7-amine × 2 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ACP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID ADENYLATE ESTER × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；6% PEG 4000, 5% glycerol, 0.1M MES, 30mM CaCl2, 30mM MgCl2, pH 6.7
|
分辨率 2.93 Å R-free 0.269 |
| 9UMU Giraffe KIF5A motor domain in nucleotide free state bound to microtubule 提交 2025-04-23 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric |
链 A
1–451（451 aa）
|
未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.9
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.40 Å |
| 9YA5 KIF1A R350G bound to microtubules in two-heads-bound state with AMP-PNP 提交 2025-09-15 | 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric |
链 A
1–451（451 aa）
链 E
1–451（451 aa）
|
未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 3 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 TA1 TAXOL × 2 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 2 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.8；BRB80 buffer composed of 80 mM
PIPES, 2 mM MgCl2, 1 mM EGTA, PH 6.8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；4uL of a 6uM MT solution in BRB80 (80mM PIPES, 2mM MgCl2, 1mM EGTA pH 6.8) along with 20uM paclitaxel was added onto a plasma-cleaned grid. The MTs were incubated for 1 minute at room temperature, and then the excess liquid was removed from the grid using Whatman #1 paper. Next, 4uL of a solution containing 20uM KIF1A-R350G in BRB80 supplemented with 20uM paclitaxel and 5mM AMP-PNP was added to the grid. The grid with the MT and kinesin mixture was then mounted into a Vitrobot, incubated for 1 minute at room temperature, and plunge-frozen into liquid nitrogen-cooled ethane.
|
分辨率 2.95 Å |
| 9YA7 KIF1A R350G bound to microtubules in the apo state 提交 2025-09-15 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric |
链 A
1–451（451 aa）
|
未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 TA1 TAXOL × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.8；BRB80 buffer composed of 80 mM
PIPES, 2 mM MgCl2, 1 mM EGTA, PH 6.8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；4uL of a 6uM MT solution in BRB80 (80mM PIPES, 2mM MgCl2, 1mM EGTA pH 6.8) along with 20uM paclitaxel was added onto a plasma-cleaned grid. The MTs were incubated for 1 minute at room temperature, and then the excess liquid was removed from the grid using Whatman #1 paper. Next, 4uL of a solution containing 20uM KIF1A-R350G in BRB80 supplemented with 20uM paclitaxel and 0.005 units per uL apyrase was added to the grid. The grid with the MT and kinesin mixture was then mounted into a Vitrobot, incubated for 1 minute at room temperature, and plunge-frozen into liquid nitrogen-cooled ethane.
|
分辨率 3.29 Å |
| 9YAB KIF1A R350W bound to microtubules in the apo state 提交 2025-09-15 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric |
链 A
1–451（451 aa）
|
未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 TA1 TAXOL × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.8；BRB80 buffer composed of 80 mM
PIPES, 2 mM MgCl2, 1 mM EGTA, PH 6.8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；4uL of a 6uM MT solution in BRB80 (80mM PIPES, 2mM MgCl2, 1mM EGTA pH 6.8) along with 20uM paclitaxel was added onto a plasma-cleaned grid. The MTs were incubated for 1 minute at room temperature, and then the excess liquid was removed from the grid using Whatman #1 paper. Next, 4uL of a solution containing 17.5uM KIF1A-R350W in BRB80 supplemented with 20uM paclitaxel and 0.005 units per uL apyrase was added to the grid. The grid with the MT and kinesin mixture was then mounted into a Vitrobot, incubated for 1 minute at room temperature, and plunge-frozen into liquid nitrogen-cooled ethane.
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分辨率 3.21 Å |
| 9YAI KIF1A R350W bound to microtubules in two-heads-bound state with AMP-PNP 提交 2025-09-16 | 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric |
链 A
1–451（451 aa）
链 E
1–451（451 aa）
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未记录 | MG MAGNESIUM ION × 3 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 2 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 TA1 TAXOL × 2 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.8；BRB80 buffer composed of 80 mM
PIPES, 2 mM MgCl2, 1 mM EGTA, PH 6.8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；4uL of a 6uM MT solution in BRB80 (80mM PIPES, 2mM MgCl2, 1mM EGTA pH 6.8) along with 20uM paclitaxel was added onto a plasma-cleaned grid. The MTs were incubated for 1 minute at room temperature, and then the excess liquid was removed from the grid using Whatman #1 paper. Next, 4uL of a solution containing 17.5uM KIF1A-R350W in BRB80 supplemented with 20uM paclitaxel and 5mM AMP-PNP was added to the grid. The grid with the MT and kinesin mixture was then mounted into a Vitrobot, incubated for 1 minute at room temperature, and plunge-frozen into liquid nitrogen-cooled ethane.
|
分辨率 3.12 Å |
| 9YMG Human KIF18A-DARPin fusion protein bound to AMP-PNP and tubulin 提交 2025-10-09 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric |
链 A
1–451（451 aa）
|
未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 3 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；0.2 M ammonium nitrate, 0.1 M sodium acetate pH 5.6, 20% (w/v) PEG Smear Low (5% PEG 400, 5% PEG 500 MME, 5% PEG 600, 5% PEG 1000), 5% (v/v) ethylene glycol
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分辨率 2.41 Å R-free 0.238 |
| 9YMG Human KIF18A-DARPin fusion protein bound to AMP-PNP and tubulin 提交 2025-10-09 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric |
链 D
1–451（451 aa）
|
未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 3 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；0.2 M ammonium nitrate, 0.1 M sodium acetate pH 5.6, 20% (w/v) PEG Smear Low (5% PEG 400, 5% PEG 500 MME, 5% PEG 600, 5% PEG 1000), 5% (v/v) ethylene glycol
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分辨率 2.41 Å R-free 0.238 |
| 9YXQ Cryo-EM structure of the Xenopus laevis mitotic centromere-associated kinesin (MCAK) bound to the paclitaxel-stabilized microtubule 提交 2025-10-27 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：14-meric |
链 1
1–451（451 aa）
链 3
1–451（451 aa）
链 6
1–451（451 aa）
链 8
1–451（451 aa）
链 A
1–451（451 aa）
链 a
1–451（451 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 11 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 6 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6 TA1 TAXOL × 6 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
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分辨率 3.39 Å |
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| UniProt名称 | TBA1B_PIG |
| Isoform | — |
| PDB实体 | 1 |
| 链与序列区间 | 作者链 A； PDB构建体 1–451； UniProt 1–451 作者链 C； PDB构建体 1–451； UniProt 1–451 |
