SAXSdb — 6y7s

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Type-1 fimbrial protein, A chain

Escherichia coli

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白同源多聚体同源多聚体蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6）与蛋白拷贝数一致	链 A； UniProt 1–182 链 B； UniProt 1–182 链 C； UniProt 1–182 链 D； UniProt 1–182 链 E； UniProt 1–182 链 F； UniProt 1–182	未记录	无其他共同聚合物	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7；in ddH2O. cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE；3 ul sample, 30 s wait time, 0.5 s drain time, 6 s blotting	分辨率 2.85 Å R-free 0.275

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 6Y7S	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
2JTY Self-complemented variant of FimA, the main subunit of type 1 pilus 提交 2007-08-09	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 24–182（159 aa）片段：Fusion protein of Type-1 fimbrial protein and type-1 fimbrial protein 链 A 24–42（19 aa）片段：Fusion protein of Type-1 fimbrial protein and type-1 fimbrial protein	未记录	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 7；298 K；离子强度（mmCIF原始值）18；压力 ambient NMR样品组成 1.7 mM [U-98% 13C; U-98% 15N] FimA, 50 M H2O, 5 M D2O, 95% H2O/5% D2O \| 95% H2O/5% D2O	分辨率未提供
2M5G Solution structure of FimA wt 提交 2013-02-24	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 24–182（159 aa）	未记录	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 7；298 K；离子强度（mmCIF原始值）0.08；压力 ambient NMR样品组成 2 mM [U-99% 13C; U-99% 15N] FimA-1, 90% H2O/10% D2O \| 90% H2O/10% D2O	分辨率未提供
3SQB Structure of the major type 1 pilus subunit FimA bound to the FimC chaperone 提交 2011-07-05	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 37–182（146 aa）片段：UNP residues 37-182	未记录	PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；277 K；0.1 M sodium acetate, 0.2 M magnesium chloride, 13% PEG 4000, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K	分辨率 3.20 Å R-free 0.300
3SQB Structure of the major type 1 pilus subunit FimA bound to the FimC chaperone 提交 2011-07-05	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 D 37–182（146 aa）片段：UNP residues 37-182	未记录	EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 TRS 2-AMINO-2-HYDROXYMETHYL-PROPANE-1,3-DIOL × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；277 K；0.1 M sodium acetate, 0.2 M magnesium chloride, 13% PEG 4000, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K	分辨率 3.20 Å R-free 0.300
3SQB Structure of the major type 1 pilus subunit FimA bound to the FimC chaperone 提交 2011-07-05	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 F 37–182（146 aa）片段：UNP residues 37-182	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；277 K；0.1 M sodium acetate, 0.2 M magnesium chloride, 13% PEG 4000, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K	分辨率 3.20 Å R-free 0.300
3SQB Structure of the major type 1 pilus subunit FimA bound to the FimC chaperone 提交 2011-07-05	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 4 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 H 37–182（146 aa）片段：UNP residues 37-182	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；277 K；0.1 M sodium acetate, 0.2 M magnesium chloride, 13% PEG 4000, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K	分辨率 3.20 Å R-free 0.300
4DWH Structure of the major type 1 pilus subunit FIMA bound to the FIMC (2.5 A resolution) 提交 2012-02-24	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 41–182（142 aa）	未记录	PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 7 PG4 TETRAETHYLENE GLYCOL × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；40% (v/v) PEG 400 0.1 M phosphate/citrate pH 4.2 , VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K	分辨率 2.50 Å R-free 0.294
4DWH Structure of the major type 1 pilus subunit FIMA bound to the FIMC (2.5 A resolution) 提交 2012-02-24	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 D 41–182（142 aa）	未记录	PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 3 PG4 TETRAETHYLENE GLYCOL × 1 PGE TRIETHYLENE GLYCOL × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；40% (v/v) PEG 400 0.1 M phosphate/citrate pH 4.2 , VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K	分辨率 2.50 Å R-free 0.294
5NKT FimA wt from E. coli 提交 2017-04-03	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 24–182（159 aa）	未记录	SO4 SULFATE ION × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 2.6；277 K；0.1 M Sodium Malonate, pH 2.6, 45% ammonium sulphate, 23 mg/ml of protein 1:1 mixture with reservoir	分辨率 1.50 Å R-free 0.188
5OH0 The Cryo-Electron Microscopy Structure of the Type 1 Chaperone-Usher Pilus Rod 提交 2017-07-13	构建体不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 A 24–182（159 aa）链 B 24–182（159 aa）链 C 24–182（159 aa）链 D 24–182（159 aa）链 E 24–182（159 aa）链 F 24–182（159 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.20 Å
6C53 Cryo-EM structure of the Type 1 pilus rod 提交 2018-01-13	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 11 PDB 声明：undecameric	链 A 24–182（159 aa）链 B 24–182（159 aa）链 C 24–182（159 aa）链 D 24–182（159 aa）链 E 24–182（159 aa）链 F 24–182（159 aa）链 G 24–182（159 aa）链 H 24–182（159 aa）链 I 24–182（159 aa）链 J 24–182（159 aa）链 K 24–182（159 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.20 Å
6R74 N-terminally reversed variant of FimA E. coli 提交 2019-03-28	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 42–182（141 aa）	未记录	SO4 SULFATE ION × 5	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 3.1；298 K；45% NH4SO2 and 0.1M Sodium Malonate buffer pH 3.1	分辨率 1.81 Å R-free 0.219
6SWH Crystal structure of the ternary complex between the type 1 pilus proteins FimC, FimI and FimA from E. coli 提交 2019-09-20	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 C 37–182（146 aa）	未记录	PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；293 K；0.8 M sodium formate, 100 mM Tris/acetic acid pH 8.5, 16% PEG 4000 (w/v)	分辨率 2.80 Å R-free 0.207
6SWH Crystal structure of the ternary complex between the type 1 pilus proteins FimC, FimI and FimA from E. coli 提交 2019-09-20	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 F 37–182（146 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；293 K；0.8 M sodium formate, 100 mM Tris/acetic acid pH 8.5, 16% PEG 4000 (w/v)	分辨率 2.80 Å R-free 0.207
8PSV 2.7 A cryo-EM structure of in vitro assembled type 1 pilus rod 提交 2023-07-13	结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 A 1–182（182 aa）链 B 1–182（182 aa）链 C 1–182（182 aa）链 D 1–182（182 aa）链 E 1–182（182 aa）链 F 1–182（182 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7；in ddH2O. cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；3 ul sample, 30 s wait time, 0.5 s drain time, 6 s blotting	分辨率 2.70 Å
8PTU 2.5 A cryo-EM structure of the in vitro FimD-catalyzed assembly of type 1 pilus rod 提交 2023-07-14	结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 A 1–182（182 aa）链 B 1–182（182 aa）链 C 1–182（182 aa）链 D 1–182（182 aa）链 E 1–182（182 aa）链 F 1–182（182 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7；in ddH2O. cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；3 ul sample, 30 s wait time, 0.5 s drain time, 6 s blotting	分辨率 2.52 Å
9FTT Cryo-EM structure of the type 1 pilus rod as part of the FimA-bound usher complex (FimDHGFAnC) 提交 2024-06-25	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric	链 B 24–182（159 aa）链 C 24–182（159 aa）链 D 24–182（159 aa）链 E 24–182（159 aa）链 F 24–182（159 aa）链 G 24–182（159 aa）链 H 24–182（159 aa）链 I 24–182（159 aa）链 J 24–182（159 aa）链 K 24–182（159 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.60 Å
9FW9 Cryo-EM structure of the type 1 pilus assembly platform as part of the FimA-bound chaperone-usher pilus complex (FimDHGFAnC - body 2) 提交 2024-06-28	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 24–182（159 aa）链 B 24–182（159 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.90 Å
9FWB Cryo-EM structure of the type 1 pilus assembly platform as part of the FimA-bound chaperone-usher pilus complex (Local refinement including FimD, FimC, FimAn and FimAn-1) 提交 2024-06-28	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 24–182（159 aa）链 B 24–182（159 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.50 Å
9FWZ Cryo-EM structure of the type 1 pilus assembly platform as part of the FimA-bound chaperone-usher pilus complex (Local refinement including FimD, FimC, FimAn, FimAn-1 and FimAn-2) 提交 2024-07-01	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric	链 A 24–182（159 aa）链 B 24–182（159 aa）链 E 24–182（159 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.60 Å
9FX0 Cryo-EM structure of the type 1 pilus tip-to-rod transition 提交 2024-07-01	构建体不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric	链 A 24–182（159 aa）链 B 24–182（159 aa）链 C 24–182（159 aa）链 D 24–182（159 aa）链 E 24–182（159 aa）链 G 24–182（159 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.10 Å
9FXA Cryo-EM structure of the type 1 pilus rod as part of the FimI-bound usher complex (FimDHGFAnIC - body 1) 提交 2024-07-01	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric	链 B 24–182（159 aa）链 C 24–182（159 aa）链 D 24–182（159 aa）链 E 24–182（159 aa）链 F 24–182（159 aa）链 G 24–182（159 aa）链 H 24–182（159 aa）链 I 24–182（159 aa）链 J 24–182（159 aa）链 K 24–182（159 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 4.00 Å
9FXB Cryo-EM structure of the type 1 pilus assembly platform as part of the FimI-bound chaperone-usher pilus complex (FimDHGFAnIC - body 2) 提交 2024-07-01	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 24–182（159 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 4.30 Å
9VKV Cryo-EM structure of the type I pilus from Escherichia Coli and the surrounding water network 提交 2025-06-24	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 15 PDB 声明：pentadecameric	链 A 24–182（159 aa）链 B 24–182（159 aa）链 C 24–182（159 aa）链 D 24–182（159 aa）链 E 24–182（159 aa）链 F 24–182（159 aa）链 G 24–182（159 aa）链 H 24–182（159 aa）链 I 24–182（159 aa）链 J 24–182（159 aa）链 K 24–182（159 aa）链 L 24–182（159 aa）链 M 24–182（159 aa）链 N 24–182（159 aa）链 O 24–182（159 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 NITROGEN	分辨率 2.09 Å
9X67 Cryo-EM structure of the type I pilus from Escherichia Coli and the surrounding water network 提交 2025-10-15	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 15 PDB 声明：15-meric	链 A 24–182（159 aa）链 B 24–182（159 aa）链 C 24–182（159 aa）链 D 24–182（159 aa）链 E 24–182（159 aa）链 F 24–182（159 aa）链 G 24–182（159 aa）链 H 24–182（159 aa）链 I 24–182（159 aa）链 J 24–182（159 aa）链 K 24–182（159 aa）链 L 24–182（159 aa）链 M 24–182（159 aa）链 N 24–182（159 aa）链 O 24–182（159 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 NITROGEN	分辨率 1.85 Å

共 20 个其他 PDB 条目、25 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	FIMA1_ECOLI
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–182； UniProt 1–182 作者链 B； PDB构建体 1–182； UniProt 1–182 作者链 C； PDB构建体 1–182； UniProt 1–182 作者链 D； PDB构建体 1–182； UniProt 1–182 作者链 E； PDB构建体 1–182； UniProt 1–182 作者链 F； PDB构建体 1–182； UniProt 1–182

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	6y7s
沉积日期 deposition_date	2020-03-02
结构标题 title	2.85 A cryo-EM structure of the in vivo assembled type 1 pilus rod
关键词 keywords	;FimA, pilus, monomer, subunit, pili, main structural subunit, high resolution, STRUCTURAL PROTEIN, cryo-EM, helical processing, RELION, Chaperone-usher pilus ;; STRUCTURAL PROTEIN
实验方法 method	ELECTRON MICROSCOPY

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3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier	30.26 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron	29.00 Å
零角强度 I(0) i0	162840000.00
分子量 molecular_weight	94934.0 kDa
排除体积 excluded_volume	116580 Å³
包络体积 envelope_volume	159460 Å³
水化壳体积 shell_volume	44123 Å³
包络直径 envelope_diameter	93.0 Å
壳层 Rg shell_rg	37.70 Å
包络 Rg envelope_rg	28.30 Å
形状 Rg shape_rg	28.98 Å
总 Rg total_rg	29.90 Å
总原子数 total_atoms	6678
残基数 n_residues	954
球谐函数阶数 n_harmonics	20
q 范围 q_range	— – 0.5000 Å⁻¹
数据点数 n_points	101
壳层类型 shell_type	directional
溶剂电子密度 solvent_density	0.3340 e/Å³
壳层衬度 contrast_shell	0.0300 e/Å³
CRYSOL 版本 crysol_version	4.1.3

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4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax	88.6 Å
Rg (实空间) rg_real	30.01 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error	0.50 Å
I(0) (实空间) i0_real	1.6280e+08
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error	2.4250e+06
Rg (倒空间) rg_reciprocal	30.11 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal	162900000.0000
解质量估计 total_estimate	0.9024
解质量评级 solution_quality	EXCELLENT a EXCELLENT solution
P(r) 峰数 n_peaks	2
主峰位置 r_peak_primary	40.9 Å
偏度 Skewness skewness	-0.010
峰度 Kurtosis kurtosis	-0.566
角度范围 angular_range	— – 0.2600 Å⁻¹
当前正则化参数 α current_alpha	0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha	37950000.0000
实空间数据点数 n_real_points	53
GNOM 版本 gnom_version	4.1.3
质量判据 quality_criteria	AN1: 0.000; Oscil: 0.944; Stabil: 1.000; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.969; Smooth: 0.926

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5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

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6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (1)

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7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 6 domains

SCOP 2.08 (6 domains)

结构域编号 domain_id	d6y7sa_
类 Class class	b — All beta proteins
折叠类型 Fold fold	b.2 — Common fold of diphtheria toxin/transcription factors/cytochrome f
超家族 Superfamily superfamily	b.2.3 — Bacterial adhesins
家族 Family family	b.2.3.0 — automated matches

结构域编号 domain_id	d6y7sb_
类 Class class	b — All beta proteins
折叠类型 Fold fold	b.2 — Common fold of diphtheria toxin/transcription factors/cytochrome f
超家族 Superfamily superfamily	b.2.3 — Bacterial adhesins
家族 Family family	b.2.3.0 — automated matches

结构域编号 domain_id	d6y7sc_
类 Class class	b — All beta proteins
折叠类型 Fold fold	b.2 — Common fold of diphtheria toxin/transcription factors/cytochrome f
超家族 Superfamily superfamily	b.2.3 — Bacterial adhesins
家族 Family family	b.2.3.0 — automated matches

结构域编号 domain_id	d6y7sd_
类 Class class	b — All beta proteins
折叠类型 Fold fold	b.2 — Common fold of diphtheria toxin/transcription factors/cytochrome f
超家族 Superfamily superfamily	b.2.3 — Bacterial adhesins
家族 Family family	b.2.3.0 — automated matches

结构域编号 domain_id	d6y7se_
类 Class class	b — All beta proteins
折叠类型 Fold fold	b.2 — Common fold of diphtheria toxin/transcription factors/cytochrome f
超家族 Superfamily superfamily	b.2.3 — Bacterial adhesins
家族 Family family	b.2.3.0 — automated matches

结构域编号 domain_id	d6y7sf_
类 Class class	b — All beta proteins
折叠类型 Fold fold	b.2 — Common fold of diphtheria toxin/transcription factors/cytochrome f
超家族 Superfamily superfamily	b.2.3 — Bacterial adhesins
家族 Family family	b.2.3.0 — automated matches

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8. 引用文献 (1)

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晶胞边长 a length_a	1.000 Å
晶胞边长 b length_b	1.000 Å
晶胞边长 c length_c	1.000 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	—

空间群 space_group	P 1
空间群编号 int_tables_number	1
晶系 crystal_system	triclinic

分辨率 resolution	2.850 Å
最低分辨率 resolution_low	2.850 Å
R 因子 r_factor	0.2407
R_work r_work	0.2392
R_free r_free	0.2754

分辨率 resolution	2.85 Å
分辨率测定方法 resolution_method	—
颗粒数 num_particles	40805

描述 description	Type-1 fimbrial protein, A chain
分子量 formula_weight	18121.1 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	6

2.85 A cryo-EM structure of the in vivo assembled type 1 pilus rod

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Type-1 fimbrial protein, A chain

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

冷冻电镜 EM 3D

6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (1)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 6 domains

SCOP 2.08 (6 domains)

8. 引用文献 (1)

9. 文件与曲线 (10)

Files (7)

Curves (3)

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A,B,C,D,E,F
原子数 atom_count	6678

来源生物 organism	Escherichia coli
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	562
宿主生物 host_organism	Escherichia coli str. K-12 substr. W3110

fit	/app/data/saxs_computation/y7/6y7s/6y7s.fit
pddf	/app/data/pr_computation/y7/6y7s/6y7s.pr.out
profile	/app/data/saxs_computation/y7/6y7s/6y7s.dat