6ybs

Structure of a human 48S translational initiation complex - head

Method: ELECTRON MICROSCOPY

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit D

物种未注明

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白–RNA	异源复合物	蛋白 17 RNA 1	Receptor of activated protein C kinase 1 × 1 （P63244） 40S ribosomal protein S28 × 1 （P62857） 40S ribosomal protein S17 × 1 （P08708） 40S ribosomal protein S20 × 1 （P60866） Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit G × 1 （O75821） 40S ribosomal protein S10 × 1 （P46783） 40S ribosomal protein S12 × 1 （P25398） 40S ribosomal protein S29 × 1 （P62273） 40S ribosomal protein S15 × 1 （P62841） 40S ribosomal protein S3 × 1 （P23396） 40S ribosomal protein S19 × 1 （P39019） 40S ribosomal protein S25 × 1 （P62851） 40S ribosomal protein S18 × 1 （P62269） 40S ribosomal protein S5 × 1 （P46782） Ubiquitin-40S ribosomal protein S27a × 1 （P62979） 40S ribosomal protein S16 × 1 （P62249） 18S rRNA × 1 MAGNESIUM ION × 29 ZINC ION × 1	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	EIF3D_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 x； PDB构建体 1–548； UniProt 1–548

Receptor of activated protein C kinase 1

物种未注明

UniProt P63244

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白–RNA	异源复合物	蛋白 17 RNA 1	Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit D × 1 （O15371） 40S ribosomal protein S28 × 1 （P62857） 40S ribosomal protein S17 × 1 （P08708） 40S ribosomal protein S20 × 1 （P60866） Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit G × 1 （O75821） 40S ribosomal protein S10 × 1 （P46783） 40S ribosomal protein S12 × 1 （P25398） 40S ribosomal protein S29 × 1 （P62273） 40S ribosomal protein S15 × 1 （P62841） 40S ribosomal protein S3 × 1 （P23396） 40S ribosomal protein S19 × 1 （P39019） 40S ribosomal protein S25 × 1 （P62851） 40S ribosomal protein S18 × 1 （P62269） 40S ribosomal protein S5 × 1 （P46782） Ubiquitin-40S ribosomal protein S27a × 1 （P62979） 40S ribosomal protein S16 × 1 （P62249） 18S rRNA × 1 MAGNESIUM ION × 29 ZINC ION × 1	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	RACK1_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 c； PDB构建体 1–317； UniProt 1–317

40S ribosomal protein S28

物种未注明

UniProt P62857

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白–RNA	异源复合物	蛋白 17 RNA 1	Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit D × 1 （O15371） Receptor of activated protein C kinase 1 × 1 （P63244） 40S ribosomal protein S17 × 1 （P08708） 40S ribosomal protein S20 × 1 （P60866） Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit G × 1 （O75821） 40S ribosomal protein S10 × 1 （P46783） 40S ribosomal protein S12 × 1 （P25398） 40S ribosomal protein S29 × 1 （P62273） 40S ribosomal protein S15 × 1 （P62841） 40S ribosomal protein S3 × 1 （P23396） 40S ribosomal protein S19 × 1 （P39019） 40S ribosomal protein S25 × 1 （P62851） 40S ribosomal protein S18 × 1 （P62269） 40S ribosomal protein S5 × 1 （P46782） Ubiquitin-40S ribosomal protein S27a × 1 （P62979） 40S ribosomal protein S16 × 1 （P62249） 18S rRNA × 1 MAGNESIUM ION × 29 ZINC ION × 1	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	RS28_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	3
链与序列区间	作者链 n； PDB构建体 1–69； UniProt 1–69

40S ribosomal protein S17

物种未注明

UniProt P08708

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白–RNA	异源复合物	蛋白 17 RNA 1	Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit D × 1 （O15371） Receptor of activated protein C kinase 1 × 1 （P63244） 40S ribosomal protein S28 × 1 （P62857） 40S ribosomal protein S20 × 1 （P60866） Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit G × 1 （O75821） 40S ribosomal protein S10 × 1 （P46783） 40S ribosomal protein S12 × 1 （P25398） 40S ribosomal protein S29 × 1 （P62273） 40S ribosomal protein S15 × 1 （P62841） 40S ribosomal protein S3 × 1 （P23396） 40S ribosomal protein S19 × 1 （P39019） 40S ribosomal protein S25 × 1 （P62851） 40S ribosomal protein S18 × 1 （P62269） 40S ribosomal protein S5 × 1 （P46782） Ubiquitin-40S ribosomal protein S27a × 1 （P62979） 40S ribosomal protein S16 × 1 （P62249） 18S rRNA × 1 MAGNESIUM ION × 29 ZINC ION × 1	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	RS17_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	4
链与序列区间	作者链 X； PDB构建体 1–135； UniProt 1–135

40S ribosomal protein S20

物种未注明

UniProt P60866

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白–RNA	异源复合物	蛋白 17 RNA 1	Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit D × 1 （O15371） Receptor of activated protein C kinase 1 × 1 （P63244） 40S ribosomal protein S28 × 1 （P62857） 40S ribosomal protein S17 × 1 （P08708） Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit G × 1 （O75821） 40S ribosomal protein S10 × 1 （P46783） 40S ribosomal protein S12 × 1 （P25398） 40S ribosomal protein S29 × 1 （P62273） 40S ribosomal protein S15 × 1 （P62841） 40S ribosomal protein S3 × 1 （P23396） 40S ribosomal protein S19 × 1 （P39019） 40S ribosomal protein S25 × 1 （P62851） 40S ribosomal protein S18 × 1 （P62269） 40S ribosomal protein S5 × 1 （P46782） Ubiquitin-40S ribosomal protein S27a × 1 （P62979） 40S ribosomal protein S16 × 1 （P62249） 18S rRNA × 1 MAGNESIUM ION × 29 ZINC ION × 1	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	RS20_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	5
链与序列区间	作者链 h； PDB构建体 1–119； UniProt 1–119

Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit G

物种未注明

UniProt O75821

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白–RNA	异源复合物	蛋白 17 RNA 1	Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit D × 1 （O15371） Receptor of activated protein C kinase 1 × 1 （P63244） 40S ribosomal protein S28 × 1 （P62857） 40S ribosomal protein S17 × 1 （P08708） 40S ribosomal protein S20 × 1 （P60866） 40S ribosomal protein S10 × 1 （P46783） 40S ribosomal protein S12 × 1 （P25398） 40S ribosomal protein S29 × 1 （P62273） 40S ribosomal protein S15 × 1 （P62841） 40S ribosomal protein S3 × 1 （P23396） 40S ribosomal protein S19 × 1 （P39019） 40S ribosomal protein S25 × 1 （P62851） 40S ribosomal protein S18 × 1 （P62269） 40S ribosomal protein S5 × 1 （P46782） Ubiquitin-40S ribosomal protein S27a × 1 （P62979） 40S ribosomal protein S16 × 1 （P62249） 18S rRNA × 1 MAGNESIUM ION × 29 ZINC ION × 1	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	EIF3G_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	6
链与序列区间	作者链 o； PDB构建体 1–320； UniProt 1–320

40S ribosomal protein S10

物种未注明

UniProt P46783

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白–RNA	异源复合物	蛋白 17 RNA 1	Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit D × 1 （O15371） Receptor of activated protein C kinase 1 × 1 （P63244） 40S ribosomal protein S28 × 1 （P62857） 40S ribosomal protein S17 × 1 （P08708） 40S ribosomal protein S20 × 1 （P60866） Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit G × 1 （O75821） 40S ribosomal protein S12 × 1 （P25398） 40S ribosomal protein S29 × 1 （P62273） 40S ribosomal protein S15 × 1 （P62841） 40S ribosomal protein S3 × 1 （P23396） 40S ribosomal protein S19 × 1 （P39019） 40S ribosomal protein S25 × 1 （P62851） 40S ribosomal protein S18 × 1 （P62269） 40S ribosomal protein S5 × 1 （P46782） Ubiquitin-40S ribosomal protein S27a × 1 （P62979） 40S ribosomal protein S16 × 1 （P62249） 18S rRNA × 1 MAGNESIUM ION × 29 ZINC ION × 1	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	RS10_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	7
链与序列区间	作者链 a； PDB构建体 1–165； UniProt 1–165

40S ribosomal protein S12

物种未注明

UniProt P25398

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白–RNA	异源复合物	蛋白 17 RNA 1	Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit D × 1 （O15371） Receptor of activated protein C kinase 1 × 1 （P63244） 40S ribosomal protein S28 × 1 （P62857） 40S ribosomal protein S17 × 1 （P08708） 40S ribosomal protein S20 × 1 （P60866） Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit G × 1 （O75821） 40S ribosomal protein S10 × 1 （P46783） 40S ribosomal protein S29 × 1 （P62273） 40S ribosomal protein S15 × 1 （P62841） 40S ribosomal protein S3 × 1 （P23396） 40S ribosomal protein S19 × 1 （P39019） 40S ribosomal protein S25 × 1 （P62851） 40S ribosomal protein S18 × 1 （P62269） 40S ribosomal protein S5 × 1 （P46782） Ubiquitin-40S ribosomal protein S27a × 1 （P62979） 40S ribosomal protein S16 × 1 （P62249） 18S rRNA × 1 MAGNESIUM ION × 29 ZINC ION × 1	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	RS12_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	8
链与序列区间	作者链 m； PDB构建体 1–132； UniProt 1–132

40S ribosomal protein S29

物种未注明

UniProt P62273

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白–RNA	异源复合物	蛋白 17 RNA 1	Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit D × 1 （O15371） Receptor of activated protein C kinase 1 × 1 （P63244） 40S ribosomal protein S28 × 1 （P62857） 40S ribosomal protein S17 × 1 （P08708） 40S ribosomal protein S20 × 1 （P60866） Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit G × 1 （O75821） 40S ribosomal protein S10 × 1 （P46783） 40S ribosomal protein S12 × 1 （P25398） 40S ribosomal protein S15 × 1 （P62841） 40S ribosomal protein S3 × 1 （P23396） 40S ribosomal protein S19 × 1 （P39019） 40S ribosomal protein S25 × 1 （P62851） 40S ribosomal protein S18 × 1 （P62269） 40S ribosomal protein S5 × 1 （P46782） Ubiquitin-40S ribosomal protein S27a × 1 （P62979） 40S ribosomal protein S16 × 1 （P62249） 18S rRNA × 1 MAGNESIUM ION × 29 ZINC ION × 1	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	RS29_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	9
链与序列区间	作者链 i； PDB构建体 1–56； UniProt 1–56

40S ribosomal protein S15

物种未注明

UniProt P62841

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白–RNA	异源复合物	蛋白 17 RNA 1	Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit D × 1 （O15371） Receptor of activated protein C kinase 1 × 1 （P63244） 40S ribosomal protein S28 × 1 （P62857） 40S ribosomal protein S17 × 1 （P08708） 40S ribosomal protein S20 × 1 （P60866） Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit G × 1 （O75821） 40S ribosomal protein S10 × 1 （P46783） 40S ribosomal protein S12 × 1 （P25398） 40S ribosomal protein S29 × 1 （P62273） 40S ribosomal protein S3 × 1 （P23396） 40S ribosomal protein S19 × 1 （P39019） 40S ribosomal protein S25 × 1 （P62851） 40S ribosomal protein S18 × 1 （P62269） 40S ribosomal protein S5 × 1 （P46782） Ubiquitin-40S ribosomal protein S27a × 1 （P62979） 40S ribosomal protein S16 × 1 （P62249） 18S rRNA × 1 MAGNESIUM ION × 29 ZINC ION × 1	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	RS15_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	10
链与序列区间	作者链 b； PDB构建体 1–145； UniProt 1–145

40S ribosomal protein S3

物种未注明

UniProt P23396

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白–RNA	异源复合物	蛋白 17 RNA 1	Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit D × 1 （O15371） Receptor of activated protein C kinase 1 × 1 （P63244） 40S ribosomal protein S28 × 1 （P62857） 40S ribosomal protein S17 × 1 （P08708） 40S ribosomal protein S20 × 1 （P60866） Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit G × 1 （O75821） 40S ribosomal protein S10 × 1 （P46783） 40S ribosomal protein S12 × 1 （P25398） 40S ribosomal protein S29 × 1 （P62273） 40S ribosomal protein S15 × 1 （P62841） 40S ribosomal protein S19 × 1 （P39019） 40S ribosomal protein S25 × 1 （P62851） 40S ribosomal protein S18 × 1 （P62269） 40S ribosomal protein S5 × 1 （P46782） Ubiquitin-40S ribosomal protein S27a × 1 （P62979） 40S ribosomal protein S16 × 1 （P62249） 18S rRNA × 1 MAGNESIUM ION × 29 ZINC ION × 1	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	RS3_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	11
链与序列区间	作者链 Z； PDB构建体 1–243； UniProt 1–243

40S ribosomal protein S19

物种未注明

UniProt P39019

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白–RNA	异源复合物	蛋白 17 RNA 1	Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit D × 1 （O15371） Receptor of activated protein C kinase 1 × 1 （P63244） 40S ribosomal protein S28 × 1 （P62857） 40S ribosomal protein S17 × 1 （P08708） 40S ribosomal protein S20 × 1 （P60866） Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit G × 1 （O75821） 40S ribosomal protein S10 × 1 （P46783） 40S ribosomal protein S12 × 1 （P25398） 40S ribosomal protein S29 × 1 （P62273） 40S ribosomal protein S15 × 1 （P62841） 40S ribosomal protein S3 × 1 （P23396） 40S ribosomal protein S25 × 1 （P62851） 40S ribosomal protein S18 × 1 （P62269） 40S ribosomal protein S5 × 1 （P46782） Ubiquitin-40S ribosomal protein S27a × 1 （P62979） 40S ribosomal protein S16 × 1 （P62249） 18S rRNA × 1 MAGNESIUM ION × 29 ZINC ION × 1	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	RS19_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	12
链与序列区间	作者链 d； PDB构建体 1–145； UniProt 1–145

40S ribosomal protein S25

物种未注明

UniProt P62851

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白–RNA	异源复合物	蛋白 17 RNA 1	Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit D × 1 （O15371） Receptor of activated protein C kinase 1 × 1 （P63244） 40S ribosomal protein S28 × 1 （P62857） 40S ribosomal protein S17 × 1 （P08708） 40S ribosomal protein S20 × 1 （P60866） Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit G × 1 （O75821） 40S ribosomal protein S10 × 1 （P46783） 40S ribosomal protein S12 × 1 （P25398） 40S ribosomal protein S29 × 1 （P62273） 40S ribosomal protein S15 × 1 （P62841） 40S ribosomal protein S3 × 1 （P23396） 40S ribosomal protein S19 × 1 （P39019） 40S ribosomal protein S18 × 1 （P62269） 40S ribosomal protein S5 × 1 （P46782） Ubiquitin-40S ribosomal protein S27a × 1 （P62979） 40S ribosomal protein S16 × 1 （P62249） 18S rRNA × 1 MAGNESIUM ION × 29 ZINC ION × 1	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	RS25_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	13
链与序列区间	作者链 e； PDB构建体 1–125； UniProt 1–125

40S ribosomal protein S18

物种未注明

UniProt P62269

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白–RNA	异源复合物	蛋白 17 RNA 1	Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit D × 1 （O15371） Receptor of activated protein C kinase 1 × 1 （P63244） 40S ribosomal protein S28 × 1 （P62857） 40S ribosomal protein S17 × 1 （P08708） 40S ribosomal protein S20 × 1 （P60866） Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit G × 1 （O75821） 40S ribosomal protein S10 × 1 （P46783） 40S ribosomal protein S12 × 1 （P25398） 40S ribosomal protein S29 × 1 （P62273） 40S ribosomal protein S15 × 1 （P62841） 40S ribosomal protein S3 × 1 （P23396） 40S ribosomal protein S19 × 1 （P39019） 40S ribosomal protein S25 × 1 （P62851） 40S ribosomal protein S5 × 1 （P46782） Ubiquitin-40S ribosomal protein S27a × 1 （P62979） 40S ribosomal protein S16 × 1 （P62249） 18S rRNA × 1 MAGNESIUM ION × 29 ZINC ION × 1	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	RS18_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	14
链与序列区间	作者链 f； PDB构建体 1–152； UniProt 1–152

40S ribosomal protein S5

物种未注明

UniProt P46782

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白–RNA	异源复合物	蛋白 17 RNA 1	Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit D × 1 （O15371） Receptor of activated protein C kinase 1 × 1 （P63244） 40S ribosomal protein S28 × 1 （P62857） 40S ribosomal protein S17 × 1 （P08708） 40S ribosomal protein S20 × 1 （P60866） Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit G × 1 （O75821） 40S ribosomal protein S10 × 1 （P46783） 40S ribosomal protein S12 × 1 （P25398） 40S ribosomal protein S29 × 1 （P62273） 40S ribosomal protein S15 × 1 （P62841） 40S ribosomal protein S3 × 1 （P23396） 40S ribosomal protein S19 × 1 （P39019） 40S ribosomal protein S25 × 1 （P62851） 40S ribosomal protein S18 × 1 （P62269） Ubiquitin-40S ribosomal protein S27a × 1 （P62979） 40S ribosomal protein S16 × 1 （P62249） 18S rRNA × 1 MAGNESIUM ION × 29 ZINC ION × 1	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	RS5_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	15
链与序列区间	作者链 V； PDB构建体 1–204； UniProt 1–204

Ubiquitin-40S ribosomal protein S27a

物种未注明

UniProt P62979

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白–RNA	异源复合物	蛋白 17 RNA 1	Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit D × 1 （O15371） Receptor of activated protein C kinase 1 × 1 （P63244） 40S ribosomal protein S28 × 1 （P62857） 40S ribosomal protein S17 × 1 （P08708） 40S ribosomal protein S20 × 1 （P60866） Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit G × 1 （O75821） 40S ribosomal protein S10 × 1 （P46783） 40S ribosomal protein S12 × 1 （P25398） 40S ribosomal protein S29 × 1 （P62273） 40S ribosomal protein S15 × 1 （P62841） 40S ribosomal protein S3 × 1 （P23396） 40S ribosomal protein S19 × 1 （P39019） 40S ribosomal protein S25 × 1 （P62851） 40S ribosomal protein S18 × 1 （P62269） 40S ribosomal protein S5 × 1 （P46782） 40S ribosomal protein S16 × 1 （P62249） 18S rRNA × 1 MAGNESIUM ION × 29 ZINC ION × 1	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	RS27A_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	16
链与序列区间	作者链 k； PDB构建体 1–156； UniProt 1–156

40S ribosomal protein S16

物种未注明

UniProt P62249

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白–RNA	异源复合物	蛋白 17 RNA 1	Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit D × 1 （O15371） Receptor of activated protein C kinase 1 × 1 （P63244） 40S ribosomal protein S28 × 1 （P62857） 40S ribosomal protein S17 × 1 （P08708） 40S ribosomal protein S20 × 1 （P60866） Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit G × 1 （O75821） 40S ribosomal protein S10 × 1 （P46783） 40S ribosomal protein S12 × 1 （P25398） 40S ribosomal protein S29 × 1 （P62273） 40S ribosomal protein S15 × 1 （P62841） 40S ribosomal protein S3 × 1 （P23396） 40S ribosomal protein S19 × 1 （P39019） 40S ribosomal protein S25 × 1 （P62851） 40S ribosomal protein S18 × 1 （P62269） 40S ribosomal protein S5 × 1 （P46782） Ubiquitin-40S ribosomal protein S27a × 1 （P62979） 18S rRNA × 1 MAGNESIUM ION × 29 ZINC ION × 1	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	RS16_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	17
链与序列区间	作者链 Y； PDB构建体 1–146； UniProt 1–146

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	6ybs
沉积日期 deposition_date	2020-03-17
结构标题 title	Structure of a human 48S translational initiation complex - head
关键词 keywords	ribosome, translation, initiation complex; TRANSLATION
实验方法 method	ELECTRON MICROSCOPY

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

6ybs__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

6ybs__assembly_1__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

6ybs__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	48.13 Å
Rg（电子密度）	49.70 Å
总 Rg	49.57 Å
原子数	28732
残基数	2827
排除体积	472540 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`6ybs__assembly_1__model_1`	octadecameric （18）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (20)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit D
分子量 formula_weight	64060.8 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	x
原子数 atom_count	28732

MAKFMTPVIQDNPSGWGPCAVPEQFRDMPYQPFSKGDRLGKVADWTGATYQDKRYTNKYSSQFGGGSQYAYFHEEDESSFQLVDTARTQKTAYQRNRMRFAQRNLRRDKDRRNMLQFNLQILPKSAKQKERERIRLQKKFQKQFGVRQKWDQKSQKPRDSSVEVRSDWEVKEEMDFPQLMKMRYLEVSEPQDIECCGALEYYDKAFDRITTRSEKPLRSIKRIFHTVTTTDDPVIRKLAKTQGNVFATDAILATLMSCTRSVYSWDIVVQRVGSKLFFDKRDNSDFDLLTVSETANEPPQDEGNSFNSPRNLAMEATYINHNFSQQCLRMGKERYNFPNPNPFVEDDMDKNEIASVAYRYRRWKLGDDIDLIVRCEHDGVMTGANGEVSFINIKTLNEWDSRHCNGVDWRQKLDSQRGAVIATELKNNSYKLARWTCCALLAGSEYLKLGYVSRYHVKDSSRHVILGTQQFKPNEFASQINLSVENAWGILRCVIDICMKLEEGKYLILKDPNKQVIRVYSLPDGTFSSDEDEEEEEEEEEEEEEEET

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	Receptor of activated protein C kinase 1
分子量 formula_weight	35115.7 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	c

MTEQMTLRGTLKGHNGWVTQIATTPQFPDMILSASRDKTIIMWKLTRDETNYGIPQRALRGHSHFVSDVVISSDGQFALSGSWDGTLRLWDLTTGTTTRRFVGHTKDVLSVAFSSDNRQIVSGSRDKTIKLWNTLGVCKYTVQDESHSEWVSCVRFSPNSSNPIIVSCGWDKLVKVWNLANCKLKTNHIGHTGYLNTVTVSPDGSLCASGGKDGQAMLWDLNEGKHLYTLDGGDIINALCFSPNRYWLCAATGPSIKIWDLEGKIIVDELKQEVISTSSKAEPPQCTSLAWSADGQTLFAGYTDNLVRVWQVTIGTR

实体 3 Entity 3 polymer

描述 description	40S ribosomal protein S28
分子量 formula_weight	7855.1 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	n

MDTSRVQPIKLARVTKVLGRTGSQGQCTQVRVEFMDDTSRSIIRNVKGPVREGDVLTLLESEREARRLR

实体 4 Entity 4 polymer

描述 description	40S ribosomal protein S17
分子量 formula_weight	15578.2 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	X

MGRVRTKTVKKAARVIIEKYYTRLGNDFHTNKRVCEEIAIIPSKKLRNKIAGYVTHLMKRIQRGPVRGISIKLQEEERERRDNYVPEVSALDQEIIEVDPDTKEMLKLLDFGSLSNLQVTQPTVGMNFKTPRGPV

实体 5 Entity 5 polymer

描述 description	40S ribosomal protein S20
分子量 formula_weight	13398.8 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	h

MAFKDTGKTPVEPEVAIHRIRITLTSRNVKSLEKVCADLIRGAKEKNLKVKGPVRMPTKTLRITTRKTPCGEGSKTWDRFQMRIHKRLIDLHSPSEIVKQITSISIEPGVEVEVTIADA

实体 6 Entity 6 polymer

描述 description	Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit G
分子量 formula_weight	35662.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	o

MPTGDFDSKPSWADQVEEEGEDDKCVTSELLKGIPLATGDTSPEPELLPGAPLPPPKEVINGNIKTVTEYKIDEDGKKFKIVRTFRIETRKASKAVARRKNWKKFGNSEFDPPGPNVATTTVSDDVSMTFITSKEDLNCQEEEDPMNKLKGQKIVSCRICKGDHWTTRCPYKDTLGPMQKELAEQLGLSTGEKEKLPGELEPVQATQNKTGKYVPPSLRDGASRRGESMQPNRRADDNATIRVTNLSEDTRETDLQELFRPFGSISRIYLAKDKTTGQSKGFAFISFHRREDAARAIAGVSGFGYDHLILNVEWAKPSTN

实体 7 Entity 7 polymer

描述 description	40S ribosomal protein S10
分子量 formula_weight	18933.8 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	a

MLMPKKNRIAIYELLFKEGVMVAKKDVHMPKHPELADKNVPNLHVMKAMQSLKSRGYVKEQFAWRHFYWYLTNEGIQYLRDYLHLPPEIVPATLRRSRPETGRPRPKGLEGERPARLTRGEADRDTYRRSAVPPGADKKAEAGAGSATEFQFRGGFGRGRGQPPQ

实体 8 Entity 8 polymer

描述 description	40S ribosomal protein S12
分子量 formula_weight	14539.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	m

MAEEGIAAGGVMDVNTALQEVLKTALIHDGLARGIREAAKALDKRQAHLCVLASNCDEPMYVKLVEALCAEHQINLIKVDDNKKLGEWVGLCKIDREGKPRKVVGCSCVVVKDYGKESQAKDVIEEYFKCKK

实体 9 Entity 9 polymer

描述 description	40S ribosomal protein S29
分子量 formula_weight	6690.8 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	i

MGHQQLYWSHPRKFGQGSRSCRVCSNRHGLIRKYGLNMCRQCFRQYAKDIGFIKLD

实体 10 Entity 10 polymer

描述 description	40S ribosomal protein S15
分子量 formula_weight	17076.2 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	b

MAEVEQKKKRTFRKFTYRGVDLDQLLDMSYEQLMQLYSARQRRRLNRGLRRKQHSLLKRLRKAKKEAPPMEKPEVVKTHLRDMIILPEMVGSMVGVYNGKTFNQVEIKPEMIGHYLGEFSITYKPVKHGRPGIGATHSSRFIPLK

实体 11 Entity 11 polymer

描述 description	40S ribosomal protein S3
分子量 formula_weight	26729.4 kDa
EC 编号 ec_number	4.2.99.18
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	Z

MAVQISKKRKFVADGIFKAELNEFLTRELAEDGYSGVEVRVTPTRTEIIILATRTQNVLGEKGRRIRELTAVVQKRFGFPEGSVELYAEKVATRGLCAIAQAESLRYKLLGGLAVRRACYGVLRFIMESGAKGCEVVVSGKLRGQRAKSMKFVDGLMIHSGDPVNYYVDTAVRHVLLRQGVLGIKVKIMLPWDPTGKIGPKKPLPDHVSIVEPKDEILPTTPISEQKGGKPEPPAMPQPVPTA

实体 12 Entity 12 polymer

描述 description	40S ribosomal protein S19
分子量 formula_weight	16091.6 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	d

MPGVTVKDVNQQEFVRALAAFLKKSGKLKVPEWVDTVKLAKHKELAPYDENWFYTRAASTARHLYLRGGAGVGSMTKIYGGRQRNGVMPSHFSRGSKSVARRVLQALEGLKMVEKDQDGGRKLTPQGQRDLDRIAGQVAAANKKH

实体 13 Entity 13 polymer

描述 description	40S ribosomal protein S25
分子量 formula_weight	13776.2 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	e

MPPKDDKKKKDAGKSAKKDKDPVNKSGGKAKKKKWSKGKVRDKLNNLVLFDKATYDKLCKEVPNYKLITPAVVSERLKIRGSLARAALQELLSKGLIKLVSKHRAQVIYTRNTKGGDAPAAGEDA

实体 14 Entity 14 polymer

描述 description	40S ribosomal protein S18
分子量 formula_weight	17759.8 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	f

MSLVIPEKFQHILRVLNTNIDGRRKIAFAITAIKGVGRRYAHVVLRKADIDLTKRAGELTEDEVERVITIMQNPRQYKIPDWFLNRQKDVKDGKYSQVLANGLDNKLREDLERLKKIRAHRGLRHFWGLRVRGQHTKTTGRRGRTVGVSKKK

实体 15 Entity 15 polymer

描述 description	40S ribosomal protein S5
分子量 formula_weight	22913.5 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	V

MTEWETAAPAVAETPDIKLFGKWSTDDVQINDISLQDYIAVKEKYAKYLPHSAGRYAAKRFRKAQCPIVERLTNSMMMHGRNNGKKLMTVRIVKHAFEIIHLLTGENPLQVLVNAIINSGPREDSTRIGRAGTVRRQAVDVSPLRRVNQAIWLLCTGAREAAFRNIKTIAECLADELINAAKGSSNSYAIKKKDELERVAKSNR

实体 16 Entity 16 polymer

描述 description	Ubiquitin-40S ribosomal protein S27a
分子量 formula_weight	18004.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	k

MQIFVKTLTGKTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGAKKRKKKSYTTPKKNKHKRKKVKLAVLKYYKVDENGKISRLRRECPSDECGAGVFMASHFDRHYCGKCCLTYCFNKPEDK

实体 17 Entity 17 polymer

描述 description	40S ribosomal protein S16
分子量 formula_weight	16477.4 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	Y

MPSKGPLQSVQVFGRKKTATAVAHCKRGNGLIKVNGRPLEMIEPRTLQYKLLEPVLLLGKERFAGVDIRVRVKGGGHVAQIYAIRQSISKALVAYYQKYVDEASKKEIKDILIQYDRTLLVADPRRCESKKFGGPGARARYQKSYR

实体 18 Entity 18 polymer

描述 description	18S rRNA
分子量 formula_weight	603130.4 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polyribonucleotide
链编号 strand_id	A

UACCUGGUUGAUCCUGCCAGUAGCAUAUGCUUGUCUCAAAGAUUAAGCCAUGCAUGUCUGAGUACGCACGGCCGGUACAGUGAAACUGCGAAUGGCUCAUUAAAUCAGUUAUGGUUCCUUUGGUCGCUCGCUCCUCUCCUACUUGGAUAACUGUGGUAAUUCUAGAGCUAAUACAUGCCGACGGGCGCUGACCCCCUUCGCGGGGGGGAUGCGUGCAUUUAUCAGAUCAAAACCAACCCGGUCAGCCCCUCUCCGGCCCCGGCCGGGGGGCGGGCGCCGGCGGCUUUGGUGACUCUAGAUAACCUCGGGCCGAUCGCACGCCCCCCGUGGCGGCGACGACCCAUUCGAACGUCUGCCCUAUCAACUUUCGAUGGUAGUCGCCGUGCCUACCAUGGUGACCACGGGUGACGGGGAAUCAGGGUUCGAUUCCGGAGAGGGAGCCUGAGAAACGGCUACCACAUCCAAGGAAGGCAGCAGGCGCGCAAAUUACCCACUCCCGACCCGGGGAGGUAGUGACGAAAAAUAACAAUACAGGACUCUUUCGAGGCCCUGUAAUUGGAAUGAGUCCACUUUAAAUCCUUUAACGAGGAUCCAUUGGAGGGCAAGUCUGGUGCCAGCAGCCGCGGUAAUUCCAGCUCCAAUAGCGUAUAUUAAAGUUGCUGCAGUUAAAAAGCUCGUAGUUGGAUCUUGGGAGCGGGCGGGCGGUCCGCCGCGAGGCGAGCCACCGCCCGUCCCCGCCCCUUGCCUCUCGGCGCCCCCUCGAUGCUCUUAGCUGAGUGUCCCGCGGGGCCCGAAGCGUUUACUUUGAAAAAAUUAGAGUGUUCAAAGCAGGCCCGAGCCGCCUGGAUACCGCAGCUAGGAAUAAUGGAAUAGGACCGCGGUUCUAUUUUGUUGGUUUUCGGAACUGAGGCCAUGAUUAAGAGGGACGGCCGGGGGCAUUCGUAUUGCGCCGCUAGAGGUGAAAUUCUUGGACCGGCGCAAGACGGACCAGAGCGAAAGCAUUUGCCAAGAAUGUUUUCAUUAAUCAAGAACGAAAGUCGGAGGUUCGAAGACGAUCAGAUACCGUCGUAGUUCCGACCAUAAACGAUGCCGACCGGCGAUGCGGCGGCGUUAUUCCCAUGACCCGCCGGGCAGCUUCCGGGAAACCAAAGUCUUUGGGUUCCGGGGGGAGUAUGGUUGCAAAGCUGAAACUUAAAGGAAUUGACGGAAGGGCACCACCAGGAGUGGAGCCUGCGGCUUAAUUUGACUCAACACGGGAAACCUCACCCGGCCCGGACACGGACAGGAUUGACAGAUUGAUAGCUCUUUCUCGAUUCCGUGGGUGGUGGUGCAUGGCCGUUCUUAGUUGGUGGAGCGAUUUGUCUGGUUAAUUCCGAUAACGAACGAGACUCUGGCAUGCUAACUAGUUACGCGACCCCCGAGCGGUCGGCGUCCCCCAACUUCUUAGAGGGACAAGUGGCGUUCAGCCACCCGAGAUUGAGCAAUAACAGGUCUGUGAUGCCCUUAGAUGUCCGGGGCUGCACGCGCGCUACACUGACUGGCUCAGCGUGUGCCUACCCUACGCCGGCAGGCGCGGGUAACCCGUUGAACCCCAUUCGUGAUGGGGAUCGGGGAUUGCAAUUAUUCCCCAUGAACGAGGAAUUCCCAGUAAGUGCGGGUCAUAAGCUUGCGUUGAUUAAGUCCCUGCCCUUUGUACACACCGCCCGUCGCUACUACCGAUUGGAUGGUUUAGUGAGGCCCUCGGAUCGGCCCCGCCGGGGUCGGCCCACGGCCCUGGCGGAGCGCUGAGAAGACGGUCGAACUUGACUAUCUAGAGGAAGUAAAAGUCGUAACAAGGUUUCCGUAGGUGAACCUGCGGAAGGAUCAUUA

实体 19 Entity 19 non-polymer

描述 description	MAGNESIUM ION
分子量 formula_weight	24.3 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	29

实体 20 Entity 20 non-polymer

描述 description	ZINC ION
分子量 formula_weight	65.4 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

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6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 3 domains

SCOP 2.08 (2 domains)

结构域编号 domain_id	d6ybsc_
类 Class class	b — All beta proteins
折叠类型 Fold fold	b.69 — 7-bladed beta-propeller
超家族 Superfamily superfamily	b.69.4 — WD40 repeat-like
家族 Family family	b.69.4.1 — WD40-repeat

结构域编号 domain_id	d6ybso_
类 Class class	d — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold fold	d.58 — Ferredoxin-like
超家族 Superfamily superfamily	d.58.7 — RNA-binding domain, RBD, aka RNA recognition motif (RRM)
家族 Family family	d.58.7.0 — automated matches

CATH v4.4 (1 domains)

结构域编号 domain_id	6ybsZ01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	300 — GMP Synthetase; Chain A, domain 3
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	20 — K homology (KH) domain

▶

晶胞边长 a length_a	1.000 Å
晶胞边长 b length_b	1.000 Å
晶胞边长 c length_c	1.000 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	—

空间群 space_group	P 1
空间群编号 int_tables_number	1
晶系 crystal_system	triclinic

分辨率 resolution	3.10 Å
分辨率测定方法 resolution_method	—
颗粒数 num_particles	144882

Structure of a human 48S translational initiation complex - head

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit D

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Receptor of activated protein C kinase 1

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

40S ribosomal protein S28

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

40S ribosomal protein S17

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

40S ribosomal protein S20

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit G

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

40S ribosomal protein S10

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

40S ribosomal protein S12

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

40S ribosomal protein S29

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

40S ribosomal protein S15

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体