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Crystal Structure of catalase HPII from Escherichia coli (serendipitously crystallized)

Method: X-RAY DIFFRACTION Dmax: 134.2 Å Quality: GOOD
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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Catalase HPII

物种未注明

UniProt P21179

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白同源多聚体 同源多聚体 蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白拷贝数一致 链 A； UniProt 1–753 链 B； UniProt 1–753 链 C； UniProt 1–753 链 D； UniProt 1–753 突变：R37S, S99D, K372N, R521S GOL GLYCEROL × 4 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 7 HDD CIS-HEME D HYDROXYCHLORIN GAMMA-SPIROLACTONE × 4 X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；292 K；0.2 M lithium sulfate monohydrate, 0.1 M Tris pH 8.5, 25% w/v polyethylene glycol 3350 分辨率 1.30 Å R-free 0.162

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 6ZTX Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
1CF9 Structure of the mutant VAL169CYS of catalase HPII from Escherichia coli 提交 1999-03-24 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 27–753（727 aa）
链 B 27–753（727 aa）
链 C 27–753（727 aa）
链 D 27–753（727 aa）
突变：V169C 突变：V169C 突变：V169C 突变：V169C HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 9；pH 9
分辨率 1.80 Å R-free 0.237
1GG9 CRYSTAL STRUCTURE OF CATALASE HPII FROM ESCHERICHIA COLI, HIS128ASN VARIANT. 提交 2000-08-11 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 1–753（753 aa）
链 B 1–753（753 aa）
链 C 1–753（753 aa）
链 D 1–753（753 aa）
突变：H128N 突变：H128N 突变：H128N 突变：H128N HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9；297 K；PEG 3350, LiCl, Tris-HCl, pH 9.0, vapor diffusion/hanging drop, temperature 297.0K
分辨率 1.89 Å R-free 0.188
1GGE CRYSTAL STRUCTURE OF CATALASE HPII FROM ESCHERICHIA COLI, NATIVE STRUCTURE AT 1.9 A RESOLUTION. 提交 2000-08-16 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 1–753（753 aa）
链 B 1–753（753 aa）
链 C 1–753（753 aa）
链 D 1–753（753 aa）
未记录 HDD CIS-HEME D HYDROXYCHLORIN GAMMA-SPIROLACTONE × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9；297 K；PEG 3350, LiCl, Tris-HCl, pH 9.00, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 297.0K
分辨率 1.89 Å R-free 0.202
1GGF CRYSTAL STRUCTURE OF CATALASE HPII FROM ESCHERICHIA COLI, VARIANT HIS128ASN, COMPLEX WITH HYDROGEN PEROXIDE. 提交 2000-08-21 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 1–753（753 aa）
链 B 1–753（753 aa）
链 C 1–753（753 aa）
链 D 1–753（753 aa）
突变：H128N 突变：H128N 突变：H128N 突变：H128N HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 4 PEO HYDROGEN PEROXIDE × 13 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 9；297 K；PEG 3350, LiCl, Tris-HCl. Before data collection the protein crystal was soaked during a few seconds in the solution with 2M hydrogen peroxide., pH 9.0, temperature 297.0K
分辨率 2.28 Å R-free 0.254
1GGH CRYSTAL STRUCTURE OF CATALASE HPII FROM ESCHERICHIA COLI, HIS128ALA VARIANT. 提交 2000-08-21 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 1–753（753 aa）
链 B 1–753（753 aa）
链 C 1–753（753 aa）
链 D 1–753（753 aa）
突变：H128A 突变：H128A 突变：H128A 突变：H128A HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9；297 K；PEG 3350, LiCl, Tris-HCl, pH 9.0, vapor diffusion/hanging drop, temperature 297.0K
分辨率 2.15 Å R-free 0.206
1GGJ CRYSTAL STRUCTURE OF CATALASE HPII FROM ESCHERICHIA COLI, ASN201ALA VARIANT. 提交 2000-08-21 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 1–753（753 aa）
链 B 1–753（753 aa）
链 C 1–753（753 aa）
链 D 1–753（753 aa）
突变：N201A 突变：N201A 突变：N201A 突变：N201A HDD CIS-HEME D HYDROXYCHLORIN GAMMA-SPIROLACTONE × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9；297 K；PEG 3350, LiCl, Tris-HCl, pH 9.0, vapor diffusion/hanging drop, temperature 297.0K
分辨率 1.92 Å R-free 0.235
1GGK CRYSTAL STRUCTURE OF CATALASE HPII FROM ESCHERICHIA COLI, ASN201HIS VARIANT. 提交 2000-08-21 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 1–753（753 aa）
链 B 1–753（753 aa）
链 C 1–753（753 aa）
链 D 1–753（753 aa）
突变：N201H 突变：N201H 突变：N201H 突变：N201H HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9；297 K；PEG 3350, LiCl, Tris-HCl, pH 9.0, vapor diffusion/hanging drop, temperature 297.0K
分辨率 2.26 Å R-free 0.208
1IPH STRUCTURE OF CATALASE HPII FROM ESCHERICHIA COLI 提交 1995-12-31 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 1–753（753 aa）
链 B 1–753（753 aa）
链 C 1–753（753 aa）
链 D 1–753（753 aa）
未记录 HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 4 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 2.80 Å
1P7Y Crystal structure of the D181A variant of catalase HPII from E. coli 提交 2003-05-06 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 1–753（753 aa）
链 B 1–753（753 aa）
链 C 1–753（753 aa）
链 D 1–753（753 aa）
突变：D181A 突变：D181A 突变：D181A 突变：D181A HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9；295 K；PEG 3350, LiCl, Tris, pH 9.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
分辨率 2.40 Å R-free 0.225
1P7Z Crystal structure of the D181S variant of catalase HPII from E. coli 提交 2003-05-06 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 1–753（753 aa）
链 B 1–753（753 aa）
链 C 1–753（753 aa）
链 D 1–753（753 aa）
突变：D181S 突变：D181S 突变：D181S 突变：D181S HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9；295 K；PEG 3350, LiCl, Tris, pH 9.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295.0K
分辨率 2.21 Å R-free 0.211
1P80 Crystal structure of the D181Q variant of catalase HPII from E. coli 提交 2003-05-06 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 1–753（753 aa）
链 B 1–753（753 aa）
链 C 1–753（753 aa）
链 D 1–753（753 aa）
突变：D181Q 突变：D181Q 突变：D181Q 突变：D181Q HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9；298 K；PEG 3350, LiCl, Tris, pH 9.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298.0K
分辨率 1.65 Å R-free 0.202
1P81 Crystal structure of the D181E variant of catalase HPII from E. coli 提交 2003-05-06 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 1–753（753 aa）
链 B 1–753（753 aa）
链 C 1–753（753 aa）
链 D 1–753（753 aa）
突变：D181E 突变：D181E 突变：D181E 突变：D181E HDD CIS-HEME D HYDROXYCHLORIN GAMMA-SPIROLACTONE × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9；295 K；PEG 3350, LiCl, Tris, pH 9.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295.0K
分辨率 1.81 Å R-free 0.216
1QF7 STRUCTURE OF THE MUTANT HIS392GLN OF CATALASE HPII FROM E. COLI 提交 1999-03-26 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 1–753（753 aa）
链 B 1–753（753 aa）
链 C 1–753（753 aa）
链 D 1–753（753 aa）
突变：H392Q 突变：H392Q 突变：H392Q 突变：H392Q HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 9；pH 9
分辨率 2.20 Å R-free 0.210
1QWS Structure of the D181N variant of catalase HPII from E. coli 提交 2003-09-03 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 1–753（753 aa）
链 B 1–753（753 aa）
链 C 1–753（753 aa）
链 D 1–753（753 aa）
突变：D181N 突变：D181N 突变：D181N 突变：D181N HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9；293 K；15% PEG 3350, 1.6M LiCl, 0.1M Tris, pH 9.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 1.90 Å R-free 0.220
1YE9 Crystal structure of proteolytically truncated catalase HPII from E. coli 提交 2004-12-28 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 A 75–300（226 aa） 片段：proteolytic fragment, residues 75-300
链 B 75–300（226 aa） 片段：proteolytic fragment, residues 75-300
链 C 75–300（226 aa） 片段：proteolytic fragment, residues 75-300
链 D 75–300（226 aa） 片段：proteolytic fragment, residues 75-300
链 E 309–567（259 aa） 片段：proteolytic fragment, residues 309-567
链 F 309–567（259 aa） 片段：proteolytic fragment, residues 309-567
链 G 309–567（259 aa） 片段：proteolytic fragment, residues 309-567
链 H 309–567（259 aa） 片段：proteolytic fragment, residues 309-567
未记录 HDD CIS-HEME D HYDROXYCHLORIN GAMMA-SPIROLACTONE × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；298 K；50mM TrisHCl, 8% PEG 20000, 8% PEG MME 550, 0.2M KSCN, 0.1M dithiothreitol, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 2.80 Å R-free 0.269
1YE9 Crystal structure of proteolytically truncated catalase HPII from E. coli 提交 2004-12-28 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 I 75–300（226 aa） 片段：proteolytic fragment, residues 75-300
链 J 75–300（226 aa） 片段：proteolytic fragment, residues 75-300
链 K 75–300（226 aa） 片段：proteolytic fragment, residues 75-300
链 L 75–300（226 aa） 片段：proteolytic fragment, residues 75-300
链 M 309–567（259 aa） 片段：proteolytic fragment, residues 309-567
链 N 309–567（259 aa） 片段：proteolytic fragment, residues 309-567
链 O 309–567（259 aa） 片段：proteolytic fragment, residues 309-567
链 P 309–567（259 aa） 片段：proteolytic fragment, residues 309-567
未记录 HDD CIS-HEME D HYDROXYCHLORIN GAMMA-SPIROLACTONE × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；298 K；50mM TrisHCl, 8% PEG 20000, 8% PEG MME 550, 0.2M KSCN, 0.1M dithiothreitol, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 2.80 Å R-free 0.269
28WU Crystal Structure of Catalase HPII (KatE) from Escherichia coli 提交 2026-02-25 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 1–753（753 aa）
链 B 1–753（753 aa）
链 C 1–753（753 aa）
链 D 1–753（753 aa）
未记录 HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.75；293 K；0.1M Bis-Tris-Propane pH 7.75, 0.2M Na-acetate, 20% PEG3350.
分辨率 2.50 Å R-free 0.224
3P9P Structure of I274V variant of E. coli KatE 提交 2010-10-18 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 1–753（753 aa）
链 B 1–753（753 aa）
链 C 1–753（753 aa）
链 D 1–753（753 aa）
突变：I274V 突变：I274V 突变：I274V 突变：I274V HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 8 HDE CIS-HEME D HYDROXYCHLORIN GAMMA-SPIROLACTONE 17R, 18S × 4 HDD CIS-HEME D HYDROXYCHLORIN GAMMA-SPIROLACTONE × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9；293 K；17% PEG3350, 1.6 M LiCl, 0.1 M Tris, pH 9.0, vapor diffusion, hanging drop, temperature 293K
分辨率 1.50 Å R-free 0.185
3P9Q Structure of I274C variant of E. coli KatE 提交 2010-10-18 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 1–753（753 aa）
链 B 1–753（753 aa）
链 C 1–753（753 aa）
链 D 1–753（753 aa）
突变：I274C 突变：I274C 突变：I274C 突变：I274C HDD CIS-HEME D HYDROXYCHLORIN GAMMA-SPIROLACTONE × 4 HDE CIS-HEME D HYDROXYCHLORIN GAMMA-SPIROLACTONE 17R, 18S × 4 H2S HYDROSULFURIC ACID × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9；293 K；17% PEG3350, 1.6 M LiCl, 0.1 M Tris, pH 9.0, vapor diffusion, hanging drop, temperature 293K
分辨率 1.48 Å R-free 0.177
3P9R Structure of I274G variant of E. coli KatE 提交 2010-10-18 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 1–753（753 aa）
链 B 1–753（753 aa）
链 C 1–753（753 aa）
链 D 1–753（753 aa）
突变：I274G 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：I274G 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：I274G 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：I274G 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） HDD CIS-HEME D HYDROXYCHLORIN GAMMA-SPIROLACTONE × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9；293 K；17% PEG3350, 1.6 M LiCl, 0.1 M Tris, pH 9.0, vapor diffusion, hanging drop, temperature 293K
分辨率 1.90 Å R-free 0.184
3P9S Structure of I274A variant of E. coli KatE 提交 2010-10-18 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 1–753（753 aa）
链 B 1–753（753 aa）
链 C 1–753（753 aa）
链 D 1–753（753 aa）
突变：I274A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：I274A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：I274A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：I274A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） HDD CIS-HEME D HYDROXYCHLORIN GAMMA-SPIROLACTONE × 4 HDE CIS-HEME D HYDROXYCHLORIN GAMMA-SPIROLACTONE 17R, 18S × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9；293 K；17% PEG3350, 1.6 M LiCl, 0.1 M Tris, pH 9.0, vapor diffusion, hanging drop, temperature 293K
分辨率 1.90 Å R-free 0.191
3PQ2 Structure of I274C variant of E. coli KatE[] - Images 1-6 提交 2010-11-25 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 1–753（753 aa）
链 B 1–753（753 aa）
链 C 1–753（753 aa）
链 D 1–753（753 aa）
突变：I274C 突变：I274C 突变：I274C 突变：I274C HDD CIS-HEME D HYDROXYCHLORIN GAMMA-SPIROLACTONE × 4 HDE CIS-HEME D HYDROXYCHLORIN GAMMA-SPIROLACTONE 17R, 18S × 4 H2S HYDROSULFURIC ACID × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9；293 K；17% PEG3350, 1.6 M LiCl, 0.1 M Tris, pH 9.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 1.79 Å R-free 0.189
3PQ3 Structure of I274C variant of E. coli KatE[] - Images 7-12 提交 2010-11-25 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 1–753（753 aa）
链 B 1–753（753 aa）
链 C 1–753（753 aa）
链 D 1–753（753 aa）
突变：I274C 突变：I274C 突变：I274C 突变：I274C HDD CIS-HEME D HYDROXYCHLORIN GAMMA-SPIROLACTONE × 4 HDE CIS-HEME D HYDROXYCHLORIN GAMMA-SPIROLACTONE 17R, 18S × 4 H2S HYDROSULFURIC ACID × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9；293 K；17% PEG3350, 1.6 M LiCl, 0.1 M Tris, pH 9.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 1.79 Å R-free 0.189
3PQ4 Structure of I274C variant of E. coli KatE[] - Images 13-18 提交 2010-11-25 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 1–753（753 aa）
链 B 1–753（753 aa）
链 C 1–753（753 aa）
链 D 1–753（753 aa）
突变：I274C 突变：I274C 突变：I274C 突变：I274C HDD CIS-HEME D HYDROXYCHLORIN GAMMA-SPIROLACTONE × 4 HDE CIS-HEME D HYDROXYCHLORIN GAMMA-SPIROLACTONE 17R, 18S × 4 H2S HYDROSULFURIC ACID × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9；293 K；17% PEG3350, 1.6 M LiCl, 0.1 M Tris, pH 9.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 1.79 Å R-free 0.189
3PQ5 Structure of I274C variant of E. coli KatE[] - Images 19-24 提交 2010-11-25 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 1–753（753 aa）
链 B 1–753（753 aa）
链 C 1–753（753 aa）
链 D 1–753（753 aa）
突变：I274C 突变：I274C 突变：I274C 突变：I274C HDD CIS-HEME D HYDROXYCHLORIN GAMMA-SPIROLACTONE × 4 HDE CIS-HEME D HYDROXYCHLORIN GAMMA-SPIROLACTONE 17R, 18S × 4 H2S HYDROSULFURIC ACID × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9；293 K；17% PEG3350, 1.6 M LiCl, 0.1 M Tris, pH 9.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 1.80 Å R-free 0.190
3PQ6 Structure of I274C variant of E. coli KatE[] - Images 25-30 提交 2010-11-25 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 1–753（753 aa）
链 B 1–753（753 aa）
链 C 1–753（753 aa）
链 D 1–753（753 aa）
突变：I274C 突变：I274C 突变：I274C 突变：I274C HDD CIS-HEME D HYDROXYCHLORIN GAMMA-SPIROLACTONE × 4 HDE CIS-HEME D HYDROXYCHLORIN GAMMA-SPIROLACTONE 17R, 18S × 4 H2S HYDROSULFURIC ACID × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9；293 K；17% PEG3350, 1.6 M LiCl, 0.1 M Tris, pH 9.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 1.80 Å R-free 0.191
3PQ7 Structure of I274C variant of E. coli KatE[] - Images 31-36 提交 2010-11-25 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 1–753（753 aa）
链 B 1–753（753 aa）
链 C 1–753（753 aa）
链 D 1–753（753 aa）
突变：I274C 突变：I274C 突变：I274C 突变：I274C HDD CIS-HEME D HYDROXYCHLORIN GAMMA-SPIROLACTONE × 4 HDE CIS-HEME D HYDROXYCHLORIN GAMMA-SPIROLACTONE 17R, 18S × 4 H2S HYDROSULFURIC ACID × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9；293 K；17% PEG3350, 1.6 M LiCl, 0.1 M Tris, pH 9.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 1.80 Å R-free 0.190
3PQ8 Structure of I274C variant of E. coli KatE[] - Images 37-42 提交 2010-11-25 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 1–753（753 aa）
链 B 1–753（753 aa）
链 C 1–753（753 aa）
链 D 1–753（753 aa）
突变：I274C 突变：I274C 突变：I274C 突变：I274C HDD CIS-HEME D HYDROXYCHLORIN GAMMA-SPIROLACTONE × 4 HDE CIS-HEME D HYDROXYCHLORIN GAMMA-SPIROLACTONE 17R, 18S × 4 H2S HYDROSULFURIC ACID × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9；293 K；17% PEG3350, 1.6 M LiCl, 0.1 M Tris, pH 9.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 1.80 Å R-free 0.190
3TTT Structure of F413Y variant of E. coli KatE 提交 2011-09-15 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 1–753（753 aa）
链 B 1–753（753 aa）
链 C 1–753（753 aa）
链 D 1–753（753 aa）
突变：F413Y 突变：F413Y 突变：F413Y 突变：F413Y HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9；293 K；17% PEG3350, 1.6 M lithium chloride, 0.1 M Tris, pH 9.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 1.58 Å R-free 0.189
3TTU Structure of F413Y/H128N double variant of E. coli KatE 提交 2011-09-15 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 1–753（753 aa）
链 B 1–753（753 aa）
链 C 1–753（753 aa）
链 D 1–753（753 aa）
突变：F413Y/H128N 突变：F413Y/H128N 突变：F413Y/H128N 突变：F413Y/H128N HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9；293 K；17% PEG3350, 1.6 M lithium chloride, 0.1 M Tris, pH 9.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 1.89 Å R-free 0.193
3TTV Structure of the F413E variant of E. coli KatE 提交 2011-09-15 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 1–753（753 aa）
链 B 1–753（753 aa）
链 C 1–753（753 aa）
链 D 1–753（753 aa）
突变：F413Y/T115A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：F413Y/T115A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：F413Y/T115A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：F413Y/T115A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9；293 K；17% PEG3350, 1.6 M lithium chloride, 0.1 M Tris, pH 9.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 1.45 Å R-free 0.172
3TTW Structure of the F413E variant of E. coli KatE 提交 2011-09-15 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 1–753（753 aa）
链 B 1–753（753 aa）
链 C 1–753（753 aa）
链 D 1–753（753 aa）
突变：F413E 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：F413E 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：F413E 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：F413E 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9；293 K；17% PEG3350, 1.6 M lithium chloride, 0.1 M Tris, pH 9.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 1.62 Å R-free 0.199
3TTX Structure of the F413K variant of E. coli KatE 提交 2011-09-15 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 1–753（753 aa）
链 B 1–753（753 aa）
链 C 1–753（753 aa）
链 D 1–753（753 aa）
突变：F413K 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：F413K 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：F413K 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：F413K 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9；293 K；17% PEG3350, 1.6 M lithium chloride, 0.1 M Tris, pH 9.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 1.74 Å R-free 0.185
3VU3 Crystal structure of the Hfq and catalase HPII complex 提交 2012-06-15 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：28-meric
链 A 1–753（753 aa）
未记录 HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9；293 K；0.1M Tris-HCl, 0.18M NaCl, 10% PEG4000, pH 9.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 2.85 Å R-free 0.246
4BFL Structure of natively expressed catalase HPII 提交 2013-03-19 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 1–753（753 aa）
链 B 1–753（753 aa）
链 C 1–753（753 aa）
链 D 1–753（753 aa）
未记录 HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 4 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 6.5；10 % PEG 20000, 20% PEG 500MME, 30 MM SODIUM NITRATE, 30 MM DISODIUM HYDROGENPHOSPHATE, 30 MM AMMONIUM SULFATE, AND 100 MM MES/IMIDAZOLE PH 6.5
分辨率 1.64 Å R-free 0.202
4ENP Structure of E530A variant E. coli KatE 提交 2012-04-13 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 1–753（753 aa）
链 B 1–753（753 aa）
链 C 1–753（753 aa）
链 D 1–753（753 aa）
突变：E530A 突变：E530A 突变：E530A 突变：E530A HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9；293 K；17% PEG3350, 1.6 M LiCl, 0.1 M Tris, pH 9.0, vapor diffusion, hanging drop, temperature 293K
分辨率 1.50 Å R-free 0.162
4ENQ Structure of E530D variant E. coli KatE 提交 2012-04-13 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 1–753（753 aa）
链 B 1–753（753 aa）
链 C 1–753（753 aa）
链 D 1–753（753 aa）
突变：E530D 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：E530D 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：E530D 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：E530D 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） HDD CIS-HEME D HYDROXYCHLORIN GAMMA-SPIROLACTONE × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9；293 K；17% PEG3350, 1.6 M LiCl, 0.1 M Tris, pH 9.0, vapor diffusion, hanging drop, temperature 293K
分辨率 1.90 Å R-free 0.207
4ENR Structure of E530I variant E. coli KatE 提交 2012-04-13 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 1–753（753 aa）
链 B 1–753（753 aa）
链 C 1–753（753 aa）
链 D 1–753（753 aa）
突变：E530I 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：E530I 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：E530I 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：E530I 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9；293 K；17% PEG3350, 1.6 M LiCl, 0.1 M Tris, pH 9.0, vapor diffusion, hanging drop, temperature 293K
分辨率 1.60 Å R-free 0.193
4ENS Structure of E530Q variant of E. coli KatE 提交 2012-04-13 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 1–753（753 aa）
链 B 1–753（753 aa）
链 C 1–753（753 aa）
链 D 1–753（753 aa）
突变：E530Q 突变：E530Q 突变：E530Q 突变：E530Q HDD CIS-HEME D HYDROXYCHLORIN GAMMA-SPIROLACTONE × 4 HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9；293 K；17% PEG3350, 1.6 M LiCl, 0.1 M Tris, pH 9.0, vapor diffusion, hanging drop, temperature 293K
分辨率 1.60 Å R-free 0.184
4ENT Structure of the S234A variant of E. coli KatE 提交 2012-04-13 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 1–753（753 aa）
链 B 1–753（753 aa）
链 C 1–753（753 aa）
链 D 1–753（753 aa）
突变：S234A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：S234A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：S234A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：S234A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） HDD CIS-HEME D HYDROXYCHLORIN GAMMA-SPIROLACTONE × 4 HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9；293 K；17% PEG3350, 1.6 M LiCl, 0.1 M Tris, pH 9.0, vapor diffusion, hanging drop, temperature 293K
分辨率 1.70 Å R-free 0.197
4ENU Structure of the S234D variant of E. coli KatE 提交 2012-04-13 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 1–753（753 aa）
链 B 1–753（753 aa）
链 C 1–753（753 aa）
链 D 1–753（753 aa）
突变：S234D 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：S234D 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：S234D 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：S234D 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） HDD CIS-HEME D HYDROXYCHLORIN GAMMA-SPIROLACTONE × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9；293 K；17% PEG3350, 1.6 M LiCl, 0.1 M Tris, pH 9.0, vapor diffusion, hanging drop, temperature 293K
分辨率 1.70 Å R-free 0.170
4ENV Structure of the S234I variant of E. coli KatE 提交 2012-04-13 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 1–753（753 aa）
链 B 1–753（753 aa）
链 C 1–753（753 aa）
链 D 1–753（753 aa）
突变：S234I 突变：S234I 突变：S234I 突变：S234I HDD CIS-HEME D HYDROXYCHLORIN GAMMA-SPIROLACTONE × 4 HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9；293 K；17% PEG3350, 1.6 M LiCl, 0.1 M Tris, pH 9.0, vapor diffusion, hanging drop, temperature 293K
分辨率 1.70 Å R-free 0.207
4ENW Structure of the S234N variant of E. coli KatE 提交 2012-04-13 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 1–753（753 aa）
链 B 1–753（753 aa）
链 C 1–753（753 aa）
链 D 1–753（753 aa）
突变：S234N 突变：S234N 突变：S234N 突变：S234N HDD CIS-HEME D HYDROXYCHLORIN GAMMA-SPIROLACTONE × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9；293 K；17% PEG3350, 1.6 M LiCl, 0.1 M Tris, pH 9.0, vapor diffusion, hanging drop, temperature 293K
分辨率 1.90 Å R-free 0.221
5BV2 Crystal structure of E. coli HPII catalase variant 提交 2015-06-04 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 P 1–753（753 aa）
链 Q 1–753（753 aa）
链 R 1–753（753 aa）
链 S 1–753（753 aa）
未记录 HDD CIS-HEME D HYDROXYCHLORIN GAMMA-SPIROLACTONE × 4 GOL GLYCEROL × 11 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 39 PGE TRIETHYLENE GLYCOL × 3 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 10 SO4 SULFATE ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 PG4 TETRAETHYLENE GLYCOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；298 K；2% PEG20000, 15% PEG5000 MME, 0.1 M potassium chloride, 0.1 M manganese acetate, 0.1 M HEPES
分辨率 1.53 Å R-free 0.132
6BY0 Crystal structure of catalase HPII from E. coli in space group P1 提交 2017-12-19 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 1–753（753 aa）
链 B 1–753（753 aa）
链 C 1–753（753 aa）
链 D 1–753（753 aa）
未记录 HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；292 K；0.085 M sodium HEPES pH 7.5, 17% w/v PEG 4000, 15% v/v glycerol, 8.5% v/v isopropanol or 0.1 M HEPES pH 7.0, 20% w/v PEG 6000, 1.0 M lithium chloride
分辨率 2.93 Å R-free 0.236
6ZTV Crystal Structure of catalase HPII from Escherichia coli (serendipitously crystallized) 提交 2020-07-20 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 1–753（753 aa）
链 B 1–753（753 aa）
链 C 1–753（753 aa）
链 D 1–753（753 aa）
突变：S99N 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：S99N 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：S99N 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：S99N 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） HDD CIS-HEME D HYDROXYCHLORIN GAMMA-SPIROLACTONE × 4 GOL GLYCEROL × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；292 K；0.2 M NaCl, 0.1 M Tris pH 7.5, 20% w/v PEG 4000, 10% MPD
分辨率 1.78 Å R-free 0.229
6ZTW Crystal Structure of catalase HPII from Escherichia coli (serendipitously crystallized) 提交 2020-07-20 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 1–753（753 aa）
链 B 1–753（753 aa）
链 C 1–753（753 aa）
链 D 1–753（753 aa）
突变：S99N 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：S99N 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：S99N 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：S99N 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） HDD CIS-HEME D HYDROXYCHLORIN GAMMA-SPIROLACTONE × 4 TRS 2-AMINO-2-HYDROXYMETHYL-PROPANE-1,3-DIOL × 4 GOL GLYCEROL × 4 MPD (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；292 K；0.1 M Tris pH 7.5, 20% w/v PEG 4000
分辨率 1.84 Å R-free 0.184
6ZTW Crystal Structure of catalase HPII from Escherichia coli (serendipitously crystallized) 提交 2020-07-20 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 E 1–753（753 aa）
链 F 1–753（753 aa）
链 G 1–753（753 aa）
链 H 1–753（753 aa）
突变：S99N 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：S99N 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：S99N 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：S99N 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） HDD CIS-HEME D HYDROXYCHLORIN GAMMA-SPIROLACTONE × 4 TRS 2-AMINO-2-HYDROXYMETHYL-PROPANE-1,3-DIOL × 5 GOL GLYCEROL × 2 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；292 K；0.1 M Tris pH 7.5, 20% w/v PEG 4000
分辨率 1.84 Å R-free 0.184

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查看构建体与数据证据
UniProt名称 CATE_ECOLI
Isoform —
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A； PDB构建体 1–753； UniProt 1–753 作者链 B； PDB构建体 1–753； UniProt 1–753 作者链 C； PDB构建体 1–753； UniProt 1–753 作者链 D； PDB构建体 1–753； UniProt 1–753

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SAXS 散射曲线 SAXS Profile

SAXS profile for 6ztx

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

P(r) distribution for 6ztx
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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id6ztx
沉积日期 deposition_date2020-07-20
结构标题 titleCrystal Structure of catalase HPII from Escherichia coli (serendipitously crystallized)
关键词 keywordscatalase, hydrogen-peroxide, heme, iron, oxidative stress, artifact crystallization, impurities, contaminations, OXIDOREDUCTASE; OXIDOREDUCTASE
实验方法 methodX-RAY DIFFRACTION
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3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier41.61 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron41.32 Å
零角强度 I(0) i01567490000.00
分子量 molecular_weight327630.0 kDa
排除体积 excluded_volume409030 ų
包络体积 envelope_volume480050 ų
水化壳体积 shell_volume90224 ų
包络直径 envelope_diameter146.5 Å
壳层 Rg shell_rg50.69 Å
包络 Rg envelope_rg41.82 Å
形状 Rg shape_rg41.26 Å
总 Rg total_rg41.90 Å
总原子数 total_atoms23176
残基数 n_residues2908
球谐函数阶数 n_harmonics20
q 范围 q_range— – 0.5000 Å−1
数据点数 n_points101
壳层类型 shell_typedirectional
溶剂电子密度 solvent_density0.3340 e/ų
壳层衬度 contrast_shell0.0300 e/ų
CRYSOL 版本 crysol_version4.1.3
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4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax134.2 Å
Rg (实空间) rg_real41.53 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error0.78 Å
I(0) (实空间) i0_real1.5670e+09
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error2.5780e+07
Rg (倒空间) rg_reciprocal41.61 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal1568000000.0000
解质量估计 total_estimate0.8721
解质量评级 solution_quality GOOD a GOOD solution
P(r) 峰数 n_peaks2
主峰位置 r_peak_primary49.5 Å
偏度 Skewness skewness0.370
峰度 Kurtosis kurtosis-0.177
角度范围 angular_range— – 0.1900 Å−1
当前正则化参数 α current_alpha0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha662000000.0000
实空间数据点数 n_real_points39
GNOM 版本 gnom_version4.1.3
质量判据 quality_criteria AN1: 0.000; Oscil: 0.846; Stabil: 1.000; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.977; Smooth: 0.818
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5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

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6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (5)

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7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 8 domains

SCOP 2.08 (8 domains)

结构域编号 domain_idd6ztxa1
类 Class classe — Multi-domain proteins (alpha and beta)
折叠类型 Fold folde.5 — Heme-dependent catalase-like
超家族 Superfamily superfamilye.5.1 — Heme-dependent catalase-like
家族 Family familye.5.1.1 — Heme-dependent catalases
结构域编号 domain_idd6ztxa2
类 Class classc — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold foldc.23 — Flavodoxin-like
超家族 Superfamily superfamilyc.23.16 — Class I glutamine amidotransferase-like
家族 Family familyc.23.16.0 — automated matches
结构域编号 domain_idd6ztxb1
类 Class classe — Multi-domain proteins (alpha and beta)
折叠类型 Fold folde.5 — Heme-dependent catalase-like
超家族 Superfamily superfamilye.5.1 — Heme-dependent catalase-like
家族 Family familye.5.1.1 — Heme-dependent catalases
结构域编号 domain_idd6ztxb2
类 Class classc — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold foldc.23 — Flavodoxin-like
超家族 Superfamily superfamilyc.23.16 — Class I glutamine amidotransferase-like
家族 Family familyc.23.16.0 — automated matches
结构域编号 domain_idd6ztxc1
类 Class classe — Multi-domain proteins (alpha and beta)
折叠类型 Fold folde.5 — Heme-dependent catalase-like
超家族 Superfamily superfamilye.5.1 — Heme-dependent catalase-like
家族 Family familye.5.1.1 — Heme-dependent catalases
结构域编号 domain_idd6ztxc2
类 Class classc — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold foldc.23 — Flavodoxin-like
超家族 Superfamily superfamilyc.23.16 — Class I glutamine amidotransferase-like
家族 Family familyc.23.16.0 — automated matches
结构域编号 domain_idd6ztxd1
类 Class classe — Multi-domain proteins (alpha and beta)
折叠类型 Fold folde.5 — Heme-dependent catalase-like
超家族 Superfamily superfamilye.5.1 — Heme-dependent catalase-like
家族 Family familye.5.1.1 — Heme-dependent catalases
结构域编号 domain_idd6ztxd2
类 Class classc — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold foldc.23 — Flavodoxin-like
超家族 Superfamily superfamilyc.23.16 — Class I glutamine amidotransferase-like
家族 Family familyc.23.16.0 — automated matches
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8. 引用文献 (1)

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9. 文件与曲线 (10)