6zz6

Cryo-EM structure of S.cerevisiae cohesin-Scc2-DNA complex

Method: ELECTRON MICROSCOPY
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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

;Structural maintenance of chromosomes protein 1,Structural maintenance of chromosomes protein 1,Structural maintenance of chromosomes protein 1 ;

Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c)

UniProt P32908

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白–DNA 异源复合物 蛋白 4 DNA 2 ;Structural maintenance of chromosomes protein 3,Structural maintenance of chromosomes protein 3,Structural maintenance of chromosomes protein 3 ; × 1 (P47037) Sister chromatid cohesion protein 1,Sister chromatid cohesion protein 1,Sister chromatid cohesion protein 1 × 1 (Q12158) Sister chromatid cohesion protein 2 × 1 (Q04002) DNA (34-MER) × 1 DNA (34-MER) × 1 ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MAGNESIUM ION × 2 与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 SMC1_YEAST
Isoform —
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A; PDB构建体 1–70; UniProt 2–71 作者链 A; PDB构建体 71–179; UniProt 87–195 作者链 A; PDB构建体 180–360; UniProt 1044–1224

;Structural maintenance of chromosomes protein 3,Structural maintenance of chromosomes protein 3,Structural maintenance of chromosomes protein 3 ;

Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c)

UniProt P47037

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白–DNA 异源复合物 蛋白 4 DNA 2 ;Structural maintenance of chromosomes protein 1,Structural maintenance of chromosomes protein 1,Structural maintenance of chromosomes protein 1 ; × 1 (P32908) Sister chromatid cohesion protein 1,Sister chromatid cohesion protein 1,Sister chromatid cohesion protein 1 × 1 (Q12158) Sister chromatid cohesion protein 2 × 1 (Q04002) DNA (34-MER) × 1 DNA (34-MER) × 1 ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MAGNESIUM ION × 2 与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 SMC3_YEAST
Isoform —
PDB实体 2
链与序列区间 作者链 B; PDB构建体 3–229; UniProt 2–228 作者链 B; PDB构建体 230–304; UniProt 997–1071 作者链 B; PDB构建体 305–423; UniProt 1104–1222

Sister chromatid cohesion protein 1,Sister chromatid cohesion protein 1,Sister chromatid cohesion protein 1

Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c)

UniProt Q12158

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白–DNA 异源复合物 蛋白 4 DNA 2 ;Structural maintenance of chromosomes protein 1,Structural maintenance of chromosomes protein 1,Structural maintenance of chromosomes protein 1 ; × 1 (P32908) ;Structural maintenance of chromosomes protein 3,Structural maintenance of chromosomes protein 3,Structural maintenance of chromosomes protein 3 ; × 1 (P47037) Sister chromatid cohesion protein 2 × 1 (Q04002) DNA (34-MER) × 1 DNA (34-MER) × 1 ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MAGNESIUM ION × 2 与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 SCC1_YEAST
Isoform —
PDB实体 3
链与序列区间 作者链 C; PDB构建体 1–37; UniProt 67–103 作者链 C; PDB构建体 38–46; UniProt 502–510 作者链 C; PDB构建体 47–83; UniProt 519–555

Sister chromatid cohesion protein 2

Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c)

UniProt Q04002

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白–DNA 异源复合物 蛋白 4 DNA 2 ;Structural maintenance of chromosomes protein 1,Structural maintenance of chromosomes protein 1,Structural maintenance of chromosomes protein 1 ; × 1 (P32908) ;Structural maintenance of chromosomes protein 3,Structural maintenance of chromosomes protein 3,Structural maintenance of chromosomes protein 3 ; × 1 (P47037) Sister chromatid cohesion protein 1,Sister chromatid cohesion protein 1,Sister chromatid cohesion protein 1 × 1 (Q12158) DNA (34-MER) × 1 DNA (34-MER) × 1 ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MAGNESIUM ION × 2 与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 SCC2_YEAST
Isoform —
PDB实体 4
链与序列区间 作者链 D; PDB构建体 1–1493; UniProt 1–1493

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中;数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护,因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id6zz6
沉积日期 deposition_date2020-08-04
结构标题 titleCryo-EM structure of S.cerevisiae cohesin-Scc2-DNA complex
关键词 keywordsSMC, cohesin, DNA, CELL CYCLE; CELL CYCLE
实验方法 methodELECTRON MICROSCOPY
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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

6zz6__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

6zz6__assembly_1__model_1 | I(q)

10-2 10-1 106 107 108 q (1/Angstrom) I(q)
100 个绘图点;横轴和纵轴均采用对数尺度。

6zz6__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

新版 assembly/model P(r) 尚未计算 此处仅保留位置,不展示旧数据 r (Angstrom) P(r)
P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。
Rg(Guinier)45.88 Å
Rg(电子密度)46.05 Å
总 Rg45.97 Å
原子数16597
残基数1984
排除体积293380 ų
最大 q0.500 Å⁻¹
Assembly Model 结构单元 聚集说明 状态 CRYSOL 操作
1 1 6zz6__assembly_1__model_1 hexameric (6) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (8)

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7. 引用文献 (1)