SAXSdb — 7cru

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein K

Homo sapiens

UniProt P61978

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2）与蛋白拷贝数一致	链 B； UniProt 18–38	未记录	Importin subunit alpha-1 × 1 （P52292） ACT ACETATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；293 K；0.1 M Ammonium Acetate, 0.1 M Bis-Tris pH 5.5, 17% w/v PEG 10000	分辨率 2.80 Å R-free 0.240
2	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2）与蛋白拷贝数一致	链 D； UniProt 18–38	未记录	Importin subunit alpha-1 × 1 （P52292） ACT ACETATE ION × 4 GOL GLYCEROL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；293 K；0.1 M Ammonium Acetate, 0.1 M Bis-Tris pH 5.5, 17% w/v PEG 10000	分辨率 2.80 Å R-free 0.240

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 7CRU	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
1J5K COMPLEX OF THE KH3 DOMAIN OF HNRNP K WITH A SINGLE_STRANDED 10MER DNA OLIGONUCLEOTIDE 提交 2002-05-13	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：dimeric	链 A 379–463（85 aa）片段：KH3 domain, RESIDUES 379-463, NUMBERED 5-89	未记录	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 6.8；308 K；离子强度（mmCIF原始值）50 mM SODIUM PHOSPHATE	分辨率未提供
1KHM C-TERMINAL KH DOMAIN OF HNRNP K (KH3) 提交 1999-01-07	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 375–463（89 aa）片段：C-TERMINAL KH DOMAIN, RESIDUES 379-463 OF FULL LENGTH HNRNP K	突变：G26R	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 5.5；300 K；离子强度（mmCIF原始值）5 mM；压力 1	分辨率未提供
1ZZI Crystal Structure Analysis of the third KH domain of hnRNP K in complex with ssDNA 提交 2005-06-14	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：dimeric	链 A 385–463（79 aa）片段：KH3 domain	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；294 K；PEG 4000, TRIS HCl, MAGNESIUM CHLORIDE, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 294K	分辨率 1.80 Å R-free 0.240
1ZZI Crystal Structure Analysis of the third KH domain of hnRNP K in complex with ssDNA 提交 2005-06-14	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白–DNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：dimeric	链 B 385–463（79 aa）片段：KH3 domain	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；294 K；PEG 4000, TRIS HCl, MAGNESIUM CHLORIDE, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 294K	分辨率 1.80 Å R-free 0.240
1ZZJ Structure of the third KH domain of hnRNP K in complex with 15-mer ssDNA 提交 2005-06-14	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：tetrameric	链 A 385–463（79 aa）片段：KH3 domain 链 B 385–463（79 aa）片段：KH3 domain 链 C 385–463（79 aa）片段：KH3 domain	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；294 K；PEG 8000, SODIUM ACETATE, MES, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 294K	分辨率 2.30 Å R-free 0.283
1ZZK Crystal Structure of the third KH domain of hnRNP K at 0.95A resolution 提交 2005-06-14	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 385–463（79 aa）片段：KH3 domain	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；294 K；ammonium sulphate, PEG 400, Tris-HCl, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 294K	分辨率 0.95 Å R-free 0.127
7RJK Crystal structure of human Bromodomain containing protein 3 (BRD3) in complex with hnRNPK 提交 2021-07-21	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 C 57–66（10 aa）片段：UNP residues 57-66	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.6；292 K；2.0 M ammonium sulfate, 0.1 M sodium citrate tribasic dihydrate, 0.2 M potassium/sodium tartrate tetrahydrate	分辨率 1.85 Å R-free 0.217
7RJK Crystal structure of human Bromodomain containing protein 3 (BRD3) in complex with hnRNPK 提交 2021-07-21	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 D 57–66（10 aa）片段：UNP residues 57-66	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 SO4 SULFATE ION × 2 GOL GLYCEROL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.6；292 K；2.0 M ammonium sulfate, 0.1 M sodium citrate tribasic dihydrate, 0.2 M potassium/sodium tartrate tetrahydrate	分辨率 1.85 Å R-free 0.217
7RJO Crystal structure of human Bromodomain containing protein 4 (BRD4) in complex with hnRNPK 提交 2021-07-21	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 57–66（10 aa）片段：UNP residues 57-66	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	NA SODIUM ION × 1 GOL GLYCEROL × 2 ACT ACETATE ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；292 K；25% w/v PEG3350, 0.2 M ammonium acetate, 0.1 M Bis-Tris	分辨率 1.38 Å R-free 0.198

共 7 个其他 PDB 条目、9 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	HNRPK_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 B； PDB构建体 3–23； UniProt 18–38 作者链 D； PDB构建体 3–23； UniProt 18–38

Importin subunit alpha-1

Homo sapiens

UniProt P52292

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2）与蛋白拷贝数一致	链 A； UniProt 73–529	未记录	Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein K × 1 （P61978） ACT ACETATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；293 K；0.1 M Ammonium Acetate, 0.1 M Bis-Tris pH 5.5, 17% w/v PEG 10000	分辨率 2.80 Å R-free 0.240
2	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2）与蛋白拷贝数一致	链 C； UniProt 73–529	未记录	Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein K × 1 （P61978） ACT ACETATE ION × 4 GOL GLYCEROL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；293 K；0.1 M Ammonium Acetate, 0.1 M Bis-Tris pH 5.5, 17% w/v PEG 10000	分辨率 2.80 Å R-free 0.240

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 7CRU	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
1EFX STRUCTURE OF A COMPLEX BETWEEN THE HUMAN NATURAL KILLER CELL RECEPTOR KIR2DL2 AND A CLASS I MHC LIGAND HLA-CW3 提交 2000-02-10	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric	链 C 204–212（9 aa）片段：RESIDUES 204-212	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；298 K；PEG 20000, calcium chloride, sodium cacodylate, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K	分辨率 3.00 Å R-free 0.294
1QGK STRUCTURE OF IMPORTIN BETA BOUND TO THE IBB DOMAIN OF IMPORTIN ALPHA 提交 1999-04-29	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 11–54（44 aa）片段：IBB DOMAIN	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 6.5；pH 6.5	分辨率 2.50 Å R-free 0.273
1QGR STRUCTURE OF IMPORTIN BETA BOUND TO THE IBB DOMAIN OF IMPORTIN ALPHA (II CRYSTAL FORM, GROWN AT LOW PH) 提交 1999-05-04	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 28–54（27 aa）片段：IBB DOMAIN	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 3.9；pH 3.9	分辨率 2.30 Å R-free 0.285
3FEX Crystal structure of the CBC-importin alpha complex. 提交 2008-12-01	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 C 70–529（460 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；291 K；100 mM KCl, 12% PEG 8000, 100 mM Tris-HCl pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K	分辨率 3.55 Å R-free 0.292
3FEX Crystal structure of the CBC-importin alpha complex. 提交 2008-12-01	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 C 70–529（460 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；291 K；100 mM KCl, 12% PEG 8000, 100 mM Tris-HCl pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K	分辨率 3.55 Å R-free 0.292
3FEY Crystal structure of the CBC-importin alpha complex. 提交 2008-12-01	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 C 70–529（460 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；291 K；100 mM MES, pH 6.0, and 8% PEG 4000 , VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K	分辨率 2.20 Å R-free 0.238
3WPT Crystal structure of closed dimer of human importin-alpha1 (Rch1) 提交 2014-01-17	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 75–497（423 aa）片段：UNP residues 75-497	未记录	PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 11	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；293 K；50MM MES, 100MM AMMONIUM SULFATE, 10MM MGCL, 15-20%(w/v) PEG8000, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K	分辨率 2.63 Å R-free 0.216
3WPT Crystal structure of closed dimer of human importin-alpha1 (Rch1) 提交 2014-01-17	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 75–497（423 aa）片段：UNP residues 75-497	未记录	PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 6	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；293 K；50MM MES, 100MM AMMONIUM SULFATE, 10MM MGCL, 15-20%(w/v) PEG8000, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K	分辨率 2.63 Å R-free 0.216
4E4V The crystal structure of the dimeric human importin alpha 1 at 2.5 angstrom resolution. 提交 2012-03-13	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 70–529（460 aa）片段：Importin alpha 1 lacking IBB domain (UNP residues 70-529)	突变：K486R	GOL GLYCEROL × 8 DTT 2,3-DIHYDROXY-1,4-DITHIOBUTANE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.4；298 K；0.5 CITRATE PH 5.4 10 MM DTT, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K	分辨率 2.53 Å R-free 0.203
4E4V The crystal structure of the dimeric human importin alpha 1 at 2.5 angstrom resolution. 提交 2012-03-13	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 70–529（460 aa）片段：Importin alpha 1 lacking IBB domain (UNP residues 70-529)	突变：K486R	GOL GLYCEROL × 5 DTT 2,3-DIHYDROXY-1,4-DITHIOBUTANE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.4；298 K；0.5 CITRATE PH 5.4 10 MM DTT, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K	分辨率 2.53 Å R-free 0.203
4WV6 Heterodimer of Importin alpha 1 with nuclear localization signal of TAF8 提交 2014-11-04	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 A 60–529（470 aa）片段：UNP residues 60-529	未记录	EDO 1,2-ETHANEDIOL × 12	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.1；281.15 K；HEPES-NaOH, polyethylene glycole 3350, L-proline	分辨率 1.75 Å R-free 0.180
5H43 Structural and mechanistical studies of the nuclear import by Importin-alpha 提交 2016-10-28	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 A 70–497（428 aa）片段：UNP residues 70-497	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293.15 K；3%(v/v) Tacsimate pH5.0, 0.1M Sodium citrate tribasic dehydrate pH5.6, 16%(w/v) PEG 3350	分辨率 2.30 Å R-free 0.243
7N8J Human importin alpha 1 in complex with Bimax2 peptide 提交 2021-06-15	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 76–529（454 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；296 K；0.4 M Ammonium phosphate monobasic	分辨率 3.20 Å R-free 0.244
7N9H Structure of the mammalian importin a1 bound to the TDP-43 NLS 提交 2021-06-17	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 C 70–497（428 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.6；293 K；0.5M sodium citrate, 10 mM mercaptoethanol	分辨率 2.20 Å R-free 0.215
8FZK Dimeric human importin alpha subunit 提交 2023-01-29	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 71–529（459 aa）链 B 71–529（459 aa）	未记录	MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；293 K；14% PEG 8000, 0.2M Magnesium chloride, 0.1M MES	分辨率 2.10 Å R-free 0.247
8FZK Dimeric human importin alpha subunit 提交 2023-01-29	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 C 71–529（459 aa）链 D 71–529（459 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；293 K；14% PEG 8000, 0.2M Magnesium chloride, 0.1M MES	分辨率 2.10 Å R-free 0.247
8GCN CRYO-EM STRUCTURE OF IMPORTIN ALPHA1/BETA HETERODIMER 提交 2023-03-02	构建体不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 11–53（43 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.95 Å
9B4Y Cryo-EM structure of importin alpha-1/beta bound to TDP-43 提交 2024-03-21	构建体不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 11–53（43 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.74 Å
9BFC Cryo-EM structure of importin alpha-1/beta bound to FG repeats 提交 2024-04-17	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：hexameric	链 I 1–53（53 aa）	未记录	PHE PHENYLALANINE × 2 GLY GLYCINE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.20 Å
9N86 Cryo-EM structure of human importin beta:importin alpha (IBB) complex 提交 2025-02-07	构建体不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 1–53（53 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.30 Å

共 16 个其他 PDB 条目、20 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	IMA1_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–457； UniProt 73–529 作者链 C； PDB构建体 1–457； UniProt 73–529

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	7cru
沉积日期 deposition_date	2020-08-14
结构标题 title	hnRNPK NLS in complex with Importin alpha 1 (KPNA2)
关键词 keywords	importin alpha, hnRNPK, NLS, complex, Transport PROTEIN; TRANSPORT PROTEIN
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier	39.50 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron	39.19 Å
零角强度 I(0) i0	139357000.00
分子量 molecular_weight	97509.0 kDa
排除体积 excluded_volume	123120 Å³
包络体积 envelope_volume	168170 Å³
水化壳体积 shell_volume	37291 Å³
包络直径 envelope_diameter	125.4 Å
壳层 Rg shell_rg	42.96 Å
包络 Rg envelope_rg	37.73 Å
形状 Rg shape_rg	39.19 Å
总 Rg total_rg	39.42 Å
总原子数 total_atoms	6862
残基数 n_residues	893
球谐函数阶数 n_harmonics	20
q 范围 q_range	— – 0.5000 Å⁻¹
数据点数 n_points	101
壳层类型 shell_type	directional
溶剂电子密度 solvent_density	0.3340 e/Å³
壳层衬度 contrast_shell	0.0300 e/Å³
CRYSOL 版本 crysol_version	4.1.3

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4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax	123.4 Å
Rg (实空间) rg_real	39.62 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error	1.09 Å
I(0) (实空间) i0_real	1.3940e+08
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error	2.3860e+06
Rg (倒空间) rg_reciprocal	39.56 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal	139300000.0000
解质量估计 total_estimate	0.8455
解质量评级 solution_quality	GOOD a GOOD solution
P(r) 峰数 n_peaks	1
主峰位置 r_peak_primary	49.4 Å
偏度 Skewness skewness	0.225
峰度 Kurtosis kurtosis	-0.751
角度范围 angular_range	— – 0.2000 Å⁻¹
当前正则化参数 α current_alpha	0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha	9474000.0000
实空间数据点数 n_real_points	41
GNOM 版本 gnom_version	4.1.3
质量判据 quality_criteria	AN1: 0.000; Oscil: 0.945; Stabil: 1.000; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.875; Smooth: 0.278

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5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

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6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (5)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein K
分子量 formula_weight	2877.2 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	B,D
原子数 atom_count	6959

WMEFGKRPAEDMEEEQAFKRSRN

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	Human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	Importin subunit alpha-1
分子量 formula_weight	49520.2 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A,C

TVNWSVDDIVKGINSSNVENQLQATQAARKLLSREKQPPIDNIIRAGLIPKFVSFLGRTDCSPIQFESAWALTNIASGTSEQTKAVVDGGAIPAFISLLASPHAHISEQAVWALGNIAGDGSVFRDLVIKYGAVDPLLALLAVPDMSSLACGYLRNLTWTLSNLCRNKNPAPPIDAVEQILPTLVRLLHHDDPEVLADTCWAISYLTDGPNERIGMVVKTGVVPQLVKLLGASELPIVTPALRAIGNIVTGTDEQTQVVIDAGALAVFPSLLTNPKTNIQKEATWTMSNITAGRQDQIQQVVNHGLVPFLVSVLSKADFKTQKEAVWAVTNYTSGGTVEQIVYLVHCGIIEPLMNLLTAKDTKIILVILDAISNIFQAAEKLGETEKLSIMIEECGGLDKIEALQNHENESVYKASLSLIEKYFSVEEEEDQNVVPETTSEGYTFQVQDGAPGTFNF

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	Human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 3 Entity 3 non-polymer

描述 description	ACETATE ION
分子量 formula_weight	59.0 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	5

实体 4 Entity 4 non-polymer

描述 description	GLYCEROL
分子量 formula_weight	92.1 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

实体 5 Entity 5 water

描述 description	water
分子量 formula_weight	18.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	97

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7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 2 domains

CATH v4.4 (2 domains)

结构域编号 domain_id	7cruA01
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	25 — Alpha Horseshoe
拓扑 Topology topology	10 — Leucine-rich Repeat Variant
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Leucine-rich Repeat Variant

结构域编号 domain_id	7cruC01
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	25 — Alpha Horseshoe
拓扑 Topology topology	10 — Leucine-rich Repeat Variant
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Leucine-rich Repeat Variant

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8. 引用文献 (1)

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晶胞边长 a length_a	89.792 Å
晶胞边长 b length_b	83.317 Å
晶胞边长 c length_c	101.372 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	98.24 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	4

空间群 space_group	P 1 21 1
空间群编号 int_tables_number	4
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	2.800 Å
最低分辨率 resolution_low	46.680 Å
R 因子 r_factor	0.2150
R_work r_work	0.2137
R_free r_free	0.2405

fit	/app/data/saxs_computation/cr/7cru/7cru.fit
pddf	/app/data/pr_computation/cr/7cru/7cru.pr.out
profile	/app/data/saxs_computation/cr/7cru/7cru.dat

hnRNPK NLS in complex with Importin alpha 1 (KPNA2)

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein K

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Importin subunit alpha-1

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (5)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 non-polymer

实体 4 Entity 4 non-polymer

实体 5 Entity 5 water

7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 2 domains

CATH v4.4 (2 domains)

8. 引用文献 (1)

9. 文件与曲线 (10)

Files (7)

Curves (3)