SAXSdb — 7ffe

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Capsid protein

Venezuelan equine encephalitis virus (strain TC-83)

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白同源多聚体	同源多聚体	蛋白 16	无其他共同聚合物	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	POLS_EEVV8
Isoform	—
PDB实体	1, 2, 3, 4
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–275； UniProt 1–275 作者链 F； PDB构建体 1–275； UniProt 1–275 作者链 K； PDB构建体 1–275； UniProt 1–275 作者链 S； PDB构建体 1–275； UniProt 1–275 作者链 B； PDB构建体 1–442； UniProt 813–1254 作者链 C； PDB构建体 1–442； UniProt 813–1254 作者链 G； PDB构建体 1–442； UniProt 813–1254 作者链 O； PDB构建体 1–442； UniProt 813–1254 作者链 I； PDB构建体 1–59； UniProt 276–334 作者链 L； PDB构建体 1–59； UniProt 276–334 作者链 P； PDB构建体 1–59； UniProt 276–334 作者链 T； PDB构建体 1–59； UniProt 276–334 作者链 J； PDB构建体 1–423； UniProt 335–757 作者链 N； PDB构建体 1–423； UniProt 335–757 作者链 Q； PDB构建体 1–423； UniProt 335–757 作者链 R； PDB构建体 1–423； UniProt 335–757

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	7ffe
沉积日期 deposition_date	2021-07-23
结构标题 title	Cryo-EM structure of VEEV VLP
关键词 keywords	Virus, Receptor, Complex, VIRUS LIKE PARTICLE; VIRUS LIKE PARTICLE
实验方法 method	ELECTRON MICROSCOPY

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

7ffe__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

7ffe__assembly_1__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

7ffe__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	67.37 Å
Rg（电子密度）	66.95 Å
总 Rg	67.30 Å
原子数	33063
残基数	4275
排除体积	588160 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`7ffe__assembly_1__model_1`	hexadecameric （16）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (4)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	Capsid protein
分子量 formula_weight	30980.8 kDa
EC 编号 ec_number	3.4.21.90
突变 mutation	K64N
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	4

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A,F,K,S
原子数 atom_count	33063

MFPFQPMYPMQPMPYRNPFAAPRRPWFPRTDPFLAMQVQELTRSMANLTFKQRRDAPPEGPSANKPKKEASQKQKGGGQGKKKKNQGKKKAKTGPPNPKAQNGNKKKTNKKPGKRQRMVMKLESDKTFPIMLEGKINGYACVVGGKLFRPMHVEGKIDNDVLAALKTKKASKYDLEYADVPQNMRADTFKYTHEKPQGYYSWHHGAVQYENGRFTVPKGVGAKGDSGRPILDNQGRVVAIVLGGVNEGSRTALSVVMWNEKGVTVKYTPENCEQW

来源 Source

来源生物 organism	Venezuelan equine encephalitis virus (strain TC-83)
通用名 common_name	VEEV
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	11037
宿主生物 host_organism	Homo sapiens

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	Spike glycoprotein E1
分子量 formula_weight	47952.1 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	4

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	B,C,G,O

YEHATTMPSQAGISYNTIVNRAGYAPLPISITPTKIKLIPTVNLEYVTCHYKTGMDSPAIKCCGSQECTPTYRPDEQCKVFTGVYPFMWGGAYCFCDTENTQVSKAYVMKSDDCLADHAEAYKAHTASVQAFLNITVGEHSIVTTVYVNGETPVNFNGVKITAGPLSTAWTPFDRKIVQYAGEIYNYDFPEYGAGQPGAFGDIQSRTVSSSDLYANTNLVLQRPKAGAIHVPYTQAPSGFEQWKKDKAPSLKFTAPFGCEIYTNPIRAENCAVGSIPLAFDIPDALFTRVSETPTLSAAECTLNECVYSSDFGGIATVKYSASKSGKCAVHVPSGTATLKEAAVELTEQGSATIHFSTANIHPEFRLQICTSYVTCKGDCHPPKDHIVTHPQYHAQTFTAAVSKTAWTWLTSLLGGSAVIIIIGLVLATIVAMYVLTNQKHN

来源 Source

来源生物 organism	Venezuelan equine encephalitis virus (strain TC-83)
通用名 common_name	VEEV
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	11037
宿主生物 host_organism	Homo sapiens

实体 3 Entity 3 polymer

描述 description	assembly protein E3
分子量 formula_weight	6488.6 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	4

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	I,L,P,T

SLVTTMCLLANVTFPCAQPPICYDRKPAETLAMLSVNVDNPGYDELLEAAVKCPGRKRR

来源 Source

来源生物 organism	Venezuelan equine encephalitis virus (strain TC-83)
通用名 common_name	VEEV
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	11037
宿主生物 host_organism	Homo sapiens

实体 4 Entity 4 polymer

描述 description	Spike glycoprotein E2
分子量 formula_weight	47113.7 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	4

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	J,N,Q,R

STEELFNEYKLTRPYMARCIRCAVGSCHSPIAIEAVKSDGHDGYVRLQTSSQYGLDSSGNLKGRTMRYDMHGTIKEIPLHQVSLYTSRPCHIVDGHGYFLLARCPAGDSITMEFKKDSVRHSCSVPYEVKFNPVGRELYTHPPEHGVEQACQVYAHDAQNRGAYVEMHLPGSEVDSSLVSLSGSSVTVTPPDGTSALVECECGGTKISETINKTKQFSQCTKKEQCRAYRLQNDKWVYNSDKLPKAAGATLKGKLHVPFLLADGKCTVPLAPEPMITFGFRSVSLKLHPKNPTYLITRQLADEPHYTHELISEPAVRNFTVTEKGWEFVWGNHPPKRFWAQETAPGNPHGLPHEVITHYYHRYPMSTILGLSICAAIATVSVAASTWLFCRSRVACLTPYRLTPNARIPFCLAVLCCARTARA

来源 Source

来源生物 organism	Venezuelan equine encephalitis virus (strain TC-83)
通用名 common_name	VEEV
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	11037
宿主生物 host_organism	Homo sapiens

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分辨率 resolution	3.50 Å
分辨率测定方法 resolution_method	—
颗粒数 num_particles	344824

Cryo-EM structure of VEEV VLP

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Capsid protein

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

7ffe__assembly_1__model_1

7ffe__assembly_1__model_1 | I(q)

7ffe__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

冷冻电镜 EM 3D

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (4)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 4 Entity 4 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

7. 引用文献 (1)

Cryo-EM structure of VEEV VLP

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Capsid protein

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

7ffe__assembly_1__model_1

7ffe__assembly_1__model_1 | I(q)

7ffe__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

冷冻电镜 EM 3D

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (4)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 4 Entity 4 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

7. 引用文献 (1)