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7hil

Group deposition of Chikungunya virus nsP3 macrodomain in complex with inhibitors from the READDI-AC AViDD center -- Crystal structure of Chikungunya virus nsP3 macrodomain in complex with RA-0188488-01 (CHIKV_MacB-x2129)

Method: X-RAY DIFFRACTION
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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Non-structural protein 3

Chikungunya virus

UniProt Q8JUX6

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白单体 单体 蛋白 1 DIMETHYL SULFOXIDE × 7 2-AMINO-2-HYDROXYMETHYL-PROPANE-1,3-DIOL × 1 CHLORIDE ION × 3 1-ethyl-N-methyl-6-oxo-N-[(1,3-thiazol-2-yl)methyl]-1,6-dihydropyridazine-3-carboxamide × 1 water × 1 与蛋白数一致
2 蛋白单体 单体 蛋白 1 DIMETHYL SULFOXIDE × 3 CHLORIDE ION × 2 1-ethyl-N-methyl-6-oxo-N-[(1,3-thiazol-2-yl)methyl]-1,6-dihydropyridazine-3-carboxamide × 1 water × 1 与蛋白数一致
3 蛋白单体 单体 蛋白 1 DIMETHYL SULFOXIDE × 4 CHLORIDE ION × 2 1-ethyl-N-methyl-6-oxo-N-[(1,3-thiazol-2-yl)methyl]-1,6-dihydropyridazine-3-carboxamide × 1 water × 1 与蛋白数一致
4 蛋白单体 单体 蛋白 1 DIMETHYL SULFOXIDE × 4 2-AMINO-2-HYDROXYMETHYL-PROPANE-1,3-DIOL × 1 CHLORIDE ION × 1 1-ethyl-N-methyl-6-oxo-N-[(1,3-thiazol-2-yl)methyl]-1,6-dihydropyridazine-3-carboxamide × 1 water × 1 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

单体
3gpg 3gpg 3gpg 3gpg 3gpo 3gpo 3gpo 3gpo 3gpq 3gpq 4tu0 4tu0

共 585 个 assembly，这里只显示前 12 个

同源二聚体

暂无

同源四聚体

暂无

其他同源多聚体
6z0u 6z0v 7dop 7fgg 7fgh 7x01 8aov 8aow 8aox 8apx 8axv 8jce

共 14 个 assembly，这里只显示前 12 个

异源或核酸复合物
3gpq 3gpq 4tu0 4tu0 7fgi 7y38

共 6 个 assembly

查看构建体与数据证据
UniProt名称 POLN_CHIKS
Isoform —
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A； PDB构建体 4–163； UniProt 1334–1493 作者链 B； PDB构建体 4–163； UniProt 1334–1493 作者链 C； PDB构建体 4–163； UniProt 1334–1493 作者链 D； PDB构建体 4–163； UniProt 1334–1493

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id7hil
沉积日期 deposition_date2024-10-04
结构标题 titleGroup deposition of Chikungunya virus nsP3 macrodomain in complex with inhibitors from the READDI-AC AViDD center -- Crystal structure of Chikungunya virus nsP3 macrodomain in complex with RA-0188488-01 (CHIKV_MacB-x2129)
关键词 keywords;Diamond Light Source, I04-1, READDI, AViDD, Chikungunya Virus, crystallographic fragment screening, PanDDA, XChemExplorer, VIRAL PROTEIN ;; VIRAL PROTEIN
实验方法 methodX-RAY DIFFRACTION
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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

7hil__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

7hil__assembly_1__model_1 | I(q)

10-2 10-1 105 106 q (1/Angstrom) I(q)
100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

7hil__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

新版 assembly/model P(r) 尚未计算 此处仅保留位置，不展示旧数据 r (Angstrom) P(r)
P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。
Rg（Guinier）16.21 Å
Rg（电子密度）14.90 Å
总 Rg16.15 Å
原子数1299
残基数163
排除体积23188 ų
最大 q0.500 Å⁻¹
Assembly Model 结构单元 聚集说明 状态 CRYSOL 操作
1 1 7hil__assembly_1__model_1 monomeric （1） 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
2 1 7hil__assembly_2__model_1 monomeric （1） 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
3 1 7hil__assembly_3__model_1 monomeric （1） 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
4 1 7hil__assembly_4__model_1 monomeric （1） 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (6)

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7. 引用文献 (1)