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5C8H
Crystal structure of ORC2 C-terminal domain
提交 2015-06-25
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构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
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链 A
458–577(120 aa)
片段:C-terminal domain (UNP residues 458-577)
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未记录
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UNX UNKNOWN LIGAND × 3
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293 K;20% PEG-3350, 0.2 M magnesium formate
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分辨率 2.01 Å
R-free 0.257
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5UJ8
Human Origin Recognition Complex subunits 2 and 3
提交 2017-01-17
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构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
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链 G
231–577(347 aa)
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未记录
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未记录非水小分子
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;290 K;9.5% PEG20000
50mM tri-Sodium-citrate
60mM Citric Acid
10mg/ml HO23
Ratio 1:1
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分辨率 6.00 Å
R-free 0.368
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5UJ8
Human Origin Recognition Complex subunits 2 and 3
提交 2017-01-17
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构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 2
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
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链 E
231–577(347 aa)
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未记录
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未记录非水小分子
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;290 K;9.5% PEG20000
50mM tri-Sodium-citrate
60mM Citric Acid
10mg/ml HO23
Ratio 1:1
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分辨率 6.00 Å
R-free 0.368
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5UJ8
Human Origin Recognition Complex subunits 2 and 3
提交 2017-01-17
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构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 3
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
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链 H
231–577(347 aa)
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未记录
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未记录非水小分子
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;290 K;9.5% PEG20000
50mM tri-Sodium-citrate
60mM Citric Acid
10mg/ml HO23
Ratio 1:1
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分辨率 6.00 Å
R-free 0.368
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5UJ8
Human Origin Recognition Complex subunits 2 and 3
提交 2017-01-17
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构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 4
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
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链 F
231–577(347 aa)
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未记录
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未记录非水小分子
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;290 K;9.5% PEG20000
50mM tri-Sodium-citrate
60mM Citric Acid
10mg/ml HO23
Ratio 1:1
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分辨率 6.00 Å
R-free 0.368
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5UJ8
Human Origin Recognition Complex subunits 2 and 3
提交 2017-01-17
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构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 5
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 4
PDB 声明:tetrameric
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链 G
231–577(347 aa)
链 H
231–577(347 aa)
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未记录
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未记录非水小分子
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;290 K;9.5% PEG20000
50mM tri-Sodium-citrate
60mM Citric Acid
10mg/ml HO23
Ratio 1:1
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分辨率 6.00 Å
R-free 0.368
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5UJ8
Human Origin Recognition Complex subunits 2 and 3
提交 2017-01-17
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构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 6
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 4
PDB 声明:tetrameric
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链 E
231–577(347 aa)
链 F
231–577(347 aa)
|
未记录
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未记录非水小分子
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;290 K;9.5% PEG20000
50mM tri-Sodium-citrate
60mM Citric Acid
10mg/ml HO23
Ratio 1:1
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分辨率 6.00 Å
R-free 0.368
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5UJM
Structure of the active form of human Origin Recognition Complex and its ATPase motor module
提交 2017-01-18
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构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 5
PDB 声明:pentameric
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链 B
231–577(347 aa)
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未记录
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ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3
MG MAGNESIUM ION × 2
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ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
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分辨率 18.00 Å
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7CTE
Human Origin Recognition Complex, ORC2-5
提交 2020-08-18
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聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 4
PDB 声明:tetrameric
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链 B
1–577(577 aa)
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未记录
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ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2
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ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
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分辨率 3.80 Å
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7CTF
Human origin recognition complex 1-5 State II
提交 2020-08-18
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聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 5
PDB 声明:pentameric
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链 B
1–577(577 aa)
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未记录
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ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2
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ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
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分辨率 4.80 Å
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7CTG
Human Origin Recognition Complex, ORC1-5 State I
提交 2020-08-18
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聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 5
PDB 声明:pentameric
|
链 B
1–577(577 aa)
|
未记录
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ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2
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ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
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分辨率 5.00 Å
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7JPO
ORC-O1AAA: Human Origin Recognition Complex (ORC) with dynamic/unresolved ORC2 WH
提交 2020-08-09
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聚集状态不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 5
PDB 声明:pentameric
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链 B
1–577(577 aa)
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未记录
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ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3
MG MAGNESIUM ION × 3
K POTASSIUM ION × 1
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ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
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分辨率 3.20 Å
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7JPP
ORC-O2WH: Human Origin Recognition Complex (ORC) with dynamic/unresolved ORC1 AAA+ domain
提交 2020-08-09
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聚集状态不同
配体/离子不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 5
PDB 声明:pentameric
|
链 B
1–577(577 aa)
|
未记录
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ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2
MG MAGNESIUM ION × 2
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ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
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分辨率 3.70 Å
|
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7JPQ
ORC-O2-5: Human Origin Recognition Complex (ORC) with subunits 2,3,4,5
提交 2020-08-09
|
聚集状态不同
配体/离子不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 4
PDB 声明:tetrameric
|
链 B
1–577(577 aa)
|
未记录
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ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2
MG MAGNESIUM ION × 2
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ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.50 Å
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7JPR
ORC-OPEN: Human Origin Recognition Complex (ORC) in an open conformation
提交 2020-08-09
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聚集状态不同
配体/离子不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 5
PDB 声明:pentameric
|
链 B
1–577(577 aa)
|
未记录
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ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3
MG MAGNESIUM ION × 3
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ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
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分辨率 4.00 Å
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8RWV
Human OCCM DNA licensing intermediate
提交 2024-02-05
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聚集状态不同
配体/离子不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白–DNA
异源复合物;蛋白 × 12
PDB 声明:14-meric
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链 B
1–577(577 aa)
|
未记录
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未记录非水小分子
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ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
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分辨率 6.68 Å
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8S0C
H. sapiens ORC1-5 bound to double stranded DNA as part of the MCM-ORC complex
提交 2024-02-13
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配体/离子不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白–DNA
异源复合物;蛋白 × 5
PDB 声明:heptameric
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链 B
1–577(577 aa)
|
未记录
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AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 2
MG MAGNESIUM ION × 2
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ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
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分辨率 4.00 Å
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8S0D
H. sapiens MCM bound to double stranded DNA and ORC1-6
提交 2024-02-13
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聚集状态不同
配体/离子不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白–DNA
异源复合物;蛋白 × 12
PDB 声明:tetradecameric
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链 B
1–577(577 aa)
|
未记录
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AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 5
MG MAGNESIUM ION × 8
ZN ZINC ION × 5
ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 3
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ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
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分辨率 3.60 Å
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8S0E
H. sapiens OCCM bound to double stranded DNA
提交 2024-02-13
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聚集状态不同
配体/离子不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白–DNA
异源复合物;蛋白 × 13
PDB 声明:pentadecameric
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链 B
1–577(577 aa)
|
未记录
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AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 5
MG MAGNESIUM ION × 5
ZN ZINC ION × 1
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ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
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分辨率 3.80 Å
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8S0F
H. sapiens OC1M bound to double stranded DNA
提交 2024-02-13
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聚集状态不同
配体/离子不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–DNA
异源复合物;蛋白 × 12
PDB 声明:tetradecameric
|
链 B
1–577(577 aa)
|
未记录
|
MG MAGNESIUM ION × 5
ZN ZINC ION × 1
AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 5
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.10 Å
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