7nhp

Structure of PSII-I (PSII with Psb27, Psb28, and Psb34)

Method: ELECTRON MICROSCOPY

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Photosystem II protein D1 1

物种未注明

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 18	Photosystem II CP47 reaction center protein × 1 （Q8DIQ1） Photosystem II CP43 reaction center protein × 1 （Q8DIF8） Photosystem II D2 protein × 1 （Q8CM25） Cytochrome b559 subunit alpha × 1 （Q8DIP0） Cytochrome b559 subunit beta × 1 （Q8DIN9） Photosystem II reaction center protein H × 1 （Q8DJ43） Photosystem II reaction center protein I × 1 （Q8DJZ6） Photosystem II reaction center protein K × 1 （Q9F1K9） Photosystem II reaction center protein L × 1 （Q8DIN8） Photosystem II reaction center protein M × 1 （Q8DHA7） Photosystem II reaction center protein T × 1 （Q8DIQ0） Photosystem II reaction center X protein × 1 （Q9F1R6） Photosystem II reaction center protein Ycf12 × 1 （Q8DJI1） Photosystem II reaction center protein Z × 1 （Q8DHJ2） Photosystem II lipoprotein Psb27 × 1 （Q8DG60） Photosystem II reaction center Psb28 protein × 1 （Q8DLJ8） Tsl0063 protein × 1 （Q8DMP8） MANGANESE (II) ION × 1 CHLORIDE ION × 1 PHEOPHYTIN A × 2 CHLOROPHYLL A × 35 BETA-CAROTENE × 10 1,2-DIPALMITOYL-PHOSPHATIDYL-GLYCEROLE × 1 1,2-DISTEAROYL-MONOGALACTOSYL-DIGLYCERIDE × 7 FE (III) ION × 1 ;2,3-DIMETHYL-5-(3,7,11,15,19,23,27,31,35-NONAMETHYL-2,6,10,14,18,22,26,30,34-HEXATRIACONTANONAENYL-2,5-CYCLOHEXADIENE-1,4-DIONE-2,3-DIMETHYL-5-SOLANESYL-1,4-BENZOQUINONE ; × 1 PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 1	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	PSBA1_THEEB
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–360； UniProt 1–360

Photosystem II CP47 reaction center protein

物种未注明

UniProt Q8DIQ1

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 18	Photosystem II protein D1 1 × 1 （P0A444） Photosystem II CP43 reaction center protein × 1 （Q8DIF8） Photosystem II D2 protein × 1 （Q8CM25） Cytochrome b559 subunit alpha × 1 （Q8DIP0） Cytochrome b559 subunit beta × 1 （Q8DIN9） Photosystem II reaction center protein H × 1 （Q8DJ43） Photosystem II reaction center protein I × 1 （Q8DJZ6） Photosystem II reaction center protein K × 1 （Q9F1K9） Photosystem II reaction center protein L × 1 （Q8DIN8） Photosystem II reaction center protein M × 1 （Q8DHA7） Photosystem II reaction center protein T × 1 （Q8DIQ0） Photosystem II reaction center X protein × 1 （Q9F1R6） Photosystem II reaction center protein Ycf12 × 1 （Q8DJI1） Photosystem II reaction center protein Z × 1 （Q8DHJ2） Photosystem II lipoprotein Psb27 × 1 （Q8DG60） Photosystem II reaction center Psb28 protein × 1 （Q8DLJ8） Tsl0063 protein × 1 （Q8DMP8） MANGANESE (II) ION × 1 CHLORIDE ION × 1 PHEOPHYTIN A × 2 CHLOROPHYLL A × 35 BETA-CAROTENE × 10 1,2-DIPALMITOYL-PHOSPHATIDYL-GLYCEROLE × 1 1,2-DISTEAROYL-MONOGALACTOSYL-DIGLYCERIDE × 7 FE (III) ION × 1 ;2,3-DIMETHYL-5-(3,7,11,15,19,23,27,31,35-NONAMETHYL-2,6,10,14,18,22,26,30,34-HEXATRIACONTANONAENYL-2,5-CYCLOHEXADIENE-1,4-DIONE-2,3-DIMETHYL-5-SOLANESYL-1,4-BENZOQUINONE ; × 1 PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 1	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	PSBB_THEEB
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 B； PDB构建体 1–510； UniProt 1–510

Photosystem II CP43 reaction center protein

物种未注明

UniProt Q8DIF8

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 18	Photosystem II protein D1 1 × 1 （P0A444） Photosystem II CP47 reaction center protein × 1 （Q8DIQ1） Photosystem II D2 protein × 1 （Q8CM25） Cytochrome b559 subunit alpha × 1 （Q8DIP0） Cytochrome b559 subunit beta × 1 （Q8DIN9） Photosystem II reaction center protein H × 1 （Q8DJ43） Photosystem II reaction center protein I × 1 （Q8DJZ6） Photosystem II reaction center protein K × 1 （Q9F1K9） Photosystem II reaction center protein L × 1 （Q8DIN8） Photosystem II reaction center protein M × 1 （Q8DHA7） Photosystem II reaction center protein T × 1 （Q8DIQ0） Photosystem II reaction center X protein × 1 （Q9F1R6） Photosystem II reaction center protein Ycf12 × 1 （Q8DJI1） Photosystem II reaction center protein Z × 1 （Q8DHJ2） Photosystem II lipoprotein Psb27 × 1 （Q8DG60） Photosystem II reaction center Psb28 protein × 1 （Q8DLJ8） Tsl0063 protein × 1 （Q8DMP8） MANGANESE (II) ION × 1 CHLORIDE ION × 1 PHEOPHYTIN A × 2 CHLOROPHYLL A × 35 BETA-CAROTENE × 10 1,2-DIPALMITOYL-PHOSPHATIDYL-GLYCEROLE × 1 1,2-DISTEAROYL-MONOGALACTOSYL-DIGLYCERIDE × 7 FE (III) ION × 1 ;2,3-DIMETHYL-5-(3,7,11,15,19,23,27,31,35-NONAMETHYL-2,6,10,14,18,22,26,30,34-HEXATRIACONTANONAENYL-2,5-CYCLOHEXADIENE-1,4-DIONE-2,3-DIMETHYL-5-SOLANESYL-1,4-BENZOQUINONE ; × 1 PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 1	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	PSBC_THEEB
Isoform	—
PDB实体	3
链与序列区间	作者链 C； PDB构建体 1–461； UniProt 1–461

Photosystem II D2 protein

物种未注明

UniProt Q8CM25

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 18	Photosystem II protein D1 1 × 1 （P0A444） Photosystem II CP47 reaction center protein × 1 （Q8DIQ1） Photosystem II CP43 reaction center protein × 1 （Q8DIF8） Cytochrome b559 subunit alpha × 1 （Q8DIP0） Cytochrome b559 subunit beta × 1 （Q8DIN9） Photosystem II reaction center protein H × 1 （Q8DJ43） Photosystem II reaction center protein I × 1 （Q8DJZ6） Photosystem II reaction center protein K × 1 （Q9F1K9） Photosystem II reaction center protein L × 1 （Q8DIN8） Photosystem II reaction center protein M × 1 （Q8DHA7） Photosystem II reaction center protein T × 1 （Q8DIQ0） Photosystem II reaction center X protein × 1 （Q9F1R6） Photosystem II reaction center protein Ycf12 × 1 （Q8DJI1） Photosystem II reaction center protein Z × 1 （Q8DHJ2） Photosystem II lipoprotein Psb27 × 1 （Q8DG60） Photosystem II reaction center Psb28 protein × 1 （Q8DLJ8） Tsl0063 protein × 1 （Q8DMP8） MANGANESE (II) ION × 1 CHLORIDE ION × 1 PHEOPHYTIN A × 2 CHLOROPHYLL A × 35 BETA-CAROTENE × 10 1,2-DIPALMITOYL-PHOSPHATIDYL-GLYCEROLE × 1 1,2-DISTEAROYL-MONOGALACTOSYL-DIGLYCERIDE × 7 FE (III) ION × 1 ;2,3-DIMETHYL-5-(3,7,11,15,19,23,27,31,35-NONAMETHYL-2,6,10,14,18,22,26,30,34-HEXATRIACONTANONAENYL-2,5-CYCLOHEXADIENE-1,4-DIONE-2,3-DIMETHYL-5-SOLANESYL-1,4-BENZOQUINONE ; × 1 PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 1	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	PSBD_THEEB
Isoform	—
PDB实体	4
链与序列区间	作者链 D； PDB构建体 1–352； UniProt 1–352

Cytochrome b559 subunit alpha

物种未注明

UniProt Q8DIP0

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 18	Photosystem II protein D1 1 × 1 （P0A444） Photosystem II CP47 reaction center protein × 1 （Q8DIQ1） Photosystem II CP43 reaction center protein × 1 （Q8DIF8） Photosystem II D2 protein × 1 （Q8CM25） Cytochrome b559 subunit beta × 1 （Q8DIN9） Photosystem II reaction center protein H × 1 （Q8DJ43） Photosystem II reaction center protein I × 1 （Q8DJZ6） Photosystem II reaction center protein K × 1 （Q9F1K9） Photosystem II reaction center protein L × 1 （Q8DIN8） Photosystem II reaction center protein M × 1 （Q8DHA7） Photosystem II reaction center protein T × 1 （Q8DIQ0） Photosystem II reaction center X protein × 1 （Q9F1R6） Photosystem II reaction center protein Ycf12 × 1 （Q8DJI1） Photosystem II reaction center protein Z × 1 （Q8DHJ2） Photosystem II lipoprotein Psb27 × 1 （Q8DG60） Photosystem II reaction center Psb28 protein × 1 （Q8DLJ8） Tsl0063 protein × 1 （Q8DMP8） MANGANESE (II) ION × 1 CHLORIDE ION × 1 PHEOPHYTIN A × 2 CHLOROPHYLL A × 35 BETA-CAROTENE × 10 1,2-DIPALMITOYL-PHOSPHATIDYL-GLYCEROLE × 1 1,2-DISTEAROYL-MONOGALACTOSYL-DIGLYCERIDE × 7 FE (III) ION × 1 ;2,3-DIMETHYL-5-(3,7,11,15,19,23,27,31,35-NONAMETHYL-2,6,10,14,18,22,26,30,34-HEXATRIACONTANONAENYL-2,5-CYCLOHEXADIENE-1,4-DIONE-2,3-DIMETHYL-5-SOLANESYL-1,4-BENZOQUINONE ; × 1 PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 1	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	PSBE_THEEB
Isoform	—
PDB实体	5
链与序列区间	作者链 E； PDB构建体 1–84； UniProt 1–84

Cytochrome b559 subunit beta

物种未注明

UniProt Q8DIN9

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 18	Photosystem II protein D1 1 × 1 （P0A444） Photosystem II CP47 reaction center protein × 1 （Q8DIQ1） Photosystem II CP43 reaction center protein × 1 （Q8DIF8） Photosystem II D2 protein × 1 （Q8CM25） Cytochrome b559 subunit alpha × 1 （Q8DIP0） Photosystem II reaction center protein H × 1 （Q8DJ43） Photosystem II reaction center protein I × 1 （Q8DJZ6） Photosystem II reaction center protein K × 1 （Q9F1K9） Photosystem II reaction center protein L × 1 （Q8DIN8） Photosystem II reaction center protein M × 1 （Q8DHA7） Photosystem II reaction center protein T × 1 （Q8DIQ0） Photosystem II reaction center X protein × 1 （Q9F1R6） Photosystem II reaction center protein Ycf12 × 1 （Q8DJI1） Photosystem II reaction center protein Z × 1 （Q8DHJ2） Photosystem II lipoprotein Psb27 × 1 （Q8DG60） Photosystem II reaction center Psb28 protein × 1 （Q8DLJ8） Tsl0063 protein × 1 （Q8DMP8） MANGANESE (II) ION × 1 CHLORIDE ION × 1 PHEOPHYTIN A × 2 CHLOROPHYLL A × 35 BETA-CAROTENE × 10 1,2-DIPALMITOYL-PHOSPHATIDYL-GLYCEROLE × 1 1,2-DISTEAROYL-MONOGALACTOSYL-DIGLYCERIDE × 7 FE (III) ION × 1 ;2,3-DIMETHYL-5-(3,7,11,15,19,23,27,31,35-NONAMETHYL-2,6,10,14,18,22,26,30,34-HEXATRIACONTANONAENYL-2,5-CYCLOHEXADIENE-1,4-DIONE-2,3-DIMETHYL-5-SOLANESYL-1,4-BENZOQUINONE ; × 1 PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 1	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	PSBF_THEEB
Isoform	—
PDB实体	6
链与序列区间	作者链 F； PDB构建体 1–45； UniProt 1–45

Photosystem II reaction center protein H

物种未注明

UniProt Q8DJ43

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 18	Photosystem II protein D1 1 × 1 （P0A444） Photosystem II CP47 reaction center protein × 1 （Q8DIQ1） Photosystem II CP43 reaction center protein × 1 （Q8DIF8） Photosystem II D2 protein × 1 （Q8CM25） Cytochrome b559 subunit alpha × 1 （Q8DIP0） Cytochrome b559 subunit beta × 1 （Q8DIN9） Photosystem II reaction center protein I × 1 （Q8DJZ6） Photosystem II reaction center protein K × 1 （Q9F1K9） Photosystem II reaction center protein L × 1 （Q8DIN8） Photosystem II reaction center protein M × 1 （Q8DHA7） Photosystem II reaction center protein T × 1 （Q8DIQ0） Photosystem II reaction center X protein × 1 （Q9F1R6） Photosystem II reaction center protein Ycf12 × 1 （Q8DJI1） Photosystem II reaction center protein Z × 1 （Q8DHJ2） Photosystem II lipoprotein Psb27 × 1 （Q8DG60） Photosystem II reaction center Psb28 protein × 1 （Q8DLJ8） Tsl0063 protein × 1 （Q8DMP8） MANGANESE (II) ION × 1 CHLORIDE ION × 1 PHEOPHYTIN A × 2 CHLOROPHYLL A × 35 BETA-CAROTENE × 10 1,2-DIPALMITOYL-PHOSPHATIDYL-GLYCEROLE × 1 1,2-DISTEAROYL-MONOGALACTOSYL-DIGLYCERIDE × 7 FE (III) ION × 1 ;2,3-DIMETHYL-5-(3,7,11,15,19,23,27,31,35-NONAMETHYL-2,6,10,14,18,22,26,30,34-HEXATRIACONTANONAENYL-2,5-CYCLOHEXADIENE-1,4-DIONE-2,3-DIMETHYL-5-SOLANESYL-1,4-BENZOQUINONE ; × 1 PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 1	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	PSBH_THEEB
Isoform	—
PDB实体	7
链与序列区间	作者链 H； PDB构建体 1–66； UniProt 1–66

Photosystem II reaction center protein I

物种未注明

UniProt Q8DJZ6

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 18	Photosystem II protein D1 1 × 1 （P0A444） Photosystem II CP47 reaction center protein × 1 （Q8DIQ1） Photosystem II CP43 reaction center protein × 1 （Q8DIF8） Photosystem II D2 protein × 1 （Q8CM25） Cytochrome b559 subunit alpha × 1 （Q8DIP0） Cytochrome b559 subunit beta × 1 （Q8DIN9） Photosystem II reaction center protein H × 1 （Q8DJ43） Photosystem II reaction center protein K × 1 （Q9F1K9） Photosystem II reaction center protein L × 1 （Q8DIN8） Photosystem II reaction center protein M × 1 （Q8DHA7） Photosystem II reaction center protein T × 1 （Q8DIQ0） Photosystem II reaction center X protein × 1 （Q9F1R6） Photosystem II reaction center protein Ycf12 × 1 （Q8DJI1） Photosystem II reaction center protein Z × 1 （Q8DHJ2） Photosystem II lipoprotein Psb27 × 1 （Q8DG60） Photosystem II reaction center Psb28 protein × 1 （Q8DLJ8） Tsl0063 protein × 1 （Q8DMP8） MANGANESE (II) ION × 1 CHLORIDE ION × 1 PHEOPHYTIN A × 2 CHLOROPHYLL A × 35 BETA-CAROTENE × 10 1,2-DIPALMITOYL-PHOSPHATIDYL-GLYCEROLE × 1 1,2-DISTEAROYL-MONOGALACTOSYL-DIGLYCERIDE × 7 FE (III) ION × 1 ;2,3-DIMETHYL-5-(3,7,11,15,19,23,27,31,35-NONAMETHYL-2,6,10,14,18,22,26,30,34-HEXATRIACONTANONAENYL-2,5-CYCLOHEXADIENE-1,4-DIONE-2,3-DIMETHYL-5-SOLANESYL-1,4-BENZOQUINONE ; × 1 PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 1	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	PSBI_THEEB
Isoform	—
PDB实体	8
链与序列区间	作者链 I； PDB构建体 1–38； UniProt 1–38

Photosystem II reaction center protein K

物种未注明

UniProt Q9F1K9

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 18	Photosystem II protein D1 1 × 1 （P0A444） Photosystem II CP47 reaction center protein × 1 （Q8DIQ1） Photosystem II CP43 reaction center protein × 1 （Q8DIF8） Photosystem II D2 protein × 1 （Q8CM25） Cytochrome b559 subunit alpha × 1 （Q8DIP0） Cytochrome b559 subunit beta × 1 （Q8DIN9） Photosystem II reaction center protein H × 1 （Q8DJ43） Photosystem II reaction center protein I × 1 （Q8DJZ6） Photosystem II reaction center protein L × 1 （Q8DIN8） Photosystem II reaction center protein M × 1 （Q8DHA7） Photosystem II reaction center protein T × 1 （Q8DIQ0） Photosystem II reaction center X protein × 1 （Q9F1R6） Photosystem II reaction center protein Ycf12 × 1 （Q8DJI1） Photosystem II reaction center protein Z × 1 （Q8DHJ2） Photosystem II lipoprotein Psb27 × 1 （Q8DG60） Photosystem II reaction center Psb28 protein × 1 （Q8DLJ8） Tsl0063 protein × 1 （Q8DMP8） MANGANESE (II) ION × 1 CHLORIDE ION × 1 PHEOPHYTIN A × 2 CHLOROPHYLL A × 35 BETA-CAROTENE × 10 1,2-DIPALMITOYL-PHOSPHATIDYL-GLYCEROLE × 1 1,2-DISTEAROYL-MONOGALACTOSYL-DIGLYCERIDE × 7 FE (III) ION × 1 ;2,3-DIMETHYL-5-(3,7,11,15,19,23,27,31,35-NONAMETHYL-2,6,10,14,18,22,26,30,34-HEXATRIACONTANONAENYL-2,5-CYCLOHEXADIENE-1,4-DIONE-2,3-DIMETHYL-5-SOLANESYL-1,4-BENZOQUINONE ; × 1 PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 1	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	PSBK_THEEB
Isoform	—
PDB实体	9
链与序列区间	作者链 K； PDB构建体 1–46； UniProt 1–46

Photosystem II reaction center protein L

物种未注明

UniProt Q8DIN8

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 18	Photosystem II protein D1 1 × 1 （P0A444） Photosystem II CP47 reaction center protein × 1 （Q8DIQ1） Photosystem II CP43 reaction center protein × 1 （Q8DIF8） Photosystem II D2 protein × 1 （Q8CM25） Cytochrome b559 subunit alpha × 1 （Q8DIP0） Cytochrome b559 subunit beta × 1 （Q8DIN9） Photosystem II reaction center protein H × 1 （Q8DJ43） Photosystem II reaction center protein I × 1 （Q8DJZ6） Photosystem II reaction center protein K × 1 （Q9F1K9） Photosystem II reaction center protein M × 1 （Q8DHA7） Photosystem II reaction center protein T × 1 （Q8DIQ0） Photosystem II reaction center X protein × 1 （Q9F1R6） Photosystem II reaction center protein Ycf12 × 1 （Q8DJI1） Photosystem II reaction center protein Z × 1 （Q8DHJ2） Photosystem II lipoprotein Psb27 × 1 （Q8DG60） Photosystem II reaction center Psb28 protein × 1 （Q8DLJ8） Tsl0063 protein × 1 （Q8DMP8） MANGANESE (II) ION × 1 CHLORIDE ION × 1 PHEOPHYTIN A × 2 CHLOROPHYLL A × 35 BETA-CAROTENE × 10 1,2-DIPALMITOYL-PHOSPHATIDYL-GLYCEROLE × 1 1,2-DISTEAROYL-MONOGALACTOSYL-DIGLYCERIDE × 7 FE (III) ION × 1 ;2,3-DIMETHYL-5-(3,7,11,15,19,23,27,31,35-NONAMETHYL-2,6,10,14,18,22,26,30,34-HEXATRIACONTANONAENYL-2,5-CYCLOHEXADIENE-1,4-DIONE-2,3-DIMETHYL-5-SOLANESYL-1,4-BENZOQUINONE ; × 1 PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 1	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	PSBL_THEEB
Isoform	—
PDB实体	10
链与序列区间	作者链 L； PDB构建体 1–37； UniProt 1–37

Photosystem II reaction center protein M

物种未注明

UniProt Q8DHA7

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 18	Photosystem II protein D1 1 × 1 （P0A444） Photosystem II CP47 reaction center protein × 1 （Q8DIQ1） Photosystem II CP43 reaction center protein × 1 （Q8DIF8） Photosystem II D2 protein × 1 （Q8CM25） Cytochrome b559 subunit alpha × 1 （Q8DIP0） Cytochrome b559 subunit beta × 1 （Q8DIN9） Photosystem II reaction center protein H × 1 （Q8DJ43） Photosystem II reaction center protein I × 1 （Q8DJZ6） Photosystem II reaction center protein K × 1 （Q9F1K9） Photosystem II reaction center protein L × 1 （Q8DIN8） Photosystem II reaction center protein T × 1 （Q8DIQ0） Photosystem II reaction center X protein × 1 （Q9F1R6） Photosystem II reaction center protein Ycf12 × 1 （Q8DJI1） Photosystem II reaction center protein Z × 1 （Q8DHJ2） Photosystem II lipoprotein Psb27 × 1 （Q8DG60） Photosystem II reaction center Psb28 protein × 1 （Q8DLJ8） Tsl0063 protein × 1 （Q8DMP8） MANGANESE (II) ION × 1 CHLORIDE ION × 1 PHEOPHYTIN A × 2 CHLOROPHYLL A × 35 BETA-CAROTENE × 10 1,2-DIPALMITOYL-PHOSPHATIDYL-GLYCEROLE × 1 1,2-DISTEAROYL-MONOGALACTOSYL-DIGLYCERIDE × 7 FE (III) ION × 1 ;2,3-DIMETHYL-5-(3,7,11,15,19,23,27,31,35-NONAMETHYL-2,6,10,14,18,22,26,30,34-HEXATRIACONTANONAENYL-2,5-CYCLOHEXADIENE-1,4-DIONE-2,3-DIMETHYL-5-SOLANESYL-1,4-BENZOQUINONE ; × 1 PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 1	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	PSBM_THEEB
Isoform	—
PDB实体	11
链与序列区间	作者链 M； PDB构建体 1–36； UniProt 1–36

Photosystem II reaction center protein T

物种未注明

UniProt Q8DIQ0

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 18	Photosystem II protein D1 1 × 1 （P0A444） Photosystem II CP47 reaction center protein × 1 （Q8DIQ1） Photosystem II CP43 reaction center protein × 1 （Q8DIF8） Photosystem II D2 protein × 1 （Q8CM25） Cytochrome b559 subunit alpha × 1 （Q8DIP0） Cytochrome b559 subunit beta × 1 （Q8DIN9） Photosystem II reaction center protein H × 1 （Q8DJ43） Photosystem II reaction center protein I × 1 （Q8DJZ6） Photosystem II reaction center protein K × 1 （Q9F1K9） Photosystem II reaction center protein L × 1 （Q8DIN8） Photosystem II reaction center protein M × 1 （Q8DHA7） Photosystem II reaction center X protein × 1 （Q9F1R6） Photosystem II reaction center protein Ycf12 × 1 （Q8DJI1） Photosystem II reaction center protein Z × 1 （Q8DHJ2） Photosystem II lipoprotein Psb27 × 1 （Q8DG60） Photosystem II reaction center Psb28 protein × 1 （Q8DLJ8） Tsl0063 protein × 1 （Q8DMP8） MANGANESE (II) ION × 1 CHLORIDE ION × 1 PHEOPHYTIN A × 2 CHLOROPHYLL A × 35 BETA-CAROTENE × 10 1,2-DIPALMITOYL-PHOSPHATIDYL-GLYCEROLE × 1 1,2-DISTEAROYL-MONOGALACTOSYL-DIGLYCERIDE × 7 FE (III) ION × 1 ;2,3-DIMETHYL-5-(3,7,11,15,19,23,27,31,35-NONAMETHYL-2,6,10,14,18,22,26,30,34-HEXATRIACONTANONAENYL-2,5-CYCLOHEXADIENE-1,4-DIONE-2,3-DIMETHYL-5-SOLANESYL-1,4-BENZOQUINONE ; × 1 PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 1	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	PSBT_THEEB
Isoform	—
PDB实体	12
链与序列区间	作者链 T； PDB构建体 1–32； UniProt 1–32

Photosystem II reaction center X protein

物种未注明

UniProt Q9F1R6

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 18	Photosystem II protein D1 1 × 1 （P0A444） Photosystem II CP47 reaction center protein × 1 （Q8DIQ1） Photosystem II CP43 reaction center protein × 1 （Q8DIF8） Photosystem II D2 protein × 1 （Q8CM25） Cytochrome b559 subunit alpha × 1 （Q8DIP0） Cytochrome b559 subunit beta × 1 （Q8DIN9） Photosystem II reaction center protein H × 1 （Q8DJ43） Photosystem II reaction center protein I × 1 （Q8DJZ6） Photosystem II reaction center protein K × 1 （Q9F1K9） Photosystem II reaction center protein L × 1 （Q8DIN8） Photosystem II reaction center protein M × 1 （Q8DHA7） Photosystem II reaction center protein T × 1 （Q8DIQ0） Photosystem II reaction center protein Ycf12 × 1 （Q8DJI1） Photosystem II reaction center protein Z × 1 （Q8DHJ2） Photosystem II lipoprotein Psb27 × 1 （Q8DG60） Photosystem II reaction center Psb28 protein × 1 （Q8DLJ8） Tsl0063 protein × 1 （Q8DMP8） MANGANESE (II) ION × 1 CHLORIDE ION × 1 PHEOPHYTIN A × 2 CHLOROPHYLL A × 35 BETA-CAROTENE × 10 1,2-DIPALMITOYL-PHOSPHATIDYL-GLYCEROLE × 1 1,2-DISTEAROYL-MONOGALACTOSYL-DIGLYCERIDE × 7 FE (III) ION × 1 ;2,3-DIMETHYL-5-(3,7,11,15,19,23,27,31,35-NONAMETHYL-2,6,10,14,18,22,26,30,34-HEXATRIACONTANONAENYL-2,5-CYCLOHEXADIENE-1,4-DIONE-2,3-DIMETHYL-5-SOLANESYL-1,4-BENZOQUINONE ; × 1 PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 1	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	PSBX_THEEB
Isoform	—
PDB实体	13
链与序列区间	作者链 X； PDB构建体 1–41； UniProt 1–41

Photosystem II reaction center protein Ycf12

物种未注明

UniProt Q8DJI1

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 18	Photosystem II protein D1 1 × 1 （P0A444） Photosystem II CP47 reaction center protein × 1 （Q8DIQ1） Photosystem II CP43 reaction center protein × 1 （Q8DIF8） Photosystem II D2 protein × 1 （Q8CM25） Cytochrome b559 subunit alpha × 1 （Q8DIP0） Cytochrome b559 subunit beta × 1 （Q8DIN9） Photosystem II reaction center protein H × 1 （Q8DJ43） Photosystem II reaction center protein I × 1 （Q8DJZ6） Photosystem II reaction center protein K × 1 （Q9F1K9） Photosystem II reaction center protein L × 1 （Q8DIN8） Photosystem II reaction center protein M × 1 （Q8DHA7） Photosystem II reaction center protein T × 1 （Q8DIQ0） Photosystem II reaction center X protein × 1 （Q9F1R6） Photosystem II reaction center protein Z × 1 （Q8DHJ2） Photosystem II lipoprotein Psb27 × 1 （Q8DG60） Photosystem II reaction center Psb28 protein × 1 （Q8DLJ8） Tsl0063 protein × 1 （Q8DMP8） MANGANESE (II) ION × 1 CHLORIDE ION × 1 PHEOPHYTIN A × 2 CHLOROPHYLL A × 35 BETA-CAROTENE × 10 1,2-DIPALMITOYL-PHOSPHATIDYL-GLYCEROLE × 1 1,2-DISTEAROYL-MONOGALACTOSYL-DIGLYCERIDE × 7 FE (III) ION × 1 ;2,3-DIMETHYL-5-(3,7,11,15,19,23,27,31,35-NONAMETHYL-2,6,10,14,18,22,26,30,34-HEXATRIACONTANONAENYL-2,5-CYCLOHEXADIENE-1,4-DIONE-2,3-DIMETHYL-5-SOLANESYL-1,4-BENZOQUINONE ; × 1 PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 1	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	YCF12_THEEB
Isoform	—
PDB实体	14
链与序列区间	作者链 y； PDB构建体 1–46； UniProt 1–46

Photosystem II reaction center protein Z

物种未注明

UniProt Q8DHJ2

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 18	Photosystem II protein D1 1 × 1 （P0A444） Photosystem II CP47 reaction center protein × 1 （Q8DIQ1） Photosystem II CP43 reaction center protein × 1 （Q8DIF8） Photosystem II D2 protein × 1 （Q8CM25） Cytochrome b559 subunit alpha × 1 （Q8DIP0） Cytochrome b559 subunit beta × 1 （Q8DIN9） Photosystem II reaction center protein H × 1 （Q8DJ43） Photosystem II reaction center protein I × 1 （Q8DJZ6） Photosystem II reaction center protein K × 1 （Q9F1K9） Photosystem II reaction center protein L × 1 （Q8DIN8） Photosystem II reaction center protein M × 1 （Q8DHA7） Photosystem II reaction center protein T × 1 （Q8DIQ0） Photosystem II reaction center X protein × 1 （Q9F1R6） Photosystem II reaction center protein Ycf12 × 1 （Q8DJI1） Photosystem II lipoprotein Psb27 × 1 （Q8DG60） Photosystem II reaction center Psb28 protein × 1 （Q8DLJ8） Tsl0063 protein × 1 （Q8DMP8） MANGANESE (II) ION × 1 CHLORIDE ION × 1 PHEOPHYTIN A × 2 CHLOROPHYLL A × 35 BETA-CAROTENE × 10 1,2-DIPALMITOYL-PHOSPHATIDYL-GLYCEROLE × 1 1,2-DISTEAROYL-MONOGALACTOSYL-DIGLYCERIDE × 7 FE (III) ION × 1 ;2,3-DIMETHYL-5-(3,7,11,15,19,23,27,31,35-NONAMETHYL-2,6,10,14,18,22,26,30,34-HEXATRIACONTANONAENYL-2,5-CYCLOHEXADIENE-1,4-DIONE-2,3-DIMETHYL-5-SOLANESYL-1,4-BENZOQUINONE ; × 1 PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 1	与蛋白数一致

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UniProt名称	PSBZ_THEEB
Isoform	—
PDB实体	15
链与序列区间	作者链 Z； PDB构建体 1–62； UniProt 1–62

Photosystem II lipoprotein Psb27

物种未注明

UniProt Q8DG60

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 18	Photosystem II protein D1 1 × 1 （P0A444） Photosystem II CP47 reaction center protein × 1 （Q8DIQ1） Photosystem II CP43 reaction center protein × 1 （Q8DIF8） Photosystem II D2 protein × 1 （Q8CM25） Cytochrome b559 subunit alpha × 1 （Q8DIP0） Cytochrome b559 subunit beta × 1 （Q8DIN9） Photosystem II reaction center protein H × 1 （Q8DJ43） Photosystem II reaction center protein I × 1 （Q8DJZ6） Photosystem II reaction center protein K × 1 （Q9F1K9） Photosystem II reaction center protein L × 1 （Q8DIN8） Photosystem II reaction center protein M × 1 （Q8DHA7） Photosystem II reaction center protein T × 1 （Q8DIQ0） Photosystem II reaction center X protein × 1 （Q9F1R6） Photosystem II reaction center protein Ycf12 × 1 （Q8DJI1） Photosystem II reaction center protein Z × 1 （Q8DHJ2） Photosystem II reaction center Psb28 protein × 1 （Q8DLJ8） Tsl0063 protein × 1 （Q8DMP8） MANGANESE (II) ION × 1 CHLORIDE ION × 1 PHEOPHYTIN A × 2 CHLOROPHYLL A × 35 BETA-CAROTENE × 10 1,2-DIPALMITOYL-PHOSPHATIDYL-GLYCEROLE × 1 1,2-DISTEAROYL-MONOGALACTOSYL-DIGLYCERIDE × 7 FE (III) ION × 1 ;2,3-DIMETHYL-5-(3,7,11,15,19,23,27,31,35-NONAMETHYL-2,6,10,14,18,22,26,30,34-HEXATRIACONTANONAENYL-2,5-CYCLOHEXADIENE-1,4-DIONE-2,3-DIMETHYL-5-SOLANESYL-1,4-BENZOQUINONE ; × 1 PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 1	与蛋白数一致

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UniProt名称	PSB27_THEEB
Isoform	—
PDB实体	16
链与序列区间	作者链 1； PDB构建体 1–134； UniProt 1–134

Photosystem II reaction center Psb28 protein

物种未注明

UniProt Q8DLJ8

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 18	Photosystem II protein D1 1 × 1 （P0A444） Photosystem II CP47 reaction center protein × 1 （Q8DIQ1） Photosystem II CP43 reaction center protein × 1 （Q8DIF8） Photosystem II D2 protein × 1 （Q8CM25） Cytochrome b559 subunit alpha × 1 （Q8DIP0） Cytochrome b559 subunit beta × 1 （Q8DIN9） Photosystem II reaction center protein H × 1 （Q8DJ43） Photosystem II reaction center protein I × 1 （Q8DJZ6） Photosystem II reaction center protein K × 1 （Q9F1K9） Photosystem II reaction center protein L × 1 （Q8DIN8） Photosystem II reaction center protein M × 1 （Q8DHA7） Photosystem II reaction center protein T × 1 （Q8DIQ0） Photosystem II reaction center X protein × 1 （Q9F1R6） Photosystem II reaction center protein Ycf12 × 1 （Q8DJI1） Photosystem II reaction center protein Z × 1 （Q8DHJ2） Photosystem II lipoprotein Psb27 × 1 （Q8DG60） Tsl0063 protein × 1 （Q8DMP8） MANGANESE (II) ION × 1 CHLORIDE ION × 1 PHEOPHYTIN A × 2 CHLOROPHYLL A × 35 BETA-CAROTENE × 10 1,2-DIPALMITOYL-PHOSPHATIDYL-GLYCEROLE × 1 1,2-DISTEAROYL-MONOGALACTOSYL-DIGLYCERIDE × 7 FE (III) ION × 1 ;2,3-DIMETHYL-5-(3,7,11,15,19,23,27,31,35-NONAMETHYL-2,6,10,14,18,22,26,30,34-HEXATRIACONTANONAENYL-2,5-CYCLOHEXADIENE-1,4-DIONE-2,3-DIMETHYL-5-SOLANESYL-1,4-BENZOQUINONE ; × 1 PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 1	与蛋白数一致

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UniProt名称	PSB28_THEEB
Isoform	—
PDB实体	17
链与序列区间	作者链 2； PDB构建体 1–116； UniProt 1–116

Tsl0063 protein

物种未注明

UniProt Q8DMP8

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 18	Photosystem II protein D1 1 × 1 （P0A444） Photosystem II CP47 reaction center protein × 1 （Q8DIQ1） Photosystem II CP43 reaction center protein × 1 （Q8DIF8） Photosystem II D2 protein × 1 （Q8CM25） Cytochrome b559 subunit alpha × 1 （Q8DIP0） Cytochrome b559 subunit beta × 1 （Q8DIN9） Photosystem II reaction center protein H × 1 （Q8DJ43） Photosystem II reaction center protein I × 1 （Q8DJZ6） Photosystem II reaction center protein K × 1 （Q9F1K9） Photosystem II reaction center protein L × 1 （Q8DIN8） Photosystem II reaction center protein M × 1 （Q8DHA7） Photosystem II reaction center protein T × 1 （Q8DIQ0） Photosystem II reaction center X protein × 1 （Q9F1R6） Photosystem II reaction center protein Ycf12 × 1 （Q8DJI1） Photosystem II reaction center protein Z × 1 （Q8DHJ2） Photosystem II lipoprotein Psb27 × 1 （Q8DG60） Photosystem II reaction center Psb28 protein × 1 （Q8DLJ8） MANGANESE (II) ION × 1 CHLORIDE ION × 1 PHEOPHYTIN A × 2 CHLOROPHYLL A × 35 BETA-CAROTENE × 10 1,2-DIPALMITOYL-PHOSPHATIDYL-GLYCEROLE × 1 1,2-DISTEAROYL-MONOGALACTOSYL-DIGLYCERIDE × 7 FE (III) ION × 1 ;2,3-DIMETHYL-5-(3,7,11,15,19,23,27,31,35-NONAMETHYL-2,6,10,14,18,22,26,30,34-HEXATRIACONTANONAENYL-2,5-CYCLOHEXADIENE-1,4-DIONE-2,3-DIMETHYL-5-SOLANESYL-1,4-BENZOQUINONE ; × 1 PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 1	与蛋白数一致

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UniProt名称	Q8DMP8_THEEB
Isoform	—
PDB实体	18
链与序列区间	作者链 3； PDB构建体 1–56； UniProt 1–56

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	7nhp
沉积日期 deposition_date	2021-02-11
结构标题 title	Structure of PSII-I (PSII with Psb27, Psb28, and Psb34)
关键词 keywords	Membrane Protein Biogenesis Assembly Factors Photosystem II, PHOTOSYNTHESIS; PHOTOSYNTHESIS
实验方法 method	ELECTRON MICROSCOPY

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

7nhp__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

7nhp__assembly_1__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

7nhp__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	44.40 Å
Rg（电子密度）	43.31 Å
总 Rg	43.85 Å
原子数	21839
残基数	2350
排除体积	404630 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`7nhp__assembly_1__model_1`	octadecameric （18）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (28)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	Photosystem II protein D1 1
分子量 formula_weight	39762.3 kDa
EC 编号 ec_number	1.10.3.9
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A
原子数 atom_count	21839

MTTTLQRRESANLWERFCNWVTSTDNRLYVGWFGVIMIPTLLAATICFVIAFIAAPPVDIDGIREPVSGSLLYGNNIITGAVVPSSNAIGLHFYPIWEAASLDEWLYNGGPYQLIIFHFLLGASCYMGRQWELSYRLGMRPWICVAYSAPLASAFAVFLIYPIGQGSFSDGMPLGISGTFNFMIVFQAEHNILMHPFHQLGVAGVFGGALFCAMHGSLVTSSLIRETTETESANYGYKFGQEEETYNIVAAHGYFGRLIFQYASFNNSRSLHFFLAAWPVVGVWFTALGISTMAFNLNGFNFNHSVIDAKGNVINTWADIINRANLGMEVMHERNAHNFPLDLASAESAPVAMIAPSING

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	Photosystem II CP47 reaction center protein
分子量 formula_weight	56656.5 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	B

MGLPWYRVHTVLINDPGRLIAAHLMHTALVAGWAGSMALYELATFDPSDPVLNPMWRQGMFVLPFMARLGVTGSWSGWSITGETGIDPGFWSFEGVALAHIVLSGLLFLAACWHWVYWDLELFRDPRTGEPALDLPKMFGIHLFLAGLLCFGFGAFHLTGLFGPGMWVSDPYGLTGSVQPVAPEWGPDGFNPYNPGGVVAHHIAAGIVGIIAGLFHILVRPPQRLYKALRMGNIETVLSSSIAAVFFAAFVVAGTMWYGSATTPIELFGPTRYQWDSSYFQQEINRRVQASLASGATLEEAWSAIPEKLAFYDYIGNNPAKGGLFRTGPMNKGDGIAQAWKGHAVFRNKEGEELFVRRMPAFFESFPVILTDKNGVVKADIPFRRAESKYSFEQQGVTVSFYGGELNGQTFTDPPTVKSYARKAIFGEIFEFDTETLNSDGIFRTSPRGWFTFAHAVFALLFFFGHIWHGARTLFRDVFSGIDPELSPEQVEWGFYQKVGDVTTRRKEAV

实体 3 Entity 3 polymer

描述 description	Photosystem II CP43 reaction center protein
分子量 formula_weight	50287.5 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	C

MVTLSSNSIFATNRDQESSGFAWWAGNARLINLSGKLLGAHVAHAGLIVFWAGAMTLFELAHFIPEKPMYEQGLILIPHIATLGWGVGPGGEVVDTFPFFVVGVVHLISSAVLGFGGVYHAIRGPETLEEYSSFFGYDWKDKNKMTTILGFHLIVLGIGALLLVAKAMFFGGLYDTWAPGGGDVRVITNPTLDPRVIFGYLLKSPFGGEGWIVSVNNLEDVVGGHIWIGLICIAGGIWHILTTPFGWARRAFIWSGEAYLSYSLGALSMMGFIATCFVWFNNTVYPSEFYGPTGPEASQAQAMTFLIRDQKLGANVGSAQGPTGLGKYLMRSPTGEIIFGGETMRFWDFRGPWLEPLRGPNGLDLNKIKNDIQPWQERRAAEYMTHAPLGSLNSVGGVATEINSVNFVSPRSWLATSHFVLAFFFLVGHLWHAGRARAAAAGFEKGIDRESEPVLSMPSLD

实体 4 Entity 4 polymer

描述 description	Photosystem II D2 protein
分子量 formula_weight	39388.2 kDa
EC 编号 ec_number	1.10.3.9
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	D

MTIAIGRAPAERGWFDILDDWLKRDRFVFVGWSGILLFPCAYLALGGWLTGTTFVTSWYTHGLASSYLEGCNFLTVAVSTPANSMGHSLLLLWGPEAQGDFTRWCQLGGLWTFIALHGAFGLIGFMLRQFEIARLVGVRPYNAIAFSAPIAVFVSVFLIYPLGQSSWFFAPSFGVAAIFRFLLFFQGFHNWTLNPFHMMGVAGVLGGALLCAIHGATVENTLFQDGEGASTFRAFNPTQAEETYSMVTANRFWSQIFGIAFSNKRWLHFFMLFVPVTGLWMSAIGVVGLALNLRSYDFISQEIRAAEDPEFETFYTKNLLLNEGIRAWMAPQDQPHENFVFPEEVLPRGNAL

实体 5 Entity 5 polymer

描述 description	Cytochrome b559 subunit alpha
分子量 formula_weight	9580.8 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	E

MAGTTGERPFSDIITSVRYWVIHSITIPALFIAGWLFVSTGLAYDVFGTPRPDSYYAQEQRSIPLVTDRFEAKQQVETFLEQLK

实体 6 Entity 6 polymer

描述 description	Cytochrome b559 subunit beta
分子量 formula_weight	5067.9 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	F

MTSNTPNQEPVSYPIFTVRWVAVHTLAVPTIFFLGAIAAMQFIQR

实体 7 Entity 7 polymer

描述 description	Photosystem II reaction center protein H
分子量 formula_weight	7358.8 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	H

MARRTWLGDILRPLNSEYGKVAPGWGTTPLMAVFMGLFLVFLLIILEIYNSTLILDGVNVSWKALG

实体 8 Entity 8 polymer

描述 description	Photosystem II reaction center protein I
分子量 formula_weight	4410.2 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	I

METLKITVYIVVTFFVLLFVFGFLSGDPARNPKRKDLE

实体 9 Entity 9 polymer

描述 description	Photosystem II reaction center protein K
分子量 formula_weight	5028.1 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	K

MIDALVLVAKLPEAYAIFDPLVDVLPVIPVLFLALAFVWQAAVGFR

实体 10 Entity 10 polymer

描述 description	Photosystem II reaction center protein L
分子量 formula_weight	4299.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	L

MEPNPNRQPVELNRTSLYLGLLLILVLALLFSSYFFN

实体 11 Entity 11 polymer

描述 description	Photosystem II reaction center protein M
分子量 formula_weight	3981.7 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	M

MEVNQLGLIATALFVLVPSVFLIILYVQTESQQKSS

实体 12 Entity 12 polymer

描述 description	Photosystem II reaction center protein T
分子量 formula_weight	3878.7 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	T

METITYVFIFACIIALFFFAIFFREPPRITKK

实体 13 Entity 13 polymer

描述 description	Photosystem II reaction center X protein
分子量 formula_weight	4322.2 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	X

MTITPSLKGFFIGLLSGAVVLGLTFAVLIAISQIDKVQRSL

实体 14 Entity 14 polymer

描述 description	Photosystem II reaction center protein Ycf12
分子量 formula_weight	5039.1 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	y

MGIFNGIIEFLSNINFEVIAQLTMIAMIGIAGPMIIFLLAVRRGNL

实体 15 Entity 15 polymer

描述 description	Photosystem II reaction center protein Z
分子量 formula_weight	6766.2 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	Z

MTILFQLALAALVILSFVMVIGVPVAYASPQDWDRSKQLIFLGSGLWIALVLVVGVLNFFVV

实体 16 Entity 16 polymer

描述 description	Photosystem II lipoprotein Psb27
分子量 formula_weight	15120.4 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	1

MKRFWAMVCALFLSVSLLLTSCANVPTGLTGNFREDTLALISSLREAIALPENDPNKKAAQAEARKKLNDFFALYRRDDSLRSLSSFMTMQTALNSLAGHYSSYPNRPLPEKLKARLEQEFKQVELALDREAKS

实体 17 Entity 17 polymer

描述 description	Photosystem II reaction center Psb28 protein
分子量 formula_weight	13188.8 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	2

MGAMAEIQFIRGINEEVVPDVRLTRARDGSSGQAMFYFDNPKIVQEGNLEVTGMYMVDEEGEIVTRDVNAKFINGQPVAIEATYTMRSPQEWDRFIRFMDRYAASHGLGFQKSENS

实体 18 Entity 18 polymer

描述 description	Tsl0063 protein
分子量 formula_weight	5943.9 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	3

MRYTTDEGGRLNNFAIEPKVYQAQPWTPQQKVRAALLVGGGLLLVAGLVAIAVGVS

实体 19 Entity 19 non-polymer

描述 description	MANGANESE (II) ION
分子量 formula_weight	54.9 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

实体 20 Entity 20 non-polymer

描述 description	CHLORIDE ION
分子量 formula_weight	35.5 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

实体 21 Entity 21 non-polymer

描述 description	PHEOPHYTIN A
分子量 formula_weight	871.2 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	2

实体 22 Entity 22 non-polymer

描述 description	CHLOROPHYLL A
分子量 formula_weight	893.5 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	35

实体 23 Entity 23 non-polymer

描述 description	BETA-CAROTENE
分子量 formula_weight	536.9 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	10

实体 24 Entity 24 non-polymer

描述 description	1,2-DIPALMITOYL-PHOSPHATIDYL-GLYCEROLE
分子量 formula_weight	723.0 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

实体 25 Entity 25 non-polymer

描述 description	1,2-DISTEAROYL-MONOGALACTOSYL-DIGLYCERIDE
分子量 formula_weight	787.2 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	7

实体 26 Entity 26 non-polymer

描述 description	FE (III) ION
分子量 formula_weight	55.8 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

实体 27 Entity 27 non-polymer

描述 description	;2,3-DIMETHYL-5-(3,7,11,15,19,23,27,31,35-NONAMETHYL-2,6,10,14,18,22,26,30,34-HEXATRIACONTANONAENYL-2,5-CYCLOHEXADIENE-1,4-DIONE-2,3-DIMETHYL-5-SOLANESYL-1,4-BENZOQUINONE ;
分子量 formula_weight	749.2 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

实体 28 Entity 28 non-polymer

描述 description	PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE
分子量 formula_weight	616.5 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

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6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 16 domains

SCOP 2.08 (14 domains)

结构域编号 domain_id	d7nhpa_
类 Class class	f — Membrane and cell surface proteins and peptides
折叠类型 Fold fold	f.26 — Bacterial photosystem II reaction centre, L and M subunits
超家族 Superfamily superfamily	f.26.1 — Bacterial photosystem II reaction centre, L and M subunits
家族 Family family	f.26.1.1 — Bacterial photosystem II reaction centre, L and M subunits

结构域编号 domain_id	d7nhpb_
类 Class class	f — Membrane and cell surface proteins and peptides
折叠类型 Fold fold	f.55 — Photosystem II antenna protein-like
超家族 Superfamily superfamily	f.55.1 — Photosystem II antenna protein-like
家族 Family family	f.55.1.1 — Photosystem II antenna protein-like

结构域编号 domain_id	d7nhpc_
类 Class class	f — Membrane and cell surface proteins and peptides
折叠类型 Fold fold	f.55 — Photosystem II antenna protein-like
超家族 Superfamily superfamily	f.55.1 — Photosystem II antenna protein-like
家族 Family family	f.55.1.1 — Photosystem II antenna protein-like

结构域编号 domain_id	d7nhpd_
类 Class class	f — Membrane and cell surface proteins and peptides
折叠类型 Fold fold	f.26 — Bacterial photosystem II reaction centre, L and M subunits
超家族 Superfamily superfamily	f.26.1 — Bacterial photosystem II reaction centre, L and M subunits
家族 Family family	f.26.1.1 — Bacterial photosystem II reaction centre, L and M subunits

结构域编号 domain_id	d7nhpe_
类 Class class	f — Membrane and cell surface proteins and peptides
折叠类型 Fold fold	f.23 — Single transmembrane helix
超家族 Superfamily superfamily	f.23.38 — Cytochrome b559 subunits
家族 Family family	f.23.38.1 — Cytochrome b559 subunits

结构域编号 domain_id	d7nhpf_
类 Class class	f — Membrane and cell surface proteins and peptides
折叠类型 Fold fold	f.23 — Single transmembrane helix
超家族 Superfamily superfamily	f.23.38 — Cytochrome b559 subunits
家族 Family family	f.23.38.1 — Cytochrome b559 subunits

结构域编号 domain_id	d7nhph_
类 Class class	f — Membrane and cell surface proteins and peptides
折叠类型 Fold fold	f.23 — Single transmembrane helix
超家族 Superfamily superfamily	f.23.33 — Photosystem II 10 kDa phosphoprotein PsbH
家族 Family family	f.23.33.1 — PsbH-like

结构域编号 domain_id	d7nhpi_
类 Class class	f — Membrane and cell surface proteins and peptides
折叠类型 Fold fold	f.23 — Single transmembrane helix
超家族 Superfamily superfamily	f.23.37 — Photosystem II reaction center protein I, PsbI
家族 Family family	f.23.37.1 — PsbI-like

结构域编号 domain_id	d7nhpk_
类 Class class	f — Membrane and cell surface proteins and peptides
折叠类型 Fold fold	f.23 — Single transmembrane helix
超家族 Superfamily superfamily	f.23.36 — Photosystem II reaction center protein K, PsbK
家族 Family family	f.23.36.1 — PsbK-like

结构域编号 domain_id	d7nhpl_
类 Class class	f — Membrane and cell surface proteins and peptides
折叠类型 Fold fold	f.23 — Single transmembrane helix
超家族 Superfamily superfamily	f.23.31 — Photosystem II reaction center protein L, PsbL
家族 Family family	f.23.31.1 — PsbL-like

结构域编号 domain_id	d7nhpm_
类 Class class	f — Membrane and cell surface proteins and peptides
折叠类型 Fold fold	f.23 — Single transmembrane helix
超家族 Superfamily superfamily	f.23.35 — Photosystem II reaction center protein M, PsbM
家族 Family family	f.23.35.1 — PsbM-like

结构域编号 domain_id	d7nhpt_
类 Class class	f — Membrane and cell surface proteins and peptides
折叠类型 Fold fold	f.23 — Single transmembrane helix
超家族 Superfamily superfamily	f.23.34 — Photosystem II reaction center protein T, PsbT
家族 Family family	f.23.34.1 — PsbT-like

结构域编号 domain_id	d7nhpx_
类 Class class	f — Membrane and cell surface proteins and peptides
折叠类型 Fold fold	f.23 — Single transmembrane helix
超家族 Superfamily superfamily	f.23.40 — Photosystem II reaction center protein X, PsbX
家族 Family family	f.23.40.1 — PsbX-like

结构域编号 domain_id	d7nhpz_
类 Class class	f — Membrane and cell surface proteins and peptides
折叠类型 Fold fold	f.17 — Transmembrane helix hairpin
超家族 Superfamily superfamily	f.17.5 — PsbZ-like
家族 Family family	f.17.5.1 — PsbZ-like

CATH v4.4 (2 domains)

结构域编号 domain_id	7nhpA01
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology	85 — Photosynthetic Reaction Center, subunit M; domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Photosystem II protein D1-like

结构域编号 domain_id	7nhpE01
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology	5 — Single alpha-helices involved in coiled-coils or other helix-helix interfaces
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	860 — Photosystem II cytochrome b559, alpha subunit

▶

晶胞边长 a length_a	1.000 Å
晶胞边长 b length_b	1.000 Å
晶胞边长 c length_c	1.000 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	—

空间群 space_group	P 1
空间群编号 int_tables_number	1
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	2.72 Å
分辨率测定方法 resolution_method	—
颗粒数 num_particles	57268

Structure of PSII-I (PSII with Psb27, Psb28, and Psb34)

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Photosystem II protein D1 1

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Photosystem II CP47 reaction center protein

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Photosystem II CP43 reaction center protein

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Photosystem II D2 protein

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Cytochrome b559 subunit alpha

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Cytochrome b559 subunit beta

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Photosystem II reaction center protein H

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Photosystem II reaction center protein I

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Photosystem II reaction center protein K

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Photosystem II reaction center protein L

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体