7ugi

Bromodomain of EP300 liganded with BMS-536924

Method: X-RAY DIFFRACTION D_max: 84.3 Å Quality: REASONABLE

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Histone acetyltransferase p300

Homo sapiens

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白单体单体蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1）与蛋白拷贝数一致	链 A； UniProt 1048–1161	未记录	N6I (3M)-4-{[(2S)-2-(3-chlorophenyl)-2-hydroxyethyl]amino}-3-[4-methyl-6-(morpholin-4-yl)-1H-benzimidazol-2-yl]pyridin-2(1H)-one × 1 PE5 3,6,9,12,15,18,21,24-OCTAOXAHEXACOSAN-1-OL × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 7	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；292 K；0.05M Potassium phosphate monobasic 20% w/v Polyethylene glycol 8,000	分辨率 2.00 Å R-free 0.274
2	蛋白单体单体蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1）与蛋白拷贝数一致	链 B； UniProt 1048–1161	未记录	N6I (3M)-4-{[(2S)-2-(3-chlorophenyl)-2-hydroxyethyl]amino}-3-[4-methyl-6-(morpholin-4-yl)-1H-benzimidazol-2-yl]pyridin-2(1H)-one × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；292 K；0.05M Potassium phosphate monobasic 20% w/v Polyethylene glycol 8,000	分辨率 2.00 Å R-free 0.274

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 7UGI	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
1L3E NMR Structures of the HIF-1alpha CTAD/p300 CH1 Complex 提交 2002-02-26	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 323–423（101 aa）片段：cysteine/histidine-rich 1 domain (CH1)	未记录	ZN ZINC ION × 3	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 6；298 K；离子强度（mmCIF原始值）100 mM NaCl；压力 ambient NMR样品组成 1mM CTAD/CH1 complex U-15N,13C; 0.1mM ZnSO4; 1mM DTT \| 90% D2O, 10% H2O NMR样品组成 1mM CTAD/CH1 complex U-15N,13C; 0.1mM ZnSO4; 1mM DTT \| 99.9% D2O NMR样品组成 1mM CTAD/CH1 complex U-15N; 0.1mM ZnSO4; 1mM DTT \| 90% D2O, 10% H2O NMR样品组成 1mM CTAD/CH1 complex; 0.1mM ZnSO4; 1mM DTT \| 99.9% D2O NMR样品组成 1mM CTAD/CH1 complex 10% U-13C; 0.1mM ZnSO4; 1mM DTT \| 99.9% D2O	分辨率未提供
1P4Q Solution structure of the CITED2 transactivation domain in complex with the p300 CH1 domain 提交 2003-04-23	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 323–423（101 aa）片段：cysteine/histidine-rich 1 (CH1) domain	未记录	ZN ZINC ION × 3	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 6；298 K；离子强度（mmCIF原始值）100mM NaCl；压力 ambient NMR样品组成 1mM CITED/p300;10mM deut-MES, pH 6.0; 100mM NaCl; 0.1mM ZnSO4 \| 99.9% D2O NMR样品组成 1mM CITED/p300 U-15N;10mM deut-MES, pH 6.0; 100mM NaCl; 0.1mM ZnSO4 \| 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 1mM CITED/p300 U-15N;10mM deut-MES, pH 6.0; 100mM NaCl; 0.1mM ZnSO4 \| 99.9% D2O NMR样品组成 1mM CITED/p300 U-15N,13C;10mM deut-MES, pH 6.0; 100mM NaCl; 0.1mM ZnSO4 \| 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 1mM CITED/p300 U-15N,13C;10mM deut-MES, pH 6.0; 100mM NaCl; 0.1mM ZnSO4 \| 99.9% D2O NMR样品组成 1mM CITED/p300 10%13C;10mM deut-MES, pH 6.0; 100mM NaCl; 0.1mM ZnSO4 \| 99.9% D2O	分辨率未提供
2K8F Structural Basis for the Regulation of p53 Function by p300 提交 2008-09-08	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1723–1812（90 aa）片段：UNP residues 1723-1812	突变：C1738A, C1746A, C1789A, C1790A	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 6.3；308 K；离子强度（mmCIF原始值）200；压力 ambient NMR样品组成 1.1 mM TAZ2, 1.0 mM [U-100% 15N] TAD(1-39), 1.0 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] TAD(1-39), 90% H2O/10% D2O \| 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 1.0 mM [U-100% 15N] TAZ2, 1.1 mM TAD(1-39), 90% H2O/10% D2O \| 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 1.0 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] TAZ2, 1.1 mM TAD(1-39), 90% H2O/10% D2O \| 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 1.0 mM TAZ2, 1.1 mM TAD(1-39), 100% D2O \| 100% D2O	分辨率未提供
2MH0 Solution NMR structure of the p300 Taz2:ETAD1 complex 提交 2013-11-12	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 1723–1812（90 aa）片段：TAZ-type 2 zinc finger residues 1723-1812	突变：C1738A, C1746A, C1789A, C1790A	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 6.5；288 K；离子强度（mmCIF原始值）0；压力 ambient NMR样品组成 1.4 mM [U-99% 13C; U-99% 15N] ETAD1, 2 mM Taz2, 20 mM MES, 1 mM sodium azide, 5 mM beta-mercaptoethanol, 90% H2O/10% D2O \| 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 3078 uM ETAD1, 1038 uM [U-99% 13C; U-99% 15N] Taz2, 20 mM MES, 1 mM sodium azide, 5 mM beta-mercaptoethanol, 90% H2O/10% D2O \| 90% H2O/10% D2O	分辨率未提供
2MZD Characterization of the p300 Taz2-p53 TAD2 Complex and Comparison with the p300 Taz2-p53 TAD1 Complex 提交 2015-02-11	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1723–1812（90 aa）片段：UNP residues 1723-1812	突变：C16A, C24A, C67A, C68A	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 6.3；308 K；离子强度（mmCIF原始值）200；压力 ambient NMR样品组成 1.1 mM Taz2 domain of Histone Acetyltransferase p300, 1.0 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] TAD2 sub-domain of Cellular Tumor Antigen p53, 90% H2O/10% D2O \| 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 1.0 mM [U-100% 15N] Taz2 domain of Histone Acetyltransferase p300, 1.1 mM TAD2 sub-domain of Cellular Tumor Antigen p53, 90% H2O/10% D2O \| 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 1.0 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] Taz2 domain of Histone Acetyltransferase p300, 1.1 mM TAD2 sub-domain of Cellular Tumor Antigen p53, 90% H2O/10% D2O \| 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 1.0 mM Taz2 domain of Histone Acetyltransferase p300, 1.1 mM TAD2 sub-domain of Cellular Tumor Antigen p53, 100% D2O \| 100% D2O	分辨率未提供
3BIY Crystal structure of p300 histone acetyltransferase domain in complex with a bisubstrate inhibitor, Lys-CoA 提交 2007-12-02	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1287–1666（380 aa）片段：acetyltransferase domain	突变：K1637R, M1652G	BR BROMIDE ION × 5 01K [(2R,3S,4R,5R)-5-(6-amino-9H-purin-9-yl)-4-hydroxy-3-(phosphonooxy)tetrahydrofuran-2-yl]methyl (3R,20R)-20-carbamoyl-3-hydroxy-2,2-dimethyl-4,8,14,22-tetraoxo-12-thia-5,9,15,21-tetraazatricos-1-yl dihydrogen diphosphate × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；0.1 M HEPES sodium pH 7.5, 20% w/v polyethylene glycol 4,000, 10% v/v 2-Propanol , VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 1.70 Å R-free 0.213
3I3J Crystal Structure of the Bromodomain of Human EP300 提交 2009-06-30	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1040–1161（122 aa）片段：UNP RESIDUES 1040-1161	未记录	CL CHLORIDE ION × 1 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；277 K；30w/v PEG 3350, 0.2M ammonium_sulfate, 5.5pH Bis-Tris, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K	分辨率 2.33 Å R-free 0.275
3I3J Crystal Structure of the Bromodomain of Human EP300 提交 2009-06-30	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 10 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 J 1040–1161（122 aa）片段：UNP RESIDUES 1040-1161	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；277 K；30w/v PEG 3350, 0.2M ammonium_sulfate, 5.5pH Bis-Tris, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K	分辨率 2.33 Å R-free 0.275
3I3J Crystal Structure of the Bromodomain of Human EP300 提交 2009-06-30	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 11 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 K 1040–1161（122 aa）片段：UNP RESIDUES 1040-1161	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；277 K；30w/v PEG 3350, 0.2M ammonium_sulfate, 5.5pH Bis-Tris, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K	分辨率 2.33 Å R-free 0.275
3I3J Crystal Structure of the Bromodomain of Human EP300 提交 2009-06-30	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 12 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 L 1040–1161（122 aa）片段：UNP RESIDUES 1040-1161	未记录	SO4 SULFATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；277 K；30w/v PEG 3350, 0.2M ammonium_sulfate, 5.5pH Bis-Tris, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K	分辨率 2.33 Å R-free 0.275
3I3J Crystal Structure of the Bromodomain of Human EP300 提交 2009-06-30	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 1040–1161（122 aa）片段：UNP RESIDUES 1040-1161	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；277 K；30w/v PEG 3350, 0.2M ammonium_sulfate, 5.5pH Bis-Tris, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K	分辨率 2.33 Å R-free 0.275
3I3J Crystal Structure of the Bromodomain of Human EP300 提交 2009-06-30	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 C 1040–1161（122 aa）片段：UNP RESIDUES 1040-1161	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；277 K；30w/v PEG 3350, 0.2M ammonium_sulfate, 5.5pH Bis-Tris, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K	分辨率 2.33 Å R-free 0.275
3I3J Crystal Structure of the Bromodomain of Human EP300 提交 2009-06-30	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 4 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 D 1040–1161（122 aa）片段：UNP RESIDUES 1040-1161	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；277 K；30w/v PEG 3350, 0.2M ammonium_sulfate, 5.5pH Bis-Tris, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K	分辨率 2.33 Å R-free 0.275
3I3J Crystal Structure of the Bromodomain of Human EP300 提交 2009-06-30	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 5 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 E 1040–1161（122 aa）片段：UNP RESIDUES 1040-1161	未记录	CL CHLORIDE ION × 1 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 SO4 SULFATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；277 K；30w/v PEG 3350, 0.2M ammonium_sulfate, 5.5pH Bis-Tris, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K	分辨率 2.33 Å R-free 0.275
3I3J Crystal Structure of the Bromodomain of Human EP300 提交 2009-06-30	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 6 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 F 1040–1161（122 aa）片段：UNP RESIDUES 1040-1161	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；277 K；30w/v PEG 3350, 0.2M ammonium_sulfate, 5.5pH Bis-Tris, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K	分辨率 2.33 Å R-free 0.275
3I3J Crystal Structure of the Bromodomain of Human EP300 提交 2009-06-30	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 7 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 G 1040–1161（122 aa）片段：UNP RESIDUES 1040-1161	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；277 K；30w/v PEG 3350, 0.2M ammonium_sulfate, 5.5pH Bis-Tris, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K	分辨率 2.33 Å R-free 0.275
3I3J Crystal Structure of the Bromodomain of Human EP300 提交 2009-06-30	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 8 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 H 1040–1161（122 aa）片段：UNP RESIDUES 1040-1161	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；277 K；30w/v PEG 3350, 0.2M ammonium_sulfate, 5.5pH Bis-Tris, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K	分辨率 2.33 Å R-free 0.275
3I3J Crystal Structure of the Bromodomain of Human EP300 提交 2009-06-30	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 9 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 I 1040–1161（122 aa）片段：UNP RESIDUES 1040-1161	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；277 K；30w/v PEG 3350, 0.2M ammonium_sulfate, 5.5pH Bis-Tris, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K	分辨率 2.33 Å R-free 0.275
3IO2 Crystal structure of the Taz2 domain of p300 提交 2009-08-13	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1723–1836（114 aa）片段：residues 1723-1836	突变：C1738A, C1746A, C1789A, C1790A	ZN ZINC ION × 3 SO4 SULFATE ION × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 MICROBATCH；pH 6.3；277 K；Protein solution: 30 mg/ml Taz2, 25 mM MES pH 6.3, 100 mM NaCl, 6% glycerol, 10% TCEP. Precipitating solution: 3.2 M AMS in MES buffer pH 6.0, 10 % ethylene glycol. Both solutions mixed 1:1 and kept under oil, Microbatch, temperature 277K	分辨率 2.50 Å R-free 0.236
3P57 Crystal structure of the p300 TAZ2 domain bound to MEF2 on DNA 提交 2010-10-08	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：tridecameric	链 P 1726–1835（110 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.8；288 K；16% PEG 1000, pH 6.8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 288K	分辨率 2.19 Å R-free 0.272
3T92 Crystal structure of the Taz2:C/EBPepsilon-TAD chimera protein 提交 2011-08-02	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1723–1818（96 aa）片段：unp residues 1723-1818; unp residues 37-61	突变：C1738A, C1746A, C1789A, C1790A,	ZN ZINC ION × 3 TCE 3,3',3''-phosphanetriyltripropanoic acid × 1 TAM TRIS(HYDROXYETHYL)AMINOMETHANE × 1 ACN ACETONE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 Micro batch under oil；pH 8.5；277 K；200mM NaCl, 5mM TCEP and 20% isopropanol, pH 8.5, Micro batch under oil, temperature 277K	分辨率 1.50 Å R-free 0.228
4BHW Structural basis for autoinhibition of the acetyltransferase activity of p300 提交 2013-04-08	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1043–1519（477 aa）片段：P300 CORE, RESIDUES 1043-1519,1581-1666 链 A 1581–1666（86 aa）片段：P300 CORE, RESIDUES 1043-1519,1581-1666 链 B 1043–1519（477 aa）片段：P300 CORE, RESIDUES 1043-1519,1581-1666 链 B 1581–1666（86 aa）片段：P300 CORE, RESIDUES 1043-1519,1581-1666	突变：YES 突变：YES 突变：YES 突变：YES	ZN ZINC ION × 7 01K [(2R,3S,4R,5R)-5-(6-amino-9H-purin-9-yl)-4-hydroxy-3-(phosphonooxy)tetrahydrofuran-2-yl]methyl (3R,20R)-20-carbamoyl-3-hydroxy-2,2-dimethyl-4,8,14,22-tetraoxo-12-thia-5,9,15,21-tetraazatricos-1-yl dihydrogen diphosphate × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 7.5；100 MM HEPES, PH 7.5, 20% PEG3350, 0.2M NACL	分辨率 2.80 Å R-free 0.244
4PZR Crystal structure of p300 histone acetyltransferase domain in complex with Coenzyme A 提交 2014-03-31	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1287–1664（378 aa）片段：acetyltransferase domain (UNP residues 1287-1664)	突变：Y1467F	PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 2 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1 COA COENZYME A × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；277 K；0.1 M HEPES, pH 7.5, 16% PEG3350, 3-10% isopropanol, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K	分辨率 2.10 Å R-free 0.219
4PZS Crystal structure of p300 histone acetyltransferase domain in complex with Acetyl-Coenzyme A 提交 2014-03-31	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1287–1664（378 aa）片段：acetyltransferase domain (UNP residues 1287-1664)	突变：Y1467F	ACO ACETYL COENZYME A × 1 DMS* DIMETHYL SULFOXIDE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；277 K；0.1 M HEPES, pH 7.5, 16% PEG3350, 3-10% isopropanol, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K	分辨率 1.94 Å R-free 0.230
4PZT Crystal structure of p300 histone acetyltransferase domain in complex with an inhibitor, Acetonyl-Coenzyme A 提交 2014-03-31	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1287–1664（378 aa）片段：acetyltransferase domain (UNP residues 1287-1664)	突变：Y1467F	SOP [(2R,3S,4R,5R)-5-(6-AMINO-9H-PURIN-9-YL)-4-HYDROXY-3-(PHOSPHONOOXY)TETRAHYDROFURAN-2-YL]METHYL (3R)-3-HYDROXY-2,2-DIMETHYL-4-OXO-4-{[3-OXO-3-({2-[(2-OXOPROPYL)THIO]ETHYL}AMINO)PROPYL]AMINO}BUTYL DIHYDROGEN DIPHOSPHATE × 1 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；277 K；0.1 M HEPES, pH 7.5, 16% PEG3350, 3-10% isopropanol, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K	分辨率 2.80 Å R-free 0.236
5BT3 Crystal structure of EP300 bromodomain in complex with SGC-CBP30 chemical probe 提交 2015-06-02	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1048–1161（114 aa）片段：bromodomain, UNP residues 1048-1161	未记录	2LO 2-[2-(3-chloro-4-methoxyphenyl)ethyl]-5-(3,5-dimethyl-1,2-oxazol-4-yl)-1-[(2S)-2-(morpholin-4-yl)propyl]-1H-benzimidazole × 1 IPA ISOPROPYL ALCOHOL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.6；277 K；0.1 M tri-sodium citrate dihydrate pH 5.6, 20% iso-propanol, 20% PEG 4000	分辨率 1.05 Å R-free 0.178
5KJ2 The novel p300/CBP inhibitor A-485 uncovers a unique mechanism of action to target AR in castrate resistant prostate cancer 提交 2016-06-17	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1287–1666（380 aa）	未记录	6TF N-[(4-fluorophenyl)methyl]-2-{(1R)-5-[(methylcarbamoyl)amino]-2',4'-dioxo-2,3-dihydro-3'H-spiro[indene-1,5'-[1,3]oxazolidin]-3'-yl}-N-[(2S)-1,1,1-trifluoropropan-2-yl]acetamide × 1 NA SODIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；290 K；25% (w/v) PEG3350, 0.2M Sodium Chloride, 0.1M BIS-TRIS buffer pH5.5	分辨率 1.95 Å R-free 0.260
5LKT Crystal structure of the p300 acetyltransferase catalytic core with butyryl-coenzyme A. 提交 2016-07-24	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1043–1519（477 aa）片段：UNP residues 1043-1519,UNP residues 1581-1666 链 A 1581–1666（86 aa）片段：UNP residues 1043-1519,UNP residues 1581-1666	突变：Y1467F,Y1467F 突变：Y1467F,Y1467F	ZN ZINC ION × 4 BCO Butyryl Coenzyme A × 1 GOL GLYCEROL × 3 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1 CL CHLORIDE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；Tris, PEG MME 2000	分辨率 2.04 Å R-free 0.204
5LKU Crystal structure of the p300 acetyltransferase catalytic core with coenzyme A. 提交 2016-07-25	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1043–1519（477 aa）链 A 1581–1666（86 aa）	突变：Y1467F,Y1467F 突变：Y1467F,Y1467F	ZN ZINC ION × 4 COA COENZYME A × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；Tris, PEG MME 2000	分辨率 3.50 Å R-free 0.242
5LKX Crystal structure of the p300 acetyltransferase catalytic core with propionyl-coenzyme A. 提交 2016-07-25	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1043–1519（477 aa）链 A 1581–1666（86 aa）	突变：Y1467F,Y1467F 突变：Y1467F,Y1467F	ZN ZINC ION × 4 1VU propionyl Coenzyme A × 1 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1 GOL GLYCEROL × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；Tris, PEG MME 2000, DMSO	分辨率 2.52 Å R-free 0.239
5LKZ Crystal structure of the p300 acetyltransferase catalytic core with crotonyl-coenzyme A. 提交 2016-07-25	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1043–1519（477 aa）片段：UNP residues 1043-1519,UNP residues 1581-1666,UNP residues 1043-1519,UNP residues 1581-1666 链 A 1581–1666（86 aa）片段：UNP residues 1043-1519,UNP residues 1581-1666,UNP residues 1043-1519,UNP residues 1581-1666	突变：Y1467F,Y1467F,Y1467F,Y1467F 突变：Y1467F,Y1467F,Y1467F,Y1467F	ZN ZINC ION × 4 COO CROTONYL COENZYME A × 1 GOL GLYCEROL × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；Tris, PEG MME 2000	分辨率 2.50 Å R-free 0.234
5LPK Crystal structure of the bromodomain of human EP300 bound to the inhibitor XDM1 提交 2016-08-13	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1040–1161（122 aa）片段：bromodomain, UNP residues 1040-1161	未记录	XDM ~{N}-[(3-chlorophenyl)methyl]-4-ethanoyl-3-ethyl-5-methyl-1~{H}-pyrrole-2-carboxamide × 1 SO4 SULFATE ION × 2 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 5	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 EVAPORATION；pH 6.5；277 K；PEG 3350, NaCl	分辨率 2.10 Å R-free 0.203
5LPK Crystal structure of the bromodomain of human EP300 bound to the inhibitor XDM1 提交 2016-08-13	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 1040–1161（122 aa）片段：bromodomain, UNP residues 1040-1161	未记录	XDM ~{N}-[(3-chlorophenyl)methyl]-4-ethanoyl-3-ethyl-5-methyl-1~{H}-pyrrole-2-carboxamide × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 6 PG4 TETRAETHYLENE GLYCOL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 EVAPORATION；pH 6.5；277 K；PEG 3350, NaCl	分辨率 2.10 Å R-free 0.203
5LPK Crystal structure of the bromodomain of human EP300 bound to the inhibitor XDM1 提交 2016-08-13	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 C 1040–1161（122 aa）片段：bromodomain, UNP residues 1040-1161	未记录	XDM ~{N}-[(3-chlorophenyl)methyl]-4-ethanoyl-3-ethyl-5-methyl-1~{H}-pyrrole-2-carboxamide × 1 SO4 SULFATE ION × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 EVAPORATION；pH 6.5；277 K；PEG 3350, NaCl	分辨率 2.10 Å R-free 0.203
5LPK Crystal structure of the bromodomain of human EP300 bound to the inhibitor XDM1 提交 2016-08-13	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 4 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 D 1040–1161（122 aa）片段：bromodomain, UNP residues 1040-1161	未记录	XDM ~{N}-[(3-chlorophenyl)methyl]-4-ethanoyl-3-ethyl-5-methyl-1~{H}-pyrrole-2-carboxamide × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 EVAPORATION；pH 6.5；277 K；PEG 3350, NaCl	分辨率 2.10 Å R-free 0.203
5LPK Crystal structure of the bromodomain of human EP300 bound to the inhibitor XDM1 提交 2016-08-13	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 5 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 E 1040–1161（122 aa）片段：bromodomain, UNP residues 1040-1161	未记录	XDM ~{N}-[(3-chlorophenyl)methyl]-4-ethanoyl-3-ethyl-5-methyl-1~{H}-pyrrole-2-carboxamide × 2 SO4 SULFATE ION × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 EVAPORATION；pH 6.5；277 K；PEG 3350, NaCl	分辨率 2.10 Å R-free 0.203
5LPK Crystal structure of the bromodomain of human EP300 bound to the inhibitor XDM1 提交 2016-08-13	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 6 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 F 1040–1161（122 aa）片段：bromodomain, UNP residues 1040-1161	未记录	XDM ~{N}-[(3-chlorophenyl)methyl]-4-ethanoyl-3-ethyl-5-methyl-1~{H}-pyrrole-2-carboxamide × 1 SO4 SULFATE ION × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 EVAPORATION；pH 6.5；277 K；PEG 3350, NaCl	分辨率 2.10 Å R-free 0.203
5LPK Crystal structure of the bromodomain of human EP300 bound to the inhibitor XDM1 提交 2016-08-13	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 7 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 G 1040–1161（122 aa）片段：bromodomain, UNP residues 1040-1161	未记录	EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 EVAPORATION；pH 6.5；277 K；PEG 3350, NaCl	分辨率 2.10 Å R-free 0.203
5LPM Crystal structure of the bromodomain of human Ep300 bound to the inhibitor XDM3d 提交 2016-08-13	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1048–1161（114 aa）片段：bromodomain, UNP residues 1048-1161	未记录	71Y ~{N}-[(1~{S},2~{S})-7-chloranyl-2-oxidanyl-1,2,3,4-tetrahydronaphthalen-1-yl]-4-ethanoyl-3-ethyl-5-methyl-1~{H}-pyrrole -2-carboxamide × 2 ACT ACETATE ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 EVAPORATION；pH 5.5；277 K；NaCl, PEG 3350	分辨率 1.50 Å R-free 0.187
5LPM Crystal structure of the bromodomain of human Ep300 bound to the inhibitor XDM3d 提交 2016-08-13	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 1048–1161（114 aa）片段：bromodomain, UNP residues 1048-1161	未记录	71Y ~{N}-[(1~{S},2~{S})-7-chloranyl-2-oxidanyl-1,2,3,4-tetrahydronaphthalen-1-yl]-4-ethanoyl-3-ethyl-5-methyl-1~{H}-pyrrole -2-carboxamide × 2 ACT ACETATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 EVAPORATION；pH 5.5；277 K；NaCl, PEG 3350	分辨率 1.50 Å R-free 0.187
5NU5 Crystal structure of the human bromodomain of EP300 bound to the inhibitor XDM-CBP 提交 2017-04-28	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1048–1161（114 aa）片段：bromodomain	未记录	99E ~{N}-[[2,8-bis(oxidanyl)naphthalen-1-yl]methyl]-4-ethanoyl-3-ethyl-5-methyl-1~{H}-pyrrole-2-carboxamide × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 EVAPORATION；pH 6.5；277 K；KSCN, NaBr, PEG 6000, PEG 8000, PEG 10000	分辨率 1.60 Å R-free 0.185
5NU5 Crystal structure of the human bromodomain of EP300 bound to the inhibitor XDM-CBP 提交 2017-04-28	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 1048–1161（114 aa）片段：bromodomain	未记录	99E ~{N}-[[2,8-bis(oxidanyl)naphthalen-1-yl]methyl]-4-ethanoyl-3-ethyl-5-methyl-1~{H}-pyrrole-2-carboxamide × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 EVAPORATION；pH 6.5；277 K；KSCN, NaBr, PEG 6000, PEG 8000, PEG 10000	分辨率 1.60 Å R-free 0.185
5XZC Cryo-EM structure of p300-p53 protein complex 提交 2017-07-12	构建体不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1046–1664（619 aa）片段：UNP residues 1046-1664	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 10.70 Å
6DS6 Crystal structure of p300 ZZ domain in complex with histone H3 peptide 提交 2018-06-13	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1663–1713（51 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 4 CL CHLORIDE ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；0.1 M HEPES and 70% MPD (pH 7.5)	分辨率 1.95 Å R-free 0.253
6FGN Solution Structure of p300Taz2-p63TA 提交 2018-01-11	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1723–1812（90 aa）片段：Taz2,transactivation domain	未记录	ZN ZINC ION × 3	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 6.3；303 K；离子强度（mmCIF原始值）200；压力 AMBIENT NMR样品组成 1200 mM [U-13C; U-15N] Fusion construct of p300 Taz2 and the transactivation domain of p63, 25 mM MES, 200 mM NaCl, 0.5 mM TCEP, 95% H2O/5% D2O \| 95% H2O/5% D2O	分辨率未提供
6FGS Solution structure of p300Taz2-p73TA1 提交 2018-01-11	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1723–1812（90 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 3	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 6.3；303 K；离子强度（mmCIF原始值）50；压力 AMBIENT NMR样品组成 700 uM [U-13C; U-15N] Fusion construct of p300 Taz2 and the transactivation domain 1 of p73, 25 mM MES, 50 mM NaCl, 0.5 mM TCEP, 95% H2O/5% D2O \| 95% H2O/5% D2O	分辨率未提供
6GYR Transcription factor dimerization activates the p300 acetyltransferase 提交 2018-07-01	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1046–1664（619 aa）链 C 1046–1664（619 aa）	突变：Y1467F 突变：Y1467F	ZN ZINC ION × 7 01K [(2R,3S,4R,5R)-5-(6-amino-9H-purin-9-yl)-4-hydroxy-3-(phosphonooxy)tetrahydrofuran-2-yl]methyl (3R,20R)-20-carbamoyl-3-hydroxy-2,2-dimethyl-4,8,14,22-tetraoxo-12-thia-5,9,15,21-tetraazatricos-1-yl dihydrogen diphosphate × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；277 K；100 mM HEPES, pH 7.5, 18-22% polyethylene glycol 3350, 0.2 M NaCl	分辨率 3.10 Å R-free 0.265
6GYR Transcription factor dimerization activates the p300 acetyltransferase 提交 2018-07-01	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 1046–1664（619 aa）链 D 1046–1664（619 aa）	突变：Y1467F 突变：Y1467F	ZN ZINC ION × 7 01K [(2R,3S,4R,5R)-5-(6-amino-9H-purin-9-yl)-4-hydroxy-3-(phosphonooxy)tetrahydrofuran-2-yl]methyl (3R,20R)-20-carbamoyl-3-hydroxy-2,2-dimethyl-4,8,14,22-tetraoxo-12-thia-5,9,15,21-tetraazatricos-1-yl dihydrogen diphosphate × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；277 K；100 mM HEPES, pH 7.5, 18-22% polyethylene glycol 3350, 0.2 M NaCl	分辨率 3.10 Å R-free 0.265
6GYT Transcription factor dimerization activates the p300 acetyltransferase 提交 2018-07-01	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 A 1047–1168（122 aa）链 B 1047–1168（122 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 EVAPORATION；294 K；1.6 M Ammonium Sulfate, 100 mM Bicine, pH 9.0	分辨率 2.50 Å R-free 0.288
6K4N Cryo-EM structure of p300 提交 2019-05-24	构建体不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1046–1664（619 aa）片段：UNP RESIDUES 1046-1664	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 9.80 Å
6PF1 Crystal structure of the p300 acetyltransferase domain with allosteric inhibitor CPI-090 and CoA 提交 2019-06-21	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1287–1513（227 aa）链 A 1581–1663（83 aa）	突变：Y1467F 突变：Y1467F	COA COENZYME A × 1 OJ7 3-[3-chloro-5-(trifluoromethyl)pyridin-2-yl]-2-methyl-1H-indole × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 9.5；277 K；0.1 M CHES pH 9.5, 30% w/v PEG 3000	分辨率 2.32 Å R-free 0.247
6PF1 Crystal structure of the p300 acetyltransferase domain with allosteric inhibitor CPI-090 and CoA 提交 2019-06-21	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 1287–1513（227 aa）链 B 1581–1663（83 aa）	突变：Y1467F 突变：Y1467F	COA COENZYME A × 1 OJ7 3-[3-chloro-5-(trifluoromethyl)pyridin-2-yl]-2-methyl-1H-indole × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 9.5；277 K；0.1 M CHES pH 9.5, 30% w/v PEG 3000	分辨率 2.32 Å R-free 0.247
6PGU Crystal structure of the p300 acetyltransferase domain with allosteric inhibitor CPI-076 and CoA 提交 2019-06-24	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1287–1519（233 aa）链 A 1582–1663（82 aa）	突变：Y1467F, loop deletion 突变：Y1467F, loop deletion	COA COENZYME A × 1 OK7 N-(thiophen-2-yl)acetamide × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；277 K；20% MPD, 0.1 M Tris pH 8, 7.5% PEG-MME 5000	分辨率 1.72 Å R-free 0.206
6PGU Crystal structure of the p300 acetyltransferase domain with allosteric inhibitor CPI-076 and CoA 提交 2019-06-24	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 1287–1519（233 aa）链 B 1582–1663（82 aa）	突变：Y1467F, loop deletion 突变：Y1467F, loop deletion	COA COENZYME A × 1 OK7 N-(thiophen-2-yl)acetamide × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；277 K；20% MPD, 0.1 M Tris pH 8, 7.5% PEG-MME 5000	分辨率 1.72 Å R-free 0.206
6V8B Crystal structure of the p300 acetyltransferase domain with AcCoA competitive inhibitor 1 提交 2019-12-10	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1287–1666（380 aa）	突变：M1652G	QRY 4-(2-{[(1R)-2-(1H-indol-3-yl)-2-oxo-1-phenylethyl]amino}ethyl)benzene-1-sulfonamide × 1 CL CHLORIDE ION × 2 SO4 SULFATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；277 K；INDEX F6. 25% PEG3350, 0.2 M Ammonium sulfate, 0.1 M BisTris pH 5.5	分辨率 3.13 Å R-free 0.316
6V8K Crystal structure of the p300 acetyltransferase domain with peptide-competitive inhibitor 2 提交 2019-12-11	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1287–1519（233 aa）链 A 1581–1663（83 aa）	突变：Y1467F 突变：Y1467F	COA COENZYME A × 1 QS4 1-(2-methyl-1H-indol-3-yl)-2-[(2R)-2-methylpiperidin-1-yl]ethan-1-one × 1 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；277 K；0.24 mM HAT, 0.12 mM CoA, 0.75 mM ligand. 200+150 (+20) nL sitting drops. Internal focus screen with microseeding. 17.5% MPD, 0.1 M Tris pH 8, 2.5 % PEG3350. Cryo 30% MPD, 5% PEG 3350, 1 mM ligand	分辨率 1.84 Å R-free 0.213
6V8N Crystal structure of the p300 acetyltransferase domain with AcCoA competitive inhibitor 17 提交 2019-12-11	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1287–1666（380 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	SO4 SULFATE ION × 2 CL CHLORIDE ION × 1 QS1 (2R)-2-{[(2S)-2-(4-cyanophenyl)propyl]amino}-N-[5-(1-methyl-1H-pyrazol-4-yl)pyridin-2-yl]-2-phenylacetamide × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；277 K；0.2 M Ammonium Sulfate, 0.1 M BisTris pH 5.5, 20% PEG 3350, streak-seed with loop	分辨率 2.30 Å R-free 0.247
6V90 Crystal structure of the p300 acetyltransferase domain with AcCoA competitive inhibitor 12 提交 2019-12-12	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1287–1666（380 aa）	突变：M1652G	QSD (2R)-2-{[2-(4-cyanophenyl)ethyl]amino}-N-[5-(1-methyl-1H-pyrazol-4-yl)pyridin-2-yl]-2-phenylacetamide × 1 SO4 SULFATE ION × 2 CL CHLORIDE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；INDEX F6. 0.1 M Bis-Tris pH 5.5, 0.2 M ammonium sulfate 25% w/v PEG 3350. The crystal was cryoprotected with MiTeGen Low Viscosity Cryo Oil	分辨率 2.04 Å R-free 0.241
7LJE Discovery of Spirohydantoins as Selective, Orally Bioavailable Inhibitors of p300/CBP Histone Acetyltransferases 提交 2021-01-29	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1287–1666（380 aa）片段：acetyltransferase domain (UNP residues 1287-1666)	未记录	Y2P 2-[4-[(3'R,4S)-3'-fluoro-1-[2-[(4-fluorophenyl)methyl-[(1S)-2,2,2-trifluoro-1-methyl-ethyl]amino]-2-oxo-ethyl]-2,5-dioxo-spiro[imidazolidine-4,1'-indane]-5'-yl]pyrazol-1-yl]-N-methyl-acetamide × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 5.5；290 K；25% PEG 3350, 0.2 M Ammonium Acetate, 0.1 M Bis-Tris HCl pH 5.5	分辨率 2.61 Å R-free 0.265
7LJE Discovery of Spirohydantoins as Selective, Orally Bioavailable Inhibitors of p300/CBP Histone Acetyltransferases 提交 2021-01-29	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 1287–1666（380 aa）片段：acetyltransferase domain (UNP residues 1287-1666)	未记录	Y2P 2-[4-[(3'R,4S)-3'-fluoro-1-[2-[(4-fluorophenyl)methyl-[(1S)-2,2,2-trifluoro-1-methyl-ethyl]amino]-2-oxo-ethyl]-2,5-dioxo-spiro[imidazolidine-4,1'-indane]-5'-yl]pyrazol-1-yl]-N-methyl-acetamide × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 5.5；290 K；25% PEG 3350, 0.2 M Ammonium Acetate, 0.1 M Bis-Tris HCl pH 5.5	分辨率 2.61 Å R-free 0.265
7LJE Discovery of Spirohydantoins as Selective, Orally Bioavailable Inhibitors of p300/CBP Histone Acetyltransferases 提交 2021-01-29	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 C 1287–1666（380 aa）片段：acetyltransferase domain (UNP residues 1287-1666)	未记录	Y2P 2-[4-[(3'R,4S)-3'-fluoro-1-[2-[(4-fluorophenyl)methyl-[(1S)-2,2,2-trifluoro-1-methyl-ethyl]amino]-2-oxo-ethyl]-2,5-dioxo-spiro[imidazolidine-4,1'-indane]-5'-yl]pyrazol-1-yl]-N-methyl-acetamide × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 5.5；290 K；25% PEG 3350, 0.2 M Ammonium Acetate, 0.1 M Bis-Tris HCl pH 5.5	分辨率 2.61 Å R-free 0.265
7LJE Discovery of Spirohydantoins as Selective, Orally Bioavailable Inhibitors of p300/CBP Histone Acetyltransferases 提交 2021-01-29	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 4 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 D 1287–1666（380 aa）片段：acetyltransferase domain (UNP residues 1287-1666)	未记录	Y2P 2-[4-[(3'R,4S)-3'-fluoro-1-[2-[(4-fluorophenyl)methyl-[(1S)-2,2,2-trifluoro-1-methyl-ethyl]amino]-2-oxo-ethyl]-2,5-dioxo-spiro[imidazolidine-4,1'-indane]-5'-yl]pyrazol-1-yl]-N-methyl-acetamide × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 5.5；290 K；25% PEG 3350, 0.2 M Ammonium Acetate, 0.1 M Bis-Tris HCl pH 5.5	分辨率 2.61 Å R-free 0.265
7SS8 Human P300 complexed with a proline-based inhibitor 提交 2021-11-10	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1048–1519（472 aa）链 A 1582–1664（83 aa）	突变：Y1467F, residues 1520-1581 replaced with SGGSG 突变：Y1467F, residues 1520-1581 replaced with SGGSG	ZN ZINC ION × 2 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 C0C 1-[1-(4-chlorophenyl)cyclopentane-1-carbonyl]-N-{[3-(methylcarbamoyl)phenyl]methyl}-D-prolinamide × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 6.5；277 K；20% PEG3350, 0.1 M MES pH 6.5	分辨率 2.15 Å R-free 0.230
7SSK Human P300 complexed with a glycine-based inhibitor 提交 2021-11-11	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1048–1519（472 aa）链 A 1582–1664（83 aa）	突变：Y1467F, residues 1520-1581 replaced with SGGSG 突变：Y1467F, residues 1520-1581 replaced with SGGSG	ZN ZINC ION × 2 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 C3I N-[2-(4-methoxyanilino)-2-oxoethyl]-N-methyl-1-phenylcyclopentane-1-carboxamide × 1 ACT ACETATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 6.5；277 K；20% PEG3350, 0.1 M MES pH 6.5	分辨率 2.36 Å R-free 0.235
7SZQ Human P300 complexed with an azaindazole inhibitor 提交 2021-11-29	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1279–1666（388 aa）	突变：Y1467F	ETL 1-[1-(4-chlorophenyl)cyclopentane-1-carbonyl]-N-1H-pyrazolo[4,3-b]pyridin-5-yl-D-prolinamide × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 9.5；277 K；30% PEG400, 0.1 M CHES pH 9.5	分辨率 2.80 Å R-free 0.235
7VHY Crystal structure of EP300 HAT domain in complex with compound (+)-3 提交 2021-09-24	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1159–1519（361 aa）片段：(UNP residues 1159-1519)-linker-(UNP residues 1581-1666) 链 A 1581–1666（86 aa）片段：(UNP residues 1159-1519)-linker-(UNP residues 1581-1666)	突变：Y1467E 突变：Y1467E	ZN ZINC ION × 3 6QI [(6R)-6-(1H-indazol-4-ylmethyl)-1,4-oxazepan-4-yl]-[1-(4-methoxyphenyl)cyclopentyl]methanone × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；277 K；15% PEG3350, 0.1 M HEPES (pH7.0)	分辨率 2.30 Å R-free 0.250
7VHY Crystal structure of EP300 HAT domain in complex with compound (+)-3 提交 2021-09-24	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 1159–1519（361 aa）片段：(UNP residues 1159-1519)-linker-(UNP residues 1581-1666) 链 B 1581–1666（86 aa）片段：(UNP residues 1159-1519)-linker-(UNP residues 1581-1666)	突变：Y1467E 突变：Y1467E	ZN ZINC ION × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；277 K；15% PEG3350, 0.1 M HEPES (pH7.0)	分辨率 2.30 Å R-free 0.250
7VHZ Crystal structure of EP300 HAT domain in complex with compound 7 提交 2021-09-24	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1159–1519（361 aa）片段：(UNP residues 1159-1519)-linker-(UNP residues 1581-1666) 链 A 1581–1666（86 aa）片段：(UNP residues 1159-1519)-linker-(UNP residues 1581-1666)	突变：Y1467E 突变：Y1467E	ZN ZINC ION × 3 6TI (2R)-N-(2H-indazol-4-yl)-1-[1-(4-methoxyphenyl)cyclopentyl]carbonyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；277 K；16% PEG3350, 0.1 M HEPES (pH 7.0)	分辨率 2.00 Å R-free 0.219
7VHZ Crystal structure of EP300 HAT domain in complex with compound 7 提交 2021-09-24	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 1159–1519（361 aa）片段：(UNP residues 1159-1519)-linker-(UNP residues 1581-1666) 链 B 1581–1666（86 aa）片段：(UNP residues 1159-1519)-linker-(UNP residues 1581-1666)	突变：Y1467E 突变：Y1467E	ZN ZINC ION × 3 6TI (2R)-N-(2H-indazol-4-yl)-1-[1-(4-methoxyphenyl)cyclopentyl]carbonyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；277 K；16% PEG3350, 0.1 M HEPES (pH 7.0)	分辨率 2.00 Å R-free 0.219
7VI0 Crystal structure of EP300 HAT domain in complex with compound 11 提交 2021-09-24	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1159–1519（361 aa）片段：(UNP residues 1159-1519)-linker-(UNP residues 1581-1666) 链 A 1581–1666（86 aa）片段：(UNP residues 1159-1519)-linker-(UNP residues 1581-1666)	突变：Y1467E 突变：Y1467E	ZN ZINC ION × 3 6YI (4S)-N-(3H-indazol-4-yl)-3-[1-(4-methoxyphenyl)cyclopentyl]carbonyl-1,1-bis(oxidanylidene)-1,3-thiazolidine-4-carboxamide × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；277 K；12% PEG3350, 0.1 M HEPES (pH 7.0)	分辨率 2.10 Å R-free 0.235
7VI0 Crystal structure of EP300 HAT domain in complex with compound 11 提交 2021-09-24	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 1159–1519（361 aa）片段：(UNP residues 1159-1519)-linker-(UNP residues 1581-1666) 链 B 1581–1666（86 aa）片段：(UNP residues 1159-1519)-linker-(UNP residues 1581-1666)	突变：Y1467E 突变：Y1467E	ZN ZINC ION × 3 6YI (4S)-N-(3H-indazol-4-yl)-3-[1-(4-methoxyphenyl)cyclopentyl]carbonyl-1,1-bis(oxidanylidene)-1,3-thiazolidine-4-carboxamide × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；277 K；12% PEG3350, 0.1 M HEPES (pH 7.0)	分辨率 2.10 Å R-free 0.235
7W9V Cryo-EM structure of nucleosome in complex with p300 acetyltransferase catalytic core (complex I) 提交 2021-12-10	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric	链 K 1035–1519（485 aa）链 K 1581–1720（140 aa）	突变：Y1467F 突变：Y1467F	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.95 Å
7XEZ NMR solution structures of p300 TAZ2 domain in complex with BRD4-NUT F1c domain binding motif #2 提交 2022-03-31	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1723–1812（90 aa）	突变：C1738A, C1746A, C1789A, C1790A	ZN ZINC ION × 3	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 6.3；298 K；压力 1 NMR样品组成 0.5 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] p300 TAZ2 domain in fusion with BRD4-NUT F1c domain binding motif #2, 200 mM sodium phosphate, 3 mM [U-100% 2H] DTT, 90% H2O/10% D2O \| 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 0.5 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] p300 TAZ2 domain in fusion with BRD4-NUT F1c domain binding motif #2, 200 mM sodium phosphate, 3 mM [U-100% 2H] DTT, 100% D2O \| 100% D2O	分辨率未提供
7XFG NMR solution structures of p300 TAZ2 domain in complex with BRD4-NUT F1c domain binding motif #1 提交 2022-04-01	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1723–1812（90 aa）片段：TAZ2 domain	突变：C1738A, C1746A, C1789A, C1790A	ZN ZINC ION × 3	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 6.3；298 K；离子强度（mmCIF原始值）null；压力 1 NMR样品组成 0.5 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] p300 TAZ2 domain, 1.5 mM BRD4-NUT fusion protein F1c domain binding motif #1, 200 mM sodium phosphate, 3.0 mM [U-100% 2H] DTT, 90% H2O/10% D2O \| 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 0.5 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] p300 TAZ2 domain, 1.5 mM BRD4-NUT fusion protein F1c domain binding motif #1, 200 mM sodium phosphate, 3.0 mM [U-100% 2H] DTT, 100% D2O \| 100% D2O	分辨率未提供
8E1D NMR-derived ensemble of the TAZ2 domain of p300 bound to the microphthalmia-associated transcription factor 提交 2022-08-10	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1723–1812（90 aa）	突变：C1738A C1746A C1789A C1790A	ZN ZINC ION × 3	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 6；308 K；离子强度（mmCIF原始值）20；压力 1 NMR样品组成 20 mM 2-(N-morpholino)ethanesulfonic acid (MES), 5 mM beta mercaptoethanol, 10 uM Zinc chloride, 1 mM [U-13C; U-15N] Microphthalmia-associated transcription factor, 1.2 mM TAZ2 domain of p300, 95% H2O/5% D2O \| 95% H2O/5% D2O NMR样品组成 20 mM 2-(N-morpholino)ethanesulfonic acid (MES), 5 mM beta mercaptoethanol, 10 mM Zinc chloride, 1.15 mM Microphthalmia-associated transcription factor, 0.95 mM [U-13C; U-15N] TAZ2 domain of p300, 95% H2O/5% D2O \| 95% H2O/5% D2O	分辨率未提供
8FVF Bromodomain of EP300 liganded with CCS-1477 提交 2023-01-18	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1048–1161（114 aa）片段：bromodomain	未记录	JHL (6S)-1-[3,4-bis(fluoranyl)phenyl]-6-[5-(3,5-dimethyl-1,2-oxazol-4-yl)-1-(4-methoxycyclohexyl)benzimidazol-2-yl]piperidin-2-one × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 NI NICKEL (II) ION × 6	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；291 K；0.1M Sodium chloride, 0.1M HEPES pH7.5, 1.6M Ammonium sulfate	分辨率 2.10 Å R-free 0.239
8FVF Bromodomain of EP300 liganded with CCS-1477 提交 2023-01-18	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 1048–1161（114 aa）片段：bromodomain	未记录	JHL (6S)-1-[3,4-bis(fluoranyl)phenyl]-6-[5-(3,5-dimethyl-1,2-oxazol-4-yl)-1-(4-methoxycyclohexyl)benzimidazol-2-yl]piperidin-2-one × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 NI NICKEL (II) ION × 3 SO4 SULFATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；291 K；0.1M Sodium chloride, 0.1M HEPES pH7.5, 1.6M Ammonium sulfate	分辨率 2.10 Å R-free 0.239
8GZC Crystal structure of EP300 HAT domain in complex with compound 10 提交 2022-09-26	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1159–1519（361 aa）链 A 1581–1666（86 aa）	突变：Y1467E 突变：Y1467E	ZN ZINC ION × 3 KQO (2~{R},4~{R})-4-fluoranyl-1-[1-(4-methoxyphenyl)cyclohexyl]carbonyl-~{N}-(1~{H}-pyrazolo[4,3-b]pyridin-5-yl)pyrrolidine-2-carboxamide × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；277 K；15% PEG3350, 0.1 M HEPES	分辨率 2.00 Å R-free 0.227
8GZC Crystal structure of EP300 HAT domain in complex with compound 10 提交 2022-09-26	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 1159–1519（361 aa）链 B 1581–1666（86 aa）	突变：Y1467E 突变：Y1467E	ZN ZINC ION × 3 KQO (2~{R},4~{R})-4-fluoranyl-1-[1-(4-methoxyphenyl)cyclohexyl]carbonyl-~{N}-(1~{H}-pyrazolo[4,3-b]pyridin-5-yl)pyrrolidine-2-carboxamide × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；277 K；15% PEG3350, 0.1 M HEPES	分辨率 2.00 Å R-free 0.227
8HAG Cryo-EM structure of the p300 catalytic core bound to the H4K12acK16ac nucleosome, class 1 (3.2 angstrom resolution) 提交 2022-10-26	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric	链 K 1048–1836（789 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.2 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.20 Å
8HAH Cryo-EM structure of the p300 catalytic core bound to the H4K12acK16ac nucleosome, class 2 (3.9 angstrom resolution) 提交 2022-10-26	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric	链 K 1048–1836（789 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.2 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.90 Å
8HAI Cryo-EM structure of the p300 catalytic core bound to the H4K12acK16ac nucleosome, class 1 (4.7 angstrom resolution) 提交 2022-10-26	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric	链 K 1048–1836（789 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.2 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.70 Å
8HAJ Cryo-EM structure of the p300 catalytic core bound to the H4K12acK16ac nucleosome, class 2 (4.8 angstrom resolution) 提交 2022-10-26	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric	链 K 1048–1836（789 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.2 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.80 Å
8HAK Cryo-EM structure of the p300 catalytic core bound to the H4K12acK16ac nucleosome, class 4 (4.5 angstrom resolution) 提交 2022-10-26	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric	链 N 1048–1836（789 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.2 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.50 Å
9IT5 p300 KAT domain in complex with KB528 提交 2024-07-19	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1287–1666（380 aa）片段：KAT domain	突变：K1637R/M1652G	A1L3B 4-[(2~{S})-1-[[(~{R})-[(3~{S})-7-(1-methylpyrazol-4-yl)-2,3-dihydro-1~{H}-pyrido[2,3-b][1,4]oxazin-3-yl]-phenyl-methyl]amino]propan-2-yl]benzenecarbonitrile × 1 CL CHLORIDE ION × 1 GOL GLYCEROL × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；HM(PEGs-E9)-D6 (0.18M NH4Cl, 24% PEG 3350)	分辨率 2.00 Å R-free 0.238
9IT5 p300 KAT domain in complex with KB528 提交 2024-07-19	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 1287–1666（380 aa）片段：KAT domain	突变：K1637R/M1652G	A1L3B 4-[(2~{S})-1-[[(~{R})-[(3~{S})-7-(1-methylpyrazol-4-yl)-2,3-dihydro-1~{H}-pyrido[2,3-b][1,4]oxazin-3-yl]-phenyl-methyl]amino]propan-2-yl]benzenecarbonitrile × 1 CL CHLORIDE ION × 1 GOL GLYCEROL × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；HM(PEGs-E9)-D6 (0.18M NH4Cl, 24% PEG 3350)	分辨率 2.00 Å R-free 0.238
9JEJ Crystal structure of human EP300 KIX domain (L644C mutant) 提交 2024-09-03	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 566–652（87 aa）片段：KIX domain	突变：L644C	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.2 M Sodium Chloride, 0.1 M Sodium Citrate : Citric Acid pH5.5, 1 M Ammonium Phosphate Dibasic	分辨率 2.90 Å R-free 0.281
9JEJ Crystal structure of human EP300 KIX domain (L644C mutant) 提交 2024-09-03	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 566–652（87 aa）片段：KIX domain	突变：L644C	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.2 M Sodium Chloride, 0.1 M Sodium Citrate : Citric Acid pH5.5, 1 M Ammonium Phosphate Dibasic	分辨率 2.90 Å R-free 0.281
9JEJ Crystal structure of human EP300 KIX domain (L644C mutant) 提交 2024-09-03	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 C 566–652（87 aa）片段：KIX domain	突变：L644C	ZN ZINC ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.2 M Sodium Chloride, 0.1 M Sodium Citrate : Citric Acid pH5.5, 1 M Ammonium Phosphate Dibasic	分辨率 2.90 Å R-free 0.281
9JUT X-ray crystal structure of Y16524 in EP300 提交 2024-10-08	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1040–1161（122 aa）	未记录	A1EDM (6~{S})-1-(3-chloranyl-4-methoxy-phenyl)-6-[4-(3-methyl-1,2-benzoxazol-5-yl)-1-[(2~{S})-2-morpholin-4-ylpropyl]imidazol-2-yl]piperidin-2-one × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；277 K；60% v/v Tacsimate pH 7.0, 0.1 M BIS-TRIS propane pH 7.0	分辨率 2.13 Å R-free 0.234
9MZA Chemically Hijacked BCL6-TCIP3-p300 Complex 提交 2025-01-22	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 B 1040–1161（122 aa）链 D 1040–1161（122 aa）	未记录	A1BUC 1-{1-[5-({1-[5-chloro-4-({8-methoxy-1-methyl-3-[2-(methylamino)-2-oxoethoxy]-2-oxo-1,2-dihydroquinolin-6-yl}amino)pyrimidin-2-yl]piperidine-4-carbonyl}amino)pentanoyl]piperidin-4-yl}-3-[(6M)-7-(difluoromethyl)-6-(1-methyl-1H-pyrazol-4-yl)-3,4-dihydroquinolin-1(2H)-yl]-N-methyl-1,4,6,7-tetrahydro-5H-pyrazolo[4,3-c]pyridine-5-carboxamide × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；289 K；0.15 M DL-Malic acid pH 7.0, PEG 3,350 20%	分辨率 2.10 Å R-free 0.277

共 58 个其他 PDB 条目、91 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	EP300_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 3–116； UniProt 1048–1161 作者链 B； PDB构建体 3–116； UniProt 1048–1161

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

下载 Download SAXS (.dat) P(r) (.pr.out) CIF

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	7ugi
沉积日期 deposition_date	2022-03-24
结构标题 title	Bromodomain of EP300 liganded with BMS-536924
关键词 keywords	bromodomain, small molecule ligand, complex, TRANSCRIPTION; TRANSCRIPTION
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier	23.99 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron	23.52 Å
零角强度 I(0) i0	14053500.00
分子量 molecular_weight	29303.0 kDa
排除体积 excluded_volume	37119 Å³
包络体积 envelope_volume	45249 Å³
水化壳体积 shell_volume	17705 Å³
包络直径 envelope_diameter	83.6 Å
壳层 Rg shell_rg	28.11 Å
包络 Rg envelope_rg	23.60 Å
形状 Rg shape_rg	23.47 Å
总 Rg total_rg	24.32 Å
总原子数 total_atoms	2113
残基数 n_residues	232
球谐函数阶数 n_harmonics	20
q 范围 q_range	— – 0.5000 Å⁻¹
数据点数 n_points	101
壳层类型 shell_type	directional
溶剂电子密度 solvent_density	0.3340 e/Å³
壳层衬度 contrast_shell	0.0300 e/Å³
CRYSOL 版本 crysol_version	4.1.3

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4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax	84.3 Å
Rg (实空间) rg_real	24.26 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error	0.70 Å
I(0) (实空间) i0_real	1.4050e+07
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error	2.3910e+05
Rg (倒空间) rg_reciprocal	24.20 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal	14050000.0000
解质量估计 total_estimate	0.6141
解质量评级 solution_quality	REASONABLE a REASONABLE solution
P(r) 峰数 n_peaks	2
主峰位置 r_peak_primary	21.1 Å
偏度 Skewness skewness	0.553
峰度 Kurtosis kurtosis	-0.321
角度范围 angular_range	— – 0.3300 Å⁻¹
当前正则化参数 α current_alpha	0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha	3952000.0000
实空间数据点数 n_real_points	65
GNOM 版本 gnom_version	4.1.3
质量判据 quality_criteria	AN1: 0.000; Oscil: 0.637; Stabil: 1.000; Sysdev: 0.203; Positv: 1.000; Valcen: 0.553; Smooth: 0.905

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5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

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6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (5)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	Histone acetyltransferase p300
分子量 formula_weight	13826.8 kDa
EC 编号 ec_number	2.3.1.48,2.3.1.-
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A,B
原子数 atom_count	2233

SMIFKPEELRQALMPTLEALYRQDPESLPFRQPVDPQLLGIPDYFDIVKSPMDLSTIKRKLDTGQYQEPWQYVDDIWLMFNNAWLYNRKTSRVYKYCSKLSEVFEQEIDPVMQSLG

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 2 Entity 2 non-polymer

描述 description	(3M)-4-{[(2S)-2-(3-chlorophenyl)-2-hydroxyethyl]amino}-3-[4-methyl-6-(morpholin-4-yl)-1H-benzimidazol-2-yl]pyridin-2(1H)-one
分子量 formula_weight	480.0 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	2

实体 3 Entity 3 non-polymer

描述 description	3,6,9,12,15,18,21,24-OCTAOXAHEXACOSAN-1-OL
分子量 formula_weight	398.5 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

实体 4 Entity 4 non-polymer

描述 description	1,2-ETHANEDIOL
分子量 formula_weight	62.1 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	9

实体 5 Entity 5 water

描述 description	water
分子量 formula_weight	18.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	120

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8. 引用文献 (1)

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晶胞边长 a length_a	43.230 Å
晶胞边长 b length_b	43.230 Å
晶胞边长 c length_c	270.890 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	120.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	12

空间群 space_group	P 31 2 1
空间群编号 int_tables_number	152
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	2.000 Å
最低分辨率 resolution_low	45.148 Å
R 因子 r_factor	0.2189
R_work r_work	0.2158
R_free r_free	0.2744

fit	/app/data/saxs_computation/ug/7ugi/7ugi.fit
pddf	/app/data/pr_computation/ug/7ugi/7ugi.pr.out
profile	/app/data/saxs_computation/ug/7ugi/7ugi.dat