SAXSdb — 7uic

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 2

物种未注明

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 6	Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 3 × 1 （P40356） Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 5 × 1 （P53114） Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 14 × 1 （P19263） Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 15 × 1 （P19659） Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 16 × 1 （P32259）	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	MED2_YEAST
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 b； PDB构建体 1–431； UniProt 1–431

Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 3

物种未注明

UniProt P40356

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 6	Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 2 × 1 （Q12124） Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 5 × 1 （P53114） Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 14 × 1 （P19263） Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 15 × 1 （P19659） Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 16 × 1 （P32259）	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	MED3_YEAST
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 c； PDB构建体 1–397； UniProt 1–397

Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 5

物种未注明

UniProt P53114

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 6	Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 2 × 1 （Q12124） Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 3 × 1 （P40356） Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 14 × 1 （P19263） Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 15 × 1 （P19659） Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 16 × 1 （P32259）	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	MED5_YEAST
Isoform	—
PDB实体	3
链与序列区间	作者链 e； PDB构建体 1–1132； UniProt 1–1132

Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 14

物种未注明

UniProt P19263

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 6	Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 2 × 1 （Q12124） Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 3 × 1 （P40356） Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 5 × 1 （P53114） Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 15 × 1 （P19659） Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 16 × 1 （P32259）	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	MED14_YEAST
Isoform	—
PDB实体	4
链与序列区间	作者链 n； PDB构建体 1–1082； UniProt 1–1082

Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 15

物种未注明

UniProt P19659

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 6	Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 2 × 1 （Q12124） Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 3 × 1 （P40356） Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 5 × 1 （P53114） Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 14 × 1 （P19263） Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 16 × 1 （P32259）	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	MED15_YEAST
Isoform	—
PDB实体	5
链与序列区间	作者链 o； PDB构建体 1–1081； UniProt 1–1081

Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 16

物种未注明

UniProt P32259

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 6	Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 2 × 1 （Q12124） Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 3 × 1 （P40356） Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 5 × 1 （P53114） Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 14 × 1 （P19263） Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 15 × 1 （P19659）	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	MED16_YEAST
Isoform	—
PDB实体	6
链与序列区间	作者链 p； PDB构建体 1–974； UniProt 1–974

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	7uic
沉积日期 deposition_date	2022-03-29
结构标题 title	Mediator-PIC Early (Tail A)
关键词 keywords	;Divergent transcription, Mediator, RNA Polymerase II, PIC, Pre-Initiation, Activation, Transcription Factor, Gal4, Gal4VP16, TRANSCRIPTION ;; TRANSCRIPTION
实验方法 method	ELECTRON MICROSCOPY

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

7uic__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

7uic__assembly_1__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

7uic__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	54.05 Å
Rg（电子密度）	54.35 Å
总 Rg	54.33 Å
原子数	17303
残基数	2138
排除体积	311080 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`7uic__assembly_1__model_1`	hexameric （6）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (6)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 2
分子量 formula_weight	47754.3 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	b
原子数 atom_count	17303

MVVQNSPVSSVHTANFSERGSNTRTMTYKNKLTVCFDDILKVGAEMMMQQQLKNVQLDSYLVNGFSQSQQKLLKEKVKLFHGILDDLETSLSQSSSYLETLTALGKEKEKEREEAEKKRAEQENMRKVREQEELKKRQELEEASQQQQLQQNSKEKNGLGLNFSTTAPANTTDANGSKENYQELGSLQSSSQTQLENANAANNGAAFSPLTTTRIQSQQAQPSDVMFNDLNSMDISMFSGLDSTGFDSTAFNATVDETKGFDDNDSGNNYNDINISSIENNINNNINSTKNGKDNNNESNKNNNGDEKNKNNNEDNENNNNSSEKNNNNNNNNNNNNDDNGNNNNNNSGNDNNNTTNNDSNNKNNSITTGNDNENIVNNDLPTTVVSNPGDNPPPADNGEEYLTLNDFNDLNIDWSTTGDNGELDLSGFNI

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 3
分子量 formula_weight	43116.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	c

MDSIIPAGVKLDDLQVILAKNENETRDKVCKQINEARDEILPLRLQFNEFIQIMANIDQEGSKQADRMAKYLHIRDKILQLNDRFQTLSSHLEALQPLFSTVPEYLKTADNRDRSFQLLEPLSTYNKNGNAVCSTATVVSTNHSAAASTPTTTATPHANPITHAHSLSNPNSTATMQHNPLAGKRGPKSGSTMGTPTVHNSTAAAPIAAPKKPRKPRQTKKAKAQAQAQAQAQAQVYAQQSTVQTPITASMAAALPNPTPSMINSVSPTNVMGTPLTNMMSPMGNAYSMGAQNQGGQVSMSQFNGSGNGSNPNTNTNSNNTPLQSQLNLNNLTPANILNMSMNNDFQQQQQQQQQQQQPQPQYNMNMGMNNMNNGGKELDSLDLNNLELGGLNMDFL

实体 3 Entity 3 polymer

描述 description	Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 5
分子量 formula_weight	128918.8 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	e

MEKESVYNLALKCAERQLTSMEFSNLYKEFFNEKFPSLIQEEEEDTTTTANINEVKKASDLVDTPSNNTAATADTTHLHEALDIVCSDFVKILNLEKPLILADYIVEVLLVNYNSDMIKCFLPKLNSVRNSLLLAHFFSKSCSFFAKLSDTLIIDQVRKDLGNVIVPNILSLDMNSMNKELIAIVSKLLQTTLKLSPSPILLTSAGCKNGSFTLLNQLSQTNKLLFKRVSQTFEAKLHFKDTKPFLNKDSTNEFVGSPSLTSPQYIPSPLSSTKPPGSVNSAAKYKDMKLLRYYKNIWLNNKIINWEISNPDFLSKYSAITSSIFQESFNSVQNLDQLLTDLIETSFTCFAQFVSNKQYHQANSNLTLLERKWVIFITKHLPLLILENSSRSPRVVTNALDNIDEKVVKAIRIYFTEKDDNKTNNEDLFDDYPSTSLDIRHDFIKGLIMLNLQPASVINNYLREDQMIDTSILPTRDDLFVRNLQGIQEVVHNTNSFIISSLDTLELESITESITHDSSNGLFQVLHNFESVAPTKQREIVKAFLSIFEDAIKELNYNRIAKICALLFFNFSHSLTTILSFSSPAALMKTLIKFVDLSRNGRNGSNGNDESSEYETINISLSFSWAILLIINLTQTYGISVVDVALKYPELSIKNSFIINFISNLPNVSDKYYLEESNVNDSDMLTKSHNTVQSWLCDLFVNGSITDQLIQNIETRQLANLIPFIVKQVLLSVEIGVLTDISSLIGGFEYFLQPLLLVGLIKTFYWLEQFLSCVKNDTISEDILQGIFNLLNTLFNPVTLNEDSKAFHTAVLRLNAIPLLKVLRKFRVQSQSNYGIYSSDAQGDPNLEPLIAKLVAVLNVSPVYDVDPRIINSENDYSRKQLGYGKFLILNENPINKIMTNQINSFWSLHSSTYYNLDYLFELIELVTPKSFLFDVLKTLEYKLATYGVPGSENKRGSLDSEHVFDYFFYFLVLYDVKTAEEASQLIEYMENDAKKSKGDVDIKGEDLHEKNDSAEVRQETQPKAEATQDDDFDMLFGENDTSTQAYEEEEENEDNDGNNRTNNVPMIKAEETPSKTNKISILKRHSFAVLLHERKLLNDLALENGEITKTENEKFISYHDKYLCMLKTCVF

实体 4 Entity 4 polymer

描述 description	Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 14
分子量 formula_weight	123500.7 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	n

MTTTIGSPQMLANEERLSNEMHALKNRSEQNGQEQQGPVKNTQLHGPSATDPETTATQKESLEMVPKDTSAATMTSAPPPALPHVEINQVSLALVIRNLTVFTMKELAQYMKTNVHTQANEPNSAKKIRFLQLIIFLRTQFLKLYVLVKWTRTIKQNNFHVLIDLLNWFRTTNMNVNNCIWALKSSLNSMTNAKLPNVDLVTALEVLSLGRPNLPTHNFKLSGVSNSMDMVDGMAKVPIGLILQRLKDLNLTVSIKIALMNIPKPLNSYHIKNGRIYFTVPNEFEIQLSTVNRQSPLFFVDLKLLFNTEAEQTVSAVTEATSTNGDSENNEENSSSNGNNLPLNKPRLEKLINEILLKSNDPLLSLYNFLHKYVLTLQLYMVHREFLKLANGGKFSKSNLIHNYDSKKSTITVRYWLNGKMDSKGKITIGIQRTTESLILKWDNQSASRAKNMPVIYNNIVSNIEGILDEIMFNHARIIRSELLARDIFQEDEENSDVLLFQLPTTCVSMAPIQLKIDLLSGQFYFRNPTPLLSNYASKINRAEGPEELARILQQLKLDKIIHVLTTMFENTGWSCSRIIKIDKPIRTQVNTGGESVVKKEDNKYAIAGNSTTNSDVSLLLQRDLFIRLPHWPLNWYLILSIISSKTSCVVEKRIGKIVSQRGKWNLKYLDNSNVMTVKLESITYQKIMILQRTILNRIINHMLIDSLNQLEIRNKICSSEMINEQKLPQYIIQGSNTNDNISIITLELESFLEGSKALNSILESSMFLRIDYSNSQIRLYAKFKRNTMMIQCQIDKLYIHFVQEEPLAFYLEESFTNLGIIVQYLTKFRQKLMQLVVLTDVVERLHKNFESENFKIIALQPNEISFKYLSNNDEDDKDCTIKISTNDDSIKNLTVQLSPSNPQHIIQPFLDNSKMDYHFIFSYLQFTSSLFKALKVILNERGGKFHESGSQYSTMVNIGLHNLNEYQIVYYNPQAGTKITICIELKTVLHNGRDKIQFHIHFADVAHITTKSPAYPMMHQVRNQVFMLDTKRLGTPESVKPANASHAIRLGNGVACDPSEIEPILMEIHNILKVDSNSSSS

实体 5 Entity 5 polymer

描述 description	Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 15
分子量 formula_weight	120432.2 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	o

MSAAPVQDKDTLSNAERAKNVNGLLQVLMDINTLNGGSSDTADKIRIHAKNFEAALFAKSSSKKEYMDSMNEKVAVMRNTYNTRKNAVTAAAANNNIKPVEQHHINNLKNSGNSANNMNVNMNLNPQMFLNQQAQARQQVAQQLRNQQQQQQQQQQQQRRQLTPQQQQLVNQMKVAPIPKQLLQRIPNIPPNINTWQQVTALAQQKLLTPQDMEAAKEVYKIHQQLLFKARLQQQQAQAQAQANNNNNGLPQNGNINNNINIPQQQQMQPPNSSANNNPLQQQSSQNTVPNVLNQINQIFSPEEQRSLLQEAIETCKNFEKTQLGSTMTEPVKQSFIRKYINQKALRKIQALRDVKNNNNANNNGSNLQRAQNVPMNIIQQQQQQNTNNNDTIATSATPNAAAFSQQQNASSKLYQMQQQQQAQAQAQAQAQAQAQAQAQAQAAQAAQAQAQAQAQAQAQAQAQAQAQAQAQAQAQAQAQAHAQHQPSQQPQQAQQQPNPLHGLTPTAKDVEVIKQLSLDASKTNLRLTDVTNSLSNEEKEKIKMKLKQGQKLFVQVSNFAPQVYIITKNENFLKEVFQLRIFVKEILEKCAEGIFVVKLDTVDRLIIKYQKYWESMRIQILRRQAILRQQQQMANNNGNPGTTSTGNNNNIATQQNMQQSLQQMQHLQQLKMQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQHIYPSSTPGVANYSAMANAPGNNIPYMNHKNTSSMDFLNSMENTPKVPVSAAATPSLNKTINGKVNGRTKSNTIPVTSIPSTNKKLSISNAASQQPTPRSASNTAKSTPNTNPSPLKTQTKNGTPNPNNMKTVQSPMGAQPSYNSAIIENAFRKEELLLKDLEIRKLEISSRFKHRQEIFKDSPMDLFMSTLGDCLGIKDEEMLTSCTIPKAVVDHINGSGKRKPTKAAQRARDQDSIDISIKDNKLVMKSKFNKSNRSYSIALSNVAAIFKGIGGNFKDLSTLVHSSSPSTSSNMDVGNPRKRKASVLEISPQDSIASVLSPDSNIMSDSKKIKVDSPDDPFMTKSGATTSEKQEVTNEAPFLTSGTSSEQFNVWDWNNWTSAT

实体 6 Entity 6 polymer

描述 description	Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 16
分子量 formula_weight	111423.4 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	p

MMLGEHLMSWSKTGIIAYSDSQSSNANICLTFLESINGINWRFHTPQKYVLHPQLHEVQYQESSSTLSTHSTTTSVNGSTTAGVGSTPNFGGNSNKSPPQFFYNISSIHWNNWFSLPGDMLAVCDELGNMTMLITGQRPDRATTYEKLTMVFQDNVYKIYNHVMPLKPVDKLKPMNIERKQTRKEYNTSILEFRWLTSSKSVIVSQFCAFDSSSNTYRSRAQQVPPYGVYHPPFIKYACLAIRKNGQIDFWYQFSNSKDHKKITLQLLDTSNQRFKDLQWLEFARITPMNDDQCMLITTYSKLSKNISFYKLHVNWNLNATKPNVLNDPSLKIQFILSTTLDPTDDEGHVLKLENLHVVSKSSIEKDPSPEILVLYNVCDTSKSLVKRYRLAPTQLSAEYLVILKPDLNIDRNNSTNQIFQSRRYNLRRHSDIVLDKKVTLITSEMFDAFVSFYFEDGTIESYNQNDWKLETERLISQSQLGKFKNIIASPLSAGFNYGKLPLPPSVEWMKVSPSMCGVIVKQYNKKWPQFYAAVQKNYADPEKDSINATALAFGYVKSLHKQISAEDLTIAAKTHILRISFLDRKRAKEFITTLLKSLYSFFNISPDAPKEIMDKIITSRPLQKIMLLQLELGSCFSQENIEEMARVILYLKNVLFAFNGVARNFHFAIEQISNNSNQQQNPKLFQTIFSKQDLIHSLIPVAKWFVKFITYLTQEILILINDPTNKEYTLVHGIFGAKMSRTLILSILNEIKKVTQIVAKFPETSYPILNESSTFLKLVLSESPVDFEKFETFLVDVNNKFIALCEQQPSQEREFSLLVKAEIPPEYAKVGDFLLQYANNAVISHANAAAVYFADTSGLKISNSEFFNPEIFHLLQPLEEGLIIDTDKLPIKNRTSKSFSKLLYDDVTCDKLSVSEISDGKLKRCSRCGSVTRAGNIISSDKTIVPTSIQTKRWPTMYTRLCICSGMLFEMDG

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晶胞边长 a length_a	1.000 Å
晶胞边长 b length_b	1.000 Å
晶胞边长 c length_c	1.000 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	—

空间群 space_group	P 1
空间群编号 int_tables_number	1
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	3.70 Å
分辨率测定方法 resolution_method	—
颗粒数 num_particles	1102984

Mediator-PIC Early (Tail A)

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 2

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 3

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 5

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 14

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 15

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 16

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

7uic__assembly_1__model_1

7uic__assembly_1__model_1 | I(q)

7uic__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

冷冻电镜 EM 3D

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (6)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

实体 3 Entity 3 polymer

聚合物 Polymer

实体 4 Entity 4 polymer

聚合物 Polymer

实体 5 Entity 5 polymer

聚合物 Polymer

实体 6 Entity 6 polymer

聚合物 Polymer

7. 引用文献 (1)