7ulj

Hsp90b N-terminal domain in complex with 42C

Method: X-RAY DIFFRACTION D_max: 114.1 Å Quality: GOOD

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Heat shock protein HSP 90-beta

Homo sapiens

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白单体单体蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1）与蛋白拷贝数一致	链 A； UniProt 1–218	未记录	42C N,N-dimethyl-7H-purin-6-amine × 1 MPD (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL × 1 GOL GLYCEROL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；291 K；0.1 M Sodium cacodylate pH 6.5, 0.1 M Sodium acetate, 5% MPD and 25% PEG8000	分辨率 1.82 Å R-free 0.219
2	蛋白单体单体蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1）与蛋白拷贝数一致	链 B； UniProt 1–218	未记录	42C N,N-dimethyl-7H-purin-6-amine × 1 MPD (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL × 1 GOL GLYCEROL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；291 K；0.1 M Sodium cacodylate pH 6.5, 0.1 M Sodium acetate, 5% MPD and 25% PEG8000	分辨率 1.82 Å R-free 0.219
3	蛋白单体单体蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1）与蛋白拷贝数一致	链 C； UniProt 1–218	未记录	42C N,N-dimethyl-7H-purin-6-amine × 1 MPD (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL × 1 GOL GLYCEROL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；291 K；0.1 M Sodium cacodylate pH 6.5, 0.1 M Sodium acetate, 5% MPD and 25% PEG8000	分辨率 1.82 Å R-free 0.219
4	蛋白单体单体蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1）与蛋白拷贝数一致	链 D； UniProt 1–218	未记录	42C N,N-dimethyl-7H-purin-6-amine × 1 MPD (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL × 1 GOL GLYCEROL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；291 K；0.1 M Sodium cacodylate pH 6.5, 0.1 M Sodium acetate, 5% MPD and 25% PEG8000	分辨率 1.82 Å R-free 0.219

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 7ULJ	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
1QZ2 Crystal Structure of FKBP52 C-terminal Domain complex with the C-terminal peptide MEEVD of Hsp90 提交 2003-09-15	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric	链 G 719–723（5 aa）链 H 719–723（5 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；291 K；Sodium Citrate, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K	分辨率 3.00 Å R-free 0.287
1UYM Human Hsp90-beta with PU3 (9-Butyl-8(3,4,5-trimethoxy-benzyl)-9H-purin-6-ylamine) 提交 2004-03-02	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–220（220 aa）片段：N-TERMINAL DOMAIN, RESIDUES 1-220	未记录	PU3 9-BUTYL-8-(3,4,5-TRIMETHOXYBENZYL)-9H-PURIN-6-AMINE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 6.5；25% PEG MME 2000, 0.1M NA CACODYLATE, PH6.5, 0.2M MGCL2., pH 6.50	分辨率 2.45 Å R-free 0.294
3FWV Crystal Structure of a Redesigned TPR Protein, T-MOD(VMY), in Complex with MEEVF Peptide 提交 2009-01-19	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 C 719–723（5 aa）片段：C-terminal residues	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	NI NICKEL (II) ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；298 K；100 mM Tris pH 8.5, 30% PEG MME 2000, 5-10 mM NiCl2, 10% xylitol, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K	分辨率 2.20 Å R-free 0.244
3FWV Crystal Structure of a Redesigned TPR Protein, T-MOD(VMY), in Complex with MEEVF Peptide 提交 2009-01-19	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 D 719–723（5 aa）片段：C-terminal residues	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	NI NICKEL (II) ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；298 K；100 mM Tris pH 8.5, 30% PEG MME 2000, 5-10 mM NiCl2, 10% xylitol, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K	分辨率 2.20 Å R-free 0.244
3NMQ Hsp90b N-terminal domain in complex with EC44, a pyrrolo-pyrimidine methoxypyridine inhibitor 提交 2010-06-22	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–223（223 aa）片段：N-terminal domain (UNP residues 1-223)	未记录	7PP 5-{2-amino-4-chloro-7-[(4-methoxy-3,5-dimethylpyridin-2-yl)methyl]-7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-5-yl}-2-methylpent-4-yn-2 -ol × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 6.5；277 K；0.1M Na Cacodylate, 20% PEG 2000 MME, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K	分辨率 2.20 Å R-free 0.267
3PRY Crystal structure of the middle domain of human HSP90-beta refined at 2.3 A resolution 提交 2010-11-30	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 284–543（260 aa）片段：middle domain (UNP residues 284-543)	未记录	SO4 SULFATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293.15 K；25.5% PEG3350, 0.17 M ammonium sulfate, 15% glycerol, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293.15K	分辨率 2.28 Å R-free 0.217
3PRY Crystal structure of the middle domain of human HSP90-beta refined at 2.3 A resolution 提交 2010-11-30	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 284–543（260 aa）片段：middle domain (UNP residues 284-543)	未记录	SO4 SULFATE ION × 1 GOL GLYCEROL × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293.15 K；25.5% PEG3350, 0.17 M ammonium sulfate, 15% glycerol, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293.15K	分辨率 2.28 Å R-free 0.217
3PRY Crystal structure of the middle domain of human HSP90-beta refined at 2.3 A resolution 提交 2010-11-30	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 C 284–543（260 aa）片段：middle domain (UNP residues 284-543)	未记录	EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293.15 K；25.5% PEG3350, 0.17 M ammonium sulfate, 15% glycerol, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293.15K	分辨率 2.28 Å R-free 0.217
5FWK Atomic cryoEM structure of Hsp90-Cdc37-Cdk4 complex 提交 2016-02-17	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 1–724（724 aa）片段：FULL LENGTH 链 B 1–724（724 aa）片段：FULL LENGTH	未记录	ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 20MM TRIS-HCL (PH 7.5), 150 MM NACL, 10 MM KCL, 10 MM MGCL2, 20 MM NA2MOO4, 2MM DTT, 0.085MM DDM；pH 7.5；20MM TRIS-HCL (PH 7.5), 150 MM NACL, 10 MM KCL, 10 MM MGCL2, 20 MM NA2MOO4, 2MM DTT, 0.085MM DDM cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；LIQUID ETHANE	分辨率 3.90 Å
5FWL Atomic cryoEM structure of Hsp90-Cdc37-Cdk4 complex 提交 2016-02-18	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 1–724（724 aa）链 B 1–724（724 aa）	未记录	ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 20MM TRIS-HCL, 150 MM NACL, 10MM KCL, 10MM MGCL2, 20MM NA2MOO4, 2MM DTT, 0.085MM DDM；pH 7.5；20MM TRIS-HCL, 150 MM NACL, 10MM KCL, 10MM MGCL2, 20MM NA2MOO4, 2MM DTT, 0.085MM DDM cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 9.00 Å
5FWM Atomic cryoEM structure of Hsp90-Cdc37-Cdk4 complex 提交 2016-02-18	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 1–724（724 aa）链 B 1–724（724 aa）	未记录	ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 20MM TRIS-HCL (PH 7.5), 150 MM NACL, 10 MM KCL, 10 MM MGCL2, 20 MM NA2MOO4, 2MM DTT, 0.085MM DDM；pH 7.5；20MM TRIS-HCL (PH 7.5), 150 MM NACL, 10 MM KCL, 10 MM MGCL2, 20 MM NA2MOO4, 2MM DTT, 0.085MM DDM cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；LIQUID ETHANE	分辨率 8.00 Å
5FWP Atomic cryoEM structure of Hsp90-Cdc37-Cdk4 complex 提交 2016-02-18	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 1–724（724 aa）链 B 1–724（724 aa）	未记录	ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20mM Tris-HCl (pH 7.5), 150 mM NaCl, 10 mM KCl, 10 mM MgCl2, 20 mM Na2MoO4, 2mM DTT, 0.085mM DDM cryo-EM玻璃化条件 Single blot from 4 to 6 seconds, at 20C；95 K；冷冻剂 ETHANE；LIQUID ETHANE	分辨率 7.20 Å
5UC4 Hsp90b N-terminal domain with inhibitors 提交 2016-12-21	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–218（218 aa）片段：N-terminal domain (UNP residues 1-218)	未记录	83S 5-Hydroxy-4-(isoindoline-2-carbonyl)-2-isopropylbenzaldehyde × 1 GOL GLYCEROL × 1 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 EVAPORATION；293 K；30% PEG 8,000, 0.2 M sodium acetate, 0.1 sodium cacodylate pH 6.5	分辨率 2.05 Å R-free 0.207
5UC4 Hsp90b N-terminal domain with inhibitors 提交 2016-12-21	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 1–218（218 aa）片段：N-terminal domain (UNP residues 1-218)	未记录	83S 5-Hydroxy-4-(isoindoline-2-carbonyl)-2-isopropylbenzaldehyde × 1 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 EVAPORATION；293 K；30% PEG 8,000, 0.2 M sodium acetate, 0.1 sodium cacodylate pH 6.5	分辨率 2.05 Å R-free 0.207
5UC4 Hsp90b N-terminal domain with inhibitors 提交 2016-12-21	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 C 1–218（218 aa）片段：N-terminal domain (UNP residues 1-218)	未记录	83S 5-Hydroxy-4-(isoindoline-2-carbonyl)-2-isopropylbenzaldehyde × 1 GOL GLYCEROL × 1 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 EVAPORATION；293 K；30% PEG 8,000, 0.2 M sodium acetate, 0.1 sodium cacodylate pH 6.5	分辨率 2.05 Å R-free 0.207
5UC4 Hsp90b N-terminal domain with inhibitors 提交 2016-12-21	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 4 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 D 1–218（218 aa）片段：N-terminal domain (UNP residues 1-218)	未记录	83S 5-Hydroxy-4-(isoindoline-2-carbonyl)-2-isopropylbenzaldehyde × 1 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 EVAPORATION；293 K；30% PEG 8,000, 0.2 M sodium acetate, 0.1 sodium cacodylate pH 6.5	分辨率 2.05 Å R-free 0.207
5UCH Hsp90b N-terminal domain with inhibitors 提交 2016-12-22	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–218（218 aa）片段：UNP residues 1-218	未记录	871 2-(5-Hydroxy-4-(isoindoline-2-carbonyl)-2-isopropylphenyl)acetonitrile × 1 GOL GLYCEROL × 1 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 EVAPORATION；293 K；30% PEG 8,000, 0.2 M sodium acetate, 0.1 sodium cacodylate pH 6.5	分辨率 2.65 Å R-free 0.226
5UCH Hsp90b N-terminal domain with inhibitors 提交 2016-12-22	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 1–218（218 aa）片段：UNP residues 1-218	未记录	871 2-(5-Hydroxy-4-(isoindoline-2-carbonyl)-2-isopropylphenyl)acetonitrile × 1 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 EVAPORATION；293 K；30% PEG 8,000, 0.2 M sodium acetate, 0.1 sodium cacodylate pH 6.5	分辨率 2.65 Å R-free 0.226
5UCH Hsp90b N-terminal domain with inhibitors 提交 2016-12-22	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 C 1–218（218 aa）片段：UNP residues 1-218	未记录	871 2-(5-Hydroxy-4-(isoindoline-2-carbonyl)-2-isopropylphenyl)acetonitrile × 1 GOL GLYCEROL × 1 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 EVAPORATION；293 K；30% PEG 8,000, 0.2 M sodium acetate, 0.1 sodium cacodylate pH 6.5	分辨率 2.65 Å R-free 0.226
5UCH Hsp90b N-terminal domain with inhibitors 提交 2016-12-22	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 4 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 D 1–218（218 aa）片段：UNP residues 1-218	未记录	871 2-(5-Hydroxy-4-(isoindoline-2-carbonyl)-2-isopropylphenyl)acetonitrile × 1 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 EVAPORATION；293 K；30% PEG 8,000, 0.2 M sodium acetate, 0.1 sodium cacodylate pH 6.5	分辨率 2.65 Å R-free 0.226
5UCI Hsp90b N-terminal domain with inhibitors 提交 2016-12-22	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–218（218 aa）片段：UNP residues 1-218	未记录	874 (2,4-Dihydroxy-3-(hydroxymethyl)-5-isopropylphenyl)(isoindolin-2-yl)methanone × 1 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 EVAPORATION；293 K；30% PEG 8,000, 0.2 M sodium acetate, 0.1 sodium cacodylate pH 6.5	分辨率 2.70 Å R-free 0.238
5UCI Hsp90b N-terminal domain with inhibitors 提交 2016-12-22	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 1–218（218 aa）片段：UNP residues 1-218	未记录	874 (2,4-Dihydroxy-3-(hydroxymethyl)-5-isopropylphenyl)(isoindolin-2-yl)methanone × 1 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1 GOL GLYCEROL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 EVAPORATION；293 K；30% PEG 8,000, 0.2 M sodium acetate, 0.1 sodium cacodylate pH 6.5	分辨率 2.70 Å R-free 0.238
5UCI Hsp90b N-terminal domain with inhibitors 提交 2016-12-22	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 C 1–218（218 aa）片段：UNP residues 1-218	未记录	874 (2,4-Dihydroxy-3-(hydroxymethyl)-5-isopropylphenyl)(isoindolin-2-yl)methanone × 1 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 EVAPORATION；293 K；30% PEG 8,000, 0.2 M sodium acetate, 0.1 sodium cacodylate pH 6.5	分辨率 2.70 Å R-free 0.238
5UCI Hsp90b N-terminal domain with inhibitors 提交 2016-12-22	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 4 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 D 1–218（218 aa）片段：UNP residues 1-218	未记录	874 (2,4-Dihydroxy-3-(hydroxymethyl)-5-isopropylphenyl)(isoindolin-2-yl)methanone × 1 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1 GOL GLYCEROL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 EVAPORATION；293 K；30% PEG 8,000, 0.2 M sodium acetate, 0.1 sodium cacodylate pH 6.5	分辨率 2.70 Å R-free 0.238
5UCJ Hsp90b N-terminal domain with inhibitors 提交 2016-12-22	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–218（218 aa）片段：UNP residues 1-218	未记录	KU3 (5-fluoroisoindolin-2-yl)(4-hydroxy-5-isopropylbenzo[d]isoxazol-7-yl)methanone × 1 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 EVAPORATION；293 K；30% PEG 8,000, 0.2 M sodium acetate, 0.1 sodium cacodylate pH 6.5	分辨率 1.69 Å R-free 0.197
5UCJ Hsp90b N-terminal domain with inhibitors 提交 2016-12-22	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 1–218（218 aa）片段：UNP residues 1-218	未记录	KU3 (5-fluoroisoindolin-2-yl)(4-hydroxy-5-isopropylbenzo[d]isoxazol-7-yl)methanone × 1 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 EVAPORATION；293 K；30% PEG 8,000, 0.2 M sodium acetate, 0.1 sodium cacodylate pH 6.5	分辨率 1.69 Å R-free 0.197
5UCJ Hsp90b N-terminal domain with inhibitors 提交 2016-12-22	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 C 1–218（218 aa）片段：UNP residues 1-218	未记录	KU3 (5-fluoroisoindolin-2-yl)(4-hydroxy-5-isopropylbenzo[d]isoxazol-7-yl)methanone × 1 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 EVAPORATION；293 K；30% PEG 8,000, 0.2 M sodium acetate, 0.1 sodium cacodylate pH 6.5	分辨率 1.69 Å R-free 0.197
5UCJ Hsp90b N-terminal domain with inhibitors 提交 2016-12-22	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 4 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 D 1–218（218 aa）片段：UNP residues 1-218	未记录	KU3 (5-fluoroisoindolin-2-yl)(4-hydroxy-5-isopropylbenzo[d]isoxazol-7-yl)methanone × 1 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 EVAPORATION；293 K；30% PEG 8,000, 0.2 M sodium acetate, 0.1 sodium cacodylate pH 6.5	分辨率 1.69 Å R-free 0.197
6N8W Structure of Unliganded Hsp90-Beta N-Terminal Domain 提交 2018-11-30	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–231（231 aa）	未记录	GOL GLYCEROL × 8	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；296 K；Tris-HCl pH 8.5, MgCl2, PEG 4000, Glycerol	分辨率 3.09 Å R-free 0.286
6N8W Structure of Unliganded Hsp90-Beta N-Terminal Domain 提交 2018-11-30	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 1–231（231 aa）	未记录	GOL GLYCEROL × 10	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；296 K；Tris-HCl pH 8.5, MgCl2, PEG 4000, Glycerol	分辨率 3.09 Å R-free 0.286
6N8W Structure of Unliganded Hsp90-Beta N-Terminal Domain 提交 2018-11-30	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 C 1–231（231 aa）	未记录	GOL GLYCEROL × 12	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；296 K；Tris-HCl pH 8.5, MgCl2, PEG 4000, Glycerol	分辨率 3.09 Å R-free 0.286
6N8W Structure of Unliganded Hsp90-Beta N-Terminal Domain 提交 2018-11-30	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 4 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 D 1–231（231 aa）	未记录	GOL GLYCEROL × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；296 K；Tris-HCl pH 8.5, MgCl2, PEG 4000, Glycerol	分辨率 3.09 Å R-free 0.286
6N8Y Hsp90-beta bound to PU-11-trans 提交 2018-11-30	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–221（221 aa）	未记录	KFY 9-[(2E)-but-2-en-1-yl]-8-[(3,4,5-trimethoxyphenyl)methyl]-9H-purin-6-amine × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；277 K；MES pH 6.5, MgCl2, PEG 2000 MME. Incubate with PU-11-trans prior to setup.	分辨率 1.55 Å R-free 0.183
7Z37 Structure of the RAF1-HSP90-CDC37 complex (RHC-II) 提交 2022-03-01	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 AP1 3–724（722 aa）链 BP1 3–724（722 aa）	未记录	ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；blot for 3 seconds before plunging	分辨率 3.67 Å
7Z38 Structure of the RAF1-HSP90-CDC37 complex (RHC-I) 提交 2022-03-01	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 3–724（722 aa）链 B 3–724（722 aa）	未记录	ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；blot for 3 seconds before plunging	分辨率 3.16 Å
7ZR0 CryoEM structure of HSP90-CDC37-BRAF(V600E) complex. 提交 2022-05-03	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 1–724（724 aa）链 B 1–724（724 aa）	未记录	ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.40 Å
7ZR5 CryoEM structure of HSP90-CDC37-BRAF(V600E)-PP5(closed) complex 提交 2022-05-03	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric	链 A 1–724（724 aa）链 B 1–724（724 aa）	未记录	ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.90 Å
7ZR6 CryoEM structure of HSP90-CDC37-BRAF(V600E)-PP5(open) complex 提交 2022-05-03	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric	链 A 1–724（724 aa）链 B 1–724（724 aa）	未记录	ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.20 Å
7ZUB Cryo-EM structure of the indirubin-bound Hsp90-XAP2-AHR complex 提交 2022-05-12	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 2–724（723 aa）链 B 2–724（723 aa）	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 MOO MOLYBDATE ION × 2 JY6 (3~{Z})-3-(3-oxidanylidene-1~{H}-indol-2-ylidene)-1~{H}-indol-2-one × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.85 Å
8EOA Cryo-EM structure of human HSP90B-AIPL1 complex 提交 2022-10-02	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 A 2–724（723 aa）链 B 2–724（723 aa）	未记录	ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 2 MG MAGNESIUM ION × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5；25 mM HEPES, 200 mM NaCl, 1 mM TCEP, pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.90 Å
8EOB Cryo-EM structure of human HSP90B in the closed state 提交 2022-10-02	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 2–724（723 aa）链 B 2–724（723 aa）	未记录	ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 2 MG MAGNESIUM ION × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5；25 mM HEPES, 200 mM NaCl, 1 mM TCEP, pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.10 Å
8GAE Hsp90 provides platform for CRaf dephosphorylation by PP5 提交 2023-02-22	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric	链 A 1–724（724 aa）链 B 1–724（724 aa）	未记录	K POTASSIUM ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MN MANGANESE (II) ION × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；3UL OF SAMPLE 10C 100% HUMIDITY 30S WAIT TIME 3S BLOT TIME -2 BLOT FORCE	分辨率 3.30 Å
8GFT Hsp90 provides platform for CRaf dephosphorylation by PP5 提交 2023-03-08	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric	链 A 1–724（724 aa）链 B 1–724（724 aa）	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 2 K POTASSIUM ION × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MN MANGANESE (II) ION × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；3uL OF SAMPLE, 10C, 100% HUMIDITY, 30S WAIT TIME, 3S BLOT TIME, -2 BLOT FORCE	分辨率 3.80 Å
8QMO Cryo-EM structure of the benzo[a]pyrene-bound Hsp90-XAP2-AHR complex 提交 2023-09-24	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 2–724（723 aa）链 B 2–724（723 aa）	未记录	MOO MOLYBDATE ION × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 W62 benzo[a]pyrene × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.76 Å
9D9H Human Hsp90b nucleotide binding domain in complex with BRI2311 提交 2024-08-21	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–223（223 aa）片段：nucleotide binding domain	未记录	A1A26 (1P)-3-amino-6-[({1-[(2S)-2-(2,4-difluorophenyl)-2-hydroxy-3-(1H-1,2,4-triazol-1-yl)propyl]piperidin-4-yl}amino)methyl]-1-(4-phenyl-3,4-dihydro-2H-1,4-benzoxazin-6-yl)thieno[2,3-b]pyrazin-2(1H)-one × 1 CL CHLORIDE ION × 5	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；21% PEG8000, 0.1M Hepes pH 7.5,1M LiCl	分辨率 1.96 Å R-free 0.208
9D9I Human Hsp90b nucleotide binding domain in complex with BRI2312 提交 2024-08-21	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–223（223 aa）片段：nucleotide binding domain	未记录	A1A24 (1P)-3-amino-6-[({1-[(2R)-2-(2,4-difluorophenyl)-2-hydroxy-3-(1H-1,2,4-triazol-1-yl)propyl]piperidin-4-yl}amino)methyl]-1-(4-phenyl-3,4-dihydro-2H-1,4-benzoxazin-6-yl)thieno[2,3-b]pyrazin-2(1H)-one × 1 CL CHLORIDE ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；21% PEG6000, 0.1M NaCacodylate pH 6.6, 1M Li	分辨率 1.50 Å R-free 0.187
9W5I AGO maturation complex (AMC): AGO2-miRNA duplex in complex with Hsp90 beta and co-chaperone p23 提交 2025-08-01	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：hexameric	链 A 1–724（724 aa）链 B 1–724（724 aa）	未记录	ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 3	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.63 Å

共 29 个其他 PDB 条目、47 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	HS90B_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 4–221； UniProt 1–218 作者链 B； PDB构建体 4–221； UniProt 1–218 作者链 C； PDB构建体 4–221； UniProt 1–218 作者链 D； PDB构建体 4–221； UniProt 1–218

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

下载 Download SAXS (.dat) P(r) (.pr.out) CIF

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	7ulj
沉积日期 deposition_date	2022-04-05
结构标题 title	Hsp90b N-terminal domain in complex with 42C
关键词 keywords	Hsp90 Isoform, molecular chaperone, Hsp90b, and Ligand binding, CHAPERONE; CHAPERONE
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier	33.11 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron	32.18 Å
零角强度 I(0) i0	139413000.00
分子量 molecular_weight	95808.0 kDa
排除体积 excluded_volume	120710 Å³
包络体积 envelope_volume	155470 Å³
水化壳体积 shell_volume	40415 Å³
包络直径 envelope_diameter	122.7 Å
壳层 Rg shell_rg	38.58 Å
包络 Rg envelope_rg	32.69 Å
形状 Rg shape_rg	32.19 Å
总 Rg total_rg	32.70 Å
总原子数 total_atoms	6754
残基数 n_residues	853
球谐函数阶数 n_harmonics	20
q 范围 q_range	— – 0.5000 Å⁻¹
数据点数 n_points	101
壳层类型 shell_type	directional
溶剂电子密度 solvent_density	0.3340 e/Å³
壳层衬度 contrast_shell	0.0300 e/Å³
CRYSOL 版本 crysol_version	4.1.3

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4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax	114.1 Å
Rg (实空间) rg_real	33.12 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error	0.93 Å
I(0) (实空间) i0_real	1.3940e+08
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error	2.4370e+06
Rg (倒空间) rg_reciprocal	33.12 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal	139400000.0000
解质量估计 total_estimate	0.8049
解质量评级 solution_quality	GOOD a GOOD solution
P(r) 峰数 n_peaks	2
主峰位置 r_peak_primary	35.7 Å
偏度 Skewness skewness	0.327
峰度 Kurtosis kurtosis	-0.428
角度范围 angular_range	— – 0.2400 Å⁻¹
当前正则化参数 α current_alpha	0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha	26880000.0000
实空间数据点数 n_real_points	49
GNOM 版本 gnom_version	4.1.3
质量判据 quality_criteria	AN1: 0.000; Oscil: 0.835; Stabil: 1.000; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.955; Smooth: 0.000

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5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

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6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (5)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	Heat shock protein HSP 90-beta
分子量 formula_weight	24669.8 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	4

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A,B,C,D
原子数 atom_count	7335

GSHMPEEVHHGEEEVETFAFQAEIAQLMSLIINTFYSNKEIFLRELISNASDALDKIRYESLTDPSKLDSGKELKIDIIPNPQERTLTLVDTGIGMTKADLINNLGTIAKSGTKAFMEALQAGADISMIGQFGVGFYSAYLVAEKVVVITKHNDDEQYAWESSAGGSFTVRADHGEPIGRGTKVILHLKEDQTEYLEERRVKEVVKKHSQFIGYPITLYLE

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 2 Entity 2 non-polymer

描述 description	N,N-dimethyl-7H-purin-6-amine
分子量 formula_weight	163.2 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	4

实体 3 Entity 3 non-polymer

描述 description	(4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL
分子量 formula_weight	118.2 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	4

实体 4 Entity 4 non-polymer

描述 description	GLYCEROL
分子量 formula_weight	92.1 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	4

实体 5 Entity 5 water

描述 description	water
分子量 formula_weight	18.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	581

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8. 引用文献 (1)

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晶胞边长 a length_a	129.506 Å
晶胞边长 b length_b	129.506 Å
晶胞边长 c length_c	104.454 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	120.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	24

空间群 space_group	P 65
空间群编号 int_tables_number	170
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	1.820 Å
最低分辨率 resolution_low	42.391 Å
R 因子 r_factor	0.1947
R_work r_work	0.1934
R_free r_free	0.2191

fit	/app/data/saxs_computation/ul/7ulj/7ulj.fit
pddf	/app/data/pr_computation/ul/7ulj/7ulj.pr.out
profile	/app/data/saxs_computation/ul/7ulj/7ulj.dat