7v6q

Crystal structure of sNASP-ASF1A-H3.1-H4 complex

Method: X-RAY DIFFRACTION

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Histone chaperone ASF1A

Homo sapiens

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 4	Histone H3.1 × 1 （P68431） Histone H4 × 1 （P62805） Isoform 2 of Nuclear autoantigenic sperm protein × 1 （P49321） GLYCEROL × 4 PENTAETHYLENE GLYCOL × 1 water × 4	与蛋白数一致
2	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 4	Histone H3.1 × 1 （P68431） Histone H4 × 1 （P62805） Isoform 2 of Nuclear autoantigenic sperm protein × 1 （P49321） GLYCEROL × 2 PENTAETHYLENE GLYCOL × 1 water × 4	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	ASF1A_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–156； UniProt 1–156 作者链 E； PDB构建体 1–156； UniProt 1–156

Histone H3.1

Homo sapiens

UniProt P68431

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 4	Histone chaperone ASF1A × 1 （Q9Y294） Histone H4 × 1 （P62805） Isoform 2 of Nuclear autoantigenic sperm protein × 1 （P49321） GLYCEROL × 4 PENTAETHYLENE GLYCOL × 1 water × 4	与蛋白数一致
2	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 4	Histone chaperone ASF1A × 1 （Q9Y294） Histone H4 × 1 （P62805） Isoform 2 of Nuclear autoantigenic sperm protein × 1 （P49321） GLYCEROL × 2 PENTAETHYLENE GLYCOL × 1 water × 4	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	H31_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 B； PDB构建体 1–136； UniProt 1–136 作者链 F； PDB构建体 1–136； UniProt 1–136

Histone H4

Homo sapiens

UniProt P62805

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 4	Histone chaperone ASF1A × 1 （Q9Y294） Histone H3.1 × 1 （P68431） Isoform 2 of Nuclear autoantigenic sperm protein × 1 （P49321） GLYCEROL × 4 PENTAETHYLENE GLYCOL × 1 water × 4	与蛋白数一致
2	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 4	Histone chaperone ASF1A × 1 （Q9Y294） Histone H3.1 × 1 （P68431） Isoform 2 of Nuclear autoantigenic sperm protein × 1 （P49321） GLYCEROL × 2 PENTAETHYLENE GLYCOL × 1 water × 4	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	H4_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	3
链与序列区间	作者链 C； PDB构建体 2–102； UniProt 3–103 作者链 G； PDB构建体 2–102； UniProt 3–103

Isoform 2 of Nuclear autoantigenic sperm protein

Homo sapiens

UniProt P49321

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 4	Histone chaperone ASF1A × 1 （Q9Y294） Histone H3.1 × 1 （P68431） Histone H4 × 1 （P62805） GLYCEROL × 4 PENTAETHYLENE GLYCOL × 1 water × 4	与蛋白数一致
2	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 4	Histone chaperone ASF1A × 1 （Q9Y294） Histone H3.1 × 1 （P68431） Histone H4 × 1 （P62805） GLYCEROL × 2 PENTAETHYLENE GLYCOL × 1 water × 4	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	NASP_HUMAN
Isoform	P49321-2
PDB实体	4
链与序列区间	作者链 D； PDB构建体 1–283； UniProt 38–320 作者链 H； PDB构建体 1–283； UniProt 38–320

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	7v6q
沉积日期 deposition_date	2021-08-20
结构标题 title	Crystal structure of sNASP-ASF1A-H3.1-H4 complex
关键词 keywords	Histone chaperone, CHAPERONE; CHAPERONE
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

7v6q__assembly_2__model_1

Assembly 2 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

7v6q__assembly_2__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

7v6q__assembly_2__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	25.17 Å
Rg（电子密度）	24.04 Å
总 Rg	25.04 Å
原子数	4212
残基数	529
排除体积	74987 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`7v6q__assembly_1__model_1`	tetrameric （4）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
2	1	`7v6q__assembly_2__model_1`	tetrameric （4）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (7)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	Histone chaperone ASF1A
分子量 formula_weight	17799.9 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A,E
原子数 atom_count	8594

MAKVQVNNVVVLDNPSPFYNPFQFEITFECIEDLSEDLEWKIIYVGSAESEEYDQVLDSVLVGPVPAGRHMFVFQADAPNPGLIPDADAVGVTVVLITCTYRGQEFIRVGYYVNNEYTETELRENPPVKPDFSKLQRNILASNPRVTRFHINWEDN

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	Human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	Histone H3.1
分子量 formula_weight	15437.2 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	B,F

MARTKQTARKSTGGKAPRKQLATKAARKSAPATGGVKKPHRYRPGTVALREIRRYQKSTELLIRKLPFQRLVREIAQDFKTDLRFQSSAVMALQEACEAYLVGLFEDTNLCAIHAKRVTIMPKDIQLARRIRGERA

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	Human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 3 Entity 3 polymer

描述 description	Histone H4
分子量 formula_weight	11307.3 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	C,G

MGRGKGGKGLGKGGAKRHRKVLRDNIQGITKPAIRRLARRGGVKRISGLIYEETRGVLKVFLENVIRDAVTYTEHAKRKTVTAMDVVYALKRQGRTLYGFGG

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	Human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 4 Entity 4 polymer

描述 description	Isoform 2 of Nuclear autoantigenic sperm protein
分子量 formula_weight	31924.9 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	D,H

DPDSEAKKLLGLGQKHLVMGDIPAAVNAFQEAASLLGKKYGETANECGEAFFFYGKSLLELARMENGVLGNALEGVHVEEEEGEKTEDESLVENNDNIDETEGSEEDDKENDKTEEMPNDSVLENKSLQENEEEEIGNLELAWDMLDLAKIIFKRQETKEAQLYAAQAHLKLGEVSVESENYVQAVEEFQSCLNLQEQYLEAHDRLLAETHYQLGLAYGYNSQYDEAVAQFSKSIEVIENRMAVLNEQVKEAEGSSAEYKKEIEELKELLPEIREKIEDAKES

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	Human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 5 Entity 5 non-polymer

描述 description	GLYCEROL
分子量 formula_weight	92.1 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	6

实体 6 Entity 6 non-polymer

描述 description	PENTAETHYLENE GLYCOL
分子量 formula_weight	238.3 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	2

实体 7 Entity 7 water

描述 description	water
分子量 formula_weight	18.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	44

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晶胞边长 a length_a	71.133 Å
晶胞边长 b length_b	71.004 Å
晶胞边长 c length_c	104.394 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	105.32 °
晶胞夹角 β angle_beta	101.99 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	95.75 °
晶胞分子数 Z z_pdb	2

空间群 space_group	P 1
空间群编号 int_tables_number	1
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	3.000 Å
最低分辨率 resolution_low	14.970 Å
R 因子 r_factor	0.1674
R_work r_work	0.1651
R_free r_free	0.2033

Crystal structure of sNASP-ASF1A-H3.1-H4 complex

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Histone chaperone ASF1A

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Histone H3.1

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Histone H4

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Isoform 2 of Nuclear autoantigenic sperm protein

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

7v6q__assembly_2__model_1

7v6q__assembly_2__model_1 | I(q)

7v6q__assembly_2__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (7)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 4 Entity 4 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 5 Entity 5 non-polymer

实体 6 Entity 6 non-polymer

实体 7 Entity 7 water

7. 引用文献 (1)