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7vnr

Structure of human KCNQ4-ML213 complex in digitonin

Method: ELECTRON MICROSCOPY Dmax: 124.1 Å Quality: REASONABLE
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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Potassium voltage-gated channel subfamily KQT member 4,Maltodextrin-binding protein

Escherichia coli (strain B / BL21-DE3)

UniProt A0A140NCD0

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 信息不足 异源复合物 蛋白 × 8 PDB 声明：octameric（8） 与蛋白拷贝数一致 链 A； UniProt 26–392 链 C； UniProt 26–392 链 E； UniProt 26–392 链 G； UniProt 26–392 未记录 Calmodulin-3 × 4 （P0DP25） 7YV (1S,2S,4R)-N-(2,4,6-trimethylphenyl)bicyclo[2.2.1]heptane-2-carboxamid × 4 K POTASSIUM ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE 分辨率 2.80 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 7VNR Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
5Z0R Structural insight into the Zika virus capsid encapsulating the viral genome 提交 2017-12-20 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 27–395（369 aa）
链 B 27–395（369 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 MICROBATCH；pH 8.5；293 K；10% v/v 2-Propanol, 0.1 M BICINE pH 8.5, 30% w/v Polyethylene glycol 1500
分辨率 2.05 Å R-free 0.254
5Z0V Structural insight into the Zika virus capsid encapsulating the viral genome 提交 2017-12-21 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 27–395（369 aa）
链 D 27–395（369 aa）
突变：N293D 突变：N293D 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 MICROBATCH；pH 4.6；293 K；0.1 M sodium acetate trihydrate pH 4.6, 8% w/v Polyethylene glycol 4000
分辨率 2.91 Å R-free 0.248
5Z0V Structural insight into the Zika virus capsid encapsulating the viral genome 提交 2017-12-21 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 27–395（369 aa）
链 C 27–395（369 aa）
突变：N293D 突变：N293D 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 MICROBATCH；pH 4.6；293 K；0.1 M sodium acetate trihydrate pH 4.6, 8% w/v Polyethylene glycol 4000
分辨率 2.91 Å R-free 0.248
7CY4 Crystal Structure of CMD1 in apo form 提交 2020-09-03 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 27–392（366 aa）
突变：D108A, K109A, E198A,N199A,E385A,K388A,D389A FE FE (III) ION × 1 CIT CITRIC ACID × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.6；290 K；2% (v/v) tacsimate, pH 5.0, 0.1 M sodium citrate, pH 5.6, 16% (w/v) PEG 3350
分辨率 2.20 Å R-free 0.223
7VNP Structure of human KCNQ4-ML213 complex with PIP2 提交 2021-10-11 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 A 26–392（367 aa）
链 C 26–392（367 aa）
链 E 26–392（367 aa）
链 G 26–392（367 aa）
未记录 PT5 [(2R)-1-octadecanoyloxy-3-[oxidanyl-[(1R,2R,3S,4R,5R,6S)-2,3,6-tris(oxidanyl)-4,5-diphosphonooxy-cyclohexyl]oxy-phospho ryl]oxy-propan-2-yl] (8Z)-icosa-5,8,11,14-tetraenoate × 8 K POTASSIUM ION × 4 7YV (1S,2S,4R)-N-(2,4,6-trimethylphenyl)bicyclo[2.2.1]heptane-2-carboxamid × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.79 Å
7VNQ Structure of human KCNQ4-ML213 complex in nanodisc 提交 2021-10-11 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 A 26–392（367 aa）
链 C 26–392（367 aa）
链 E 26–392（367 aa）
链 G 26–392（367 aa）
未记录 7YV (1S,2S,4R)-N-(2,4,6-trimethylphenyl)bicyclo[2.2.1]heptane-2-carboxamid × 4 K POTASSIUM ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.96 Å

共 5 个其他 PDB 条目、6 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 A0A140NCD0_ECOBD
Isoform —
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A； PDB构建体 668–1034； UniProt 26–392 作者链 C； PDB构建体 668–1034； UniProt 26–392 作者链 E； PDB构建体 668–1034； UniProt 26–392 作者链 G； PDB构建体 668–1034； UniProt 26–392

Potassium voltage-gated channel subfamily KQT member 4,Maltodextrin-binding protein

Escherichia coli (strain B / BL21-DE3)

UniProt P56696

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 信息不足 异源复合物 蛋白 × 8 PDB 声明：octameric（8） 与蛋白拷贝数一致 链 A； UniProt 2–650 链 C； UniProt 2–650 链 E； UniProt 2–650 链 G； UniProt 2–650 未记录 Calmodulin-3 × 4 （P0DP25） 7YV (1S,2S,4R)-N-(2,4,6-trimethylphenyl)bicyclo[2.2.1]heptane-2-carboxamid × 4 K POTASSIUM ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE 分辨率 2.80 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 7VNR Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
2OVC Crystal structure of a coiled-coil tetramerization domain from Kv7.4 channels 提交 2007-02-13 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 610–640（31 aa） 片段：coiled-coil assembly domain, residues 611-640
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；289 K；45% MPD, 0.2M ammonium acetate, 0.1M Bis-Tris, pH 5.5, vapor diffusion, hanging drop, temperature 289K
分辨率 2.07 Å R-free 0.224
4GOW Crystal Structure of Ca2+/CaM:Kv7.4 (KCNQ4) B helix complex 提交 2012-08-20 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 522–593（72 aa） 片段：UNP residues 522-593
未记录 CA CALCIUM ION × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；298 K；1.6M ammonium sulfate, 0.2M sodium citrate (pH 6.0), 0.1M sodium tartrate, 4% isopropanol, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 2.60 Å R-free 0.268
6B8L Crystal Structure of the Apo/CaM:Kv7.4 (KCNQ4) AB Domain Complex 提交 2017-10-09 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 325–367（43 aa）
链 A 524–557（34 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；277 K；2M ammonium sulfate, 0.1M BisTris pH 6.5
分辨率 2.30 Å R-free 0.246
6B8L Crystal Structure of the Apo/CaM:Kv7.4 (KCNQ4) AB Domain Complex 提交 2017-10-09 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 C 325–367（43 aa）
链 C 524–557（34 aa）
未记录 SO4 SULFATE ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；277 K；2M ammonium sulfate, 0.1M BisTris pH 6.5
分辨率 2.30 Å R-free 0.246
6B8L Crystal Structure of the Apo/CaM:Kv7.4 (KCNQ4) AB Domain Complex 提交 2017-10-09 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 E 325–367（43 aa）
链 E 524–557（34 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；277 K；2M ammonium sulfate, 0.1M BisTris pH 6.5
分辨率 2.30 Å R-free 0.246
6B8L Crystal Structure of the Apo/CaM:Kv7.4 (KCNQ4) AB Domain Complex 提交 2017-10-09 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 G 325–367（43 aa）
链 G 524–557（34 aa）
未记录 SO4 SULFATE ION × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；277 K；2M ammonium sulfate, 0.1M BisTris pH 6.5
分辨率 2.30 Å R-free 0.246
6B8M Crystal Structure of the Ca2+/CaM:Kv7.4 (KCNQ4) AB Domain Complex, 1 mM CaCl2 soak 提交 2017-10-09 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 325–367（43 aa）
链 A 524–557（34 aa）
未记录 CA CALCIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；277 K；2M ammonium sulfate, 0.1M BisTris pH 6.5, 1mM CaCl2
分辨率 2.30 Å R-free 0.262
6B8M Crystal Structure of the Ca2+/CaM:Kv7.4 (KCNQ4) AB Domain Complex, 1 mM CaCl2 soak 提交 2017-10-09 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 C 325–367（43 aa）
链 C 524–557（34 aa）
未记录 CA CALCIUM ION × 1 SO4 SULFATE ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；277 K；2M ammonium sulfate, 0.1M BisTris pH 6.5, 1mM CaCl2
分辨率 2.30 Å R-free 0.262
6B8M Crystal Structure of the Ca2+/CaM:Kv7.4 (KCNQ4) AB Domain Complex, 1 mM CaCl2 soak 提交 2017-10-09 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 E 325–367（43 aa）
链 E 524–557（34 aa）
未记录 CA CALCIUM ION × 2 SO4 SULFATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；277 K；2M ammonium sulfate, 0.1M BisTris pH 6.5, 1mM CaCl2
分辨率 2.30 Å R-free 0.262
6B8M Crystal Structure of the Ca2+/CaM:Kv7.4 (KCNQ4) AB Domain Complex, 1 mM CaCl2 soak 提交 2017-10-09 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 G 325–367（43 aa）
链 G 524–557（34 aa）
未记录 CA CALCIUM ION × 2 SO4 SULFATE ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；277 K；2M ammonium sulfate, 0.1M BisTris pH 6.5, 1mM CaCl2
分辨率 2.30 Å R-free 0.262
6B8N Crystal Structure of the Ca2+/CaM:Kv7.4 (KCNQ4) AB Domain Complex, 10 uM CaCl2 soak 提交 2017-10-09 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 325–367（43 aa）
链 A 524–557（34 aa）
未记录 CA CALCIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；277 K；2M ammonium sulfate, 0.1M BisTris pH 6.5, 0.01mM CaCl2
分辨率 2.20 Å R-free 0.264
6B8N Crystal Structure of the Ca2+/CaM:Kv7.4 (KCNQ4) AB Domain Complex, 10 uM CaCl2 soak 提交 2017-10-09 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 C 325–367（43 aa）
链 C 524–557（34 aa）
未记录 CA CALCIUM ION × 1 SO4 SULFATE ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；277 K；2M ammonium sulfate, 0.1M BisTris pH 6.5, 0.01mM CaCl2
分辨率 2.20 Å R-free 0.264
6B8N Crystal Structure of the Ca2+/CaM:Kv7.4 (KCNQ4) AB Domain Complex, 10 uM CaCl2 soak 提交 2017-10-09 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 E 325–367（43 aa）
链 E 524–557（34 aa）
未记录 CA CALCIUM ION × 1 SO4 SULFATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；277 K；2M ammonium sulfate, 0.1M BisTris pH 6.5, 0.01mM CaCl2
分辨率 2.20 Å R-free 0.264
6B8N Crystal Structure of the Ca2+/CaM:Kv7.4 (KCNQ4) AB Domain Complex, 10 uM CaCl2 soak 提交 2017-10-09 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 G 325–367（43 aa）
链 G 524–557（34 aa）
未记录 CA CALCIUM ION × 1 SO4 SULFATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；277 K；2M ammonium sulfate, 0.1M BisTris pH 6.5, 0.01mM CaCl2
分辨率 2.20 Å R-free 0.264
6B8P Crystal Structure of the Mg2+/CaM:Kv7.4 (KCNQ4) AB domain complex 提交 2017-10-09 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 325–367（43 aa）
链 A 524–557（34 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；277 K；2M ammonium sulfate, 0.1M BisTris pH 6.5, 1mM MgCl2
分辨率 2.20 Å R-free 0.240
6B8P Crystal Structure of the Mg2+/CaM:Kv7.4 (KCNQ4) AB domain complex 提交 2017-10-09 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 C 325–367（43 aa）
链 C 524–557（34 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 SO4 SULFATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；277 K；2M ammonium sulfate, 0.1M BisTris pH 6.5, 1mM MgCl2
分辨率 2.20 Å R-free 0.240
6B8P Crystal Structure of the Mg2+/CaM:Kv7.4 (KCNQ4) AB domain complex 提交 2017-10-09 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 E 325–367（43 aa）
链 E 524–557（34 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 SO4 SULFATE ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；277 K；2M ammonium sulfate, 0.1M BisTris pH 6.5, 1mM MgCl2
分辨率 2.20 Å R-free 0.240
6B8P Crystal Structure of the Mg2+/CaM:Kv7.4 (KCNQ4) AB domain complex 提交 2017-10-09 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 G 325–367（43 aa）
链 G 524–557（34 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 SO4 SULFATE ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；277 K；2M ammonium sulfate, 0.1M BisTris pH 6.5, 1mM MgCl2
分辨率 2.20 Å R-free 0.240
6N5W Crystal structure of the Ca2+/CaM complex with independent peptides of Kv7.4 (KCNQ4) A & B domains 提交 2018-11-22 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 336–362（27 aa）
链 B 470–495（26 aa）
未记录 CA CALCIUM ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；295 K；1.3 M sodium citrate, 0.1 M HEPES pH 7.0
分辨率 2.15 Å R-free 0.274
7BYL Cryo-EM structure of human KCNQ4 提交 2020-04-23 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 A 1–695（695 aa）
链 C 1–695（695 aa）
链 E 1–695（695 aa）
链 G 1–695（695 aa）
突变：F64L/S65T/K107T/A206K 突变：F64L/S65T/K107T/A206K 突变：F64L/S65T/K107T/A206K 突变：F64L/S65T/K107T/A206K PT5 [(2R)-1-octadecanoyloxy-3-[oxidanyl-[(1R,2R,3S,4R,5R,6S)-2,3,6-tris(oxidanyl)-4,5-diphosphonooxy-cyclohexyl]oxy-phospho ryl]oxy-propan-2-yl] (8Z)-icosa-5,8,11,14-tetraenoate × 4 K POTASSIUM ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.50 Å
7BYM Cryo-EM structure of human KCNQ4 with retigabine 提交 2020-04-23 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 A 1–695（695 aa）
链 C 1–695（695 aa）
链 E 1–695（695 aa）
链 G 1–695（695 aa）
突变：F64L/S65T/K107T/A206K/H231L 突变：F64L/S65T/K107T/A206K/H231L 突变：F64L/S65T/K107T/A206K/H231L 突变：F64L/S65T/K107T/A206K/H231L PT5 [(2R)-1-octadecanoyloxy-3-[oxidanyl-[(1R,2R,3S,4R,5R,6S)-2,3,6-tris(oxidanyl)-4,5-diphosphonooxy-cyclohexyl]oxy-phospho ryl]oxy-propan-2-yl] (8Z)-icosa-5,8,11,14-tetraenoate × 4 FBX ethyl N-[2-azanyl-4-[(4-fluorophenyl)methylamino]phenyl]carbamate × 4 K POTASSIUM ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
7BYN Cryo-EM structure of human KCNQ4 with linopirdine 提交 2020-04-23 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 A 1–695（695 aa）
链 C 1–695（695 aa）
链 E 1–695（695 aa）
链 G 1–695（695 aa）
突变：F64L/S65T/K107T/A206K/H231L 突变：F64L/S65T/K107T/A206K/H231L 突变：F64L/S65T/K107T/A206K/H231L 突变：F64L/S65T/K107T/A206K/H231L PT5 [(2R)-1-octadecanoyloxy-3-[oxidanyl-[(1R,2R,3S,4R,5R,6S)-2,3,6-tris(oxidanyl)-4,5-diphosphonooxy-cyclohexyl]oxy-phospho ryl]oxy-propan-2-yl] (8Z)-icosa-5,8,11,14-tetraenoate × 4 K POTASSIUM ION × 3 FCC 1-phenyl-3,3-bis(pyridin-4-ylmethyl)indol-2-one × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
7VNP Structure of human KCNQ4-ML213 complex with PIP2 提交 2021-10-11 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 A 2–650（649 aa）
链 C 2–650（649 aa）
链 E 2–650（649 aa）
链 G 2–650（649 aa）
未记录 PT5 [(2R)-1-octadecanoyloxy-3-[oxidanyl-[(1R,2R,3S,4R,5R,6S)-2,3,6-tris(oxidanyl)-4,5-diphosphonooxy-cyclohexyl]oxy-phospho ryl]oxy-propan-2-yl] (8Z)-icosa-5,8,11,14-tetraenoate × 8 K POTASSIUM ION × 4 7YV (1S,2S,4R)-N-(2,4,6-trimethylphenyl)bicyclo[2.2.1]heptane-2-carboxamid × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.79 Å
7VNQ Structure of human KCNQ4-ML213 complex in nanodisc 提交 2021-10-11 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 A 2–650（649 aa）
链 C 2–650（649 aa）
链 E 2–650（649 aa）
链 G 2–650（649 aa）
未记录 7YV (1S,2S,4R)-N-(2,4,6-trimethylphenyl)bicyclo[2.2.1]heptane-2-carboxamid × 4 K POTASSIUM ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.96 Å

共 12 个其他 PDB 条目、24 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 KCNQ4_HUMAN
Isoform —
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A； PDB构建体 10–658； UniProt 2–650 作者链 C； PDB构建体 10–658； UniProt 2–650 作者链 E； PDB构建体 10–658； UniProt 2–650 作者链 G； PDB构建体 10–658； UniProt 2–650

Calmodulin-3

Homo sapiens

UniProt P0DP25

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 信息不足 异源复合物 蛋白 × 8 PDB 声明：octameric（8） 与蛋白拷贝数一致 链 B； UniProt 1–149 链 D； UniProt 1–149 链 F； UniProt 1–149 链 H； UniProt 1–149 未记录 Potassium voltage-gated channel subfamily KQT member 4,Maltodextrin-binding protein × 4 （P56696,A0A140NCD0） 7YV (1S,2S,4R)-N-(2,4,6-trimethylphenyl)bicyclo[2.2.1]heptane-2-carboxamid × 4 K POTASSIUM ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE 分辨率 2.80 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 7VNR Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
7BYL Cryo-EM structure of human KCNQ4 提交 2020-04-23 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 B 1–149（149 aa）
链 D 1–149（149 aa）
链 F 1–149（149 aa）
链 H 1–149（149 aa）
未记录 PT5 [(2R)-1-octadecanoyloxy-3-[oxidanyl-[(1R,2R,3S,4R,5R,6S)-2,3,6-tris(oxidanyl)-4,5-diphosphonooxy-cyclohexyl]oxy-phospho ryl]oxy-propan-2-yl] (8Z)-icosa-5,8,11,14-tetraenoate × 4 K POTASSIUM ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.50 Å
7BYM Cryo-EM structure of human KCNQ4 with retigabine 提交 2020-04-23 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 B 1–149（149 aa）
链 D 1–149（149 aa）
链 F 1–149（149 aa）
链 H 1–149（149 aa）
未记录 PT5 [(2R)-1-octadecanoyloxy-3-[oxidanyl-[(1R,2R,3S,4R,5R,6S)-2,3,6-tris(oxidanyl)-4,5-diphosphonooxy-cyclohexyl]oxy-phospho ryl]oxy-propan-2-yl] (8Z)-icosa-5,8,11,14-tetraenoate × 4 FBX ethyl N-[2-azanyl-4-[(4-fluorophenyl)methylamino]phenyl]carbamate × 4 K POTASSIUM ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
7BYN Cryo-EM structure of human KCNQ4 with linopirdine 提交 2020-04-23 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 B 1–149（149 aa）
链 D 1–149（149 aa）
链 F 1–149（149 aa）
链 H 1–149（149 aa）
未记录 PT5 [(2R)-1-octadecanoyloxy-3-[oxidanyl-[(1R,2R,3S,4R,5R,6S)-2,3,6-tris(oxidanyl)-4,5-diphosphonooxy-cyclohexyl]oxy-phospho ryl]oxy-propan-2-yl] (8Z)-icosa-5,8,11,14-tetraenoate × 4 K POTASSIUM ION × 3 FCC 1-phenyl-3,3-bis(pyridin-4-ylmethyl)indol-2-one × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
7CR3 human KCNQ2-CaM in apo state 提交 2020-08-12 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 C 1–149（149 aa）
链 E 1–149（149 aa）
链 F 1–149（149 aa）
链 H 1–149（149 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
7CR4 human KCNQ2-CaM in complex with ztz240 提交 2020-08-12 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 C 1–149（149 aa）
链 E 1–149（149 aa）
链 G 1–149（149 aa）
链 H 1–149（149 aa）
未记录 GB9 N-(6-chloranylpyridin-3-yl)-4-fluoranyl-benzamide × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.90 Å
7CR7 human KCNQ2-CaM in complex with retigabine 提交 2020-08-12 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 C 1–149（149 aa）
链 E 1–149（149 aa）
链 F 1–149（149 aa）
链 H 1–149（149 aa）
未记录 FBX ethyl N-[2-azanyl-4-[(4-fluorophenyl)methylamino]phenyl]carbamate × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.70 Å
7VNP Structure of human KCNQ4-ML213 complex with PIP2 提交 2021-10-11 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 B 1–149（149 aa）
链 D 1–149（149 aa）
链 F 1–149（149 aa）
链 H 1–149（149 aa）
未记录 PT5 [(2R)-1-octadecanoyloxy-3-[oxidanyl-[(1R,2R,3S,4R,5R,6S)-2,3,6-tris(oxidanyl)-4,5-diphosphonooxy-cyclohexyl]oxy-phospho ryl]oxy-propan-2-yl] (8Z)-icosa-5,8,11,14-tetraenoate × 8 K POTASSIUM ION × 4 7YV (1S,2S,4R)-N-(2,4,6-trimethylphenyl)bicyclo[2.2.1]heptane-2-carboxamid × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.79 Å
7VNQ Structure of human KCNQ4-ML213 complex in nanodisc 提交 2021-10-11 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 B 1–149（149 aa）
链 D 1–149（149 aa）
链 F 1–149（149 aa）
链 H 1–149（149 aa）
未记录 7YV (1S,2S,4R)-N-(2,4,6-trimethylphenyl)bicyclo[2.2.1]heptane-2-carboxamid × 4 K POTASSIUM ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.96 Å
7XNI human KCNQ1-CaM in apo state 提交 2022-04-28 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 C 1–149（149 aa）
链 E 1–149（149 aa）
链 F 1–149（149 aa）
链 H 1–149（149 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.50 Å
7XNK human KCNQ1-CaM in complex with ML277 提交 2022-04-29 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 B 1–149（149 aa）
链 D 1–149（149 aa）
链 F 1–149（149 aa）
链 H 1–149（149 aa）
未记录 K POTASSIUM ION × 4 I0S (2R)-N-[4-(4-methoxyphenyl)-1,3-thiazol-2-yl]-1-(4-methylbenzene-1-sulfonyl)piperidine-2-carboxamide × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.60 Å
7XNL human KCNQ1-CaM-ML277-PIP2 complex in state A 提交 2022-04-29 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 B 1–149（149 aa）
链 D 1–149（149 aa）
链 F 1–149（149 aa）
链 H 1–149（149 aa）
未记录 K POTASSIUM ION × 4 I0S (2R)-N-[4-(4-methoxyphenyl)-1,3-thiazol-2-yl]-1-(4-methylbenzene-1-sulfonyl)piperidine-2-carboxamide × 4 PIO [(2R)-2-octanoyloxy-3-[oxidanyl-[(1R,2R,3S,4R,5R,6S)-2,3,6-tris(oxidanyl)-4,5-diphosphonooxy-cyclohexyl]oxy-phosphoryl]oxy-propyl] octanoate × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
7XNN human KCNQ1-CaM-ML277-PIP2 complex in state B 提交 2022-04-29 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 A 1–149（149 aa）
链 D 1–149（149 aa）
链 F 1–149（149 aa）
链 H 1–149（149 aa）
未记录 K POTASSIUM ION × 4 I0S (2R)-N-[4-(4-methoxyphenyl)-1,3-thiazol-2-yl]-1-(4-methylbenzene-1-sulfonyl)piperidine-2-carboxamide × 4 PIO [(2R)-2-octanoyloxy-3-[oxidanyl-[(1R,2R,3S,4R,5R,6S)-2,3,6-tris(oxidanyl)-4,5-diphosphonooxy-cyclohexyl]oxy-phosphoryl]oxy-propyl] octanoate × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.50 Å
8BD2 Calcium-bound Calmodulin variant G113R 提交 2022-10-18 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 2–149（148 aa）
未记录 CA CALCIUM ION × 2 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 6.69；298.1 K；离子强度（mmCIF原始值）127；压力 1
NMR样品组成 100 mM potassium chloride, 5 mM calcium chloride, 2 mM sodium azide, 20 mM HEPES, 0.1 mM 2,2,3,3-tetradeutero TSP-d4, 1 mM (Ser81-Lys148-U-15N,13C) Calmodulin G113R, 95% H2O/5% D2O | 95% H2O/5% D2O
分辨率未提供
8Z5M human phosphorylase kinase alpha/gamma/delta subcomplex - inactive state 提交 2024-04-18 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 D 1–149（149 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.66 Å
8Z5P human phosphorylase kinase - inactive state 提交 2024-04-18 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 D 1–149（149 aa）
链 H 1–149（149 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.41 Å
8Z5Q human phosphorylase kinase - inactive state 提交 2024-04-18 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric
链 D 1–149（149 aa）
链 H 1–149（149 aa）
链 L 1–149（149 aa）
链 P 1–149（149 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.24 Å
8Z5R human phosphorylase kinase alpha/gamma/delta subcomplex - phosphorylation and Ca2+ bound state 提交 2024-04-18 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 D 1–149（149 aa）
未记录 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.52 Å
8Z5T human phosphorylase kinase - phosphorylation and Ca2+ bound state 提交 2024-04-18 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric
链 D 1–149（149 aa）
链 H 1–149（149 aa）
链 L 1–149（149 aa）
链 P 1–149（149 aa）
未记录 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.74 Å
9IXY Human KCNQ2-CaM-Ebio2 Complex in the Presence of PIP2 提交 2024-07-29 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 E 1–149（149 aa）
链 F 1–149（149 aa）
链 G 1–149（149 aa）
链 H 1–149（149 aa）
未记录 A1L3C ~{N}-[7-[bis(fluoranyl)methoxy]-1-prop-2-ynyl-indazol-3-yl]-3,3-dimethyl-butanamide × 4 PIO [(2R)-2-octanoyloxy-3-[oxidanyl-[(1R,2R,3S,4R,5R,6S)-2,3,6-tris(oxidanyl)-4,5-diphosphonooxy-cyclohexyl]oxy-phosphoryl]oxy-propyl] octanoate × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
9LIZ Human KCNQ5-CaM in complex with PIP2 提交 2025-01-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 C 1–149（149 aa）
链 E 1–149（149 aa）
链 F 1–149（149 aa）
链 H 1–149（149 aa）
未记录 PIO [(2R)-2-octanoyloxy-3-[oxidanyl-[(1R,2R,3S,4R,5R,6S)-2,3,6-tris(oxidanyl)-4,5-diphosphonooxy-cyclohexyl]oxy-phosphoryl]oxy-propyl] octanoate × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
9LJ1 Human KCNQ5-CaM-PIP2-HN37 complex in a closed conformation. 提交 2025-01-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 C 1–149（149 aa）
链 E 1–149（149 aa）
链 F 1–149（149 aa）
链 H 1–149（149 aa）
未记录 9MF methyl N-[4-[(4-fluorophenyl)methyl-prop-2-ynyl-amino]-2,6-dimethyl-phenyl]carbamate × 4 PIO [(2R)-2-octanoyloxy-3-[oxidanyl-[(1R,2R,3S,4R,5R,6S)-2,3,6-tris(oxidanyl)-4,5-diphosphonooxy-cyclohexyl]oxy-phosphoryl]oxy-propyl] octanoate × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
9LJ5 Human KCNQ5-CaM-PIP2-HN37 complex in an open conformation. 提交 2025-01-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 C 1–149（149 aa）
链 E 1–149（149 aa）
链 F 1–149（149 aa）
链 H 1–149（149 aa）
未记录 PIO [(2R)-2-octanoyloxy-3-[oxidanyl-[(1R,2R,3S,4R,5R,6S)-2,3,6-tris(oxidanyl)-4,5-diphosphonooxy-cyclohexyl]oxy-phosphoryl]oxy-propyl] octanoate × 8 9MF methyl N-[4-[(4-fluorophenyl)methyl-prop-2-ynyl-amino]-2,6-dimethyl-phenyl]carbamate × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å

共 22 个其他 PDB 条目、22 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 CALM3_HUMAN
Isoform —
PDB实体 2
链与序列区间 作者链 B； PDB构建体 1–149； UniProt 1–149 作者链 D； PDB构建体 1–149； UniProt 1–149 作者链 F； PDB构建体 1–149； UniProt 1–149 作者链 H； PDB构建体 1–149； UniProt 1–149

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

SAXS profile for 7vnr

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

P(r) distribution for 7vnr
下载 Download
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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id7vnr
沉积日期 deposition_date2021-10-11
结构标题 titleStructure of human KCNQ4-ML213 complex in digitonin
关键词 keywordsKCNQ4, ML213, cryo-EM, digitonin, MEMBRANE PROTEIN; MEMBRANE PROTEIN
实验方法 methodELECTRON MICROSCOPY
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3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier41.71 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron40.77 Å
零角强度 I(0) i0654739000.00
分子量 molecular_weight217710.0 kDa
排除体积 excluded_volume275510 ų
包络体积 envelope_volume391650 ų
水化壳体积 shell_volume76707 ų
包络直径 envelope_diameter119.9 Å
壳层 Rg shell_rg49.49 Å
包络 Rg envelope_rg39.66 Å
形状 Rg shape_rg40.74 Å
总 Rg total_rg41.32 Å
总原子数 total_atoms15435
残基数 n_residues1896
球谐函数阶数 n_harmonics20
q 范围 q_range— – 0.5000 Å−1
数据点数 n_points101
壳层类型 shell_typedirectional
溶剂电子密度 solvent_density0.3340 e/ų
壳层衬度 contrast_shell0.0300 e/ų
CRYSOL 版本 crysol_version4.1.3
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4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax124.1 Å
Rg (实空间) rg_real41.40 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error0.66 Å
I(0) (实空间) i0_real6.5470e+08
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error1.0260e+07
Rg (倒空间) rg_reciprocal41.70 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal655000000.0000
解质量估计 total_estimate0.5984
解质量评级 solution_quality REASONABLE a REASONABLE solution
P(r) 峰数 n_peaks1
主峰位置 r_peak_primary55.5 Å
偏度 Skewness skewness-0.028
峰度 Kurtosis kurtosis-0.555
角度范围 angular_range— – 0.1900 Å−1
当前正则化参数 α current_alpha0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha49050000.0000
实空间数据点数 n_real_points39
GNOM 版本 gnom_version4.1.3
质量判据 quality_criteria AN1: 0.000; Oscil: 0.930; Stabil: 1.000; Sysdev: 0.008; Positv: 1.000; Valcen: 0.959; Smooth: 0.000
▶

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

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6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (4)

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7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 4 domains

CATH v4.4 (4 domains)

结构域编号 domain_id7vnrB01
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology238 — Recoverin; domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — EF-hand
结构域编号 domain_id7vnrD01
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology238 — Recoverin; domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — EF-hand
结构域编号 domain_id7vnrF01
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology238 — Recoverin; domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — EF-hand
结构域编号 domain_id7vnrH01
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology238 — Recoverin; domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — EF-hand
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8. 引用文献 (1)

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9. 文件与曲线 (10)