7ylw

yeast TRiC-plp2-tubulin complex at S3 closed TRiC state

Method: ELECTRON MICROSCOPY
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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

T-complex protein 1 subunit alpha

Saccharomyces cerevisiae

UniProt P12612

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 18 T-complex protein 1 subunit beta × 2 (P39076) T-complex protein 1 subunit delta × 2 (P39078) T-complex protein 1 subunit epsilon × 2 (P40413) T-complex protein 1 subunit gamma × 2 (P39077) T-complex protein 1 subunit eta × 2 (P42943) T-complex protein 1 subunit theta × 2 (P47079) Tubulin beta chain × 1 (A0A6A5PXT5) T-complex protein 1 subunit zeta × 2 (P39079) Phosducin-like protein 2 × 1 (Q12017) ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 16 MAGNESIUM ION × 16 ALUMINUM FLUORIDE × 14 GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 water × 14 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 TCPA_YEAST
Isoform —
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A; PDB构建体 1–559; UniProt 1–559 作者链 a; PDB构建体 1–559; UniProt 1–559

T-complex protein 1 subunit beta

Saccharomyces cerevisiae

UniProt P39076

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 18 T-complex protein 1 subunit alpha × 2 (P12612) T-complex protein 1 subunit delta × 2 (P39078) T-complex protein 1 subunit epsilon × 2 (P40413) T-complex protein 1 subunit gamma × 2 (P39077) T-complex protein 1 subunit eta × 2 (P42943) T-complex protein 1 subunit theta × 2 (P47079) Tubulin beta chain × 1 (A0A6A5PXT5) T-complex protein 1 subunit zeta × 2 (P39079) Phosducin-like protein 2 × 1 (Q12017) ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 16 MAGNESIUM ION × 16 ALUMINUM FLUORIDE × 14 GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 water × 14 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 TCPB_YEAST
Isoform —
PDB实体 2
链与序列区间 作者链 B; PDB构建体 1–527; UniProt 1–527 作者链 b; PDB构建体 1–527; UniProt 1–527

T-complex protein 1 subunit delta

Saccharomyces cerevisiae

UniProt P39078

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 18 T-complex protein 1 subunit alpha × 2 (P12612) T-complex protein 1 subunit beta × 2 (P39076) T-complex protein 1 subunit epsilon × 2 (P40413) T-complex protein 1 subunit gamma × 2 (P39077) T-complex protein 1 subunit eta × 2 (P42943) T-complex protein 1 subunit theta × 2 (P47079) Tubulin beta chain × 1 (A0A6A5PXT5) T-complex protein 1 subunit zeta × 2 (P39079) Phosducin-like protein 2 × 1 (Q12017) ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 16 MAGNESIUM ION × 16 ALUMINUM FLUORIDE × 14 GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 water × 14 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 TCPD_YEAST
Isoform —
PDB实体 3
链与序列区间 作者链 D; PDB构建体 1–528; UniProt 1–528 作者链 d; PDB构建体 1–528; UniProt 1–528

T-complex protein 1 subunit epsilon

Saccharomyces cerevisiae

UniProt P40413

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 18 T-complex protein 1 subunit alpha × 2 (P12612) T-complex protein 1 subunit beta × 2 (P39076) T-complex protein 1 subunit delta × 2 (P39078) T-complex protein 1 subunit gamma × 2 (P39077) T-complex protein 1 subunit eta × 2 (P42943) T-complex protein 1 subunit theta × 2 (P47079) Tubulin beta chain × 1 (A0A6A5PXT5) T-complex protein 1 subunit zeta × 2 (P39079) Phosducin-like protein 2 × 1 (Q12017) ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 16 MAGNESIUM ION × 16 ALUMINUM FLUORIDE × 14 GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 water × 14 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 TCPE_YEAST
Isoform —
PDB实体 4
链与序列区间 作者链 E; PDB构建体 1–562; UniProt 1–562 作者链 e; PDB构建体 1–562; UniProt 1–562

T-complex protein 1 subunit gamma

Saccharomyces cerevisiae

UniProt P39077

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 18 T-complex protein 1 subunit alpha × 2 (P12612) T-complex protein 1 subunit beta × 2 (P39076) T-complex protein 1 subunit delta × 2 (P39078) T-complex protein 1 subunit epsilon × 2 (P40413) T-complex protein 1 subunit eta × 2 (P42943) T-complex protein 1 subunit theta × 2 (P47079) Tubulin beta chain × 1 (A0A6A5PXT5) T-complex protein 1 subunit zeta × 2 (P39079) Phosducin-like protein 2 × 1 (Q12017) ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 16 MAGNESIUM ION × 16 ALUMINUM FLUORIDE × 14 GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 water × 14 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称 TCPG_YEAST
Isoform —
PDB实体 5
链与序列区间 作者链 G; PDB构建体 1–374; UniProt 1–374 作者链 G; PDB构建体 436–594; UniProt 376–534 作者链 g; PDB构建体 1–374; UniProt 1–374 作者链 g; PDB构建体 436–594; UniProt 376–534

T-complex protein 1 subunit eta

Saccharomyces cerevisiae

UniProt P42943

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 18 T-complex protein 1 subunit alpha × 2 (P12612) T-complex protein 1 subunit beta × 2 (P39076) T-complex protein 1 subunit delta × 2 (P39078) T-complex protein 1 subunit epsilon × 2 (P40413) T-complex protein 1 subunit gamma × 2 (P39077) T-complex protein 1 subunit theta × 2 (P47079) Tubulin beta chain × 1 (A0A6A5PXT5) T-complex protein 1 subunit zeta × 2 (P39079) Phosducin-like protein 2 × 1 (Q12017) ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 16 MAGNESIUM ION × 16 ALUMINUM FLUORIDE × 14 GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 water × 14 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称 TCPH_YEAST
Isoform —
PDB实体 6
链与序列区间 作者链 H; PDB构建体 1–550; UniProt 1–550 作者链 h; PDB构建体 1–550; UniProt 1–550

T-complex protein 1 subunit theta

Saccharomyces cerevisiae

UniProt P47079

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 18 T-complex protein 1 subunit alpha × 2 (P12612) T-complex protein 1 subunit beta × 2 (P39076) T-complex protein 1 subunit delta × 2 (P39078) T-complex protein 1 subunit epsilon × 2 (P40413) T-complex protein 1 subunit gamma × 2 (P39077) T-complex protein 1 subunit eta × 2 (P42943) Tubulin beta chain × 1 (A0A6A5PXT5) T-complex protein 1 subunit zeta × 2 (P39079) Phosducin-like protein 2 × 1 (Q12017) ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 16 MAGNESIUM ION × 16 ALUMINUM FLUORIDE × 14 GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 water × 14 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称 TCPQ_YEAST
Isoform —
PDB实体 7
链与序列区间 作者链 Q; PDB构建体 1–568; UniProt 1–568 作者链 q; PDB构建体 1–568; UniProt 1–568

Tubulin beta chain

Saccharomyces cerevisiae

UniProt A0A6A5PXT5

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 18 T-complex protein 1 subunit alpha × 2 (P12612) T-complex protein 1 subunit beta × 2 (P39076) T-complex protein 1 subunit delta × 2 (P39078) T-complex protein 1 subunit epsilon × 2 (P40413) T-complex protein 1 subunit gamma × 2 (P39077) T-complex protein 1 subunit eta × 2 (P42943) T-complex protein 1 subunit theta × 2 (P47079) T-complex protein 1 subunit zeta × 2 (P39079) Phosducin-like protein 2 × 1 (Q12017) ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 16 MAGNESIUM ION × 16 ALUMINUM FLUORIDE × 14 GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 water × 14 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称 A0A6A5PXT5_YEASX
Isoform —
PDB实体 8
链与序列区间 作者链 T; PDB构建体 1–457; UniProt 1–457

T-complex protein 1 subunit zeta

Saccharomyces cerevisiae

UniProt P39079

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 18 T-complex protein 1 subunit alpha × 2 (P12612) T-complex protein 1 subunit beta × 2 (P39076) T-complex protein 1 subunit delta × 2 (P39078) T-complex protein 1 subunit epsilon × 2 (P40413) T-complex protein 1 subunit gamma × 2 (P39077) T-complex protein 1 subunit eta × 2 (P42943) T-complex protein 1 subunit theta × 2 (P47079) Tubulin beta chain × 1 (A0A6A5PXT5) Phosducin-like protein 2 × 1 (Q12017) ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 16 MAGNESIUM ION × 16 ALUMINUM FLUORIDE × 14 GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 water × 14 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称 TCPZ_YEAST
Isoform —
PDB实体 9
链与序列区间 作者链 Z; PDB构建体 1–546; UniProt 1–546 作者链 z; PDB构建体 1–546; UniProt 1–546

Phosducin-like protein 2

Saccharomyces cerevisiae

UniProt Q12017

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 18 T-complex protein 1 subunit alpha × 2 (P12612) T-complex protein 1 subunit beta × 2 (P39076) T-complex protein 1 subunit delta × 2 (P39078) T-complex protein 1 subunit epsilon × 2 (P40413) T-complex protein 1 subunit gamma × 2 (P39077) T-complex protein 1 subunit eta × 2 (P42943) T-complex protein 1 subunit theta × 2 (P47079) Tubulin beta chain × 1 (A0A6A5PXT5) T-complex protein 1 subunit zeta × 2 (P39079) ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 16 MAGNESIUM ION × 16 ALUMINUM FLUORIDE × 14 GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 water × 14 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称 PLP2_YEAST
Isoform —
PDB实体 10
链与序列区间 作者链 p; PDB构建体 1–286; UniProt 1–286

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中;数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护,因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id7ylw
沉积日期 deposition_date2022-07-27
结构标题 titleyeast TRiC-plp2-tubulin complex at S3 closed TRiC state
关键词 keywordsTRiC/CCT, tubulin, phosducin-like protein, CHAPERONE; CHAPERONE
实验方法 methodELECTRON MICROSCOPY
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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

7ylw__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

7ylw__assembly_1__model_1 | I(q)

10-2 10-1 106 107 108 109 1010 q (1/Angstrom) I(q)
100 个绘图点;横轴和纵轴均采用对数尺度。

7ylw__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

新版 assembly/model P(r) 尚未计算 此处仅保留位置,不展示旧数据 r (Angstrom) P(r)
P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。
Rg(Guinier)65.00 Å
Rg(电子密度)63.96 Å
总 Rg64.13 Å
原子数70324
残基数9105
排除体积1257900 ų
最大 q0.500 Å⁻¹
Assembly Model 结构单元 聚集说明 状态 CRYSOL 操作
1 1 7ylw__assembly_1__model_1 octadecameric (18) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (15)

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6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 12 domains

CATH v4.4 (12 domains)

结构域编号 domain_id7ylwB01
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture50 — 3-Layer(bba) Sandwich
拓扑 Topology topology7 — GroEL
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — GroEL
结构域编号 domain_id7ylwD01
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture50 — 3-Layer(bba) Sandwich
拓扑 Topology topology7 — GroEL
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — GroEL
结构域编号 domain_id7ylwH01
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture50 — 3-Layer(bba) Sandwich
拓扑 Topology topology7 — GroEL
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — GroEL
结构域编号 domain_id7ylwQ01
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture50 — 3-Layer(bba) Sandwich
拓扑 Topology topology7 — GroEL
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — GroEL
结构域编号 domain_id7ylwT01
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology50 — Rossmann fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily1440 — Tubulin/FtsZ, GTPase domain
结构域编号 domain_id7ylwT02
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology1330 — 60s Ribosomal Protein L30; Chain: A;
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily20 — Tubulin/FtsZ, C-terminal domain
结构域编号 domain_id7ylwT03
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology287 — Helix Hairpins
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily600 — Helix hairpin bin
结构域编号 domain_id7ylwa01
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture50 — 3-Layer(bba) Sandwich
拓扑 Topology topology7 — GroEL
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — GroEL
结构域编号 domain_id7ylwb01
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture50 — 3-Layer(bba) Sandwich
拓扑 Topology topology7 — GroEL
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — GroEL
结构域编号 domain_id7ylwd01
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture50 — 3-Layer(bba) Sandwich
拓扑 Topology topology7 — GroEL
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — GroEL
结构域编号 domain_id7ylwh01
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology260 — GROEL; domain 2
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — TCP-1-like chaperonin intermediate domain
结构域编号 domain_id7ylwq01
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture50 — 3-Layer(bba) Sandwich
拓扑 Topology topology7 — GroEL
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — GroEL
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7. 引用文献 (1)