7yq2

Crystal structure of photosystem II expressing psbA2 gene only

Method: X-RAY DIFFRACTION

▼

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Photosystem II protein D1 2

物种未注明

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 39	Photosystem II CP47 reaction center protein × 2 （Q8DIQ1） Photosystem II CP43 reaction center protein × 2 （Q8DIF8） Photosystem II D2 protein × 2 （Q8CM25） Cytochrome b559 subunit alpha × 2 （Q8DIP0） Cytochrome b559 subunit beta × 2 （Q8DIN9） Photosystem II reaction center protein H × 2 （Q8DJ43） Photosystem II reaction center protein I × 2 （Q8DJZ6） Photosystem II reaction center protein J × 2 （P59087） Photosystem II reaction center protein K × 2 （Q9F1K9） Photosystem II reaction center protein L × 2 （Q8DIN8） Photosystem II reaction center protein M × 2 （Q8DHA7） Photosystem II manganese-stabilizing polypeptide × 2 （P0A431） Photosystem II reaction center protein T × 2 （Q8DIQ0） Photosystem II 12 kDa extrinsic protein × 2 （Q9F1L5） Cytochrome c-550 × 2 （P0A386） Photosystem II reaction center protein Ycf12 × 2 （Q8DJI1） Photosystem II reaction center X protein × 2 （Q9F1R6） Photosystem II reaction center protein Z × 2 （Q8DHJ2） Photosystem II protein Y × 1 （Q8DKM3） CA-MN4-O5 CLUSTER × 2 FE (II) ION × 2 CHLORIDE ION × 4 CHLOROPHYLL A × 70 PHEOPHYTIN A × 4 BETA-CAROTENE × 20 1,2-DI-O-ACYL-3-O-[6-DEOXY-6-SULFO-ALPHA-D-GLUCOPYRANOSYL]-SN-GLYCEROL × 8 1,2-DISTEAROYL-MONOGALACTOSYL-DIGLYCERIDE × 10 ;2,3-DIMETHYL-5-(3,7,11,15,19,23,27,31,35-NONAMETHYL-2,6,10,14,18,22,26,30,34-HEXATRIACONTANONAENYL-2,5-CYCLOHEXADIENE-1,4-DIONE-2,3-DIMETHYL-5-SOLANESYL-1,4-BENZOQUINONE ; × 4 UNKNOWN LIGAND × 77 DODECYL-BETA-D-MALTOSIDE × 19 GLYCEROL × 10 BICARBONATE ION × 3 DIMETHYL SULFOXIDE × 116 CALCIUM ION × 7 heptyl 1-thio-beta-D-glucopyranoside × 31 DIGALACTOSYL DIACYL GLYCEROL (DGDG) × 10 1,2-DIPALMITOYL-PHOSPHATIDYL-GLYCEROLE × 9 PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 2 (3R)-beta,beta-caroten-3-ol × 2 MAGNESIUM ION × 2 HEME C × 2 water × 38	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	PSBA2_THEEB
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–360； UniProt 1–360 作者链 a； PDB构建体 1–360； UniProt 1–360

Photosystem II CP47 reaction center protein

物种未注明

UniProt Q8DIQ1

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 39	Photosystem II protein D1 2 × 2 （P0A446） Photosystem II CP43 reaction center protein × 2 （Q8DIF8） Photosystem II D2 protein × 2 （Q8CM25） Cytochrome b559 subunit alpha × 2 （Q8DIP0） Cytochrome b559 subunit beta × 2 （Q8DIN9） Photosystem II reaction center protein H × 2 （Q8DJ43） Photosystem II reaction center protein I × 2 （Q8DJZ6） Photosystem II reaction center protein J × 2 （P59087） Photosystem II reaction center protein K × 2 （Q9F1K9） Photosystem II reaction center protein L × 2 （Q8DIN8） Photosystem II reaction center protein M × 2 （Q8DHA7） Photosystem II manganese-stabilizing polypeptide × 2 （P0A431） Photosystem II reaction center protein T × 2 （Q8DIQ0） Photosystem II 12 kDa extrinsic protein × 2 （Q9F1L5） Cytochrome c-550 × 2 （P0A386） Photosystem II reaction center protein Ycf12 × 2 （Q8DJI1） Photosystem II reaction center X protein × 2 （Q9F1R6） Photosystem II reaction center protein Z × 2 （Q8DHJ2） Photosystem II protein Y × 1 （Q8DKM3） CA-MN4-O5 CLUSTER × 2 FE (II) ION × 2 CHLORIDE ION × 4 CHLOROPHYLL A × 70 PHEOPHYTIN A × 4 BETA-CAROTENE × 20 1,2-DI-O-ACYL-3-O-[6-DEOXY-6-SULFO-ALPHA-D-GLUCOPYRANOSYL]-SN-GLYCEROL × 8 1,2-DISTEAROYL-MONOGALACTOSYL-DIGLYCERIDE × 10 ;2,3-DIMETHYL-5-(3,7,11,15,19,23,27,31,35-NONAMETHYL-2,6,10,14,18,22,26,30,34-HEXATRIACONTANONAENYL-2,5-CYCLOHEXADIENE-1,4-DIONE-2,3-DIMETHYL-5-SOLANESYL-1,4-BENZOQUINONE ; × 4 UNKNOWN LIGAND × 77 DODECYL-BETA-D-MALTOSIDE × 19 GLYCEROL × 10 BICARBONATE ION × 3 DIMETHYL SULFOXIDE × 116 CALCIUM ION × 7 heptyl 1-thio-beta-D-glucopyranoside × 31 DIGALACTOSYL DIACYL GLYCEROL (DGDG) × 10 1,2-DIPALMITOYL-PHOSPHATIDYL-GLYCEROLE × 9 PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 2 (3R)-beta,beta-caroten-3-ol × 2 MAGNESIUM ION × 2 HEME C × 2 water × 38	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	PSBB_THEEB
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 B； PDB构建体 1–510； UniProt 1–510 作者链 b； PDB构建体 1–510； UniProt 1–510

Photosystem II CP43 reaction center protein

物种未注明

UniProt Q8DIF8

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 39	Photosystem II protein D1 2 × 2 （P0A446） Photosystem II CP47 reaction center protein × 2 （Q8DIQ1） Photosystem II D2 protein × 2 （Q8CM25） Cytochrome b559 subunit alpha × 2 （Q8DIP0） Cytochrome b559 subunit beta × 2 （Q8DIN9） Photosystem II reaction center protein H × 2 （Q8DJ43） Photosystem II reaction center protein I × 2 （Q8DJZ6） Photosystem II reaction center protein J × 2 （P59087） Photosystem II reaction center protein K × 2 （Q9F1K9） Photosystem II reaction center protein L × 2 （Q8DIN8） Photosystem II reaction center protein M × 2 （Q8DHA7） Photosystem II manganese-stabilizing polypeptide × 2 （P0A431） Photosystem II reaction center protein T × 2 （Q8DIQ0） Photosystem II 12 kDa extrinsic protein × 2 （Q9F1L5） Cytochrome c-550 × 2 （P0A386） Photosystem II reaction center protein Ycf12 × 2 （Q8DJI1） Photosystem II reaction center X protein × 2 （Q9F1R6） Photosystem II reaction center protein Z × 2 （Q8DHJ2） Photosystem II protein Y × 1 （Q8DKM3） CA-MN4-O5 CLUSTER × 2 FE (II) ION × 2 CHLORIDE ION × 4 CHLOROPHYLL A × 70 PHEOPHYTIN A × 4 BETA-CAROTENE × 20 1,2-DI-O-ACYL-3-O-[6-DEOXY-6-SULFO-ALPHA-D-GLUCOPYRANOSYL]-SN-GLYCEROL × 8 1,2-DISTEAROYL-MONOGALACTOSYL-DIGLYCERIDE × 10 ;2,3-DIMETHYL-5-(3,7,11,15,19,23,27,31,35-NONAMETHYL-2,6,10,14,18,22,26,30,34-HEXATRIACONTANONAENYL-2,5-CYCLOHEXADIENE-1,4-DIONE-2,3-DIMETHYL-5-SOLANESYL-1,4-BENZOQUINONE ; × 4 UNKNOWN LIGAND × 77 DODECYL-BETA-D-MALTOSIDE × 19 GLYCEROL × 10 BICARBONATE ION × 3 DIMETHYL SULFOXIDE × 116 CALCIUM ION × 7 heptyl 1-thio-beta-D-glucopyranoside × 31 DIGALACTOSYL DIACYL GLYCEROL (DGDG) × 10 1,2-DIPALMITOYL-PHOSPHATIDYL-GLYCEROLE × 9 PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 2 (3R)-beta,beta-caroten-3-ol × 2 MAGNESIUM ION × 2 HEME C × 2 water × 38	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	PSBC_THEEB
Isoform	—
PDB实体	3
链与序列区间	作者链 C； PDB构建体 1–461； UniProt 1–461 作者链 c； PDB构建体 1–461； UniProt 1–461

Photosystem II D2 protein

物种未注明

UniProt Q8CM25

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 39	Photosystem II protein D1 2 × 2 （P0A446） Photosystem II CP47 reaction center protein × 2 （Q8DIQ1） Photosystem II CP43 reaction center protein × 2 （Q8DIF8） Cytochrome b559 subunit alpha × 2 （Q8DIP0） Cytochrome b559 subunit beta × 2 （Q8DIN9） Photosystem II reaction center protein H × 2 （Q8DJ43） Photosystem II reaction center protein I × 2 （Q8DJZ6） Photosystem II reaction center protein J × 2 （P59087） Photosystem II reaction center protein K × 2 （Q9F1K9） Photosystem II reaction center protein L × 2 （Q8DIN8） Photosystem II reaction center protein M × 2 （Q8DHA7） Photosystem II manganese-stabilizing polypeptide × 2 （P0A431） Photosystem II reaction center protein T × 2 （Q8DIQ0） Photosystem II 12 kDa extrinsic protein × 2 （Q9F1L5） Cytochrome c-550 × 2 （P0A386） Photosystem II reaction center protein Ycf12 × 2 （Q8DJI1） Photosystem II reaction center X protein × 2 （Q9F1R6） Photosystem II reaction center protein Z × 2 （Q8DHJ2） Photosystem II protein Y × 1 （Q8DKM3） CA-MN4-O5 CLUSTER × 2 FE (II) ION × 2 CHLORIDE ION × 4 CHLOROPHYLL A × 70 PHEOPHYTIN A × 4 BETA-CAROTENE × 20 1,2-DI-O-ACYL-3-O-[6-DEOXY-6-SULFO-ALPHA-D-GLUCOPYRANOSYL]-SN-GLYCEROL × 8 1,2-DISTEAROYL-MONOGALACTOSYL-DIGLYCERIDE × 10 ;2,3-DIMETHYL-5-(3,7,11,15,19,23,27,31,35-NONAMETHYL-2,6,10,14,18,22,26,30,34-HEXATRIACONTANONAENYL-2,5-CYCLOHEXADIENE-1,4-DIONE-2,3-DIMETHYL-5-SOLANESYL-1,4-BENZOQUINONE ; × 4 UNKNOWN LIGAND × 77 DODECYL-BETA-D-MALTOSIDE × 19 GLYCEROL × 10 BICARBONATE ION × 3 DIMETHYL SULFOXIDE × 116 CALCIUM ION × 7 heptyl 1-thio-beta-D-glucopyranoside × 31 DIGALACTOSYL DIACYL GLYCEROL (DGDG) × 10 1,2-DIPALMITOYL-PHOSPHATIDYL-GLYCEROLE × 9 PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 2 (3R)-beta,beta-caroten-3-ol × 2 MAGNESIUM ION × 2 HEME C × 2 water × 38	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	PSBD_THEEB
Isoform	—
PDB实体	4
链与序列区间	作者链 D； PDB构建体 1–352； UniProt 1–352 作者链 d； PDB构建体 1–352； UniProt 1–352

Cytochrome b559 subunit alpha

物种未注明

UniProt Q8DIP0

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 39	Photosystem II protein D1 2 × 2 （P0A446） Photosystem II CP47 reaction center protein × 2 （Q8DIQ1） Photosystem II CP43 reaction center protein × 2 （Q8DIF8） Photosystem II D2 protein × 2 （Q8CM25） Cytochrome b559 subunit beta × 2 （Q8DIN9） Photosystem II reaction center protein H × 2 （Q8DJ43） Photosystem II reaction center protein I × 2 （Q8DJZ6） Photosystem II reaction center protein J × 2 （P59087） Photosystem II reaction center protein K × 2 （Q9F1K9） Photosystem II reaction center protein L × 2 （Q8DIN8） Photosystem II reaction center protein M × 2 （Q8DHA7） Photosystem II manganese-stabilizing polypeptide × 2 （P0A431） Photosystem II reaction center protein T × 2 （Q8DIQ0） Photosystem II 12 kDa extrinsic protein × 2 （Q9F1L5） Cytochrome c-550 × 2 （P0A386） Photosystem II reaction center protein Ycf12 × 2 （Q8DJI1） Photosystem II reaction center X protein × 2 （Q9F1R6） Photosystem II reaction center protein Z × 2 （Q8DHJ2） Photosystem II protein Y × 1 （Q8DKM3） CA-MN4-O5 CLUSTER × 2 FE (II) ION × 2 CHLORIDE ION × 4 CHLOROPHYLL A × 70 PHEOPHYTIN A × 4 BETA-CAROTENE × 20 1,2-DI-O-ACYL-3-O-[6-DEOXY-6-SULFO-ALPHA-D-GLUCOPYRANOSYL]-SN-GLYCEROL × 8 1,2-DISTEAROYL-MONOGALACTOSYL-DIGLYCERIDE × 10 ;2,3-DIMETHYL-5-(3,7,11,15,19,23,27,31,35-NONAMETHYL-2,6,10,14,18,22,26,30,34-HEXATRIACONTANONAENYL-2,5-CYCLOHEXADIENE-1,4-DIONE-2,3-DIMETHYL-5-SOLANESYL-1,4-BENZOQUINONE ; × 4 UNKNOWN LIGAND × 77 DODECYL-BETA-D-MALTOSIDE × 19 GLYCEROL × 10 BICARBONATE ION × 3 DIMETHYL SULFOXIDE × 116 CALCIUM ION × 7 heptyl 1-thio-beta-D-glucopyranoside × 31 DIGALACTOSYL DIACYL GLYCEROL (DGDG) × 10 1,2-DIPALMITOYL-PHOSPHATIDYL-GLYCEROLE × 9 PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 2 (3R)-beta,beta-caroten-3-ol × 2 MAGNESIUM ION × 2 HEME C × 2 water × 38	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	PSBE_THEEB
Isoform	—
PDB实体	5
链与序列区间	作者链 E； PDB构建体 1–84； UniProt 1–84 作者链 e； PDB构建体 1–84； UniProt 1–84

Cytochrome b559 subunit beta

物种未注明

UniProt Q8DIN9

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 39	Photosystem II protein D1 2 × 2 （P0A446） Photosystem II CP47 reaction center protein × 2 （Q8DIQ1） Photosystem II CP43 reaction center protein × 2 （Q8DIF8） Photosystem II D2 protein × 2 （Q8CM25） Cytochrome b559 subunit alpha × 2 （Q8DIP0） Photosystem II reaction center protein H × 2 （Q8DJ43） Photosystem II reaction center protein I × 2 （Q8DJZ6） Photosystem II reaction center protein J × 2 （P59087） Photosystem II reaction center protein K × 2 （Q9F1K9） Photosystem II reaction center protein L × 2 （Q8DIN8） Photosystem II reaction center protein M × 2 （Q8DHA7） Photosystem II manganese-stabilizing polypeptide × 2 （P0A431） Photosystem II reaction center protein T × 2 （Q8DIQ0） Photosystem II 12 kDa extrinsic protein × 2 （Q9F1L5） Cytochrome c-550 × 2 （P0A386） Photosystem II reaction center protein Ycf12 × 2 （Q8DJI1） Photosystem II reaction center X protein × 2 （Q9F1R6） Photosystem II reaction center protein Z × 2 （Q8DHJ2） Photosystem II protein Y × 1 （Q8DKM3） CA-MN4-O5 CLUSTER × 2 FE (II) ION × 2 CHLORIDE ION × 4 CHLOROPHYLL A × 70 PHEOPHYTIN A × 4 BETA-CAROTENE × 20 1,2-DI-O-ACYL-3-O-[6-DEOXY-6-SULFO-ALPHA-D-GLUCOPYRANOSYL]-SN-GLYCEROL × 8 1,2-DISTEAROYL-MONOGALACTOSYL-DIGLYCERIDE × 10 ;2,3-DIMETHYL-5-(3,7,11,15,19,23,27,31,35-NONAMETHYL-2,6,10,14,18,22,26,30,34-HEXATRIACONTANONAENYL-2,5-CYCLOHEXADIENE-1,4-DIONE-2,3-DIMETHYL-5-SOLANESYL-1,4-BENZOQUINONE ; × 4 UNKNOWN LIGAND × 77 DODECYL-BETA-D-MALTOSIDE × 19 GLYCEROL × 10 BICARBONATE ION × 3 DIMETHYL SULFOXIDE × 116 CALCIUM ION × 7 heptyl 1-thio-beta-D-glucopyranoside × 31 DIGALACTOSYL DIACYL GLYCEROL (DGDG) × 10 1,2-DIPALMITOYL-PHOSPHATIDYL-GLYCEROLE × 9 PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 2 (3R)-beta,beta-caroten-3-ol × 2 MAGNESIUM ION × 2 HEME C × 2 water × 38	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	PSBF_THEEB
Isoform	—
PDB实体	6
链与序列区间	作者链 F； PDB构建体 1–45； UniProt 1–45 作者链 f； PDB构建体 1–45； UniProt 1–45

Photosystem II reaction center protein H

物种未注明

UniProt Q8DJ43

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 39	Photosystem II protein D1 2 × 2 （P0A446） Photosystem II CP47 reaction center protein × 2 （Q8DIQ1） Photosystem II CP43 reaction center protein × 2 （Q8DIF8） Photosystem II D2 protein × 2 （Q8CM25） Cytochrome b559 subunit alpha × 2 （Q8DIP0） Cytochrome b559 subunit beta × 2 （Q8DIN9） Photosystem II reaction center protein I × 2 （Q8DJZ6） Photosystem II reaction center protein J × 2 （P59087） Photosystem II reaction center protein K × 2 （Q9F1K9） Photosystem II reaction center protein L × 2 （Q8DIN8） Photosystem II reaction center protein M × 2 （Q8DHA7） Photosystem II manganese-stabilizing polypeptide × 2 （P0A431） Photosystem II reaction center protein T × 2 （Q8DIQ0） Photosystem II 12 kDa extrinsic protein × 2 （Q9F1L5） Cytochrome c-550 × 2 （P0A386） Photosystem II reaction center protein Ycf12 × 2 （Q8DJI1） Photosystem II reaction center X protein × 2 （Q9F1R6） Photosystem II reaction center protein Z × 2 （Q8DHJ2） Photosystem II protein Y × 1 （Q8DKM3） CA-MN4-O5 CLUSTER × 2 FE (II) ION × 2 CHLORIDE ION × 4 CHLOROPHYLL A × 70 PHEOPHYTIN A × 4 BETA-CAROTENE × 20 1,2-DI-O-ACYL-3-O-[6-DEOXY-6-SULFO-ALPHA-D-GLUCOPYRANOSYL]-SN-GLYCEROL × 8 1,2-DISTEAROYL-MONOGALACTOSYL-DIGLYCERIDE × 10 ;2,3-DIMETHYL-5-(3,7,11,15,19,23,27,31,35-NONAMETHYL-2,6,10,14,18,22,26,30,34-HEXATRIACONTANONAENYL-2,5-CYCLOHEXADIENE-1,4-DIONE-2,3-DIMETHYL-5-SOLANESYL-1,4-BENZOQUINONE ; × 4 UNKNOWN LIGAND × 77 DODECYL-BETA-D-MALTOSIDE × 19 GLYCEROL × 10 BICARBONATE ION × 3 DIMETHYL SULFOXIDE × 116 CALCIUM ION × 7 heptyl 1-thio-beta-D-glucopyranoside × 31 DIGALACTOSYL DIACYL GLYCEROL (DGDG) × 10 1,2-DIPALMITOYL-PHOSPHATIDYL-GLYCEROLE × 9 PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 2 (3R)-beta,beta-caroten-3-ol × 2 MAGNESIUM ION × 2 HEME C × 2 water × 38	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	PSBH_THEEB
Isoform	—
PDB实体	7
链与序列区间	作者链 H； PDB构建体 1–66； UniProt 1–66 作者链 h； PDB构建体 1–66； UniProt 1–66

Photosystem II reaction center protein I

物种未注明

UniProt Q8DJZ6

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 39	Photosystem II protein D1 2 × 2 （P0A446） Photosystem II CP47 reaction center protein × 2 （Q8DIQ1） Photosystem II CP43 reaction center protein × 2 （Q8DIF8） Photosystem II D2 protein × 2 （Q8CM25） Cytochrome b559 subunit alpha × 2 （Q8DIP0） Cytochrome b559 subunit beta × 2 （Q8DIN9） Photosystem II reaction center protein H × 2 （Q8DJ43） Photosystem II reaction center protein J × 2 （P59087） Photosystem II reaction center protein K × 2 （Q9F1K9） Photosystem II reaction center protein L × 2 （Q8DIN8） Photosystem II reaction center protein M × 2 （Q8DHA7） Photosystem II manganese-stabilizing polypeptide × 2 （P0A431） Photosystem II reaction center protein T × 2 （Q8DIQ0） Photosystem II 12 kDa extrinsic protein × 2 （Q9F1L5） Cytochrome c-550 × 2 （P0A386） Photosystem II reaction center protein Ycf12 × 2 （Q8DJI1） Photosystem II reaction center X protein × 2 （Q9F1R6） Photosystem II reaction center protein Z × 2 （Q8DHJ2） Photosystem II protein Y × 1 （Q8DKM3） CA-MN4-O5 CLUSTER × 2 FE (II) ION × 2 CHLORIDE ION × 4 CHLOROPHYLL A × 70 PHEOPHYTIN A × 4 BETA-CAROTENE × 20 1,2-DI-O-ACYL-3-O-[6-DEOXY-6-SULFO-ALPHA-D-GLUCOPYRANOSYL]-SN-GLYCEROL × 8 1,2-DISTEAROYL-MONOGALACTOSYL-DIGLYCERIDE × 10 ;2,3-DIMETHYL-5-(3,7,11,15,19,23,27,31,35-NONAMETHYL-2,6,10,14,18,22,26,30,34-HEXATRIACONTANONAENYL-2,5-CYCLOHEXADIENE-1,4-DIONE-2,3-DIMETHYL-5-SOLANESYL-1,4-BENZOQUINONE ; × 4 UNKNOWN LIGAND × 77 DODECYL-BETA-D-MALTOSIDE × 19 GLYCEROL × 10 BICARBONATE ION × 3 DIMETHYL SULFOXIDE × 116 CALCIUM ION × 7 heptyl 1-thio-beta-D-glucopyranoside × 31 DIGALACTOSYL DIACYL GLYCEROL (DGDG) × 10 1,2-DIPALMITOYL-PHOSPHATIDYL-GLYCEROLE × 9 PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 2 (3R)-beta,beta-caroten-3-ol × 2 MAGNESIUM ION × 2 HEME C × 2 water × 38	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	PSBI_THEEB
Isoform	—
PDB实体	8
链与序列区间	作者链 I； PDB构建体 1–38； UniProt 1–38 作者链 i； PDB构建体 1–38； UniProt 1–38

Photosystem II reaction center protein J

物种未注明

UniProt P59087

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 39	Photosystem II protein D1 2 × 2 （P0A446） Photosystem II CP47 reaction center protein × 2 （Q8DIQ1） Photosystem II CP43 reaction center protein × 2 （Q8DIF8） Photosystem II D2 protein × 2 （Q8CM25） Cytochrome b559 subunit alpha × 2 （Q8DIP0） Cytochrome b559 subunit beta × 2 （Q8DIN9） Photosystem II reaction center protein H × 2 （Q8DJ43） Photosystem II reaction center protein I × 2 （Q8DJZ6） Photosystem II reaction center protein K × 2 （Q9F1K9） Photosystem II reaction center protein L × 2 （Q8DIN8） Photosystem II reaction center protein M × 2 （Q8DHA7） Photosystem II manganese-stabilizing polypeptide × 2 （P0A431） Photosystem II reaction center protein T × 2 （Q8DIQ0） Photosystem II 12 kDa extrinsic protein × 2 （Q9F1L5） Cytochrome c-550 × 2 （P0A386） Photosystem II reaction center protein Ycf12 × 2 （Q8DJI1） Photosystem II reaction center X protein × 2 （Q9F1R6） Photosystem II reaction center protein Z × 2 （Q8DHJ2） Photosystem II protein Y × 1 （Q8DKM3） CA-MN4-O5 CLUSTER × 2 FE (II) ION × 2 CHLORIDE ION × 4 CHLOROPHYLL A × 70 PHEOPHYTIN A × 4 BETA-CAROTENE × 20 1,2-DI-O-ACYL-3-O-[6-DEOXY-6-SULFO-ALPHA-D-GLUCOPYRANOSYL]-SN-GLYCEROL × 8 1,2-DISTEAROYL-MONOGALACTOSYL-DIGLYCERIDE × 10 ;2,3-DIMETHYL-5-(3,7,11,15,19,23,27,31,35-NONAMETHYL-2,6,10,14,18,22,26,30,34-HEXATRIACONTANONAENYL-2,5-CYCLOHEXADIENE-1,4-DIONE-2,3-DIMETHYL-5-SOLANESYL-1,4-BENZOQUINONE ; × 4 UNKNOWN LIGAND × 77 DODECYL-BETA-D-MALTOSIDE × 19 GLYCEROL × 10 BICARBONATE ION × 3 DIMETHYL SULFOXIDE × 116 CALCIUM ION × 7 heptyl 1-thio-beta-D-glucopyranoside × 31 DIGALACTOSYL DIACYL GLYCEROL (DGDG) × 10 1,2-DIPALMITOYL-PHOSPHATIDYL-GLYCEROLE × 9 PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 2 (3R)-beta,beta-caroten-3-ol × 2 MAGNESIUM ION × 2 HEME C × 2 water × 38	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	PSBJ_THEEB
Isoform	—
PDB实体	9
链与序列区间	作者链 J； PDB构建体 1–40； UniProt 1–40 作者链 j； PDB构建体 1–40； UniProt 1–40

Photosystem II reaction center protein K

物种未注明

UniProt Q9F1K9

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 39	Photosystem II protein D1 2 × 2 （P0A446） Photosystem II CP47 reaction center protein × 2 （Q8DIQ1） Photosystem II CP43 reaction center protein × 2 （Q8DIF8） Photosystem II D2 protein × 2 （Q8CM25） Cytochrome b559 subunit alpha × 2 （Q8DIP0） Cytochrome b559 subunit beta × 2 （Q8DIN9） Photosystem II reaction center protein H × 2 （Q8DJ43） Photosystem II reaction center protein I × 2 （Q8DJZ6） Photosystem II reaction center protein J × 2 （P59087） Photosystem II reaction center protein L × 2 （Q8DIN8） Photosystem II reaction center protein M × 2 （Q8DHA7） Photosystem II manganese-stabilizing polypeptide × 2 （P0A431） Photosystem II reaction center protein T × 2 （Q8DIQ0） Photosystem II 12 kDa extrinsic protein × 2 （Q9F1L5） Cytochrome c-550 × 2 （P0A386） Photosystem II reaction center protein Ycf12 × 2 （Q8DJI1） Photosystem II reaction center X protein × 2 （Q9F1R6） Photosystem II reaction center protein Z × 2 （Q8DHJ2） Photosystem II protein Y × 1 （Q8DKM3） CA-MN4-O5 CLUSTER × 2 FE (II) ION × 2 CHLORIDE ION × 4 CHLOROPHYLL A × 70 PHEOPHYTIN A × 4 BETA-CAROTENE × 20 1,2-DI-O-ACYL-3-O-[6-DEOXY-6-SULFO-ALPHA-D-GLUCOPYRANOSYL]-SN-GLYCEROL × 8 1,2-DISTEAROYL-MONOGALACTOSYL-DIGLYCERIDE × 10 ;2,3-DIMETHYL-5-(3,7,11,15,19,23,27,31,35-NONAMETHYL-2,6,10,14,18,22,26,30,34-HEXATRIACONTANONAENYL-2,5-CYCLOHEXADIENE-1,4-DIONE-2,3-DIMETHYL-5-SOLANESYL-1,4-BENZOQUINONE ; × 4 UNKNOWN LIGAND × 77 DODECYL-BETA-D-MALTOSIDE × 19 GLYCEROL × 10 BICARBONATE ION × 3 DIMETHYL SULFOXIDE × 116 CALCIUM ION × 7 heptyl 1-thio-beta-D-glucopyranoside × 31 DIGALACTOSYL DIACYL GLYCEROL (DGDG) × 10 1,2-DIPALMITOYL-PHOSPHATIDYL-GLYCEROLE × 9 PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 2 (3R)-beta,beta-caroten-3-ol × 2 MAGNESIUM ION × 2 HEME C × 2 water × 38	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	PSBK_THEEB
Isoform	—
PDB实体	10
链与序列区间	作者链 K； PDB构建体 1–46； UniProt 1–46 作者链 k； PDB构建体 1–46； UniProt 1–46

Photosystem II reaction center protein L

物种未注明

UniProt Q8DIN8

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 39	Photosystem II protein D1 2 × 2 （P0A446） Photosystem II CP47 reaction center protein × 2 （Q8DIQ1） Photosystem II CP43 reaction center protein × 2 （Q8DIF8） Photosystem II D2 protein × 2 （Q8CM25） Cytochrome b559 subunit alpha × 2 （Q8DIP0） Cytochrome b559 subunit beta × 2 （Q8DIN9） Photosystem II reaction center protein H × 2 （Q8DJ43） Photosystem II reaction center protein I × 2 （Q8DJZ6） Photosystem II reaction center protein J × 2 （P59087） Photosystem II reaction center protein K × 2 （Q9F1K9） Photosystem II reaction center protein M × 2 （Q8DHA7） Photosystem II manganese-stabilizing polypeptide × 2 （P0A431） Photosystem II reaction center protein T × 2 （Q8DIQ0） Photosystem II 12 kDa extrinsic protein × 2 （Q9F1L5） Cytochrome c-550 × 2 （P0A386） Photosystem II reaction center protein Ycf12 × 2 （Q8DJI1） Photosystem II reaction center X protein × 2 （Q9F1R6） Photosystem II reaction center protein Z × 2 （Q8DHJ2） Photosystem II protein Y × 1 （Q8DKM3） CA-MN4-O5 CLUSTER × 2 FE (II) ION × 2 CHLORIDE ION × 4 CHLOROPHYLL A × 70 PHEOPHYTIN A × 4 BETA-CAROTENE × 20 1,2-DI-O-ACYL-3-O-[6-DEOXY-6-SULFO-ALPHA-D-GLUCOPYRANOSYL]-SN-GLYCEROL × 8 1,2-DISTEAROYL-MONOGALACTOSYL-DIGLYCERIDE × 10 ;2,3-DIMETHYL-5-(3,7,11,15,19,23,27,31,35-NONAMETHYL-2,6,10,14,18,22,26,30,34-HEXATRIACONTANONAENYL-2,5-CYCLOHEXADIENE-1,4-DIONE-2,3-DIMETHYL-5-SOLANESYL-1,4-BENZOQUINONE ; × 4 UNKNOWN LIGAND × 77 DODECYL-BETA-D-MALTOSIDE × 19 GLYCEROL × 10 BICARBONATE ION × 3 DIMETHYL SULFOXIDE × 116 CALCIUM ION × 7 heptyl 1-thio-beta-D-glucopyranoside × 31 DIGALACTOSYL DIACYL GLYCEROL (DGDG) × 10 1,2-DIPALMITOYL-PHOSPHATIDYL-GLYCEROLE × 9 PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 2 (3R)-beta,beta-caroten-3-ol × 2 MAGNESIUM ION × 2 HEME C × 2 water × 38	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	PSBL_THEVB
Isoform	—
PDB实体	11
链与序列区间	作者链 L； PDB构建体 1–37； UniProt 1–37 作者链 l； PDB构建体 1–37； UniProt 1–37

Photosystem II reaction center protein M

物种未注明

UniProt Q8DHA7

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 39	Photosystem II protein D1 2 × 2 （P0A446） Photosystem II CP47 reaction center protein × 2 （Q8DIQ1） Photosystem II CP43 reaction center protein × 2 （Q8DIF8） Photosystem II D2 protein × 2 （Q8CM25） Cytochrome b559 subunit alpha × 2 （Q8DIP0） Cytochrome b559 subunit beta × 2 （Q8DIN9） Photosystem II reaction center protein H × 2 （Q8DJ43） Photosystem II reaction center protein I × 2 （Q8DJZ6） Photosystem II reaction center protein J × 2 （P59087） Photosystem II reaction center protein K × 2 （Q9F1K9） Photosystem II reaction center protein L × 2 （Q8DIN8） Photosystem II manganese-stabilizing polypeptide × 2 （P0A431） Photosystem II reaction center protein T × 2 （Q8DIQ0） Photosystem II 12 kDa extrinsic protein × 2 （Q9F1L5） Cytochrome c-550 × 2 （P0A386） Photosystem II reaction center protein Ycf12 × 2 （Q8DJI1） Photosystem II reaction center X protein × 2 （Q9F1R6） Photosystem II reaction center protein Z × 2 （Q8DHJ2） Photosystem II protein Y × 1 （Q8DKM3） CA-MN4-O5 CLUSTER × 2 FE (II) ION × 2 CHLORIDE ION × 4 CHLOROPHYLL A × 70 PHEOPHYTIN A × 4 BETA-CAROTENE × 20 1,2-DI-O-ACYL-3-O-[6-DEOXY-6-SULFO-ALPHA-D-GLUCOPYRANOSYL]-SN-GLYCEROL × 8 1,2-DISTEAROYL-MONOGALACTOSYL-DIGLYCERIDE × 10 ;2,3-DIMETHYL-5-(3,7,11,15,19,23,27,31,35-NONAMETHYL-2,6,10,14,18,22,26,30,34-HEXATRIACONTANONAENYL-2,5-CYCLOHEXADIENE-1,4-DIONE-2,3-DIMETHYL-5-SOLANESYL-1,4-BENZOQUINONE ; × 4 UNKNOWN LIGAND × 77 DODECYL-BETA-D-MALTOSIDE × 19 GLYCEROL × 10 BICARBONATE ION × 3 DIMETHYL SULFOXIDE × 116 CALCIUM ION × 7 heptyl 1-thio-beta-D-glucopyranoside × 31 DIGALACTOSYL DIACYL GLYCEROL (DGDG) × 10 1,2-DIPALMITOYL-PHOSPHATIDYL-GLYCEROLE × 9 PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 2 (3R)-beta,beta-caroten-3-ol × 2 MAGNESIUM ION × 2 HEME C × 2 water × 38	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	PSBM_THEVB
Isoform	—
PDB实体	12
链与序列区间	作者链 M； PDB构建体 1–36； UniProt 1–36 作者链 m； PDB构建体 1–36； UniProt 1–36

Photosystem II manganese-stabilizing polypeptide

物种未注明

UniProt P0A431

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 39	Photosystem II protein D1 2 × 2 （P0A446） Photosystem II CP47 reaction center protein × 2 （Q8DIQ1） Photosystem II CP43 reaction center protein × 2 （Q8DIF8） Photosystem II D2 protein × 2 （Q8CM25） Cytochrome b559 subunit alpha × 2 （Q8DIP0） Cytochrome b559 subunit beta × 2 （Q8DIN9） Photosystem II reaction center protein H × 2 （Q8DJ43） Photosystem II reaction center protein I × 2 （Q8DJZ6） Photosystem II reaction center protein J × 2 （P59087） Photosystem II reaction center protein K × 2 （Q9F1K9） Photosystem II reaction center protein L × 2 （Q8DIN8） Photosystem II reaction center protein M × 2 （Q8DHA7） Photosystem II reaction center protein T × 2 （Q8DIQ0） Photosystem II 12 kDa extrinsic protein × 2 （Q9F1L5） Cytochrome c-550 × 2 （P0A386） Photosystem II reaction center protein Ycf12 × 2 （Q8DJI1） Photosystem II reaction center X protein × 2 （Q9F1R6） Photosystem II reaction center protein Z × 2 （Q8DHJ2） Photosystem II protein Y × 1 （Q8DKM3） CA-MN4-O5 CLUSTER × 2 FE (II) ION × 2 CHLORIDE ION × 4 CHLOROPHYLL A × 70 PHEOPHYTIN A × 4 BETA-CAROTENE × 20 1,2-DI-O-ACYL-3-O-[6-DEOXY-6-SULFO-ALPHA-D-GLUCOPYRANOSYL]-SN-GLYCEROL × 8 1,2-DISTEAROYL-MONOGALACTOSYL-DIGLYCERIDE × 10 ;2,3-DIMETHYL-5-(3,7,11,15,19,23,27,31,35-NONAMETHYL-2,6,10,14,18,22,26,30,34-HEXATRIACONTANONAENYL-2,5-CYCLOHEXADIENE-1,4-DIONE-2,3-DIMETHYL-5-SOLANESYL-1,4-BENZOQUINONE ; × 4 UNKNOWN LIGAND × 77 DODECYL-BETA-D-MALTOSIDE × 19 GLYCEROL × 10 BICARBONATE ION × 3 DIMETHYL SULFOXIDE × 116 CALCIUM ION × 7 heptyl 1-thio-beta-D-glucopyranoside × 31 DIGALACTOSYL DIACYL GLYCEROL (DGDG) × 10 1,2-DIPALMITOYL-PHOSPHATIDYL-GLYCEROLE × 9 PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 2 (3R)-beta,beta-caroten-3-ol × 2 MAGNESIUM ION × 2 HEME C × 2 water × 38	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	PSBO_THEEB
Isoform	—
PDB实体	13
链与序列区间	作者链 O； PDB构建体 1–272； UniProt 1–272 作者链 o； PDB构建体 1–272； UniProt 1–272

Photosystem II reaction center protein T

物种未注明

UniProt Q8DIQ0

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 39	Photosystem II protein D1 2 × 2 （P0A446） Photosystem II CP47 reaction center protein × 2 （Q8DIQ1） Photosystem II CP43 reaction center protein × 2 （Q8DIF8） Photosystem II D2 protein × 2 （Q8CM25） Cytochrome b559 subunit alpha × 2 （Q8DIP0） Cytochrome b559 subunit beta × 2 （Q8DIN9） Photosystem II reaction center protein H × 2 （Q8DJ43） Photosystem II reaction center protein I × 2 （Q8DJZ6） Photosystem II reaction center protein J × 2 （P59087） Photosystem II reaction center protein K × 2 （Q9F1K9） Photosystem II reaction center protein L × 2 （Q8DIN8） Photosystem II reaction center protein M × 2 （Q8DHA7） Photosystem II manganese-stabilizing polypeptide × 2 （P0A431） Photosystem II 12 kDa extrinsic protein × 2 （Q9F1L5） Cytochrome c-550 × 2 （P0A386） Photosystem II reaction center protein Ycf12 × 2 （Q8DJI1） Photosystem II reaction center X protein × 2 （Q9F1R6） Photosystem II reaction center protein Z × 2 （Q8DHJ2） Photosystem II protein Y × 1 （Q8DKM3） CA-MN4-O5 CLUSTER × 2 FE (II) ION × 2 CHLORIDE ION × 4 CHLOROPHYLL A × 70 PHEOPHYTIN A × 4 BETA-CAROTENE × 20 1,2-DI-O-ACYL-3-O-[6-DEOXY-6-SULFO-ALPHA-D-GLUCOPYRANOSYL]-SN-GLYCEROL × 8 1,2-DISTEAROYL-MONOGALACTOSYL-DIGLYCERIDE × 10 ;2,3-DIMETHYL-5-(3,7,11,15,19,23,27,31,35-NONAMETHYL-2,6,10,14,18,22,26,30,34-HEXATRIACONTANONAENYL-2,5-CYCLOHEXADIENE-1,4-DIONE-2,3-DIMETHYL-5-SOLANESYL-1,4-BENZOQUINONE ; × 4 UNKNOWN LIGAND × 77 DODECYL-BETA-D-MALTOSIDE × 19 GLYCEROL × 10 BICARBONATE ION × 3 DIMETHYL SULFOXIDE × 116 CALCIUM ION × 7 heptyl 1-thio-beta-D-glucopyranoside × 31 DIGALACTOSYL DIACYL GLYCEROL (DGDG) × 10 1,2-DIPALMITOYL-PHOSPHATIDYL-GLYCEROLE × 9 PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 2 (3R)-beta,beta-caroten-3-ol × 2 MAGNESIUM ION × 2 HEME C × 2 water × 38	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	PSBT_THEVB
Isoform	—
PDB实体	14
链与序列区间	作者链 T； PDB构建体 1–32； UniProt 1–32 作者链 t； PDB构建体 1–32； UniProt 1–32

Photosystem II 12 kDa extrinsic protein

物种未注明

UniProt Q9F1L5

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 39	Photosystem II protein D1 2 × 2 （P0A446） Photosystem II CP47 reaction center protein × 2 （Q8DIQ1） Photosystem II CP43 reaction center protein × 2 （Q8DIF8） Photosystem II D2 protein × 2 （Q8CM25） Cytochrome b559 subunit alpha × 2 （Q8DIP0） Cytochrome b559 subunit beta × 2 （Q8DIN9） Photosystem II reaction center protein H × 2 （Q8DJ43） Photosystem II reaction center protein I × 2 （Q8DJZ6） Photosystem II reaction center protein J × 2 （P59087） Photosystem II reaction center protein K × 2 （Q9F1K9） Photosystem II reaction center protein L × 2 （Q8DIN8） Photosystem II reaction center protein M × 2 （Q8DHA7） Photosystem II manganese-stabilizing polypeptide × 2 （P0A431） Photosystem II reaction center protein T × 2 （Q8DIQ0） Cytochrome c-550 × 2 （P0A386） Photosystem II reaction center protein Ycf12 × 2 （Q8DJI1） Photosystem II reaction center X protein × 2 （Q9F1R6） Photosystem II reaction center protein Z × 2 （Q8DHJ2） Photosystem II protein Y × 1 （Q8DKM3） CA-MN4-O5 CLUSTER × 2 FE (II) ION × 2 CHLORIDE ION × 4 CHLOROPHYLL A × 70 PHEOPHYTIN A × 4 BETA-CAROTENE × 20 1,2-DI-O-ACYL-3-O-[6-DEOXY-6-SULFO-ALPHA-D-GLUCOPYRANOSYL]-SN-GLYCEROL × 8 1,2-DISTEAROYL-MONOGALACTOSYL-DIGLYCERIDE × 10 ;2,3-DIMETHYL-5-(3,7,11,15,19,23,27,31,35-NONAMETHYL-2,6,10,14,18,22,26,30,34-HEXATRIACONTANONAENYL-2,5-CYCLOHEXADIENE-1,4-DIONE-2,3-DIMETHYL-5-SOLANESYL-1,4-BENZOQUINONE ; × 4 UNKNOWN LIGAND × 77 DODECYL-BETA-D-MALTOSIDE × 19 GLYCEROL × 10 BICARBONATE ION × 3 DIMETHYL SULFOXIDE × 116 CALCIUM ION × 7 heptyl 1-thio-beta-D-glucopyranoside × 31 DIGALACTOSYL DIACYL GLYCEROL (DGDG) × 10 1,2-DIPALMITOYL-PHOSPHATIDYL-GLYCEROLE × 9 PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 2 (3R)-beta,beta-caroten-3-ol × 2 MAGNESIUM ION × 2 HEME C × 2 water × 38	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	PSBU_THEEB
Isoform	—
PDB实体	15
链与序列区间	作者链 U； PDB构建体 1–134； UniProt 1–134 作者链 u； PDB构建体 1–134； UniProt 1–134

Cytochrome c-550

物种未注明

UniProt P0A386

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 39	Photosystem II protein D1 2 × 2 （P0A446） Photosystem II CP47 reaction center protein × 2 （Q8DIQ1） Photosystem II CP43 reaction center protein × 2 （Q8DIF8） Photosystem II D2 protein × 2 （Q8CM25） Cytochrome b559 subunit alpha × 2 （Q8DIP0） Cytochrome b559 subunit beta × 2 （Q8DIN9） Photosystem II reaction center protein H × 2 （Q8DJ43） Photosystem II reaction center protein I × 2 （Q8DJZ6） Photosystem II reaction center protein J × 2 （P59087） Photosystem II reaction center protein K × 2 （Q9F1K9） Photosystem II reaction center protein L × 2 （Q8DIN8） Photosystem II reaction center protein M × 2 （Q8DHA7） Photosystem II manganese-stabilizing polypeptide × 2 （P0A431） Photosystem II reaction center protein T × 2 （Q8DIQ0） Photosystem II 12 kDa extrinsic protein × 2 （Q9F1L5） Photosystem II reaction center protein Ycf12 × 2 （Q8DJI1） Photosystem II reaction center X protein × 2 （Q9F1R6） Photosystem II reaction center protein Z × 2 （Q8DHJ2） Photosystem II protein Y × 1 （Q8DKM3） CA-MN4-O5 CLUSTER × 2 FE (II) ION × 2 CHLORIDE ION × 4 CHLOROPHYLL A × 70 PHEOPHYTIN A × 4 BETA-CAROTENE × 20 1,2-DI-O-ACYL-3-O-[6-DEOXY-6-SULFO-ALPHA-D-GLUCOPYRANOSYL]-SN-GLYCEROL × 8 1,2-DISTEAROYL-MONOGALACTOSYL-DIGLYCERIDE × 10 ;2,3-DIMETHYL-5-(3,7,11,15,19,23,27,31,35-NONAMETHYL-2,6,10,14,18,22,26,30,34-HEXATRIACONTANONAENYL-2,5-CYCLOHEXADIENE-1,4-DIONE-2,3-DIMETHYL-5-SOLANESYL-1,4-BENZOQUINONE ; × 4 UNKNOWN LIGAND × 77 DODECYL-BETA-D-MALTOSIDE × 19 GLYCEROL × 10 BICARBONATE ION × 3 DIMETHYL SULFOXIDE × 116 CALCIUM ION × 7 heptyl 1-thio-beta-D-glucopyranoside × 31 DIGALACTOSYL DIACYL GLYCEROL (DGDG) × 10 1,2-DIPALMITOYL-PHOSPHATIDYL-GLYCEROLE × 9 PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 2 (3R)-beta,beta-caroten-3-ol × 2 MAGNESIUM ION × 2 HEME C × 2 water × 38	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	CY550_THEEB
Isoform	—
PDB实体	16
链与序列区间	作者链 V； PDB构建体 1–163； UniProt 1–163 作者链 v； PDB构建体 1–163； UniProt 1–163

Photosystem II reaction center protein Ycf12

物种未注明

UniProt Q8DJI1

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 39	Photosystem II protein D1 2 × 2 （P0A446） Photosystem II CP47 reaction center protein × 2 （Q8DIQ1） Photosystem II CP43 reaction center protein × 2 （Q8DIF8） Photosystem II D2 protein × 2 （Q8CM25） Cytochrome b559 subunit alpha × 2 （Q8DIP0） Cytochrome b559 subunit beta × 2 （Q8DIN9） Photosystem II reaction center protein H × 2 （Q8DJ43） Photosystem II reaction center protein I × 2 （Q8DJZ6） Photosystem II reaction center protein J × 2 （P59087） Photosystem II reaction center protein K × 2 （Q9F1K9） Photosystem II reaction center protein L × 2 （Q8DIN8） Photosystem II reaction center protein M × 2 （Q8DHA7） Photosystem II manganese-stabilizing polypeptide × 2 （P0A431） Photosystem II reaction center protein T × 2 （Q8DIQ0） Photosystem II 12 kDa extrinsic protein × 2 （Q9F1L5） Cytochrome c-550 × 2 （P0A386） Photosystem II reaction center X protein × 2 （Q9F1R6） Photosystem II reaction center protein Z × 2 （Q8DHJ2） Photosystem II protein Y × 1 （Q8DKM3） CA-MN4-O5 CLUSTER × 2 FE (II) ION × 2 CHLORIDE ION × 4 CHLOROPHYLL A × 70 PHEOPHYTIN A × 4 BETA-CAROTENE × 20 1,2-DI-O-ACYL-3-O-[6-DEOXY-6-SULFO-ALPHA-D-GLUCOPYRANOSYL]-SN-GLYCEROL × 8 1,2-DISTEAROYL-MONOGALACTOSYL-DIGLYCERIDE × 10 ;2,3-DIMETHYL-5-(3,7,11,15,19,23,27,31,35-NONAMETHYL-2,6,10,14,18,22,26,30,34-HEXATRIACONTANONAENYL-2,5-CYCLOHEXADIENE-1,4-DIONE-2,3-DIMETHYL-5-SOLANESYL-1,4-BENZOQUINONE ; × 4 UNKNOWN LIGAND × 77 DODECYL-BETA-D-MALTOSIDE × 19 GLYCEROL × 10 BICARBONATE ION × 3 DIMETHYL SULFOXIDE × 116 CALCIUM ION × 7 heptyl 1-thio-beta-D-glucopyranoside × 31 DIGALACTOSYL DIACYL GLYCEROL (DGDG) × 10 1,2-DIPALMITOYL-PHOSPHATIDYL-GLYCEROLE × 9 PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 2 (3R)-beta,beta-caroten-3-ol × 2 MAGNESIUM ION × 2 HEME C × 2 water × 38	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	YCF12_THEEB
Isoform	—
PDB实体	17
链与序列区间	作者链 Y； PDB构建体 1–46； UniProt 1–46 作者链 y； PDB构建体 1–46； UniProt 1–46

Photosystem II reaction center X protein

物种未注明

UniProt Q9F1R6

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 39	Photosystem II protein D1 2 × 2 （P0A446） Photosystem II CP47 reaction center protein × 2 （Q8DIQ1） Photosystem II CP43 reaction center protein × 2 （Q8DIF8） Photosystem II D2 protein × 2 （Q8CM25） Cytochrome b559 subunit alpha × 2 （Q8DIP0） Cytochrome b559 subunit beta × 2 （Q8DIN9） Photosystem II reaction center protein H × 2 （Q8DJ43） Photosystem II reaction center protein I × 2 （Q8DJZ6） Photosystem II reaction center protein J × 2 （P59087） Photosystem II reaction center protein K × 2 （Q9F1K9） Photosystem II reaction center protein L × 2 （Q8DIN8） Photosystem II reaction center protein M × 2 （Q8DHA7） Photosystem II manganese-stabilizing polypeptide × 2 （P0A431） Photosystem II reaction center protein T × 2 （Q8DIQ0） Photosystem II 12 kDa extrinsic protein × 2 （Q9F1L5） Cytochrome c-550 × 2 （P0A386） Photosystem II reaction center protein Ycf12 × 2 （Q8DJI1） Photosystem II reaction center protein Z × 2 （Q8DHJ2） Photosystem II protein Y × 1 （Q8DKM3） CA-MN4-O5 CLUSTER × 2 FE (II) ION × 2 CHLORIDE ION × 4 CHLOROPHYLL A × 70 PHEOPHYTIN A × 4 BETA-CAROTENE × 20 1,2-DI-O-ACYL-3-O-[6-DEOXY-6-SULFO-ALPHA-D-GLUCOPYRANOSYL]-SN-GLYCEROL × 8 1,2-DISTEAROYL-MONOGALACTOSYL-DIGLYCERIDE × 10 ;2,3-DIMETHYL-5-(3,7,11,15,19,23,27,31,35-NONAMETHYL-2,6,10,14,18,22,26,30,34-HEXATRIACONTANONAENYL-2,5-CYCLOHEXADIENE-1,4-DIONE-2,3-DIMETHYL-5-SOLANESYL-1,4-BENZOQUINONE ; × 4 UNKNOWN LIGAND × 77 DODECYL-BETA-D-MALTOSIDE × 19 GLYCEROL × 10 BICARBONATE ION × 3 DIMETHYL SULFOXIDE × 116 CALCIUM ION × 7 heptyl 1-thio-beta-D-glucopyranoside × 31 DIGALACTOSYL DIACYL GLYCEROL (DGDG) × 10 1,2-DIPALMITOYL-PHOSPHATIDYL-GLYCEROLE × 9 PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 2 (3R)-beta,beta-caroten-3-ol × 2 MAGNESIUM ION × 2 HEME C × 2 water × 38	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	PSBX_THEEB
Isoform	—
PDB实体	18
链与序列区间	作者链 X； PDB构建体 1–41； UniProt 1–41 作者链 x； PDB构建体 1–41； UniProt 1–41

Photosystem II reaction center protein Z

物种未注明

UniProt Q8DHJ2

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 39	Photosystem II protein D1 2 × 2 （P0A446） Photosystem II CP47 reaction center protein × 2 （Q8DIQ1） Photosystem II CP43 reaction center protein × 2 （Q8DIF8） Photosystem II D2 protein × 2 （Q8CM25） Cytochrome b559 subunit alpha × 2 （Q8DIP0） Cytochrome b559 subunit beta × 2 （Q8DIN9） Photosystem II reaction center protein H × 2 （Q8DJ43） Photosystem II reaction center protein I × 2 （Q8DJZ6） Photosystem II reaction center protein J × 2 （P59087） Photosystem II reaction center protein K × 2 （Q9F1K9） Photosystem II reaction center protein L × 2 （Q8DIN8） Photosystem II reaction center protein M × 2 （Q8DHA7） Photosystem II manganese-stabilizing polypeptide × 2 （P0A431） Photosystem II reaction center protein T × 2 （Q8DIQ0） Photosystem II 12 kDa extrinsic protein × 2 （Q9F1L5） Cytochrome c-550 × 2 （P0A386） Photosystem II reaction center protein Ycf12 × 2 （Q8DJI1） Photosystem II reaction center X protein × 2 （Q9F1R6） Photosystem II protein Y × 1 （Q8DKM3） CA-MN4-O5 CLUSTER × 2 FE (II) ION × 2 CHLORIDE ION × 4 CHLOROPHYLL A × 70 PHEOPHYTIN A × 4 BETA-CAROTENE × 20 1,2-DI-O-ACYL-3-O-[6-DEOXY-6-SULFO-ALPHA-D-GLUCOPYRANOSYL]-SN-GLYCEROL × 8 1,2-DISTEAROYL-MONOGALACTOSYL-DIGLYCERIDE × 10 ;2,3-DIMETHYL-5-(3,7,11,15,19,23,27,31,35-NONAMETHYL-2,6,10,14,18,22,26,30,34-HEXATRIACONTANONAENYL-2,5-CYCLOHEXADIENE-1,4-DIONE-2,3-DIMETHYL-5-SOLANESYL-1,4-BENZOQUINONE ; × 4 UNKNOWN LIGAND × 77 DODECYL-BETA-D-MALTOSIDE × 19 GLYCEROL × 10 BICARBONATE ION × 3 DIMETHYL SULFOXIDE × 116 CALCIUM ION × 7 heptyl 1-thio-beta-D-glucopyranoside × 31 DIGALACTOSYL DIACYL GLYCEROL (DGDG) × 10 1,2-DIPALMITOYL-PHOSPHATIDYL-GLYCEROLE × 9 PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 2 (3R)-beta,beta-caroten-3-ol × 2 MAGNESIUM ION × 2 HEME C × 2 water × 38	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	PSBZ_THEEB
Isoform	—
PDB实体	19
链与序列区间	作者链 Z； PDB构建体 1–62； UniProt 1–62 作者链 z； PDB构建体 1–62； UniProt 1–62

Photosystem II protein Y

物种未注明

UniProt Q8DKM3

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 39	Photosystem II protein D1 2 × 2 （P0A446） Photosystem II CP47 reaction center protein × 2 （Q8DIQ1） Photosystem II CP43 reaction center protein × 2 （Q8DIF8） Photosystem II D2 protein × 2 （Q8CM25） Cytochrome b559 subunit alpha × 2 （Q8DIP0） Cytochrome b559 subunit beta × 2 （Q8DIN9） Photosystem II reaction center protein H × 2 （Q8DJ43） Photosystem II reaction center protein I × 2 （Q8DJZ6） Photosystem II reaction center protein J × 2 （P59087） Photosystem II reaction center protein K × 2 （Q9F1K9） Photosystem II reaction center protein L × 2 （Q8DIN8） Photosystem II reaction center protein M × 2 （Q8DHA7） Photosystem II manganese-stabilizing polypeptide × 2 （P0A431） Photosystem II reaction center protein T × 2 （Q8DIQ0） Photosystem II 12 kDa extrinsic protein × 2 （Q9F1L5） Cytochrome c-550 × 2 （P0A386） Photosystem II reaction center protein Ycf12 × 2 （Q8DJI1） Photosystem II reaction center X protein × 2 （Q9F1R6） Photosystem II reaction center protein Z × 2 （Q8DHJ2） CA-MN4-O5 CLUSTER × 2 FE (II) ION × 2 CHLORIDE ION × 4 CHLOROPHYLL A × 70 PHEOPHYTIN A × 4 BETA-CAROTENE × 20 1,2-DI-O-ACYL-3-O-[6-DEOXY-6-SULFO-ALPHA-D-GLUCOPYRANOSYL]-SN-GLYCEROL × 8 1,2-DISTEAROYL-MONOGALACTOSYL-DIGLYCERIDE × 10 ;2,3-DIMETHYL-5-(3,7,11,15,19,23,27,31,35-NONAMETHYL-2,6,10,14,18,22,26,30,34-HEXATRIACONTANONAENYL-2,5-CYCLOHEXADIENE-1,4-DIONE-2,3-DIMETHYL-5-SOLANESYL-1,4-BENZOQUINONE ; × 4 UNKNOWN LIGAND × 77 DODECYL-BETA-D-MALTOSIDE × 19 GLYCEROL × 10 BICARBONATE ION × 3 DIMETHYL SULFOXIDE × 116 CALCIUM ION × 7 heptyl 1-thio-beta-D-glucopyranoside × 31 DIGALACTOSYL DIACYL GLYCEROL (DGDG) × 10 1,2-DIPALMITOYL-PHOSPHATIDYL-GLYCEROLE × 9 PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 2 (3R)-beta,beta-caroten-3-ol × 2 MAGNESIUM ION × 2 HEME C × 2 water × 38	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	PSBY_THEEB
Isoform	—
PDB实体	20
链与序列区间	作者链 R； PDB构建体 1–41； UniProt 1–41

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	7yq2
沉积日期 deposition_date	2022-08-05
结构标题 title	Crystal structure of photosystem II expressing psbA2 gene only
关键词 keywords	PHOTOSYNTHESIS, ELECTRON TRANSPORT; PHOTOSYNTHESIS,ELECTRON TRANSPORT
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

7yq2__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

7yq2__assembly_1__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

7yq2__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	57.45 Å
Rg（电子密度）	56.85 Å
总 Rg	57.21 Å
原子数	51802
残基数	5293
排除体积	965310 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`7yq2__assembly_1__model_1`	39-meric （39）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (43)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	Photosystem II protein D1 2
分子量 formula_weight	39762.5 kDa
EC 编号 ec_number	1.10.3.9
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A,a
原子数 atom_count	55630

MTTVLQRRQTANLWERFCDWITSTENRLYIGWFGVIMIPTLLAATICFVIAFIAAPPVDIDGIREPVSGSLLYGNNIITAAVVPSSNAIGLHLYPIWDAASLDEWLYNGGPYQLIIFHFLIGIFCYMGREWELSYRLGMRPWIPVAFSAPVAAATAVLLIYPIGQGSFSDGLMLGISGTFNFMIVFQAEHNILMHPFHMLGVAGVFGGALFAAMHGSLVTSSLIRETTETESTNYGYKFGQEEETYNIVAAHGYFGRLIFQYASFNNSRSLHFFLAAWPVVGIWFAALGISTMAFNLNGFNFNHSVVDAQGNVINTWADIINRANIGIEVMHERNAHNFPLDLASGELAPVAMIAPSIEA

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	Photosystem II CP47 reaction center protein
分子量 formula_weight	56656.5 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	B,b

MGLPWYRVHTVLINDPGRLIAAHLMHTALVAGWAGSMALYELATFDPSDPVLNPMWRQGMFVLPFMARLGVTGSWSGWSITGETGIDPGFWSFEGVALAHIVLSGLLFLAACWHWVYWDLELFRDPRTGEPALDLPKMFGIHLFLAGLLCFGFGAFHLTGLFGPGMWVSDPYGLTGSVQPVAPEWGPDGFNPYNPGGVVAHHIAAGIVGIIAGLFHILVRPPQRLYKALRMGNIETVLSSSIAAVFFAAFVVAGTMWYGSATTPIELFGPTRYQWDSSYFQQEINRRVQASLASGATLEEAWSAIPEKLAFYDYIGNNPAKGGLFRTGPMNKGDGIAQAWKGHAVFRNKEGEELFVRRMPAFFESFPVILTDKNGVVKADIPFRRAESKYSFEQQGVTVSFYGGELNGQTFTDPPTVKSYARKAIFGEIFEFDTETLNSDGIFRTSPRGWFTFAHAVFALLFFFGHIWHGARTLFRDVFSGIDPELSPEQVEWGFYQKVGDVTTRRKEAV

实体 3 Entity 3 polymer

描述 description	Photosystem II CP43 reaction center protein
分子量 formula_weight	50287.5 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	C,c

MVTLSSNSIFATNRDQESSGFAWWAGNARLINLSGKLLGAHVAHAGLIVFWAGAMTLFELAHFIPEKPMYEQGLILIPHIATLGWGVGPGGEVVDTFPFFVVGVVHLISSAVLGFGGVYHAIRGPETLEEYSSFFGYDWKDKNKMTTILGFHLIVLGIGALLLVAKAMFFGGLYDTWAPGGGDVRVITNPTLDPRVIFGYLLKSPFGGEGWIVSVNNLEDVVGGHIWIGLICIAGGIWHILTTPFGWARRAFIWSGEAYLSYSLGALSMMGFIATCFVWFNNTVYPSEFYGPTGPEASQAQAMTFLIRDQKLGANVGSAQGPTGLGKYLMRSPTGEIIFGGETMRFWDFRGPWLEPLRGPNGLDLNKIKNDIQPWQERRAAEYMTHAPLGSLNSVGGVATEINSVNFVSPRSWLATSHFVLAFFFLVGHLWHAGRARAAAAGFEKGIDRESEPVLSMPSLD

实体 4 Entity 4 polymer

描述 description	Photosystem II D2 protein
分子量 formula_weight	39388.2 kDa
EC 编号 ec_number	1.10.3.9
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	D,d

MTIAIGRAPAERGWFDILDDWLKRDRFVFVGWSGILLFPCAYLALGGWLTGTTFVTSWYTHGLASSYLEGCNFLTVAVSTPANSMGHSLLLLWGPEAQGDFTRWCQLGGLWTFIALHGAFGLIGFMLRQFEIARLVGVRPYNAIAFSAPIAVFVSVFLIYPLGQSSWFFAPSFGVAAIFRFLLFFQGFHNWTLNPFHMMGVAGVLGGALLCAIHGATVENTLFQDGEGASTFRAFNPTQAEETYSMVTANRFWSQIFGIAFSNKRWLHFFMLFVPVTGLWMSAIGVVGLALNLRSYDFISQEIRAAEDPEFETFYTKNLLLNEGIRAWMAPQDQPHENFVFPEEVLPRGNAL

实体 5 Entity 5 polymer

描述 description	Cytochrome b559 subunit alpha
分子量 formula_weight	9580.8 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	E,e

MAGTTGERPFSDIITSVRYWVIHSITIPALFIAGWLFVSTGLAYDVFGTPRPDSYYAQEQRSIPLVTDRFEAKQQVETFLEQLK

实体 6 Entity 6 polymer

描述 description	Cytochrome b559 subunit beta
分子量 formula_weight	5067.9 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	F,f

MTSNTPNQEPVSYPIFTVRWVAVHTLAVPTIFFLGAIAAMQFIQR

实体 7 Entity 7 polymer

描述 description	Photosystem II reaction center protein H
分子量 formula_weight	7358.8 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	H,h

MARRTWLGDILRPLNSEYGKVAPGWGTTPLMAVFMGLFLVFLLIILEIYNSTLILDGVNVSWKALG

实体 8 Entity 8 polymer

描述 description	Photosystem II reaction center protein I
分子量 formula_weight	4438.3 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	I,i

METLKITVYIVVTFFVLLFVFGFLSGDPARNPKRKDLE

实体 9 Entity 9 polymer

描述 description	Photosystem II reaction center protein J
分子量 formula_weight	4105.9 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	J,j

MMSEGGRIPLWIVATVAGMGVIVIVGLFFYGAYAGLGSSL

实体 10 Entity 10 polymer

描述 description	Photosystem II reaction center protein K
分子量 formula_weight	5028.1 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	K,k

MIDALVLVAKLPEAYAIFDPLVDVLPVIPVLFLALAFVWQAAVGFR

实体 11 Entity 11 polymer

描述 description	Photosystem II reaction center protein L
分子量 formula_weight	4299.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	L,l

MEPNPNRQPVELNRTSLYLGLLLILVLALLFSSYFFN

实体 12 Entity 12 polymer

描述 description	Photosystem II reaction center protein M
分子量 formula_weight	4009.7 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	M,m

MEVNQLGLIATALFVLVPSVFLIILYVQTESQQKSS

实体 13 Entity 13 polymer

描述 description	Photosystem II manganese-stabilizing polypeptide
分子量 formula_weight	29637.4 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	O,o

MKYRILMATLLAVCLGIFSLSAPAFAAKQTLTYDDIVGTGLANKCPTLDDTARGAYPIDSSQTYRIARLCLQPTTFLVKEEPKNKRQEAEFVPTKLVTRETTSLDQIQGELKVNSDGSLTFVEEDGIDFQPVTVQMAGGERIPLLFTVKNLVASTQPNVTSITTSTDFKGEFNVPSYRTANFLDPKGRGLASGYDSAIALPQAKEEELARANVKRFSLTKGQISLNVAKVDGRTGEIAGTFESEQLSDDDMGAHEPHEVKIQGVFYASIEPA

实体 14 Entity 14 polymer

描述 description	Photosystem II reaction center protein T
分子量 formula_weight	3906.7 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	T,t

METITYVFIFACIIALFFFAIFFREPPRITKK

实体 15 Entity 15 polymer

描述 description	Photosystem II 12 kDa extrinsic protein
分子量 formula_weight	15031.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	U,u

MQRLGRWLALAYFVGVSLLGWINWSAPTLAATASTEEELVNVVDEKLGTAYGEKIDLNNTNIAAFIQYRGLYPTLAKLIVKNAPYESVEDVLNIPGLTERQKQILRENLEHFTVTEVETALVEGGDRYNNGLYK

实体 16 Entity 16 polymer

描述 description	Cytochrome c-550
分子量 formula_weight	18046.9 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	V,v

MLKKCVWLAVALCLCLWQFTMGTALAAELTPEVLTVPLNSEGKTITLTEKQYLEGKRLFQYACASCHVGGITKTNPSLDLRTETLALATPPRDNIEGLVDYMKNPTTYDGEQEIAEVHPSLRSADIFPKMRNLTEKDLVAIAGHILVEPKILGDKWGGGKVYY

实体 17 Entity 17 polymer

描述 description	Photosystem II reaction center protein Ycf12
分子量 formula_weight	5039.1 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	Y,y

MGIFNGIIEFLSNINFEVIAQLTMIAMIGIAGPMIIFLLAVRRGNL

实体 18 Entity 18 polymer

描述 description	Photosystem II reaction center X protein
分子量 formula_weight	4322.2 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	X,x

MTITPSLKGFFIGLLSGAVVLGLTFAVLIAISQIDKVQRSL

实体 19 Entity 19 polymer

描述 description	Photosystem II reaction center protein Z
分子量 formula_weight	6794.2 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	Z,z

MTILFQLALAALVILSFVMVIGVPVAYASPQDWDRSKQLIFLGSGLWIALVLVVGVLNFFVV

实体 20 Entity 20 polymer

描述 description	Photosystem II protein Y
分子量 formula_weight	4590.6 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	R

MDWRVLVVLLPVLLAAGWAVRNILPYAVKQVQKLLQKAKAA

实体 21 Entity 21 non-polymer

描述 description	CA-MN4-O5 CLUSTER
分子量 formula_weight	339.8 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	2

实体 22 Entity 22 non-polymer

描述 description	FE (II) ION
分子量 formula_weight	55.8 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	2

实体 23 Entity 23 non-polymer

描述 description	CHLORIDE ION
分子量 formula_weight	35.5 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	4

实体 24 Entity 24 non-polymer

描述 description	CHLOROPHYLL A
分子量 formula_weight	893.5 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	70

实体 25 Entity 25 non-polymer

描述 description	PHEOPHYTIN A
分子量 formula_weight	871.2 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	4

实体 26 Entity 26 non-polymer

描述 description	BETA-CAROTENE
分子量 formula_weight	536.9 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	20

实体 27 Entity 27 non-polymer

描述 description	1,2-DI-O-ACYL-3-O-[6-DEOXY-6-SULFO-ALPHA-D-GLUCOPYRANOSYL]-SN-GLYCEROL
分子量 formula_weight	795.1 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	8

实体 28 Entity 28 non-polymer

描述 description	1,2-DISTEAROYL-MONOGALACTOSYL-DIGLYCERIDE
分子量 formula_weight	787.2 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	10

实体 29 Entity 29 non-polymer

描述 description	;2,3-DIMETHYL-5-(3,7,11,15,19,23,27,31,35-NONAMETHYL-2,6,10,14,18,22,26,30,34-HEXATRIACONTANONAENYL-2,5-CYCLOHEXADIENE-1,4-DIONE-2,3-DIMETHYL-5-SOLANESYL-1,4-BENZOQUINONE ;
分子量 formula_weight	749.2 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	4

实体 30 Entity 30 non-polymer

描述 description	UNKNOWN LIGAND
分子量 formula_weight	258.1 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	77

实体 31 Entity 31 non-polymer

描述 description	DODECYL-BETA-D-MALTOSIDE
分子量 formula_weight	510.6 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	19

实体 32 Entity 32 non-polymer

描述 description	GLYCEROL
分子量 formula_weight	92.1 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	10

实体 33 Entity 33 non-polymer

描述 description	BICARBONATE ION
分子量 formula_weight	61.0 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	3

实体 34 Entity 34 non-polymer

描述 description	DIMETHYL SULFOXIDE
分子量 formula_weight	78.1 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	116

实体 35 Entity 35 non-polymer

描述 description	CALCIUM ION
分子量 formula_weight	40.1 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	7

实体 36 Entity 36 non-polymer

描述 description	heptyl 1-thio-beta-D-glucopyranoside
分子量 formula_weight	294.4 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	31

实体 37 Entity 37 non-polymer

描述 description	DIGALACTOSYL DIACYL GLYCEROL (DGDG)
分子量 formula_weight	949.3 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	10

实体 38 Entity 38 non-polymer

描述 description	1,2-DIPALMITOYL-PHOSPHATIDYL-GLYCEROLE
分子量 formula_weight	723.0 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	9

实体 39 Entity 39 non-polymer

描述 description	PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE
分子量 formula_weight	616.5 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	2

实体 40 Entity 40 non-polymer

描述 description	(3R)-beta,beta-caroten-3-ol
分子量 formula_weight	552.9 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	2

实体 41 Entity 41 non-polymer

描述 description	MAGNESIUM ION
分子量 formula_weight	24.3 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	2

实体 42 Entity 42 non-polymer

描述 description	HEME C
分子量 formula_weight	618.5 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

实体 43 Entity 43 water

描述 description	water
分子量 formula_weight	18.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	3420

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6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 6 domains

CATH v4.4 (6 domains)

结构域编号 domain_id	7yq2A01
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology	85 — Photosynthetic Reaction Center, subunit M; domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Photosystem II protein D1-like

结构域编号 domain_id	7yq2B01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	10 — Roll
拓扑 Topology topology	680 — Photosystem II CP47 reaction center protein
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Photosystem II CP47 reaction center protein

结构域编号 domain_id	7yq2E01
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology	5 — Single alpha-helices involved in coiled-coils or other helix-helix interfaces
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	860 — Photosystem II cytochrome b559, alpha subunit

结构域编号 domain_id	7yq2a01
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology	85 — Photosynthetic Reaction Center, subunit M; domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Photosystem II protein D1-like

结构域编号 domain_id	7yq2b01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	10 — Roll
拓扑 Topology topology	680 — Photosystem II CP47 reaction center protein
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Photosystem II CP47 reaction center protein

结构域编号 domain_id	7yq2e01
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology	5 — Single alpha-helices involved in coiled-coils or other helix-helix interfaces
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	860 — Photosystem II cytochrome b559, alpha subunit

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晶胞边长 a length_a	122.135 Å
晶胞边长 b length_b	228.172 Å
晶胞边长 c length_c	286.685 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	8

空间群 space_group	P 21 21 21
空间群编号 int_tables_number	19
晶系 crystal_system	orthorhombic

分辨率 resolution	1.900 Å
最低分辨率 resolution_low	20.000 Å
R 因子 r_factor	0.1528
R_work r_work	0.1512
R_free r_free	0.1844

Crystal structure of photosystem II expressing psbA2 gene only

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Photosystem II protein D1 2

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Photosystem II CP47 reaction center protein

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Photosystem II CP43 reaction center protein

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Photosystem II D2 protein

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Cytochrome b559 subunit alpha

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Cytochrome b559 subunit beta

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Photosystem II reaction center protein H

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Photosystem II reaction center protein I

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Photosystem II reaction center protein J

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Photosystem II reaction center protein K

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体