Leptin
Homo sapiens
当前结构中的状态
| Assembly | 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与共同组分 | 实验方法与环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 6 PDB 声明:hexameric(6) 与蛋白拷贝数一致 | 链 A; UniProt 22–167 链 C; UniProt 22–167 链 E; UniProt 22–167 | 未记录 | Leptin receptor × 3 (P48357) | ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 7.4;20 mM HEPES, 150 mM NaCl, pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE | 分辨率 6.45 Å |
数据库中的同蛋白其他状态
以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。
| 其他 PDB | 相对当前条目 8AVF | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法与环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1AX8 Human obesity protein, leptin 提交 1997-10-31 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
22–167(146 aa)
|
突变:W100E | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 7.5;PROTEIN WAS CRYSTALLIZED FROM 1.8M NA FORMATE, 100MM TRIS, PH 7.5
|
分辨率 2.40 Å R-free 0.283 |
| 1AX8 Human obesity protein, leptin 提交 1997-10-31 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric |
链 A
22–167(146 aa)
|
突变:W100E | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 7.5;PROTEIN WAS CRYSTALLIZED FROM 1.8M NA FORMATE, 100MM TRIS, PH 7.5
|
分辨率 2.40 Å R-free 0.283 |
| 7Z3Q Crystal structure of the human leptin:LepR-CRH2 encounter complex to 3.6 A resolution. 提交 2022-03-02 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 A
22–167(146 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;Index screen HT #F1
0.2 M L-proline
0.1 M HEPES pH 7.5
10% PEG 3350
cryo: 25% PEG400
|
分辨率 3.62 Å R-free 0.305 |
| 7Z3Q Crystal structure of the human leptin:LepR-CRH2 encounter complex to 3.6 A resolution. 提交 2022-03-02 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 C
22–167(146 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;Index screen HT #F1
0.2 M L-proline
0.1 M HEPES pH 7.5
10% PEG 3350
cryo: 25% PEG400
|
分辨率 3.62 Å R-free 0.305 |
| 7Z3Q Crystal structure of the human leptin:LepR-CRH2 encounter complex to 3.6 A resolution. 提交 2022-03-02 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 E
22–167(146 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;Index screen HT #F1
0.2 M L-proline
0.1 M HEPES pH 7.5
10% PEG 3350
cryo: 25% PEG400
|
分辨率 3.62 Å R-free 0.305 |
| 8AVE Human leptin in complex with the human LEP-R ectodomain fused to a C-terminal trimeric isoleucine GCN4 zipper (2:2 model) 提交 2022-08-26 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric |
链 A
22–167(146 aa)
链 C
22–167(146 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4;20 mM HEPES, 150 mM NaCl, pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 5.62 Å |
| 8AVO Human leptin in complex with the human LEP-R ectodomain fused to a C-terminal trimeric isoleucine GCN4 zipper (open 3:3 model). 提交 2022-08-26 | 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 6 PDB 声明:hexameric |
链 A
22–167(146 aa)
链 C
22–167(146 aa)
链 E
22–167(146 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4;20 mM HEPES, 150 mM NaCl, pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 6.84 Å |
| 8K6Z NMR structure of human leptin 提交 2023-07-26 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
22–167(146 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
SOLUTION NMR
NMR测量条件
pH 4.5;298 K;离子强度(mmCIF原始值)5;压力 1
NMR样品组成
0.8 mM [U-13C; U-15N] leptin, 95% H2O/5% D2O | 95% H2O/5% D2O
|
分辨率未提供 |
| 8X80 Structure of leptin-LepR trimer with a small gap 提交 2023-11-27 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 其他组合 异源复合物;蛋白 × 6 PDB 声明:hexameric |
链 D
1–167(167 aa)
链 E
1–167(167 aa)
链 F
1–167(167 aa)
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 15 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.88 Å |
| 8X81 Structure of leptin-LepR trimer with a large gap 提交 2023-11-27 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 其他组合 异源复合物;蛋白 × 6 PDB 声明:hexameric |
链 D
1–167(167 aa)
链 E
1–167(167 aa)
链 F
1–167(167 aa)
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 19 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.77 Å |
| 8X85 Structure of leptin-LepR dimer 提交 2023-11-27 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 其他组合 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric |
链 C
1–167(167 aa)
链 D
1–167(167 aa)
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 11 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.58 Å |
| 9PUO Neutralizing monoclonal antibody Fab fragment bound to leptin 提交 2025-07-31 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric |
链 C
22–167(146 aa)
|
突变:W100E | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.4;293 K;Protein at 25 mg/ml in 20 mM Hepes pH 7.4 and 75 mM sodium chloride versus a reservoir with 18% PEG 8,000 and 20% glycerol.
|
分辨率 3.10 Å R-free 0.277 |
| 9PUO Neutralizing monoclonal antibody Fab fragment bound to leptin 提交 2025-07-31 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric |
链 F
22–167(146 aa)
|
突变:W100E | PO4 PHOSPHATE ION × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.4;293 K;Protein at 25 mg/ml in 20 mM Hepes pH 7.4 and 75 mM sodium chloride versus a reservoir with 18% PEG 8,000 and 20% glycerol.
|
分辨率 3.10 Å R-free 0.277 |
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查看构建体与数据证据
| UniProt名称 | LEP_HUMAN |
| Isoform | — |
| PDB实体 | 1 |
| 链与序列区间 | 作者链 A; PDB构建体 26–171; UniProt 22–167 作者链 C; PDB构建体 26–171; UniProt 22–167 作者链 E; PDB构建体 26–171; UniProt 22–167 |