SAXSdb — 8crt

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Blood group Rh(CE) polypeptide

物种未注明

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	其他组合	异源复合物	蛋白 8 其他聚合物 2	Ammonium transporter Rh type A × 2 （Q02094） Glycophorin-B × 1 （P06028） Glycophorin-A × 2 （P02724） Band 3 anion transport protein × 2 （P02730） 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 CHOLESTEROL × 2	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	RHCE_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 K； PDB构建体 1–417； UniProt 1–417

Ammonium transporter Rh type A

物种未注明

UniProt Q02094

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	其他组合	异源复合物	蛋白 8 其他聚合物 2	Blood group Rh(CE) polypeptide × 1 （P18577） Glycophorin-B × 1 （P06028） Glycophorin-A × 2 （P02724） Band 3 anion transport protein × 2 （P02730） 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 CHOLESTEROL × 2	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	RHAG_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 L； PDB构建体 1–409； UniProt 1–409 作者链 Q； PDB构建体 1–409； UniProt 1–409

Glycophorin-B

物种未注明

UniProt P06028

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	其他组合	异源复合物	蛋白 8 其他聚合物 2	Blood group Rh(CE) polypeptide × 1 （P18577） Ammonium transporter Rh type A × 2 （Q02094） Glycophorin-A × 2 （P02724） Band 3 anion transport protein × 2 （P02730） 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 CHOLESTEROL × 2	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	GLPB_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	3
链与序列区间	作者链 P； PDB构建体 1–91； UniProt 1–91

Glycophorin-A

物种未注明

UniProt P02724

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	其他组合	异源复合物	蛋白 8 其他聚合物 2	Blood group Rh(CE) polypeptide × 1 （P18577） Ammonium transporter Rh type A × 2 （Q02094） Glycophorin-B × 1 （P06028） Band 3 anion transport protein × 2 （P02730） 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 CHOLESTEROL × 2	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	GLPA_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	4
链与序列区间	作者链 B； PDB构建体 1–150； UniProt 1–150 作者链 D； PDB构建体 1–150； UniProt 1–150

Band 3 anion transport protein

物种未注明

UniProt P02730

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	其他组合	异源复合物	蛋白 8 其他聚合物 2	Blood group Rh(CE) polypeptide × 1 （P18577） Ammonium transporter Rh type A × 2 （Q02094） Glycophorin-B × 1 （P06028） Glycophorin-A × 2 （P02724） 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 CHOLESTEROL × 2	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	B3AT_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	5
链与序列区间	作者链 C； PDB构建体 1–911； UniProt 1–911 作者链 E； PDB构建体 1–911； UniProt 1–911

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	8crt
沉积日期 deposition_date	2022-05-11
结构标题 title	Local refinement of Rh trimer, glycophorin B and Band3-III transmembrane region, class 1a of erythrocyte ankyrin-1 complex
关键词 keywords	Membrane Protein, ankyrin complex, Erythrocyte, STRUCTURAL PROTEIN; STRUCTURAL PROTEIN
实验方法 method	ELECTRON MICROSCOPY

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

8crt__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

8crt__assembly_1__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

8crt__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	48.65 Å
Rg（电子密度）	48.99 Å
总 Rg	49.10 Å
原子数	17901
残基数	2305
排除体积	328930 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`8crt__assembly_1__model_1`	octameric （8）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (7)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	Blood group Rh(CE) polypeptide
分子量 formula_weight	45598.9 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	K
原子数 atom_count	17925

MSSKYPRSVRRCLPLWALTLEAALILLFYFFTHYDASLEDQKGLVASYQVGQDLTVMAALGLGFLTSNFRRHSWSSVAFNLFMLALGVQWAILLDGFLSQFPPGKVVITLFSIRLATMSAMSVLISAGAVLGKVNLAQLVVMVLVEVTALGTLRMVISNIFNTDYHMNLRHFYVFAAYFGLTVAWCLPKPLPKGTEDNDQRATIPSLSAMLGALFLWMFWPSVNSPLLRSPIQRKNAMFNTYYALAVSVVTAISGSSLAHPQRKISMTYVHSAVLAGGVAVGTSCHLIPSPWLAMVLGLVAGLISIGGAKCLPVCCNRVLGIHHISVMHSIFSLLGLLGEITYIVLLVLHTVWNGNGMIGFQVLLSIGELSLAIVIALTSGLLTGLLLNLKIWKAPHVAKYFDDQVFWKFPHLAVGF

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	Ammonium transporter Rh type A
分子量 formula_weight	44229.6 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	L,Q

MRFTFPLMAIVLEIAMIVLFGLFVEYETDQTVLEQLNITKPTDMGIFFELYPLFQDVHVMIFVGFGFLMTFLKKYGFSSVGINLLVAALGLQWGTIVQGILQSQGQKFNIGIKNMINADFSAATVLISFGAVLGKTSPTQMLIMTILEIVFFAHNEYLVSEIFKASDIGASMTIHAFGAYFGLAVAGILYRSGLRKGHENEESAYYSDLFAMIGTLFLWMFWPSFNSAIAEPGDKQCRAIVNTYFSLAACVLTAFAFSSLVEHRGKLNMVHIQNATLAGGVAVGTCADMAIHPFGSMIIGSIAGMVSVLGYKFLTPLFTTKLRIHDTCGVHNLHGLPGVVGGLAGIVAVAMGASNTSMAMQAAALGSSIGTAVVGGLMTGLILKLPLWGQPSDQNCYDDSVYWKVPKTR

实体 3 Entity 3 polymer

描述 description	Glycophorin-B
分子量 formula_weight	9789.7 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	P

MYGKIIFVLLLSEIVSISALSTTEVAMHTSTSSSVTKSYISSQTNGETGQLVHRFTVPAPVVIILIILCVMAGIIGTILLISYSIRRLIKA

实体 4 Entity 4 polymer

描述 description	Glycophorin-A
分子量 formula_weight	16348.4 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	B,D

MYGKIIFVLLLSEIVSISASSTTGVAMHTSTSSSVTKSYISSQTNDTHKRDTYAATPRAHEVSEISVRTVYPPEEETGERVQLAHHFSEPEITLIIFGVMAGVIGTILLISYGIRRLIKKSPSDVKPLPSPDTDVPLSSVEIENPETSDQ

实体 5 Entity 5 polymer

描述 description	Band 3 anion transport protein
分子量 formula_weight	101883.9 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	C,E

MEELQDDYEDMMEENLEQEEYEDPDIPESQMEEPAAHDTEATATDYHTTSHPGTHKVYVELQELVMDEKNQELRWMEAARWVQLEENLGENGAWGRPHLSHLTFWSLLELRRVFTKGTVLLDLQETSLAGVANQLLDRFIFEDQIRPQDREELLRALLLKHSHAGELEALGGVKPAVLTRSGDPSQPLLPQHSSLETQLFCEQGDGGTEGHSPSGILEKIPPDSEATLVLVGRADFLEQPVLGFVRLQEAAELEAVELPVPIRFLFVLLGPEAPHIDYTQLGRAAATLMSERVFRIDAYMAQSRGELLHSLEGFLDCSLVLPPTDAPSEQALLSLVPVQRELLRRRYQSSPAKPDSSFYKGLDLNGGPDDPLQQTGQLFGGLVRDIRRRYPYYLSDITDAFSPQVLAAVIFIYFAALSPAITFGGLLGEKTRNQMGVSELLISTAVQGILFALLGAQPLLVVGFSGPLLVFEEAFFSFCETNGLEYIVGRVWIGFWLILLVVLVVAFEGSFLVRFISRYTQEIFSFLISLIFIYETFSKLIKIFQDHPLQKTYNYNVLMVPKPQGPLPNTALLSLVLMAGTFFFAMMLRKFKNSSYFPGKLRRVIGDFGVPISILIMVLVDFFIQDTYTQKLSVPDGFKVSNSSARGWVIHPLGLRSEFPIWMMFASALPALLVFILIFLESQITTLIVSKPERKMVKGSGFHLDLLLVVGMGGVAALFGMPWLSATTVRSVTHANALTVMGKASTPGAAAQIQEVKEQRISGLLVAVLVGLSILMEPILSRIPLAVLFGIFLYMGVTSLSGIQLFDRILLLFKPPKYHPDVPYVKRVKTWRMHLFTGIQIICLAVLWVVKSTPASLALPFVLILTVPLRRVLLPLIFRNVELQCLDADDAKATFDEEEGRDEYDEVAMPV

实体 6 Entity 6 branched

描述 description	2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose
分子量 formula_weight	424.4 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

实体 7 Entity 7 non-polymer

描述 description	CHOLESTEROL
分子量 formula_weight	386.7 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	2

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6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 3 domains

CATH v4.4 (3 domains)

结构域编号 domain_id	8crtK01
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	3430 — Ammonium transporter fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Ammonium transporter AmtB like domains

结构域编号 domain_id	8crtL01
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	3430 — Ammonium transporter fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Ammonium transporter AmtB like domains

结构域编号 domain_id	8crtQ01
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	3430 — Ammonium transporter fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Ammonium transporter AmtB like domains

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晶胞边长 a length_a	1.000 Å
晶胞边长 b length_b	1.000 Å
晶胞边长 c length_c	1.000 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	—

空间群 space_group	P 1
空间群编号 int_tables_number	1
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	3.00 Å
分辨率测定方法 resolution_method	—
颗粒数 num_particles	22953

Local refinement of Rh trimer, glycophorin B and Band3-III transmembrane region, class 1a of erythrocyte ankyrin-1 complex

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Blood group Rh(CE) polypeptide

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Ammonium transporter Rh type A

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Glycophorin-B

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Glycophorin-A

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Band 3 anion transport protein

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

8crt__assembly_1__model_1

8crt__assembly_1__model_1 | I(q)

8crt__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

冷冻电镜 EM 3D

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (7)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

实体 3 Entity 3 polymer

聚合物 Polymer

实体 4 Entity 4 polymer

聚合物 Polymer

实体 5 Entity 5 polymer

聚合物 Polymer

实体 6 Entity 6 branched

实体 7 Entity 7 non-polymer

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 3 domains

CATH v4.4 (3 domains)

7. 引用文献 (1)