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2X19
Crystal structure of Importin13 - RanGTP complex
提交 2009-12-23
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构建体不同
突变/修饰不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
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链 A
8–179(172 aa)
片段:RESIDUES 8-179
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突变:YES
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GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1
MG MAGNESIUM ION × 1
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 6;100MM BIS-TRIS PH 6 23% 9W/V) PEG 3350 100MM NA-THIIOCYANATE RT
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分辨率 2.80 Å
R-free 0.268
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3ICQ
Karyopherin nuclear state
提交 2009-07-18
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构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白–RNA
异源复合物;蛋白 × 2
PDB 声明:trimeric
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链 B
9–179(171 aa)
片段:Ran, UNP residues 9-179
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突变:Q71L
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GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1
MG MAGNESIUM ION × 1
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;298 K;100mM Bis-Tris, pH5.5, 20% PEG3350, 180mM sodium acetate at 18 degrees, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
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分辨率 3.20 Å
R-free 0.294
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3ICQ
Karyopherin nuclear state
提交 2009-07-18
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构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 2
蛋白–RNA
异源复合物;蛋白 × 2
PDB 声明:trimeric
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链 C
9–179(171 aa)
片段:Ran, UNP residues 9-179
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突变:Q71L
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GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1
MG MAGNESIUM ION × 1
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;298 K;100mM Bis-Tris, pH5.5, 20% PEG3350, 180mM sodium acetate at 18 degrees, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
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分辨率 3.20 Å
R-free 0.294
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3M1I
Crystal structure of yeast CRM1 (Xpo1p) in complex with yeast RanBP1 (Yrb1p) and yeast RanGTP (Gsp1pGTP)
提交 2010-03-05
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突变/修饰不同
聚集状态不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 3
PDB 声明:trimeric
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链 A
1–219(219 aa)
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突变:Q71L
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GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1
MG MAGNESIUM ION × 1
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.6;293 K;0.1M Bis-Tris, 0.2M ammonium nitrate, 18% PEG3350, pH 6.6, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
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分辨率 2.00 Å
R-free 0.220
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8F19
Cryo-EM structure of Kap114 bound to Gsp1 (RanGTP)
提交 2022-11-04
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构建体不同
突变/修饰不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
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链 B
1–179(179 aa)
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突变:Q71L
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GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1
MG MAGNESIUM ION × 1
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ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5;20 mM Tris pH 7.5, 300 mM NaCl, 2 mM MgCl2, 1 mM TCEP, and 0.1% NP-40
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
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分辨率 3.49 Å
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8F1E
Cryo-EM structure of Kap114 bound to Gsp1 (RanGTP) and H2A-H2B
提交 2022-11-04
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构建体不同
聚集状态不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 4
PDB 声明:tetrameric
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链 D
1–179(179 aa)
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未记录
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MG MAGNESIUM ION × 1
GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1
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ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
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分辨率 3.28 Å
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8F7A
Cryo-EM structure of Importin-9 bound to RanGTP
提交 2022-11-18
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结构质量不同
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Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
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链 B
1–219(219 aa)
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未记录
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MG MAGNESIUM ION × 1
GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1
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ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
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分辨率 3.78 Å
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8QYZ
Crystal structure of hiNES2 in complex with Xpo1 and RanGTP
提交 2023-10-26
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构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 3
PDB 声明:trimeric
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链 A
1–182(182 aa)
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突变:1-182, Q71L
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GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1
MG MAGNESIUM ION × 1
ACT ACETATE ION × 1
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.4;293 K;Tris, PEG 20K, magnesium acetate
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分辨率 3.00 Å
R-free 0.247
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8QYZ
Crystal structure of hiNES2 in complex with Xpo1 and RanGTP
提交 2023-10-26
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构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 2
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 3
PDB 声明:trimeric
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链 B
1–182(182 aa)
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突变:1-182, Q71L
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GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1
MG MAGNESIUM ION × 1
ACT ACETATE ION × 1
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.4;293 K;Tris, PEG 20K, magnesium acetate
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分辨率 3.00 Å
R-free 0.247
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8QYZ
Crystal structure of hiNES2 in complex with Xpo1 and RanGTP
提交 2023-10-26
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 3
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 3
PDB 声明:trimeric
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链 E
1–182(182 aa)
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突变:1-182, Q71L
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GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1
MG MAGNESIUM ION × 1
ACT ACETATE ION × 1
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.4;293 K;Tris, PEG 20K, magnesium acetate
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分辨率 3.00 Å
R-free 0.247
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8QYZ
Crystal structure of hiNES2 in complex with Xpo1 and RanGTP
提交 2023-10-26
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构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 4
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 3
PDB 声明:trimeric
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链 G
1–182(182 aa)
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突变:1-182, Q71L
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GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1
MG MAGNESIUM ION × 1
ACT ACETATE ION × 1
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.4;293 K;Tris, PEG 20K, magnesium acetate
|
分辨率 3.00 Å
R-free 0.247
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9D45
Cryo-EM structure of yeast Exportin Msn5 bound to cargo Pho4 and RanGTP
提交 2024-08-12
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构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 3
PDB 声明:trimeric
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链 B
2–179(178 aa)
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突变:Q71L
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GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1
MG MAGNESIUM ION × 1
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ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
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分辨率 3.10 Å
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9DXM
Cryo-EM structure of yeast Exportin Msn5 bound to RanGTP and Pho4 (not modeled) (State 2-1)
提交 2024-10-11
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构建体不同
突变/修饰不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
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链 B
2–179(178 aa)
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突变:Q71L
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GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1
MG MAGNESIUM ION × 1
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ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
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分辨率 3.20 Å
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9DZ6
Cryo-EM structure of yeast Exportin Msn5 bound to RanGTP and Pho4 (not modeled) (State 3-1)
提交 2024-10-15
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构建体不同
突变/修饰不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
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链 B
2–179(178 aa)
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突变:Q71L
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GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1
MG MAGNESIUM ION × 1
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ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
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分辨率 3.10 Å
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9OGB
Cryo-EM structure of human exportin-1 conjugated with selinexor and bound to yeast RAN-GTP and human ASB8-ELOB/C
提交 2025-04-30
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构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 5
PDB 声明:pentameric
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链 B
1–179(179 aa)
片段:residues 1-179
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突变:Q71L
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V6A selinexor, bound form × 1
GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1
MG MAGNESIUM ION × 1
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ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4;20 mM HEPES pH 7.4, 110 mM KOAc, 2 mM Mg(OAc)2, 2 mM TCEP
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
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分辨率 3.25 Å
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