8eas

Yeast VO in complex with Vma12-22p

Method: ELECTRON MICROSCOPY
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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Vacuolar ATPase assembly protein VMA22

物种未注明

UniProt P38784

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 18 V-type proton ATPase assembly factor Vma12p × 1 V-type proton ATPase subunit F × 1 (A0A6A5PYF6) V-type proton ATPase subunit a, vacuolar isoform × 1 (P32563) V0 assembly protein 1 × 1 (P53262) ;V-type proton ATPase subunit c'' ; × 1 (P23968) V-type proton ATPase subunit d × 1 (P32366) V-type proton ATPase subunit e × 1 (Q3E7B6) Yeast V-ATPase subunit f × 1 (P0C5R9) V-type proton ATPase subunit c × 8 (P25515) ;V-type proton ATPase subunit c' ; × 1 (P32842) 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称 VMA22_YEAST
Isoform —
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A; PDB构建体 1–181; UniProt 1–181

V-type proton ATPase subunit F

物种未注明

UniProt A0A6A5PYF6

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 18 Vacuolar ATPase assembly protein VMA22 × 1 (P38784) V-type proton ATPase assembly factor Vma12p × 1 V-type proton ATPase subunit a, vacuolar isoform × 1 (P32563) V0 assembly protein 1 × 1 (P53262) ;V-type proton ATPase subunit c'' ; × 1 (P23968) V-type proton ATPase subunit d × 1 (P32366) V-type proton ATPase subunit e × 1 (Q3E7B6) Yeast V-ATPase subunit f × 1 (P0C5R9) V-type proton ATPase subunit c × 8 (P25515) ;V-type proton ATPase subunit c' ; × 1 (P32842) 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称 A0A6A5PYF6_YEASX
Isoform —
PDB实体 3
链与序列区间 作者链 F; PDB构建体 1–118; UniProt 1–118

V-type proton ATPase subunit a, vacuolar isoform

物种未注明

UniProt P32563

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 18 Vacuolar ATPase assembly protein VMA22 × 1 (P38784) V-type proton ATPase assembly factor Vma12p × 1 V-type proton ATPase subunit F × 1 (A0A6A5PYF6) V0 assembly protein 1 × 1 (P53262) ;V-type proton ATPase subunit c'' ; × 1 (P23968) V-type proton ATPase subunit d × 1 (P32366) V-type proton ATPase subunit e × 1 (Q3E7B6) Yeast V-ATPase subunit f × 1 (P0C5R9) V-type proton ATPase subunit c × 8 (P25515) ;V-type proton ATPase subunit c' ; × 1 (P32842) 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称 VPH1_YEAST
Isoform —
PDB实体 4
链与序列区间 作者链 a; PDB构建体 1–840; UniProt 1–840

V0 assembly protein 1

物种未注明

UniProt P53262

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 18 Vacuolar ATPase assembly protein VMA22 × 1 (P38784) V-type proton ATPase assembly factor Vma12p × 1 V-type proton ATPase subunit F × 1 (A0A6A5PYF6) V-type proton ATPase subunit a, vacuolar isoform × 1 (P32563) ;V-type proton ATPase subunit c'' ; × 1 (P23968) V-type proton ATPase subunit d × 1 (P32366) V-type proton ATPase subunit e × 1 (Q3E7B6) Yeast V-ATPase subunit f × 1 (P0C5R9) V-type proton ATPase subunit c × 8 (P25515) ;V-type proton ATPase subunit c' ; × 1 (P32842) 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称 VOA1_YEAST
Isoform —
PDB实体 5
链与序列区间 作者链 b; PDB构建体 1–265; UniProt 1–265

;V-type proton ATPase subunit c'' ;

物种未注明

UniProt P23968

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 18 Vacuolar ATPase assembly protein VMA22 × 1 (P38784) V-type proton ATPase assembly factor Vma12p × 1 V-type proton ATPase subunit F × 1 (A0A6A5PYF6) V-type proton ATPase subunit a, vacuolar isoform × 1 (P32563) V0 assembly protein 1 × 1 (P53262) V-type proton ATPase subunit d × 1 (P32366) V-type proton ATPase subunit e × 1 (Q3E7B6) Yeast V-ATPase subunit f × 1 (P0C5R9) V-type proton ATPase subunit c × 8 (P25515) ;V-type proton ATPase subunit c' ; × 1 (P32842) 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称 VATO_YEAST
Isoform —
PDB实体 6
链与序列区间 作者链 c; PDB构建体 1–213; UniProt 1–213

V-type proton ATPase subunit d

物种未注明

UniProt P32366

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 18 Vacuolar ATPase assembly protein VMA22 × 1 (P38784) V-type proton ATPase assembly factor Vma12p × 1 V-type proton ATPase subunit F × 1 (A0A6A5PYF6) V-type proton ATPase subunit a, vacuolar isoform × 1 (P32563) V0 assembly protein 1 × 1 (P53262) ;V-type proton ATPase subunit c'' ; × 1 (P23968) V-type proton ATPase subunit e × 1 (Q3E7B6) Yeast V-ATPase subunit f × 1 (P0C5R9) V-type proton ATPase subunit c × 8 (P25515) ;V-type proton ATPase subunit c' ; × 1 (P32842) 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称 VA0D_YEAST
Isoform —
PDB实体 7
链与序列区间 作者链 d; PDB构建体 1–345; UniProt 1–345

V-type proton ATPase subunit e

物种未注明

UniProt Q3E7B6

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 18 Vacuolar ATPase assembly protein VMA22 × 1 (P38784) V-type proton ATPase assembly factor Vma12p × 1 V-type proton ATPase subunit F × 1 (A0A6A5PYF6) V-type proton ATPase subunit a, vacuolar isoform × 1 (P32563) V0 assembly protein 1 × 1 (P53262) ;V-type proton ATPase subunit c'' ; × 1 (P23968) V-type proton ATPase subunit d × 1 (P32366) Yeast V-ATPase subunit f × 1 (P0C5R9) V-type proton ATPase subunit c × 8 (P25515) ;V-type proton ATPase subunit c' ; × 1 (P32842) 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称 VA0E_YEAST
Isoform —
PDB实体 8
链与序列区间 作者链 e; PDB构建体 1–73; UniProt 1–73

Yeast V-ATPase subunit f

物种未注明

UniProt P0C5R9

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 18 Vacuolar ATPase assembly protein VMA22 × 1 (P38784) V-type proton ATPase assembly factor Vma12p × 1 V-type proton ATPase subunit F × 1 (A0A6A5PYF6) V-type proton ATPase subunit a, vacuolar isoform × 1 (P32563) V0 assembly protein 1 × 1 (P53262) ;V-type proton ATPase subunit c'' ; × 1 (P23968) V-type proton ATPase subunit d × 1 (P32366) V-type proton ATPase subunit e × 1 (Q3E7B6) V-type proton ATPase subunit c × 8 (P25515) ;V-type proton ATPase subunit c' ; × 1 (P32842) 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称 YP17B_YEAST
Isoform —
PDB实体 9
链与序列区间 作者链 f; PDB构建体 1–85; UniProt 1–85

V-type proton ATPase subunit c

物种未注明

UniProt P25515

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 18 Vacuolar ATPase assembly protein VMA22 × 1 (P38784) V-type proton ATPase assembly factor Vma12p × 1 V-type proton ATPase subunit F × 1 (A0A6A5PYF6) V-type proton ATPase subunit a, vacuolar isoform × 1 (P32563) V0 assembly protein 1 × 1 (P53262) ;V-type proton ATPase subunit c'' ; × 1 (P23968) V-type proton ATPase subunit d × 1 (P32366) V-type proton ATPase subunit e × 1 (Q3E7B6) Yeast V-ATPase subunit f × 1 (P0C5R9) ;V-type proton ATPase subunit c' ; × 1 (P32842) 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称 VATL1_YEAST
Isoform —
PDB实体 10
链与序列区间 作者链 g; PDB构建体 1–160; UniProt 1–160 作者链 h; PDB构建体 1–160; UniProt 1–160 作者链 i; PDB构建体 1–160; UniProt 1–160 作者链 j; PDB构建体 1–160; UniProt 1–160 作者链 k; PDB构建体 1–160; UniProt 1–160 作者链 l; PDB构建体 1–160; UniProt 1–160 作者链 m; PDB构建体 1–160; UniProt 1–160 作者链 n; PDB构建体 1–160; UniProt 1–160

;V-type proton ATPase subunit c' ;

物种未注明

UniProt P32842

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 18 Vacuolar ATPase assembly protein VMA22 × 1 (P38784) V-type proton ATPase assembly factor Vma12p × 1 V-type proton ATPase subunit F × 1 (A0A6A5PYF6) V-type proton ATPase subunit a, vacuolar isoform × 1 (P32563) V0 assembly protein 1 × 1 (P53262) ;V-type proton ATPase subunit c'' ; × 1 (P23968) V-type proton ATPase subunit d × 1 (P32366) V-type proton ATPase subunit e × 1 (Q3E7B6) Yeast V-ATPase subunit f × 1 (P0C5R9) V-type proton ATPase subunit c × 8 (P25515) 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称 VATL2_YEAST
Isoform —
PDB实体 11
链与序列区间 作者链 o; PDB构建体 1–164; UniProt 1–164

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中;数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护,因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id8eas
沉积日期 deposition_date2022-08-29
结构标题 titleYeast VO in complex with Vma12-22p
关键词 keywordsV-type, ATPase, assembly, proton, MEMBRANE PROTEIN; MEMBRANE PROTEIN
实验方法 methodELECTRON MICROSCOPY
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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

8eas__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

8eas__assembly_1__model_1 | I(q)

10-2 10-1 106 107 108 109 q (1/Angstrom) I(q)
100 个绘图点;横轴和纵轴均采用对数尺度。

8eas__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

新版 assembly/model P(r) 尚未计算 此处仅保留位置,不展示旧数据 r (Angstrom) P(r)
P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。
Rg(Guinier)46.58 Å
Rg(电子密度)45.97 Å
总 Rg46.23 Å
原子数24802
残基数3280
排除体积450710 ų
最大 q0.500 Å⁻¹
Assembly Model 结构单元 聚集说明 状态 CRYSOL 操作
1 1 8eas__assembly_1__model_1 octadecameric (18) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (11)

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6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 1 domains

CATH v4.4 (1 domains)

结构域编号 domain_id8easo01
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology120 — Four Helix Bundle (Hemerythrin (Met), subunit A)
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily610 — lithium bound rotor ring of v- atpase
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7. 引用文献 (2)