8i0b

The crystal structure of human glutamate receptor 2 in complex with LT-102

Method: X-RAY DIFFRACTION Dmax: 80.2 Å Quality: GOOD

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

SAXS profile for 8i0b

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

P(r) distribution for 8i0b
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1. 结构基本信息 1. Structure Basics

条目编号 entry_id8i0b
沉积日期 deposition_date2023-01-10
结构标题 titleThe crystal structure of human glutamate receptor 2 in complex with LT-102
关键词 keywordsglutamate receptor 2, inhibitor, complex, STRUCTURAL PROTEIN; STRUCTURAL PROTEIN
实验方法 methodX-RAY DIFFRACTION

2. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 2. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier25.09
回转半径 Rg (电子) rg_electron23.84
零角强度 I(0) i056437400.00
分子量 molecular_weight58637.0 kDa
排除体积 excluded_volume73514 ų
包络体积 envelope_volume87509 ų
水化壳体积 shell_volume29778 ų
包络直径 envelope_diameter82.1
壳层 Rg shell_rg31.74
包络 Rg envelope_rg24.02
形状 Rg shape_rg23.80
总 Rg total_rg24.84
总原子数 total_atoms8169
残基数 n_residues523
球谐函数阶数 n_harmonics20
q 范围 q_range— – 0.5000 −1
数据点数 n_points101
壳层类型 shell_typedirectional
溶剂电子密度 solvent_density0.3340 e/ų
壳层衬度 contrast_shell0.0300 e/ų
CRYSOL 版本 crysol_version4.1.3

3. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 3. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax80.2
Rg (实空间) rg_real24.96
Rg 误差 (实空间) rg_real_error0.43
I(0) (实空间) i0_real5.6440e+07
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error6.9530e+05
Rg (倒空间) rg_reciprocal25.00
I(0) (倒空间) i0_reciprocal56440000.0000
解质量估计 total_estimate0.8987
解质量评级 solution_quality GOOD a GOOD solution
P(r) 峰数 n_peaks2
主峰位置 r_peak_primary31.8
偏度 Skewness skewness0.142
峰度 Kurtosis kurtosis-0.518
角度范围 angular_range— – 0.3150 −1
当前正则化参数 α current_alpha0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha13330000.0000
实空间数据点数 n_real_points64
GNOM 版本 gnom_version4.1.3
质量判据 quality_criteria AN1: 0.000; Oscil: 0.900; Stabil: 1.000; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 1.000; Smooth: 0.977

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

5. 实体与聚合体信息 (6)

7. 引用文献 (1)

8. 文件与曲线 (10)