SAXSdb — 8ilb

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Ribulose bisphosphate carboxylase large chain

Synechococcus elongatus PCC 6301

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 18	Rubisco accumulation factor 1.2, chloroplastic × 2 （Q9SR19） Protein BUNDLE SHEATH DEFECTIVE 2, chloroplastic × 8 （Q9SN73）	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	RBL_SYNP6
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–472； UniProt 1–472 作者链 B； PDB构建体 1–472； UniProt 1–472 作者链 C； PDB构建体 1–472； UniProt 1–472 作者链 D； PDB构建体 1–472； UniProt 1–472 作者链 J； PDB构建体 1–472； UniProt 1–472 作者链 K； PDB构建体 1–472； UniProt 1–472 作者链 L； PDB构建体 1–472； UniProt 1–472 作者链 M； PDB构建体 1–472； UniProt 1–472

Rubisco accumulation factor 1.2, chloroplastic

Arabidopsis thaliana

UniProt Q9SR19

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 18	Ribulose bisphosphate carboxylase large chain × 8 （P00880） Protein BUNDLE SHEATH DEFECTIVE 2, chloroplastic × 8 （Q9SN73）	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	RAF2_ARATH
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 E； PDB构建体 2–389； UniProt 62–449 作者链 N； PDB构建体 2–389； UniProt 62–449

Protein BUNDLE SHEATH DEFECTIVE 2, chloroplastic

Arabidopsis thaliana

UniProt Q9SN73

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 18	Ribulose bisphosphate carboxylase large chain × 8 （P00880） Rubisco accumulation factor 1.2, chloroplastic × 2 （Q9SR19）	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	BSD2_ARATH
Isoform	—
PDB实体	3
链与序列区间	作者链 F； PDB构建体 2–81； UniProt 57–136 作者链 G； PDB构建体 2–81； UniProt 57–136 作者链 H； PDB构建体 2–81； UniProt 57–136 作者链 I； PDB构建体 2–81； UniProt 57–136 作者链 O； PDB构建体 2–81； UniProt 57–136 作者链 P； PDB构建体 2–81； UniProt 57–136 作者链 Q； PDB构建体 2–81； UniProt 57–136 作者链 R； PDB构建体 2–81； UniProt 57–136

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	8ilb
沉积日期 deposition_date	2023-03-03
结构标题 title	The complexes of RbcL, AtRaf1 and AtBSD2 (LFB)
关键词 keywords	RUBISCO ASSEMBL INTERMIDATES, COMPLEX, CHAPERONE, LYASE-CHAPERONE complex; LYASE/CHAPERONE
实验方法 method	ELECTRON MICROSCOPY

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

8ilb__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

8ilb__assembly_1__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

8ilb__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	51.32 Å
Rg（电子密度）	50.50 Å
总 Rg	50.77 Å
原子数	36322
残基数	4680
排除体积	642490 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`8ilb__assembly_1__model_1`	octadecameric （18）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (3)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	Ribulose bisphosphate carboxylase large chain
分子量 formula_weight	52516.6 kDa
EC 编号 ec_number	4.1.1.39
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	8

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A,B,C,D,J,K,L,M
原子数 atom_count	36322

MPKTQSAAGYKAGVKDYKLTYYTPDYTPKDTDLLAAFRFSPQPGVPADEAGAAIAAESSTGTWTTVWTDLLTDMDRYKGKCYHIEPVQGEENSYFAFIAYPLDLFEEGSVTNILTSIVGNVFGFKAIRSLRLEDIRFPVALVKTFQGPPHGIQVERDLLNKYGRPMLGCTIKPKLGLSAKNYGRAVYECLRGGLDFTKDDENINSQPFQRWRDRFLFVADAIHKSQAETGEIKGHYLNVTAPTCEEMMKRAEFAKELGMPIIMHDFLTAGFTANTTLAKWCRDNGVLLHIHRAMHAVIDRQRNHGIHFRVLAKCLRLSGGDHLHSGTVVGKLEGDKASTLGFVDLMREDHIEADRSRGVFFTQDWASMPGVLPVASGGIHVWHMPALVEIFGDDSVLQFGGGTLGHPWGNAPGATANRVALEACVQARNEGRDLYREGGDILREAGKWSPELAAALDLWKEIKFEFETMDKL

来源 Source

来源生物 organism	Synechococcus elongatus PCC 6301
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	269084
宿主生物 host_organism	Escherichia coli BL21(DE3)

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	Rubisco accumulation factor 1.2, chloroplastic
分子量 formula_weight	43732.6 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	E,N

MQQLYQPFRPPSSPIPTQFRSLDSAGKIEILAGRMALWFEYAPLISSLYTDGFTPPTIEELTGISSIEQNRLIVGAQVRDSILQSIHEPELISAFDTGGAELLYEIRLLSTTQRVAAATFIIDRNIDSKGAQDLARAIKDYPNRRGDVGWLDFDYNLPGDCLSFLYYRQSRENKNPSDQRTSMLLQALGVAESEKAKNRLNTELYGDKEAEKEKEKKKKEEEVKAIRIPVVRLKFGEVAEATSVVVLPVCKAEEGEKKILEAPMEIIAGGDFKVVEAEKGWKRWVVLPSWNPVAAIGKGGVAVSFRDDRKVLPWDGKEEPLLVVADRVRNVVEADDGYYLVVAENGLKLEKGSDLKAREVKESLGMVVLVVRPPREDDDDWQTSHQNWD

来源 Source

来源生物 organism	Arabidopsis thaliana
通用名 common_name	thale cress
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	3702
宿主生物 host_organism	Escherichia coli BL21(DE3)

实体 3 Entity 3 polymer

描述 description	Protein BUNDLE SHEATH DEFECTIVE 2, chloroplastic
分子量 formula_weight	8355.5 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	8

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	F,G,H,I,O,P,Q,R

MAANNNPQGTKPNSLVCANCEGEGCVACSQCKGGGVNLIDHFNGQFKAGALCWLCRGKKEVLCGDCNGAGFIGGFLSTFDE

来源 Source

来源生物 organism	Arabidopsis thaliana
通用名 common_name	thale cress
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	3702
宿主生物 host_organism	Escherichia coli BL21(DE3)

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分辨率 resolution	3.00 Å
分辨率测定方法 resolution_method	—
颗粒数 num_particles	233489

The complexes of RbcL, AtRaf1 and AtBSD2 (LFB)

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Ribulose bisphosphate carboxylase large chain

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Rubisco accumulation factor 1.2, chloroplastic

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Protein BUNDLE SHEATH DEFECTIVE 2, chloroplastic

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

8ilb__assembly_1__model_1

8ilb__assembly_1__model_1 | I(q)

8ilb__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

冷冻电镜 EM 3D

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (3)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

7. 引用文献 (1)

The complexes of RbcL, AtRaf1 and AtBSD2 (LFB)

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Ribulose bisphosphate carboxylase large chain

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Rubisco accumulation factor 1.2, chloroplastic

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Protein BUNDLE SHEATH DEFECTIVE 2, chloroplastic

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

8ilb__assembly_1__model_1

8ilb__assembly_1__model_1 | I(q)

8ilb__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

冷冻电镜 EM 3D

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (3)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

7. 引用文献 (1)