SAXSdb — 8k42

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

VP2

物种未注明

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 145	VP8 × 65 （W0G587） VP10 × 10 （A0A2H4QDD3） VP4 × 30 （B4Y048） VP9 × 30 （Q9YWN5）	与蛋白数一致
2	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 29	VP8 × 13 （W0G587） VP10 × 2 （A0A2H4QDD3） VP4 × 6 （B4Y048） VP9 × 6 （Q9YWN5）	与蛋白数一致
3	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 29	VP8 × 13 （W0G587） VP10 × 2 （A0A2H4QDD3） VP4 × 6 （B4Y048） VP9 × 6 （Q9YWN5）	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	Q9INH3_9REOV
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–955； UniProt 1–955 作者链 B； PDB构建体 1–955； UniProt 1–955

VP8

物种未注明

UniProt W0G587

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 145	VP2 × 10 （Q9INH3） VP10 × 10 （A0A2H4QDD3） VP4 × 30 （B4Y048） VP9 × 30 （Q9YWN5）	与蛋白数一致
2	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 29	VP2 × 2 （Q9INH3） VP10 × 2 （A0A2H4QDD3） VP4 × 6 （B4Y048） VP9 × 6 （Q9YWN5）	与蛋白数一致
3	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 29	VP2 × 2 （Q9INH3） VP10 × 2 （A0A2H4QDD3） VP4 × 6 （B4Y048） VP9 × 6 （Q9YWN5）	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	W0G587_9REOV
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 C； PDB构建体 1–302； UniProt 1–302 作者链 D； PDB构建体 1–302； UniProt 1–302 作者链 E； PDB构建体 1–302； UniProt 1–302 作者链 F； PDB构建体 1–302； UniProt 1–302 作者链 G； PDB构建体 1–302； UniProt 1–302 作者链 H； PDB构建体 1–302； UniProt 1–302 作者链 I； PDB构建体 1–302； UniProt 1–302 作者链 J； PDB构建体 1–302； UniProt 1–302 作者链 K； PDB构建体 1–302； UniProt 1–302 作者链 L； PDB构建体 1–302； UniProt 1–302 作者链 M； PDB构建体 1–302； UniProt 1–302 作者链 N； PDB构建体 1–302； UniProt 1–302 作者链 O； PDB构建体 1–302； UniProt 1–302

VP10

物种未注明

UniProt A0A2H4QDD3

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 145	VP2 × 10 （Q9INH3） VP8 × 65 （W0G587） VP4 × 30 （B4Y048） VP9 × 30 （Q9YWN5）	与蛋白数一致
2	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 29	VP2 × 2 （Q9INH3） VP8 × 13 （W0G587） VP4 × 6 （B4Y048） VP9 × 6 （Q9YWN5）	与蛋白数一致
3	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 29	VP2 × 2 （Q9INH3） VP8 × 13 （W0G587） VP4 × 6 （B4Y048） VP9 × 6 （Q9YWN5）	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	A0A2H4QDD3_9REOV
Isoform	—
PDB实体	3
链与序列区间	作者链 P； PDB构建体 1–249； UniProt 1–249 作者链 Q； PDB构建体 1–249； UniProt 1–249

VP4

物种未注明

UniProt B4Y048

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 145	VP2 × 10 （Q9INH3） VP8 × 65 （W0G587） VP10 × 10 （A0A2H4QDD3） VP9 × 30 （Q9YWN5）	与蛋白数一致
2	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 29	VP2 × 2 （Q9INH3） VP8 × 13 （W0G587） VP10 × 2 （A0A2H4QDD3） VP9 × 6 （Q9YWN5）	与蛋白数一致
3	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 29	VP2 × 2 （Q9INH3） VP8 × 13 （W0G587） VP10 × 2 （A0A2H4QDD3） VP9 × 6 （Q9YWN5）	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	B4Y048_9REOV
Isoform	—
PDB实体	4
链与序列区间	作者链 R； PDB构建体 1–628； UniProt 1–628 作者链 S； PDB构建体 1–628； UniProt 1–628 作者链 T； PDB构建体 1–628； UniProt 1–628 作者链 U； PDB构建体 1–628； UniProt 1–628 作者链 V； PDB构建体 1–628； UniProt 1–628 作者链 W； PDB构建体 1–628； UniProt 1–628

VP9

物种未注明

UniProt Q9YWN5

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 145	VP2 × 10 （Q9INH3） VP8 × 65 （W0G587） VP10 × 10 （A0A2H4QDD3） VP4 × 30 （B4Y048）	与蛋白数一致
2	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 29	VP2 × 2 （Q9INH3） VP8 × 13 （W0G587） VP10 × 2 （A0A2H4QDD3） VP4 × 6 （B4Y048）	与蛋白数一致
3	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 29	VP2 × 2 （Q9INH3） VP8 × 13 （W0G587） VP10 × 2 （A0A2H4QDD3） VP4 × 6 （B4Y048）	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	Q9YWN5_9REOV
Isoform	—
PDB实体	5
链与序列区间	作者链 r； PDB构建体 1–283； UniProt 1–283 作者链 s； PDB构建体 1–283； UniProt 1–283 作者链 t； PDB构建体 1–283； UniProt 1–283 作者链 u； PDB构建体 1–283； UniProt 1–283 作者链 v； PDB构建体 1–283； UniProt 1–283 作者链 w； PDB构建体 1–283； UniProt 1–283

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	8k42
沉积日期 deposition_date	2023-07-17
结构标题 title	Structure of full Banna virus
关键词 keywords	reovirus, complex, capsid protein, VIRUS; VIRUS
实验方法 method	ELECTRON MICROSCOPY

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

8k42__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

8k42__assembly_1__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

8k42__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	0.00 Å
Rg（电子密度）	132.10 Å
总 Rg	132.10 Å
原子数	381795
残基数	48985
排除体积	6789300 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`8k42__assembly_1__model_1`	145-meric （145）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
2	1	`8k42__assembly_2__model_1`	29-meric （29）	排除	—	—
	排除原因：辅助对称表示，不是完整或代表性的 biological assembly。
3	1	`8k42__assembly_3__model_1`	29-meric （29）	排除	—	—
	排除原因：辅助对称表示，不是完整或代表性的 biological assembly。

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (5)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	VP2
分子量 formula_weight	108031.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A,B
原子数 atom_count	76359

MPRKKDQVTKNDDGNQTSDVQTQDFKTAVQPDTNTAQLIKTYSNPKQRGDKGEIIYDGGLSSKLADVVDKTTEPHNADGAVKDGRIAPVKLDLEKQKLDKLKLFETSPFDPLTIKNNQDVVDKLYATQSSSIQEVVPTKTFATELQFGVTSEDMAKIYGAVAAVSKNVNSSVTYEVKRGTHELIKVPTIPHNLVLIQSDNGKHALIKEDLGQWPVETGISLVNQAGVFAVQLANKLGIDKPFVLDAGSNYFTDTSFIDTRKYCTDGLSPREIQKALNRQRAYYDRPELTISENKTLLSQSIIYPDADGNDVSIIFSGAMSHAIFTYAQSQWNKNIIKLDDYIREITLTVPKQYRPRRFKEIEHTHGYVYRELNQGSLLPLVDANLKESSSYYFKKLMSSISNVPVDARTLQSATAALAADTGQAVNRAQHVSMLTNRLTTANAPTVRAITVLTCMFKQFRIGMTYALDPNIMDVAAATCMLLFRPAQSISDEQYRYCLQTMAVFLTNTTYDIVNNDTIDVLKMKLRNQGWPFVERYNAVEIDMSVEPLRSPGQVGRYYNPFNIDPLTKKHVEDRLEEFINQVQVGRFRNASGNAVGTTLAAFLRACRDKTSANWRGYSVLVSRYRSLIPNELFESLRNISGEYNINPQDEHSFFFALAQINADDEFIGAIDKESAEYLDEYATLARDISNSLTLVKAAFGPLERTSGSIINHANNLNKVINHVFADKPLISETMLKILTIDGTTGKDGYRNWLDKLVGHNYPVYVEPVVNIMNFISARFVADSSYFGYTNEIMIMPNHINVPVDDRFGFRDSPFCTSLPRTIMGNDVRRISYNVFSMMEDIDDVISEGFILYDAYFNFSYDIMTTDGVTRLKEDILIVTDTGNDIKPIHFYIYFENRNDKKLRYESKMNVSYRLYIKTPACLLPLSDYMRAQHDYVSPSSSRVYIKDPAVVYTRS

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	VP8
分子量 formula_weight	32885.3 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	13

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N,O

MANRATSAFLDNPHPVGVNYVDEGSRQFVAVAELLASKLIDSSRESDESNSDVPFVQAYSKFADDNPRHLRVKTGGKMANALTNVIRSYYSINAPAIVPQVEIDRLASKATVSGDMYNSYAIFNSVPIVEVLSPARTTVSIVGSDRADVTMLNTGAGAANITFNFGQIAETVILKGSVPFQLARLNQPMPAARFTYKLRPLDGPFIVVLPVGNPLVISATAATRIQVPLAFNKALVESGFQTAMNDGLFDIQNVNYYSSFDEFIISQYHAQDGINRVSTCVILGLALQAYDQMRRALPVRRV

实体 3 Entity 3 polymer

描述 description	VP10
分子量 formula_weight	28655.8 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	P,Q

MDVLSKGSLKELLAHLEKTPLEEAISYRIGTVPYQNVLISRNEYYNQLYPDTTSLIDGVSREGQRNVNGLIMSIISYVVSGSGHYIPNIGFMLLRRSILDILTKHDTGLVTNNLNYGIIARNLTVSKMNCEQRKRMLICFKLLAYKDGNQNDYEIYLNQNIPLKQIAPNFIPGDMRTVIHNQDQLAIVGIPAYRLTQSTELSIRDDNAKSYKLGYVDWYNSNSFLRERSEFNLIRLKDRDTKYGKLNGW

实体 4 Entity 4 polymer

描述 description	VP4
分子量 formula_weight	69767.5 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	6

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	R,S,T,U,V,W

MAWVTQAYSSGLSQNSIISLTGNDRTVADGTFNSMIMPRAVIANEREHFMKTRIDKIEHDLNRSAKQEMMDRQSLAEDYNALNLAVGQEIKLDIATQHQLNRLGSAMYKADHERETELTDLINRIRENEVTVNGILENQKAITAAERADLLLEVVASTAKSVSAAGRAAADGSGVVPVFGPSVANGIKVGIDIADSVAEAAIAVKESGIITQLNDVYHAFQSVHVAPNDVIKPAAVVAGTSTELIGNLQAIYSRLRSHSDIGFKKATVGDVIPNSYMIKPVNSTEYASWQLYVIHPVQGSLGLVVQLMGDALTYNVFAQYGNTSASEFGKTVLTGGATNTALEGTKVKFQTKVTAQQALALTMALKDAASMLSQGELIGYFEQYINLALEPDNLSLQDNMHKYHHLLTSQNSPIDWNYHDEEMHKWLDSRKTTNYDAMQKKDGTVIADIHIPKVFNDLRNTTLHCKLEGKQTIAGYTVYEYLIGPWAHYGDIDYSVVVDTLNEETKWYCEVIGIDGHLLIEKSVQHKPEKILELTVNDSGVTSFNGRNHDRLKLKVYVKDSLSVKVFRNWIGINAPRVKTKMFNDHIGVKYDYSHFDKNISPAHLTLTDLGWHTWDQYNAGNWTNIKP

实体 5 Entity 5 polymer

描述 description	VP9
分子量 formula_weight	30581.2 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	6

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	r,s,t,u,v,w

MLSETELRALKKLSTTTSRVVGDSTLALPSNVKLSKGEVEKIAVTKKEMFDELAQCNLPTIELITREHTFNGDVIRFAAWLFLMNGQKLMIANNVAVRMGMQYATNLAGNNVKITYVTSNNVVKLGHIAAGVLANPYSNKGSGLFITYEYNLISNLIETGKVCVLFITSLSTTASSTNSFAYSTCSVPIENWDFNMIKLTAETSCASLTAMTNLVNSLVPGERTRPVGLYVDIPGVTVTTSASSGSLPLTTIPAVTPLIFSAYTKQVEEVGVINTLYALSYLP

▶

晶胞边长 a length_a	1.000 Å
晶胞边长 b length_b	1.000 Å
晶胞边长 c length_c	1.000 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	—

空间群 space_group	P 1
空间群编号 int_tables_number	1
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	2.64 Å
分辨率测定方法 resolution_method	—
颗粒数 num_particles	293354

Structure of full Banna virus

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

VP2

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

VP8

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

VP10

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

VP4

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

VP9

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

8k42__assembly_1__model_1

8k42__assembly_1__model_1 | I(q)

8k42__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

冷冻电镜 EM 3D

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (5)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

实体 3 Entity 3 polymer

聚合物 Polymer

实体 4 Entity 4 polymer

聚合物 Polymer

实体 5 Entity 5 polymer

聚合物 Polymer

7. 引用文献 (1)

Structure of full Banna virus

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

VP2

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

VP8

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

VP10

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

VP4

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

VP9

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

8k42__assembly_1__model_1

8k42__assembly_1__model_1 | I(q)

8k42__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

冷冻电镜 EM 3D

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (5)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

实体 3 Entity 3 polymer

聚合物 Polymer

实体 4 Entity 4 polymer

聚合物 Polymer

实体 5 Entity 5 polymer

聚合物 Polymer

7. 引用文献 (1)