SAXSdb — 8q7c

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Hexon protein

物种未注明

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白同源多聚体同源多聚体蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3）与蛋白拷贝数一致	链 A； UniProt 1–952 链 B； UniProt 1–952 链 C； UniProt 1–952	未记录	无其他共同聚合物	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.2 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.90 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 8Q7C	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
1P30 Refinement of Adenovirus Type 5 Hexon with CNS 提交 2003-04-16	构建体不同突变/修饰不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 A 1–951（951 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 3.2；298 K；0.5 SODIUM CITRATE , pH 3.2, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K	分辨率 2.50 Å R-free 0.207
3TG7 Crystal structure of Adenovirus serotype 5 hexon at 1.6A resolution 提交 2011-08-17	构建体不同突变/修饰不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 A 2–952（951 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；291 K；14% PEG 6000 in Bis-tris propane buffer., pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 291K	分辨率 1.57 Å R-free 0.223
4V4U The quasi-atomic model of Human Adenovirus type 5 capsid 提交 2005-03-03	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 840 PDB 声明：840-meric	链 F 1–951（951 aa）链 G 1–951（951 aa）链 H 1–951（951 aa）链 I 1–951（951 aa）链 J 1–951（951 aa）链 K 1–951（951 aa）链 L 1–951（951 aa）链 M 1–951（951 aa）链 N 1–951（951 aa）链 O 1–951（951 aa）链 P 1–951（951 aa）链 Q 1–951（951 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 TRIS；pH 7.5；TRIS cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；LIQUID ETHANE	分辨率 10.00 Å
4V4U The quasi-atomic model of Human Adenovirus type 5 capsid 提交 2005-03-03	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 22 PDB 声明：22-meric	链 F 1–951（951 aa）链 G 1–951（951 aa）链 H 1–951（951 aa）链 I 1–951（951 aa）链 J 1–951（951 aa）链 K 1–951（951 aa）链 L 1–951（951 aa）链 M 1–951（951 aa）链 N 1–951（951 aa）链 O 1–951（951 aa）链 P 1–951（951 aa）链 Q 1–951（951 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 TRIS；pH 7.5；TRIS cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；LIQUID ETHANE	分辨率 10.00 Å
4V4U The quasi-atomic model of Human Adenovirus type 5 capsid 提交 2005-03-03	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 22 PDB 声明：22-meric	链 F 1–951（951 aa）链 G 1–951（951 aa）链 H 1–951（951 aa）链 I 1–951（951 aa）链 J 1–951（951 aa）链 K 1–951（951 aa）链 L 1–951（951 aa）链 M 1–951（951 aa）链 N 1–951（951 aa）链 O 1–951（951 aa）链 P 1–951（951 aa）链 Q 1–951（951 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 TRIS；pH 7.5；TRIS cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；LIQUID ETHANE	分辨率 10.00 Å
5LDN A viral capsid:antibody complex 提交 2016-06-27	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 A 8–947（940 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；PEG 4000, sodium chloride,	分辨率 2.70 Å R-free 0.223
5OGI Complex of a binding protein and human adenovirus C 5 hexon 提交 2017-07-13	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–952（952 aa）	未记录	SO4 SULFATE ION × 7 DIO 1,4-DIETHYLENE DIOXIDE × 10 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；277 K；1.6 M (NH4)2SO4, 10 % dioxane, 0.1 M MES pH 6.5	分辨率 2.80 Å R-free 0.235
6B1T Improved cryoEM structure of human adenovirus type 5 with atomic details of minor proteins VI and VII 提交 2017-09-18	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 1500 PDB 声明：1500-meric	链 A 1–952（952 aa）链 B 1–952（952 aa）链 C 1–952（952 aa）链 D 1–952（952 aa）链 E 1–952（952 aa）链 F 1–952（952 aa）链 G 1–952（952 aa）链 H 1–952（952 aa）链 I 1–952（952 aa）链 J 1–952（952 aa）链 K 1–952（952 aa）链 L 1–952（952 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.20 Å
6B1T Improved cryoEM structure of human adenovirus type 5 with atomic details of minor proteins VI and VII 提交 2017-09-18	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 25 PDB 声明：25-meric	链 A 1–952（952 aa）链 B 1–952（952 aa）链 C 1–952（952 aa）链 D 1–952（952 aa）链 E 1–952（952 aa）链 F 1–952（952 aa）链 G 1–952（952 aa）链 H 1–952（952 aa）链 I 1–952（952 aa）链 J 1–952（952 aa）链 K 1–952（952 aa）链 L 1–952（952 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.20 Å
6B1T Improved cryoEM structure of human adenovirus type 5 with atomic details of minor proteins VI and VII 提交 2017-09-18	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 125 PDB 声明：125-meric	链 A 1–952（952 aa）链 B 1–952（952 aa）链 C 1–952（952 aa）链 D 1–952（952 aa）链 E 1–952（952 aa）链 F 1–952（952 aa）链 G 1–952（952 aa）链 H 1–952（952 aa）链 I 1–952（952 aa）链 J 1–952（952 aa）链 K 1–952（952 aa）链 L 1–952（952 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.20 Å
6B1T Improved cryoEM structure of human adenovirus type 5 with atomic details of minor proteins VI and VII 提交 2017-09-18	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 4 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 150 PDB 声明：150-meric	链 A 1–952（952 aa）链 B 1–952（952 aa）链 C 1–952（952 aa）链 D 1–952（952 aa）链 E 1–952（952 aa）链 F 1–952（952 aa）链 G 1–952（952 aa）链 H 1–952（952 aa）链 I 1–952（952 aa）链 J 1–952（952 aa）链 K 1–952（952 aa）链 L 1–952（952 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.20 Å
6B1T Improved cryoEM structure of human adenovirus type 5 with atomic details of minor proteins VI and VII 提交 2017-09-18	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 5 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 25 PDB 声明：25-meric	链 A 1–952（952 aa）链 B 1–952（952 aa）链 C 1–952（952 aa）链 D 1–952（952 aa）链 E 1–952（952 aa）链 F 1–952（952 aa）链 G 1–952（952 aa）链 H 1–952（952 aa）链 I 1–952（952 aa）链 J 1–952（952 aa）链 K 1–952（952 aa）链 L 1–952（952 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.20 Å
6CGV Revised crystal structure of human adenovirus 提交 2018-02-21	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 1260 PDB 声明：1260-meric	链 A 4–952（949 aa）链 B 4–952（949 aa）链 C 4–952（949 aa）链 D 4–952（949 aa）链 E 4–952（949 aa）链 F 4–952（949 aa）链 G 4–952（949 aa）链 H 4–952（949 aa）链 I 4–952（949 aa）链 J 4–952（949 aa）链 K 4–952（949 aa）链 L 4–952（949 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；293 K；100MM HEPES PH 7.0, 200MM CALCIUM ACETATE, 14% PEG550 MME, 15% GLYCEROL.	分辨率 3.80 Å R-free 0.427
6CGV Revised crystal structure of human adenovirus 提交 2018-02-21	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 21 PDB 声明：21-meric	链 A 4–952（949 aa）链 B 4–952（949 aa）链 C 4–952（949 aa）链 D 4–952（949 aa）链 E 4–952（949 aa）链 F 4–952（949 aa）链 G 4–952（949 aa）链 H 4–952（949 aa）链 I 4–952（949 aa）链 J 4–952（949 aa）链 K 4–952（949 aa）链 L 4–952（949 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；293 K；100MM HEPES PH 7.0, 200MM CALCIUM ACETATE, 14% PEG550 MME, 15% GLYCEROL.	分辨率 3.80 Å R-free 0.427
6CGV Revised crystal structure of human adenovirus 提交 2018-02-21	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 105 PDB 声明：105-meric	链 A 4–952（949 aa）链 B 4–952（949 aa）链 C 4–952（949 aa）链 D 4–952（949 aa）链 E 4–952（949 aa）链 F 4–952（949 aa）链 G 4–952（949 aa）链 H 4–952（949 aa）链 I 4–952（949 aa）链 J 4–952（949 aa）链 K 4–952（949 aa）链 L 4–952（949 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；293 K；100MM HEPES PH 7.0, 200MM CALCIUM ACETATE, 14% PEG550 MME, 15% GLYCEROL.	分辨率 3.80 Å R-free 0.427
6CGV Revised crystal structure of human adenovirus 提交 2018-02-21	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 4 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 126 PDB 声明：126-meric	链 A 4–952（949 aa）链 B 4–952（949 aa）链 C 4–952（949 aa）链 D 4–952（949 aa）链 E 4–952（949 aa）链 F 4–952（949 aa）链 G 4–952（949 aa）链 H 4–952（949 aa）链 I 4–952（949 aa）链 J 4–952（949 aa）链 K 4–952（949 aa）链 L 4–952（949 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；293 K；100MM HEPES PH 7.0, 200MM CALCIUM ACETATE, 14% PEG550 MME, 15% GLYCEROL.	分辨率 3.80 Å R-free 0.427
6CGV Revised crystal structure of human adenovirus 提交 2018-02-21	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 5 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 21 PDB 声明：21-meric	链 A 4–952（949 aa）链 B 4–952（949 aa）链 C 4–952（949 aa）链 D 4–952（949 aa）链 E 4–952（949 aa）链 F 4–952（949 aa）链 G 4–952（949 aa）链 H 4–952（949 aa）链 I 4–952（949 aa）链 J 4–952（949 aa）链 K 4–952（949 aa）链 L 4–952（949 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；293 K；100MM HEPES PH 7.0, 200MM CALCIUM ACETATE, 14% PEG550 MME, 15% GLYCEROL.	分辨率 3.80 Å R-free 0.427
6CGV Revised crystal structure of human adenovirus 提交 2018-02-21	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 6 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 1260 PDB 声明：1260-meric	链 A 4–952（949 aa）链 B 4–952（949 aa）链 C 4–952（949 aa）链 D 4–952（949 aa）链 E 4–952（949 aa）链 F 4–952（949 aa）链 G 4–952（949 aa）链 H 4–952（949 aa）链 I 4–952（949 aa）链 J 4–952（949 aa）链 K 4–952（949 aa）链 L 4–952（949 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；293 K；100MM HEPES PH 7.0, 200MM CALCIUM ACETATE, 14% PEG550 MME, 15% GLYCEROL.	分辨率 3.80 Å R-free 0.427
6EQC Cryo-EM reconstruction of a complex of a binding protein and human adenovirus C5 hexon 提交 2017-10-12	聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 A 1–952（952 aa）链 B 1–952（952 aa）链 C 1–952（952 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 7.40 Å
7S78 Structure of a cell-entry defective human adenovirus provides insights into precursor proteins and capsid maturation 提交 2021-09-15	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 1860 PDB 声明：1860-meric	链 A 1–952（952 aa）链 B 1–952（952 aa）链 C 1–952（952 aa）链 D 1–952（952 aa）链 E 1–952（952 aa）链 F 1–952（952 aa）链 G 1–952（952 aa）链 H 1–952（952 aa）链 I 1–952（952 aa）链 J 1–952（952 aa）链 K 1–952（952 aa）链 L 1–952（952 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8.1；40 mM Tris, pH 8.1 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.72 Å
7S78 Structure of a cell-entry defective human adenovirus provides insights into precursor proteins and capsid maturation 提交 2021-09-15	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 31 PDB 声明：31-meric	链 A 1–952（952 aa）链 B 1–952（952 aa）链 C 1–952（952 aa）链 D 1–952（952 aa）链 E 1–952（952 aa）链 F 1–952（952 aa）链 G 1–952（952 aa）链 H 1–952（952 aa）链 I 1–952（952 aa）链 J 1–952（952 aa）链 K 1–952（952 aa）链 L 1–952（952 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8.1；40 mM Tris, pH 8.1 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.72 Å
7S78 Structure of a cell-entry defective human adenovirus provides insights into precursor proteins and capsid maturation 提交 2021-09-15	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 155 PDB 声明：155-meric	链 A 1–952（952 aa）链 B 1–952（952 aa）链 C 1–952（952 aa）链 D 1–952（952 aa）链 E 1–952（952 aa）链 F 1–952（952 aa）链 G 1–952（952 aa）链 H 1–952（952 aa）链 I 1–952（952 aa）链 J 1–952（952 aa）链 K 1–952（952 aa）链 L 1–952（952 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8.1；40 mM Tris, pH 8.1 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.72 Å
7S78 Structure of a cell-entry defective human adenovirus provides insights into precursor proteins and capsid maturation 提交 2021-09-15	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 4 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 186 PDB 声明：186-meric	链 A 1–952（952 aa）链 B 1–952（952 aa）链 C 1–952（952 aa）链 D 1–952（952 aa）链 E 1–952（952 aa）链 F 1–952（952 aa）链 G 1–952（952 aa）链 H 1–952（952 aa）链 I 1–952（952 aa）链 J 1–952（952 aa）链 K 1–952（952 aa）链 L 1–952（952 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8.1；40 mM Tris, pH 8.1 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.72 Å
7S78 Structure of a cell-entry defective human adenovirus provides insights into precursor proteins and capsid maturation 提交 2021-09-15	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 5 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 31 PDB 声明：31-meric	链 A 1–952（952 aa）链 B 1–952（952 aa）链 C 1–952（952 aa）链 D 1–952（952 aa）链 E 1–952（952 aa）链 F 1–952（952 aa）链 G 1–952（952 aa）链 H 1–952（952 aa）链 I 1–952（952 aa）链 J 1–952（952 aa）链 K 1–952（952 aa）链 L 1–952（952 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8.1；40 mM Tris, pH 8.1 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.72 Å
9CLI Cryo-EM model derived from localized reconstruction of human adenovirus (Ad5)-hexon-FX complex at 3.6A resolution 提交 2024-07-11	聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 J 1–952（952 aa）链 K 1–952（952 aa）链 L 1–952（952 aa）	未记录	CA CALCIUM ION × 7	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.2 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.61 Å
9CLN Cryo-EM model derived from localized reconstruction of human adenovirus 5 (Ad5)-hexon-FII complex at 3.9A resolution 提交 2024-07-11	聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 J 1–952（952 aa）链 K 1–952（952 aa）链 L 1–952（952 aa）	未记录	CA CALCIUM ION × 7	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.2 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.13 Å

共 11 个其他 PDB 条目、26 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	CAPSH_ADE05
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–952； UniProt 1–952 作者链 B； PDB构建体 1–952； UniProt 1–952 作者链 C； PDB构建体 1–952； UniProt 1–952

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	8q7c
沉积日期 deposition_date	2023-08-16
结构标题 title	Cryo-EM structure of Adenovirus C5 hexon
关键词 keywords	capsid protein, trimer, VIRUS; VIRUS
实验方法 method	ELECTRON MICROSCOPY

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3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier	42.17 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron	41.47 Å
零角强度 I(0) i0	1336640000.00
分子量 molecular_weight	302350.0 kDa
排除体积 excluded_volume	377490 Å³
包络体积 envelope_volume	489390 Å³
水化壳体积 shell_volume	92142 Å³
包络直径 envelope_diameter	133.2 Å
壳层 Rg shell_rg	51.08 Å
包络 Rg envelope_rg	41.06 Å
形状 Rg shape_rg	41.47 Å
总 Rg total_rg	41.92 Å
总原子数 total_atoms	21348
残基数 n_residues	2670
球谐函数阶数 n_harmonics	20
q 范围 q_range	— – 0.5000 Å⁻¹
数据点数 n_points	101
壳层类型 shell_type	directional
溶剂电子密度 solvent_density	0.3340 e/Å³
壳层衬度 contrast_shell	0.0300 e/Å³
CRYSOL 版本 crysol_version	4.1.3

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4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax	132.8 Å
Rg (实空间) rg_real	41.92 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error	0.73 Å
I(0) (实空间) i0_real	1.3370e+09
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error	2.0040e+07
Rg (倒空间) rg_reciprocal	42.17 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal	1337000000.0000
解质量估计 total_estimate	0.8843
解质量评级 solution_quality	GOOD a GOOD solution
P(r) 峰数 n_peaks	1
主峰位置 r_peak_primary	57.4 Å
偏度 Skewness skewness	0.111
峰度 Kurtosis kurtosis	-0.442
角度范围 angular_range	— – 0.1850 Å⁻¹
当前正则化参数 α current_alpha	0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha	362400000.0000
实空间数据点数 n_real_points	38
GNOM 版本 gnom_version	4.1.3
质量判据 quality_criteria	AN1: 0.000; Oscil: 0.870; Stabil: 1.000; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.959; Smooth: 0.921

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5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

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6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (1)

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7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 3 domains

CATH v4.4 (3 domains)

结构域编号 domain_id	8q7cA01
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	170 — Beta Complex
拓扑 Topology topology	9 — Adenovirus Type 2 Hexon; domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Adenovirus Type 2 Hexon, domain 1

结构域编号 domain_id	8q7cB01
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	170 — Beta Complex
拓扑 Topology topology	9 — Adenovirus Type 2 Hexon; domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Adenovirus Type 2 Hexon, domain 1

结构域编号 domain_id	8q7cC01
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	170 — Beta Complex
拓扑 Topology topology	9 — Adenovirus Type 2 Hexon; domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Adenovirus Type 2 Hexon, domain 1

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8. 引用文献 (1)

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晶胞边长 a length_a	1.000 Å
晶胞边长 b length_b	1.000 Å
晶胞边长 c length_c	1.000 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	—

空间群 space_group	P 1
空间群编号 int_tables_number	1
晶系 crystal_system	triclinic

分辨率 resolution	2.90 Å
分辨率测定方法 resolution_method	—
颗粒数 num_particles	53396

描述 description	Hexon protein
分子量 formula_weight	108107.6 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	3

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A,B,C
原子数 atom_count	21348

Cryo-EM structure of Adenovirus C5 hexon

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Hexon protein

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

冷冻电镜 EM 3D

6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (1)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 3 domains

CATH v4.4 (3 domains)

8. 引用文献 (1)

9. 文件与曲线 (10)

Files (7)

Curves (3)

fit	/app/data/saxs_computation/q7/8q7c/8q7c.fit
pddf	/app/data/pr_computation/q7/8q7c/8q7c.pr.out
profile	/app/data/saxs_computation/q7/8q7c/8q7c.dat