SAXSdb — 8qjf

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Gap junction beta-1 protein

Homo sapiens

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白同源多聚体同源多聚体蛋白 × 12 PDB 声明：12-meric（12）与蛋白拷贝数一致	链 A； UniProt 1–283 链 C； UniProt 1–283 链 D； UniProt 1–283 链 E； UniProt 1–283 链 F； UniProt 1–283 链 G； UniProt 1–283 链 H； UniProt 1–283 链 I； UniProt 1–283 链 J； UniProt 1–283 链 K； UniProt 1–283 链 L； UniProt 1–283 链 M； UniProt 1–283	未记录	CLR CHOLESTEROL × 12	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 8 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.86 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 8QJF	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
5KK9 Connexin 32 G12R N-Terminal Mutant, 提交 2016-06-21	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–22（22 aa）	突变：G12R 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 7；288 K；离子强度（mmCIF原始值）0.1；压力 1 NMR样品组成 1.0 mM ACE-MET-ASN-TRP-THR-GLY-LEU-TYR-THR-LEU-LEU-SER-ARG-VAL-ASN-ARG-HIS-SER-THR-ALA-ILE-GLY-ARG, 100 mM KCl, 100 uM TSP, 90% H2O/10% D2O \| 90% H2O/10% D2O	分辨率未提供
7ZXM cryo-EM structure of Connexin 32 gap junction channel 提交 2022-05-21	配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric	链 A 1–283（283 aa）链 B 1–283（283 aa）链 C 1–283（283 aa）链 D 1–283（283 aa）链 E 1–283（283 aa）链 F 1–283（283 aa）链 G 1–283（283 aa）链 H 1–283（283 aa）链 I 1–283（283 aa）链 J 1–283（283 aa）链 K 1–283（283 aa）链 L 1–283（283 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.14 Å
7ZXN cryo-EM structure of Connexin 32 gap junction channel 提交 2022-05-21	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 A 1–283（283 aa）链 B 1–283（283 aa）链 C 1–283（283 aa）链 D 1–283（283 aa）链 E 1–283（283 aa）链 F 1–283（283 aa）	未记录	CLR CHOLESTEROL × 6	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.06 Å
7ZXO cryo-EM structure of Connexin 32 gap junction channel 提交 2022-05-21	配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric	链 A 1–283（283 aa）链 B 1–283（283 aa）链 C 1–283（283 aa）链 D 1–283（283 aa）链 E 1–283（283 aa）链 F 1–283（283 aa）链 G 1–283（283 aa）链 H 1–283（283 aa）链 I 1–283（283 aa）链 J 1–283（283 aa）链 K 1–283（283 aa）链 L 1–283（283 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.50 Å
7ZXP cryo-EM structure of Connexin 32 R22G mutation gap junction channel 提交 2022-05-22	配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric	链 A 1–283（283 aa）链 B 1–283（283 aa）链 C 1–283（283 aa）链 D 1–283（283 aa）链 E 1–283（283 aa）链 F 1–283（283 aa）链 G 1–283（283 aa）链 H 1–283（283 aa）链 I 1–283（283 aa）链 J 1–283（283 aa）链 K 1–283（283 aa）链 L 1–283（283 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.39 Å
7ZXQ cryo-EM structure of Connexin 32 R22G mutation hemi channel 提交 2022-05-22	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 A 1–283（283 aa）链 B 1–283（283 aa）链 C 1–283（283 aa）链 D 1–283（283 aa）链 E 1–283（283 aa）链 F 1–283（283 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.53 Å
7ZXT cryo-EM structure of Connexin 32 W3S mutation hemi channel 提交 2022-05-22	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 A 1–283（283 aa）链 B 1–283（283 aa）链 C 1–283（283 aa）链 D 1–283（283 aa）链 E 1–283（283 aa）链 F 1–283（283 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.90 Å
8QJH Connexin-32 gap junction channel in complex with mefloquine 提交 2023-09-13	配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 12 PDB 声明：12-meric	链 A 1–283（283 aa）链 B 1–283（283 aa）链 C 1–283（283 aa）链 D 1–283（283 aa）链 E 1–283（283 aa）链 F 1–283（283 aa）链 G 1–283（283 aa）链 H 1–283（283 aa）链 I 1–283（283 aa）链 J 1–283（283 aa）链 K 1–283（283 aa）链 L 1–283（283 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.91 Å
8QK6 Connexin-32 hemichannel upon addition of 2-aminoetoxydiphenyl borate 提交 2023-09-14	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 A 1–283（283 aa）链 B 1–283（283 aa）链 C 1–283（283 aa）链 D 1–283（283 aa）链 E 1–283（283 aa）链 F 1–283（283 aa）	未记录	CLR CHOLESTEROL × 6	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.18 Å
8QKI Connexin-32 hemichannel upon addition of mefloquine 提交 2023-09-15	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 A 1–283（283 aa）链 B 1–283（283 aa）链 C 1–283（283 aa）链 D 1–283（283 aa）链 E 1–283（283 aa）链 F 1–283（283 aa）	未记录	CLR CHOLESTEROL × 6	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.46 Å
9QN9 Connexin-32 (Cx32) gap junction channel in POPC-containing nanodiscs in the absence of CHS 提交 2025-03-24	配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 12 PDB 声明：12-meric	链 A 1–283（283 aa）链 B 1–283（283 aa）链 C 1–283（283 aa）链 D 1–283（283 aa）链 E 1–283（283 aa）链 F 1–283（283 aa）链 G 1–283（283 aa）链 H 1–283（283 aa）链 I 1–283（283 aa）链 J 1–283（283 aa）链 K 1–283（283 aa）链 L 1–283（283 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.12 Å
9QND Connexin-32 (Cx32) W3S mutant gap junction channel in POPC-containing MSP2N2 nanodiscs 提交 2025-03-24	配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 12 PDB 声明：12-meric	链 A 1–283（283 aa）链 B 1–283（283 aa）链 C 1–283（283 aa）链 D 1–283（283 aa）链 E 1–283（283 aa）链 F 1–283（283 aa）链 G 1–283（283 aa）链 H 1–283（283 aa）链 I 1–283（283 aa）链 J 1–283（283 aa）链 K 1–283（283 aa）链 L 1–283（283 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.35 Å
9QNF Connexin-32 (Cx32) in MSP2N2 nanodiscs with POPC 提交 2025-03-25	聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足同源多聚体；蛋白 × 12 PDB 声明：12-meric	链 A 1–283（283 aa）链 B 1–283（283 aa）链 C 1–283（283 aa）链 D 1–283（283 aa）链 E 1–283（283 aa）链 F 1–283（283 aa）链 G 1–283（283 aa）链 H 1–283（283 aa）链 I 1–283（283 aa）链 J 1–283（283 aa）链 K 1–283（283 aa）链 L 1–283（283 aa）	未记录	POV (2S)-3-(hexadecanoyloxy)-2-[(9Z)-octadec-9-enoyloxy]propyl 2-(trimethylammonio)ethyl phosphate × 12 CLR CHOLESTEROL × 12	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.16 Å
9QNT Connexin-32 (Cx32) in MSP2N2 nanodiscs with liver polar lipids 提交 2025-03-25	聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足同源多聚体；蛋白 × 12 PDB 声明：12-meric	链 A 1–283（283 aa）链 B 1–283（283 aa）链 C 1–283（283 aa）链 D 1–283（283 aa）链 E 1–283（283 aa）链 F 1–283（283 aa）链 G 1–283（283 aa）链 H 1–283（283 aa）链 I 1–283（283 aa）链 J 1–283（283 aa）链 K 1–283（283 aa）链 L 1–283（283 aa）	未记录	POV (2S)-3-(hexadecanoyloxy)-2-[(9Z)-octadec-9-enoyloxy]propyl 2-(trimethylammonio)ethyl phosphate × 12 CLR CHOLESTEROL × 12	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.29 Å

共 14 个其他 PDB 条目、14 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	CXB1_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–283； UniProt 1–283 作者链 C； PDB构建体 1–283； UniProt 1–283 作者链 D； PDB构建体 1–283； UniProt 1–283 作者链 E； PDB构建体 1–283； UniProt 1–283 作者链 F； PDB构建体 1–283； UniProt 1–283 作者链 G； PDB构建体 1–283； UniProt 1–283 作者链 H； PDB构建体 1–283； UniProt 1–283 作者链 I； PDB构建体 1–283； UniProt 1–283 作者链 J； PDB构建体 1–283； UniProt 1–283 作者链 K； PDB构建体 1–283； UniProt 1–283 作者链 L； PDB构建体 1–283； UniProt 1–283 作者链 M； PDB构建体 1–283； UniProt 1–283

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	8qjf
沉积日期 deposition_date	2023-09-13
结构标题 title	Connexin-32 gap junction channel in complex with 2-aminoethoxydiphenyl borate
关键词 keywords	complex, MEMBRANE PROTEIN; MEMBRANE PROTEIN
实验方法 method	ELECTRON MICROSCOPY

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3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier	48.31 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron	48.99 Å
零角强度 I(0) i0	847536000.00
分子量 molecular_weight	272320.0 kDa
排除体积 excluded_volume	352940 Å³
包络体积 envelope_volume	460780 Å³
水化壳体积 shell_volume	80237 Å³
包络直径 envelope_diameter	158.6 Å
壳层 Rg shell_rg	51.02 Å
包络 Rg envelope_rg	48.69 Å
形状 Rg shape_rg	49.01 Å
总 Rg total_rg	49.01 Å
总原子数 total_atoms	19164
残基数 n_residues	2352
球谐函数阶数 n_harmonics	20
q 范围 q_range	— – 0.5000 Å⁻¹
数据点数 n_points	101
壳层类型 shell_type	directional
溶剂电子密度 solvent_density	0.3340 e/Å³
壳层衬度 contrast_shell	0.0300 e/Å³
CRYSOL 版本 crysol_version	4.1.3

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4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax	162.6 Å
Rg (实空间) rg_real	48.67 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error	1.54 Å
I(0) (实空间) i0_real	8.4750e+08
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error	1.7830e+07
Rg (倒空间) rg_reciprocal	48.32 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal	847100000.0000
解质量估计 total_estimate	0.7622
解质量评级 solution_quality	GOOD a GOOD solution
P(r) 峰数 n_peaks	1
主峰位置 r_peak_primary	49.3 Å
偏度 Skewness skewness	0.523
峰度 Kurtosis kurtosis	-0.368
角度范围 angular_range	— – 0.1650 Å⁻¹
当前正则化参数 α current_alpha	0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha	198100000.0000
实空间数据点数 n_real_points	34
GNOM 版本 gnom_version	4.1.3
质量判据 quality_criteria	AN1: 0.000; Oscil: 0.637; Stabil: 1.000; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.994; Smooth: 0.000

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5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

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6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (2)

▶

8. 引用文献 (1)

▶

晶胞边长 a length_a	1.000 Å
晶胞边长 b length_b	1.000 Å
晶胞边长 c length_c	1.000 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	—

空间群 space_group	P 1
空间群编号 int_tables_number	1
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	2.86 Å
分辨率测定方法 resolution_method	—
颗粒数 num_particles	51701

描述 description	Gap junction beta-1 protein
分子量 formula_weight	32065.5 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	12

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M
原子数 atom_count	19164

Connexin-32 gap junction channel in complex with 2-aminoethoxydiphenyl borate

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Gap junction beta-1 protein

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

冷冻电镜 EM 3D

6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (2)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 non-polymer

8. 引用文献 (1)

9. 文件与曲线 (10)

Files (7)

Curves (3)

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Homo sapiens

描述 description	CHOLESTEROL
分子量 formula_weight	386.7 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	12

fit	/app/data/saxs_computation/qj/8qjf/8qjf.fit
pddf	/app/data/pr_computation/qj/8qjf/8qjf.pr.out
profile	/app/data/saxs_computation/qj/8qjf/8qjf.dat