8qu5

mt-LSU assembly intermediate in GTPBP8 knock-out cells, state 2

Method: ELECTRON MICROSCOPY Dmax: 270.6 Å Quality: REASONABLE

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

SAXS profile for 8qu5

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

P(r) distribution for 8qu5
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1. 结构基本信息 1. Structure Basics

条目编号 entry_id8qu5
沉积日期 deposition_date2023-10-13
结构标题 titlemt-LSU assembly intermediate in GTPBP8 knock-out cells, state 2
关键词 keywordsMitochondria, Assembly, GTPBP8, RIBOSOME; RIBOSOME
实验方法 methodELECTRON MICROSCOPY

2. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 2. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier75.77
回转半径 Rg (电子) rg_electron78.68
零角强度 I(0) i033273500000.00
分子量 molecular_weight1297400.0 kDa
排除体积 excluded_volume1517900 ų
包络体积 envelope_volume2575800 ų
水化壳体积 shell_volume257460 ų
包络直径 envelope_diameter251.3
壳层 Rg shell_rg86.35
包络 Rg envelope_rg77.48
形状 Rg shape_rg78.84
总 Rg total_rg78.29
总原子数 total_atoms89817
残基数 n_residues9238
球谐函数阶数 n_harmonics20
q 范围 q_range— – 0.5000 −1
数据点数 n_points101
壳层类型 shell_typedirectional
溶剂电子密度 solvent_density0.3340 e/ų
壳层衬度 contrast_shell0.0300 e/ų
CRYSOL 版本 crysol_version4.1.3

3. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 3. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax270.6
Rg (实空间) rg_real78.85
Rg 误差 (实空间) rg_real_error1.56
I(0) (实空间) i0_real3.3270e+10
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error7.0790e+08
Rg (倒空间) rg_reciprocal76.27
I(0) (倒空间) i0_reciprocal33320000000.0000
解质量估计 total_estimate0.6731
解质量评级 solution_quality REASONABLE a REASONABLE solution
P(r) 峰数 n_peaks2
主峰位置 r_peak_primary90.2
偏度 Skewness skewness0.480
峰度 Kurtosis kurtosis0.088
角度范围 angular_range— – 0.1050 −1
当前正则化参数 α current_alpha1.0670
最高正则化参数 α highest_alpha1938000000.0000
实空间数据点数 n_real_points22
GNOM 版本 gnom_version4.1.3
质量判据 quality_criteria AN1: 0.000; Oscil: 0.786; Stabil: 0.886; Sysdev: 0.020; Positv: 1.000; Valcen: 0.956; Smooth: 0.748

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

5. 实体与聚合体信息 (58)

7. 引用文献 (1)

8. 文件与曲线 (10)