8r02

Crystal structure of the retromer complex VPS29/VPS35 with the ligand bis-1,3-phenyl guanylhydrazone, 2a

Method: X-RAY DIFFRACTION D_max: 126.9 Å Quality: GOOD

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Vacuolar protein sorting-associated protein 29

Homo sapiens

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2）与蛋白拷贝数一致	链 A； UniProt 1–182	未记录	Vacuolar protein sorting-associated protein 35 × 1 （Q96QK1）	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.4；293 K；20% PEG 3350, 150 mM NaK tartrate, 100 mM NaCl, pH 7.4	分辨率 2.50 Å R-free 0.264
2	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2）与蛋白拷贝数一致	链 B； UniProt 1–182	未记录	Vacuolar protein sorting-associated protein 35 × 1 （Q96QK1） XFZ Bis-1,3-phenyl guanylhydrazon × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.4；293 K；20% PEG 3350, 150 mM NaK tartrate, 100 mM NaCl, pH 7.4	分辨率 2.50 Å R-free 0.264

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 8R02	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
1W24 Crystal Structure Of human Vps29 提交 2004-06-26	聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–182（182 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 7.5；25%PEG4000, 10%ETHYENE GLYCOL, 100MM HEPES PH7.5, pH 7.50	分辨率 2.10 Å R-free 0.244
2R17 Functional architecture of the retromer cargo-recognition complex 提交 2007-08-22	突变/修饰不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–182（182 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 hanging drop；pH 8；291 K；20% PEG 3350, 1M NaCl,50mM Tris, pH 8.0, hanging drop, temperature 291K	分辨率 2.80 Å R-free 0.268
2R17 Functional architecture of the retromer cargo-recognition complex 提交 2007-08-22	突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 1–182（182 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	GOL GLYCEROL × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 hanging drop；pH 8；291 K；20% PEG 3350, 1M NaCl,50mM Tris, pH 8.0, hanging drop, temperature 291K	分辨率 2.80 Å R-free 0.268
5GTU Structural and mechanistic insights into regulation of the retromer coat by TBC1d5 提交 2016-08-23	构建体不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 2–182（181 aa）片段：UNP residues 2-182	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 EVAPORATION；pH 6；289 K；0.1M Bis-Tris, pH6.0, 2% Tacsimate, pH 6.0, 15~20% PEG3350	分辨率 1.50 Å R-free 0.186
5OSH Structure of retromer VPS29-VPS35C subunits complexed with RidL N-terminal domain (1-236) 提交 2017-08-17	聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 A 1–182（182 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；291 K；0.1 M sodium chloride 0.1 M Tris pH 8.0 4-8% PEG6000.	分辨率 4.30 Å R-free 0.311
5OSH Structure of retromer VPS29-VPS35C subunits complexed with RidL N-terminal domain (1-236) 提交 2017-08-17	聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 D 1–182（182 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；291 K；0.1 M sodium chloride 0.1 M Tris pH 8.0 4-8% PEG6000.	分辨率 4.30 Å R-free 0.311
5OSH Structure of retromer VPS29-VPS35C subunits complexed with RidL N-terminal domain (1-236) 提交 2017-08-17	聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 G 1–182（182 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；291 K；0.1 M sodium chloride 0.1 M Tris pH 8.0 4-8% PEG6000.	分辨率 4.30 Å R-free 0.311
5OSH Structure of retromer VPS29-VPS35C subunits complexed with RidL N-terminal domain (1-236) 提交 2017-08-17	聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 4 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 J 1–182（182 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；291 K；0.1 M sodium chloride 0.1 M Tris pH 8.0 4-8% PEG6000.	分辨率 4.30 Å R-free 0.311
5OSI Structure of retromer VPS29-VPS35C subunits complexed with RidL harpin loop (163-176) 提交 2017-08-17	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 A 1–182（182 aa）	未记录	EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；291 K；0.1 M NaCl, 20% PEG3350 0.1 M Tris pH 8.5	分辨率 2.52 Å R-free 0.267
5OSI Structure of retromer VPS29-VPS35C subunits complexed with RidL harpin loop (163-176) 提交 2017-08-17	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 D 1–182（182 aa）	未记录	EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 NA SODIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；291 K；0.1 M NaCl, 20% PEG3350 0.1 M Tris pH 8.5	分辨率 2.52 Å R-free 0.267
5OSI Structure of retromer VPS29-VPS35C subunits complexed with RidL harpin loop (163-176) 提交 2017-08-17	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 G 1–182（182 aa）	未记录	EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 NA SODIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；291 K；0.1 M NaCl, 20% PEG3350 0.1 M Tris pH 8.5	分辨率 2.52 Å R-free 0.267
5OSI Structure of retromer VPS29-VPS35C subunits complexed with RidL harpin loop (163-176) 提交 2017-08-17	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 4 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 J 1–182（182 aa）	未记录	EDO 1,2-ETHANEDIOL × 5 NA SODIUM ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；291 K；0.1 M NaCl, 20% PEG3350 0.1 M Tris pH 8.5	分辨率 2.52 Å R-free 0.267
5WYH Crystal structure of RidL(1-200) complexed with VPS29 提交 2017-01-13	构建体不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 2–182（181 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293 K；0.1M Tris pH8.0, 20% PEG 8000	分辨率 2.46 Å R-free 0.225
5WYH Crystal structure of RidL(1-200) complexed with VPS29 提交 2017-01-13	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 C 2–182（181 aa）	未记录	GOL GLYCEROL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293 K；0.1M Tris pH8.0, 20% PEG 8000	分辨率 2.46 Å R-free 0.225
6XS5 Crystal structure of human Vps29 complexed with RaPID-derived cyclic peptide RT-D1 提交 2020-07-15	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–182（182 aa）	未记录	GOL GLYCEROL × 2 FMT FORMIC ACID × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；3.5 M Sodium Formate	分辨率 2.01 Å R-free 0.225
6XS7 Crystal structure of human Vps29 complexed with RaPID-derived cyclic peptide RT-D2 提交 2020-07-15	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–182（182 aa）	未记录	GOL GLYCEROL × 2 FMT FORMIC ACID × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.1 M Potassium thiocyanate, 30% PEG2000 MME	分辨率 1.58 Å R-free 0.191
6XS9 Crystal structure of human Vps29 complexed with RaPID-derived cyclic peptide RT-L1 提交 2020-07-15	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 1–182（182 aa）	未记录	MLI MALONATE ION × 2 GOL GLYCEROL × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293 K；1.4 M sodium malonate	分辨率 2.69 Å R-free 0.282
6XS9 Crystal structure of human Vps29 complexed with RaPID-derived cyclic peptide RT-L1 提交 2020-07-15	突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 1–182（182 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	GOL GLYCEROL × 1 O4B 1,4,7,10,13,16-HEXAOXACYCLOOCTADECANE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293 K；1.4 M sodium malonate	分辨率 2.69 Å R-free 0.282
6XSA Crystal structure of human Vps29 complexed with RaPID-derived cyclic peptide RT-L2 提交 2020-07-15	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–182（182 aa）	未记录	SO4 SULFATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；293 K；0.1 M HEPES, 1 M succinic and 1% PEG2000 MME	分辨率 1.83 Å R-free 0.227
7BLN VPS35/VPS29 arch of metazoan membrane-assembled retromer:SNX3 complex modelled with human proteins 提交 2021-01-18	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 B 1–182（182 aa）链 D 1–182（182 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 8.90 Å
8ESE Crystal structure of human Vps29 bound to a peptide from Vps35L 提交 2022-10-13	实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 Z 1–182（182 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；293 K；0.1 M Bis-tris pH 5.5 and 25% (w/v) PEG3350	分辨率 1.35 Å R-free 0.241
8P0V Structure of the human Commander complex coiled coils, DENND10 and partial Retriever subcomplex 提交 2023-05-10	聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric	链 N 1–182（182 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 6.50 Å
8P0X Structure of the human Commander complex Retriever Subcomplex 提交 2023-05-11	聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric	链 N 1–182（182 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 7.50 Å
8R0J Crystal structure of the retromer complex VPS29/VPS35 with the ligand bis-1,3-phenyl guanylhydrazone, 2a 提交 2023-10-31	实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–182（182 aa）	未记录	XFZ Bis-1,3-phenyl guanylhydrazon × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.4；293 K；18% PEG 3350, 150 mM NaK tartrate, pH 7.4;	分辨率 2.40 Å R-free 0.250
8R0J Crystal structure of the retromer complex VPS29/VPS35 with the ligand bis-1,3-phenyl guanylhydrazone, 2a 提交 2023-10-31	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 1–182（182 aa）	未记录	TRS 2-AMINO-2-HYDROXYMETHYL-PROPANE-1,3-DIOL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.4；293 K；18% PEG 3350, 150 mM NaK tartrate, pH 7.4;	分辨率 2.40 Å R-free 0.250
8RKS Structure of VPS29-VPS35 bound to the LFa motif R21 of Fam21. 提交 2023-12-30	聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 A 1–182（182 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；291 K；0.1 M NaCl, 20% PEG3350 0.1 M Tris pH 8.5	分辨率 3.10 Å R-free 0.288
8RKS Structure of VPS29-VPS35 bound to the LFa motif R21 of Fam21. 提交 2023-12-30	聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 C 1–182（182 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；291 K；0.1 M NaCl, 20% PEG3350 0.1 M Tris pH 8.5	分辨率 3.10 Å R-free 0.288
8RKS Structure of VPS29-VPS35 bound to the LFa motif R21 of Fam21. 提交 2023-12-30	聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 E 1–182（182 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；291 K；0.1 M NaCl, 20% PEG3350 0.1 M Tris pH 8.5	分辨率 3.10 Å R-free 0.288
8RKS Structure of VPS29-VPS35 bound to the LFa motif R21 of Fam21. 提交 2023-12-30	聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 4 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 G 1–182（182 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；291 K；0.1 M NaCl, 20% PEG3350 0.1 M Tris pH 8.5	分辨率 3.10 Å R-free 0.288
8SYM Human VPS29/VPS35L Complex (Locally refined map) 提交 2023-05-25	构建体不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 1–186（186 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7；10 mM HEPES (pH 7.0), 150 mM NaCl, 2 mM MgCl2, 2 mM DTT, and 5% (v/v) glycerol cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.20 Å
8SYN Human VPS35L/VPS29/VPS26C Complex 提交 2023-05-25	构建体不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 B 1–186（186 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7；10 mM HEPES (pH 7.0), 150 mM NaCl, 2 mM MgCl2, 2 mM DTT, and 5% (v/v) glycerol cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.94 Å
8SYO Human Retriever VPS35L/VPS29/VPS26C Complex (Composite Map) 提交 2023-05-25	构建体不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 B 1–186（186 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7；10 mM HEPES (pH 7.0), 150 mM NaCl, 2 mM MgCl2, 2 mM DTT, and 5% (v/v) glycerol cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.94 Å
9AU7 Human Retriever VPS35L/VPS29/VPS26C complex bound to SNX17 peptide (Composite Map) 提交 2024-02-28	构建体不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 B 1–186（186 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.40 Å

共 20 个其他 PDB 条目、33 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	VPS29_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 4–185； UniProt 1–182 作者链 B； PDB构建体 4–185； UniProt 1–182

Vacuolar protein sorting-associated protein 35

Homo sapiens

UniProt Q96QK1

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2）与蛋白拷贝数一致	链 C； UniProt 476–780	未记录	Vacuolar protein sorting-associated protein 29 × 1 （Q9UBQ0）	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.4；293 K；20% PEG 3350, 150 mM NaK tartrate, 100 mM NaCl, pH 7.4	分辨率 2.50 Å R-free 0.264
2	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2）与蛋白拷贝数一致	链 D； UniProt 476–780	未记录	Vacuolar protein sorting-associated protein 29 × 1 （Q9UBQ0） XFZ Bis-1,3-phenyl guanylhydrazon × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.4；293 K；20% PEG 3350, 150 mM NaK tartrate, 100 mM NaCl, pH 7.4	分辨率 2.50 Å R-free 0.264

数据库中的同蛋白其他状态

其他 PDB	相对当前条目 8R02	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
2R17 Functional architecture of the retromer cargo-recognition complex 提交 2007-08-22	构建体不同突变/修饰不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 C 483–780（298 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 hanging drop；pH 8；291 K；20% PEG 3350, 1M NaCl,50mM Tris, pH 8.0, hanging drop, temperature 291K	分辨率 2.80 Å R-free 0.268
2R17 Functional architecture of the retromer cargo-recognition complex 提交 2007-08-22	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 D 483–780（298 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	GOL GLYCEROL × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 hanging drop；pH 8；291 K；20% PEG 3350, 1M NaCl,50mM Tris, pH 8.0, hanging drop, temperature 291K	分辨率 2.80 Å R-free 0.268
5F0J Structure of retromer VPS26-VPS35 subunits bound to SNX3 提交 2015-11-27	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 A 14–470（457 aa）片段：Residues 14-470	未记录	SO4 SULFATE ION × 6 GOL GLYCEROL × 5 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 24	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；291 K；0.9 M AmSO4, 0.1 M MES pH 6.0	分辨率 2.70 Å R-free 0.246
5F0K Structure of VPS35 N terminal region 提交 2015-11-27	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 14–470（457 aa）片段：Residues 14-470	未记录	EDO 1,2-ETHANEDIOL × 5 GOL GLYCEROL × 1 SO4 SULFATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.6；291 K；1.7 M AmSO4, 2% PEG 1000, 0.1 M Hepes pH 7.6	分辨率 3.07 Å R-free 0.255
5F0K Structure of VPS35 N terminal region 提交 2015-11-27	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 14–470（457 aa）片段：Residues 14-470	未记录	EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 GOL GLYCEROL × 3 SO4 SULFATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.6；291 K；1.7 M AmSO4, 2% PEG 1000, 0.1 M Hepes pH 7.6	分辨率 3.07 Å R-free 0.255
5F0K Structure of VPS35 N terminal region 提交 2015-11-27	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 C 14–470（457 aa）片段：Residues 14-470	未记录	EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 GOL GLYCEROL × 1 PG4 TETRAETHYLENE GLYCOL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.6；291 K；1.7 M AmSO4, 2% PEG 1000, 0.1 M Hepes pH 7.6	分辨率 3.07 Å R-free 0.255
5F0K Structure of VPS35 N terminal region 提交 2015-11-27	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 4 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 D 14–470（457 aa）片段：Residues 14-470	未记录	EDO 1,2-ETHANEDIOL × 3 GOL GLYCEROL × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.6；291 K；1.7 M AmSO4, 2% PEG 1000, 0.1 M Hepes pH 7.6	分辨率 3.07 Å R-free 0.255
5F0K Structure of VPS35 N terminal region 提交 2015-11-27	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 5 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 E 14–470（457 aa）片段：Residues 14-470	未记录	EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 GOL GLYCEROL × 2 SO4 SULFATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.6；291 K；1.7 M AmSO4, 2% PEG 1000, 0.1 M Hepes pH 7.6	分辨率 3.07 Å R-free 0.255
5F0L Structure of retromer VPS26-VPS35 subunits bound to SNX3 and DMT1 提交 2015-11-27	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 14–470（457 aa）片段：Residues 14-470	未记录	SO4 SULFATE ION × 10 GOL GLYCEROL × 6 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 18	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；291 K；0.75 M AmSO4, 0.1 M MES pH 6.0, 15% Glycerol	分辨率 3.20 Å R-free 0.259
5F0M Structure of retromer VPS26-VPS35 subunits bound to SNX3 and DMT1 (SeMet labeled) 提交 2015-11-27	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 14–470（457 aa）片段：Residues 14-470	未记录	SO4 SULFATE ION × 6 GOL GLYCEROL × 5 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 12	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；291 K；0.8 M AmSO4, 0.1 M MES pH 6.0, 5% Glycerol	分辨率 3.10 Å R-free 0.254
5F0P Structure of retromer VPS26-VPS35 subunits bound to SNX3 and DMT1(L557M) (SeMet labeled) 提交 2015-11-27	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 14–470（457 aa）片段：Residues 14-470	未记录	SO4 SULFATE ION × 6 GOL GLYCEROL × 4 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 20 ZN ZINC ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；291 K；0.8 M AmSO4, 0.1 M MES pH 6.0, 10% Glycerol	分辨率 2.78 Å R-free 0.261
5OSH Structure of retromer VPS29-VPS35C subunits complexed with RidL N-terminal domain (1-236) 提交 2017-08-17	构建体不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 B 482–780（299 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；291 K；0.1 M sodium chloride 0.1 M Tris pH 8.0 4-8% PEG6000.	分辨率 4.30 Å R-free 0.311
5OSH Structure of retromer VPS29-VPS35C subunits complexed with RidL N-terminal domain (1-236) 提交 2017-08-17	构建体不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 E 482–780（299 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；291 K；0.1 M sodium chloride 0.1 M Tris pH 8.0 4-8% PEG6000.	分辨率 4.30 Å R-free 0.311
5OSH Structure of retromer VPS29-VPS35C subunits complexed with RidL N-terminal domain (1-236) 提交 2017-08-17	构建体不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 H 482–780（299 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；291 K；0.1 M sodium chloride 0.1 M Tris pH 8.0 4-8% PEG6000.	分辨率 4.30 Å R-free 0.311
5OSH Structure of retromer VPS29-VPS35C subunits complexed with RidL N-terminal domain (1-236) 提交 2017-08-17	构建体不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 4 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 K 482–780（299 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；291 K；0.1 M sodium chloride 0.1 M Tris pH 8.0 4-8% PEG6000.	分辨率 4.30 Å R-free 0.311
5OSI Structure of retromer VPS29-VPS35C subunits complexed with RidL harpin loop (163-176) 提交 2017-08-17	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 B 471–781（311 aa）	未记录	EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；291 K；0.1 M NaCl, 20% PEG3350 0.1 M Tris pH 8.5	分辨率 2.52 Å R-free 0.267
5OSI Structure of retromer VPS29-VPS35C subunits complexed with RidL harpin loop (163-176) 提交 2017-08-17	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 E 471–781（311 aa）	未记录	EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 NA SODIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；291 K；0.1 M NaCl, 20% PEG3350 0.1 M Tris pH 8.5	分辨率 2.52 Å R-free 0.267
5OSI Structure of retromer VPS29-VPS35C subunits complexed with RidL harpin loop (163-176) 提交 2017-08-17	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 H 471–781（311 aa）	未记录	EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 NA SODIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；291 K；0.1 M NaCl, 20% PEG3350 0.1 M Tris pH 8.5	分辨率 2.52 Å R-free 0.267
5OSI Structure of retromer VPS29-VPS35C subunits complexed with RidL harpin loop (163-176) 提交 2017-08-17	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 4 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 K 471–781（311 aa）	未记录	EDO 1,2-ETHANEDIOL × 5 NA SODIUM ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；291 K；0.1 M NaCl, 20% PEG3350 0.1 M Tris pH 8.5	分辨率 2.52 Å R-free 0.267
7BLN VPS35/VPS29 arch of metazoan membrane-assembled retromer:SNX3 complex modelled with human proteins 提交 2021-01-18	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 1–796（796 aa）链 C 1–796（796 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 8.90 Å
7BLO VPS26 dimer region of metazoan membrane-assembled retromer:SNX3 complex modelled with human proteins 提交 2021-01-18	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric	链 A 12–363（352 aa）链 C 12–363（352 aa）	未记录	PIB 2-(BUTANOYLOXY)-1-{[(HYDROXY{[2,3,4,6-TETRAHYDROXY-5-(PHOSPHONOOXY)CYCLOHEXYL]OXY}PHOSPHORYL)OXY]METHYL}ETHYL BUTANOATE × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 9.50 Å
8R0J Crystal structure of the retromer complex VPS29/VPS35 with the ligand bis-1,3-phenyl guanylhydrazone, 2a 提交 2023-10-31	实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 C 476–780（305 aa）	未记录	XFZ Bis-1,3-phenyl guanylhydrazon × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.4；293 K；18% PEG 3350, 150 mM NaK tartrate, pH 7.4;	分辨率 2.40 Å R-free 0.250
8R0J Crystal structure of the retromer complex VPS29/VPS35 with the ligand bis-1,3-phenyl guanylhydrazone, 2a 提交 2023-10-31	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 D 476–780（305 aa）	未记录	TRS 2-AMINO-2-HYDROXYMETHYL-PROPANE-1,3-DIOL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.4；293 K；18% PEG 3350, 150 mM NaK tartrate, pH 7.4;	分辨率 2.40 Å R-free 0.250
8RKS Structure of VPS29-VPS35 bound to the LFa motif R21 of Fam21. 提交 2023-12-30	构建体不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 B 471–781（311 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；291 K；0.1 M NaCl, 20% PEG3350 0.1 M Tris pH 8.5	分辨率 3.10 Å R-free 0.288
8RKS Structure of VPS29-VPS35 bound to the LFa motif R21 of Fam21. 提交 2023-12-30	构建体不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 D 471–781（311 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；291 K；0.1 M NaCl, 20% PEG3350 0.1 M Tris pH 8.5	分辨率 3.10 Å R-free 0.288
8RKS Structure of VPS29-VPS35 bound to the LFa motif R21 of Fam21. 提交 2023-12-30	构建体不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 F 471–781（311 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；291 K；0.1 M NaCl, 20% PEG3350 0.1 M Tris pH 8.5	分辨率 3.10 Å R-free 0.288
8RKS Structure of VPS29-VPS35 bound to the LFa motif R21 of Fam21. 提交 2023-12-30	构建体不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 4 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 H 471–781（311 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；291 K；0.1 M NaCl, 20% PEG3350 0.1 M Tris pH 8.5	分辨率 3.10 Å R-free 0.288

共 12 个其他 PDB 条目、27 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	VPS35_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 C； PDB构建体 2–306； UniProt 476–780 作者链 D； PDB构建体 2–306； UniProt 476–780

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

下载 Download SAXS (.dat) P(r) (.pr.out) CIF

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	8r02
沉积日期 deposition_date	2023-10-30
最后修订 last_revision	2024-03-27
结构标题 title	Crystal structure of the retromer complex VPS29/VPS35 with the ligand bis-1,3-phenyl guanylhydrazone, 2a
关键词 keywords	Complex, transport, recycling, ligand, PROTEIN TRANSPORT; PROTEIN TRANSPORT
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier	37.01 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron	36.90 Å
零角强度 I(0) i0	178498000.00
分子量 molecular_weight	109870.0 kDa
排除体积 excluded_volume	138380 Å³
包络体积 envelope_volume	178860 Å³
水化壳体积 shell_volume	42500 Å³
包络直径 envelope_diameter	132.8 Å
壳层 Rg shell_rg	40.56 Å
包络 Rg envelope_rg	36.91 Å
形状 Rg shape_rg	36.85 Å
总 Rg total_rg	37.30 Å
总原子数 total_atoms	7747
残基数 n_residues	962
球谐函数阶数 n_harmonics	20
q 范围 q_range	— – 0.5000 Å⁻¹
数据点数 n_points	101
壳层类型 shell_type	directional
溶剂电子密度 solvent_density	0.3340 e/Å³
壳层衬度 contrast_shell	0.0300 e/Å³
CRYSOL 版本 crysol_version	4.1.3

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4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax	126.9 Å
Rg (实空间) rg_real	37.40 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error	1.28 Å
I(0) (实空间) i0_real	1.7850e+08
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error	3.6180e+06
Rg (倒空间) rg_reciprocal	37.16 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal	178500000.0000
解质量估计 total_estimate	0.8041
解质量评级 solution_quality	GOOD a GOOD solution
P(r) 峰数 n_peaks	1
主峰位置 r_peak_primary	32.5 Å
偏度 Skewness skewness	0.559
峰度 Kurtosis kurtosis	-0.337
角度范围 angular_range	— – 0.2150 Å⁻¹
当前正则化参数 α current_alpha	0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha	46090000.0000
实空间数据点数 n_real_points	44
GNOM 版本 gnom_version	4.1.3
质量判据 quality_criteria	AN1: 0.000; Oscil: 0.698; Stabil: 1.000; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.686; Smooth: 0.669

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5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

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6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (4)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	Vacuolar protein sorting-associated protein 29
分子量 formula_weight	20930.2 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A,B
原子数 atom_count	7814

MEHMLVLVLGDLHIPHRCNSLPAKFKKLLVPGKIQHILCTGNLCTKESYDYLKTLAGDVHIVRGDFDENLNYPEQKVVTVGQFKIGLIHGHQVIPWGDMASLALLQRQFDVDILISGHTHKFEAFEHENKFYINPGSATGAYNALETNIIPSFVLMDIQASTVVTYVYQLIGDDVKVERIEYKKP

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	Vacuolar protein sorting-associated protein 35
分子量 formula_weight	35243.1 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	C,D

MVEDPDPEDFADEQSLVGRFIHLLRSEDPDQQYLILNTARKHFGAGGNQRIRFTLPPLVFAAYQLAFRYKENSKVDDKWEKKCQKIFSFAHQTISALIKAELAELPLRLFLQGALAAGEIGFENHETVAYEFMSQAFSLYEDEISDSKAQLAAITLIIGTFERMKCFSEENHEPLRTQCALAASKLLKKPDQGRAVSTCAHLFWSGRNTDKNGEELHGGKRVMECLKKALKIANQCMDPSLQVQLFIEILNRYIYFYEKENDAVTIQVLNQLIQKIREDLPNLESSEETEQINKHFHNTLEHLRLR

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 3 Entity 3 non-polymer

描述 description	Bis-1,3-phenyl guanylhydrazon
分子量 formula_weight	246.3 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

实体 4 Entity 4 water

描述 description	water
分子量 formula_weight	18.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	64

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8. 引用文献 (1)

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晶胞边长 a length_a	57.500 Å
晶胞边长 b length_b	140.830 Å
晶胞边长 c length_c	141.340 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	8

空间群 space_group	P 21 21 21
空间群编号 int_tables_number	19
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	2.500 Å
最低分辨率 resolution_low	19.919 Å
R 因子 r_factor	—
R_work r_work	0.2017
R_free r_free	0.2639

fit	/app/data/saxs_computation/r0/8r02/8r02.fit
pddf	/app/data/pr_computation/r0/8r02/8r02.pr.out
profile	/app/data/saxs_computation/r0/8r02/8r02.dat

Crystal structure of the retromer complex VPS29/VPS35 with the ligand bis-1,3-phenyl guanylhydrazone, 2a

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Vacuolar protein sorting-associated protein 29

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Vacuolar protein sorting-associated protein 35

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (4)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 non-polymer

实体 4 Entity 4 water

8. 引用文献 (1)

9. 文件与曲线 (10)

Files (7)

Curves (3)