8tw9

Cryo-EM structure of S. cerevisiae PolE-Ctf18-8-1-DNA

Method: ELECTRON MICROSCOPY D_max: 132.3 Å Quality: GOOD

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Chromosome transmission fidelity protein 18

Saccharomyces cerevisiae

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白–DNA 异源复合物蛋白 × 4 DNA 2 PDB 声明：hexameric（6）与全部聚合物数一致	链 C； UniProt 715–740	未记录	Primer DNA × 1 Template DNA × 1 DNA polymerase epsilon catalytic subunit A × 1 （P21951） Chromosome transmission fidelity protein 8 × 1 （P38877） Sister chromatid cohesion protein DCC1 × 1 （P25559） SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.60 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 8TW9	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
5MSM Structure of the Dcc1-Ctf8-Ctf18C Trimer 提交 2017-01-05	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 C 666–741（76 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.1M Bis-Tris Propane pH 6.3, 0.2M NaBr and 17% PEG 3,350	分辨率 2.29 Å R-free 0.260
5MSM Structure of the Dcc1-Ctf8-Ctf18C Trimer 提交 2017-01-05	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 F 666–741（76 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.1M Bis-Tris Propane pH 6.3, 0.2M NaBr and 17% PEG 3,350	分辨率 2.29 Å R-free 0.260
5OKC Crystal structure of the Ctf18-1-8 module from Ctf18-RFC 提交 2017-07-25	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 I 715–741（27 aa）	未记录	NO3 NITRATE ION × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.8；293 K；16% PEG 3350, 0.1 M HEPES pH 7.0, 0.2 M potassium nitrate	分辨率 2.30 Å R-free 0.260
5OKC Crystal structure of the Ctf18-1-8 module from Ctf18-RFC 提交 2017-07-25	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 G 715–741（27 aa）	未记录	NO3 NITRATE ION × 2 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.8；293 K；16% PEG 3350, 0.1 M HEPES pH 7.0, 0.2 M potassium nitrate	分辨率 2.30 Å R-free 0.260
5OKI Crystal structure of the Ctf18-1-8 module from Ctf18-RFC in complex with a 63 kDa fragment of DNA Polymerase epsilon 提交 2017-07-25	聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 I 715–740（26 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293 K；12% PEG 10000, 0.1 M MES pH 6.5, 0.2 M ammonium chloride	分辨率 4.50 Å R-free 0.312
5OKI Crystal structure of the Ctf18-1-8 module from Ctf18-RFC in complex with a 63 kDa fragment of DNA Polymerase epsilon 提交 2017-07-25	聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 E 715–740（26 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293 K；12% PEG 10000, 0.1 M MES pH 6.5, 0.2 M ammonium chloride	分辨率 4.50 Å R-free 0.312
6S1C P3221 crystal form of the Ctf18-1-8/Pol2(1-528) complex 提交 2019-06-18	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 D 713–741（29 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.2 M NaCl, 14% PEG 20000, 0.1 M HEPES pH 7.0	分辨率 6.10 Å R-free 0.333
6S1C P3221 crystal form of the Ctf18-1-8/Pol2(1-528) complex 提交 2019-06-18	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 H 713–741（29 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.2 M NaCl, 14% PEG 20000, 0.1 M HEPES pH 7.0	分辨率 6.10 Å R-free 0.333
6S2E Cryo-EM structure of Ctf18-1-8 in complex with the catalytic domain of DNA polymerase epsilon 提交 2019-06-20	构建体不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 E 713–741（29 aa）	未记录	SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.20 Å
6S2F Cryo-EM structure of Ctf18-1-8 in complex with the catalytic domain of DNA polymerase epsilon (Class 2) 提交 2019-06-20	构建体不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 E 713–741（29 aa）	未记录	SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 5.80 Å
8TW7 Cryo-EM structure of S. cerevisiae Ctf18-RFC-PCNA complex in Apo state conformation I 提交 2023-08-20	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric	链 1 386–643（258 aa）	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 3 MG MAGNESIUM ION × 3	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.80 Å
8TW8 Cryo-EM structure of S. cerevisiae Ctf18-RFC-PCNA complex in Apo state conformation I 提交 2023-08-20	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric	链 1 386–643（258 aa）	未记录	AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 3 MG MAGNESIUM ION × 3 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.50 Å
8TWA Cryo-EM structure of S. cerevisiae Ctf18-RFC-PCNA-PolE-DNA complex 提交 2023-08-20	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：14-meric	链 1 1–741（741 aa）链 C 715–740（26 aa）	未记录	SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 3 MG MAGNESIUM ION × 3 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.10 Å
8TWB Cryo-EM structure of S. cerevisiae Ctf18-RFC-PCNA-DNA complex 提交 2023-08-20	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 1 386–643（258 aa）	未记录	AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 3 MG MAGNESIUM ION × 3 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.20 Å

共 10 个其他 PDB 条目、14 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

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UniProt名称	CTF18_YEAST
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 C； PDB构建体 1–26； UniProt 715–740

DNA polymerase epsilon catalytic subunit A

Saccharomyces cerevisiae

UniProt P21951

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白–DNA 异源复合物蛋白 × 4 DNA 2 PDB 声明：hexameric（6）与全部聚合物数一致	链 E； UniProt 1–2222	未记录	Chromosome transmission fidelity protein 18 × 1 （P49956） Primer DNA × 1 Template DNA × 1 Chromosome transmission fidelity protein 8 × 1 （P38877） Sister chromatid cohesion protein DCC1 × 1 （P25559） SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.60 Å

数据库中的同蛋白其他状态

其他 PDB	相对当前条目 8TW9	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
28VY sCMGE assembled on ARS1 DNA with Sld2 and RPA 提交 2026-02-23	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：15-meric	链 G 1–2222（2222 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 6 ZN ZINC ION × 7 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 5	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.70 Å
4M8O TERNARY COMPLEX OF DNA POLYMERASE EPSILON WITH AN INCOMING dATP 提交 2013-08-13	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：trimeric	链 A 1–1228（1228 aa）片段：POL2 domain, UNP residues 1-1228	突变：D290A,E292A	DTP 2'-DEOXYADENOSINE 5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 1 TAU 2-AMINOETHANESULFONIC ACID × 2 CL CHLORIDE ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；291 K；20% PEG-3350, 50 mM Hepes-NaOH pH 7.0, 10 mM MgCl2, 400 mM LiAc, and 10 mM 2-aminoethanesulfonic acid (taurine) , VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K	分辨率 2.20 Å R-free 0.237
4PTF Ternary crystal structure of yeast DNA polymerase epsilon with template G 提交 2014-03-10	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：trimeric	链 A 1–1187（1187 aa）片段：catalytic domain (UNP residues 1-1187)	未记录	DCP 2'-DEOXYCYTIDINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 CA CALCIUM ION × 4 NA SODIUM ION × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；293 K；12% PEG5000 MME, 25 mM magnesium acetate, 1% DMSO, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 2.81 Å R-free 0.247
5OKI Crystal structure of the Ctf18-1-8 module from Ctf18-RFC in complex with a 63 kDa fragment of DNA Polymerase epsilon 提交 2017-07-25	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 1–524（524 aa）	突变：D290A. E292A	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293 K；12% PEG 10000, 0.1 M MES pH 6.5, 0.2 M ammonium chloride	分辨率 4.50 Å R-free 0.312
5OKI Crystal structure of the Ctf18-1-8 module from Ctf18-RFC in complex with a 63 kDa fragment of DNA Polymerase epsilon 提交 2017-07-25	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 B 1–524（524 aa）	突变：D290A. E292A	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293 K；12% PEG 10000, 0.1 M MES pH 6.5, 0.2 M ammonium chloride	分辨率 4.50 Å R-free 0.312
6FWK The crystal structure of Pol2CORE-M644G in complex with DNA and an incoming nucleotide 提交 2018-03-06	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：trimeric	链 A 1–1186（1186 aa）	突变：M644G	DTP 2'-DEOXYADENOSINE 5'-TRIPHOSPHATE × 1 CA CALCIUM ION × 2 FE FE (III) ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；292 K；50mM MES, 150mM NaAc and 8% PEG20K	分辨率 2.50 Å R-free 0.263
6FWK The crystal structure of Pol2CORE-M644G in complex with DNA and an incoming nucleotide 提交 2018-03-06	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白–DNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：trimeric	链 B 1–1186（1186 aa）	突变：M644G	DTP 2'-DEOXYADENOSINE 5'-TRIPHOSPHATE × 1 CA CALCIUM ION × 3 FE FE (III) ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；292 K；50mM MES, 150mM NaAc and 8% PEG20K	分辨率 2.50 Å R-free 0.263
6G0A The crystal structure of the Pol2 catalytic domain of DNA polymerase epsilon carrying a P301R substitution. 提交 2018-03-16	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：trimeric	链 A 1–1186（1186 aa）	突变：P301R	DTP 2'-DEOXYADENOSINE 5'-TRIPHOSPHATE × 1 CA CALCIUM ION × 2 FE FE (III) ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；292 K；50mM MES pH 6.5, 150mM NaAc and 8% PEG20K	分辨率 2.62 Å R-free 0.265
6H1V The crystal structure of Pol2CORE in complex with DNA and an incoming nucleotide, carrying an Fe-S cluster 提交 2018-07-12	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：trimeric	链 A 1–1187（1187 aa）	突变：D290A and E292A	SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 DTP 2'-DEOXYADENOSINE 5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；291 K；20% PEG-3350, 50 mM Hepes-NaOH pH 7.0, 10 mM MgCl2, 400 mM LiAc, and 10 mM 2-aminoethanesulfonic acid (taurine) X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；291 K；20% PEG-3350, 50 mM Hepes-NaOH pH 7.0, 10 mM MgCl2, 400 mM LiAc, and 10 mM 2-aminoethanesulfonic acid (taurine)	分辨率 2.70 Å R-free 0.266
6HV8 Cryo-EM structure of S. cerevisiae Polymerase epsilon deltacat mutant 提交 2018-10-10	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1308–2221（914 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.40 Å
6I8A The crystal structure of the Pol2 catalytic domain of DNA polymerase epsilon carrying a P301R substitution. 提交 2018-11-19	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：trimeric	链 A 1–1185（1185 aa）	突变：P301R	DTP 2'-DEOXYADENOSINE 5'-TRIPHOSPHATE × 1 CA CALCIUM ION × 2 FE FE (III) ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；292 K；50mM MES pH 6.5, 150mM NaAc, 8%PEG20K	分辨率 2.65 Å R-free 0.279
6I8A The crystal structure of the Pol2 catalytic domain of DNA polymerase epsilon carrying a P301R substitution. 提交 2018-11-19	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白–DNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：trimeric	链 B 1–1185（1185 aa）	突变：P301R	DTP 2'-DEOXYADENOSINE 5'-TRIPHOSPHATE × 1 CA CALCIUM ION × 2 FE FE (III) ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；292 K；50mM MES pH 6.5, 150mM NaAc, 8%PEG20K	分辨率 2.65 Å R-free 0.279
6QIB The crystal structure of Pol2CORE in complex with DNA and an incoming nucleotide, carrying an Fe-S cluster 提交 2019-01-18	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：trimeric	链 A 1–1187（1187 aa）	突变：D290A, E292A	SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 DTP 2'-DEOXYADENOSINE 5'-TRIPHOSPHATE × 1 CA CALCIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；291 K；10mM Tris HCl pH8, 10mM CaCl2, 15% PEG8000	分辨率 2.80 Å R-free 0.286
6S1C P3221 crystal form of the Ctf18-1-8/Pol2(1-528) complex 提交 2019-06-18	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 1–524（524 aa）	突变：D290A, E292A	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.2 M NaCl, 14% PEG 20000, 0.1 M HEPES pH 7.0	分辨率 6.10 Å R-free 0.333
6S1C P3221 crystal form of the Ctf18-1-8/Pol2(1-528) complex 提交 2019-06-18	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 E 1–524（524 aa）	突变：D290A, E292A	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.2 M NaCl, 14% PEG 20000, 0.1 M HEPES pH 7.0	分辨率 6.10 Å R-free 0.333
6S2E Cryo-EM structure of Ctf18-1-8 in complex with the catalytic domain of DNA polymerase epsilon 提交 2019-06-20	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 1–1186（1186 aa）	突变：D290A, E292A	SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.20 Å
6S2F Cryo-EM structure of Ctf18-1-8 in complex with the catalytic domain of DNA polymerase epsilon (Class 2) 提交 2019-06-20	构建体不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 1–1192（1192 aa）	未记录	SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 5.80 Å
6WJV Structure of the Saccharomyces cerevisiae polymerase epsilon holoenzyme 提交 2020-04-14	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 1–2222（2222 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.50 Å
7PMK S. cerevisiae replisome-SCF(Dia2) complex bound to double-stranded DNA (conformation I) 提交 2021-09-02	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：22-meric	链 Q 1–2222（2222 aa）	未记录	ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 3 MG MAGNESIUM ION × 3 ZN ZINC ION × 7	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；Manual plunger	分辨率 3.20 Å
7PMN S. cerevisiae replisome-SCF(Dia2) complex bound to double-stranded DNA (conformation II) 提交 2021-09-02	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：22-meric	链 Q 1–2222（2222 aa）	未记录	ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 7	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；Manual plunger	分辨率 3.20 Å
7QHS S. cerevisiae CMGE nucleating origin DNA melting 提交 2021-12-14	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：pentadecameric	链 G 1–2222（2222 aa）	未记录	ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 ZN ZINC ION × 7 MG MAGNESIUM ION × 3 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.30 Å
7R3X The crystal structure of the L439V variant of Pol2CORE in complex with DNA and an incoming nucleotide 提交 2022-02-08	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：trimeric	链 A 1–1185（1185 aa）	突变：L439V	DTP 2'-DEOXYADENOSINE 5'-TRIPHOSPHATE × 1 CA CALCIUM ION × 2 ACT ACETATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；292 K；8 % PEG 20K , 150 mM NaAc, 0-1,5% Glycerol, 50 mM MES pH6.5	分辨率 2.46 Å R-free 0.256
7Z13 S. cerevisiae CMGE dimer nucleating origin DNA melting 提交 2022-02-24	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：28-meric	链 N 1–2222（2222 aa）链 Q 1–2222（2222 aa）	未记录	ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 8 ZN ZINC ION × 14 MG MAGNESIUM ION × 6 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 4	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.40 Å
8B67 The crystal structure of M644G variant of DNA Pol Epsilon containing CTP in the polymerase active site 提交 2022-09-26	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：trimeric	链 A 1–1186（1186 aa）片段：Catalytic subunit of DNA Pol Epsilon	突变：M644G	CA CALCIUM ION × 3 CTP CYTIDINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ACT ACETATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；292 K；10mM Tris, 15% PEG8K,10mM CaCl2	分辨率 2.60 Å R-free 0.276
8B6K The crystal structure of M644G variant of DNA Pol Epsilon containing dCTP in the polymerase active site 提交 2022-09-27	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：trimeric	链 A 1–1186（1186 aa）片段：Catalytic subunit of DNA Pol Epsilon	突变：M644G, D290A, E292A	CA CALCIUM ION × 1 DCP 2'-DEOXYCYTIDINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；292 K；10mM Tris, 15% PEG8K,10mM CaCl2	分辨率 2.50 Å R-free 0.260
8B6K The crystal structure of M644G variant of DNA Pol Epsilon containing dCTP in the polymerase active site 提交 2022-09-27	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白–DNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：trimeric	链 B 1–1186（1186 aa）片段：Catalytic subunit of DNA Pol Epsilon	突变：M644G, D290A, E292A	CA CALCIUM ION × 1 DCP 2'-DEOXYCYTIDINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；292 K；10mM Tris, 15% PEG8K,10mM CaCl2	分辨率 2.50 Å R-free 0.260
8B76 The crystal structure of M644G variant of DNA Pol Epsilon containing dTTP in the polymerase active site 提交 2022-09-28	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：trimeric	链 A 1–1186（1186 aa）片段：Catalytic subunit of DNA Pol Epsilon	突变：M644G	CA CALCIUM ION × 3 TTP THYMIDINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ACT ACETATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；292 K；10mM Tris, 15% PEG8K,10mM CaCl2	分辨率 2.60 Å R-free 0.247
8B76 The crystal structure of M644G variant of DNA Pol Epsilon containing dTTP in the polymerase active site 提交 2022-09-28	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白–DNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：trimeric	链 B 1–1186（1186 aa）片段：Catalytic subunit of DNA Pol Epsilon	突变：M644G	CA CALCIUM ION × 3 TTP THYMIDINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ACT ACETATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；292 K；10mM Tris, 15% PEG8K,10mM CaCl2	分辨率 2.60 Å R-free 0.247
8B77 The crystal structure of N828V variant of DNA Pol Epsilon containing dATP in the polymerase active site 提交 2022-09-29	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：trimeric	链 A 1–1186（1186 aa）	突变：N828V	DTP 2'-DEOXYADENOSINE 5'-TRIPHOSPHATE × 1 CA CALCIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；292 K；10mM Tris, 15% PEG8K,10mM CaCl2	分辨率 2.70 Å R-free 0.273
8B79 The crystal structure of M644G variant of DNA Pol Epsilon containing UTP in the polymerase active site 提交 2022-09-29	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：trimeric	链 A 1–1186（1186 aa）片段：Catalytic subunit of DNA Pol Epsilon	突变：M644G	UTP URIDINE 5'-TRIPHOSPHATE × 1 CA CALCIUM ION × 3 ACT ACETATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；292 K；50mM MES, PEG20K,2.5% glycerol, 150mM Sodium Actetate	分辨率 2.65 Å R-free 0.248
8B79 The crystal structure of M644G variant of DNA Pol Epsilon containing UTP in the polymerase active site 提交 2022-09-29	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白–DNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：trimeric	链 B 1–1186（1186 aa）片段：Catalytic subunit of DNA Pol Epsilon	突变：M644G	UTP URIDINE 5'-TRIPHOSPHATE × 1 CA CALCIUM ION × 3 ACT ACETATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；292 K；50mM MES, PEG20K,2.5% glycerol, 150mM Sodium Actetate	分辨率 2.65 Å R-free 0.248
8B7E The crystal structure of N828V variant of DNA Pol Epsilon containing UTP in the polymerase active site 提交 2022-09-29	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：trimeric	链 A 1–1186（1186 aa）片段：Catalytic subunit of DNA Pol Epsilon	突变：N828V	UTP URIDINE 5'-TRIPHOSPHATE × 1 CA CALCIUM ION × 2 GOL GLYCEROL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；292 K；10mM Tris, 15% PEG8K,10mM CaCl2	分辨率 2.60 Å R-free 0.230
8B7E The crystal structure of N828V variant of DNA Pol Epsilon containing UTP in the polymerase active site 提交 2022-09-29	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白–DNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：trimeric	链 B 1–1186（1186 aa）片段：Catalytic subunit of DNA Pol Epsilon	突变：N828V	UTP URIDINE 5'-TRIPHOSPHATE × 1 CA CALCIUM ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；292 K；10mM Tris, 15% PEG8K,10mM CaCl2	分辨率 2.60 Å R-free 0.230
8KG6 Yeast replisome in state I 提交 2023-08-17	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：20-meric	链 M 1–2222（2222 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 7 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 5 AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 3	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；blot with filter paper for 3-4 seconds before plunging.	分辨率 3.07 Å
8KG8 Yeast replisome in state II 提交 2023-08-17	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：octadecameric	链 M 1–2222（2222 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 7 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 5 AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 3	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；blot with filter paper for 3-4 seconds before plunging.	分辨率 4.23 Å
8KG9 Yeast replisome in state III 提交 2023-08-17	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：octadecameric	链 M 1–2222（2222 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 7 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 4 AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；blot with filter paper for 3-4 seconds before plunging.	分辨率 4.52 Å
8P5E S. cerevisiae nexus-sCMGE after DNA replication initiation 提交 2023-05-24	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：15-meric	链 G 1–2222（2222 aa）	未记录	ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 ZN ZINC ION × 7 MG MAGNESIUM ION × 3 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.90 Å
8P62 S. cerevisiae ssDNA-sCMGE after DNA replication initiation 提交 2023-05-25	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：14-meric	链 G 1–2222（2222 aa）	未记录	ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 ZN ZINC ION × 7 MG MAGNESIUM ION × 3 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.90 Å
8P63 S. cerevisiae consensus-sCMGE on ssDNA after DNA replication initiation 提交 2023-05-25	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：14-meric	链 G 1–2222（2222 aa）	未记录	ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 ZN ZINC ION × 7 MG MAGNESIUM ION × 3 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.70 Å
8TWA Cryo-EM structure of S. cerevisiae Ctf18-RFC-PCNA-PolE-DNA complex 提交 2023-08-20	聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：14-meric	链 E 1–2222（2222 aa）	未记录	SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 3 MG MAGNESIUM ION × 3 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.10 Å
8XGC Structure of yeast replisome associated with FACT and histone hexamer, Composite map 提交 2023-12-15	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 27 PDB 声明：29-meric	链 8 1–2222（2222 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 7 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 5	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.70 Å

共 33 个其他 PDB 条目、41 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	DPOE_YEAST
Isoform	—
PDB实体	4
链与序列区间	作者链 E； PDB构建体 1–2222； UniProt 1–2222

Chromosome transmission fidelity protein 8

Saccharomyces cerevisiae

UniProt P38877

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白–DNA 异源复合物蛋白 × 4 DNA 2 PDB 声明：hexameric（6）与全部聚合物数一致	链 D； UniProt 2–133	未记录	Chromosome transmission fidelity protein 18 × 1 （P49956） Primer DNA × 1 Template DNA × 1 DNA polymerase epsilon catalytic subunit A × 1 （P21951） Sister chromatid cohesion protein DCC1 × 1 （P25559） SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.60 Å

数据库中的同蛋白其他状态

其他 PDB	相对当前条目 8TW9	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
5MSM Structure of the Dcc1-Ctf8-Ctf18C Trimer 提交 2017-01-05	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 B 1–133（133 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.1M Bis-Tris Propane pH 6.3, 0.2M NaBr and 17% PEG 3,350	分辨率 2.29 Å R-free 0.260
5MSM Structure of the Dcc1-Ctf8-Ctf18C Trimer 提交 2017-01-05	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 E 1–133（133 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.1M Bis-Tris Propane pH 6.3, 0.2M NaBr and 17% PEG 3,350	分辨率 2.29 Å R-free 0.260
5OKC Crystal structure of the Ctf18-1-8 module from Ctf18-RFC 提交 2017-07-25	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 H 1–133（133 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	NO3 NITRATE ION × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.8；293 K；16% PEG 3350, 0.1 M HEPES pH 7.0, 0.2 M potassium nitrate	分辨率 2.30 Å R-free 0.260
5OKC Crystal structure of the Ctf18-1-8 module from Ctf18-RFC 提交 2017-07-25	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 F 1–133（133 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	NO3 NITRATE ION × 2 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.8；293 K；16% PEG 3350, 0.1 M HEPES pH 7.0, 0.2 M potassium nitrate	分辨率 2.30 Å R-free 0.260
5OKI Crystal structure of the Ctf18-1-8 module from Ctf18-RFC in complex with a 63 kDa fragment of DNA Polymerase epsilon 提交 2017-07-25	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 H 1–133（133 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293 K；12% PEG 10000, 0.1 M MES pH 6.5, 0.2 M ammonium chloride	分辨率 4.50 Å R-free 0.312
5OKI Crystal structure of the Ctf18-1-8 module from Ctf18-RFC in complex with a 63 kDa fragment of DNA Polymerase epsilon 提交 2017-07-25	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 D 1–133（133 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293 K；12% PEG 10000, 0.1 M MES pH 6.5, 0.2 M ammonium chloride	分辨率 4.50 Å R-free 0.312
6S1C P3221 crystal form of the Ctf18-1-8/Pol2(1-528) complex 提交 2019-06-18	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 C 1–133（133 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.2 M NaCl, 14% PEG 20000, 0.1 M HEPES pH 7.0	分辨率 6.10 Å R-free 0.333
6S1C P3221 crystal form of the Ctf18-1-8/Pol2(1-528) complex 提交 2019-06-18	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 G 1–133（133 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.2 M NaCl, 14% PEG 20000, 0.1 M HEPES pH 7.0	分辨率 6.10 Å R-free 0.333
6S2E Cryo-EM structure of Ctf18-1-8 in complex with the catalytic domain of DNA polymerase epsilon 提交 2019-06-20	构建体不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 D 1–133（133 aa）	未记录	SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.20 Å
6S2F Cryo-EM structure of Ctf18-1-8 in complex with the catalytic domain of DNA polymerase epsilon (Class 2) 提交 2019-06-20	构建体不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 D 1–133（133 aa）	未记录	SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 5.80 Å
8TWA Cryo-EM structure of S. cerevisiae Ctf18-RFC-PCNA-PolE-DNA complex 提交 2023-08-20	聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：14-meric	链 D 2–133（132 aa）	未记录	SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 3 MG MAGNESIUM ION × 3 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.10 Å

共 7 个其他 PDB 条目、11 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	CTF8_YEAST
Isoform	—
PDB实体	5
链与序列区间	作者链 D； PDB构建体 1–132； UniProt 2–133

Sister chromatid cohesion protein DCC1

Saccharomyces cerevisiae

UniProt P25559

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白–DNA 异源复合物蛋白 × 4 DNA 2 PDB 声明：hexameric（6）与全部聚合物数一致	链 B； UniProt 1–380	未记录	Chromosome transmission fidelity protein 18 × 1 （P49956） Primer DNA × 1 Template DNA × 1 DNA polymerase epsilon catalytic subunit A × 1 （P21951） Chromosome transmission fidelity protein 8 × 1 （P38877） SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.60 Å

数据库中的同蛋白其他状态

其他 PDB	相对当前条目 8TW9	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
5MSM Structure of the Dcc1-Ctf8-Ctf18C Trimer 提交 2017-01-05	聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 A 1–380（380 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.1M Bis-Tris Propane pH 6.3, 0.2M NaBr and 17% PEG 3,350	分辨率 2.29 Å R-free 0.260
5MSM Structure of the Dcc1-Ctf8-Ctf18C Trimer 提交 2017-01-05	聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 D 1–380（380 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.1M Bis-Tris Propane pH 6.3, 0.2M NaBr and 17% PEG 3,350	分辨率 2.29 Å R-free 0.260
5MSN Structure of the Dcc1 Protein 提交 2017-01-05	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 90–380（291 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.2M potassium sodium tartrate and 18% PEG 3,350	分辨率 2.00 Å R-free 0.230
5MSN Structure of the Dcc1 Protein 提交 2017-01-05	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 90–380（291 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.2M potassium sodium tartrate and 18% PEG 3,350	分辨率 2.00 Å R-free 0.230
5MSN Structure of the Dcc1 Protein 提交 2017-01-05	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 C 90–380（291 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.2M potassium sodium tartrate and 18% PEG 3,350	分辨率 2.00 Å R-free 0.230
5MSN Structure of the Dcc1 Protein 提交 2017-01-05	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 4 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 D 90–380（291 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.2M potassium sodium tartrate and 18% PEG 3,350	分辨率 2.00 Å R-free 0.230
5OKC Crystal structure of the Ctf18-1-8 module from Ctf18-RFC 提交 2017-07-25	突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 A 1–380（380 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	NO3 NITRATE ION × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.8；293 K；16% PEG 3350, 0.1 M HEPES pH 7.0, 0.2 M potassium nitrate	分辨率 2.30 Å R-free 0.260
5OKC Crystal structure of the Ctf18-1-8 module from Ctf18-RFC 提交 2017-07-25	突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 B 1–380（380 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	NO3 NITRATE ION × 2 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.8；293 K；16% PEG 3350, 0.1 M HEPES pH 7.0, 0.2 M potassium nitrate	分辨率 2.30 Å R-free 0.260
5OKI Crystal structure of the Ctf18-1-8 module from Ctf18-RFC in complex with a 63 kDa fragment of DNA Polymerase epsilon 提交 2017-07-25	聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 G 1–380（380 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293 K；12% PEG 10000, 0.1 M MES pH 6.5, 0.2 M ammonium chloride	分辨率 4.50 Å R-free 0.312
5OKI Crystal structure of the Ctf18-1-8 module from Ctf18-RFC in complex with a 63 kDa fragment of DNA Polymerase epsilon 提交 2017-07-25	聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 C 1–380（380 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293 K；12% PEG 10000, 0.1 M MES pH 6.5, 0.2 M ammonium chloride	分辨率 4.50 Å R-free 0.312
6S1C P3221 crystal form of the Ctf18-1-8/Pol2(1-528) complex 提交 2019-06-18	聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 B 1–380（380 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.2 M NaCl, 14% PEG 20000, 0.1 M HEPES pH 7.0	分辨率 6.10 Å R-free 0.333
6S1C P3221 crystal form of the Ctf18-1-8/Pol2(1-528) complex 提交 2019-06-18	聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 F 1–380（380 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.2 M NaCl, 14% PEG 20000, 0.1 M HEPES pH 7.0	分辨率 6.10 Å R-free 0.333
6S2E Cryo-EM structure of Ctf18-1-8 in complex with the catalytic domain of DNA polymerase epsilon 提交 2019-06-20	聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 B 1–380（380 aa）	未记录	SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.20 Å
6S2F Cryo-EM structure of Ctf18-1-8 in complex with the catalytic domain of DNA polymerase epsilon (Class 2) 提交 2019-06-20	聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 B 1–380（380 aa）	未记录	SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 5.80 Å
8TWA Cryo-EM structure of S. cerevisiae Ctf18-RFC-PCNA-PolE-DNA complex 提交 2023-08-20	聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：14-meric	链 B 1–380（380 aa）	未记录	SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 3 MG MAGNESIUM ION × 3 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.10 Å

共 8 个其他 PDB 条目、15 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	DCC1_YEAST
Isoform	—
PDB实体	6
链与序列区间	作者链 B； PDB构建体 1–380； UniProt 1–380

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

下载 Download SAXS (.dat) P(r) (.pr.out) CIF

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	8tw9
沉积日期 deposition_date	2023-08-20
结构标题 title	Cryo-EM structure of S. cerevisiae PolE-Ctf18-8-1-DNA
关键词 keywords	Pol2, Ctf18-8-1, DNA, DNA BINDING PROTEIN-DNA complex; DNA BINDING PROTEIN/DNA
实验方法 method	ELECTRON MICROSCOPY

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3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier	41.02 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron	40.63 Å
零角强度 I(0) i0	579244000.00
分子量 molecular_weight	193440.0 kDa
排除体积 excluded_volume	240410 Å³
包络体积 envelope_volume	347670 Å³
水化壳体积 shell_volume	70220 Å³
包络直径 envelope_diameter	137.7 Å
壳层 Rg shell_rg	47.32 Å
包络 Rg envelope_rg	39.98 Å
形状 Rg shape_rg	40.61 Å
总 Rg total_rg	41.03 Å
总原子数 total_atoms	13586
残基数 n_residues	1680
球谐函数阶数 n_harmonics	20
q 范围 q_range	— – 0.5000 Å⁻¹
数据点数 n_points	101
壳层类型 shell_type	directional
溶剂电子密度 solvent_density	0.3340 e/Å³
壳层衬度 contrast_shell	0.0300 e/Å³
CRYSOL 版本 crysol_version	4.1.3

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4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax	132.3 Å
Rg (实空间) rg_real	40.92 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error	1.00 Å
I(0) (实空间) i0_real	5.7920e+08
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error	1.0190e+07
Rg (倒空间) rg_reciprocal	41.02 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal	579300000.0000
解质量估计 total_estimate	0.8899
解质量评级 solution_quality	GOOD a GOOD solution
P(r) 峰数 n_peaks	1
主峰位置 r_peak_primary	50.9 Å
偏度 Skewness skewness	0.256
峰度 Kurtosis kurtosis	-0.382
角度范围 angular_range	— – 0.1950 Å⁻¹
当前正则化参数 α current_alpha	0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha	64950000.0000
实空间数据点数 n_real_points	40
GNOM 版本 gnom_version	4.1.3
质量判据 quality_criteria	AN1: 0.000; Oscil: 0.895; Stabil: 1.000; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.998; Smooth: 0.883

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5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

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6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (7)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	Chromosome transmission fidelity protein 18
分子量 formula_weight	3171.6 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	C
原子数 atom_count	13586

TVKIWVKYNEGFSNAVRKNVTWNNLW

来源 Source

来源生物 organism	Saccharomyces cerevisiae
通用名 common_name	;brewer's yeast ;
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	4932
宿主生物 host_organism	Saccharomyces cerevisiae

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	Primer DNA
分子量 formula_weight	2737.8 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polydeoxyribonucleotide
链编号 strand_id	P

TGTTGCTGC

实体 3 Entity 3 polymer

描述 description	Template DNA
分子量 formula_weight	4568.0 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polydeoxyribonucleotide
链编号 strand_id	T

TTTTTAGCAGCAACA

实体 4 Entity 4 polymer

描述 description	DNA polymerase epsilon catalytic subunit A
分子量 formula_weight	255992.5 kDa
EC 编号 ec_number	2.7.7.7,3.1.11.-
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	E

MMFGKKKNNGGSSTARYSAGNKYNTLSNNYALSAQQLLNASKIDDIDSMMGFERYVPPQYNGRFDAKDIDQIPGRVGWLTNMHATLVSQETLSSGSNGGGNSNDGERVTTNQGISGVDFYFLDEEGGSFKSTVVYDPYFFIACNDESRVNDVEELVKKYLESCLKSLQIIRKEDLTMDNHLLGLQKTLIKLSFVNSNQLFEARKLLRPILQDNANNNVQRNIYNVAANGSEKVDAKHLIEDIREYDVPYHVRVSIDKDIRVGKWYKVTQQGFIEDTRKIAFADPVVMAFDIETTKPPLKFPDSAVDQIMMISYMIDGEGFLITNREIISEDIEDFEYTPKPEYPGFFTIFNENDEVALLQRFFEHIRDVRPTVISTFNGDFFDWPFIHNRSKIHGLDMFDEIGFAPDAEGEYKSSYCSHMDCFRWVKRDSYLPQGSQGLKAVTQSKLGYNPIELDPELMTPYAFEKPQHLSEYSVSDAVATYYLYMKYVHPFIFSLCTIIPLNPDETLRKGTGTLCEMLLMVQAYQHNILLPNKHTDPIERFYDGHLLESETYVGGHVESLEAGVFRSDLKNEFKIDPSAIDELLQELPEALKFSVEVENKSSVDKVTNFEEIKNQITQKLLELKENNIRNELPLIYHVDVASMYPNIMTTNRLQPDSIKAERDCASCDFNRPGKTCARKLKWAWRGEFFPSKMDEYNMIKRALQNETFPNKNKFSKKKVLTFDELSYADQVIHIKKRLTEYSRKVYHRVKVSEIVEREAIVCQRENPFYVDTVKSFRDRRYEFKGLAKTWKGNLSKIDPSDKHARDEAKKMIVLYDSLQLAHKVILNSFYGYVMRKGSRWYSMEMAGITCLTGATIIQMARALVERVGRPLELDTDGIWCILPKSFPETYFFTLENGKKLYLSYPCSMLNYRVHQKFTNHQYQELKDPLNYIYETHSENTIFFEVDGPYKAMILPSSKEEGKGIKKRYAVFNEDGSLAELKGFELKRRGELQLIKNFQSDIFKVFLEGDTLEGCYSAVASVCNRWLDVLDSHGLMLEDEDLVSLICENRSMSKTLKEYEGQKSTSITTARRLGDFLGEDMVKDKGLQCKYIISSKPFNAPVTERAIPVAIFSADIPIKRSFLRRWTLDPSLEDLDIRTIIDWGYYRERLGSAIQKIITIPAALQGVSNPVPRVEHPDWLKRKIATKEDKFKQTSLTKFFSKTKNVPTMGKIKDIEDLFEPTVEEDNAKIKIARTTKKKAVSKRKRNQLTNEEDPLVLPSEIPSMDEDYVGWLNYQKIKWKIQARDRKRRDQLFGNTNSSRERSALGSMIRKQAESYANSTWEVLQYKDSGEPGVLEVFVTINGKVQNITFHIPKTIYMKFKSQTMPLQKIKNCLIEKSSASLPNNPKTSNPAGGQLFKITLPESVFLEEKENCTSIFNDENVLGVFEGTITPHQRAIMDLGASVTFRSKAMGALGKGIQQGFEMKDLSMAENERYLSGFSMDIGYLLHFPTSIGYEFFSLFKSWGDTITILVLKPSNQAQEINASSLGQIYKQMFEKKKGKIETYSYLVDIKEDINFEFVYFTDISKLYRRLSQETTKLKEERGLQFLLLLQSPFITKLLGTIRLLNQMPIVKLSLNEVLLPQLNWQPTLLKKLVNHVLSSGSWISHLIKLSQYSNIPICNLRLDSMDYIIDVLYARKLKKENIVLWWNEKAPLPDHGGIQNDFDLNTSWIMNDSEFPKINNSGVYDNVVLDVGVDNLTVNTILTSALINDAEGSDLVNNNMGIDDKDAVINSPSEFVHDAFSNDALNVLRGMLKEWWDEALKENSTADLLVNSLASWVQNPNAKLFDGLLRYHVHNLTKKALLQLVNEFSALGSTIVYADRNQILIKTNKYSPENCYAYSQYMMKAVRTNPMFSYLDLNIKRYWDLLIWMDKFNFSGLACIEIEEKENQDYTAVSQWQLKKFLSPIYQPEFEDWMMIILDSMLKTKQSYLKLNSGTQRPTQIVNVKKQDKEDSVENSLNGFSHLFSKPLMKRVKKLFKNQQEFILDPQYEADYVIPVLPGSHLNVKNPLLELVKSLCHVMLLSKSTILEIRTLRKELLKIFELREFAKVAEFKDPSLSLVVPDFLCEYCFFISDIDFCKAAPESIFSCVRCHKAFNQVLLQEHLIQKLRSDIESYLIQDLRCSRCHKVKRDYMSAHCPCAGAWEGTLPRESIVQKLNVFKQVAKYYGFDILLSCIADLTI

来源 Source

来源生物 organism	Saccharomyces cerevisiae
通用名 common_name	;brewer's yeast ;
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	4932
宿主生物 host_organism	Saccharomyces cerevisiae

实体 5 Entity 5 polymer

描述 description	Chromosome transmission fidelity protein 8
分子量 formula_weight	15058.5 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	D

PSVDIDASQWQKLTQSREKQTTVITPLGMMMLEIQGELELPKDFASLARRDSPNEGRFSEQDGETLIRFGSLQIDGERATLFVGKKQRLLGKVTKLDVPMGIMHFNSKDNKVELVDVMKYKVIFKDRPLPIM

来源 Source

来源生物 organism	Saccharomyces cerevisiae
通用名 common_name	;brewer's yeast ;
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	4932
宿主生物 host_organism	Saccharomyces cerevisiae

实体 6 Entity 6 polymer

描述 description	Sister chromatid cohesion protein DCC1
分子量 formula_weight	44133.8 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	B

MSINLHSAPEYDPSYKLIQLTPELLDIIQDPVQNHQLRFKSLDKDKSEVVLCSHDKTWVLKQRKHSNTVLLMREFVPEQPITFDETLLFGLSKPYMDVVGFAKTESEFETRETHGELNLNSVPIYNGELDFSDKIMKRSSTKVIGTLEELLENSPCSALEGISKWHKIGGSVKDGVLCILSQDFLFKALHVLLMSAMAESLDLQHLNVEDTHHAVGKDIEDEFNPYTREIIETVLNKFAVQEQEAENNTWRLRIPFIAQWYGIQALRKYVSGISMPIDEFLIKWKSLFPPFFPCDIDIDMLRGYHFKPTDKTVQYIAKSTLPMDPKERFKVLFRLQSQWDLEDIKPLIEELNSRGMKIDSFIMKYARRKRLGKKTVVTSR

来源 Source

来源生物 organism	Saccharomyces cerevisiae
通用名 common_name	;brewer's yeast ;
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	4932
宿主生物 host_organism	Saccharomyces cerevisiae

实体 7 Entity 7 non-polymer

描述 description	IRON/SULFUR CLUSTER
分子量 formula_weight	351.6 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

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8. 引用文献 (1)

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分辨率 resolution	3.60 Å
分辨率测定方法 resolution_method	—
颗粒数 num_particles	385806

fit	/app/data/saxs_computation/tw/8tw9/8tw9.fit
pddf	/app/data/pr_computation/tw/8tw9/8tw9.pr.out
profile	/app/data/saxs_computation/tw/8tw9/8tw9.dat

Cryo-EM structure of S. cerevisiae PolE-Ctf18-8-1-DNA

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Chromosome transmission fidelity protein 18

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

DNA polymerase epsilon catalytic subunit A

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Chromosome transmission fidelity protein 8

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Sister chromatid cohesion protein DCC1

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

冷冻电镜 EM 3D

6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (7)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

实体 3 Entity 3 polymer

聚合物 Polymer

实体 4 Entity 4 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 5 Entity 5 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 6 Entity 6 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 7 Entity 7 non-polymer

8. 引用文献 (1)

9. 文件与曲线 (10)

Files (7)

Curves (3)