8tye

Lassa GPC (strain Josiah) bound to rabbit polyclonal fusion-peptide-targeting antibody FP-1

Method: ELECTRON MICROSCOPY D_max: 108.8 Å Quality: GOOD

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Glycoprotein GP1

Lassa virus (strain Mouse/Sierra Leone/Josiah/1976)

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	信息不足异源复合物蛋白 × 8 其他聚合物 19 PDB 声明：octameric（8）与蛋白拷贝数一致	链 A； UniProt 1–259 链 B； UniProt 1–259 链 C； UniProt 1–259 链 a； UniProt 260–424 链 b； UniProt 260–424 链 c； UniProt 260–424	未记录	Polyclonal Fv heavy chain × 1 Polyclonal Fv light chain × 1 alpha-L-fucopyranose-(1-6)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 ;alpha-D-mannopyranose-(1-6)-beta-D-mannopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose ; × 2 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-4)-[alpha-L-fucopyranose-(1-6)]2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 11 beta-D-mannopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 3 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 14	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.80 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 8TYE	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
5FT2 Sub-tomogram averaging of Lassa virus glycoprotein spike from virus- like particles at pH 5 提交 2016-01-09	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 75–237（163 aa）片段：RECEPTOR BINDING DOMAIN, UNP RESIDUES 75-237	未记录	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 50 MM BUFFER OF SUCCINIC ACID, DIHYDROGEN PHOSPHATE AND GLYCINE (SPG)；pH 5.2；50 MM BUFFER OF SUCCINIC ACID, DIHYDROGEN PHOSPHATE AND GLYCINE (SPG) cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE；VITRIFICATION 1 -- CRYOGEN- ETHANE-PROPANE MIXTURE, HUMIDITY- 80, TEMPERATURE- 120, INSTRUMENT- GATAN CRYOPLUNGE 3, METHOD- BLOT FOR 3 SECONDS BEFORE PLUNGING.,	分辨率 16.40 Å
5VK2 Structural basis for antibody-mediated neutralization of Lassa virus 提交 2017-04-20	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric	链 A 1–259（259 aa）片段：UNP residues 1-259 链 B 1–259（259 aa）片段：UNP residues 1-259 链 C 1–259（259 aa）片段：UNP residues 1-259 链 a 260–423（164 aa）片段：UNP residues 260-423 链 b 260–423（164 aa）片段：UNP residues 260-423 链 c 260–423（164 aa）片段：UNP residues 260-423	未记录	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 11	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；296 K；0.1M Tris pH 8, 15-18% PEG 3350 and 0.1M-0.3M magnesium acetate	分辨率 3.20 Å R-free 0.231
6P95 Structure of Lassa virus glycoprotein in complex with Fab 25.6A 提交 2019-06-09	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric	链 A 1–259（259 aa）链 B 1–259（259 aa）链 C 1–259（259 aa）链 a 260–433（174 aa）链 b 260–433（174 aa）链 c 260–433（174 aa）	突变：R207C, L258R, L259RG 突变：R207C, L258R, L259RG 突变：R207C, L258R, L259RG 突变：G360P, M332T, E329C 突变：G360P, M332T, E329C 突变：G360P, M332T, E329C	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 9	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；295 K；0.1 M Tris pH 8, 15-18% PEG 3350 and 0.1 M-0.3 M magnesium acetate	分辨率 3.50 Å R-free 0.247
7PUY Structure of the membrane soluble spike complex from the Lassa virus in a C3-symmetric map 提交 2021-10-01	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 A 1–259（259 aa）链 B 1–259（259 aa）链 C 1–259（259 aa）链 a 260–491（232 aa）链 b 260–491（232 aa）链 c 260–491（232 aa）	未记录	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 15	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.30 Å
7PVD Structure of the membrane soluble spike complex from the Lassa virus in a C1-symmetric map focused on the ectodomain 提交 2021-10-02	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 A 1–259（259 aa）链 B 1–259（259 aa）链 C 1–259（259 aa）链 a 260–491（232 aa）链 b 260–491（232 aa）链 c 260–491（232 aa）	未记录	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 12	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.70 Å
7S8H Structure of Lassa virus glycoprotein bound to Fab 18.5C and Fab 36.1F 提交 2021-09-17	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：octadecameric	链 A 59–259（201 aa）链 a 260–424（165 aa）	突变：G243C, Residues 256-259 mutated from RRLL to RRRR 突变：E329P, M332T, I350C	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；293.15 K；0.1 M Tris, pH 8.0, 1.25 M LiCl and 15% PEG 8k	分辨率 2.70 Å R-free 0.251
7TYV Structure of Lassa Virus glycoprotein (Josiah) bound to Fab 25.10C 提交 2022-02-14	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric	链 A 1–259（259 aa）链 B 1–259（259 aa）链 C 1–259（259 aa）链 a 260–423（164 aa）链 b 260–423（164 aa）链 c 260–423（164 aa）	突变：R207C, Residues 256-259 mutated from RRLL to RRRR 突变：R207C, Residues 256-259 mutated from RRLL to RRRR 突变：R207C, Residues 256-259 mutated from RRLL to RRRR 突变：E329P, M332T, G360C 突变：E329P, M332T, G360C 突变：E329P, M332T, G360C	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 13	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4；pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.80 Å
7UOT Native Lassa glycoprotein in complex with neutralizing antibodies 8.9F and 37.2D 提交 2022-04-13	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：tetradecameric	链 A 1–259（259 aa）链 B 1–259（259 aa）链 C 1–259（259 aa）链 a 260–491（232 aa）链 b 260–491（232 aa）链 c 260–491（232 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.77 Å
7UOV Native Lassa glycoprotein in complex with neutralizing antibodies 12.1F and 37.2D 提交 2022-04-14	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：octadecameric	链 A 1–259（259 aa）链 B 1–259（259 aa）链 C 1–259（259 aa）链 a 260–491（232 aa）链 b 260–491（232 aa）链 c 260–491（232 aa）	未记录	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.75 Å
8EJD Structure of lineage IV Lassa virus glycoprotein complex (strain Josiah) 提交 2022-09-16	突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同	Assembly 1 其他组合同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 A 1–259（259 aa）链 B 1–259（259 aa）链 C 1–259（259 aa）链 a 260–424（165 aa）链 b 260–424（165 aa）链 c 260–424（165 aa）	突变：R207C, L258R, L259R 突变：R207C, L258R, L259R 突变：R207C, L258R, L259R 突变：E329P, G360C 突变：E329P, G360C 突变：E329P, G360C	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 6	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4；TBS cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；Wait time 10 s; blotting time varied between 3-7 s; blotting force of 0	分辨率 3.80 Å
8EJH Lassa virus glycoprotein complex (Josiah) bound to 12.1F Fab 提交 2022-09-16	突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric	链 A 1–259（259 aa）链 B 1–259（259 aa）链 C 1–259（259 aa）链 a 260–424（165 aa）链 b 260–424（165 aa）链 c 260–424（165 aa）	突变：R207C, L258R, L259R 突变：R207C, L258R, L259R 突变：R207C, L258R, L259R 突变：E329P, G360C 突变：E329P, G360C 突变：E329P, G360C	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 6 MAN alpha-D-mannopyranose × 3	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4；TBS cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；Wait time 10 s; blotting time varied between 3-7 s; blotting force of 0	分辨率 3.71 Å
8EJI Lassa virus glycoprotein complex (Josiah) bound to 19.7E Fab 提交 2022-09-16	突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric	链 A 1–259（259 aa）链 B 1–259（259 aa）链 C 1–259（259 aa）链 a 260–424（165 aa）链 b 260–424（165 aa）链 c 260–424（165 aa）	突变：R207C, L258R, L259R 突变：R207C, L258R, L259R 突变：R207C, L258R, L259R 突变：E328P, G359C 突变：E328P, G359C 突变：E328P, G359C	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 14	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4；TBS cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；Wait time 10 s; blotting time varied between 3-7 s; blotting force of 0	分辨率 3.81 Å
8T5C Lassa GPC Trimer in complex with Fab 8.11G and nanobody D5 提交 2023-06-13	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：undecameric	链 A 59–257（199 aa）链 B 59–257（199 aa）链 C 59–257（199 aa）链 a 260–418（159 aa）链 b 260–418（159 aa）链 c 260–418（159 aa）	未记录	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 23	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4；PBS cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.70 Å
8TYC Lassa GPC (strain Josiah) bound to rabbit polyclonal base-targeting antibody Base-1 提交 2023-08-24	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric	链 A 1–259（259 aa）链 B 1–259（259 aa）链 C 1–259（259 aa）链 a 260–423（164 aa）链 b 260–423（164 aa）链 c 260–423（164 aa）	未记录	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 6	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.30 Å
8VCV Lineage IV Lassa virus glycoprotein (Josiah) in complex with rabbit polyclonal antibody (GPC-C epitope) 提交 2023-12-14	聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric	链 A 1–259（259 aa）链 B 1–259（259 aa）链 C 1–259（259 aa）链 a 260–424（165 aa）链 b 260–424（165 aa）链 c 260–424（165 aa）	未记录	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 9	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.80 Å
8VE8 Lineage IV Lassa virus glycoprotein (Josiah) in complex with rabbit polyclonal antibody (GP1-A epitope) 提交 2023-12-18	聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric	链 A 1–259（259 aa）链 B 1–259（259 aa）链 C 1–259（259 aa）链 a 260–424（165 aa）链 b 260–424（165 aa）链 c 260–424（165 aa）	未记录	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 13	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.80 Å
9CJ7 Lineage IV Lassa virus glycoprotein (Josiah) in complex with monoclonal antibody 8.9F 提交 2024-07-05	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric	链 A 1–259（259 aa）链 B 1–259（259 aa）链 C 1–259（259 aa）链 a 260–424（165 aa）链 b 260–424（165 aa）链 c 260–424（165 aa）	未记录	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 6	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4；TBS cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.00 Å
9CJ8 Lineage IV Lassa virus glycoprotein (Josiah) in complex with rabbit polyclonal antibody (LAVA01-like epitope) 提交 2024-07-05	聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric	链 A 1–259（259 aa）链 B 1–259（259 aa）链 C 1–259（259 aa）链 a 260–424（165 aa）链 b 260–424（165 aa）链 c 260–424（165 aa）	未记录	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 25	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.74 Å
9CK7 Lineage IV Lassa virus glycoprotein (Josiah) in complex with polyclonal antibody (GPC-A epitope) from rabbit 187 提交 2024-07-08	聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric	链 A 1–259（259 aa）链 B 1–259（259 aa）链 C 1–259（259 aa）链 a 260–424（165 aa）链 b 260–424（165 aa）链 c 260–424（165 aa）	未记录	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 15	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.45 Å
9CK8 Lineage IV Lassa virus glycoprotein (Josiah) in complex with polyclonal antibody (GPC-A epitope) from rabbit 189 提交 2024-07-08	聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric	链 A 1–259（259 aa）链 B 1–259（259 aa）链 C 1–259（259 aa）链 a 260–424（165 aa）链 b 260–424（165 aa）链 c 260–424（165 aa）	未记录	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 17	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.04 Å
9MHE Native tagless Lassa virus spike complex bound to ARN-75039 at pH 8.0 提交 2024-12-11	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：12-meric	链 A 1–259（259 aa）链 B 1–259（259 aa）链 C 1–259（259 aa）链 a 260–491（232 aa）链 b 260–491（232 aa）链 c 260–491（232 aa）	未记录	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 10 UNX UNKNOWN LIGAND × 2 A1BK9 (4S)-3-(4-tert-butoxyphenyl)-7-methyl-6-{4-[(propan-2-yl)oxy]phenyl}imidazo[1,2-a]pyridine × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.01 Å
9MIV Native tagless Lassa virus spike complex pH 6.0 提交 2024-12-13	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：12-meric	链 A 1–259（259 aa）链 B 1–259（259 aa）链 C 1–259（259 aa）链 a 260–491（232 aa）链 b 260–491（232 aa）链 c 260–491（232 aa）	未记录	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 12 UNX UNKNOWN LIGAND × 3	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.02 Å
9MIY Focused reconstruction of the transmembrane region of the Lassa virus spike complex 提交 2024-12-13	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 A 1–58（58 aa）链 B 1–58（58 aa）链 C 1–58（58 aa）链 a 260–491（232 aa）链 b 260–491（232 aa）链 c 260–491（232 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.72 Å
9MJ1 Native tagless Lassa virus spike complex bound at pH 8.0 提交 2024-12-13	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：12-meric	链 A 1–259（259 aa）链 B 1–259（259 aa）链 C 1–259（259 aa）链 a 260–491（232 aa）链 b 260–491（232 aa）链 c 260–491（232 aa）	未记录	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 12 UNX UNKNOWN LIGAND × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 1.90 Å
9MJ2 Flag-tag Lassa virus spike complex at pH 6.0 提交 2024-12-13	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 A 59–259（201 aa）链 B 59–259（201 aa）链 C 59–259（201 aa）链 a 260–491（232 aa）链 b 260–491（232 aa）链 c 260–491（232 aa）	未记录	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 15 UNX UNKNOWN LIGAND × 3	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 6 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.58 Å
9R8U Flag-tag LASV spike acidified to pH 5.0 and re-equilibrated to pH 8.0 提交 2025-05-16	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 A 1–259（259 aa）链 B 1–259（259 aa）链 C 1–259（259 aa）链 a 260–491（232 aa）链 b 260–491（232 aa）链 c 260–491（232 aa）	未记录	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 15 UNX UNKNOWN LIGAND × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.30 Å

共 26 个其他 PDB 条目、26 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	GLYC_LASSJ
Isoform	—
PDB实体	3, 4
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–259； UniProt 1–259 作者链 B； PDB构建体 1–259； UniProt 1–259 作者链 C； PDB构建体 1–259； UniProt 1–259 作者链 a； PDB构建体 1–165； UniProt 260–424 作者链 b； PDB构建体 1–165； UniProt 260–424 作者链 c； PDB构建体 1–165； UniProt 260–424

Glycoprotein GP2

Thermotoga maritima (strain ATCC 43589 / DSM 3109 / JCM 10099 / NBRC 100826 / MSB8)

UniProt Q9WXS1

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	信息不足异源复合物蛋白 × 8 其他聚合物 19 PDB 声明：octameric（8）与蛋白拷贝数一致	链 a； UniProt 2–205 链 b； UniProt 2–205 链 c； UniProt 2–205	未记录	Polyclonal Fv heavy chain × 1 Polyclonal Fv light chain × 1 Glycoprotein GP1 × 3 （P08669） alpha-L-fucopyranose-(1-6)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 ;alpha-D-mannopyranose-(1-6)-beta-D-mannopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose ; × 2 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-4)-[alpha-L-fucopyranose-(1-6)]2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 11 beta-D-mannopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 3 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 14	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.80 Å

数据库中的同蛋白其他状态

其他 PDB	相对当前条目 8TYE	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
1VLW Crystal structure of 2-dehydro-3-deoxyphosphogluconate aldolase/4-hydroxy-2-oxoglutarate aldolase (TM0066) from Thermotoga maritima at 2.30 A resolution 提交 2004-08-18	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–205（205 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION,SITTING DROP,NANODROP；pH 7.5；277 K；22.5% PEG-1000, 0.1M Tris pH 7.5 , VAPOR DIFFUSION,SITTING DROP,NANODROP, temperature 277K	分辨率 2.30 Å R-free 0.221
1VLW Crystal structure of 2-dehydro-3-deoxyphosphogluconate aldolase/4-hydroxy-2-oxoglutarate aldolase (TM0066) from Thermotoga maritima at 2.30 A resolution 提交 2004-08-18	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 1–205（205 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION,SITTING DROP,NANODROP；pH 7.5；277 K；22.5% PEG-1000, 0.1M Tris pH 7.5 , VAPOR DIFFUSION,SITTING DROP,NANODROP, temperature 277K	分辨率 2.30 Å R-free 0.221
1VLW Crystal structure of 2-dehydro-3-deoxyphosphogluconate aldolase/4-hydroxy-2-oxoglutarate aldolase (TM0066) from Thermotoga maritima at 2.30 A resolution 提交 2004-08-18	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 C 1–205（205 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION,SITTING DROP,NANODROP；pH 7.5；277 K；22.5% PEG-1000, 0.1M Tris pH 7.5 , VAPOR DIFFUSION,SITTING DROP,NANODROP, temperature 277K	分辨率 2.30 Å R-free 0.221
1VLW Crystal structure of 2-dehydro-3-deoxyphosphogluconate aldolase/4-hydroxy-2-oxoglutarate aldolase (TM0066) from Thermotoga maritima at 2.30 A resolution 提交 2004-08-18	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 4 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 A 1–205（205 aa）链 B 1–205（205 aa）链 C 1–205（205 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION,SITTING DROP,NANODROP；pH 7.5；277 K；22.5% PEG-1000, 0.1M Tris pH 7.5 , VAPOR DIFFUSION,SITTING DROP,NANODROP, temperature 277K	分辨率 2.30 Å R-free 0.221
1WA3 Mechanism of the Class I KDPG aldolase 提交 2004-10-22	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 A 1–205（205 aa）链 B 1–205（205 aa）链 C 1–205（205 aa）	未记录	PYR PYRUVIC ACID × 3 SO4 SULFATE ION × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 4.6；0.075M SODIUM ACETATE, 0.1M AMMONIUM SULPHATE, 28%W/V PEG4000, pH 4.60	分辨率 1.90 Å R-free 0.239
1WA3 Mechanism of the Class I KDPG aldolase 提交 2004-10-22	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 D 1–205（205 aa）链 E 1–205（205 aa）链 F 1–205（205 aa）	未记录	PYR PYRUVIC ACID × 3 SO4 SULFATE ION × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 4.6；0.075M SODIUM ACETATE, 0.1M AMMONIUM SULPHATE, 28%W/V PEG4000, pH 4.60	分辨率 1.90 Å R-free 0.239
5KP9 Structure of Nanoparticle Released from Enveloped Protein Nanoparticle 提交 2016-07-02	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足同源多聚体；蛋白 × 60 PDB 声明：60-meric	链 B 2–205（204 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5；Phosphate-buffered saline cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；11 second blot, 0 mm offset	分辨率 5.70 Å
5KP9 Structure of Nanoparticle Released from Enveloped Protein Nanoparticle 提交 2016-07-02	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 信息不足单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 2–205（204 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5；Phosphate-buffered saline cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；11 second blot, 0 mm offset	分辨率 5.70 Å
5KP9 Structure of Nanoparticle Released from Enveloped Protein Nanoparticle 提交 2016-07-02	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 信息不足同源多聚体；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric	链 B 2–205（204 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5；Phosphate-buffered saline cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；11 second blot, 0 mm offset	分辨率 5.70 Å
5KP9 Structure of Nanoparticle Released from Enveloped Protein Nanoparticle 提交 2016-07-02	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 4 信息不足同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 B 2–205（204 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5；Phosphate-buffered saline cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；11 second blot, 0 mm offset	分辨率 5.70 Å
5KP9 Structure of Nanoparticle Released from Enveloped Protein Nanoparticle 提交 2016-07-02	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 5 信息不足单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 2–205（204 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5；Phosphate-buffered saline cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；11 second blot, 0 mm offset	分辨率 5.70 Å
7B3Y Structure of a nanoparticle for a COVID-19 vaccine candidate 提交 2020-12-01	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足同源多聚体；蛋白 × 60 PDB 声明：60-meric	链 B 1–205（205 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5；PBS cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.70 Å
8A8N Structure of self-assembling engineered protein nanocage (EPN) fused with hepatitis A pX protein 提交 2022-06-23	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 2–205（204 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7；PBS cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；Blot time 4-5 s.	分辨率 6.70 Å
8E01 Structure of engineered nano-cage fusion protein 提交 2022-08-08	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 60 PDB 声明：60-meric	链 A 1–205（205 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8.1；Tris, 100 mM NaCl, 1 mM DTT cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.40 Å
8E01 Structure of engineered nano-cage fusion protein 提交 2022-08-08	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–205（205 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8.1；Tris, 100 mM NaCl, 1 mM DTT cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.40 Å
8E01 Structure of engineered nano-cage fusion protein 提交 2022-08-08	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric	链 A 1–205（205 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8.1；Tris, 100 mM NaCl, 1 mM DTT cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.40 Å
8E01 Structure of engineered nano-cage fusion protein 提交 2022-08-08	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 4 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 A 1–205（205 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8.1；Tris, 100 mM NaCl, 1 mM DTT cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.40 Å
8E01 Structure of engineered nano-cage fusion protein 提交 2022-08-08	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 5 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–205（205 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8.1；Tris, 100 mM NaCl, 1 mM DTT cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.40 Å
8JGA Cryo-EM structure of Mi3 fused with FKBP 提交 2023-05-20	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–205（205 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.68 Å
8JGC Cryo-EM structure of Mi3 fused with LOV2 提交 2023-05-20	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–205（205 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.44 Å
8SZZ CryoEM Structure of Computationally Designed Nanocage O32-ZL4 提交 2023-05-30	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：48-meric	链 I 1–205（205 aa）链 J 1–205（205 aa）链 K 1–205（205 aa）链 L 1–205（205 aa）链 M 1–205（205 aa）链 N 1–205（205 aa）链 O 1–205（205 aa）链 U 1–205（205 aa）链 Y 1–205（205 aa）链 Z 1–205（205 aa）链 a 1–205（205 aa）链 b 1–205（205 aa）链 c 1–205（205 aa）链 d 1–205（205 aa）链 e 1–205（205 aa）链 f 1–205（205 aa）链 g 1–205（205 aa）链 h 1–205（205 aa）链 i 1–205（205 aa）链 j 1–205（205 aa）链 k 1–205（205 aa）链 l 1–205（205 aa）链 m 1–205（205 aa）链 n 1–205（205 aa）	未记录	NA SODIUM ION × 24	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5；25 mM Tris/HCl pH 7.5, 150 mM NaCl cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.90 Å
8TVB Ghanaian virus fusion glycoprotein (GhV F) 提交 2023-08-17	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 A 2–205（204 aa）链 B 2–205（204 aa）链 C 2–205（204 aa）	未记录	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 12	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.90 Å
8TYC Lassa GPC (strain Josiah) bound to rabbit polyclonal base-targeting antibody Base-1 提交 2023-08-24	聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric	链 a 2–205（204 aa）链 b 2–205（204 aa）链 c 2–205（204 aa）	未记录	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 6	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.30 Å
9FO3 Structure of a gp140 SpyTag-SpyCatcher mi3 nanoparticle including mi3 density only. 提交 2024-06-11	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 60 PDB 声明：60-meric	链 0 1–205（205 aa）链 1 1–205（205 aa）链 2 1–205（205 aa）链 3 1–205（205 aa）链 4 1–205（205 aa）链 5 1–205（205 aa）链 6 1–205（205 aa）链 7 1–205（205 aa）链 A 1–205（205 aa）链 B 1–205（205 aa）链 C 1–205（205 aa）链 D 1–205（205 aa）链 E 1–205（205 aa）链 F 1–205（205 aa）链 G 1–205（205 aa）链 H 1–205（205 aa）链 I 1–205（205 aa）链 J 1–205（205 aa）链 K 1–205（205 aa）链 L 1–205（205 aa）链 M 1–205（205 aa）链 N 1–205（205 aa）链 O 1–205（205 aa）链 P 1–205（205 aa）链 Q 1–205（205 aa）链 R 1–205（205 aa）链 S 1–205（205 aa）链 T 1–205（205 aa）链 U 1–205（205 aa）链 V 1–205（205 aa）链 W 1–205（205 aa）链 X 1–205（205 aa）链 Y 1–205（205 aa）链 Z 1–205（205 aa）链 a 1–205（205 aa）链 b 1–205（205 aa）链 c 1–205（205 aa）链 d 1–205（205 aa）链 e 1–205（205 aa）链 f 1–205（205 aa）链 g 1–205（205 aa）链 h 1–205（205 aa）链 i 1–205（205 aa）链 j 1–205（205 aa）链 k 1–205（205 aa）链 l 1–205（205 aa）链 m 1–205（205 aa）链 n 1–205（205 aa）链 o 1–205（205 aa）链 p 1–205（205 aa）链 q 1–205（205 aa）链 r 1–205（205 aa）链 s 1–205（205 aa）链 t 1–205（205 aa）链 u 1–205（205 aa）链 v 1–205（205 aa）链 w 1–205（205 aa）链 x 1–205（205 aa）链 y 1–205（205 aa）链 z 1–205（205 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 5.30 Å
9UAQ CryoEM structure of GFP-like protein from Aequorea coerulescens with Trimbody 提交 2025-04-01	聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric	链 A 2–205（204 aa）链 B 2–205（204 aa）链 C 2–205（204 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.29 Å
9UBR CryoEM structure of human Galectin-10 with iTrimbody 提交 2025-04-03	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：octadecameric	链 A 2–205（204 aa）链 B 2–205（204 aa）链 C 2–205（204 aa）链 D 2–205（204 aa）链 E 2–205（204 aa）链 F 2–205（204 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.62 Å
9UCL CryoEM structure of IgV domain of human Nectin-4 with Trimbody 提交 2025-04-04	聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric	链 A 2–205（204 aa）链 B 2–205（204 aa）链 C 2–205（204 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.43 Å
9XOU CryoEM structure of LacY with Trimbody 提交 2025-11-15	聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric	链 A 2–205（204 aa）链 B 2–205（204 aa）链 C 2–205（204 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.50 Å

共 16 个其他 PDB 条目、28 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	Q9WXS1_THEMA
Isoform	—
PDB实体	4
链与序列区间	作者链 a； PDB构建体 191–394； UniProt 2–205 作者链 b； PDB构建体 191–394； UniProt 2–205 作者链 c； PDB构建体 191–394； UniProt 2–205

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

下载 Download SAXS (.dat) P(r) (.pr.out) CIF

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	8tye
沉积日期 deposition_date	2023-08-25
结构标题 title	Lassa GPC (strain Josiah) bound to rabbit polyclonal fusion-peptide-targeting antibody FP-1
关键词 keywords	;Lassa virus glycoprotein complex, GPC, immune complex, antibody, polyclonal antibody, base antibody, VIRAL PROTEIN, VIRAL PROTEIN-IMMUNE SYSTEM complex ;; VIRAL PROTEIN/IMMUNE SYSTEM
实验方法 method	ELECTRON MICROSCOPY

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3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier	34.03 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron	32.82 Å
零角强度 I(0) i0	338272000.00
分子量 molecular_weight	141860.0 kDa
排除体积 excluded_volume	174900 Å³
包络体积 envelope_volume	234490 Å³
水化壳体积 shell_volume	56753 Å³
包络直径 envelope_diameter	117.9 Å
壳层 Rg shell_rg	41.34 Å
包络 Rg envelope_rg	33.50 Å
形状 Rg shape_rg	32.88 Å
总 Rg total_rg	33.25 Å
总原子数 total_atoms	9921
残基数 n_residues	1205
球谐函数阶数 n_harmonics	20
q 范围 q_range	— – 0.5000 Å⁻¹
数据点数 n_points	101
壳层类型 shell_type	directional
溶剂电子密度 solvent_density	0.3340 e/Å³
壳层衬度 contrast_shell	0.0300 e/Å³
CRYSOL 版本 crysol_version	4.1.3

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4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax	108.8 Å
Rg (实空间) rg_real	33.94 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error	0.67 Å
I(0) (实空间) i0_real	3.3830e+08
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error	5.0120e+06
Rg (倒空间) rg_reciprocal	33.99 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal	338300000.0000
解质量估计 total_estimate	0.8735
解质量评级 solution_quality	GOOD a GOOD solution
P(r) 峰数 n_peaks	2
主峰位置 r_peak_primary	41.7 Å
偏度 Skewness skewness	0.328
峰度 Kurtosis kurtosis	-0.174
角度范围 angular_range	— – 0.2350 Å⁻¹
当前正则化参数 α current_alpha	0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha	133300000.0000
实空间数据点数 n_real_points	48
GNOM 版本 gnom_version	4.1.3
质量判据 quality_criteria	AN1: 0.000; Oscil: 0.858; Stabil: 1.000; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.997; Smooth: 0.782

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5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

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6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (10)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	Polyclonal Fv heavy chain
分子量 formula_weight	9890.2 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	H
原子数 atom_count	9921

XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	Polyclonal Fv light chain
分子量 formula_weight	8698.7 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	L

XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX

实体 3 Entity 3 polymer

描述 description	Glycoprotein GP1
分子量 formula_weight	29010.4 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	3

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	C,A,B

MGQIVTFFQEVPHVIEEVMNIVLIALSVLAVLKGLYNFATCGLVGLVTFLLLCGRSCTTSLYKGVYELQTLELNMETLNMTMPLSCTKNNSHHYIMVGNETGLELTLTNTSIINHKFCNLSDAHKKNLYDHALMSIISTFHLSIPNFNQYEAMSCDFNGGKISVQYNLSHSYAGDAANHCGTVANGVLQTFMRMAWGGSYIALDSGCGNWDCIMTSYQYLIIQNTTWEDHCQFSRPSPIGYLGLLSQRTRDIYISRRLL

来源 Source

来源生物 organism	Lassa virus (strain Mouse/Sierra Leone/Josiah/1976)
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	11622
宿主生物 host_organism	Homo sapiens

实体 4 Entity 4 polymer

描述 description	Glycoprotein GP2
分子量 formula_weight	44765.0 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	3

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	c,a,b

GTFTWTLSDSEGKDTPGGYCLTRWMLIEAELKCFGNTAVAKCNEKHDEEFCDMLRLFDFNKQAIQRLKAPAQMSIQLINKAVNALINDQLIMKNHLRDIMCIPYCNYSKYWYLNHTTTGRTSLPKCWLVSNGSYLNETHFSDDIEQQADNMITEMLQKEYMERQGGSGGSGGSGGSGGSEKAAKAEEAARKMEELFKKHKIVAVLRANSVEEAIEKAVAVFAGGVHLIEITFTVPDADTVIKALSVLKEKGAIIGAGTVTSVEQCRKAVESGAEFIVSPHLDEEISQFCKEKGVFYMPGVMTPTELVKAMKLGHDILKLFPGEVVGPEFVKAMKGPFPNVKFVPTGGVDLDNVCEWFDAGVLAVGVGDALVEGDPDEVREKAKEFVEKIRGCTEGSLEWSHPQFEK

来源 Source

来源生物 organism	Thermotoga maritima (strain ATCC 43589 / DSM 3109 / JCM 10099 / NBRC 100826 / MSB8)
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	243274
宿主生物 host_organism	Homo sapiens

实体 5 Entity 5 branched

描述 description	alpha-L-fucopyranose-(1-6)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose
分子量 formula_weight	367.3 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

实体 6 Entity 6 branched

描述 description	;alpha-D-mannopyranose-(1-6)-beta-D-mannopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose ;
分子量 formula_weight	748.7 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

实体 7 Entity 7 branched

描述 description	2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-4)-[alpha-L-fucopyranose-(1-6)]2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose
分子量 formula_weight	570.5 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

实体 8 Entity 8 branched

描述 description	2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose
分子量 formula_weight	424.4 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	11

实体 9 Entity 9 branched

描述 description	beta-D-mannopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose
分子量 formula_weight	586.5 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	3

实体 10 Entity 10 non-polymer

描述 description	2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose
分子量 formula_weight	221.2 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	14

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8. 引用文献 (1)

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分辨率 resolution	3.80 Å
分辨率测定方法 resolution_method	—
颗粒数 num_particles	59236

fit	/app/data/saxs_computation/ty/8tye/8tye.fit
pddf	/app/data/pr_computation/ty/8tye/8tye.pr.out
profile	/app/data/saxs_computation/ty/8tye/8tye.dat

Lassa GPC (strain Josiah) bound to rabbit polyclonal fusion-peptide-targeting antibody FP-1

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Glycoprotein GP1

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Glycoprotein GP2

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

冷冻电镜 EM 3D

6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (10)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

实体 3 Entity 3 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 4 Entity 4 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 5 Entity 5 branched

实体 6 Entity 6 branched

实体 7 Entity 7 branched

实体 8 Entity 8 branched

实体 9 Entity 9 branched

实体 10 Entity 10 non-polymer

8. 引用文献 (1)

9. 文件与曲线 (10)

Files (7)

Curves (3)