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1C1Y
CRYSTAL STRUCTURE OF RAP.GMPPNP IN COMPLEX WITH THE RAS-BINDING-DOMAIN OF C-RAF1 KINASE (RAFRBD).
提交 1999-07-22
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构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
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链 B
55–131(77 aa)
片段:RAFRBD, RESIDUES 51-131
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未记录
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MG MAGNESIUM ION × 1
GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1
CA CALCIUM ION × 1
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.6;300 K;mmePeg5000, magnesium chloride, calcium chloride, ammonium sulphate., pH 7.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 300K
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分辨率 1.90 Å
R-free 0.257
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1FAQ
RAF-1 CYSTEINE RICH DOMAIN, NMR, 27 STRUCTURES
提交 1996-09-05
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构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
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链 A
136–187(52 aa)
片段:CYSTEINE-RICH DOMAIN
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未记录
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ZN ZINC ION × 2
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SOLUTION NMR
mmCIF 未提供已读取条件
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分辨率未提供
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1FAR
RAF-1 CYSTEINE RICH DOMAIN, NMR, MINIMIZED AVERAGE STRUCTURE
提交 1996-09-05
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构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
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链 A
136–187(52 aa)
片段:CYSTEINE-RICH DOMAIN
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未记录
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ZN ZINC ION × 2
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SOLUTION NMR
mmCIF 未提供已读取条件
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分辨率未提供
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1GUA
HUMAN RAP1A, RESIDUES 1-167, DOUBLE MUTANT (E30D,K31E) COMPLEXED WITH GPPNHP AND THE RAS-BINDING-DOMAIN OF HUMAN C-RAF1, RESIDUES 51-131
提交 1996-06-18
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构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
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链 B
51–131(81 aa)
片段:RESIDUES 51-131
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未记录
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MG MAGNESIUM ION × 1
GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1
CA CALCIUM ION × 1
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X-RAY DIFFRACTION
mmCIF 未提供已读取条件
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分辨率 2.00 Å
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1RFA
NMR SOLUTION STRUCTURE OF THE RAS-BINDING DOMAIN OF C-RAF-1
提交 1995-04-26
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构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
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链 A
55–132(78 aa)
片段:RAS BINDING DOMAIN, RESIDUES 55 - 132 WITH AN ADDITIONAL ALA AT THE N-TERMINUS
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未记录
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未记录非水小分子
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SOLUTION NMR
mmCIF 未提供已读取条件
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分辨率未提供
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3CU8
Impaired binding of 14-3-3 to Raf1 is linked to Noonan and LEOPARD syndrome
提交 2008-04-16
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构建体不同
突变/修饰不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 4
PDB 声明:tetrameric
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链 P
256–264(9 aa)
片段:Phosphorylated cRaf1 peptide
链 Q
256–264(9 aa)
片段:Phosphorylated cRaf1 peptide
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非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点)
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点)
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MG MAGNESIUM ION × 2
PPI PROPANOIC ACID × 1
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 8;293 K;0.1M (Sodium propionate, sodium cacodylate, BIS-TRIS propane), 27% PEG 1500, 2mM DTT, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.40 Å
R-free 0.259
|
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3IQJ
Crystal Structure of human 14-3-3 sigma in Complex with Raf1 peptide (10mer)
提交 2009-08-20
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构建体不同
突变/修饰不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 4
PDB 声明:tetrameric
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链 P
255–264(10 aa)
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非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点)
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CL CHLORIDE ION × 2
MG MAGNESIUM ION × 6
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.5;277 K;0.1M Hepes/NaOH ph 7.5, 0.2M CaCl2, 28% PEG 400, 5% glycerol, 2mM DTT, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 1.15 Å
R-free 0.153
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3IQU
Crystal Structure of human 14-3-3 sigma in Complex with Raf1 peptide (6mer)
提交 2009-08-21
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构建体不同
突变/修饰不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 4
PDB 声明:tetrameric
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链 P
255–260(6 aa)
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点)
|
CL CHLORIDE ION × 2
MG MAGNESIUM ION × 6
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.5;277 K;0.1M Hepes/NaOH ph 7.5, 0.2M CaCl2, 28% PEG 400, 5% glycerol, 2mM DTT, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 1.05 Å
R-free 0.151
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3IQV
Crystal Structure of human 14-3-3 sigma in Complex with Raf1 peptide (6mer) and stabilisator Fusicoccin
提交 2009-08-21
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构建体不同
突变/修饰不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 4
PDB 声明:tetrameric
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链 P
255–260(6 aa)
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非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点)
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FSC FUSICOCCIN × 2
CL CHLORIDE ION × 4
MG MAGNESIUM ION × 8
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.5;277 K;20mM Hepes/NaOH pH 7.5, 2mM MgCl2 and 2 mM DTT, set up for crystallization in 0.1 M Hepes/NaOH ph 7.5, 0.2 M CaCl2, 28% PEG 400, 5% glycerol, 2mM DTT, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 1.20 Å
R-free 0.153
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3KUC
Complex of Rap1A(E30D/K31E)GDP with RafRBD(A85K/N71R)
提交 2009-11-27
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构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
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链 B
51–131(81 aa)
片段:UNP residues 51-131
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突变:A85K, N71R
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GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1
MG MAGNESIUM ION × 1
CA CALCIUM ION × 1
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.5;298 K;20-25% PEG 8000, 100 mM Tris or HEPES pH 7.2-7.6, 10-200 mM Ca Acetate or 100 mM Ammonium Sulfate, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 1.92 Å
R-free 0.209
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3KUD
Complex of Ras-GDP with RafRBD(A85K)
提交 2009-11-27
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 B
51–131(81 aa)
片段:UNP residues 51-131
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突变:A85K
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GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1
MG MAGNESIUM ION × 1
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6;298 K;1.3M Na-Malonat pH 6.0, 100 mM MES pH 6.1, 4% Betaine, 2% Sarcosine, 2% N,N-dimethylglycine, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 2.15 Å
R-free 0.264
|
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3NKX
Impaired binding of 14-3-3 to Raf1 is linked to Noonan and LEOPARD syndrome
提交 2010-06-21
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构建体不同
突变/修饰不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 4
PDB 声明:tetrameric
|
链 P
255–264(10 aa)
片段:phosphorylated C-Raf peptide, UNP residues 255-264
链 Q
255–264(10 aa)
片段:phosphorylated C-Raf peptide, UNP residues 255-264
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点)
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点)
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PPI PROPANOIC ACID × 1
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 8;293 K;0.1M (Sodium propionate, sodium cacodylate, BIS-TRIS propane), 27% PEG 1500, 2mM DTT, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.40 Å
R-free 0.247
|
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3O8I
Structure of 14-3-3 isoform sigma in complex with a C-Raf1 peptide and a stabilizing small molecule fragment
提交 2010-08-03
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构建体不同
突变/修饰不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 4
PDB 声明:tetrameric
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链 B
255–264(10 aa)
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非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点)
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M1T 6,6-dihydroxy-1-methoxyhexan-2-one × 2
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.5;277.15 K;0.095M HEPES Na, 26.6%(v/v) PEG400, 0.19M CaCl2, 5%(v/v) Glycerol, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277.15K
|
分辨率 2.00 Å
R-free 0.239
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3OMV
Crystal structure of c-raf (raf-1)
提交 2010-08-27
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构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
323–618(296 aa)
片段:C-RAF kinase domain, UNP residues 323-618
链 B
323–618(296 aa)
片段:C-RAF kinase domain, UNP residues 323-618
|
未记录
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SM5 (1E)-5-(1-piperidin-4-yl-3-pyridin-4-yl-1H-pyrazol-4-yl)-2,3-dihydro-1H-inden-1-one oxime × 2
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 8;285 K;12% PEG 8K, 100 MM TRIS PH 8.0, 10% TACSIMATE, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 285K
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分辨率 4.00 Å
R-free 0.364
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4FJ3
14-3-3 isoform zeta in complex with a diphoyphorylated C-RAF peptide
提交 2012-06-11
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构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 3
PDB 声明:trimeric
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链 P
229–264(36 aa)
片段:UNP residues 229-264
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非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点)
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未记录非水小分子
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7;277 K;0.1 M Na-acetate pH 7.0, 0.8 M NaH2PO4 and 1.2 M K2HPO4 , VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
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分辨率 1.95 Å
R-free 0.208
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4G0N
Crystal Structure of wt H-Ras-GppNHp bound to the RBD of Raf Kinase
提交 2012-07-09
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构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 B
54–131(78 aa)
片段:UNP residues 54-131
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未记录
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GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1
CA CALCIUM ION × 2
MG MAGNESIUM ION × 1
ACT ACETATE ION × 1
DTU (2R,3S)-1,4-DIMERCAPTOBUTANE-2,3-DIOL × 1
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.8;291 K;Protein solution: 10 - 16 mg/mL, 50 mM HEPES, pH 7.2, 50 mM NaCl, 10mM MgCl2 5% Glycerol, 1mM DTE, 10 M ZnCl2
Reservoir solution:200mM calcium acetate, 100mM sodium cacodylate pH 6.5, 18% PEG 8000.
Drop: 1uL protein, 1uL reservoir, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 291K
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分辨率 2.45 Å
R-free 0.229
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4G3X
Crystal Structure of Q61L H-Ras-GppNHp bound to the RBD of Raf Kinase
提交 2012-07-15
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 B
55–131(77 aa)
片段:UNP residues 55-131
|
未记录
|
GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1
MG MAGNESIUM ION × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.8;291 K;Protein solution: 10 - 18 mg/mL, 50 mM HEPES, pH 7.2, 50 mM NaCl, 10mM MgCl2 5% Glycerol, 1mM DTE, 10 M ZnCl2 Reservoir solution:200mM calcium acetate, 100mM sodium cacodylate pH 6.5, 18% PEG 8000. Drop: 3uL protein, 3uL reservoir , VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
|
分辨率 3.25 Å
R-free 0.271
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4IEA
14-3-3 isoform sigma in complex with a phosphorylated C-RAF peptide
提交 2012-12-13
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构建体不同
突变/修饰不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 4
PDB 声明:tetrameric
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链 P
618–625(8 aa)
片段:UNP residues 618-625
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非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点)
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未记录非水小分子
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.4;277 K;95 mM Na-HEPES pH 7.4, 25.6 % PEG 400, 190 mM CaCl2, 5 % Glycerol, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
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分辨率 1.70 Å
R-free 0.208
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4IHL
Human 14-3-3 isoform zeta in complex with a diphoyphorylated C-RAF peptide and Cotylenin A
提交 2012-12-19
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构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 3
PDB 声明:trimeric
|
链 P
229–264(36 aa)
片段:UNP residues 229-264
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非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点)
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K POTASSIUM ION × 2
1F5 (1R,3aS,4R,5R,6R,9aR,10E)-6-({(1S,2R,4S,5R,6R,8S,9S)-5-hydroxy-2-(methoxymethyl)-9-methyl-9-[(2S)-oxiran-2-yl]-3,7,10,1 1-tetraoxatricyclo[6.2.1.0~1,6~]undec-4-yl}oxy)-1-(methoxymethyl)-4,9a-dimethyl-7-(propan-2-yl)-1,2,3,3a,4,5,6,8,9,9a-de cahydrodicyclopenta[a,d][8]annulene-1,5-diol × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7;277 K;0.1 M NA-ACETATE PH 7.0, 0.8 M NAH2PO4 AND 1.2 M K2HPO4, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
|
分辨率 2.20 Å
R-free 0.243
|
|
6NTC
Crystal Structure of G12V HRas-GppNHp bound in complex with the engineered RBD variant 1 of CRAF Kinase protein
提交 2019-01-28
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 B
55–131(77 aa)
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突变:F61L, K65Q, Q66E, R67W, N71K, C81S, V88R, R89H, C95S, C96S
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GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1
GOL GLYCEROL × 1
MG MAGNESIUM ION × 1
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;30% PEG4000, 200mM NH4SO4, 100mM Na CaCo pH 6.5
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分辨率 2.90 Å
R-free 0.278
|
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6NTD
Crystal Structure of G12V HRas-GppNHp bound in complex with the engineered RBD variant 12 of CRAF Kinase protein
提交 2019-01-28
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 B
55–131(77 aa)
|
突变:F61L, K65H, Q66E, N71K, C81S, V88R, R89H, C95S, C96S
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MG MAGNESIUM ION × 1
GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 5.6;293.15 K;30% PEG4000, 200mM NH4SO4, 100mM Na Citrate
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分辨率 3.15 Å
R-free 0.287
|
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6PTS
NMR data-driven model of KRas-GMPPNP:RBD-CRD complex tethered to a nanodisc (state A)
提交 2019-07-16
|
构建体不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 4
PDB 声明:tetrameric
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链 D
56–187(132 aa)
片段:RBD-CRD (UNP residues 56-187)
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未记录
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PCW 1,2-DIOLEOYL-SN-GLYCERO-3-PHOSPHOCHOLINE × 64
17F O-[(S)-({(2R)-2,3-bis[(9Z)-octadec-9-enoyloxy]propyl}oxy)(hydroxy)phosphoryl]-L-serine × 16
GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1
MG MAGNESIUM ION × 1
ZN ZINC ION × 2
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SOLUTION NMR
NMR测量条件
pH 5.5;298 K;离子强度(mmCIF原始值)450;压力 1
NMR测量条件
pH 5.5;308 K;离子强度(mmCIF原始值)150;压力 1
NMR样品组成
0.2 mM U-2H; U-15N; Ile Leu C-delta-13C, Val C-gamma-13C KRAS, 0.2 mM U-12C, 14N, 1H RBD-CRD, 0.4 mM U-12C, 14N, 1H MSP, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成
0.2 mM U-12C, 14N, 1H KRAS, 0.2 mM U-2H; U-15N; Ile Leu C-delta-13C, Val C-gamma-13C RBD-CRD, 0.4 mM U-12C, 14N, 1H MSP, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成
0.2 mM U-12C, 14N, 1H KRAS, 0.2 mM U-2H; U-15N; Ile Leu C-delta-13C, Val C-gamma-13C RBD-CRD, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成
0.2 mM U-12C, 14N, 1H KRAS, 0.2 mM U-2H; U-15N; Ile Leu C-delta-13C, Val C-gamma-13C RBD-CRD, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成
0.5 mM U-15N; Ile C-delta-13C, Met methyl-13C KRAS, 0.5 mM Leu C-delta-13C, Val C-gamma-13C, RBD-CRD, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成
0.5 mM [U-99% 15N]; [U-13C]; RBD, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成
0.3 mM [U-99% 15N]; [U-13C]; CRD, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
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分辨率未提供
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6PTW
NMR data-driven model of KRas-GMPPNP:RBD-CRD complex tethered to a nanodisc (state B)
提交 2019-07-16
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构建体不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 4
PDB 声明:tetrameric
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链 D
56–187(132 aa)
片段:RBD-CRD (UNP residues 56-187)
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未记录
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PCW 1,2-DIOLEOYL-SN-GLYCERO-3-PHOSPHOCHOLINE × 64
17F O-[(S)-({(2R)-2,3-bis[(9Z)-octadec-9-enoyloxy]propyl}oxy)(hydroxy)phosphoryl]-L-serine × 16
GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1
MG MAGNESIUM ION × 1
ZN ZINC ION × 2
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SOLUTION NMR
NMR测量条件
pH 5.5;298 K;离子强度(mmCIF原始值)450;压力 1
NMR测量条件
pH 5.5;308 K;离子强度(mmCIF原始值)150;压力 1
NMR样品组成
0.2 mM [Ile, Leu C-delta-13C; Val C-gamma-13C; U-15N; U-2H] KRAS, 0.2 mM [U-12C; U-14N; U-1H] RBD-CRD, 0.4 mM [U-12C; U-14N; U-1H] MSP, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成
0.2 mM [U-12C; U-14N; U-1H] KRAS, 0.2 mM [Ile, Leu C-delta-13C; Val C-gamma-13C; U-15N; U-2H] RBD-CRD, 0.4 mM [U-12C; U-14N; U-1H] MSP, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成
0.2 mM [Ile, Leu C-delta-13C; Val C-gamma-13C; U-15N] RBD-CRD, 0.2 mM [U-12C; U-14N; U-1H] KRAS Q43C, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成
0.2 mM [Ile, Leu C-delta-13C; Val C-gamma-13C; U-15N] RBD-CRD, 0.2 mM [U-12C; U-14N; U-1H] KRAS N-term C, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成
0.5 mM [U-15N; Ile C-delta-13C; Met methyl-13C] KRAS, 0.5 mM [Leu C-delta-13C; Val C-gamma-13C] RBD-CRD, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成
0.5 mM [U-13C; U-15N] RBD, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成
0.5 mM [U-13C; U-15N] CRD, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
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分辨率未提供
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6VJJ
Crystal Structure of wild-type KRAS4b (GMPPNP-bound) in complex with RAS-binding domain (RBD) of RAF1/CRAF
提交 2020-01-16
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构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 B
52–131(80 aa)
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未记录
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MG MAGNESIUM ION × 1
GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1
CL CHLORIDE ION × 3
EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2
MPD (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293 K;0.09M Halogens, 0.1M Imidazole.MES pH 6.5, 37.5% MPD, PEG 1000 and PEG 3350
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分辨率 1.40 Å
R-free 0.195
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6XGU
Crystal Structure of KRAS-Q61R (GMPPNP-bound) in complex with RAS-binding domain (RBD) and cysteine-rich domain (CRD) of RAF1/CRAF
提交 2020-06-18
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
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链 B
52–188(137 aa)
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点)
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GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1
MG MAGNESIUM ION × 1
ZN ZINC ION × 3
GOL GLYCEROL × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.8;293 K;100 mM Tris 7.8, 200 mM KBr, 200 mM KSCN, 3% PGA, 0.35 mM D-myo-phosphatidylinositol 3,4,5-triphosphate
|
分辨率 2.70 Å
R-free 0.236
|
|
6XGV
Crystal Structure of KRAS-G13D (GMPPNP-bound) in complex with RAS-binding domain (RBD) and cysteine-rich domain (CRD) of RAF1/CRAF
提交 2020-06-18
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构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 B
52–188(137 aa)
|
突变:Modified Cys95
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点)
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GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1
MG MAGNESIUM ION × 1
ZN ZINC ION × 3
GOL GLYCEROL × 2
CL CHLORIDE ION × 1
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293 K;100 mM sodium cacodylate pH 6.5, 700 mM sodium acetate, 0.35 mM D-myo-phosphatidylinositol 3,4,5-triphosphate
|
分辨率 2.11 Å
R-free 0.204
|
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6XHA
Crystal Structure of KRAS-G12V (GMPPNP-bound) in complex with RAS-binding domain (RBD) and cysteine-rich domain (CRD) of RAF1/CRAF
提交 2020-06-18
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 B
52–188(137 aa)
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点)
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GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1
GOL GLYCEROL × 4
MG MAGNESIUM ION × 1
CL CHLORIDE ION × 2
ZN ZINC ION × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293 K;100 mM sodium cacodylate pH 6.5, 200 mM MgCl2, 8% PGA, 0.35 mM D-myo-phosphatidylinositol 3,4,5-triphosphate
|
分辨率 2.87 Å
R-free 0.269
|
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6XHB
Crystal Structure of wild-type KRAS (GMPPNP-bound) in complex with RAS-binding domain (RBD) and cysteine-rich domain (CRD) of RAF1/CRAF (crystal form II)
提交 2020-06-18
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构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 B
52–188(137 aa)
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点)
|
GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1
MG MAGNESIUM ION × 1
CL CHLORIDE ION × 3
GOL GLYCEROL × 2
IPA ISOPROPYL ALCOHOL × 1
ZN ZINC ION × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293 K;100 mM sodium cacodylate pH 6.5, 200 mM sodium citrate, 15% 2-propanol, 0.25% (w/v) n-octyl-beta-D-glucoside, 0.35 mM D-myo-phosphatidylinositol 3,4,5-triphosphate, and 0.25% (w/v) n-dodecyl-beta-D-maltoside
|
分辨率 2.50 Å
R-free 0.221
|
|
6XI7
Crystal Structure of wild-type KRAS (GMPPNP-bound) in complex with RAS-binding domain (RBD) and cysteine-rich domain (CRD) of RAF1/CRAF (crystal form I)
提交 2020-06-19
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 B
52–188(137 aa)
|
未记录
|
GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1
MG MAGNESIUM ION × 1
SO4 SULFATE ION × 2
CL CHLORIDE ION × 5
ZN ZINC ION × 3
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 5.3;293 K;2218.18 mM AMSO4, 6.5% (w/v) PEG 400, pH 5.3
|
分辨率 1.95 Å
R-free 0.232
|
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7JHP
Crystal structure of HRas in complex with the Ras-binding and cysteine-rich domains of CRaf-kinase
提交 2020-07-21
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 C
55–187(133 aa)
片段:UNP residues 55-187
|
未记录
|
GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1
MG MAGNESIUM ION × 1
ZN ZINC ION × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;291 K;0.1 M ammonium acetate, 0.1 M Bis-Tris, pH 5.5, 17% w/v PEG10000
|
分辨率 2.77 Å
R-free 0.264
|
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7Z37
Structure of the RAF1-HSP90-CDC37 complex (RHC-II)
提交 2022-03-01
|
构建体不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 4
PDB 声明:tetrameric
|
链 CP1
1–648(648 aa)
|
未记录
|
ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE;blot for 3 seconds before plunging
|
分辨率 3.67 Å
|
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7Z38
Structure of the RAF1-HSP90-CDC37 complex (RHC-I)
提交 2022-03-01
|
构建体不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 4
PDB 声明:tetrameric
|
链 C
1–648(648 aa)
|
未记录
|
ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2
MG MAGNESIUM ION × 2
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE;blot for 3 seconds before plunging
|
分辨率 3.16 Å
|
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8A68
Small molecule stabilizer (compound 5) for C-RAF(pS259) and 14-3-3
提交 2022-06-16
|
构建体不同
突变/修饰不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 4
PDB 声明:tetrameric
|
链 B
255–263(9 aa)
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点)
|
MG MAGNESIUM ION × 6
L7U ~{N}-[2-[2-(dimethylamino)ethyldisulfanyl]ethyl]-1-[(2~{R})-2-(6-methoxynaphthalen-2-yl)propanoyl]piperidine-4-carboxamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;277 K;0.095 M HEPES pH 7.5,
0.19 M CaCl2, 5% glycerol, 28% PEG 400
|
分辨率 1.60 Å
R-free 0.179
|
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8A6F
Small molecule stabilizer (compound 8) for C-RAF and 14-3-3
提交 2022-06-17
|
构建体不同
突变/修饰不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 4
PDB 声明:tetrameric
|
链 P
255–264(10 aa)
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点)
|
CL CHLORIDE ION × 2
MG MAGNESIUM ION × 4
O56 1-[4-[4-chloranyl-3-(trifluoromethyl)phenyl]-4-oxidanyl-piperidin-1-yl]-3-[2-(dimethylamino)ethyldisulfanyl]propan-1-one × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;277 K;0.095 M HEPES pH 7.5, 0.19 M CaCl2, 26% (v/v) PEG 400 and 5% (v/v)
glycerol
|
分辨率 1.60 Å
R-free 0.181
|
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8A6H
Small molecule stabilizer (compound 7) for C-RAF and 14-3-3
提交 2022-06-17
|
构建体不同
突变/修饰不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 4
PDB 声明:tetrameric
|
链 P
255–264(10 aa)
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点)
|
CL CHLORIDE ION × 2
MG MAGNESIUM ION × 4
L6L 3-[2-(dimethylamino)ethyldisulfanyl]-1-[4-oxidanyl-4-[3-(trifluoromethyl)phenyl]piperidin-1-yl]propan-1-one × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;277 K;0.095 M HEPES pH 7.7, 0.19 M CaCl2, 24 % (v/v) PEG 400 and 5% (v/v) glycerol)
|
分辨率 1.60 Å
R-free 0.174
|
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8ATR
Small molecular stabilizer for C-RAF (pS259) and 14-3-3 (1075297)
提交 2022-08-24
|
构建体不同
突变/修饰不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 4
PDB 声明:tetrameric
|
链 P
255–263(9 aa)
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点)
|
CL CHLORIDE ION × 2
MG MAGNESIUM ION × 4
O6L 2-chloranyl-~{N}-[[1-[1-(4-chloranylphenoxy)cyclopentyl]carbonylpiperidin-4-yl]methyl]ethanamide × 2
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;277 K;0.095 M HEPES (pH 7.1), PEG400 (24% (v/v)), 0.19 M CaCl2 and 5% (v/v) Glycerol
|
分辨率 1.70 Å
R-free 0.211
|
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8ATS
Small molecular stabilizer for C-RAF (pS259) and 14-3-3 (1075306)
提交 2022-08-24
|
构建体不同
突变/修饰不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 4
PDB 声明:tetrameric
|
链 P
255–263(9 aa)
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点)
|
CL CHLORIDE ION × 2
MG MAGNESIUM ION × 6
O5I 2-chloranyl-~{N}-[[1-[1-[(4-chlorophenyl)amino]cyclopentyl]carbonylpiperidin-4-yl]methyl]ethanamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;277 K;0.095 M HEPES (pH 7.1), PEG400 (24% (v/v)), 0.19 M CaCl2 and 5% (v/v) Glycerol
|
分辨率 1.40 Å
R-free 0.171
|
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8AV0
small molecule stabilizer (compound 1) for C-RAF pS259 and 14-3-3
提交 2022-08-26
|
构建体不同
突变/修饰不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 4
PDB 声明:tetrameric
|
链 P
256–264(9 aa)
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点)
|
CL CHLORIDE ION × 2
MG MAGNESIUM ION × 6
O6C 1-[2-(4-chloranylphenoxy)-2-methyl-propanoyl]-~{N}-[2-[2-(dimethylamino)ethyldisulfanyl]ethyl]piperidine-4-carboxamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;277 K;0.095 M HEPES (pH 7.1), PEG400 (24% (v/v)), 0.19 M CaCl2 and 5% (v/v) Glycerol
|
分辨率 1.50 Å
R-free 0.180
|
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8CHF
cryo-EM Structure of Craf:14-3-3:Mek1
提交 2023-02-07
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 6
PDB 声明:hexameric
|
链 A
1–648(648 aa)
链 B
1–648(648 aa)
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点)
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点)
|
29L 2-{4-[(1E)-1-(hydroxyimino)-2,3-dihydro-1H-inden-5-yl]-3-(pyridin-4-yl)-1H-pyrazol-1-yl}ethanol × 2
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ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE
|
分辨率 4.25 Å
|
|
8CPD
Cryo-EM structure of CRaf dimer with 14:3:3
提交 2023-03-02
|
构建体不同
突变/修饰不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 4
PDB 声明:tetrameric
|
链 A
1–648(648 aa)
链 B
1–648(648 aa)
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点)
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点)
|
未记录非水小分子
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE
|
分辨率 3.46 Å
|
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8EPW
Crystal Structure of KRAS4b-G13D (GMPPNP-bound) in complex with RAS-binding domain (RBD) of RAF1/CRAF
提交 2022-10-06
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 B
52–131(80 aa)
|
未记录
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GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1
MG MAGNESIUM ION × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293 K;0.15 M potassium bromide, 30% PEG 2000 MME
|
分辨率 2.00 Å
R-free 0.253
|
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8GAE
Hsp90 provides platform for CRaf dephosphorylation by PP5
提交 2023-02-22
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 5
PDB 声明:pentameric
|
链 D
404–610(207 aa)
|
未记录
|
K POTASSIUM ION × 2
MG MAGNESIUM ION × 2
ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1
ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1
MN MANGANESE (II) ION × 2
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE;3UL OF SAMPLE
10C
100% HUMIDITY
30S WAIT TIME
3S BLOT TIME
-2 BLOT FORCE
|
分辨率 3.30 Å
|
|
8GFT
Hsp90 provides platform for CRaf dephosphorylation by PP5
提交 2023-03-08
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 5
PDB 声明:pentameric
|
链 D
336–618(283 aa)
|
未记录
|
ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1
MG MAGNESIUM ION × 2
K POTASSIUM ION × 2
ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1
MN MANGANESE (II) ION × 2
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE;3uL OF SAMPLE, 10C, 100%
HUMIDITY, 30S WAIT TIME, 3S
BLOT TIME, -2 BLOT FORCE
|
分辨率 3.80 Å
|
|
8JNA
CRAF ras-binding domain chimera, apo form
提交 2023-06-06
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
信息不足
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
50–101(52 aa)
链 B
114–141(28 aa)
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突变:K65S, F99Y, S120W, D129E
突变:K65S, F99Y, S120W, D129E
|
未记录非水小分子
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 8;293 K;1.0M tri-sodium citrate, 0.1M imidazole, pH 8.0
|
分辨率 1.70 Å
R-free 0.272
|
|
8JNB
CRAF ras-binding domain chimera, ligand complex
提交 2023-06-06
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
信息不足
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
50–101(52 aa)
链 B
114–141(28 aa)
|
突变:K65S, F99Y, S120W, D129E
突变:K65S, F99Y, S120W, D129E
|
USX 2-[4-[[(2S)-1-ethanoyl-3-oxidanylidene-2H-indol-2-yl]methyl]-2-methoxy-phenoxy]ethanamide × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 5.6;293 K;0.5M ammonium sulfate, 1.0M lithium sulfate, 0.1M sodium citrate, pH 5.6
|
分辨率 1.62 Å
R-free 0.242
|
|
8JOF
solution-structure of Ras Binding Domain (RBD) in C-RAF
提交 2023-06-07
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
51–131(81 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
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SOLUTION NMR
NMR测量条件
pH 6.8;298 K;离子强度(mmCIF原始值)85;压力 ambient
NMR样品组成
0.3 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] Serine/threonine-protein Kinase C-RAF, 25 mM sodium phosphate, 50 mM sodium chloride, 10 mM magnesium dichloride, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
|
分辨率未提供
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8JOG
solution structure of Ras Binding Domein (RBD) in C-RAF with negative allosteric modulator.
提交 2023-06-07
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
51–131(81 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
SOLUTION NMR
NMR测量条件
pH 6.8;298 K;离子强度(mmCIF原始值)85;压力 ambient
NMR样品组成
0.3 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] Serin/threonine protein kinase C-RAF, 25 mM sodium phosphate, 50 mM sodium chloride, 10 mM magnesium dichloride, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
|
分辨率未提供
|
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8S42
Ternary structure of 14-3-3s, C-RAF phosphopeptide (pS259) and compound 80 (1124898)
提交 2024-02-21
|
构建体不同
突变/修饰不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 4
PDB 声明:tetrameric
|
链 P
255–263(9 aa)
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点)
|
CL CHLORIDE ION × 2
MG MAGNESIUM ION × 4
A1H5F 2-chloranyl-1-[8-[3-fluoranyl-4-(trifluoromethyl)phenyl]sulfonyl-5-oxa-2,8-diazaspiro[3.5]nonan-2-yl]ethanone × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;277 K;0.095 M HEPES pH=7.1-7.7
0.19 M CaCl2
5% glycerol
24-29% PEG400
|
分辨率 1.70 Å
R-free 0.194
|
|
8T74
Crystal structure of KRAS4a (GMPPNP) in complex with RAF1 (RBD)
提交 2023-06-19
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 B
52–131(80 aa)
|
未记录
|
MG MAGNESIUM ION × 1
GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293 K;0.15 M DL-malic acid (pH 7.0), 20% PEG 3350
|
分辨率 1.65 Å
R-free 0.196
|
|
8T75
Crystal Structure of KRAS4a (GMPPNP) in complex with RAF1 (RBD-CRD)
提交 2023-06-19
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 B
52–188(137 aa)
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点)
|
GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1
MG MAGNESIUM ION × 1
ZN ZINC ION × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293 K;0.1 M sodium acetate (pH 4.6), 2 M sodium formate
|
分辨率 2.65 Å
R-free 0.219
|
|
8T75
Crystal Structure of KRAS4a (GMPPNP) in complex with RAF1 (RBD-CRD)
提交 2023-06-19
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 D
52–188(137 aa)
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点)
|
GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1
MG MAGNESIUM ION × 1
ZN ZINC ION × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293 K;0.1 M sodium acetate (pH 4.6), 2 M sodium formate
|
分辨率 2.65 Å
R-free 0.219
|
|
8T75
Crystal Structure of KRAS4a (GMPPNP) in complex with RAF1 (RBD-CRD)
提交 2023-06-19
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 3
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 F
52–188(137 aa)
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点)
|
GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1
MG MAGNESIUM ION × 1
ZN ZINC ION × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293 K;0.1 M sodium acetate (pH 4.6), 2 M sodium formate
|
分辨率 2.65 Å
R-free 0.219
|
|
8T75
Crystal Structure of KRAS4a (GMPPNP) in complex with RAF1 (RBD-CRD)
提交 2023-06-19
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 4
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 H
52–188(137 aa)
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点)
|
GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1
MG MAGNESIUM ION × 1
ZN ZINC ION × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293 K;0.1 M sodium acetate (pH 4.6), 2 M sodium formate
|
分辨率 2.65 Å
R-free 0.219
|
|
9AXA
CryoEM structure of activated CRAF/MEK/14-3-3 complex with NST-628
提交 2024-03-06
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
信息不足
异源复合物;蛋白 × 6
PDB 声明:hexameric
|
链 A
306–648(343 aa)
链 C
306–648(343 aa)
|
突变:Y340D Y341D
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点)
突变:Y340D Y341D
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点)
|
A1AHE N-[3-fluoro-4-({7-[(3-fluoropyridin-2-yl)oxy]-4-methyl-2-oxo-2H-1-benzopyran-3-yl}methyl)pyridin-2-yl]-N'-methylsulfuric diamide × 2
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.36 Å
|
|
9AXC
Activated CRAF/MEK heterotetramer from focused refinement of CRAF/MEK/14-3-3 complex
提交 2024-03-06
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
信息不足
异源复合物;蛋白 × 4
PDB 声明:tetrameric
|
链 A
306–648(343 aa)
链 C
306–648(343 aa)
|
突变:Y340D Y341D
突变:Y340D Y341D
|
A1AHE N-[3-fluoro-4-({7-[(3-fluoropyridin-2-yl)oxy]-4-methyl-2-oxo-2H-1-benzopyran-3-yl}methyl)pyridin-2-yl]-N'-methylsulfuric diamide × 2
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.16 Å
|
|
9AY7
Crystal structure of CRAF/MEK1 complex with NST-628 and inactive RAF
提交 2024-03-07
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
337–615(279 aa)
|
突变:Y340D Y341D
|
ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 2
MG MAGNESIUM ION × 2
NI NICKEL (II) ION × 1
ACT ACETATE ION × 5
EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1
A1AHE N-[3-fluoro-4-({7-[(3-fluoropyridin-2-yl)oxy]-4-methyl-2-oxo-2H-1-benzopyran-3-yl}methyl)pyridin-2-yl]-N'-methylsulfuric diamide × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 8;291 K;0.2M sodium acetate pH 8.0, 20% w/v PEG 3350
|
分辨率 2.41 Å
R-free 0.236
|
|
9AYA
Crystal structure of CRAF/MEK complex with NST-628 and active RAF dimer
提交 2024-03-07
|
构建体不同
突变/修饰不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 4
PDB 声明:tetrameric
|
链 A
337–615(279 aa)
链 C
337–615(279 aa)
|
突变:Y340D Y341D
突变:Y340D Y341D
|
A1AHE N-[3-fluoro-4-({7-[(3-fluoropyridin-2-yl)oxy]-4-methyl-2-oxo-2H-1-benzopyran-3-yl}methyl)pyridin-2-yl]-N'-methylsulfuric diamide × 2
ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 2
MG MAGNESIUM ION × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7;291 K;0.2M magnesium chloride, 0.1M tris pH 7.0, 10% w/v PEG 8000
|
分辨率 2.59 Å
R-free 0.257
|
|
9EW1
Ternary structure of 14-3-3s, CRAF phosphopeptide (pS259) and compound 79 (1124379).
提交 2024-04-03
|
构建体不同
突变/修饰不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 4
PDB 声明:tetrameric
|
链 P
255–263(9 aa)
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点)
|
CL CHLORIDE ION × 2
MG MAGNESIUM ION × 6
WQT 2-chloranyl-1-[8-(4-iodophenyl)sulfonyl-5-oxa-2,8-diazaspiro[3.5]nonan-2-yl]ethanone × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;277 K;0.095 M HEPES pH=7.1-7.7
0.19 M CaCl2
5% glycerol
24-29% PEG400
|
分辨率 1.40 Å
R-free 0.168
|
|
9EW3
Ternary structure of 14-3-3s, C-RAF phosphopeptide 12-mer (pS259) and compound 78 (1084378)
提交 2024-04-03
|
构建体不同
突变/修饰不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 4
PDB 声明:tetrameric
|
链 P
255–263(9 aa)
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点)
|
CL CHLORIDE ION × 2
MG MAGNESIUM ION × 6
WQN 1-[8-(4-bromophenyl)sulfonyl-5-oxa-2,8-diazaspiro[3.5]nonan-2-yl]-2-chloranyl-ethanone × 2
CA CALCIUM ION × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;277 K;0.095 M HEPES pH=7.1-7.7
0.19 M CaCl2
5% glycerol
24-29% PEG400
|
分辨率 1.40 Å
R-free 0.229
|
|
9EW4
Ternary structure of 14-3-3s, C-RAF phosphopeptide 12mer (pS259) and compound 86 (1124384)
提交 2024-04-03
|
构建体不同
突变/修饰不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 4
PDB 声明:tetrameric
|
链 P
255–263(9 aa)
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点)
|
CL CHLORIDE ION × 2
MG MAGNESIUM ION × 8
WQ9 1-[(5~{R})-2-(4-bromanyl-3-fluoranyl-phenyl)sulfonyl-2,7-diazaspiro[4.4]nonan-7-yl]-2-chloranyl-ethanone × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;277 K;0.095 M HEPES pH=7.1-7.7
0.19 M CaCl2
5% glycerol
24-29% PEG400
|
分辨率 1.60 Å
R-free 0.211
|
|
9EW5
Ternary structure of 14-3-3s, C-RAF phosphopeptide (pS259) 12mer and compound 23 (1083848)
提交 2024-04-03
|
构建体不同
突变/修饰不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 4
PDB 声明:tetrameric
|
链 C
255–265(11 aa)
链 F
255–265(11 aa)
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点)
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点)
|
WQI 2-chloranyl-~{N}-[[1-(4-iodophenyl)sulfonylpiperidin-4-yl]methyl]ethanamide × 2
CA CALCIUM ION × 3
MG MAGNESIUM ION × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;277 K;0.095 M HEPES pH=7.1-7.7
0.19 M CaCl2
5% glycerol
24-29% PEG400
|
分辨率 1.50 Å
R-free 0.216
|
|
9EW7
Binary structure of 14-3-3s and CRAF phosphopeptide (pS259)
提交 2024-04-03
|
构建体不同
突变/修饰不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 4
PDB 声明:tetrameric
|
链 P
255–264(10 aa)
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点)
|
CL CHLORIDE ION × 2
MG MAGNESIUM ION × 4
CA CALCIUM ION × 4
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;277 K;0.095 M HEPES pH=7.1-7.7
0.19 M CaCl2
5% glycerol
24-29% PEG400
|
分辨率 1.80 Å
R-free 0.193
|
|
9MMP
Cryo-EM structure of CRAF/MEK1/14-3-3 complex (autoinhibited conformation)
提交 2024-12-20
|
构建体不同
突变/修饰不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 4
PDB 声明:tetrameric
|
链 A
1–648(648 aa)
|
突变:Q156R, D587E
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点)
|
AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 2
ZN ZINC ION × 2
LCJ 5-[(2-fluoro-4-iodophenyl)amino]-N-(2-hydroxyethoxy)imidazo[1,5-a]pyridine-6-carboxamide × 1
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5;50 mM Tris pH 7.5, 150 mM NaCl, 2 mM MgCl2, 0.5 mM TCEP, 2 uM ATPgS, 1 uM GDC0623
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.40 Å
|
|
9MMQ
Cryo-EM structure of CRAF/MEK1 complex (kinase domain)
提交 2024-12-20
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
1–648(648 aa)
|
突变:Q156R, D587E
|
AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 2
MG MAGNESIUM ION × 2
LCJ 5-[(2-fluoro-4-iodophenyl)amino]-N-(2-hydroxyethoxy)imidazo[1,5-a]pyridine-6-carboxamide × 1
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5;50 mM Tris pH 7.5, 150 mM NaCl, 2 mM MgCl2, 0.5 mM TCEP, 2 uM ATPgS, 1 uM GDC0623
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.90 Å
|
|
9MMR
Cryo-EM structure of CRAF/MEK1/14-3-3 complex (open monomer conformation, CRAF Y340D/Y341D mutant)
提交 2024-12-20
|
构建体不同
突变/修饰不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 4
PDB 声明:tetrameric
|
链 A
1–648(648 aa)
|
突变:Q156R, Y340D, Y341D, D587E
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点)
|
AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 2
MG MAGNESIUM ION × 2
LCJ 5-[(2-fluoro-4-iodophenyl)amino]-N-(2-hydroxyethoxy)imidazo[1,5-a]pyridine-6-carboxamide × 1
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5;50 mM Tris pH 7.5, 150 mM NaCl, 2 mM MgCl2, 0.5 mM TCEP, 2 uM ATPgS, 1 uM GDC0623
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.90 Å
|
|
9MMS
Cryo-EM structure of CRAF/MEK1 complex (kinase domain, CRAF Y340D/Y341D mutant)
提交 2024-12-20
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
1–648(648 aa)
|
突变:Q156R, Y340D, Y341D, D587E
|
AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 2
MG MAGNESIUM ION × 2
LCJ 5-[(2-fluoro-4-iodophenyl)amino]-N-(2-hydroxyethoxy)imidazo[1,5-a]pyridine-6-carboxamide × 1
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5;50 mM Tris pH 7.5, 150 mM NaCl, 2 mM MgCl2, 0.5 mM TCEP, 2 uM ATPgS, 1 uM GDC0623
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.30 Å
|
|
9O0U
Crystal structure of CRAF/MEK1 complex with PLX4720 and CH5126766
提交 2025-04-03
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
337–615(279 aa)
|
突变:Y340D, Y341D
|
324 N-{3-[(5-chloro-1H-pyrrolo[2,3-b]pyridin-3-yl)carbonyl]-2,4-difluorophenyl}propane-1-sulfonamide × 1
CHU N-(3-fluoro-4-{[4-methyl-2-oxo-7-(pyrimidin-2-yloxy)-2H-chromen-3-yl]methyl}pyridin-2-yl)-N'-methylsulfuric diamide × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;295 K;18% PEG 3350, 0.1 M Sodium citrate pH 5.6, 4% Tacsimate pH 5
|
分辨率 2.91 Å
R-free 0.264
|
|
9O0U
Crystal structure of CRAF/MEK1 complex with PLX4720 and CH5126766
提交 2025-04-03
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 C
337–615(279 aa)
|
突变:Y340D, Y341D
|
324 N-{3-[(5-chloro-1H-pyrrolo[2,3-b]pyridin-3-yl)carbonyl]-2,4-difluorophenyl}propane-1-sulfonamide × 1
CHU N-(3-fluoro-4-{[4-methyl-2-oxo-7-(pyrimidin-2-yloxy)-2H-chromen-3-yl]methyl}pyridin-2-yl)-N'-methylsulfuric diamide × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;295 K;18% PEG 3350, 0.1 M Sodium citrate pH 5.6, 4% Tacsimate pH 5
|
分辨率 2.91 Å
R-free 0.264
|
|
9O0U
Crystal structure of CRAF/MEK1 complex with PLX4720 and CH5126766
提交 2025-04-03
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 3
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 E
337–615(279 aa)
|
突变:Y340D, Y341D
|
324 N-{3-[(5-chloro-1H-pyrrolo[2,3-b]pyridin-3-yl)carbonyl]-2,4-difluorophenyl}propane-1-sulfonamide × 1
CHU N-(3-fluoro-4-{[4-methyl-2-oxo-7-(pyrimidin-2-yloxy)-2H-chromen-3-yl]methyl}pyridin-2-yl)-N'-methylsulfuric diamide × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;295 K;18% PEG 3350, 0.1 M Sodium citrate pH 5.6, 4% Tacsimate pH 5
|
分辨率 2.91 Å
R-free 0.264
|
|
9O0U
Crystal structure of CRAF/MEK1 complex with PLX4720 and CH5126766
提交 2025-04-03
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 4
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 G
337–615(279 aa)
|
突变:Y340D, Y341D
|
324 N-{3-[(5-chloro-1H-pyrrolo[2,3-b]pyridin-3-yl)carbonyl]-2,4-difluorophenyl}propane-1-sulfonamide × 1
CHU N-(3-fluoro-4-{[4-methyl-2-oxo-7-(pyrimidin-2-yloxy)-2H-chromen-3-yl]methyl}pyridin-2-yl)-N'-methylsulfuric diamide × 1
ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;295 K;18% PEG 3350, 0.1 M Sodium citrate pH 5.6, 4% Tacsimate pH 5
|
分辨率 2.91 Å
R-free 0.264
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9O0V
Crystal structure of CRAF/MEK1 complex with PLX4720, CH5126766, and AMPPNP
提交 2025-04-03
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
337–615(279 aa)
|
突变:Y340D, Y341D
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324 N-{3-[(5-chloro-1H-pyrrolo[2,3-b]pyridin-3-yl)carbonyl]-2,4-difluorophenyl}propane-1-sulfonamide × 1
CHU N-(3-fluoro-4-{[4-methyl-2-oxo-7-(pyrimidin-2-yloxy)-2H-chromen-3-yl]methyl}pyridin-2-yl)-N'-methylsulfuric diamide × 1
ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;295 K;18% PEG 3350, 0.1 M Sodium citrate pH 5.6, 4% Tacsimate pH 5
|
分辨率 3.50 Å
R-free 0.254
|
|
9O0V
Crystal structure of CRAF/MEK1 complex with PLX4720, CH5126766, and AMPPNP
提交 2025-04-03
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 2
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 C
337–615(279 aa)
|
突变:Y340D, Y341D
|
324 N-{3-[(5-chloro-1H-pyrrolo[2,3-b]pyridin-3-yl)carbonyl]-2,4-difluorophenyl}propane-1-sulfonamide × 1
CHU N-(3-fluoro-4-{[4-methyl-2-oxo-7-(pyrimidin-2-yloxy)-2H-chromen-3-yl]methyl}pyridin-2-yl)-N'-methylsulfuric diamide × 1
ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;295 K;18% PEG 3350, 0.1 M Sodium citrate pH 5.6, 4% Tacsimate pH 5
|
分辨率 3.50 Å
R-free 0.254
|
|
9O0V
Crystal structure of CRAF/MEK1 complex with PLX4720, CH5126766, and AMPPNP
提交 2025-04-03
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 3
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 E
337–615(279 aa)
|
突变:Y340D, Y341D
|
324 N-{3-[(5-chloro-1H-pyrrolo[2,3-b]pyridin-3-yl)carbonyl]-2,4-difluorophenyl}propane-1-sulfonamide × 1
CHU N-(3-fluoro-4-{[4-methyl-2-oxo-7-(pyrimidin-2-yloxy)-2H-chromen-3-yl]methyl}pyridin-2-yl)-N'-methylsulfuric diamide × 1
ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;295 K;18% PEG 3350, 0.1 M Sodium citrate pH 5.6, 4% Tacsimate pH 5
|
分辨率 3.50 Å
R-free 0.254
|
|
9O0V
Crystal structure of CRAF/MEK1 complex with PLX4720, CH5126766, and AMPPNP
提交 2025-04-03
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 4
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 G
337–615(279 aa)
|
突变:Y340D, Y341D
|
324 N-{3-[(5-chloro-1H-pyrrolo[2,3-b]pyridin-3-yl)carbonyl]-2,4-difluorophenyl}propane-1-sulfonamide × 1
CHU N-(3-fluoro-4-{[4-methyl-2-oxo-7-(pyrimidin-2-yloxy)-2H-chromen-3-yl]methyl}pyridin-2-yl)-N'-methylsulfuric diamide × 1
ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;295 K;18% PEG 3350, 0.1 M Sodium citrate pH 5.6, 4% Tacsimate pH 5
|
分辨率 3.50 Å
R-free 0.254
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9S2I
Ternary structure of 14-3-3, CRAF R256S NS mutant phosphopeptide (pS259), and compound 78 (1124378)
提交 2025-07-21
|
构建体不同
突变/修饰不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 4
PDB 声明:tetrameric
|
链 P
255–265(11 aa)
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突变:R256S
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点)
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CL CHLORIDE ION × 2
MG MAGNESIUM ION × 4
WQN 1-[8-(4-bromophenyl)sulfonyl-5-oxa-2,8-diazaspiro[3.5]nonan-2-yl]-2-chloranyl-ethanone × 2
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;277 K;0.095 M HEPES pH=7.1-7.7 0.19 M CaCl2 5% glycerol 24-29% PEG400
|
分辨率 1.67 Å
R-free 0.201
|
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9S2J
Ternary structure of 14-3-3s, CRAF S257L NS mutant phosphopeptide (pS259) and compound 78 (1084378)
提交 2025-07-21
|
构建体不同
突变/修饰不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 4
PDB 声明:tetrameric
|
链 P
255–265(11 aa)
|
突变:S257L
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点)
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CL CHLORIDE ION × 2
MG MAGNESIUM ION × 4
WQN 1-[8-(4-bromophenyl)sulfonyl-5-oxa-2,8-diazaspiro[3.5]nonan-2-yl]-2-chloranyl-ethanone × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;277 K;0.095 M HEPES pH=7.1-7.7 0.19 M CaCl2 5% glycerol 24-29% PEG400
|
分辨率 1.50 Å
R-free 0.203
|
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9S2K
Ternary structure of 14-3-3s, CRAF V263A NS mutant phosphopeptide (pS259), and compound 78 (1124378)
提交 2025-07-21
|
构建体不同
突变/修饰不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 4
PDB 声明:tetrameric
|
链 P
255–265(11 aa)
|
突变:V263A
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点)
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CL CHLORIDE ION × 2
MG MAGNESIUM ION × 6
WQN 1-[8-(4-bromophenyl)sulfonyl-5-oxa-2,8-diazaspiro[3.5]nonan-2-yl]-2-chloranyl-ethanone × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;277 K;0.095 M HEPES pH=7.1-7.7 0.19 M CaCl2 5% glycerol 24-29% PEG400
|
分辨率 2.15 Å
R-free 0.233
|
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9S2L
Ternary structure of 14-3-3s, CRAF R256S NS mutant phosphopeptide (pS259), and compound 23 (1083848)
提交 2025-07-21
|
构建体不同
突变/修饰不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 4
PDB 声明:tetrameric
|
链 H
255–265(11 aa)
链 S
255–265(11 aa)
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点)
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点)
|
WQI 2-chloranyl-~{N}-[[1-(4-iodophenyl)sulfonylpiperidin-4-yl]methyl]ethanamide × 2
MG MAGNESIUM ION × 6
CL CHLORIDE ION × 2
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;277 K;0.095 M HEPES pH=7.1-7.7 0.19 M CaCl2 5% glycerol 24-29% PEG400
|
分辨率 1.85 Å
R-free 0.223
|
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9S2M
Ternary structure of 14-3-3s, CRAF S257L NS mutant phosphopeptide (pS259), and compound 23 (1083848)
提交 2025-07-21
|
构建体不同
突变/修饰不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 4
PDB 声明:tetrameric
|
链 H
255–265(11 aa)
链 S
255–265(11 aa)
|
突变:S257L
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点)
突变:S257L
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点)
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WQI 2-chloranyl-~{N}-[[1-(4-iodophenyl)sulfonylpiperidin-4-yl]methyl]ethanamide × 2
MG MAGNESIUM ION × 5
CL CHLORIDE ION × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;277 K;0.095 M HEPES pH=7.1-7.7 0.19 M CaCl2 5% glycerol 24-29% PEG400
|
分辨率 2.00 Å
R-free 0.227
|
|
9S2N
Ternary structure of 14-3-3s, CRAF V263A NS mutant phosphopeptide (pS259), and compound 23 (1083848)
提交 2025-07-21
|
构建体不同
突变/修饰不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 4
PDB 声明:tetrameric
|
链 H
255–264(10 aa)
链 S
255–264(10 aa)
|
突变:V263A
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点)
突变:V263A
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点)
|
WQI 2-chloranyl-~{N}-[[1-(4-iodophenyl)sulfonylpiperidin-4-yl]methyl]ethanamide × 2
MG MAGNESIUM ION × 6
CL CHLORIDE ION × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;277 K;0.095 M HEPES pH=7.1-7.7 0.19 M CaCl2 5% glycerol 24-29% PEG400
|
分辨率 1.85 Å
R-free 0.239
|
|
9S2O
Ternary structure of 14-3-3s, CRAF R256S NS mutant phosphopeptide (pS259), and compound 22 (1083853)
提交 2025-07-21
|
构建体不同
突变/修饰不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 4
PDB 声明:tetrameric
|
链 H
255–265(11 aa)
链 S
255–265(11 aa)
|
突变:R256S
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点)
突变:R256S
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点)
|
WPN ~{N}-[[1-(4-bromophenyl)sulfonylpiperidin-4-yl]methyl]-2-chloranyl-ethanamide × 2
MG MAGNESIUM ION × 6
CL CHLORIDE ION × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;277 K;0.095 M HEPES pH=7.1-7.7 0.19 M CaCl2 5% glycerol 24-29% PEG400
|
分辨率 1.80 Å
R-free 0.213
|
|
9S2P
Ternary structure of 14-3-3s, CRAF V263A NS mutant phosphopeptide (pS259), and compound 22 (1083853)
提交 2025-07-21
|
构建体不同
突变/修饰不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 4
PDB 声明:tetrameric
|
链 P
255–265(11 aa)
|
突变:V263A
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点)
|
CL CHLORIDE ION × 2
MG MAGNESIUM ION × 4
WPN ~{N}-[[1-(4-bromophenyl)sulfonylpiperidin-4-yl]methyl]-2-chloranyl-ethanamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;277 K;0.095 M HEPES pH=7.1-7.7 0.19 M CaCl2 5% glycerol 24-29% PEG400
|
分辨率 1.50 Å
R-free 0.197
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9YGS
Crystal structure of GMPPNP bound KRAS-Y71H in complex with RBD domain of CRAF(RAF1)
提交 2025-09-29
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 B
52–131(80 aa)
|
未记录
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GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1
MG MAGNESIUM ION × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;291.15 K;100 mM Potassium thiocyanate, 30% PEG monomethyl ether 2000.
|
分辨率 1.68 Å
R-free 0.233
|