SAXSdb — 8udt

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Fibroblast growth factor receptor 3

Homo sapiens

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白单体单体蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1）与蛋白拷贝数一致	链 A； UniProt 455–756	片段：kinase domain 突变：residues 572-585 replaced by Ser-Gly	MLT D-MALATE × 2 WGF 3-[(1-cyclopropyl-4,6-difluoro-1H-benzimidazol-5-yl)ethynyl]-1-[(3R,5R)-5-(methoxymethyl)-1-propanoylpyrrolidin-3-yl]-5-(methylamino)-1H-pyrazole-4-carboxamide × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.20 M DL-Malic acid pH 5.00, 18.00 % (w/v) PEG 4000	分辨率 2.83 Å R-free 0.274
2	蛋白单体单体蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1）与蛋白拷贝数一致	链 B； UniProt 455–756	片段：kinase domain 突变：residues 572-585 replaced by Ser-Gly	WGF 3-[(1-cyclopropyl-4,6-difluoro-1H-benzimidazol-5-yl)ethynyl]-1-[(3R,5R)-5-(methoxymethyl)-1-propanoylpyrrolidin-3-yl]-5-(methylamino)-1H-pyrazole-4-carboxamide × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.20 M DL-Malic acid pH 5.00, 18.00 % (w/v) PEG 4000	分辨率 2.83 Å R-free 0.274
3	蛋白单体单体蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1）与蛋白拷贝数一致	链 C； UniProt 455–756	片段：kinase domain 突变：residues 572-585 replaced by Ser-Gly	WGF 3-[(1-cyclopropyl-4,6-difluoro-1H-benzimidazol-5-yl)ethynyl]-1-[(3R,5R)-5-(methoxymethyl)-1-propanoylpyrrolidin-3-yl]-5-(methylamino)-1H-pyrazole-4-carboxamide × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.20 M DL-Malic acid pH 5.00, 18.00 % (w/v) PEG 4000	分辨率 2.83 Å R-free 0.274

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 8UDT	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
1RY7 Crystal Structure of the 3 Ig form of FGFR3c in complex with FGF1 提交 2003-12-19	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 33–365（333 aa）片段：FGFR-3c	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；Peg 4000, glycerol, MPD, cadmium chloride, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 3.20 Å R-free 0.341
2LZL FGFR3tm 提交 2012-10-04	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 357–399（43 aa）片段：UNP residues 357-399 链 B 357–399（43 aa）片段：UNP residues 357-399	未记录	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 5.7；313 K；离子强度（mmCIF原始值）50；压力 ambient NMR样品组成 0.75 mM [U-99% 13C; U-99% 15N] FGFR3tm, 0.75 mM FGFR3tm, 88 mM [U-99% 2H] DPC, 10 mM [U-99% 2H] SDS, 0.3 mM sodium azide, 6 mM TCEP, 5 mM citric acid, 15 mM Na2HPO4, 95% H2O/5% D2O \| 95% H2O/5% D2O	分辨率未提供
4K33 Crystal Structure of FGF Receptor 3 (FGFR3) Kinase Domain Harboring the K650E Mutation, a Gain-of-Function Mutation Responsible for Thanatophoric Dysplasia Type II and Spermatocytic Seminoma 提交 2013-04-10	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 449–759（311 aa）片段：Human FGF Receptor 3 Kinase Domain	突变：C482A, C582S, K650E	ACP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID ADENYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；298 K；100mM HEPES pH7.5, 19% PEG 4000, 4% C4H10O2, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K	分辨率 2.34 Å R-free 0.228
6LVM Crystal structure of FGFR3 in complex with pyrimidine derivative 提交 2020-02-04	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 472–759（288 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	EVR 2-[[5-[2-(3,5-dimethoxyphenyl)ethyl]-2-[[3-methoxy-4-[4-(4-methylpiperazin-1-yl)piperidin-1-yl]phenyl]amino]pyrimidin-4-yl]amino]-N-ethyl-benzenesulfonamide × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5；296 K；Citric Acid, PEG 8000	分辨率 2.53 Å R-free 0.279
6PNX Crystal Structure of an Asymmetric Dimer of FGF Receptor 3 Kinases Trapped in A-loop Tyrosine Transphosphorylation Reaction 提交 2019-07-03	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 451–759（309 aa）链 B 451–759（309 aa）	突变：C482A, C582S, R669E 突变：C482A, C582S, R669E	ACP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID ADENYLATE ESTER × 2 SO4 SULFATE ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；292 K；0.1 M Hepes, pH 7.5, and 1.8 M (NH4)2SO4	分辨率 2.20 Å R-free 0.230
7DHL Crystal structure of FGFR3 in complex with pyrimidine derivative 提交 2020-11-16	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 472–759（288 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	H6X 5-[2-(3,5-dimethoxyphenyl)ethyl]-N-[3-methoxy-4-[4-(4-methylpiperazin-1-yl)piperidin-1-yl]phenyl]pyrimidin-2-amine × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5；293 K；Citric Acid, Ammonium dihydrogen phosphate, PEG 3350	分辨率 2.57 Å R-free 0.254
7YSU Cryo-EM Structure of FGF23-FGFR3c-aKlotho-HS Quaternary Complex 提交 2022-08-13	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 C 148–358（211 aa）链 E 148–358（211 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 1 CU COPPER (II) ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.20 Å
8UDU The X-RAY co-crystal structure of human FGFR3 and Compound 17 提交 2023-09-29	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 455–756（302 aa）片段：kinase domain	突变：residues 572-585 replaced by Ser-Gly	CL CHLORIDE ION × 1 WIQ 3-[(6-chloro-1-cyclopropyl-1H-benzimidazol-5-yl)ethynyl]-1-[(3S,5S)-5-(methoxymethyl)-1-(prop-2-enoyl)pyrrolidin-3-yl]-5-(methylamino)-1H-pyrazole-4-carboxamide × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.10 M Magnesium Chloride, 0.10 M TRIS/HCl pH 8.10, 0.20 M Sodium Chloride, 20.00 % (w/v) PEG 3350	分辨率 1.74 Å R-free 0.256
8UDU The X-RAY co-crystal structure of human FGFR3 and Compound 17 提交 2023-09-29	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 455–756（302 aa）片段：kinase domain	突变：residues 572-585 replaced by Ser-Gly	CL CHLORIDE ION × 1 WIQ 3-[(6-chloro-1-cyclopropyl-1H-benzimidazol-5-yl)ethynyl]-1-[(3S,5S)-5-(methoxymethyl)-1-(prop-2-enoyl)pyrrolidin-3-yl]-5-(methylamino)-1H-pyrazole-4-carboxamide × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.10 M Magnesium Chloride, 0.10 M TRIS/HCl pH 8.10, 0.20 M Sodium Chloride, 20.00 % (w/v) PEG 3350	分辨率 1.74 Å R-free 0.256
8UDV The X-RAY co-crystal structure of human FGFR3 V555M and Compound 17 提交 2023-09-29	突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 455–756（302 aa）片段：kinase domain	突变：V555M and residues 572-585 (Uniprot numbering) replaced by Ser-Gly	SO4 SULFATE ION × 3 WIQ 3-[(6-chloro-1-cyclopropyl-1H-benzimidazol-5-yl)ethynyl]-1-[(3S,5S)-5-(methoxymethyl)-1-(prop-2-enoyl)pyrrolidin-3-yl]-5-(methylamino)-1H-pyrazole-4-carboxamide × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.10 M BIS-TRIS/HCl pH 6.50, 0.20 M (NH4)2SO4, 25.00 % (w/v) PEG 3350	分辨率 2.35 Å R-free 0.261
8UDV The X-RAY co-crystal structure of human FGFR3 V555M and Compound 17 提交 2023-09-29	突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 455–756（302 aa）片段：kinase domain	突变：V555M and residues 572-585 (Uniprot numbering) replaced by Ser-Gly	SO4 SULFATE ION × 2 WIQ 3-[(6-chloro-1-cyclopropyl-1H-benzimidazol-5-yl)ethynyl]-1-[(3S,5S)-5-(methoxymethyl)-1-(prop-2-enoyl)pyrrolidin-3-yl]-5-(methylamino)-1H-pyrazole-4-carboxamide × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.10 M BIS-TRIS/HCl pH 6.50, 0.20 M (NH4)2SO4, 25.00 % (w/v) PEG 3350	分辨率 2.35 Å R-free 0.261
8UDV The X-RAY co-crystal structure of human FGFR3 V555M and Compound 17 提交 2023-09-29	突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 C 455–756（302 aa）片段：kinase domain	突变：V555M and residues 572-585 (Uniprot numbering) replaced by Ser-Gly	SO4 SULFATE ION × 2 WIQ 3-[(6-chloro-1-cyclopropyl-1H-benzimidazol-5-yl)ethynyl]-1-[(3S,5S)-5-(methoxymethyl)-1-(prop-2-enoyl)pyrrolidin-3-yl]-5-(methylamino)-1H-pyrazole-4-carboxamide × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.10 M BIS-TRIS/HCl pH 6.50, 0.20 M (NH4)2SO4, 25.00 % (w/v) PEG 3350	分辨率 2.35 Å R-free 0.261
9CD7 FGFR3 Kinase Domain with Inhibitor TYRA-300 提交 2024-06-24	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 448–759（312 aa）	突变：C482A, C582S, K650E	A1AV2 (3P)-5-[(1R)-1-(3,5-dichloropyridin-4-yl)ethoxy]-3-{6-[6-(methanesulfonyl)-2,6-diazaspiro[3.3]heptan-2-yl]pyridin-3-yl}-1H-indazole × 1 GOL GLYCEROL × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.25；291 K；17% PEG Smear Medium 10% Tacsimate pH 5.25 0.2M Ammonium Sulfate	分辨率 2.53 Å R-free 0.267
9CD7 FGFR3 Kinase Domain with Inhibitor TYRA-300 提交 2024-06-24	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 448–759（312 aa）	突变：C482A, C582S, K650E	A1AV2 (3P)-5-[(1R)-1-(3,5-dichloropyridin-4-yl)ethoxy]-3-{6-[6-(methanesulfonyl)-2,6-diazaspiro[3.3]heptan-2-yl]pyridin-3-yl}-1H-indazole × 1 GOL GLYCEROL × 6 SO4 SULFATE ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.25；291 K；17% PEG Smear Medium 10% Tacsimate pH 5.25 0.2M Ammonium Sulfate	分辨率 2.53 Å R-free 0.267
9CD7 FGFR3 Kinase Domain with Inhibitor TYRA-300 提交 2024-06-24	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 C 448–759（312 aa）	突变：C482A, C582S, K650E	A1AV2 (3P)-5-[(1R)-1-(3,5-dichloropyridin-4-yl)ethoxy]-3-{6-[6-(methanesulfonyl)-2,6-diazaspiro[3.3]heptan-2-yl]pyridin-3-yl}-1H-indazole × 1 GOL GLYCEROL × 6 SO4 SULFATE ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.25；291 K；17% PEG Smear Medium 10% Tacsimate pH 5.25 0.2M Ammonium Sulfate	分辨率 2.53 Å R-free 0.267
9D1X Crystal structure of FGFR3 bound to indazole inhibitor 提交 2024-08-08	突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 455–756（302 aa）片段：kinase domain	突变：P572S, P573G	A1A6M (3P)-N-(2,6-dimethylphenyl)-6-methoxy-3-(1-methyl-1H-pyrazol-4-yl)-1H-indazole-5-carboxamide × 1 CL CHLORIDE ION × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.1；293 K；0.2 M magnesium chloride, 0.3 M sodium chloride, 23% (w/v) PEG 3350, 0.1 M Tris-HCl pH 8.1	分辨率 1.60 Å R-free 0.190
9EKO A chimeric hybrid protein fused with the FGFR3 Transmembrane Domain 提交 2024-12-03	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 371–399（29 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 2.90 Å R-free 0.287
9KFU Human FGFR3 in complex with inhibitor F1 提交 2024-11-07	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 448–756（309 aa）	未记录	A1L5T (7~{S})-2-azanyl-7-(4-fluorophenyl)-6,7-dihydro-4~{H}-[1,3]thiazolo[4,5-b]pyridin-5-one × 1 SO4 SULFATE ION × 4 CO COBALT (II) ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293.15 K；25mM HEPES pH7.5, 1.8-2.0 M LiSO4, 10 Mm CoCl2	分辨率 1.40 Å R-free 0.251
9VM9 Crystal structure of FGFR3 in complex with 10s 提交 2025-06-27	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 455–756（302 aa）	未记录	A1ESW ~{N}-[1-methyl-3-[2-[[5-methyl-1-(2-morpholin-4-ylethyl)pyrazol-4-yl]amino]pyrimidin-4-yl]indol-6-yl]propanamide × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；25% (w/v) PEG 3350, 0.2 M MgCl2, and 0.1 M HEPES, pH 7.5	分辨率 2.65 Å R-free 0.312
9VM9 Crystal structure of FGFR3 in complex with 10s 提交 2025-06-27	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 455–756（302 aa）	未记录	A1ESW ~{N}-[1-methyl-3-[2-[[5-methyl-1-(2-morpholin-4-ylethyl)pyrazol-4-yl]amino]pyrimidin-4-yl]indol-6-yl]propanamide × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；25% (w/v) PEG 3350, 0.2 M MgCl2, and 0.1 M HEPES, pH 7.5	分辨率 2.65 Å R-free 0.312
9VM9 Crystal structure of FGFR3 in complex with 10s 提交 2025-06-27	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 C 455–756（302 aa）	未记录	A1ESW ~{N}-[1-methyl-3-[2-[[5-methyl-1-(2-morpholin-4-ylethyl)pyrazol-4-yl]amino]pyrimidin-4-yl]indol-6-yl]propanamide × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；25% (w/v) PEG 3350, 0.2 M MgCl2, and 0.1 M HEPES, pH 7.5	分辨率 2.65 Å R-free 0.312
9VM9 Crystal structure of FGFR3 in complex with 10s 提交 2025-06-27	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 4 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 D 455–756（302 aa）	未记录	A1ESW ~{N}-[1-methyl-3-[2-[[5-methyl-1-(2-morpholin-4-ylethyl)pyrazol-4-yl]amino]pyrimidin-4-yl]indol-6-yl]propanamide × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 GOL GLYCEROL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；25% (w/v) PEG 3350, 0.2 M MgCl2, and 0.1 M HEPES, pH 7.5	分辨率 2.65 Å R-free 0.312
9VMB The X-RAY co-crystal structure of human FGFR3 and Compound 10t 提交 2025-06-27	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 455–756（302 aa）	未记录	A1ESX ~{N}-[1-methyl-3-[2-[[3-methyl-1-(2-morpholin-4-ylethyl)pyrazol-4-yl]amino]pyrimidin-4-yl]indol-6-yl]propanamide × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 GOL GLYCEROL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；25% (w/v) PEG 3350, 0.2 M MgCl2, and 0.1 M HEPES, pH 7.5	分辨率 1.97 Å R-free 0.237
9VMB The X-RAY co-crystal structure of human FGFR3 and Compound 10t 提交 2025-06-27	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 455–756（302 aa）	未记录	A1ESX ~{N}-[1-methyl-3-[2-[[3-methyl-1-(2-morpholin-4-ylethyl)pyrazol-4-yl]amino]pyrimidin-4-yl]indol-6-yl]propanamide × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；25% (w/v) PEG 3350, 0.2 M MgCl2, and 0.1 M HEPES, pH 7.5	分辨率 1.97 Å R-free 0.237
9VMB The X-RAY co-crystal structure of human FGFR3 and Compound 10t 提交 2025-06-27	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 C 455–756（302 aa）	未记录	A1ESX ~{N}-[1-methyl-3-[2-[[3-methyl-1-(2-morpholin-4-ylethyl)pyrazol-4-yl]amino]pyrimidin-4-yl]indol-6-yl]propanamide × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 GOL GLYCEROL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；25% (w/v) PEG 3350, 0.2 M MgCl2, and 0.1 M HEPES, pH 7.5	分辨率 1.97 Å R-free 0.237
9VMB The X-RAY co-crystal structure of human FGFR3 and Compound 10t 提交 2025-06-27	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 4 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 D 455–756（302 aa）	未记录	A1ESX ~{N}-[1-methyl-3-[2-[[3-methyl-1-(2-morpholin-4-ylethyl)pyrazol-4-yl]amino]pyrimidin-4-yl]indol-6-yl]propanamide × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 GOL GLYCEROL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；25% (w/v) PEG 3350, 0.2 M MgCl2, and 0.1 M HEPES, pH 7.5	分辨率 1.97 Å R-free 0.237

共 15 个其他 PDB 条目、26 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	FGFR3_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 2–291； UniProt 455–756 作者链 B； PDB构建体 2–291； UniProt 455–756 作者链 C； PDB构建体 2–291； UniProt 455–756

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	8udt
沉积日期 deposition_date	2023-09-29
结构标题 title	The X-RAY co-crystal structure of human FGFR3 and KIN-3248
关键词 keywords	;FGFR inhibitor, Covalent Drug, KIN-3248, alteration, mutation, structure-based drug design, kinase inhibitor, signaling, proliferation, TRANSFERASE, TRANSFERASE-INHIBITOR complex ;; TRANSFERASE/INHIBITOR
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier	35.89 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron	35.51 Å
零角强度 I(0) i0	146854000.00
分子量 molecular_weight	98364.0 kDa
排除体积 excluded_volume	123690 Å³
包络体积 envelope_volume	165780 Å³
水化壳体积 shell_volume	39911 Å³
包络直径 envelope_diameter	123.2 Å
壳层 Rg shell_rg	40.70 Å
包络 Rg envelope_rg	35.19 Å
形状 Rg shape_rg	35.50 Å
总 Rg total_rg	35.92 Å
总原子数 total_atoms	13734
残基数 n_residues	853
球谐函数阶数 n_harmonics	20
q 范围 q_range	— – 0.5000 Å⁻¹
数据点数 n_points	101
壳层类型 shell_type	directional
溶剂电子密度 solvent_density	0.3340 e/Å³
壳层衬度 contrast_shell	0.0300 e/Å³
CRYSOL 版本 crysol_version	4.1.3

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4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax	117.5 Å
Rg (实空间) rg_real	35.94 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error	1.07 Å
I(0) (实空间) i0_real	1.4690e+08
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error	2.5320e+06
Rg (倒空间) rg_reciprocal	35.92 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal	146900000.0000
解质量估计 total_estimate	0.8174
解质量评级 solution_quality	GOOD a GOOD solution
P(r) 峰数 n_peaks	1
主峰位置 r_peak_primary	32.0 Å
偏度 Skewness skewness	0.266
峰度 Kurtosis kurtosis	-0.685
角度范围 angular_range	— – 0.2200 Å⁻¹
当前正则化参数 α current_alpha	0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha	51720000.0000
实空间数据点数 n_real_points	45
GNOM 版本 gnom_version	4.1.3
质量判据 quality_criteria	AN1: 0.000; Oscil: 0.903; Stabil: 1.000; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.913; Smooth: 0.000

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5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

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6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (4)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	Fibroblast growth factor receptor 3
分子量 formula_weight	33742.0 kDa
EC 编号 ec_number	2.7.10.1
突变 mutation	residues 572-585 replaced by Ser-Gly
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	3

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A,B,C
原子数 atom_count	13854

MSELELPADPKWELSRARLTLGKPLGEGCFGQVVMAEAIGIDKDRAAKPVTVAVKMLKDDATDKDLSDLVSEMEMMKMIGKHKNIINLLGACTQGGPLYVLVEYAAKGNLREFLRARRSGEEQLTFKDLVSCAYQVARGMEYLASQKCIHRDLAARNVLVTEDNVMKIADFGLARDVHNLDYYKKTTNGRLPVKWMAPEALFDRVYTHQSDVWSFGVLLWEIFTLGGSPYPGIPVEELFKLLKEGHRMDKPANCTHDLYMIMRECWHAAPSQRPTFKQLVEDLDRVLTVTSHHHHHH

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Spodoptera frugiperda

实体 2 Entity 2 non-polymer

描述 description	D-MALATE
分子量 formula_weight	134.1 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	2

实体 3 Entity 3 non-polymer

描述 description	;3-[(1-cyclopropyl-4,6-difluoro-1H-benzimidazol-5-yl)ethynyl]-1-[(3R,5R)-5-(methoxymethyl)-1-propanoylpyrrolidin-3-yl]-5-(methylamino)-1H-pyrazole-4-carboxamide ;
分子量 formula_weight	525.5 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	3

实体 4 Entity 4 water

描述 description	water
分子量 formula_weight	18.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	120

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8. 引用文献 (1)

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晶胞边长 a length_a	89.980 Å
晶胞边长 b length_b	160.440 Å
晶胞边长 c length_c	179.163 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	24

空间群 space_group	I 2 2 2
空间群编号 int_tables_number	23
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	2.829 Å
最低分辨率 resolution_low	33.290 Å
R 因子 r_factor	0.2629
R_work r_work	0.2623
R_free r_free	0.2740

fit	/app/data/saxs_computation/ud/8udt/8udt.fit
pddf	/app/data/pr_computation/ud/8udt/8udt.pr.out
profile	/app/data/saxs_computation/ud/8udt/8udt.dat

The X-RAY co-crystal structure of human FGFR3 and KIN-3248

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Fibroblast growth factor receptor 3

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction