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8w9b

CryoEM structure of human PI3K-alpha (P85/P110-H1047R) with QR-8557 binding at an allosteric site

Method: ELECTRON MICROSCOPY Dmax: 120.5 Å Quality: GOOD
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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit alpha isoform

Homo sapiens

UniProt P42336

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白拷贝数一致 链 A； UniProt 1–1068 未记录 Phosphatidylinositol 3-kinase regulatory subunit alpha × 1 （P27986） UJ3 1-[(1S)-1-(5-fluoranyl-3-methyl-1-benzofuran-2-yl)-2-methyl-propyl]-3-(1-oxidanylidene-2,3-dihydroisoindol-5-yl)urea × 1 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 8 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE 分辨率 3.00 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 8W9B Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
2ENQ Solution structure of the C2 domain from human PI3-kinase p110 subunit alpha 提交 2007-03-28 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 331–481（151 aa） 片段：C2 domain
未记录 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 7；293 K；离子强度（mmCIF原始值）120mM；压力 ambient
NMR样品组成 0.77mM 13C, 15N-labeled protein; 20mM d-Tris-HCl(pH7.0), 100mM NaCl; 1mM d-DTT; 0.02% NaN3; 10% D2O; 90% H2O | 10% D2O; 90% H2O
分辨率未提供
2RD0 Structure of a human p110alpha/p85alpha complex 提交 2007-09-20 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–1068（1068 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 7；293 K；Sodium Formate, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, temperature 293K
分辨率 3.05 Å R-free 0.323
3HHM Crystal structure of p110alpha H1047R mutant in complex with niSH2 of p85alpha and the drug wortmannin 提交 2009-05-15 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–1068（1068 aa）
突变：H1047R KWT (1S,6BR,9AS,11R,11BR)-9A,11B-DIMETHYL-1-[(METHYLOXY)METHYL]-3,6,9-TRIOXO-1,6,6B,7,8,9,9A,10,11,11B-DECAHYDRO-3H-FURO[4, 3,2-DE]INDENO[4,5-H][2]BENZOPYRAN-11-YL ACETATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.8；298 K；Na formate, pH 6.8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 2.80 Å R-free 0.307
3HIZ Crystal structure of p110alpha H1047R mutant in complex with niSH2 of p85alpha 提交 2009-05-20 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–1068（1068 aa）
突变：H1047R 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.8；298 K；Na formate, pH 6.8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 3.30 Å R-free 0.333
3ZIM Discovery of a potent and isoform-selective targeted covalent inhibitor of the lipid kinase PI3Kalpha 提交 2013-01-09 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 107–1046（940 aa） 片段：N-TERMINAL TRUNCATED, RESIDUES 107-1046
未记录 KKR 1-[4-[[2-(1H-indazol-4-yl)-4-morpholin-4-yl-thieno[3,2-d]pyrimidin-6-yl]methyl]piperazin-1-yl]-6-methyl-hept-5-ene-1,4- dione × 1 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 2.85 Å R-free 0.278
4JPS Co-crystal Structures of the Lipid Kinase PI3K alpha with Pan and Isoform Selective Inhibitors 提交 2013-03-19 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–1068（1068 aa）
突变：M232K, L233K SCN THIOCYANATE ION × 1 1LT (2S)-N~1~-{4-methyl-5-[2-(1,1,1-trifluoro-2-methylpropan-2-yl)pyridin-4-yl]-1,3-thiazol-2-yl}pyrrolidine-1,2-dicarboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；303 K；12% PEG 3350, 120MM KSCN, 6uL protein to 4uL well with streak seeding at 18C , pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 303K
分辨率 2.20 Å R-free 0.228
4L1B Crystal Structure of p110alpha complexed with niSH2 of p85alpha 提交 2013-06-03 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–1068（1068 aa）
未记录 SO4 SULFATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；291 K；0.15 M Lithium sulfate, 0.1 M Tris PH 8.5, 30%(W/V) PEG 1000MME, vapor diffusion, hanging drop, temperature 291K
分辨率 2.59 Å R-free 0.274
4L23 Crystal Structure of p110alpha complexed with niSH2 of p85alpha and PI-103 提交 2013-06-04 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–1068（1068 aa）
未记录 X6K 3-(4-MORPHOLIN-4-YLPYRIDO[3',2':4,5]FURO[3,2-D]PYRIMIDIN-2-YL)PHENOL × 1 SO4 SULFATE ION × 2 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；291 K；0.15 M Lithium sulfate, 0.1 M Tris PH 8.5, 30%(W/V) PEG 1000MME, vapor diffusion, hanging drop, temperature 291K
分辨率 2.50 Å R-free 0.273
4L2Y Crystal Structure of p110alpha complexed with niSH2 of p85alpha and compound 9d 提交 2013-06-05 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–1068（1068 aa）
未记录 XXK 3-amino-5-[4-(morpholin-4-yl)pyrido[3',2':4,5]furo[3,2-d]pyrimidin-2-yl]phenol × 1 SO4 SULFATE ION × 2 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；291 K；0.15 M Lithium sulfate, 0.1 M Tris PH 8.5, 30%(W/V) PEG 1000MME, vapor diffusion, hanging drop, temperature 291K
分辨率 2.80 Å R-free 0.271
4OVU Crystal Structure of p110alpha in complex with niSH2 of p85alpha 提交 2014-01-14 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–1068（1068 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.8；298 K；NaFormate
分辨率 2.96 Å R-free 0.272
4OVV Crystal Structure of PI3Kalpha in complex with diC4-PIP2 提交 2014-01-14 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–1068（1068 aa）
未记录 PBU (2R)-3-{[(R)-HYDROXY{[(1R,2R,3S,4R,5R,6S)-2,3,6-TRIHYDROXY-4,5-BIS(PHOSPHONOOXY)CYCLOHEXYL]OXY}PHOSPHORYL]OXY}PROPANE-1 ,2-DIYL DIBUTANOATE × 2 PO4 PHOSPHATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.8；298 K；NaFormate
分辨率 3.50 Å R-free 0.339
4TUU Isolated p110a subunit of PI3Ka provides a platform for structure-based drug design 提交 2014-06-24 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 105–1048（944 aa） 片段：UNP residues 105-1048
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；293.15 K；PEG 6K, 0.6 M Na Formate, 0.1M CHES, pH 9.0-10 and 5 mM TCEP, pH 7.0 at a temperature of 20 degC.
分辨率 2.64 Å R-free 0.245
4TV3 Isolated p110a subunit of PI3Ka provides a platform for structure-based drug design 提交 2014-06-25 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 105–1048（944 aa） 片段：UNP residues 105-1048
未记录 ML9 2-amino-8-[trans-4-(2-hydroxyethoxy)cyclohexyl]-6-(6-methoxypyridin-3-yl)-4-methylpyrido[2,3-d]pyrimidin-7(8H)-one × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；293.15 K；PEG 6K, 0.6 M Na Formate, 0.1M CHES, pH 9.0-10 and 5 mM TCEP, pH 7.0 at a temperature of 20 degC.
分辨率 2.85 Å R-free 0.250
4WAF Crystal Structure of a novel tetrahydropyrazolo[1,5-a]pyrazine in an engineered PI3K alpha 提交 2014-08-29 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 2–1068（1067 aa）
突变：M232K, L233K, I800M, F930V 3K6 N,N-dimethyl-4-[(6R)-6-methyl-5-(1H-pyrrolo[2,3-b]pyridin-4-yl)-4,5,6,7-tetrahydropyrazolo[1,5-a]pyrazin-3-yl]benzenesulfonamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；303.15 K；12% PEG 3350, 120mM potassium thiocyanate
分辨率 2.39 Å R-free 0.247
4YKN Pi3K alpha lipid kinase with Active Site Inhibitor 提交 2015-03-04 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 2–1068（1067 aa） 片段：UNP P27986 residues 318-615, LINKER (GSPGISGGGGG), P42336 residues 2-1068
未记录 4EL 3-(6-methoxypyridin-3-yl)-5-[({4-[(5-methyl-1,3,4-thiadiazol-2-yl)sulfamoyl]phenyl}amino)methyl]benzoic acid × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；ethylenene glycol, PIP2
分辨率 2.90 Å R-free 0.247
4ZOP Co-crystal Structure of Lipid Kinase PI3K alpha with a selective phosphatidylinositol-3 kinase alpha inhibitor 提交 2015-05-06 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–1068（1068 aa）
突变：M232K, L233K 4Q2 (2S,3R)-N~1~-(8-tert-butyl-4,5-dihydro[1,3]thiazolo[4,5-h]quinazolin-2-yl)-3-methylpyrrolidine-1,2-dicarboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；303 K；12% PEG 3350, 120MM KSCN, 6UL PROTEIN TO 4UL WELL WITH STREAK SEEDING AT 18C , PH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
分辨率 2.62 Å R-free 0.258
5DXH p110alpha/p85alpha with compound 5 提交 2015-09-23 构建体不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 2–1068（1067 aa）
未记录 5H2 methyl {2-[4-(2-chlorophenyl)-4H-1,2,4-triazol-3-yl]-4,5-dihydrothieno[3,2-d][1]benzoxepin-8-yl}carbamate × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；PEG 20000
分辨率 3.00 Å R-free 0.218
5DXH p110alpha/p85alpha with compound 5 提交 2015-09-23 构建体不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 D 2–1068（1067 aa）
未记录 5H2 methyl {2-[4-(2-chlorophenyl)-4H-1,2,4-triazol-3-yl]-4,5-dihydrothieno[3,2-d][1]benzoxepin-8-yl}carbamate × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；PEG 20000
分辨率 3.00 Å R-free 0.218
5DXT p110alpha with GDC-0326 提交 2015-09-23 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 107–1068（962 aa） 片段：PI3-KINASE P110 ALPHA, UNP residues 107-1068
未记录 5H5 (2S)-2-({2-[1-(propan-2-yl)-1H-1,2,4-triazol-5-yl]-5,6-dihydroimidazo[1,2-d][1,4]benzoxazepin-9-yl}oxy)propanamide × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；PEG 20000
分辨率 2.25 Å R-free 0.262
5FI4 Discovery of imidazo[1,2-a]-pyridine inhibitors of pan-PI3 kinases that are efficacious in a mouse xenograft model 提交 2015-12-22 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–1068（1068 aa）
突变：M232K L233K GOL GLYCEROL × 1 5XV ~{N}-[6-[5-azanyl-6-[(2~{S})-1,1,1-tris(fluoranyl)propan-2-yl]oxy-pyrazin-2-yl]imidazo[1,2-a]pyridin-2-yl]ethanamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；303.15 K；12.5% PEG 3350, 125 mM KSCN Drops were 5uL protein: 3uL well solutions and streak seeded.
分辨率 2.50 Å R-free 0.245
5ITD Crystal structure of PI3K alpha with PI3K delta inhibitor 提交 2016-03-16 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–1068（1068 aa）
突变：M232K, L233K 6CY 5-{4-[3-(4-acetylpiperazine-1-carbonyl)phenyl]quinazolin-6-yl}-2-methoxypyridine-3-carbonitrile × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.2；303.15 K；3 uL of protein was mixed with 5 uL of well solution containing 12% PEG 3350 and 120 mM potassium thiocyanate
分辨率 3.02 Å R-free 0.241
5SW8 Crystal structure of PI3Kalpha in complex with fragments 7 and 11 提交 2016-08-08 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–1068（1068 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） EPE 4-(2-HYDROXYETHYL)-1-PIPERAZINE ETHANESULFONIC ACID × 1 70S 2H-indazol-5-amine × 1 FB1 2-CHLOROBENZENESULFONAMIDE × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；298 K；NaFormate
分辨率 3.30 Å R-free 0.298
5SWG Crystal Structure of PI3Kalpha in complex with fragments 5 and 21 提交 2016-08-08 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–1068（1068 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） AX7 1H-benzimidazol-2-amine × 1 CAQ CATECHOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；298 K；NaFormate
分辨率 3.11 Å R-free 0.262
5SWO Crystal Structure of PI3Kalpha in complex with fragments 4 and 19 提交 2016-08-08 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–1068（1068 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） CL CHLORIDE ION × 1 70T 2-methyl-5-nitro-1H-indole × 1 2ZV 4-methyl-3-nitropyridin-2-amine × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；298 K；NaFormate
分辨率 3.50 Å R-free 0.274
5SWP Crystal Structure of PI3Kalpha in complex with fragments 6 and 24 提交 2016-08-08 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–1068（1068 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 70W tert-butyl 4-aminopiperidine-1-carboxylate × 2 70V 2-methylcyclohexane-1,3-dione × 2 CL CHLORIDE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；298 K；NaFormate
分辨率 3.41 Å R-free 0.296
5SWR Crystal Structure of PI3Kalpha in complex with fragments 20 and 26 提交 2016-08-08 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–1068（1068 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 718 6-hydroxy-3,4-dihydronaphthalen-1(2H)-one × 1 CL CHLORIDE ION × 2 SAL 2-HYDROXYBENZOIC ACID × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；298 K；NaFormate
分辨率 3.31 Å R-free 0.273
5SWT Crystal Structure of PI3Kalpha in complex with fragments 17 and 27 提交 2016-08-08 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–1068（1068 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 71A pyridin-3-ol × 1 71B 3-fluoro-4-methoxyaniline × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；298 K；NaFormate
分辨率 3.49 Å R-free 0.285
5SX8 Crystal Structure of PI3Kalpha in complex with fragments 12 and 15 提交 2016-08-09 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–1068（1068 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 71M 6-methylpyridin-2-amine × 2 LUZ pteridine-2,4(1H,3H)-dione × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；298 K；NaFormate
分辨率 3.47 Å R-free 0.276
5SX9 Crystal Structure of PI3Kalpha in complex with fragment 14 提交 2016-08-09 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–1068（1068 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 71L 4,6-dimethylpyridin-2-amine × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；298 K；NaFormate
分辨率 3.52 Å R-free 0.277
5SXA Crystal Structure of PI3Kalpha in complex with fragment 10 提交 2016-08-09 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–1068（1068 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 71N 2-(trifluoromethyl)-1H-benzimidazol-5-amine × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；298 K；NaFormate
分辨率 3.35 Å R-free 0.275
5SXB Crystal Structure of PI3Kalpha in complex with fragment 23 提交 2016-08-09 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–1068（1068 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） SOA ISATOIC ANHYDRIDE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；298 K；NaFormate
分辨率 3.30 Å R-free 0.278
5SXC Crystal Structure of PI3Kalpha in complex with fragment 8 提交 2016-08-09 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–1068（1068 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） URF 5-FLUOROURACIL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；298 K；NaFormate
分辨率 3.55 Å R-free 0.268
5SXD Crystal Structure of PI3Kalpha in complex with fragment 22 提交 2016-08-09 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–1068（1068 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 71F 2-methoxybenzoic acid × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；298 K；NaFormate
分辨率 3.50 Å R-free 0.276
5SXE Crystal Structure of PI3Kalpha in complex with fragments 19 and 28 提交 2016-08-09 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–1068（1068 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 71G 3-aminobenzonitrile × 1 ES3 4-bromo-1H-imidazole × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；298 K；NaFormate
分辨率 3.51 Å R-free 0.271
5SXF Crystal Structure of PI3Kalpha in complex with fragment 9 提交 2016-08-09 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–1068（1068 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） HPP HYDROXYPHENYL PROPIONIC ACID × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；298 K；NaFormate
分辨率 3.46 Å R-free 0.267
5SXI Crystal Structure of PI3Kalpha in complex with fragment 13 提交 2016-08-09 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–1068（1068 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 71J trans-cyclohexane-1,4-diol × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；298 K；NaFormate
分辨率 3.40 Å R-free 0.279
5SXJ Crystal Structure of PI3Kalpha in complex with fragment 29 提交 2016-08-09 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–1068（1068 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） BHO BENZHYDROXAMIC ACID × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；298 K；NaFormate
分辨率 3.42 Å R-free 0.279
5SXK Crystal Structure of PI3Kalpha in complex with fragment 18 提交 2016-08-09 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–1068（1068 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 71K 2-methylbenzene-1,3-diamine × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；298 K；NaFormate
分辨率 3.55 Å R-free 0.278
5UBR CRYSTAL STRUCTURE OF PI3K ALPHA IN COMPLEX WITH A 7-(3-(PIPERAZIN-1-YL)PHENYL)PYRROLO[2,1-F][1,2,4] TRIAZIN-4-AMINE DERIVIATINE 提交 2016-12-21 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 107–1050（944 aa）
未记录 85S 1-[4-(3-{4-amino-5-[1-(oxan-4-yl)-1H-pyrazol-5-yl]pyrrolo[2,1-f][1,2,4]triazin-7-yl}phenyl)piperazin-1-yl]ethan-1-one × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；293 K；NULL
分辨率 2.40 Å R-free 0.246
5UK8 The co-structure of (R)-4-(6-(1-(cyclopropylsulfonyl)cyclopropyl)-2-(1H-indol-4-yl)pyrimidin-4-yl)-3-methylmorpholine and a rationally designed PI3K-alpha mutant that mimics ATR 提交 2017-01-20 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–1068（1068 aa）
突变：M232K,L233K, I800M, F930V, R770E, W780K, E798I, V850W 8DV (R)-4-(6-(1-(cyclopropylsulfonyl)cyclopropyl)-2-(1H-indol-4-yl)pyrimidin-4-yl)-3-methylmorpholine × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.2；303.15 K；3 UL OF PROTEIN WAS MIXED WITH 5 UL OF WELL SOLUTION CONTAINING 12% PEG 3350 AND 120 MM POTASSIUM THIOCYANATE, PH 7.2, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, TEMPERATURE 303.15K
分辨率 2.50 Å R-free 0.240
5UKJ The co-structure of N,N-dimethyl-4-[(6R)-6-methyl-5-(1H-pyrrolo[2,3- b]pyridin-4-yl)-4,5,6,7-tetrahydropyrazolo[1,5- a]pyrazin-3-yl]benzenesulfonamide and a rationally designed PI3K-alpha mutant that mimics ATR 提交 2017-01-23 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–1068（1068 aa） 片段：UNP residues
突变：M232K L233K I800M F930V W780K V850W R770E E798I 3K6 N,N-dimethyl-4-[(6R)-6-methyl-5-(1H-pyrrolo[2,3-b]pyridin-4-yl)-4,5,6,7-tetrahydropyrazolo[1,5-a]pyrazin-3-yl]benzenesulfonamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.2；303.15 K；3 UL OF PROTEIN WAS MIXED WITH 5 UL OF WELL SOLUTION CONTAINING 12% PEG 3350 AND 120 MM POTASSIUM THIOCYANATE, PH 7.2, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP,
分辨率 2.80 Å R-free 0.252
5UL1 The co-structure of 3-amino-6-(4-((1-(dimethylamino)propan-2-yl)sulfonyl)phenyl)-N-phenylpyrazine-2-carboxamide and a rationally designed PI3K-alpha mutant that mimics ATR 提交 2017-01-23 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–1068（1068 aa）
突变：M232K L233K I800M F930V W780K V850W R770E E798I 8DY 3-amino-6-(4-{[(2S)-1-(dimethylamino)propan-2-yl]sulfonyl}phenyl)-N-phenylpyrazine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.2；303.15 K；3 UL OF PROTEIN WAS MIXED WITH 5 UL OF WELL SOLUTION CONTAINING 12% PEG 3350 AND 120 MM POTASSIUM THIOCYANATE, PH 7.2, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
分辨率 3.00 Å R-free 0.260
5XGH Crystal structure of PI3K complex with an inhibitor 提交 2017-04-13 构建体不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 8–1055（1048 aa） 片段：UNP residues 8-1055
未记录 84U 3-[(4-fluorophenyl)methylamino]-5-(4-morpholin-4-ylthieno[3,2-d]pyrimidin-2-yl)phenol × 1 GOL GLYCEROL × 1 SO4 SULFATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291.15 K；0.15M Lithium sulfate, 0.1M Tris-HCl pH 8.5, 28%(W/V) PEG2000MME
分辨率 2.97 Å R-free 0.280
5XGI Crystal structure of PI3K complex with an inhibitor 提交 2017-04-13 构建体不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 8–1059（1052 aa） 片段：UNP residues 8-1059
未记录 84R 3-azanyl-5-(4-morpholin-4-ylthieno[3,2-d]pyrimidin-2-yl)phenol × 1 P6G HEXAETHYLENE GLYCOL × 1 SO4 SULFATE ION × 3 GOL GLYCEROL × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291.15 K；0.15M Lithium sulfate, 0.1M Tris-HCl pH 8.5, 28%(W/V) PEG2000MME
分辨率 2.56 Å R-free 0.290
5XGJ Crystal structure of PI3K complex with an inhibitor 提交 2017-04-13 构建体不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 8–1055（1048 aa） 片段：UNP residues 8-1055
未记录 84X 3-(4-morpholin-4-ylfuro[3,2-d]pyrimidin-2-yl)-5-[(phenylmethyl)amino]phenol × 1 SO4 SULFATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291.15 K；0.15M Lithium sulfate, 0.1M Tris-HCl pH 8.5, 28%(W/V) PEG2000MME
分辨率 2.97 Å R-free 0.279
6GVF Crystal structure of PI3K alpha in complex with 3-(2-Amino-benzooxazol-5-yl)-1-isopropyl-1H-pyrazolo[3,4-d]pyrimidin-4-ylamine 提交 2018-06-21 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 107–1051（945 aa）
未记录 FE5 5-(4-azanyl-1-propan-2-yl-pyrazolo[3,4-d]pyrimidin-3-yl)-1,3-benzoxazol-2-amine × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；NULL
分辨率 2.50 Å R-free 0.244
6GVG Crystal structure of PI3K alpha in complex with 3-(2-Amino-benzooxazol-5-yl)-1-isopropyl-4-methyl-1H-pyrazolo[3,4-d]pyrimidin-6-ylamine 提交 2018-06-21 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 107–1068（962 aa）
未记录 FCZ 5-(6-azanyl-4-methyl-1-propan-2-yl-pyrazolo[3,4-d]pyrimidin-3-yl)-1,3-benzoxazol-2-amine × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；none
分辨率 3.00 Å R-free 0.229
6GVH Crystal structure of PI3K alpha in complex with 3-(2-Amino-benzooxazol-5-yl)-4-chloro-1-isopropyl-1H-pyrazolo[3,4-d]pyrimidin-6-ylamine 提交 2018-06-21 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 107–1068（962 aa）
未记录 FDH 5-(6-azanyl-4-chloranyl-1-propan-2-yl-pyrazolo[3,4-d]pyrimidin-3-yl)-1,3-benzoxazol-2-amine × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；none
分辨率 2.74 Å R-free 0.246
6GVI Crystal structure of PI3K alpha in complex with 3-(2-Amino-benzooxazol-5-yl)-1-isopropyl-1H-pyrazolo[3,4-d]pyrimidine-4,6-diamine 提交 2018-06-21 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 107–1068（962 aa）
未记录 FDW 3-(2-azanyl-1,3-benzoxazol-5-yl)-1-propan-2-yl-pyrazolo[3,4-d]pyrimidine-4,6-diamine × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；none
分辨率 2.90 Å R-free 0.232
6NCT Structure of p110alpha/niSH2 - vector data collection 提交 2018-12-12 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–1068（1068 aa）
未记录 144 TRIS-HYDROXYMETHYL-METHYL-AMMONIUM × 2 SO4 SULFATE ION × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；298 K；0.1 M Hepes, 1.4-1.6 M sodium formate
分辨率 3.35 Å R-free 0.271
6OAC PQR530 [(S)-4-(Difluoromethyl)-5-(4-(3-methylmorpholino)-6-morpholino-1,3,5-triazin-2-yl)pyridin-2-amine] bound to the PI3Ka catalytic subunit p110alpha 提交 2019-03-15 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 105–1048（944 aa）
未记录 M1J 4-(difluoromethyl)-5-{4-[(3S)-3-methylmorpholin-4-yl]-6-(morpholin-4-yl)-1,3,5-triazin-2-yl}pyridin-2-amine × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；290 K；8% PEG6000, 0.6M Na Formate, 0.1M CHES pH 9.5, 5mM TCEP
分辨率 3.15 Å R-free 0.287
6PYS Human PI3Kalpha in complex with Compound 2-10 ((3S)-3-benzyl-3-methyl-5-[5-(2-methylpyrimidin-5-yl)pyrazolo[1,5-a]pyrimidin-3-yl]-1,3-dihydro-2H-indol-2-one) 提交 2019-07-30 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 107–1051（945 aa） 片段：UNP residues 107-1051
未记录 P5J (3S)-3-benzyl-3-methyl-5-[5-(2-methylpyrimidin-5-yl)pyrazolo[1,5-a]pyrimidin-3-yl]-1,3-dihydro-2H-indol-2-one × 1 GOL GLYCEROL × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；293 K；not available
分辨率 2.19 Å R-free 0.259
6VO7 Crystal structure of PI3K-alpha Ras Binding Domain (RBD) 提交 2020-01-30 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 157–300（144 aa） 片段：Ras Binding Domain (RBD)
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；293 K；0.1 M Tris-HCL, 0.7 M Na Citrate, pH 8.5
分辨率 2.31 Å R-free 0.255
7JIU HUMAN PI3KDELTA IN COMPLEX WITH COMPOUND 2F 提交 2020-07-23 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 107–1052（946 aa） 片段：TRUNCATED PI3-KINASE ALPHA, residues 107-1052
未记录 VBS (3S)-3-benzyl-5-[9-ethyl-8-(2-methylpyrimidin-5-yl)-9H-purin-6-yl]-3-methyl-1,3-dihydro-2H-indol-2-one × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；293 K；NOT AVAILABLE
分辨率 2.12 Å R-free 0.246
7K6M Crystal structure of PI3Kalpha selective Inhibitor PF-06843195 提交 2020-09-21 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 105–1048（944 aa）
未记录 VXY 2,2-difluoroethyl (3S)-3-{[2'-amino-5-fluoro-2-(morpholin-4-yl)[4,5'-bipyrimidin]-6-yl]amino}-3-(hydroxymethyl)pyrrolidine-1-carboxylate × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；286 K；8% (w/v) PEG 6000, 0.1 M CHES pH 9.75, 0.64 M sodium formate, 5 mM TCEP pH 7, 50 mM Tris pH 8.0, 100 mM NaCl, 2% Ethylene Glycol
分辨率 2.41 Å R-free 0.232
7K6N Crystal structure of PI3Kalpha selective Inhibitor 11-1575 提交 2020-09-21 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 105–1048（944 aa）
未记录 VY4 tert-butyl (3S)-3-[4-(2-aminopyrimidin-5-yl)-2-(morpholin-4-yl)-5,6-dihydro-7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-7-yl]-3-methylpyrrolidine-1-carboxylate × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；286 K；8% (w/v) PEG 6000, 0.1 M CHES pH 9.75, 0.64 M sodium formate, 5 mM TCEP pH 7
分辨率 2.77 Å R-free 0.235
7K6O Crystal structure of PI3Kalpha inhibitor 10-5429 提交 2020-09-21 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 105–1048（944 aa）
未记录 VY1 (3S)-3-[4-(2-aminopyrimidin-5-yl)-2-(morpholin-4-yl)-5,6-dihydro-7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-7-yl]-N-methylpyrrolidine-1-sulfonamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；286 K；8% (w/v) PEG 6000, 0.1 M CHES pH 9.75, 0.64 M sodium formate, 5 mM TCEP pH 7
分辨率 2.74 Å R-free 0.262
7K71 Crystal structure of PI3Kalpha inhibitor 4-0686 提交 2020-09-21 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 105–1048（944 aa）
未记录 VYP 2-(morpholin-4-yl)[4,5'-bipyrimidin]-2'-amine × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；286 K；8% (w/v) PEG 6000, 0.1 M CHES pH 9.75, 0.64 M sodium formate, 5 mM TCEP pH 7
分辨率 2.90 Å R-free 0.259
7L1B Crystal structure of HLA-A*03:01 in complex with a wild-type PIK3CA peptide 提交 2020-12-14 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 C 1046–1054（9 aa）
未记录 GOL GLYCEROL × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；277.15 K；10.00 % w/v Polyethylene glycol 8,000, 200 mM Calcium acetate, 100 mM HEPES; pH 7.5
分辨率 2.04 Å R-free 0.221
7L1C Crystal structure of HLA-A*03:01 in complex with a mutant PIK3CA peptide 提交 2020-12-14 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 C 1046–1054（9 aa）
未记录 GOL GLYCEROL × 5 FMT FORMIC ACID × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.6；277.15 K；20% w/v Polyethylene glycol 3,350, 200 mM Ammonium formate, pH 6.6
分辨率 1.96 Å R-free 0.205
7L1D Crystal structure of human 21LT2-2 TCR bound to HLA-A*03:01 in complex with a mutant PIK3CA peptide 提交 2020-12-14 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 C 1046–1054（9 aa）
未记录 ACT ACETATE ION × 1 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277.15 K；10% w/v Polyethylene glycol 8,000, 200mM Magnesium acetate
分辨率 3.11 Å R-free 0.250
7MLK Crystal structure of human PI3Ka (p110a subunit) with MMV085400 bound to the active site determined at 2.9 angstroms resolution 提交 2021-04-28 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 105–1048（944 aa） 片段：UNP residues 105-1048
未记录 ZHY 4-[6-(3,4,5-trimethoxyanilino)pyrazin-2-yl]benzamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；286 K；8% (w/v) PEG 6000, 0.1 M CHES pH 9.75, 0.64 M Sodium Formate and AMP, 5 mM TCEP pH 7
分辨率 2.91 Å R-free 0.242
7MYN Cryo-EM Structure of p110alpha in complex with p85alpha 提交 2021-05-21 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–1068（1068 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.79 Å
7MYO Cryo-EM structure of p110alpha in complex with p85alpha inhibited by BYL-719 提交 2021-05-21 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–1068（1068 aa）
未记录 1LT (2S)-N~1~-{4-methyl-5-[2-(1,1,1-trifluoro-2-methylpropan-2-yl)pyridin-4-yl]-1,3-thiazol-2-yl}pyrrolidine-1,2-dicarboxamide × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.92 Å
7PG5 Crystal Structure of PI3Kalpha 提交 2021-08-13 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–1068（1068 aa）
突变：M232K, L233K PO4 PHOSPHATE ION × 2 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293.15 K；10% PEG 5K MME (w/v), 160 nM KSCN, 100 mM sodium cacodylate pH 6.5.
分辨率 2.20 Å R-free 0.246
7PG6 Crystal Structure of PI3Kalpha in complex with the inhibitor NVP-BYL719 提交 2021-08-13 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–1068（1068 aa）
突变：M232K, L233K 1LT (2S)-N~1~-{4-methyl-5-[2-(1,1,1-trifluoro-2-methylpropan-2-yl)pyridin-4-yl]-1,3-thiazol-2-yl}pyrrolidine-1,2-dicarboxamide × 1 NA SODIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；10% PEG 5000, 160 mM KSCN and 100 mM sodium cacodylate pH 6.5
分辨率 2.50 Å R-free 0.240
7R9V Structure of PIK3CA with covalent inhibitor 19 提交 2021-06-29 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 105–1048（944 aa）
未记录 2Q7 N-[2-(4-{4-[2-amino-4-(difluoromethyl)pyrimidin-5-yl]-6-(morpholin-4-yl)-1,3,5-triazin-2-yl}piperazin-1-yl)-2-oxoethyl]-1-(prop-2-enoyl)piperidine-4-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；PEG6000 8%, 0.6 M sodium formate, 0.1 M CHES pH 9.4, 5 mM TCEP
分辨率 2.69 Å R-free 0.292
7R9Y Structure of PIK3CA with covalent inhibitor 22 提交 2021-06-29 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 105–1048（944 aa）
未记录 2IX N-[2-(4-{4-[2-amino-4-(difluoromethyl)pyrimidin-5-yl]-6-(morpholin-4-yl)-1,3,5-triazin-2-yl}piperazin-1-yl)-2-oxoethyl]-N-methyl-1-(prop-2-enoyl)piperidine-4-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；PEG6000 8%, 0.6 M sodium formate, 0.1 M CHES pH 9.4, 5 mM TCEP
分辨率 2.85 Å R-free 0.287
7RRG Crystal structure of human 0606T1-2 TCR bound to HLA-A*03:01 in complex with a mutant PIK3CA peptide 提交 2021-08-09 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 C 1046–1054（9 aa）
突变：H1047L GOL GLYCEROL × 13 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；277.15 K；12% w/v Polyethylene glycol 3,350, 100 mM Succinic acid
分辨率 2.12 Å R-free 0.221
7TZ7 PI3K alpha in complex with an inhibitor 提交 2022-02-15 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–1068（1068 aa）
突变：M232K, L233K KVJ (4S,5R)-3-[2'-amino-2-(morpholin-4-yl)-4'-(trifluoromethyl)[4,5'-bipyrimidin]-6-yl]-4-(hydroxymethyl)-5-methyl-1,3-oxazolidin-2-one × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；303.15 K；0.15M Potassium Thiocyanate, 20% PEG 3350
分辨率 2.41 Å R-free 0.277
8AM0 Crystal structure of human T1061E PI3Kalpha in complex with its regulatory subunit and the inhibitor GDC-0077 (Inavolisib) 提交 2022-08-02 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–1068（1068 aa）
突变：T1061E MWF (2R)-2-[[2-[(4S)-4-[bis(fluoranyl)methyl]-2-oxidanylidene-1,3-oxazolidin-3-yl]-5,6-dihydroimidazo[1,2-d][1,4]benzoxazepin-9-yl]amino]propanamide × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 3 PGE TRIETHYLENE GLYCOL × 1 CL CHLORIDE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.1；293 K；0.10 M Bis-Tris-Propane pH 8.10, 0.20 M Na 3 -citrate, 10.00 %(w/v) PEG 3350
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.1；293 K；0.10 M Bis-Tris-Propane pH 8.10, 0.20 M Na 3 -citrate, 10.00 %(w/v) PEG 3350
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.1；293 K；0.10 M Bis-Tris-Propane pH 8.10, 0.20 M Na 3 -citrate, 10.00 %(w/v) PEG 3350
分辨率 2.82 Å R-free 0.300
8BFU Crystal structure of the apo p110alpha catalytic subunit from homo sapiens 提交 2022-10-26 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 105–1048（944 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；12.5% (w/v) PEG 4K, 20% (v/v) 1,2,6-hexanetriol, 90 mM LiNaK, 0.1 M MOPSO/bis-tris pH 6.5
分辨率 2.41 Å R-free 0.279
8DCP PI 3-kinase alpha with nanobody 3-126 提交 2022-06-17 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–1068（1068 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.41 Å
8DCX PI 3-kinase alpha with nanobody 3-159 提交 2022-06-17 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–1068（1068 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
8DD4 PI 3-kinase alpha with nanobody 3-142 提交 2022-06-17 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–1068（1068 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8DD8 PI 3-kinase alpha with nanobody 3-142, crosslinked with DSG 提交 2022-06-17 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–1068（1068 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
8EXL Crystal structure of PI3K-alpha in complex with taselisib 提交 2022-10-25 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 7–1052（1046 aa）
未记录 799 2-methyl-2-(4-{2-[3-methyl-1-(propan-2-yl)-1H-1,2,4-triazol-5-yl]-5,6-dihydroimidazo[1,2-d][1,4]benzoxazepin-9-yl}-1H-pyrazol-1-yl)propanamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.2；291 K；0.1M MES buffer pH 6.2, 16% PEG 20,000, 0.1M KCl
分辨率 1.99 Å R-free 0.225
8EXO Crystal structure of PI3K-alpha in complex with compound 19 提交 2022-10-25 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 7–1052（1046 aa）
未记录 X3W 1-{(4S,11aM)-2-[(4R)-2-oxo-4-(propan-2-yl)-1,3-oxazolidin-3-yl]-5,6-dihydroimidazo[1,2-d][1,4]benzoxazepin-9-yl}-L-prolinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.2；291 K；0.1M MES buffer pH 6.2, 16% PEG 20,000, 0.1M KCl
分辨率 2.46 Å R-free 0.242
8EXU Crystal structure of PI3K-alpha in complex with compound 30 提交 2022-10-25 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 7–1052（1046 aa）
未记录 X3R (2S)-2-cyclopropyl-2-({(4S,11aM)-2-[(4S)-2-oxo-4-(trifluoromethyl)-1,3-oxazolidin-3-yl]-5,6-dihydroimidazo[1,2-d][1,4]benzoxazepin-9-yl}amino)acetamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.2；291 K；0.1M MES buffer pH 6.2, 16% PEG 20,000, 0.1M KCl
分辨率 2.68 Å R-free 0.241
8EXV Crystal structure of PI3K-alpha in complex with compound 32 提交 2022-10-25 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 7–1052（1046 aa）
未记录 X3N N~2~-{(4S,11aP)-2-[(4S)-4-(difluoromethyl)-2-oxo-1,3-oxazolidin-3-yl]-5,6-dihydroimidazo[1,2-d][1,4]benzoxazepin-9-yl}-L-alaninamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.2；291 K；0.1M MES buffer pH 6.2, 16% PEG 20,000, 0.1M KCl
分辨率 2.48 Å R-free 0.258
8GUA Cryo-EM structure of cancer-specific PI3Kalpha mutant E542K in complex with BYL-719 提交 2022-09-11 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–1068（1068 aa）
未记录 1LT (2S)-N~1~-{4-methyl-5-[2-(1,1,1-trifluoro-2-methylpropan-2-yl)pyridin-4-yl]-1,3-thiazol-2-yl}pyrrolidine-1,2-dicarboxamide × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.77 Å
8GUB Cryo-EM structure of cancer-specific PI3Kalpha mutant H1047R in complex with BYL-719 提交 2022-09-11 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–1068（1068 aa）
未记录 1LT (2S)-N~1~-{4-methyl-5-[2-(1,1,1-trifluoro-2-methylpropan-2-yl)pyridin-4-yl]-1,3-thiazol-2-yl}pyrrolidine-1,2-dicarboxamide × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.73 Å
8GUD Cryo-EM structure of cancer-specific PI3Kalpha mutant E545K in complex with BYL-719 提交 2022-09-11 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–1068（1068 aa）
未记录 1LT (2S)-N~1~-{4-methyl-5-[2-(1,1,1-trifluoro-2-methylpropan-2-yl)pyridin-4-yl]-1,3-thiazol-2-yl}pyrrolidine-1,2-dicarboxamide × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.62 Å
8ILR Cryo-EM structure of PI3Kalpha in complex with compound 16 提交 2023-03-04 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–1068（1068 aa）
未记录 7TZ N-[(2S)-1-(ethylamino)-1-oxidanylidene-3-[4-(2-quinoxalin-6-ylethynyl)phenyl]propan-2-yl]-2,3-dimethyl-quinoxaline-6-carboxamide × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.05 Å
8ILS Cryo-EM structure of PI3Kalpha in complex with compound 17 提交 2023-03-04 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–1068（1068 aa）
未记录 7U5 N-[(2R)-1-(ethylamino)-1-oxidanylidene-3-[4-(2-quinoxalin-6-ylethynyl)phenyl]propan-2-yl]-2,3-dimethyl-quinoxaline-6-carboxamide × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8ILV Cryo-EM structure of PI3Kalpha in complex with compound 18 提交 2023-03-04 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–1068（1068 aa）
未记录 L2V N-[(2R)-1-(ethylamino)-1-oxidanylidene-3-[3-(2-quinoxalin-6-ylethynyl)phenyl]propan-2-yl]-2,3-dimethyl-quinoxaline-6-carboxamide × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.19 Å
8OW2 Crystal structure of the p110alpha catalytic subunit from homo sapiens in complex with activator 1938 提交 2023-04-26 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 105–1048（944 aa）
未记录 QIH 1-[7-[[2-[[4-(4-ethylpiperazin-1-yl)phenyl]amino]pyridin-4-yl]amino]-2,3-dihydroindol-1-yl]ethanone × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；12.5% (w/v) PEG 4K, 20% (v/v) 1,2,6-hexanetriol, 50 mM Polyamines, 0.1 M MOPSO/bis-tris pH 6.5
分辨率 2.57 Å R-free 0.271
8SBC Co-structure of Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit alpha isoform and brain penetrant inhibitors 提交 2023-04-03 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–1068（1068 aa）
突变：M232K, L233K, W780K, I800M, V850W, F930V ZTV (2M)-7-[(3R)-3-methylmorpholin-4-yl]-5-[(3S)-3-methylmorpholin-4-yl]-2-(pyridin-2-yl)-1H-imidazo[4,5-b]pyridine × 1 SO4 SULFATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.2；303 K；RESERVOIR SOLUTION : 12%-20% PEG 3350, 0.125M-0.20M KSCN PROTEIN SOLUTION : 20MM TRIS PH 7.2, 200MM NACL, 1% BETAINE, 1% ETHYLENE GLYCOL, 0.02% CHAPS, 5MM DTT, PROTEIN IS 7.4 MG/ML FORMATION METHOD : SOAKING PROTOCOL : SET UP APO XTALS DROPS IN 1:1 RATIO IN 30C, REMARK 280 XTALS GROW OVERNIGHT, THEN ADD 2MM OF STOCK CPD AND INCUBATE FOR A FEW HOURS METHOD : VAPOR DIFFUSION - HANGING DROP TEMPERATURE : 303.0 CRYO PROTOCOL : 20% ETHYLENE GLYCOL PLUS WELL SOLUTION
分辨率 2.30 Å R-free 0.271
8SBJ Co-structure Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit alpha isoform complexed with brain penetrant inhibitors 提交 2023-04-03 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–1068（1068 aa）
未记录 ZUO (2M)-7-[(3R)-3-methylmorpholin-4-yl]-5-[(3S)-3-methylmorpholin-4-yl]-2-(1H-pyrazol-3-yl)-3H-imidazo[4,5-b]pyridine × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.2；303 K；RESERVOIR SOLUTION : 12%-20% PEG 3350, 0.125M-0.20M KSCN; PROTEIN SOLUTION: 20MM TRIS PH 7.2, 200MM NACL, 1% BETAINE, 1% ETHYLENE GLYCOL, 0.02% CHAPS, 5MM DTT, PROTEIN IS 7.4 MG/ML, FORMATION METHOD : SOAKING, PROTOCOL: SET UP APO XTALS DROPS IN 1:1 RATIO IN 30C, XTALS GROW OVERNIGHT, THEN ADD 2MM OF STOCK CPD AND INCUBATE FOR A FEW HOURS; CRYO PROTOCOL: 20% ETHYLENE GLYCOL PLUS WELL SOLUTION
分辨率 3.10 Å R-free 0.257
8TDU STX-478, a Mutant-Selective, Allosteric Inhibitor bound to PI3Kalpha 提交 2023-07-05 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–1068（1068 aa）
未记录 X3N N~2~-{(4S,11aP)-2-[(4S)-4-(difluoromethyl)-2-oxo-1,3-oxazolidin-3-yl]-5,6-dihydroimidazo[1,2-d][1,4]benzoxazepin-9-yl}-L-alaninamide × 1 ZWE N-(2-aminopyrimidin-5-yl)-N'-[(1R)-1-(5,7-difluoro-3-methyl-1-benzofuran-2-yl)-2,2,2-trifluoroethyl]urea × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；298 K；0.1 M MES pH 6.8, 500mM NaCl, 8% w/v PEG 3350
分辨率 3.11 Å R-free 0.267
8TDU STX-478, a Mutant-Selective, Allosteric Inhibitor bound to PI3Kalpha 提交 2023-07-05 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 C 1–1068（1068 aa）
未记录 X3N N~2~-{(4S,11aP)-2-[(4S)-4-(difluoromethyl)-2-oxo-1,3-oxazolidin-3-yl]-5,6-dihydroimidazo[1,2-d][1,4]benzoxazepin-9-yl}-L-alaninamide × 1 ZWE N-(2-aminopyrimidin-5-yl)-N'-[(1R)-1-(5,7-difluoro-3-methyl-1-benzofuran-2-yl)-2,2,2-trifluoroethyl]urea × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；298 K；0.1 M MES pH 6.8, 500mM NaCl, 8% w/v PEG 3350
分辨率 3.11 Å R-free 0.267
8TGD STX-478, a Mutant-Selective, Allosteric Inhibitor bound to H1047R PI3Kalpha 提交 2023-07-12 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–1068（1068 aa）
突变：H1047R EDO 1,2-ETHANEDIOL × 10 X3N N~2~-{(4S,11aP)-2-[(4S)-4-(difluoromethyl)-2-oxo-1,3-oxazolidin-3-yl]-5,6-dihydroimidazo[1,2-d][1,4]benzoxazepin-9-yl}-L-alaninamide × 1 ZWE N-(2-aminopyrimidin-5-yl)-N'-[(1R)-1-(5,7-difluoro-3-methyl-1-benzofuran-2-yl)-2,2,2-trifluoroethyl]urea × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.8；293 K；0.5 M NaCl, 0.1 M MES-NaOH pH 6.8, 5% w/v PEG 3350
分辨率 2.93 Å R-free 0.252
8TGD STX-478, a Mutant-Selective, Allosteric Inhibitor bound to H1047R PI3Kalpha 提交 2023-07-12 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 C 1–1068（1068 aa）
突变：H1047R EDO 1,2-ETHANEDIOL × 3 X3N N~2~-{(4S,11aP)-2-[(4S)-4-(difluoromethyl)-2-oxo-1,3-oxazolidin-3-yl]-5,6-dihydroimidazo[1,2-d][1,4]benzoxazepin-9-yl}-L-alaninamide × 1 ZWE N-(2-aminopyrimidin-5-yl)-N'-[(1R)-1-(5,7-difluoro-3-methyl-1-benzofuran-2-yl)-2,2,2-trifluoroethyl]urea × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.8；293 K；0.5 M NaCl, 0.1 M MES-NaOH pH 6.8, 5% w/v PEG 3350
分辨率 2.93 Å R-free 0.252
8TS7 Human PI3K p85alpha/p110alpha 提交 2023-08-11 构建体不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 2–1053（1052 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；0.1 M Hepes pH 7.5, 9% PEG-3350
分辨率 2.71 Å R-free 0.288
8TS8 p85alpha/p110alpha heterodimer H1047R mutant 提交 2023-08-11 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 2–1053（1052 aa）
突变：H1047R 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；0.1 M Hepes pH 7.5, 9% PEG-3350
分辨率 2.72 Å R-free 0.265
8TS9 Human PI3K p85alpha/p110alpha H1047R bound to compound 1 提交 2023-08-11 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 2–1050（1049 aa）
突变：H1047R UE9 5-[3-fluoro-5-(trifluoromethyl)benzamido]-N-methyl-6-(2-methylanilino)pyridine-3-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；0.1 M Hepes pH 7.5, 9% PEG-3350
分辨率 2.83 Å R-free 0.252
8TSA Human PI3K p85alpha/p110alpha H1047R bound to compound 2 提交 2023-08-11 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 2–1050（1049 aa）
突变：H1047R UIW 5-(3-bromo-5-fluorobenzamido)-N-methyl-6-(2-methylanilino)pyridine-3-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；0.1 M Hepes pH 7.5, 9% PEG-3350
分辨率 2.51 Å R-free 0.276
8TSB Human PI3K p85alpha/p110alpha bound to compound 2 提交 2023-08-11 构建体不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 2–1053（1052 aa）
未记录 UIW 5-(3-bromo-5-fluorobenzamido)-N-methyl-6-(2-methylanilino)pyridine-3-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；0.1 M Hepes pH 7.5, 9% PEG-3350
分辨率 3.53 Å R-free 0.256
8TSC Human PI3K p85alpha/p110alpha H1047R bound to compound 3 提交 2023-08-11 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 2–1050（1049 aa）
突变：H1047R UJC (1S)-7-[3-fluoro-5-(trifluoromethyl)benzamido]-N-methyl-1-(2-methylphenyl)-3-oxo-2,3-dihydro-1H-isoindole-5-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；0.1 M Hepes pH 7.5, 9% PEG-3350
分辨率 3.62 Å R-free 0.255
8TSD Human PI3K p85alpha/p110alpha bound to RLY-2608 提交 2023-08-11 构建体不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 2–1053（1052 aa）
未记录 XUZ N-{(3R,6M)-3-(2-chloro-5-fluorophenyl)-6-[(4S)-5-cyano[1,2,4]triazolo[1,5-a]pyridin-6-yl]-1-oxo-2,3-dihydro-1H-isoindol-4-yl}-3-fluoro-5-(trifluoromethyl)benzamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；0.1 M Hepes pH 7.5, 9% PEG-3350
分辨率 2.70 Å R-free 0.277
8TU6 CryoEM structure of PI3Kalpha 提交 2023-08-15 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 2–1068（1067 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.12 Å
8TWY Structure of p110 alpha bound to (S)-1-(4-((2-(4-(4-(2-amino-4-(difluoromethyl)pyrimidin-5-yl)-6-(3-methylmorpholino)-1,3,5- triazin-2-yl)piperazin-1-yl)-2-oxoethoxy)methyl)piperidin-1-yl)prop-2-en-1-one (compound 9) 提交 2023-08-21 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 105–1048（944 aa）
未记录 RNX 1-(4-{[2-(4-{(4P)-4-[2-amino-4-(difluoromethyl)pyrimidin-5-yl]-6-[(3S)-3-methylmorpholin-4-yl]-1,3,5-triazin-2-yl}piperazin-1-yl)-2-oxoethoxy]methyl}piperidin-1-yl)prop-2-en-1-one × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；PEG6000 10-15%, 0.6 M sodium formate, 0.1 M CHES pH 9.5-10.5, 5 mM TCEP
分辨率 2.67 Å R-free 0.261
8V8H PI3Ka H1047R co-crystal structure with inhibitor in cryptic pocket near H1047R (compound 4). 提交 2023-12-05 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–1068（1068 aa）
突变：H1047R YO4 2-({(1R)-1-[2-(4,4-dimethylpiperidin-1-yl)-3,6-dimethyl-4-oxo-4H-1-benzopyran-8-yl]ethyl}amino)benzoic acid × 1 YNZ (2S)-N~1~-[(4P)-2-tert-butyl-4'-methyl[4,5'-bi-1,3-thiazol]-2'-yl]pyrrolidine-1,2-dicarboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；0.2 M Sodium acetate, 0.1 M Sodium citrate pH 5.5, 4% w/v PEG 4000.
分辨率 3.58 Å R-free 0.272
8V8H PI3Ka H1047R co-crystal structure with inhibitor in cryptic pocket near H1047R (compound 4). 提交 2023-12-05 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 C 1–1068（1068 aa）
突变：H1047R YO4 2-({(1R)-1-[2-(4,4-dimethylpiperidin-1-yl)-3,6-dimethyl-4-oxo-4H-1-benzopyran-8-yl]ethyl}amino)benzoic acid × 1 YNZ (2S)-N~1~-[(4P)-2-tert-butyl-4'-methyl[4,5'-bi-1,3-thiazol]-2'-yl]pyrrolidine-1,2-dicarboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；0.2 M Sodium acetate, 0.1 M Sodium citrate pH 5.5, 4% w/v PEG 4000.
分辨率 3.58 Å R-free 0.272
8V8I PI3Ka H1047R co-crystal structure with inhibitor in cryptic pocket (compound 5). 提交 2023-12-05 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–1068（1068 aa）
未记录 YOR N-{(3S)-3-(2-methylphenyl)-6-[(oxetan-3-yl)amino]-1-oxo-2,3-dihydro-1H-isoindol-4-yl}-1-benzothiophene-3-carboxamide × 1 YNZ (2S)-N~1~-[(4P)-2-tert-butyl-4'-methyl[4,5'-bi-1,3-thiazol]-2'-yl]pyrrolidine-1,2-dicarboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；289 K；0.1 M Sodium Malonate pH 5.0, 10% w/v PEG 3350
分辨率 3.20 Å R-free 0.310
8V8I PI3Ka H1047R co-crystal structure with inhibitor in cryptic pocket (compound 5). 提交 2023-12-05 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 C 1–1068（1068 aa）
未记录 YOR N-{(3S)-3-(2-methylphenyl)-6-[(oxetan-3-yl)amino]-1-oxo-2,3-dihydro-1H-isoindol-4-yl}-1-benzothiophene-3-carboxamide × 1 YNZ (2S)-N~1~-[(4P)-2-tert-butyl-4'-methyl[4,5'-bi-1,3-thiazol]-2'-yl]pyrrolidine-1,2-dicarboxamide × 1 CL CHLORIDE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；289 K；0.1 M Sodium Malonate pH 5.0, 10% w/v PEG 3350
分辨率 3.20 Å R-free 0.310
8V8J PI3Ka H1047R co-crystal structure with inhibitors in two cryptic pockets (compounds 4 and 5). 提交 2023-12-05 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–1068（1068 aa）
未记录 YO4 2-({(1R)-1-[2-(4,4-dimethylpiperidin-1-yl)-3,6-dimethyl-4-oxo-4H-1-benzopyran-8-yl]ethyl}amino)benzoic acid × 1 YOR N-{(3S)-3-(2-methylphenyl)-6-[(oxetan-3-yl)amino]-1-oxo-2,3-dihydro-1H-isoindol-4-yl}-1-benzothiophene-3-carboxamide × 1 YNZ (2S)-N~1~-[(4P)-2-tert-butyl-4'-methyl[4,5'-bi-1,3-thiazol]-2'-yl]pyrrolidine-1,2-dicarboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；289 K；0.4M Sodium Formate, 0.1 M Sodium Citrate, pH 5.2
分辨率 3.35 Å R-free 0.251
8V8J PI3Ka H1047R co-crystal structure with inhibitors in two cryptic pockets (compounds 4 and 5). 提交 2023-12-05 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 C 1–1068（1068 aa）
未记录 YO4 2-({(1R)-1-[2-(4,4-dimethylpiperidin-1-yl)-3,6-dimethyl-4-oxo-4H-1-benzopyran-8-yl]ethyl}amino)benzoic acid × 1 YOR N-{(3S)-3-(2-methylphenyl)-6-[(oxetan-3-yl)amino]-1-oxo-2,3-dihydro-1H-isoindol-4-yl}-1-benzothiophene-3-carboxamide × 1 YNZ (2S)-N~1~-[(4P)-2-tert-butyl-4'-methyl[4,5'-bi-1,3-thiazol]-2'-yl]pyrrolidine-1,2-dicarboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；289 K；0.4M Sodium Formate, 0.1 M Sodium Citrate, pH 5.2
分辨率 3.35 Å R-free 0.251
8V8U PI3Ka H1047R co-crystal structure with inhibitor in cryptic pocket near H1047R (compound 12). 提交 2023-12-06 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–1068（1068 aa）
突变：H1047R 1LT (2S)-N~1~-{4-methyl-5-[2-(1,1,1-trifluoro-2-methylpropan-2-yl)pyridin-4-yl]-1,3-thiazol-2-yl}pyrrolidine-1,2-dicarboxamide × 1 YQB (3S)-9-[(1R)-1-(2-carboxyanilino)ethyl]-3-cyano-7-methyl-4-oxo-2-(piperidin-1-yl)-3,4-dihydropyrido[1,2-a]pyrimidin-5-ium × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；0.3-0.6 M Sodium Formate, 0.1 M Citrate pH 5.0
分辨率 2.93 Å R-free 0.255
8V8U PI3Ka H1047R co-crystal structure with inhibitor in cryptic pocket near H1047R (compound 12). 提交 2023-12-06 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 C 1–1068（1068 aa）
突变：H1047R 1LT (2S)-N~1~-{4-methyl-5-[2-(1,1,1-trifluoro-2-methylpropan-2-yl)pyridin-4-yl]-1,3-thiazol-2-yl}pyrrolidine-1,2-dicarboxamide × 1 YQB (3S)-9-[(1R)-1-(2-carboxyanilino)ethyl]-3-cyano-7-methyl-4-oxo-2-(piperidin-1-yl)-3,4-dihydropyrido[1,2-a]pyrimidin-5-ium × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；0.3-0.6 M Sodium Formate, 0.1 M Citrate pH 5.0
分辨率 2.93 Å R-free 0.255
8V8V PI3Ka H1047R co-crystal structure with inhibitor in cryptic pocket near H1047R (compound 7). 提交 2023-12-06 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–1068（1068 aa）
突变：H1047R YQ2 2-[[(1~{R})-1-(7-methyl-4-oxidanylidene-2-piperidin-1-yl-3~{H}-pyrido[1,2-a]pyrimidin-9-yl)ethyl]amino]benzoic acid × 1 1LT (2S)-N~1~-{4-methyl-5-[2-(1,1,1-trifluoro-2-methylpropan-2-yl)pyridin-4-yl]-1,3-thiazol-2-yl}pyrrolidine-1,2-dicarboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.6 M Sodium Formate, 0.1 M Citrate pH 5.0
分辨率 2.61 Å R-free 0.288
8V8V PI3Ka H1047R co-crystal structure with inhibitor in cryptic pocket near H1047R (compound 7). 提交 2023-12-06 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 C 1–1068（1068 aa）
突变：H1047R YQ2 2-[[(1~{R})-1-(7-methyl-4-oxidanylidene-2-piperidin-1-yl-3~{H}-pyrido[1,2-a]pyrimidin-9-yl)ethyl]amino]benzoic acid × 1 1LT (2S)-N~1~-{4-methyl-5-[2-(1,1,1-trifluoro-2-methylpropan-2-yl)pyridin-4-yl]-1,3-thiazol-2-yl}pyrrolidine-1,2-dicarboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.6 M Sodium Formate, 0.1 M Citrate pH 5.0
分辨率 2.61 Å R-free 0.288
8VCL Crystal structure of HLA-A*03:01 in complex with a mutant PIK3CA peptide 提交 2023-12-14 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 C 1046–1054（9 aa）
突变：H2L FMT FORMIC ACID × 4 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；277.15 K；12% w/v Polyethylene glycol 3,350, 4% v/v TacsimateTM, pH 6.0
分辨率 2.40 Å R-free 0.230
8W9A CryoEM structure of human PI3K-alpha (P85/P110-H1047R) with QR-7909 binding at an allosteric site 提交 2023-09-05 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–1068（1068 aa）
未记录 UEX 6-chloranyl-3-[[(1R)-1-[2-(1,3-dihydropyrrolo[3,4-c]pyridin-2-yl)-3,6-dimethyl-4-oxidanylidene-quinazolin-8-yl]ethyl]amino]pyridine-2-carboxylic acid × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.70 Å
9ASF Crystal structure of HLA-A*03:01 in complex with a wild-type PIK3CA peptide analogue (Trp-6 Bta) 提交 2024-02-25 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 C 1046–1054（9 aa） 片段：residues 1046-1054 (Uniprot numbering)
突变：W6Bta 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） GOL GLYCEROL × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277.15 K；15% w/v Polyethylene glycol 6,000, 50 mM Potassium chloride; 10 mM Magnesium chloride
分辨率 1.77 Å R-free 0.237
9ASG Crystal structure of HLA-A*03:01 in complex with a mutant PIK3CA peptide analogue (Trp-6 Bta) 提交 2024-02-25 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 C 1046–1054（9 aa） 片段：residues 1046-1054 (Uniprot numbering)
突变：H2L, W6Bta 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277.15 K；15% w/v Polyethylene glycol 3,350, 150mM Cesium chloride
分辨率 2.03 Å R-free 0.238
9B4S Crystal structure of the RRAS2-p110alpha complex 提交 2024-03-21 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 105–1068（964 aa）
突变：W1057A, I1058A, F1059A 5H5 (2S)-2-({2-[1-(propan-2-yl)-1H-1,2,4-triazol-5-yl]-5,6-dihydroimidazo[1,2-d][1,4]benzoxazepin-9-yl}oxy)propanamide × 1 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；293 K；0.1 M (Bicine/Tris), 0.06 M Divalent mix, 30% (40%v/v PEG MME 500, 20%w/v PEG 20000)
分辨率 3.10 Å R-free 0.272
9B4T Crystal structure of the MRAS-p110alpha complex 提交 2024-03-21 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 105–1068（964 aa）
突变：W1057A, I1058A, F1059A 5H5 (2S)-2-({2-[1-(propan-2-yl)-1H-1,2,4-triazol-5-yl]-5,6-dihydroimidazo[1,2-d][1,4]benzoxazepin-9-yl}oxy)propanamide × 1 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；293 K；0.1 M (Tris/Bicine) 1.2%w/v cholic acid mix, 50%v/v (40%v/v ethylene glycol, 20%w/v PEG 8000)
分辨率 2.75 Å R-free 0.262
9B4U Crystal structure of p110alpha-RBD covalently bound to a breaker compound BBO-10203 via Cys242 提交 2024-03-21 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 157–300（144 aa） 片段：Ras Binding Domain (RBD)
链 B 157–300（144 aa） 片段：Ras Binding Domain (RBD)
未记录 A1AIR 1-[(4R,8R)-2-[(4M,7P)-7-[2,4-difluoro-6-(2-methoxyethoxy)phenyl]-4-(1-methyl-1H-indazol-5-yl)thieno[3,2-c]pyridin-6-yl]-4-methyl-6,7-dihydropyrazolo[1,5-a]pyrazin-5(4H)-yl]propan-1-one × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.9；277 K；0.1 M Tris, 0.2 M CaCl2, 24 % PEG 6000
分辨率 2.21 Å R-free 0.269
9C15 Crystal structure of the KRAS-p110alpha complex with molecular glue D927 提交 2024-05-28 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 105–1068（964 aa）
突变：W1057A, I1058A, F1059A A1ATF 2-[3-fluoro-4-({(7P)-7-[2-(2-methoxyethoxy)phenyl]thieno[2,3-d]pyridazin-4-yl}amino)phenyl]acetamide × 1 MG MAGNESIUM ION × 2 IPA ISOPROPYL ALCOHOL × 2 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；293 K；0.1 M Tris, 0.1 M NaCl, 15% PEG 20K
分辨率 2.81 Å R-free 0.234
9CMK Crystal structure of p110alpha-RAS binding domain (RBD) in complex with molecular glue D927 提交 2024-07-15 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 160–300（141 aa）
未记录 A1ATF 2-[3-fluoro-4-({(7P)-7-[2-(2-methoxyethoxy)phenyl]thieno[2,3-d]pyridazin-4-yl}amino)phenyl]acetamide × 1 MG MAGNESIUM ION × 3 MRD (4R)-2-METHYLPENTANE-2,4-DIOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.4；277 K；0.1 M (MES/Imidazole), 0.06 M Divalent mix, 40 %v/v (MPD, PEG 1000, PEG 3350)
分辨率 1.75 Å R-free 0.221
9CMK Crystal structure of p110alpha-RAS binding domain (RBD) in complex with molecular glue D927 提交 2024-07-15 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 160–300（141 aa）
未记录 A1ATF 2-[3-fluoro-4-({(7P)-7-[2-(2-methoxyethoxy)phenyl]thieno[2,3-d]pyridazin-4-yl}amino)phenyl]acetamide × 1 MRD (4R)-2-METHYLPENTANE-2,4-DIOL × 1 MPD (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.4；277 K；0.1 M (MES/Imidazole), 0.06 M Divalent mix, 40 %v/v (MPD, PEG 1000, PEG 3350)
分辨率 1.75 Å R-free 0.221
9CML Crystal structure of p110alpha-RAS binding domain (RBD) in complex with molecular glue D223 提交 2024-07-15 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 160–300（141 aa）
未记录 A1AZD tert-butyl [2-(2-{[(2P)-2-{4-[4-(2-amino-2-oxoethyl)-2-fluoroanilino]thieno[2,3-d]pyridazin-7-yl}phenyl]oxy}ethoxy)ethyl]carbamate × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；277 K；0.1 M (TRIS/Bicine), 0.1 M amino acid mix, 50 %v/v (MPD, PEG 1000, PEG 3350)
分辨率 2.01 Å R-free 0.278
9CML Crystal structure of p110alpha-RAS binding domain (RBD) in complex with molecular glue D223 提交 2024-07-15 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 160–300（141 aa）
未记录 A1AZD tert-butyl [2-(2-{[(2P)-2-{4-[4-(2-amino-2-oxoethyl)-2-fluoroanilino]thieno[2,3-d]pyridazin-7-yl}phenyl]oxy}ethoxy)ethyl]carbamate × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；277 K；0.1 M (TRIS/Bicine), 0.1 M amino acid mix, 50 %v/v (MPD, PEG 1000, PEG 3350)
分辨率 2.01 Å R-free 0.278
9CMV Crystal structure of the KRAS-p110alpha complex in the presence of molecular glue D223 提交 2024-07-15 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 105–1068（964 aa）
突变：W1057A/I1058A/F1059A A1AZD tert-butyl [2-(2-{[(2P)-2-{4-[4-(2-amino-2-oxoethyl)-2-fluoroanilino]thieno[2,3-d]pyridazin-7-yl}phenyl]oxy}ethoxy)ethyl]carbamate × 1 GOL GLYCEROL × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；293 K；0.1 M Tris, 0.1 M NaCl, 10 % PEG 20K
分辨率 3.01 Å R-free 0.268
9CWY Crystal structure of HLA-A*03:02 in complex with a wild-type PIK3CA peptide 提交 2024-07-30 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 C 1046–1054（9 aa）
未记录 ACT ACETATE ION × 2 FMT FORMIC ACID × 7 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；277.15 K；12% w/v polyethylene glycol 3,350, 4% v/v Tacsimate (Hampton Research)
分辨率 1.98 Å R-free 0.224
9CWZ Crystal structure of HLA-A*03:02 in complex with a mutant PIK3CA peptide 提交 2024-07-30 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 C 1046–1054（9 aa）
突变：H2L GOL GLYCEROL × 10 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.1；277.15 K；20% w/v polyethylene glycol 3,350, 200 mM lithium nitrate
分辨率 2.05 Å R-free 0.238
9CX0 Crystal structure of HLA-A*03:01 E152V mutant in complex with a mutant PIK3CA peptide 提交 2024-07-30 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 C 1046–1054（9 aa）
突变：H2L GOL GLYCEROL × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；277.15 K；12% w/v polyethylene glycol 3,350, 100 mM sodium malonate
分辨率 1.92 Å R-free 0.242
9CX1 Crystal structure of HLA-A*03:01 L156Q mutant in complex with a mutant PIK3CA peptide 提交 2024-07-30 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 C 1046–1054（9 aa）
突变：H2L GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；277.15 K；20% w/v polyethylene glycol 3,350, 200 mM sodium malonate
分辨率 2.00 Å R-free 0.221
9CX2 Crystal structure of HLA-A*03:01 L156Q mutant in complex with a mutant PIK3CA peptide 提交 2024-07-30 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 C 1046–1054（9 aa）
突变：H2L 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；277.15 K；10% w/v polyethylene glycol 20,000, 100 mM MES
分辨率 2.30 Å R-free 0.219
9E8M Covalent inhibitor VVD-442 bound to the RAS binding domain (RBD) of PI3Ka 提交 2024-11-05 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 157–300（144 aa） 片段：Ras Binding Domain (RBD)
未记录 A1BF9 1-[(1P)-5-bromo-2'-chloro[1,1'-biphenyl]-2-sulfonyl]-4-fluoro-N-[(2S)-4-(methanesulfonyl)butan-2-yl]piperidine-4-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；277.15 K；4.8 M ammonium acetate, 0.1 M MES pH 5.5
分辨率 2.83 Å R-free 0.268
9E8M Covalent inhibitor VVD-442 bound to the RAS binding domain (RBD) of PI3Ka 提交 2024-11-05 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 157–300（144 aa） 片段：Ras Binding Domain (RBD)
未记录 A1BF9 1-[(1P)-5-bromo-2'-chloro[1,1'-biphenyl]-2-sulfonyl]-4-fluoro-N-[(2S)-4-(methanesulfonyl)butan-2-yl]piperidine-4-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；277.15 K；4.8 M ammonium acetate, 0.1 M MES pH 5.5
分辨率 2.83 Å R-free 0.268
9LWQ Cryo-EM structure of PI3Kalpha in complex with compound UCL-TRO-1938 提交 2025-02-16 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–1068（1068 aa）
未记录 QIH 1-[7-[[2-[[4-(4-ethylpiperazin-1-yl)phenyl]amino]pyridin-4-yl]amino]-2,3-dihydroindol-1-yl]ethanone × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.17 Å
9LWR Cryo-EM structure of PI3Kalpha H1047R in complex with compound UCL-TRO-1938 提交 2025-02-16 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–1068（1068 aa）
突变：H1047R 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
9LWS Cryo-EM structure of PI3Kalpha H1047R in complex with compound UCL-TRO-1938 提交 2025-02-16 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–1068（1068 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.94 Å
9NI3 Cryo-EM structure of the PI3K alpha/KRas complex on POPC/POPS/PIP2 nanodiscs 提交 2025-02-25 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–1068（1068 aa）
未记录 PBU (2R)-3-{[(R)-HYDROXY{[(1R,2R,3S,4R,5R,6S)-2,3,6-TRIHYDROXY-4,5-BIS(PHOSPHONOOXY)CYCLOHEXYL]OXY}PHOSPHORYL]OXY}PROPANE-1 ,2-DIYL DIBUTANOATE × 1 A1AZD tert-butyl [2-(2-{[(2P)-2-{4-[4-(2-amino-2-oxoethyl)-2-fluoroanilino]thieno[2,3-d]pyridazin-7-yl}phenyl]oxy}ethoxy)ethyl]carbamate × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；50 mM Tris-HCL, 150 mM NaCl, 1mM TCEP
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.82 Å
9NI4 Cryo-EM structure of the PI3K alpha/KRas/HER3 phosphopeptide complex dimer on POPC/POPS/PIP2 nanodiscs 提交 2025-02-25 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 1–1068（1068 aa）
链 B 1–1068（1068 aa）
未记录 A1AZD tert-butyl [2-(2-{[(2P)-2-{4-[4-(2-amino-2-oxoethyl)-2-fluoroanilino]thieno[2,3-d]pyridazin-7-yl}phenyl]oxy}ethoxy)ethyl]carbamate × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；50 mM Tris-HCL, 150 mM NaCl, 1mM TCEP
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.61 Å
9NI5 Cryo-EM structure of the PI3K alpha/KRas/HER3 phosphopeptide complex on POPC/POPS/PIP2 nanodiscs 提交 2025-02-25 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–1068（1068 aa）
未记录 A1AZD tert-butyl [2-(2-{[(2P)-2-{4-[4-(2-amino-2-oxoethyl)-2-fluoroanilino]thieno[2,3-d]pyridazin-7-yl}phenyl]oxy}ethoxy)ethyl]carbamate × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；50 mM Tris-HCL, 150 mM NaCl, 1mM TCEP
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.89 Å
9NI6 Cryo-EM structure of the Class 1 PI3K alpha/KRas complex on POPC/POPS nanodiscs 提交 2025-02-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–1068（1068 aa）
未记录 A1AZD tert-butyl [2-(2-{[(2P)-2-{4-[4-(2-amino-2-oxoethyl)-2-fluoroanilino]thieno[2,3-d]pyridazin-7-yl}phenyl]oxy}ethoxy)ethyl]carbamate × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；50 mM Tris-HCL, 150 mM NaCl, 1mM TCEP
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.01 Å
9NI7 Cryo-EM structure of the Class 3 PI3K alpha/KRas complex on POPC/POPS nanodiscs 提交 2025-02-25 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–1068（1068 aa）
未记录 A1AZD tert-butyl [2-(2-{[(2P)-2-{4-[4-(2-amino-2-oxoethyl)-2-fluoroanilino]thieno[2,3-d]pyridazin-7-yl}phenyl]oxy}ethoxy)ethyl]carbamate × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；50 mM Tris-HCL, 150 mM NaCl, 1mM TCEP
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.05 Å
9NI8 Cryo-EM structure of the Class 2 PI3K alpha/KRas complex on POPC/POPS nanodiscs 提交 2025-02-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–1068（1068 aa）
未记录 A1AZD tert-butyl [2-(2-{[(2P)-2-{4-[4-(2-amino-2-oxoethyl)-2-fluoroanilino]thieno[2,3-d]pyridazin-7-yl}phenyl]oxy}ethoxy)ethyl]carbamate × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；50 mM Tris-HCL, 150 mM NaCl, 1mM TCEP
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.23 Å
9NID Cryo-EM structure of the PI3K alpha/KRas/HER3 phosphopeptide complex dimer on POPC/POPS/PIP2 nanodiscs low-pass filtered to 5 angstroms 提交 2025-02-26 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 1–1068（1068 aa）
链 B 1–1068（1068 aa）
未记录 A1AZD tert-butyl [2-(2-{[(2P)-2-{4-[4-(2-amino-2-oxoethyl)-2-fluoroanilino]thieno[2,3-d]pyridazin-7-yl}phenyl]oxy}ethoxy)ethyl]carbamate × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；50 mM Tris-HCL, 150 mM NaCl, 1mM TCEP
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 5.00 Å
9NIE Cryo-EM structure of the PI3K alpha/KRas/HER3 phosphopeptide complex on POPC/POPS/PIP2 nanodiscs low-pass filtered to 5 angstroms 提交 2025-02-26 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–1068（1068 aa）
未记录 A1AZD tert-butyl [2-(2-{[(2P)-2-{4-[4-(2-amino-2-oxoethyl)-2-fluoroanilino]thieno[2,3-d]pyridazin-7-yl}phenyl]oxy}ethoxy)ethyl]carbamate × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；50 mM Tris-HCL, 150 mM NaCl, 1mM TCEP
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 5.00 Å
9NIF Cryo-EM structure of the PI3K alpha/KRas complex on POPC/POPS/PIP2 nanodiscs low-pass filtered to 5 angstroms 提交 2025-02-26 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–1068（1068 aa）
未记录 PBU (2R)-3-{[(R)-HYDROXY{[(1R,2R,3S,4R,5R,6S)-2,3,6-TRIHYDROXY-4,5-BIS(PHOSPHONOOXY)CYCLOHEXYL]OXY}PHOSPHORYL]OXY}PROPANE-1 ,2-DIYL DIBUTANOATE × 1 A1AZD tert-butyl [2-(2-{[(2P)-2-{4-[4-(2-amino-2-oxoethyl)-2-fluoroanilino]thieno[2,3-d]pyridazin-7-yl}phenyl]oxy}ethoxy)ethyl]carbamate × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；50 mM Tris-HCL, 150 mM NaCl, 1mM TCEP
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 5.00 Å
9NLC Cryo-EM structure of the Class 1 PI3K alpha/KRas complex on POPC/POPS nanodiscs low-pass filtered to 10 angstroms 提交 2025-03-03 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–1068（1068 aa）
未记录 A1AZD tert-butyl [2-(2-{[(2P)-2-{4-[4-(2-amino-2-oxoethyl)-2-fluoroanilino]thieno[2,3-d]pyridazin-7-yl}phenyl]oxy}ethoxy)ethyl]carbamate × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；50 mM Tris-HCL, 150 mM NaCl, 1mM TCEP
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 10.00 Å

共 134 个其他 PDB 条目、145 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 PK3CA_HUMAN
Isoform —
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A； PDB构建体 1–1068； UniProt 1–1068

Phosphatidylinositol 3-kinase regulatory subunit alpha

Homo sapiens

UniProt P27986

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白拷贝数一致 链 B； UniProt 322–600 未记录 Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit alpha isoform × 1 （P42336） UJ3 1-[(1S)-1-(5-fluoranyl-3-methyl-1-benzofuran-2-yl)-2-methyl-propyl]-3-(1-oxidanylidene-2,3-dihydroisoindol-5-yl)urea × 1 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 8 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE 分辨率 3.00 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 8W9B Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
1A0N NMR STUDY OF THE SH3 DOMAIN FROM FYN PROTO-ONCOGENE TYROSINE KINASE COMPLEXED WITH THE SYNTHETIC PEPTIDE P2L CORRESPONDING TO RESIDUES 91-104 OF THE P85 SUBUNIT OF PI3-KINASE, FAMILY OF 25 STRUCTURES 提交 1997-12-05 构建体不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 91–104（14 aa） 片段：P85 SUBUNIT OF PI3-KINASE, RESIDUES 91 - 104
未记录 未记录非水小分子 SOLUTION NMR mmCIF 未提供已读取条件 分辨率未提供
1AZG NMR STUDY OF THE SH3 DOMAIN FROM FYN PROTO-ONCOGENE TYROSINE KINASE KINASE COMPLEXED WITH THE SYNTHETIC PEPTIDE P2L CORRESPONDING TO RESIDUES 91-104 OF THE P85 SUBUNIT OF PI3-KINASE, MINIMIZED AVERAGE (PROBMAP) STRUCTURE 提交 1997-11-18 构建体不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 91–104（14 aa） 片段：P85 SUBUNIT OF PI3-KINASE, RESIDUES 91 - 104
未记录 未记录非水小分子 SOLUTION NMR mmCIF 未提供已读取条件 分辨率未提供
1H9O PHOSPHATIDYLINOSITOL 3-KINASE, P85-ALPHA SUBUNIT: C-TERMINAL SH2 DOMAIN COMPLEXED WITH A TYR751 PHOSPHOPEPTIDE FROM THE PDGF RECEPTOR, CRYSTAL STRUCTURE AT 1.79 A 提交 2001-03-14 构建体不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 617–724（108 aa） 片段：C-TERMINAL SH2 DOMAIN, P85-ALPHA REGULATORY SUBUNIT RESIDUES 617 - 724
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 7；40MG/ML PROTEIN IN 20 MM PHOSPHATE PH6.2 + PEG8000, RESERVOIR WITH SAME PHOSPHATE + PEG8000 + 250MM NACL, pH 7.00
分辨率 1.79 Å R-free 0.219
1PBW STRUCTURE OF BCR-HOMOLOGY (BH) DOMAIN 提交 1996-10-17 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 105–319（215 aa） 片段：P85 ALPHA SUBUNIT BCR-HOMOLOGY DOMAIN
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 2.00 Å R-free 0.235
1PBW STRUCTURE OF BCR-HOMOLOGY (BH) DOMAIN 提交 1996-10-17 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 105–319（215 aa） 片段：P85 ALPHA SUBUNIT BCR-HOMOLOGY DOMAIN
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 2.00 Å R-free 0.235
1PHT PHOSPHATIDYLINOSITOL 3-KINASE P85-ALPHA SUBUNIT SH3 DOMAIN, RESIDUES 1-85 提交 1995-08-17 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–85（85 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 2.00 Å R-free 0.258
1PIC PHOSPHATIDYLINOSITOL 3-KINASE, P85-ALPHA SUBUNIT: C-TERMINAL SH2 DOMAIN COMPLEXED WITH A TYR751 PHOSPHOPEPTIDE FROM THE PDGF RECEPTOR, NMR, MINIMIZED MEAN STRUCTURE 提交 1997-06-23 构建体不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 617–724（108 aa） 片段：C-TERMINAL SH2 DOMAIN, RESIDUES 617 - 724 OF P85-ALPHA REGULATORY SUBUNIT
未记录 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 6.8；296 K
分辨率未提供
1PKS STRUCTURE OF THE PI3K SH3 DOMAIN AND ANALYSIS OF THE SH3 FAMILY 提交 1994-03-07 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–79（79 aa）
未记录 未记录非水小分子 SOLUTION NMR mmCIF 未提供已读取条件 分辨率未提供
1PKT STRUCTURE OF THE PI3K SH3 DOMAIN AND ANALYSIS OF THE SH3 FAMILY 提交 1994-03-07 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–79（79 aa）
未记录 未记录非水小分子 SOLUTION NMR mmCIF 未提供已读取条件 分辨率未提供
2IUG Crystal structure of the PI3-kinase p85 N-terminal SH2 domain 提交 2006-06-03 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 321–440（120 aa） 片段：N-TERMINAL SH2 DOMAIN, RESIDUES 321-440
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 20% PEG4000, 50MM MGCL2, 50MM TRIS PH7.5
分辨率 1.89 Å R-free 0.289
2IUH Crystal structure of the PI3-kinase p85 N-terminal SH2 domain in complex with c-Kit phosphotyrosyl peptide 提交 2006-06-03 构建体不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 321–440（120 aa） 片段：N-TERMINAL SH2 DOMAIN, RESIDUES 321-440
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 0.1M NA CITRATE PH5.6, 0.2M NA/K TARTRATE, 2M AMMONIUM SULFATE
分辨率 2.00 Å R-free 0.245
2IUI Crystal structure of the PI3-kinase p85 N-terminal SH2 domain in complex with PDGFR phosphotyrosyl peptide 提交 2006-06-03 构建体不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 321–440（120 aa） 片段：N-TERMINAL SH2 DOMAIN, RESIDUES 321-440
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 0.1M SODIUM ACETATE PH 4.6, 0.2M AMMONIUM ACETATE, 30% PEG4000
分辨率 2.40 Å R-free 0.248
2IUI Crystal structure of the PI3-kinase p85 N-terminal SH2 domain in complex with PDGFR phosphotyrosyl peptide 提交 2006-06-03 构建体不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 321–440（120 aa） 片段：N-TERMINAL SH2 DOMAIN, RESIDUES 321-440
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 0.1M SODIUM ACETATE PH 4.6, 0.2M AMMONIUM ACETATE, 30% PEG4000
分辨率 2.40 Å R-free 0.248
2RD0 Structure of a human p110alpha/p85alpha complex 提交 2007-09-20 构建体不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 322–600（279 aa） 片段：UNP residues 322-600
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 7；293 K；Sodium Formate, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, temperature 293K
分辨率 3.05 Å R-free 0.323
2V1Y Structure of a phosphoinositide 3-kinase alpha adaptor-binding domain (ABD) in a complex with the iSH2 domain from p85 alpha 提交 2007-05-30 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 431–600（170 aa） 片段：INTER-SH2 DOMAIN (ISH2), RESIDUES 431-600
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 7；0.2M MG(NO3)2, 20% PEG3350 (HAMPTON), 5MM TRIS-HCL PH 7.0 (25C), 5% GLYCEROL AND 5MM FRESH DTT
分辨率 2.40 Å R-free 0.292
3HHM Crystal structure of p110alpha H1047R mutant in complex with niSH2 of p85alpha and the drug wortmannin 提交 2009-05-15 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 322–694（373 aa） 片段：UNP residues 322-694
突变：D330N KWT (1S,6BR,9AS,11R,11BR)-9A,11B-DIMETHYL-1-[(METHYLOXY)METHYL]-3,6,9-TRIOXO-1,6,6B,7,8,9,9A,10,11,11B-DECAHYDRO-3H-FURO[4, 3,2-DE]INDENO[4,5-H][2]BENZOPYRAN-11-YL ACETATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.8；298 K；Na formate, pH 6.8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 2.80 Å R-free 0.307
3HIZ Crystal structure of p110alpha H1047R mutant in complex with niSH2 of p85alpha 提交 2009-05-20 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 322–694（373 aa） 片段：UNP residues 322-694
突变：D330N 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.8；298 K；Na formate, pH 6.8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 3.30 Å R-free 0.333
3I5R PI3K SH3 domain in complex with a peptide ligand 提交 2009-07-06 构建体不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–83（83 aa） 片段：SH3 domain (UNP residues 1-83)
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 10.5；293 K；100mM CAPS, 2M ammonium sulfate, 0.2M lithium sulfate, pH 10.5, VAPOR DIFFUSION, temperature 293.0K
分辨率 1.70 Å R-free 0.223
3I5S Crystal structure of PI3K SH3 提交 2009-07-06 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–83（83 aa） 片段：SH3 domain (UNP residues 1-83)
未记录 SO4 SULFATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 5.5；293 K；100mM Na-citrate, 0.5M ammonium sulfate, 1M lithium sulfate, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, temperature 293.0K
分辨率 3.00 Å R-free 0.299
3I5S Crystal structure of PI3K SH3 提交 2009-07-06 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 1–83（83 aa） 片段：SH3 domain (UNP residues 1-83)
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 5.5；293 K；100mM Na-citrate, 0.5M ammonium sulfate, 1M lithium sulfate, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, temperature 293.0K
分辨率 3.00 Å R-free 0.299
3I5S Crystal structure of PI3K SH3 提交 2009-07-06 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 C 1–83（83 aa） 片段：SH3 domain (UNP residues 1-83)
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 5.5；293 K；100mM Na-citrate, 0.5M ammonium sulfate, 1M lithium sulfate, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, temperature 293.0K
分辨率 3.00 Å R-free 0.299
3I5S Crystal structure of PI3K SH3 提交 2009-07-06 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 D 1–83（83 aa） 片段：SH3 domain (UNP residues 1-83)
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 5.5；293 K；100mM Na-citrate, 0.5M ammonium sulfate, 1M lithium sulfate, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, temperature 293.0K
分辨率 3.00 Å R-free 0.299
4A55 Crystal structure of p110alpha in complex with iSH2 of p85alpha and the inhibitor PIK-108 提交 2011-10-24 构建体不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 322–600（279 aa） 片段：NISH2, RESIDUES 322-600
未记录 P08 PIK-108 × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 6.4；0.1 M NAK PHOSPHATE PH 6.4, 0.14 M NH4H2SO4, 0.1 M NA FORMATE, 0.42 M NA2SO4, 15% ETHYLENE GLYCOL
分辨率 3.50 Å R-free 0.228
4JPS Co-crystal Structures of the Lipid Kinase PI3K alpha with Pan and Isoform Selective Inhibitors 提交 2013-03-19 构建体不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 307–593（287 aa）
未记录 SCN THIOCYANATE ION × 1 1LT (2S)-N~1~-{4-methyl-5-[2-(1,1,1-trifluoro-2-methylpropan-2-yl)pyridin-4-yl]-1,3-thiazol-2-yl}pyrrolidine-1,2-dicarboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；303 K；12% PEG 3350, 120MM KSCN, 6uL protein to 4uL well with streak seeding at 18C , pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 303K
分辨率 2.20 Å R-free 0.228
4L1B Crystal Structure of p110alpha complexed with niSH2 of p85alpha 提交 2013-06-03 构建体不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 318–615（298 aa） 片段：niSH2 of p85alpha, UNP residues 318-615
未记录 SO4 SULFATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；291 K；0.15 M Lithium sulfate, 0.1 M Tris PH 8.5, 30%(W/V) PEG 1000MME, vapor diffusion, hanging drop, temperature 291K
分辨率 2.59 Å R-free 0.274
4L23 Crystal Structure of p110alpha complexed with niSH2 of p85alpha and PI-103 提交 2013-06-04 构建体不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 318–615（298 aa） 片段：niSH2 of p85alpha, UNP residues 318-615
未记录 X6K 3-(4-MORPHOLIN-4-YLPYRIDO[3',2':4,5]FURO[3,2-D]PYRIMIDIN-2-YL)PHENOL × 1 SO4 SULFATE ION × 2 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；291 K；0.15 M Lithium sulfate, 0.1 M Tris PH 8.5, 30%(W/V) PEG 1000MME, vapor diffusion, hanging drop, temperature 291K
分辨率 2.50 Å R-free 0.273
4L2Y Crystal Structure of p110alpha complexed with niSH2 of p85alpha and compound 9d 提交 2013-06-05 构建体不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 318–615（298 aa） 片段：niSH2 of p85alpha, UNP residues 318-615
未记录 XXK 3-amino-5-[4-(morpholin-4-yl)pyrido[3',2':4,5]furo[3,2-d]pyrimidin-2-yl]phenol × 1 SO4 SULFATE ION × 2 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；291 K；0.15 M Lithium sulfate, 0.1 M Tris PH 8.5, 30%(W/V) PEG 1000MME, vapor diffusion, hanging drop, temperature 291K
分辨率 2.80 Å R-free 0.271
4OVU Crystal Structure of p110alpha in complex with niSH2 of p85alpha 提交 2014-01-14 构建体不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 322–600（279 aa） 片段：UNP residues 322-600
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.8；298 K；NaFormate
分辨率 2.96 Å R-free 0.272
4OVV Crystal Structure of PI3Kalpha in complex with diC4-PIP2 提交 2014-01-14 构建体不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 322–600（279 aa） 片段：UNP residues 322-600
未记录 PBU (2R)-3-{[(R)-HYDROXY{[(1R,2R,3S,4R,5R,6S)-2,3,6-TRIHYDROXY-4,5-BIS(PHOSPHONOOXY)CYCLOHEXYL]OXY}PHOSPHORYL]OXY}PROPANE-1 ,2-DIYL DIBUTANOATE × 2 PO4 PHOSPHATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.8；298 K；NaFormate
分辨率 3.50 Å R-free 0.339
4WAF Crystal Structure of a novel tetrahydropyrazolo[1,5-a]pyrazine in an engineered PI3K alpha 提交 2014-08-29 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 2–317（316 aa） 片段：UNP residues 2-317
突变：T12Y 3K6 N,N-dimethyl-4-[(6R)-6-methyl-5-(1H-pyrrolo[2,3-b]pyridin-4-yl)-4,5,6,7-tetrahydropyrazolo[1,5-a]pyrazin-3-yl]benzenesulfonamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；303.15 K；12% PEG 3350, 120mM potassium thiocyanate
分辨率 2.39 Å R-free 0.247
4YKN Pi3K alpha lipid kinase with Active Site Inhibitor 提交 2015-03-04 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 318–615（298 aa） 片段：UNP P27986 residues 318-615, LINKER (GSPGISGGGGG), P42336 residues 2-1068
未记录 4EL 3-(6-methoxypyridin-3-yl)-5-[({4-[(5-methyl-1,3,4-thiadiazol-2-yl)sulfamoyl]phenyl}amino)methyl]benzoic acid × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；ethylenene glycol, PIP2
分辨率 2.90 Å R-free 0.247
4ZOP Co-crystal Structure of Lipid Kinase PI3K alpha with a selective phosphatidylinositol-3 kinase alpha inhibitor 提交 2015-05-06 构建体不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 1–290（290 aa）
未记录 4Q2 (2S,3R)-N~1~-(8-tert-butyl-4,5-dihydro[1,3]thiazolo[4,5-h]quinazolin-2-yl)-3-methylpyrrolidine-1,2-dicarboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；303 K；12% PEG 3350, 120MM KSCN, 6UL PROTEIN TO 4UL WELL WITH STREAK SEEDING AT 18C , PH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
分辨率 2.62 Å R-free 0.258
5AUL PI3K p85 C-terminal SH2 domain/CD28-derived peptide complex 提交 2015-04-28 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 622–728（107 aa） 片段：UNP residues 614-720
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；100 mM Sodium Acetate trihydrate, 200 mM Ammonium Acetate, 30% PEG4000
分辨率 1.10 Å R-free 0.160
5FI4 Discovery of imidazo[1,2-a]-pyridine inhibitors of pan-PI3 kinases that are efficacious in a mouse xenograft model 提交 2015-12-22 构建体不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 2–317（316 aa） 片段：UNP residues 2-317
未记录 GOL GLYCEROL × 1 5XV ~{N}-[6-[5-azanyl-6-[(2~{S})-1,1,1-tris(fluoranyl)propan-2-yl]oxy-pyrazin-2-yl]imidazo[1,2-a]pyridin-2-yl]ethanamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；303.15 K；12.5% PEG 3350, 125 mM KSCN Drops were 5uL protein: 3uL well solutions and streak seeded.
分辨率 2.50 Å R-free 0.245
5GJI PI3K p85 N-terminal SH2 domain/CD28-derived peptide complex 提交 2016-06-30 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 325–430（106 aa） 片段：UNP residues 325-430
突变：D330N SO4 SULFATE ION × 3 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.6；293 K；100mM Sodium acetate trihydrate, 30% PEG MME 2000, 200mM Ammonium sulfate
分辨率 0.90 Å R-free 0.145
5ITD Crystal structure of PI3K alpha with PI3K delta inhibitor 提交 2016-03-16 构建体不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 2–317（316 aa） 片段：UNP residues 2-317
未记录 6CY 5-{4-[3-(4-acetylpiperazine-1-carbonyl)phenyl]quinazolin-6-yl}-2-methoxypyridine-3-carbonitrile × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.2；303.15 K；3 uL of protein was mixed with 5 uL of well solution containing 12% PEG 3350 and 120 mM potassium thiocyanate
分辨率 3.02 Å R-free 0.241
5M6U HUMAN PI3KDELTA IN COMPLEX WITH LASW1579 提交 2016-10-26 构建体不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 1–724（724 aa） 片段：UNP residues 431-599
未记录 7KA 4-azanyl-6-[[(1~{S})-1-(4-oxidanylidene-3-phenyl-pyrrolo[2,1-f][1,2,4]triazin-2-yl)ethyl]amino]pyrimidine-5-carbonitrile × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；NULL
分辨率 2.85 Å R-free 0.309
5SW8 Crystal structure of PI3Kalpha in complex with fragments 7 and 11 提交 2016-08-08 构建体不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 322–600（279 aa） 片段：residues 322-600
未记录 EPE 4-(2-HYDROXYETHYL)-1-PIPERAZINE ETHANESULFONIC ACID × 1 70S 2H-indazol-5-amine × 1 FB1 2-CHLOROBENZENESULFONAMIDE × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；298 K；NaFormate
分辨率 3.30 Å R-free 0.298
5SWG Crystal Structure of PI3Kalpha in complex with fragments 5 and 21 提交 2016-08-08 构建体不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 322–600（279 aa） 片段：residues 322-600
未记录 AX7 1H-benzimidazol-2-amine × 1 CAQ CATECHOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；298 K；NaFormate
分辨率 3.11 Å R-free 0.262
5SWO Crystal Structure of PI3Kalpha in complex with fragments 4 and 19 提交 2016-08-08 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 322–600（279 aa）
未记录 CL CHLORIDE ION × 1 70T 2-methyl-5-nitro-1H-indole × 1 2ZV 4-methyl-3-nitropyridin-2-amine × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；298 K；NaFormate
分辨率 3.50 Å R-free 0.274
5SWP Crystal Structure of PI3Kalpha in complex with fragments 6 and 24 提交 2016-08-08 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 322–600（279 aa）
未记录 70W tert-butyl 4-aminopiperidine-1-carboxylate × 2 70V 2-methylcyclohexane-1,3-dione × 2 CL CHLORIDE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；298 K；NaFormate
分辨率 3.41 Å R-free 0.296
5SWR Crystal Structure of PI3Kalpha in complex with fragments 20 and 26 提交 2016-08-08 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 322–600（279 aa）
未记录 718 6-hydroxy-3,4-dihydronaphthalen-1(2H)-one × 1 CL CHLORIDE ION × 2 SAL 2-HYDROXYBENZOIC ACID × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；298 K；NaFormate
分辨率 3.31 Å R-free 0.273
5SWT Crystal Structure of PI3Kalpha in complex with fragments 17 and 27 提交 2016-08-08 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 322–600（279 aa）
未记录 71A pyridin-3-ol × 1 71B 3-fluoro-4-methoxyaniline × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；298 K；NaFormate
分辨率 3.49 Å R-free 0.285
5SX8 Crystal Structure of PI3Kalpha in complex with fragments 12 and 15 提交 2016-08-09 构建体不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 322–600（279 aa） 片段：residues 322-600
未记录 71M 6-methylpyridin-2-amine × 2 LUZ pteridine-2,4(1H,3H)-dione × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；298 K；NaFormate
分辨率 3.47 Å R-free 0.276
5SX9 Crystal Structure of PI3Kalpha in complex with fragment 14 提交 2016-08-09 构建体不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 322–600（279 aa） 片段：residues 322-600
未记录 71L 4,6-dimethylpyridin-2-amine × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；298 K；NaFormate
分辨率 3.52 Å R-free 0.277
5SXA Crystal Structure of PI3Kalpha in complex with fragment 10 提交 2016-08-09 构建体不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 322–600（279 aa） 片段：residues 322-600
未记录 71N 2-(trifluoromethyl)-1H-benzimidazol-5-amine × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；298 K；NaFormate
分辨率 3.35 Å R-free 0.275
5SXB Crystal Structure of PI3Kalpha in complex with fragment 23 提交 2016-08-09 构建体不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 322–600（279 aa） 片段：residues 322-600
未记录 SOA ISATOIC ANHYDRIDE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；298 K；NaFormate
分辨率 3.30 Å R-free 0.278
5SXC Crystal Structure of PI3Kalpha in complex with fragment 8 提交 2016-08-09 构建体不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 322–600（279 aa） 片段：residues 322-600
未记录 URF 5-FLUOROURACIL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；298 K；NaFormate
分辨率 3.55 Å R-free 0.268
5SXD Crystal Structure of PI3Kalpha in complex with fragment 22 提交 2016-08-09 构建体不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 322–600（279 aa） 片段：residues 322-600
未记录 71F 2-methoxybenzoic acid × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；298 K；NaFormate
分辨率 3.50 Å R-free 0.276
5SXE Crystal Structure of PI3Kalpha in complex with fragments 19 and 28 提交 2016-08-09 构建体不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 322–600（279 aa） 片段：residues 322-600
未记录 71G 3-aminobenzonitrile × 1 ES3 4-bromo-1H-imidazole × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；298 K；NaFormate
分辨率 3.51 Å R-free 0.271
5SXF Crystal Structure of PI3Kalpha in complex with fragment 9 提交 2016-08-09 构建体不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 322–600（279 aa） 片段：residues 322-600
未记录 HPP HYDROXYPHENYL PROPIONIC ACID × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；298 K；NaFormate
分辨率 3.46 Å R-free 0.267
5SXI Crystal Structure of PI3Kalpha in complex with fragment 13 提交 2016-08-09 构建体不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 322–600（279 aa） 片段：residues 322-600
未记录 71J trans-cyclohexane-1,4-diol × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；298 K；NaFormate
分辨率 3.40 Å R-free 0.279
5SXJ Crystal Structure of PI3Kalpha in complex with fragment 29 提交 2016-08-09 构建体不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 322–600（279 aa） 片段：residues 322-600
未记录 BHO BENZHYDROXAMIC ACID × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；298 K；NaFormate
分辨率 3.42 Å R-free 0.279
5SXK Crystal Structure of PI3Kalpha in complex with fragment 18 提交 2016-08-09 构建体不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 322–600（279 aa） 片段：residues 322-600
未记录 71K 2-methylbenzene-1,3-diamine × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；298 K；NaFormate
分辨率 3.55 Å R-free 0.278
5UBT CRYSTAL STRUCTURE OF PI3K DELTA IN COMPLEX WITH A 7-(3-(PIPERAZIN-1-YL)PHENYL)PYRROLO[2,1-F][1,2,4] TRIAZIN-4-AMINE DERIVIATINE 提交 2016-12-21 构建体不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 432–599（168 aa）
未记录 85S 1-[4-(3-{4-amino-5-[1-(oxan-4-yl)-1H-pyrazol-5-yl]pyrrolo[2,1-f][1,2,4]triazin-7-yl}phenyl)piperazin-1-yl]ethan-1-one × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；293 K；NULL
分辨率 2.83 Å R-free 0.268
5UK8 The co-structure of (R)-4-(6-(1-(cyclopropylsulfonyl)cyclopropyl)-2-(1H-indol-4-yl)pyrimidin-4-yl)-3-methylmorpholine and a rationally designed PI3K-alpha mutant that mimics ATR 提交 2017-01-20 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 1–293（293 aa）
突变：T6Y 8DV (R)-4-(6-(1-(cyclopropylsulfonyl)cyclopropyl)-2-(1H-indol-4-yl)pyrimidin-4-yl)-3-methylmorpholine × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.2；303.15 K；3 UL OF PROTEIN WAS MIXED WITH 5 UL OF WELL SOLUTION CONTAINING 12% PEG 3350 AND 120 MM POTASSIUM THIOCYANATE, PH 7.2, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, TEMPERATURE 303.15K
分辨率 2.50 Å R-free 0.240
5UKJ The co-structure of N,N-dimethyl-4-[(6R)-6-methyl-5-(1H-pyrrolo[2,3- b]pyridin-4-yl)-4,5,6,7-tetrahydropyrazolo[1,5- a]pyrazin-3-yl]benzenesulfonamide and a rationally designed PI3K-alpha mutant that mimics ATR 提交 2017-01-23 构建体不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 1–293（293 aa）
未记录 3K6 N,N-dimethyl-4-[(6R)-6-methyl-5-(1H-pyrrolo[2,3-b]pyridin-4-yl)-4,5,6,7-tetrahydropyrazolo[1,5-a]pyrazin-3-yl]benzenesulfonamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.2；303.15 K；3 UL OF PROTEIN WAS MIXED WITH 5 UL OF WELL SOLUTION CONTAINING 12% PEG 3350 AND 120 MM POTASSIUM THIOCYANATE, PH 7.2, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP,
分辨率 2.80 Å R-free 0.252
5UL1 The co-structure of 3-amino-6-(4-((1-(dimethylamino)propan-2-yl)sulfonyl)phenyl)-N-phenylpyrazine-2-carboxamide and a rationally designed PI3K-alpha mutant that mimics ATR 提交 2017-01-23 构建体不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 1–293（293 aa）
未记录 8DY 3-amino-6-(4-{[(2S)-1-(dimethylamino)propan-2-yl]sulfonyl}phenyl)-N-phenylpyrazine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.2；303.15 K；3 UL OF PROTEIN WAS MIXED WITH 5 UL OF WELL SOLUTION CONTAINING 12% PEG 3350 AND 120 MM POTASSIUM THIOCYANATE, PH 7.2, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
分辨率 3.00 Å R-free 0.260
5VLR CRYSTAL STRUCTURE OF PI3K DELTA IN COMPLEX WITH A TRIFLUORO-ETHYL-PYRAZOL-PYROLOTRIAZINE INHIBITOR 提交 2017-04-26 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 431–600（170 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；300 K；NULL, VAPOR DIFFUSION, TEMPERATURE 293K
分辨率 2.80 Å R-free 0.279
5VLR CRYSTAL STRUCTURE OF PI3K DELTA IN COMPLEX WITH A TRIFLUORO-ETHYL-PYRAZOL-PYROLOTRIAZINE INHIBITOR 提交 2017-04-26 构建体不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 431–600（170 aa）
未记录 9EM 4-acetyl-1-(3-{4-amino-5-[1-(2,2,2-trifluoroethyl)-1H-pyrazol-5-yl]pyrrolo[2,1-f][1,2,4]triazin-7-yl}phenyl)-3,3-dimethylpiperazin-2-one × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；300 K；NULL, VAPOR DIFFUSION, TEMPERATURE 293K
分辨率 2.80 Å R-free 0.279
5XGH Crystal structure of PI3K complex with an inhibitor 提交 2017-04-13 构建体不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 322–598（277 aa） 片段：UNP residues 322-598
未记录 84U 3-[(4-fluorophenyl)methylamino]-5-(4-morpholin-4-ylthieno[3,2-d]pyrimidin-2-yl)phenol × 1 GOL GLYCEROL × 1 SO4 SULFATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291.15 K；0.15M Lithium sulfate, 0.1M Tris-HCl pH 8.5, 28%(W/V) PEG2000MME
分辨率 2.97 Å R-free 0.280
5XGI Crystal structure of PI3K complex with an inhibitor 提交 2017-04-13 构建体不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 322–598（277 aa） 片段：UNP residues 322-598
未记录 84R 3-azanyl-5-(4-morpholin-4-ylthieno[3,2-d]pyrimidin-2-yl)phenol × 1 P6G HEXAETHYLENE GLYCOL × 1 SO4 SULFATE ION × 3 GOL GLYCEROL × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291.15 K；0.15M Lithium sulfate, 0.1M Tris-HCl pH 8.5, 28%(W/V) PEG2000MME
分辨率 2.56 Å R-free 0.290
5XGJ Crystal structure of PI3K complex with an inhibitor 提交 2017-04-13 构建体不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 322–599（278 aa） 片段：UNP residues 322-598
未记录 84X 3-(4-morpholin-4-ylfuro[3,2-d]pyrimidin-2-yl)-5-[(phenylmethyl)amino]phenol × 1 SO4 SULFATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291.15 K；0.15M Lithium sulfate, 0.1M Tris-HCl pH 8.5, 28%(W/V) PEG2000MME
分辨率 2.97 Å R-free 0.279
6NCT Structure of p110alpha/niSH2 - vector data collection 提交 2018-12-12 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 322–600（279 aa）
未记录 144 TRIS-HYDROXYMETHYL-METHYL-AMMONIUM × 2 SO4 SULFATE ION × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；298 K；0.1 M Hepes, 1.4-1.6 M sodium formate
分辨率 3.35 Å R-free 0.271
6PYR Human PI3Kdelta in complex with Compound 2-10 ((3S)-3-benzyl-3-methyl-5-[5-(2-methylpyrimidin-5-yl)pyrazolo[1,5-a]pyrimidin-3-yl]-1,3-dihydro-2H-indol-2-one) 提交 2019-07-30 构建体不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 131–299（169 aa） 片段：UNP residues 131-299
未记录 P5J (3S)-3-benzyl-3-methyl-5-[5-(2-methylpyrimidin-5-yl)pyrazolo[1,5-a]pyrimidin-3-yl]-1,3-dihydro-2H-indol-2-one × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；293 K；12-14% PEG6000, 100 mM MES/NaOH, pH 5.75, 5 mM DTT
分辨率 2.21 Å R-free 0.259
6PYU Human PI3Kdelta in complex with Compound 4-2 ((3S)-1'-(cyclopropanecarbonyl)-5-(quinoxalin-6-yl)spiro[indole-3,2'-pyrrolidin]-2(1H)-one) 提交 2019-07-30 构建体不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 131–299（169 aa） 片段：UNP residues 131-299
未记录 P5V (3S)-1'-(cyclopropanecarbonyl)-5-(quinoxalin-6-yl)spiro[indole-3,2'-pyrrolidin]-2(1H)-one × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；293 K；not available
分辨率 2.54 Å R-free 0.292
7CIO Molecular interactions of cytoplasmic region of CTLA-4 with SH2 domains of PI3-kinase 提交 2020-07-08 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 614–720（107 aa）
突变：C656S, C659V, C670L 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.6；293 K；0.2 M ammonium acetate, 0.1 M sodium acetate trihydrate pH 4.6, 30% PEG 4000
分辨率 1.10 Å R-free 0.179
7LM2 HUMAN PI3KDELTA IN COMPLEX WITH COMPOUND 3C 提交 2021-02-05 构建体不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 131–299（169 aa）
未记录 Y5Y cyclopropyl[(3S)-3-{[9-ethyl-8-(2-methylpyrimidin-5-yl)-9H-purin-6-yl]amino}pyrrolidin-1-yl]methanone × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 SO4 SULFATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；293 K；12-14% PEG6000, 100 MM MES/NAOH, PH 5.75, 5 MM DTT
分辨率 2.79 Å R-free 0.289
7LQ1 HUMAN PI3KDELTA IN COMPLEX WITH COMPOUND 28 提交 2021-02-12 构建体不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 131–299（169 aa）
未记录 YA7 N-(5-(6-(2-((2S,6R)-2,6-dimethylmorpholino)pyridin-4-yl)-1-oxoisoindolin-4-yl)-2-methoxypyridin-3-yl)methanesulfonamide × 1 CL CHLORIDE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；293 K；16% PEG6000, 0.10 M KCL, 0.10 M MES PH 6.0
分辨率 2.96 Å R-free 0.281
7MYN Cryo-EM Structure of p110alpha in complex with p85alpha 提交 2021-05-21 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 3–724（722 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.79 Å
7MYO Cryo-EM structure of p110alpha in complex with p85alpha inhibited by BYL-719 提交 2021-05-21 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 3–724（722 aa）
未记录 1LT (2S)-N~1~-{4-methyl-5-[2-(1,1,1-trifluoro-2-methylpropan-2-yl)pyridin-4-yl]-1,3-thiazol-2-yl}pyrrolidine-1,2-dicarboxamide × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.92 Å
7PG5 Crystal Structure of PI3Kalpha 提交 2021-08-13 构建体不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 307–593（287 aa）
未记录 PO4 PHOSPHATE ION × 2 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293.15 K；10% PEG 5K MME (w/v), 160 nM KSCN, 100 mM sodium cacodylate pH 6.5.
分辨率 2.20 Å R-free 0.246
7PG6 Crystal Structure of PI3Kalpha in complex with the inhibitor NVP-BYL719 提交 2021-08-13 构建体不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 307–593（287 aa）
未记录 1LT (2S)-N~1~-{4-methyl-5-[2-(1,1,1-trifluoro-2-methylpropan-2-yl)pyridin-4-yl]-1,3-thiazol-2-yl}pyrrolidine-1,2-dicarboxamide × 1 NA SODIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；10% PEG 5000, 160 mM KSCN and 100 mM sodium cacodylate pH 6.5
分辨率 2.50 Å R-free 0.240
7RNS nSH2 domain of p85-alpha subunit of phosphatidylinositol 3-kinase in complex with an actin peptide with phosphorylated tyrosine 53 提交 2021-07-29 构建体不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 51–164（114 aa）
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 6 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；292 K；0.05 M cadmium sulfate hydrate, 0.1 M HEPES, pH 7.5, 1.0 M sodium acetate trihydrate
分辨率 1.14 Å R-free 0.147
7TZ7 PI3K alpha in complex with an inhibitor 提交 2022-02-15 构建体不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 1–291（291 aa）
未记录 KVJ (4S,5R)-3-[2'-amino-2-(morpholin-4-yl)-4'-(trifluoromethyl)[4,5'-bipyrimidin]-6-yl]-4-(hydroxymethyl)-5-methyl-1,3-oxazolidin-2-one × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；303.15 K；0.15M Potassium Thiocyanate, 20% PEG 3350
分辨率 2.41 Å R-free 0.277
8DCP PI 3-kinase alpha with nanobody 3-126 提交 2022-06-17 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 3–724（722 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.41 Å
8DCX PI 3-kinase alpha with nanobody 3-159 提交 2022-06-17 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 3–724（722 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
8DD4 PI 3-kinase alpha with nanobody 3-142 提交 2022-06-17 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 3–724（722 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8DD8 PI 3-kinase alpha with nanobody 3-142, crosslinked with DSG 提交 2022-06-17 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 3–724（722 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
8GUB Cryo-EM structure of cancer-specific PI3Kalpha mutant H1047R in complex with BYL-719 提交 2022-09-11 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 3–724（722 aa）
未记录 1LT (2S)-N~1~-{4-methyl-5-[2-(1,1,1-trifluoro-2-methylpropan-2-yl)pyridin-4-yl]-1,3-thiazol-2-yl}pyrrolidine-1,2-dicarboxamide × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.73 Å
8H36 Cryo-EM Structure of the KBTBD2-CUL3-Rbx1-p85a dimeric complex 提交 2022-10-08 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 G 1–724（724 aa）
链 H 1–724（724 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.60 Å
8H37 Cryo-EM Structure of the KBTBD2-CUL3-Rbx1-p85a tetrameric complex 提交 2022-10-08 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric
链 G 1–724（724 aa）
链 H 1–724（724 aa）
链 I 1–724（724 aa）
链 J 1–724（724 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 12 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 7.52 Å
8ILR Cryo-EM structure of PI3Kalpha in complex with compound 16 提交 2023-03-04 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 3–724（722 aa）
未记录 7TZ N-[(2S)-1-(ethylamino)-1-oxidanylidene-3-[4-(2-quinoxalin-6-ylethynyl)phenyl]propan-2-yl]-2,3-dimethyl-quinoxaline-6-carboxamide × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.05 Å
8ILS Cryo-EM structure of PI3Kalpha in complex with compound 17 提交 2023-03-04 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 3–724（722 aa）
未记录 7U5 N-[(2R)-1-(ethylamino)-1-oxidanylidene-3-[4-(2-quinoxalin-6-ylethynyl)phenyl]propan-2-yl]-2,3-dimethyl-quinoxaline-6-carboxamide × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8ILV Cryo-EM structure of PI3Kalpha in complex with compound 18 提交 2023-03-04 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 3–724（722 aa）
未记录 L2V N-[(2R)-1-(ethylamino)-1-oxidanylidene-3-[3-(2-quinoxalin-6-ylethynyl)phenyl]propan-2-yl]-2,3-dimethyl-quinoxaline-6-carboxamide × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.19 Å
8SBC Co-structure of Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit alpha isoform and brain penetrant inhibitors 提交 2023-04-03 构建体不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 1–293（293 aa）
未记录 ZTV (2M)-7-[(3R)-3-methylmorpholin-4-yl]-5-[(3S)-3-methylmorpholin-4-yl]-2-(pyridin-2-yl)-1H-imidazo[4,5-b]pyridine × 1 SO4 SULFATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.2；303 K；RESERVOIR SOLUTION : 12%-20% PEG 3350, 0.125M-0.20M KSCN PROTEIN SOLUTION : 20MM TRIS PH 7.2, 200MM NACL, 1% BETAINE, 1% ETHYLENE GLYCOL, 0.02% CHAPS, 5MM DTT, PROTEIN IS 7.4 MG/ML FORMATION METHOD : SOAKING PROTOCOL : SET UP APO XTALS DROPS IN 1:1 RATIO IN 30C, REMARK 280 XTALS GROW OVERNIGHT, THEN ADD 2MM OF STOCK CPD AND INCUBATE FOR A FEW HOURS METHOD : VAPOR DIFFUSION - HANGING DROP TEMPERATURE : 303.0 CRYO PROTOCOL : 20% ETHYLENE GLYCOL PLUS WELL SOLUTION
分辨率 2.30 Å R-free 0.271
8SBJ Co-structure Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit alpha isoform complexed with brain penetrant inhibitors 提交 2023-04-03 构建体不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 1–293（293 aa）
未记录 ZUO (2M)-7-[(3R)-3-methylmorpholin-4-yl]-5-[(3S)-3-methylmorpholin-4-yl]-2-(1H-pyrazol-3-yl)-3H-imidazo[4,5-b]pyridine × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.2；303 K；RESERVOIR SOLUTION : 12%-20% PEG 3350, 0.125M-0.20M KSCN; PROTEIN SOLUTION: 20MM TRIS PH 7.2, 200MM NACL, 1% BETAINE, 1% ETHYLENE GLYCOL, 0.02% CHAPS, 5MM DTT, PROTEIN IS 7.4 MG/ML, FORMATION METHOD : SOAKING, PROTOCOL: SET UP APO XTALS DROPS IN 1:1 RATIO IN 30C, XTALS GROW OVERNIGHT, THEN ADD 2MM OF STOCK CPD AND INCUBATE FOR A FEW HOURS; CRYO PROTOCOL: 20% ETHYLENE GLYCOL PLUS WELL SOLUTION
分辨率 3.10 Å R-free 0.257
8TDU STX-478, a Mutant-Selective, Allosteric Inhibitor bound to PI3Kalpha 提交 2023-07-05 构建体不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 8–293（286 aa）
未记录 X3N N~2~-{(4S,11aP)-2-[(4S)-4-(difluoromethyl)-2-oxo-1,3-oxazolidin-3-yl]-5,6-dihydroimidazo[1,2-d][1,4]benzoxazepin-9-yl}-L-alaninamide × 1 ZWE N-(2-aminopyrimidin-5-yl)-N'-[(1R)-1-(5,7-difluoro-3-methyl-1-benzofuran-2-yl)-2,2,2-trifluoroethyl]urea × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；298 K；0.1 M MES pH 6.8, 500mM NaCl, 8% w/v PEG 3350
分辨率 3.11 Å R-free 0.267
8TDU STX-478, a Mutant-Selective, Allosteric Inhibitor bound to PI3Kalpha 提交 2023-07-05 构建体不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 D 8–293（286 aa）
未记录 X3N N~2~-{(4S,11aP)-2-[(4S)-4-(difluoromethyl)-2-oxo-1,3-oxazolidin-3-yl]-5,6-dihydroimidazo[1,2-d][1,4]benzoxazepin-9-yl}-L-alaninamide × 1 ZWE N-(2-aminopyrimidin-5-yl)-N'-[(1R)-1-(5,7-difluoro-3-methyl-1-benzofuran-2-yl)-2,2,2-trifluoroethyl]urea × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；298 K；0.1 M MES pH 6.8, 500mM NaCl, 8% w/v PEG 3350
分辨率 3.11 Å R-free 0.267
8TGD STX-478, a Mutant-Selective, Allosteric Inhibitor bound to H1047R PI3Kalpha 提交 2023-07-12 构建体不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 8–293（286 aa）
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 10 X3N N~2~-{(4S,11aP)-2-[(4S)-4-(difluoromethyl)-2-oxo-1,3-oxazolidin-3-yl]-5,6-dihydroimidazo[1,2-d][1,4]benzoxazepin-9-yl}-L-alaninamide × 1 ZWE N-(2-aminopyrimidin-5-yl)-N'-[(1R)-1-(5,7-difluoro-3-methyl-1-benzofuran-2-yl)-2,2,2-trifluoroethyl]urea × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.8；293 K；0.5 M NaCl, 0.1 M MES-NaOH pH 6.8, 5% w/v PEG 3350
分辨率 2.93 Å R-free 0.252
8TGD STX-478, a Mutant-Selective, Allosteric Inhibitor bound to H1047R PI3Kalpha 提交 2023-07-12 构建体不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 D 8–293（286 aa）
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 3 X3N N~2~-{(4S,11aP)-2-[(4S)-4-(difluoromethyl)-2-oxo-1,3-oxazolidin-3-yl]-5,6-dihydroimidazo[1,2-d][1,4]benzoxazepin-9-yl}-L-alaninamide × 1 ZWE N-(2-aminopyrimidin-5-yl)-N'-[(1R)-1-(5,7-difluoro-3-methyl-1-benzofuran-2-yl)-2,2,2-trifluoroethyl]urea × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.8；293 K；0.5 M NaCl, 0.1 M MES-NaOH pH 6.8, 5% w/v PEG 3350
分辨率 2.93 Å R-free 0.252
8TS7 Human PI3K p85alpha/p110alpha 提交 2023-08-11 构建体不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 318–615（298 aa） 片段：residues 318-615
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；0.1 M Hepes pH 7.5, 9% PEG-3350
分辨率 2.71 Å R-free 0.288
8TS8 p85alpha/p110alpha heterodimer H1047R mutant 提交 2023-08-11 构建体不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 318–615（298 aa） 片段：residues 318-615
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；0.1 M Hepes pH 7.5, 9% PEG-3350
分辨率 2.72 Å R-free 0.265
8TS9 Human PI3K p85alpha/p110alpha H1047R bound to compound 1 提交 2023-08-11 构建体不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 318–615（298 aa） 片段：residues 318-615
未记录 UE9 5-[3-fluoro-5-(trifluoromethyl)benzamido]-N-methyl-6-(2-methylanilino)pyridine-3-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；0.1 M Hepes pH 7.5, 9% PEG-3350
分辨率 2.83 Å R-free 0.252
8TSA Human PI3K p85alpha/p110alpha H1047R bound to compound 2 提交 2023-08-11 构建体不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 318–615（298 aa） 片段：residues 318-615
未记录 UIW 5-(3-bromo-5-fluorobenzamido)-N-methyl-6-(2-methylanilino)pyridine-3-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；0.1 M Hepes pH 7.5, 9% PEG-3350
分辨率 2.51 Å R-free 0.276
8TSB Human PI3K p85alpha/p110alpha bound to compound 2 提交 2023-08-11 构建体不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 318–615（298 aa） 片段：residues 318-615
未记录 UIW 5-(3-bromo-5-fluorobenzamido)-N-methyl-6-(2-methylanilino)pyridine-3-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；0.1 M Hepes pH 7.5, 9% PEG-3350
分辨率 3.53 Å R-free 0.256
8TSC Human PI3K p85alpha/p110alpha H1047R bound to compound 3 提交 2023-08-11 构建体不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 318–615（298 aa） 片段：residues 318-615
未记录 UJC (1S)-7-[3-fluoro-5-(trifluoromethyl)benzamido]-N-methyl-1-(2-methylphenyl)-3-oxo-2,3-dihydro-1H-isoindole-5-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；0.1 M Hepes pH 7.5, 9% PEG-3350
分辨率 3.62 Å R-free 0.255
8TSD Human PI3K p85alpha/p110alpha bound to RLY-2608 提交 2023-08-11 构建体不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 318–615（298 aa） 片段：residues 318-615
未记录 XUZ N-{(3R,6M)-3-(2-chloro-5-fluorophenyl)-6-[(4S)-5-cyano[1,2,4]triazolo[1,5-a]pyridin-6-yl]-1-oxo-2,3-dihydro-1H-isoindol-4-yl}-3-fluoro-5-(trifluoromethyl)benzamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；0.1 M Hepes pH 7.5, 9% PEG-3350
分辨率 2.70 Å R-free 0.277
8TU6 CryoEM structure of PI3Kalpha 提交 2023-08-15 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 1–724（724 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.12 Å
8V8H PI3Ka H1047R co-crystal structure with inhibitor in cryptic pocket near H1047R (compound 4). 提交 2023-12-05 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 322–600（279 aa）
未记录 YO4 2-({(1R)-1-[2-(4,4-dimethylpiperidin-1-yl)-3,6-dimethyl-4-oxo-4H-1-benzopyran-8-yl]ethyl}amino)benzoic acid × 1 YNZ (2S)-N~1~-[(4P)-2-tert-butyl-4'-methyl[4,5'-bi-1,3-thiazol]-2'-yl]pyrrolidine-1,2-dicarboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；0.2 M Sodium acetate, 0.1 M Sodium citrate pH 5.5, 4% w/v PEG 4000.
分辨率 3.58 Å R-free 0.272
8V8H PI3Ka H1047R co-crystal structure with inhibitor in cryptic pocket near H1047R (compound 4). 提交 2023-12-05 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 D 322–600（279 aa）
未记录 YO4 2-({(1R)-1-[2-(4,4-dimethylpiperidin-1-yl)-3,6-dimethyl-4-oxo-4H-1-benzopyran-8-yl]ethyl}amino)benzoic acid × 1 YNZ (2S)-N~1~-[(4P)-2-tert-butyl-4'-methyl[4,5'-bi-1,3-thiazol]-2'-yl]pyrrolidine-1,2-dicarboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；0.2 M Sodium acetate, 0.1 M Sodium citrate pH 5.5, 4% w/v PEG 4000.
分辨率 3.58 Å R-free 0.272
8V8I PI3Ka H1047R co-crystal structure with inhibitor in cryptic pocket (compound 5). 提交 2023-12-05 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 322–600（279 aa）
未记录 YOR N-{(3S)-3-(2-methylphenyl)-6-[(oxetan-3-yl)amino]-1-oxo-2,3-dihydro-1H-isoindol-4-yl}-1-benzothiophene-3-carboxamide × 1 YNZ (2S)-N~1~-[(4P)-2-tert-butyl-4'-methyl[4,5'-bi-1,3-thiazol]-2'-yl]pyrrolidine-1,2-dicarboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；289 K；0.1 M Sodium Malonate pH 5.0, 10% w/v PEG 3350
分辨率 3.20 Å R-free 0.310
8V8I PI3Ka H1047R co-crystal structure with inhibitor in cryptic pocket (compound 5). 提交 2023-12-05 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 D 322–600（279 aa）
未记录 YOR N-{(3S)-3-(2-methylphenyl)-6-[(oxetan-3-yl)amino]-1-oxo-2,3-dihydro-1H-isoindol-4-yl}-1-benzothiophene-3-carboxamide × 1 YNZ (2S)-N~1~-[(4P)-2-tert-butyl-4'-methyl[4,5'-bi-1,3-thiazol]-2'-yl]pyrrolidine-1,2-dicarboxamide × 1 CL CHLORIDE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；289 K；0.1 M Sodium Malonate pH 5.0, 10% w/v PEG 3350
分辨率 3.20 Å R-free 0.310
8V8J PI3Ka H1047R co-crystal structure with inhibitors in two cryptic pockets (compounds 4 and 5). 提交 2023-12-05 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 322–600（279 aa）
未记录 YO4 2-({(1R)-1-[2-(4,4-dimethylpiperidin-1-yl)-3,6-dimethyl-4-oxo-4H-1-benzopyran-8-yl]ethyl}amino)benzoic acid × 1 YOR N-{(3S)-3-(2-methylphenyl)-6-[(oxetan-3-yl)amino]-1-oxo-2,3-dihydro-1H-isoindol-4-yl}-1-benzothiophene-3-carboxamide × 1 YNZ (2S)-N~1~-[(4P)-2-tert-butyl-4'-methyl[4,5'-bi-1,3-thiazol]-2'-yl]pyrrolidine-1,2-dicarboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；289 K；0.4M Sodium Formate, 0.1 M Sodium Citrate, pH 5.2
分辨率 3.35 Å R-free 0.251
8V8J PI3Ka H1047R co-crystal structure with inhibitors in two cryptic pockets (compounds 4 and 5). 提交 2023-12-05 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 D 322–600（279 aa）
未记录 YO4 2-({(1R)-1-[2-(4,4-dimethylpiperidin-1-yl)-3,6-dimethyl-4-oxo-4H-1-benzopyran-8-yl]ethyl}amino)benzoic acid × 1 YOR N-{(3S)-3-(2-methylphenyl)-6-[(oxetan-3-yl)amino]-1-oxo-2,3-dihydro-1H-isoindol-4-yl}-1-benzothiophene-3-carboxamide × 1 YNZ (2S)-N~1~-[(4P)-2-tert-butyl-4'-methyl[4,5'-bi-1,3-thiazol]-2'-yl]pyrrolidine-1,2-dicarboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；289 K；0.4M Sodium Formate, 0.1 M Sodium Citrate, pH 5.2
分辨率 3.35 Å R-free 0.251
8V8U PI3Ka H1047R co-crystal structure with inhibitor in cryptic pocket near H1047R (compound 12). 提交 2023-12-06 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 322–600（279 aa）
未记录 1LT (2S)-N~1~-{4-methyl-5-[2-(1,1,1-trifluoro-2-methylpropan-2-yl)pyridin-4-yl]-1,3-thiazol-2-yl}pyrrolidine-1,2-dicarboxamide × 1 YQB (3S)-9-[(1R)-1-(2-carboxyanilino)ethyl]-3-cyano-7-methyl-4-oxo-2-(piperidin-1-yl)-3,4-dihydropyrido[1,2-a]pyrimidin-5-ium × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；0.3-0.6 M Sodium Formate, 0.1 M Citrate pH 5.0
分辨率 2.93 Å R-free 0.255
8V8U PI3Ka H1047R co-crystal structure with inhibitor in cryptic pocket near H1047R (compound 12). 提交 2023-12-06 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 D 322–600（279 aa）
未记录 1LT (2S)-N~1~-{4-methyl-5-[2-(1,1,1-trifluoro-2-methylpropan-2-yl)pyridin-4-yl]-1,3-thiazol-2-yl}pyrrolidine-1,2-dicarboxamide × 1 YQB (3S)-9-[(1R)-1-(2-carboxyanilino)ethyl]-3-cyano-7-methyl-4-oxo-2-(piperidin-1-yl)-3,4-dihydropyrido[1,2-a]pyrimidin-5-ium × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；0.3-0.6 M Sodium Formate, 0.1 M Citrate pH 5.0
分辨率 2.93 Å R-free 0.255
8V8V PI3Ka H1047R co-crystal structure with inhibitor in cryptic pocket near H1047R (compound 7). 提交 2023-12-06 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 322–600（279 aa）
未记录 YQ2 2-[[(1~{R})-1-(7-methyl-4-oxidanylidene-2-piperidin-1-yl-3~{H}-pyrido[1,2-a]pyrimidin-9-yl)ethyl]amino]benzoic acid × 1 1LT (2S)-N~1~-{4-methyl-5-[2-(1,1,1-trifluoro-2-methylpropan-2-yl)pyridin-4-yl]-1,3-thiazol-2-yl}pyrrolidine-1,2-dicarboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.6 M Sodium Formate, 0.1 M Citrate pH 5.0
分辨率 2.61 Å R-free 0.288
8V8V PI3Ka H1047R co-crystal structure with inhibitor in cryptic pocket near H1047R (compound 7). 提交 2023-12-06 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 D 322–600（279 aa）
未记录 YQ2 2-[[(1~{R})-1-(7-methyl-4-oxidanylidene-2-piperidin-1-yl-3~{H}-pyrido[1,2-a]pyrimidin-9-yl)ethyl]amino]benzoic acid × 1 1LT (2S)-N~1~-{4-methyl-5-[2-(1,1,1-trifluoro-2-methylpropan-2-yl)pyridin-4-yl]-1,3-thiazol-2-yl}pyrrolidine-1,2-dicarboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.6 M Sodium Formate, 0.1 M Citrate pH 5.0
分辨率 2.61 Å R-free 0.288
8W9A CryoEM structure of human PI3K-alpha (P85/P110-H1047R) with QR-7909 binding at an allosteric site 提交 2023-09-05 构建体不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 1–724（724 aa）
未记录 UEX 6-chloranyl-3-[[(1R)-1-[2-(1,3-dihydropyrrolo[3,4-c]pyridin-2-yl)-3,6-dimethyl-4-oxidanylidene-quinazolin-8-yl]ethyl]amino]pyridine-2-carboxylic acid × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.70 Å
9LWQ Cryo-EM structure of PI3Kalpha in complex with compound UCL-TRO-1938 提交 2025-02-16 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 3–724（722 aa）
未记录 QIH 1-[7-[[2-[[4-(4-ethylpiperazin-1-yl)phenyl]amino]pyridin-4-yl]amino]-2,3-dihydroindol-1-yl]ethanone × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.17 Å
9LWR Cryo-EM structure of PI3Kalpha H1047R in complex with compound UCL-TRO-1938 提交 2025-02-16 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 3–724（722 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
9LWS Cryo-EM structure of PI3Kalpha H1047R in complex with compound UCL-TRO-1938 提交 2025-02-16 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 3–724（722 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.94 Å
9NI6 Cryo-EM structure of the Class 1 PI3K alpha/KRas complex on POPC/POPS nanodiscs 提交 2025-02-25 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 1–724（724 aa）
未记录 A1AZD tert-butyl [2-(2-{[(2P)-2-{4-[4-(2-amino-2-oxoethyl)-2-fluoroanilino]thieno[2,3-d]pyridazin-7-yl}phenyl]oxy}ethoxy)ethyl]carbamate × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；50 mM Tris-HCL, 150 mM NaCl, 1mM TCEP
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.01 Å
9NI8 Cryo-EM structure of the Class 2 PI3K alpha/KRas complex on POPC/POPS nanodiscs 提交 2025-02-25 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 1–724（724 aa）
未记录 A1AZD tert-butyl [2-(2-{[(2P)-2-{4-[4-(2-amino-2-oxoethyl)-2-fluoroanilino]thieno[2,3-d]pyridazin-7-yl}phenyl]oxy}ethoxy)ethyl]carbamate × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；50 mM Tris-HCL, 150 mM NaCl, 1mM TCEP
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.23 Å
9NLC Cryo-EM structure of the Class 1 PI3K alpha/KRas complex on POPC/POPS nanodiscs low-pass filtered to 10 angstroms 提交 2025-03-03 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 1–724（724 aa）
未记录 A1AZD tert-butyl [2-(2-{[(2P)-2-{4-[4-(2-amino-2-oxoethyl)-2-fluoroanilino]thieno[2,3-d]pyridazin-7-yl}phenyl]oxy}ethoxy)ethyl]carbamate × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；50 mM Tris-HCL, 150 mM NaCl, 1mM TCEP
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 10.00 Å

共 103 个其他 PDB 条目、116 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 P85A_HUMAN
Isoform —
PDB实体 2
链与序列区间 作者链 B； PDB构建体 1–279； UniProt 322–600

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

SAXS profile for 8w9b

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

P(r) distribution for 8w9b
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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id8w9b
沉积日期 deposition_date2023-09-05
结构标题 titleCryoEM structure of human PI3K-alpha (P85/P110-H1047R) with QR-8557 binding at an allosteric site
关键词 keywordsPI3K-alpha, lipid kinase, allosteric inhibition, ONCOPROTEIN; ONCOPROTEIN
实验方法 methodELECTRON MICROSCOPY
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3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier36.09 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron35.33 Å
零角强度 I(0) i0322844000.00
分子量 molecular_weight145840.0 kDa
排除体积 excluded_volume183090 ų
包络体积 envelope_volume247100 ų
水化壳体积 shell_volume57568 ų
包络直径 envelope_diameter131.7 Å
壳层 Rg shell_rg42.39 Å
包络 Rg envelope_rg35.06 Å
形状 Rg shape_rg35.34 Å
总 Rg total_rg35.81 Å
总原子数 total_atoms10267
残基数 n_residues1242
球谐函数阶数 n_harmonics20
q 范围 q_range— – 0.5000 Å−1
数据点数 n_points101
壳层类型 shell_typedirectional
溶剂电子密度 solvent_density0.3340 e/ų
壳层衬度 contrast_shell0.0300 e/ų
CRYSOL 版本 crysol_version4.1.3
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4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax120.5 Å
Rg (实空间) rg_real35.97 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error0.96 Å
I(0) (实空间) i0_real3.2280e+08
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error5.2810e+06
Rg (倒空间) rg_reciprocal36.04 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal322900000.0000
解质量估计 total_estimate0.8751
解质量评级 solution_quality GOOD a GOOD solution
P(r) 峰数 n_peaks2
主峰位置 r_peak_primary43.8 Å
偏度 Skewness skewness0.292
峰度 Kurtosis kurtosis-0.203
角度范围 angular_range— – 0.2200 Å−1
当前正则化参数 α current_alpha0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha60420000.0000
实空间数据点数 n_real_points45
GNOM 版本 gnom_version4.1.3
质量判据 quality_criteria AN1: 0.000; Oscil: 0.814; Stabil: 1.000; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.998; Smooth: 0.933
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5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

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6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (3)

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8. 引用文献 (1)

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9. 文件与曲线 (10)