8wgd

mGlu2-4 inactive heterodimer

Method: ELECTRON MICROSCOPY Dmax: 178.5 Å Quality: GOOD

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Metabotropic glutamate receptor 2

Homo sapiens

UniProt Q14416

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白拷贝数一致 链 C; UniProt 19–872 未记录 Metabotropic glutamate receptor 4 × 1 (Q14833) WAG (1S,2R)-2-[(2S)-2-azanyl-1-oxidanyl-1-oxidanylidene-3-(9H-xanthen-9-yl)propan-2-yl]cyclopropane-1-carboxylic acid × 1 WA6 (2S)-2-azanyl-2-cyclopropyl-2-(4-phosphonophenyl)ethanoic acid × 1 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE 分辨率 4.45 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 28 个其他 PDB 条目、28 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 GRM2_HUMAN
Isoform
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 C; PDB构建体 1–854; UniProt 19–872

Metabotropic glutamate receptor 4

Homo sapiens

UniProt Q14833

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白拷贝数一致 链 B; UniProt 33–912 未记录 Metabotropic glutamate receptor 2 × 1 (Q14416) WAG (1S,2R)-2-[(2S)-2-azanyl-1-oxidanyl-1-oxidanylidene-3-(9H-xanthen-9-yl)propan-2-yl]cyclopropane-1-carboxylic acid × 1 WA6 (2S)-2-azanyl-2-cyclopropyl-2-(4-phosphonophenyl)ethanoic acid × 1 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE 分辨率 4.45 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 7 个其他 PDB 条目、7 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 GRM4_HUMAN
Isoform
PDB实体 2
链与序列区间 作者链 B; PDB构建体 1–880; UniProt 33–912

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中;数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护,因此不在读者页面展示。

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

SAXS profile for 8wgd

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

P(r) distribution for 8wgd
下载 Download

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id8wgd
沉积日期 deposition_date2023-09-20
结构标题 titlemGlu2-4 inactive heterodimer
关键词 keywordsGPCR, MEMBRANE PROTEIN; MEMBRANE PROTEIN
实验方法 methodELECTRON MICROSCOPY

3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier57.45
回转半径 Rg (电子) rg_electron57.93
零角强度 I(0) i0351244000.00
分子量 molecular_weight82066.0 kDa
排除体积 excluded_volume68067 ų
包络体积 envelope_volume250790 ų
水化壳体积 shell_volume38864 ų
包络直径 envelope_diameter179.8
壳层 Rg shell_rg56.48
包络 Rg envelope_rg53.58
形状 Rg shape_rg57.93
总 Rg total_rg57.90
总原子数 total_atoms6076
残基数 n_residues1508
球谐函数阶数 n_harmonics20
q 范围 q_range— – 0.5000 −1
数据点数 n_points101
壳层类型 shell_typedirectional
溶剂电子密度 solvent_density0.3340 e/ų
壳层衬度 contrast_shell0.0300 e/ų
CRYSOL 版本 crysol_version4.1.3

4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax178.5
Rg (实空间) rg_real57.90
Rg 误差 (实空间) rg_real_error1.85
I(0) (实空间) i0_real3.5120e+08
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error7.4750e+06
Rg (倒空间) rg_reciprocal57.01
I(0) (倒空间) i0_reciprocal350700000.0000
解质量估计 total_estimate0.7726
解质量评级 solution_quality GOOD a GOOD solution
P(r) 峰数 n_peaks2
主峰位置 r_peak_primary46.3
偏度 Skewness skewness0.286
峰度 Kurtosis kurtosis-0.976
角度范围 angular_range— – 0.1350 −1
当前正则化参数 α current_alpha0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha8754000.0000
实空间数据点数 n_real_points28
GNOM 版本 gnom_version4.1.3
质量判据 quality_criteria AN1: 0.000; Oscil: 0.779; Stabil: 1.000; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.703; Smooth: 0.000

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (4)

8. 引用文献 (1)

9. 文件与曲线 (10)