8x31

The piccolo NuA4 bound to the H2A.Z nucleosome complex with Ac-CoA at resetting state

Method: ELECTRON MICROSCOPY
▼

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Maltose/maltodextrin-binding periplasmic protein,Chromatin modification-related protein EAF6

Saccharomyces cerevisiae

UniProt A0A6A5PYU5

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 信息不足 异源复合物 蛋白 12 DNA 2 Chromatin modification-related protein × 1 (A0A8H4C0Q6) Histone acetyltransferase × 1 (A0A6A5Q414) glutathione transferase,Enhancer of polycomb-like protein × 1 (A0A8H8UL58,Q540A3) DNA (146-MER) × 2 Histone H3 × 2 (A0A6A5Q536) Histone H4 × 2 (A0A6A5Q1V3) Histone H2A × 2 (A0A6A5Q818) Histone H2B × 2 (A0A6A5PZQ7) 与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 A0A6A5PYU5_YEASX
Isoform —
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 L; PDB构建体 425–537; UniProt 1–113

Maltose/maltodextrin-binding periplasmic protein,Chromatin modification-related protein EAF6

Saccharomyces cerevisiae

UniProt P0AEX9

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 信息不足 异源复合物 蛋白 12 DNA 2 Chromatin modification-related protein × 1 (A0A8H4C0Q6) Histone acetyltransferase × 1 (A0A6A5Q414) glutathione transferase,Enhancer of polycomb-like protein × 1 (A0A8H8UL58,Q540A3) DNA (146-MER) × 2 Histone H3 × 2 (A0A6A5Q536) Histone H4 × 2 (A0A6A5Q1V3) Histone H2A × 2 (A0A6A5Q818) Histone H2B × 2 (A0A6A5PZQ7) 与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 MALE_ECOLI
Isoform —
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 L; PDB构建体 1–392; UniProt 1–392

Chromatin modification-related protein

Saccharomyces cerevisiae

UniProt A0A8H4C0Q6

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 信息不足 异源复合物 蛋白 12 DNA 2 Maltose/maltodextrin-binding periplasmic protein,Chromatin modification-related protein EAF6 × 1 (A0A6A5PYU5,P0AEX9) Histone acetyltransferase × 1 (A0A6A5Q414) glutathione transferase,Enhancer of polycomb-like protein × 1 (A0A8H8UL58,Q540A3) DNA (146-MER) × 2 Histone H3 × 2 (A0A6A5Q536) Histone H4 × 2 (A0A6A5Q1V3) Histone H2A × 2 (A0A6A5Q818) Histone H2B × 2 (A0A6A5PZQ7) 与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 A0A8H4C0Q6_YEASX
Isoform —
PDB实体 2
链与序列区间 作者链 N; PDB构建体 1–120; UniProt 1–120

Histone acetyltransferase

Saccharomyces cerevisiae

UniProt A0A6A5Q414

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 信息不足 异源复合物 蛋白 12 DNA 2 Maltose/maltodextrin-binding periplasmic protein,Chromatin modification-related protein EAF6 × 1 (A0A6A5PYU5,P0AEX9) Chromatin modification-related protein × 1 (A0A8H4C0Q6) glutathione transferase,Enhancer of polycomb-like protein × 1 (A0A8H8UL58,Q540A3) DNA (146-MER) × 2 Histone H3 × 2 (A0A6A5Q536) Histone H4 × 2 (A0A6A5Q1V3) Histone H2A × 2 (A0A6A5Q818) Histone H2B × 2 (A0A6A5PZQ7) 与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 A0A6A5Q414_YEASX
Isoform —
PDB实体 3
链与序列区间 作者链 K; PDB构建体 25–469; UniProt 1–445

glutathione transferase,Enhancer of polycomb-like protein

Saccharomyces cerevisiae

UniProt A0A8H8UL58

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 信息不足 异源复合物 蛋白 12 DNA 2 Maltose/maltodextrin-binding periplasmic protein,Chromatin modification-related protein EAF6 × 1 (A0A6A5PYU5,P0AEX9) Chromatin modification-related protein × 1 (A0A8H4C0Q6) Histone acetyltransferase × 1 (A0A6A5Q414) DNA (146-MER) × 2 Histone H3 × 2 (A0A6A5Q536) Histone H4 × 2 (A0A6A5Q1V3) Histone H2A × 2 (A0A6A5Q818) Histone H2B × 2 (A0A6A5PZQ7) 与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 A0A8H8UL58_YEASX
Isoform —
PDB实体 4
链与序列区间 作者链 M; PDB构建体 236–586; UniProt 50–400

glutathione transferase,Enhancer of polycomb-like protein

Saccharomyces cerevisiae

UniProt Q540A3

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 信息不足 异源复合物 蛋白 12 DNA 2 Maltose/maltodextrin-binding periplasmic protein,Chromatin modification-related protein EAF6 × 1 (A0A6A5PYU5,P0AEX9) Chromatin modification-related protein × 1 (A0A8H4C0Q6) Histone acetyltransferase × 1 (A0A6A5Q414) DNA (146-MER) × 2 Histone H3 × 2 (A0A6A5Q536) Histone H4 × 2 (A0A6A5Q1V3) Histone H2A × 2 (A0A6A5Q818) Histone H2B × 2 (A0A6A5PZQ7) 与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 Q540A3_SCHJA
Isoform —
PDB实体 4
链与序列区间 作者链 M; PDB构建体 1–218; UniProt 1–218

Histone H3

Saccharomyces cerevisiae

UniProt A0A6A5Q536

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 信息不足 异源复合物 蛋白 12 DNA 2 Maltose/maltodextrin-binding periplasmic protein,Chromatin modification-related protein EAF6 × 1 (A0A6A5PYU5,P0AEX9) Chromatin modification-related protein × 1 (A0A8H4C0Q6) Histone acetyltransferase × 1 (A0A6A5Q414) glutathione transferase,Enhancer of polycomb-like protein × 1 (A0A8H8UL58,Q540A3) DNA (146-MER) × 2 Histone H4 × 2 (A0A6A5Q1V3) Histone H2A × 2 (A0A6A5Q818) Histone H2B × 2 (A0A6A5PZQ7) 与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 A0A6A5Q536_YEASX
Isoform —
PDB实体 6
链与序列区间 作者链 A; PDB构建体 1–136; UniProt 1–136 作者链 E; PDB构建体 1–136; UniProt 1–136

Histone H4

Saccharomyces cerevisiae

UniProt A0A6A5Q1V3

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 信息不足 异源复合物 蛋白 12 DNA 2 Maltose/maltodextrin-binding periplasmic protein,Chromatin modification-related protein EAF6 × 1 (A0A6A5PYU5,P0AEX9) Chromatin modification-related protein × 1 (A0A8H4C0Q6) Histone acetyltransferase × 1 (A0A6A5Q414) glutathione transferase,Enhancer of polycomb-like protein × 1 (A0A8H8UL58,Q540A3) DNA (146-MER) × 2 Histone H3 × 2 (A0A6A5Q536) Histone H2A × 2 (A0A6A5Q818) Histone H2B × 2 (A0A6A5PZQ7) 与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 A0A6A5Q1V3_YEASX
Isoform —
PDB实体 7
链与序列区间 作者链 B; PDB构建体 1–102; UniProt 1–102 作者链 F; PDB构建体 1–102; UniProt 1–102

Histone H2A

Saccharomyces cerevisiae

UniProt A0A6A5Q818

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 信息不足 异源复合物 蛋白 12 DNA 2 Maltose/maltodextrin-binding periplasmic protein,Chromatin modification-related protein EAF6 × 1 (A0A6A5PYU5,P0AEX9) Chromatin modification-related protein × 1 (A0A8H4C0Q6) Histone acetyltransferase × 1 (A0A6A5Q414) glutathione transferase,Enhancer of polycomb-like protein × 1 (A0A8H8UL58,Q540A3) DNA (146-MER) × 2 Histone H3 × 2 (A0A6A5Q536) Histone H4 × 2 (A0A6A5Q1V3) Histone H2B × 2 (A0A6A5PZQ7) 与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 A0A6A5Q818_YEASX
Isoform —
PDB实体 8
链与序列区间 作者链 C; PDB构建体 1–134; UniProt 1–134 作者链 G; PDB构建体 1–134; UniProt 1–134

Histone H2B

Saccharomyces cerevisiae

UniProt A0A6A5PZQ7

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 信息不足 异源复合物 蛋白 12 DNA 2 Maltose/maltodextrin-binding periplasmic protein,Chromatin modification-related protein EAF6 × 1 (A0A6A5PYU5,P0AEX9) Chromatin modification-related protein × 1 (A0A8H4C0Q6) Histone acetyltransferase × 1 (A0A6A5Q414) glutathione transferase,Enhancer of polycomb-like protein × 1 (A0A8H8UL58,Q540A3) DNA (146-MER) × 2 Histone H3 × 2 (A0A6A5Q536) Histone H4 × 2 (A0A6A5Q1V3) Histone H2A × 2 (A0A6A5Q818) 与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 A0A6A5PZQ7_YEASX
Isoform —
PDB实体 9
链与序列区间 作者链 D; PDB构建体 1–131; UniProt 1–131 作者链 H; PDB构建体 1–131; UniProt 1–131

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中;数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护,因此不在读者页面展示。

▼

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id8x31
沉积日期 deposition_date2023-11-10
结构标题 titleThe piccolo NuA4 bound to the H2A.Z nucleosome complex with Ac-CoA at resetting state
关键词 keywordsNua4, nucleosome, GENE REGULATION; GENE REGULATION
实验方法 methodELECTRON MICROSCOPY
▼

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

8x31__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

8x31__assembly_1__model_1 | I(q)

10-2 10-1 106 107 108 109 q (1/Angstrom) I(q)
100 个绘图点;横轴和纵轴均采用对数尺度。

8x31__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

新版 assembly/model P(r) 尚未计算 此处仅保留位置,不展示旧数据 r (Angstrom) P(r)
P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。
Rg(Guinier)46.59 Å
Rg(电子密度)45.61 Å
总 Rg45.91 Å
原子数16944
残基数1642
排除体积283610 ų
最大 q0.500 Å⁻¹
Assembly Model 结构单元 聚集说明 状态 CRYSOL 操作
1 1 8x31__assembly_1__model_1 tetradecameric (14) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
▶

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

▶

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (9)

▶

7. 引用文献 (1)