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8xkk

Ckappa domain of mouse immunoglobulin

Method: SOLUTION NMR Dmax: 49.5 Å Quality: GOOD
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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Immunoglobulin kappa constant

Mus musculus

UniProt P01837

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白单体 单体 蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白拷贝数一致 链 A； UniProt 2–106 未记录 无其他共同聚合物 SOLUTION NMR NMR测量条件：pH 6；298 K；离子强度（mmCIF原始值）Not defined；压力 1 NMR样品组成：1.6 mM [U-13C; U-15N] Ckappa domain of mouse immunoglobulin, 5 mM NaPi, 50 mM sodium chloride, 95% H2O/5% D2O | 95% H2O/5% D2O NMR样品组成：1.6 mM [U-13C; U-15N] Ckappa domain of mouse immunoglobulin, 95% H2O/5% D2O | 95% H2O/5% D2O NMR样品组成：1.6 mM [U-13C; U-15N] Ckappa domain of mouse immunoglobulin, 95% H2O/5% D2O | 95% H2O/5% D2O 分辨率未提供

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 8XKK Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
15C8 CATALYTIC ANTIBODY 5C8, FREE FAB 提交 1998-03-18 构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 L 24–235（212 aa） 片段：FAB
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 5.5；pH 5.5
分辨率 2.50 Å R-free 0.251
1AHW A COMPLEX OF EXTRACELLULAR DOMAIN OF TISSUE FACTOR WITH AN INHIBITORY FAB (5G9) 提交 1997-04-10 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 A 1–214（214 aa） 片段：LIGHT CHAIN RESIDUES 1 - 214
链 D 1–214（214 aa） 片段：LIGHT CHAIN RESIDUES 1 - 214
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 7；TF-5G9 CRYSTAL WERE GROWN IN 1.7-2.0M AMMONIUM SULFATE, 0.1M SODIUM CITRATE, PH 5.0-5.5, 0.2% 2-METHYL-2,4-PENTANE-DIOL (MPD), AND 2% PEG 600 AT AN EQUIMOLAR 5G9:TF RATIO. THE CRYSTALS GREW EXTREMELY SLOWLY, TAKING 6-9 MONTHS TO REACH A MAXIMAL SIZE OF 0.4 X 0.4 X 0.8 MM3., pH 7.0
分辨率 3.00 Å R-free 0.285
1AIF ANTI-IDIOTYPIC FAB 409.5.3 (IGG2A) FAB FROM MOUSE 提交 1994-11-14 构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 L 1–213（213 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 2.90 Å
1AIF ANTI-IDIOTYPIC FAB 409.5.3 (IGG2A) FAB FROM MOUSE 提交 1994-11-14 构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–213（213 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 2.90 Å
1F11 F124 FAB FRAGMENT FROM A MONOCLONAL ANTI-PRES2 ANTIBODY 提交 2000-05-18 构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–106（106 aa） 片段：FAB FRAGMENT (UNP P01665 residues 1-111, P01837 residues 1-106)
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.6；290 K；PEG 400, sodium acetate, ammonium sulfate, pH 4.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 290K
分辨率 3.00 Å R-free 0.271
1F11 F124 FAB FRAGMENT FROM A MONOCLONAL ANTI-PRES2 ANTIBODY 提交 2000-05-18 构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 信息不足 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 C 1–106（106 aa） 片段：FAB FRAGMENT (UNP P01665 residues 1-111, P01837 residues 1-106)
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.6；290 K；PEG 400, sodium acetate, ammonium sulfate, pH 4.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 290K
分辨率 3.00 Å R-free 0.271
1FAI THREE-DIMENSIONAL STRUCTURE OF TWO CRYSTAL FORMS OF FAB R19.9, FROM A MONOCLONAL ANTI-ARSONATE ANTIBODY 提交 1992-05-27 构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 L 1–106（106 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 2.70 Å
1FSK COMPLEX FORMATION BETWEEN A FAB FRAGMENT OF A MONOCLONAL IGG ANTIBODY AND THE MAJOR ALLERGEN FROM BIRCH POLLEN BET V 1 提交 2000-09-11 构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 1–106（106 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4；300 K；12% peg 6000, 0.1M sodium citrate, pH 4.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 300K
分辨率 2.90 Å R-free 0.285
1FSK COMPLEX FORMATION BETWEEN A FAB FRAGMENT OF A MONOCLONAL IGG ANTIBODY AND THE MAJOR ALLERGEN FROM BIRCH POLLEN BET V 1 提交 2000-09-11 构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 E 1–106（106 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4；300 K；12% peg 6000, 0.1M sodium citrate, pH 4.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 300K
分辨率 2.90 Å R-free 0.285
1FSK COMPLEX FORMATION BETWEEN A FAB FRAGMENT OF A MONOCLONAL IGG ANTIBODY AND THE MAJOR ALLERGEN FROM BIRCH POLLEN BET V 1 提交 2000-09-11 构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 H 1–106（106 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4；300 K；12% peg 6000, 0.1M sodium citrate, pH 4.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 300K
分辨率 2.90 Å R-free 0.285
1FSK COMPLEX FORMATION BETWEEN A FAB FRAGMENT OF A MONOCLONAL IGG ANTIBODY AND THE MAJOR ALLERGEN FROM BIRCH POLLEN BET V 1 提交 2000-09-11 构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 K 1–106（106 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4；300 K；12% peg 6000, 0.1M sodium citrate, pH 4.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 300K
分辨率 2.90 Å R-free 0.285
1GPO CRYSTAL STRUCTURE OF THE RATIONALLY DESIGNED ANTIBODY M41 AS A FAB FRAGMENT 提交 1997-03-27 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 L 1–106（106 aa） 片段：FAB FRAGMENT
未记录 SO4 SULFATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 6.5；2.0 M AMMONIUM SULFATE, 5 % DMSO, 0.1 M CACODYLATE PH 6.5
分辨率 1.95 Å R-free 0.283
1GPO CRYSTAL STRUCTURE OF THE RATIONALLY DESIGNED ANTIBODY M41 AS A FAB FRAGMENT 提交 1997-03-27 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 M 1–106（106 aa） 片段：FAB FRAGMENT
未记录 SO4 SULFATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 6.5；2.0 M AMMONIUM SULFATE, 5 % DMSO, 0.1 M CACODYLATE PH 6.5
分辨率 1.95 Å R-free 0.283
1KB5 MURINE T-CELL RECEPTOR VARIABLE DOMAIN/FAB COMPLEX 提交 1997-04-06 构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 L 1–106（106 aa） 片段：FAB
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 7.2；15% PEG6000, 100MM HEPES PH 6.9-7.5, 200MM NACL, 0.1% NAN3, pH 7.2
分辨率 2.50 Å
1KCR CRYSTAL STRUCTURE OF ANTIBODY PC283 IN COMPLEX WITH PS1 PEPTIDE 提交 2001-11-11 构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 L 1–106（106 aa） 片段：light chain
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.2；300 K；18% PEG 3K, pH 7.2, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 300K
分辨率 2.90 Å R-free 0.277
1KCS CRYSTAL STRUCTURE OF ANTIBODY PC282 IN COMPLEX WITH PS1 PEPTIDE 提交 2001-11-11 构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 L 1–106（106 aa） 片段：light chain
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.2；300 K；20% PEG 8K, pH 7.2, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 300K
分辨率 2.50 Å R-free 0.277
1KCU CRYSTAL STRUCTURE OF ANTIBODY PC287 提交 2001-11-11 构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 L 1–106（106 aa） 片段：light chain
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.2；300 K；15% PEG 8K, pH 7.2, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 300K
分辨率 2.20 Å R-free 0.249
1KCV Crystal structure of antibody pc282 提交 2001-11-11 构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 L 1–106（106 aa） 片段：light chain
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.2；300 K；10 % PEG 3K, pH 7.2, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 300K
分辨率 1.80 Å R-free 0.233
1LO0 Catalytic Retro-Diels-Alderase Transition State Analogue Complex 提交 2002-05-05 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 X 1–106（106 aa） 片段：Fab fragment
未记录 BC1 3-{[(9-CYANO-9,10-DIHYDRO-10-METHYLACRIDIN-9-YL)CARBONYL]AMINO}PROPANOIC ACID × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；290 K；PEG, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 290K
分辨率 2.00 Å R-free 0.255
1LO0 Catalytic Retro-Diels-Alderase Transition State Analogue Complex 提交 2002-05-05 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 L 1–106（106 aa） 片段：Fab fragment
未记录 BC1 3-{[(9-CYANO-9,10-DIHYDRO-10-METHYLACRIDIN-9-YL)CARBONYL]AMINO}PROPANOIC ACID × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；290 K；PEG, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 290K
分辨率 2.00 Å R-free 0.255
1MLB MONOCLONAL ANTIBODY FAB D44.1 RAISED AGAINST CHICKEN EGG-WHITE LYSOZYME 提交 1995-03-08 构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–106（106 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 2.10 Å R-free 0.274
1NBY Crystal Structure of HyHEL-63 complexed with HEL mutant K96A 提交 2002-12-04 构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–106（106 aa） 片段：light chain
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.6；PEG 4000, AMMONIUM ACETATE, SODIUM ACETATE, pH 4.60, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
分辨率 1.80 Å R-free 0.250
1NDG Crystal structure of Fab fragment of antibody HyHEL-8 complexed with its antigen lysozyme 提交 2002-12-09 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–106（106 aa） 片段：light chain
未记录 ACY ACETIC ACID × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
分辨率 1.90 Å R-free 0.249
1NDM Crystal structure of Fab fragment of antibody HyHEL-26 complexed with lysozyme 提交 2002-12-09 构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–106（106 aa） 片段：light chain
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
分辨率 2.10 Å R-free 0.258
1ORQ X-ray structure of a voltage-dependent potassium channel in complex with an Fab 提交 2003-03-14 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric
链 A 1–106（106 aa）
未记录 CD CADMIUM ION × 28 K POTASSIUM ION × 24 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5；293 K；PEG400, Cadmium chloride, Sodium acetate, pH 5.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
分辨率 3.20 Å R-free 0.298
1ORQ X-ray structure of a voltage-dependent potassium channel in complex with an Fab 提交 2003-03-14 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 24 PDB 声明：24-meric
链 A 1–106（106 aa）
未记录 CD CADMIUM ION × 56 K POTASSIUM ION × 48 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5；293 K；PEG400, Cadmium chloride, Sodium acetate, pH 5.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
分辨率 3.20 Å R-free 0.298
1ORS X-ray structure of the KvAP potassium channel voltage sensor in complex with an Fab 提交 2003-03-14 构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–106（106 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；PEG4000, Hepes, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
分辨率 1.90 Å R-free 0.251
1PSK THE CRYSTAL STRUCTURE OF AN FAB FRAGMENT THAT BINDS TO THE MELANOMA-ASSOCIATED GD2 GANGLIOSIDE 提交 1997-03-03 构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 L 1–106（106 aa） 片段：FAB
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 7.5；30% (W/V) PEG 4000, 1% MPD, TRIS BUFFER, PH 7.5
分辨率 2.80 Å R-free 0.326
25C8 CATALYTIC ANTIBODY 5C8, FAB-HAPTEN COMPLEX 提交 1998-03-18 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 L 24–234（211 aa） 片段：FAB
未记录 GEP N-METHYL-N-(PARA-GLUTARAMIDOPHENYL-ETHYL)-PIPERIDINIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 5.5；pH 5.5
分辨率 2.00 Å R-free 0.292
2F19 THREE-DIMENSIONAL STRUCTURE OF TWO CRYSTAL FORMS OF FAB R19.9, FROM A MONOCLONAL ANTI-ARSONATE ANTIBODY 提交 1992-05-27 构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 L 1–106（106 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 2.80 Å
2MPA BACTERICIDAL ANTIBODY AGAINST NEISSERIA MENINGITIDIS 提交 1999-06-09 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 L 8–106（99 aa） 片段：FAB FRAGMENT
未记录 CD CADMIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.6；THE MN12H2 FAB PEPTIDE COMPLEX WAS CRYSTALLIZED FROM 15% W/V PEG 20000, 100 MM SODIUM ACETATE, PH 4.6, 20 MM CDCL2, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
分辨率 2.60 Å R-free 0.264
4ZXB Structure of the human insulin receptor ectodomain, IRDeltabeta construct, in complex with four Fab molecules 提交 2015-05-20 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric
链 B 1–106（106 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 6 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；Crystals were produced by vapour diffusion using 1 microlitre of the complex (2.6 mg/ml) in 10 mM HEPES (pH 7.5), 0.02% sodium azide and 10% D-trehalose solution and 1 microlitres of well solution containing 10% PEG 8000, 0.1 M MES (pH 6.5) and 0.1 M MgAc2.
分辨率 3.30 Å R-free 0.237
6FAB THREE-DIMENSIONAL STRUCTURE OF MURINE ANTI-P-AZOPHENYLARSONATE FAB 36-71. 1. X-RAY CRYSTALLOGRAPHY, SITE-DIRECTED MUTAGENESIS, AND MODELING OF THE COMPLEX WITH HAPTEN 提交 1991-01-17 构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 L 1–106（106 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 1.90 Å

共 25 个其他 PDB 条目、33 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 IGKC_MOUSE
Isoform —
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A； PDB构建体 1–105； UniProt 2–106

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

SAXS profile for 8xkk

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

P(r) distribution for 8xkk
下载 Download
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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id8xkk
沉积日期 deposition_date2023-12-23
最后修订 last_revision2025-02-05
结构标题 titleCkappa domain of mouse immunoglobulin
关键词 keywordsSTRUCTURE FROM CYANA 3.98.15, IMMUNE SYSTEM; IMMUNE SYSTEM
实验方法 methodSOLUTION NMR
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3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier15.26 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron15.04 Å
零角强度 I(0) i0962282000.00
分子量 molecular_weight250710.0 kDa
排除体积 excluded_volume307810 ų
包络体积 envelope_volume24504 ų
水化壳体积 shell_volume13116 ų
包络直径 envelope_diameter57.1 Å
壳层 Rg shell_rg21.81 Å
包络 Rg envelope_rg16.93 Å
形状 Rg shape_rg15.05 Å
总 Rg total_rg15.12 Å
总原子数 total_atoms34160
残基数 n_residues2240
球谐函数阶数 n_harmonics20
q 范围 q_range— – 0.5000 Å−1
数据点数 n_points101
壳层类型 shell_typedirectional
溶剂电子密度 solvent_density0.3340 e/ų
壳层衬度 contrast_shell0.0300 e/ų
CRYSOL 版本 crysol_version4.1.3
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4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax49.5 Å
Rg (实空间) rg_real15.28 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error0.35 Å
I(0) (实空间) i0_real9.6230e+08
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error1.2130e+07
Rg (倒空间) rg_reciprocal15.28 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal962300000.0000
解质量估计 total_estimate0.8056
解质量评级 solution_quality GOOD a GOOD solution
P(r) 峰数 n_peaks2
主峰位置 r_peak_primary16.3 Å
偏度 Skewness skewness0.317
峰度 Kurtosis kurtosis-0.516
角度范围 angular_range— – 0.5000 Å−1
当前正则化参数 α current_alpha0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha379700.0000
实空间数据点数 n_real_points80
GNOM 版本 gnom_version4.1.3
质量判据 quality_criteria AN1: 0.000; Oscil: 0.835; Stabil: 1.000; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.964; Smooth: 0.000
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5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

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6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (1)

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8. 引用文献 (1)

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9. 文件与曲线 (10)