9bfc

Cryo-EM structure of importin alpha-1/beta bound to FG repeats

Method: ELECTRON MICROSCOPY D_max: 106.5 Å Quality: EXCELLENT

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Importin subunit beta-1

Homo sapiens

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 5 PDB 声明：hexameric（6）计数不一致，待复核	链 H； UniProt 1–876	未记录	PHE-GLY-ALA × 1 Importin subunit alpha-1 × 1 （P52292） LYS-PRO-ALA-PHE-SER-PHE-GLY × 1 ALA-PHE-SER-PHE × 1 PHE PHENYLALANINE × 2 GLY GLYCINE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 8 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.20 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 9BFC	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
1F59 IMPORTIN-BETA-FXFG NUCLEOPORIN COMPLEX 提交 2000-06-13	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–442（442 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；293 K；ammonium sulphate, ammonium acetate, dtt, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 20K	分辨率 2.80 Å R-free 0.262
1F59 IMPORTIN-BETA-FXFG NUCLEOPORIN COMPLEX 提交 2000-06-13	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 1–442（442 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；293 K；ammonium sulphate, ammonium acetate, dtt, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 20K	分辨率 2.80 Å R-free 0.262
1IBR COMPLEX OF RAN WITH IMPORTIN BETA 提交 1999-05-14	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 1–462（462 aa）片段：RESIDUES 1-462	未记录	MG MAGNESIUM ION × 1 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 6；pH 6.0	分辨率 2.30 Å R-free 0.272
1IBR COMPLEX OF RAN WITH IMPORTIN BETA 提交 1999-05-14	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 D 1–462（462 aa）片段：RESIDUES 1-462	未记录	MG MAGNESIUM ION × 1 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 6；pH 6.0	分辨率 2.30 Å R-free 0.272
1M5N Crystal structure of HEAT repeats (1-11) of importin b bound to the non-classical NLS(67-94) of PTHrP 提交 2002-07-09	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 S 1–485（485 aa）片段：N-terminal domain (Residues 1-485)	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 6；298 K；MES, PEG 4000, sodium chloride, Tween, pH 6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298.0K, pH 6.00	分辨率 2.90 Å R-free 0.297
1O6O Importin Beta aa1-442 bound to five FxFG repeats from yeast Nsp1p. Second crystal form 提交 2002-10-10	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–442（442 aa）片段：RESIDUES 1-442	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 5.9；1.2-1.28M AMMONIUM SULPHATE, 100MM AMMONIUM ACETATE, PH 5.9, 30MM DTT	分辨率 2.80 Å R-free 0.273
1O6O Importin Beta aa1-442 bound to five FxFG repeats from yeast Nsp1p. Second crystal form 提交 2002-10-10	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 1–442（442 aa）片段：RESIDUES 1-442	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 5.9；1.2-1.28M AMMONIUM SULPHATE, 100MM AMMONIUM ACETATE, PH 5.9, 30MM DTT	分辨率 2.80 Å R-free 0.273
1O6O Importin Beta aa1-442 bound to five FxFG repeats from yeast Nsp1p. Second crystal form 提交 2002-10-10	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 C 1–442（442 aa）片段：RESIDUES 1-442	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 5.9；1.2-1.28M AMMONIUM SULPHATE, 100MM AMMONIUM ACETATE, PH 5.9, 30MM DTT	分辨率 2.80 Å R-free 0.273
1O6P Importin Beta bound to a GLFG Nucleoporin peptide 提交 2002-10-10	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 A 1–442（442 aa）片段：IMPORTIN BETA-1 SUBUNIT, RESIDUES 1-442	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 6；100MM AMMONIUM ACETATE PH6.0, 1.2M AMMONIUM SULPHATE, pH 6.00	分辨率 2.80 Å R-free 0.267
1O6P Importin Beta bound to a GLFG Nucleoporin peptide 提交 2002-10-10	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 B 1–442（442 aa）片段：IMPORTIN BETA-1 SUBUNIT, RESIDUES 1-442	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 6；100MM AMMONIUM ACETATE PH6.0, 1.2M AMMONIUM SULPHATE, pH 6.00	分辨率 2.80 Å R-free 0.267
1QGK STRUCTURE OF IMPORTIN BETA BOUND TO THE IBB DOMAIN OF IMPORTIN ALPHA 提交 1999-04-29	聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–876（876 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 6.5；pH 6.5	分辨率 2.50 Å R-free 0.273
1QGR STRUCTURE OF IMPORTIN BETA BOUND TO THE IBB DOMAIN OF IMPORTIN ALPHA (II CRYSTAL FORM, GROWN AT LOW PH) 提交 1999-05-04	聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–876（876 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 3.9；pH 3.9	分辨率 2.30 Å R-free 0.285
2P8Q Crystal Structure of human Importin beta bound to the Snurportin1 IBB-domain 提交 2007-03-22	聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–876（876 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；285 K；22%PEG 8000, 0.05M Sodium Chloride, 0.1M MES, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 285K	分辨率 2.35 Å R-free 0.250
2Q5D Crystal Structure of Human Importin Beta bound to the Snurportin1 IBB-domain second crystal form 提交 2007-05-31	聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–876（876 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；285 K；22%PEG 8000, 0.05M SODIUM CHLORIDE 0.1M MES, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 285K	分辨率 3.20 Å R-free 0.328
2Q5D Crystal Structure of Human Importin Beta bound to the Snurportin1 IBB-domain second crystal form 提交 2007-05-31	聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 1–876（876 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；285 K；22%PEG 8000, 0.05M SODIUM CHLORIDE 0.1M MES, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 285K	分辨率 3.20 Å R-free 0.328
2QNA Crystal structure of human Importin-beta (127-876) in complex with the IBB-domain of Snurportin1 (1-65) 提交 2007-07-18	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 127–876（750 aa）片段：residues 127-876	未记录	SO4 SULFATE ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.55；283 K；sodium citrate, Ammonium SO4, Ethanol, NaCl, Tris, pH 5.55, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 283K	分辨率 2.84 Å R-free 0.282
3LWW Structure of an open and closed conformation of Human Importin Beta bound to the Snurportin1 IBB-domain trapped in the same crystallographic asymmetric unit 提交 2010-02-24	聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–876（876 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；18% PEG 8000, 50 mM sodium chloride, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 3.15 Å R-free 0.313
3LWW Structure of an open and closed conformation of Human Importin Beta bound to the Snurportin1 IBB-domain trapped in the same crystallographic asymmetric unit 提交 2010-02-24	聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 C 1–876（876 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；18% PEG 8000, 50 mM sodium chloride, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 3.15 Å R-free 0.313
3W5K Crystal structure of Snail1 and importin beta complex 提交 2013-01-30	聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–876（876 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 4	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 2.60 Å R-free 0.264
6N88 Cryo-EM structure of the Importin7:Importin beta:Histone H1.0 complex 提交 2018-11-28	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 B 1–876（876 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 6.20 Å
6N89 Cryo-EM structure of the Importin beta:Histone H1.0 complex 提交 2018-11-28	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–876（876 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 7.50 Å
8GCN CRYO-EM STRUCTURE OF IMPORTIN ALPHA1/BETA HETERODIMER 提交 2023-03-02	聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–876（876 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.95 Å
9B4Y Cryo-EM structure of importin alpha-1/beta bound to TDP-43 提交 2024-03-21	聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–876（876 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.74 Å
9BAW Cryo-EM structure of human importin beta-Ran-GTP heterodimer 提交 2024-04-04	聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–876（876 aa）	未记录	GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.30 Å
9N85 Cryo-EM structure of human importin beta:Ran-GTP:RanBP1 trimeric complex 提交 2025-02-07	聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 A 1–876（876 aa）	未记录	GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.60 Å
9N86 Cryo-EM structure of human importin beta:importin alpha (IBB) complex 提交 2025-02-07	聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–876（876 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.30 Å
9N87 Cryo-EM structure of human importin beta: xIBB complex 提交 2025-02-07	聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–876（876 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.40 Å
9QEJ Cryo-EM structure of the Importin beta:Importin7:Histone H1.0 complex 提交 2025-03-10	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 B 1–876（876 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 6.20 Å
9YB5 Cryo-EM structure of human importin Beta:Ran-GDP:RanBP1 complex 提交 2025-09-16	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 B 2–459（458 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.20 Å

共 22 个其他 PDB 条目、29 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	IMB1_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 H； PDB构建体 1–876； UniProt 1–876

Importin subunit alpha-1

Homo sapiens

UniProt P52292

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 5 PDB 声明：hexameric（6）计数不一致，待复核	链 I； UniProt 1–53	未记录	PHE-GLY-ALA × 1 Importin subunit beta-1 × 1 （Q14974） LYS-PRO-ALA-PHE-SER-PHE-GLY × 1 ALA-PHE-SER-PHE × 1 PHE PHENYLALANINE × 2 GLY GLYCINE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 8 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.20 Å

数据库中的同蛋白其他状态

其他 PDB	相对当前条目 9BFC	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
1EFX STRUCTURE OF A COMPLEX BETWEEN THE HUMAN NATURAL KILLER CELL RECEPTOR KIR2DL2 AND A CLASS I MHC LIGAND HLA-CW3 提交 2000-02-10	构建体不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric	链 C 204–212（9 aa）片段：RESIDUES 204-212	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；298 K；PEG 20000, calcium chloride, sodium cacodylate, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K	分辨率 3.00 Å R-free 0.294
1QGK STRUCTURE OF IMPORTIN BETA BOUND TO THE IBB DOMAIN OF IMPORTIN ALPHA 提交 1999-04-29	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 11–54（44 aa）片段：IBB DOMAIN	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 6.5；pH 6.5	分辨率 2.50 Å R-free 0.273
1QGR STRUCTURE OF IMPORTIN BETA BOUND TO THE IBB DOMAIN OF IMPORTIN ALPHA (II CRYSTAL FORM, GROWN AT LOW PH) 提交 1999-05-04	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 28–54（27 aa）片段：IBB DOMAIN	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 3.9；pH 3.9	分辨率 2.30 Å R-free 0.285
3FEX Crystal structure of the CBC-importin alpha complex. 提交 2008-12-01	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 C 70–529（460 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；291 K；100 mM KCl, 12% PEG 8000, 100 mM Tris-HCl pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K	分辨率 3.55 Å R-free 0.292
3FEX Crystal structure of the CBC-importin alpha complex. 提交 2008-12-01	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 C 70–529（460 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；291 K；100 mM KCl, 12% PEG 8000, 100 mM Tris-HCl pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K	分辨率 3.55 Å R-free 0.292
3FEY Crystal structure of the CBC-importin alpha complex. 提交 2008-12-01	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 C 70–529（460 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；291 K；100 mM MES, pH 6.0, and 8% PEG 4000 , VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K	分辨率 2.20 Å R-free 0.238
3WPT Crystal structure of closed dimer of human importin-alpha1 (Rch1) 提交 2014-01-17	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 75–497（423 aa）片段：UNP residues 75-497	未记录	PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 11	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；293 K；50MM MES, 100MM AMMONIUM SULFATE, 10MM MGCL, 15-20%(w/v) PEG8000, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K	分辨率 2.63 Å R-free 0.216
3WPT Crystal structure of closed dimer of human importin-alpha1 (Rch1) 提交 2014-01-17	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 75–497（423 aa）片段：UNP residues 75-497	未记录	PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 6	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；293 K；50MM MES, 100MM AMMONIUM SULFATE, 10MM MGCL, 15-20%(w/v) PEG8000, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K	分辨率 2.63 Å R-free 0.216
4E4V The crystal structure of the dimeric human importin alpha 1 at 2.5 angstrom resolution. 提交 2012-03-13	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 70–529（460 aa）片段：Importin alpha 1 lacking IBB domain (UNP residues 70-529)	突变：K486R	GOL GLYCEROL × 8 DTT 2,3-DIHYDROXY-1,4-DITHIOBUTANE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.4；298 K；0.5 CITRATE PH 5.4 10 MM DTT, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K	分辨率 2.53 Å R-free 0.203
4E4V The crystal structure of the dimeric human importin alpha 1 at 2.5 angstrom resolution. 提交 2012-03-13	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 70–529（460 aa）片段：Importin alpha 1 lacking IBB domain (UNP residues 70-529)	突变：K486R	GOL GLYCEROL × 5 DTT 2,3-DIHYDROXY-1,4-DITHIOBUTANE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.4；298 K；0.5 CITRATE PH 5.4 10 MM DTT, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K	分辨率 2.53 Å R-free 0.203
4WV6 Heterodimer of Importin alpha 1 with nuclear localization signal of TAF8 提交 2014-11-04	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 A 60–529（470 aa）片段：UNP residues 60-529	未记录	EDO 1,2-ETHANEDIOL × 12	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.1；281.15 K；HEPES-NaOH, polyethylene glycole 3350, L-proline	分辨率 1.75 Å R-free 0.180
5H43 Structural and mechanistical studies of the nuclear import by Importin-alpha 提交 2016-10-28	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 A 70–497（428 aa）片段：UNP residues 70-497	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293.15 K；3%(v/v) Tacsimate pH5.0, 0.1M Sodium citrate tribasic dehydrate pH5.6, 16%(w/v) PEG 3350	分辨率 2.30 Å R-free 0.243
7CRU hnRNPK NLS in complex with Importin alpha 1 (KPNA2) 提交 2020-08-14	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 73–529（457 aa）	未记录	ACT ACETATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；293 K；0.1 M Ammonium Acetate, 0.1 M Bis-Tris pH 5.5, 17% w/v PEG 10000	分辨率 2.80 Å R-free 0.240
7CRU hnRNPK NLS in complex with Importin alpha 1 (KPNA2) 提交 2020-08-14	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 C 73–529（457 aa）	未记录	ACT ACETATE ION × 4 GOL GLYCEROL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；293 K；0.1 M Ammonium Acetate, 0.1 M Bis-Tris pH 5.5, 17% w/v PEG 10000	分辨率 2.80 Å R-free 0.240
7N8J Human importin alpha 1 in complex with Bimax2 peptide 提交 2021-06-15	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 76–529（454 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；296 K；0.4 M Ammonium phosphate monobasic	分辨率 3.20 Å R-free 0.244
7N9H Structure of the mammalian importin a1 bound to the TDP-43 NLS 提交 2021-06-17	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 C 70–497（428 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.6；293 K；0.5M sodium citrate, 10 mM mercaptoethanol	分辨率 2.20 Å R-free 0.215
8FZK Dimeric human importin alpha subunit 提交 2023-01-29	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 71–529（459 aa）链 B 71–529（459 aa）	未记录	MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；293 K；14% PEG 8000, 0.2M Magnesium chloride, 0.1M MES	分辨率 2.10 Å R-free 0.247
8FZK Dimeric human importin alpha subunit 提交 2023-01-29	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 C 71–529（459 aa）链 D 71–529（459 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；293 K；14% PEG 8000, 0.2M Magnesium chloride, 0.1M MES	分辨率 2.10 Å R-free 0.247
8GCN CRYO-EM STRUCTURE OF IMPORTIN ALPHA1/BETA HETERODIMER 提交 2023-03-02	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 11–53（43 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.95 Å
9B4Y Cryo-EM structure of importin alpha-1/beta bound to TDP-43 提交 2024-03-21	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 11–53（43 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.74 Å
9N86 Cryo-EM structure of human importin beta:importin alpha (IBB) complex 提交 2025-02-07	聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 1–53（53 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.30 Å

共 16 个其他 PDB 条目、21 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	IMA1_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	3
链与序列区间	作者链 I； PDB构建体 1–53； UniProt 1–53

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

下载 Download SAXS (.dat) P(r) (.pr.out) CIF

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	9bfc
沉积日期 deposition_date	2024-04-17
结构标题 title	Cryo-EM structure of importin alpha-1/beta bound to FG repeats
关键词 keywords	Importins, TRANSPORT PROTEIN, FG nucleoporins; TRANSPORT PROTEIN
实验方法 method	ELECTRON MICROSCOPY

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3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier	34.87 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron	34.32 Å
零角强度 I(0) i0	176468000.00
分子量 molecular_weight	105340.0 kDa
排除体积 excluded_volume	131720 Å³
包络体积 envelope_volume	190260 Å³
水化壳体积 shell_volume	45911 Å³
包络直径 envelope_diameter	110.6 Å
壳层 Rg shell_rg	41.63 Å
包络 Rg envelope_rg	33.01 Å
形状 Rg shape_rg	34.33 Å
总 Rg total_rg	34.89 Å
总原子数 total_atoms	7383
残基数 n_residues	943
球谐函数阶数 n_harmonics	20
q 范围 q_range	— – 0.5000 Å⁻¹
数据点数 n_points	101
壳层类型 shell_type	directional
溶剂电子密度 solvent_density	0.3340 e/Å³
壳层衬度 contrast_shell	0.0300 e/Å³
CRYSOL 版本 crysol_version	4.1.3

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4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax	106.5 Å
Rg (实空间) rg_real	34.69 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error	0.76 Å
I(0) (实空间) i0_real	1.7650e+08
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error	2.9600e+06
Rg (倒空间) rg_reciprocal	34.80 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal	176500000.0000
解质量估计 total_estimate	0.9078
解质量评级 solution_quality	EXCELLENT a EXCELLENT solution
P(r) 峰数 n_peaks	1
主峰位置 r_peak_primary	49.7 Å
偏度 Skewness skewness	0.046
峰度 Kurtosis kurtosis	-0.671
角度范围 angular_range	— – 0.2250 Å⁻¹
当前正则化参数 α current_alpha	0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha	93520000.0000
实空间数据点数 n_real_points	46
GNOM 版本 gnom_version	4.1.3
质量判据 quality_criteria	AN1: 0.000; Oscil: 0.952; Stabil: 1.000; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.997; Smooth: 0.944

▶

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

▶

6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (7)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	PHE-GLY-ALA
分子量 formula_weight	293.3 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	F
原子数 atom_count	7383

FGA

来源 Source

来源生物 organism	Saccharomyces cerevisiae
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	4932
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	Importin subunit beta-1
分子量 formula_weight	97323.9 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	H

MELITILEKTVSPDRLELEAAQKFLERAAVENLPTFLVELSRVLANPGNSQVARVAAGLQIKNSLTSKDPDIKAQYQQRWLAIDANARREVKNYVLHTLGTETYRPSSASQCVAGIACAEIPVNQWPELIPQLVANVTNPNSTEHMKESTLEAIGYICQDIDPEQLQDKSNEILTAIIQGMRKEEPSNNVKLAATNALLNSLEFTKANFDKESERHFIMQVVCEATQCPDTRVRVAALQNLVKIMSLYYQYMETYMGPALFAITIEAMKSDIDEVALQGIEFWSNVCDEEMDLAIEASEAAEQGRPPEHTSKFYAKGALQYLVPILTQTLTKQDENDDDDDWNPCKAAGVCLMLLATCCEDDIVPHVLPFIKEHIKNPDWRYRDAAVMAFGCILEGPEPSQLKPLVIQAMPTLIELMKDPSVVVRDTAAWTVGRICELLPEAAINDVYLAPLLQCLIEGLSAEPRVASNVCWAFSSLAEAAYEAADVADDQEEPATYCLSSSFELIVQKLLETTDRPDGHQNNLRSSAYESLMEIVKNSAKDCYPAVQKTTLVIMERLQQVLQMESHIQSTSDRIQFNDLQSLLCATLQNVLRKVQHQDALQISDVVMASLLRMFQSTAGSGGVQEDALMAVSTLVEVLGGEFLKYMEAFKPFLGIGLKNYAEYQVCLAAVGLVGDLCRALQSNIIPFCDEVMQLLLENLGNENVHRSVKPQILSVFGDIALAIGGEFKKYLEVVLNTLQQASQAQVDKSDYDMVDYLNELRESCLEAYTGIVQGLKGDQENVHPDVMLVQPRVEFILSFIDHIAGDEDHTDGVVACAAGLIGDLCTAFGKDVLKLVEARPMIHELLTEGRRSKTNKAKTLARWATKELRKLKNQA

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 3 Entity 3 polymer

描述 description	Importin subunit alpha-1
分子量 formula_weight	6356.4 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	I

MSTNENANTPAARLHRFKNKGKDSTEMRRRRIEVNVELRKAKKDDQMLKRRNV

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 4 Entity 4 polymer

描述 description	LYS-PRO-ALA-PHE-SER-PHE-GLY
分子量 formula_weight	753.9 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	J

KPAFSFG

来源 Source

来源生物 organism	Saccharomyces cerevisiae
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	4932
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 5 Entity 5 polymer

描述 description	ALA-PHE-SER-PHE
分子量 formula_weight	470.5 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	C

AFSF

来源 Source

来源生物 organism	Saccharomyces cerevisiae
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	4932
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 6 Entity 6 non-polymer

描述 description	PHENYLALANINE
分子量 formula_weight	165.2 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	2

实体 7 Entity 7 non-polymer

描述 description	GLYCINE
分子量 formula_weight	75.1 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

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8. 引用文献 (1)

▶

晶胞边长 a length_a	1.000 Å
晶胞边长 b length_b	1.000 Å
晶胞边长 c length_c	1.000 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	—

空间群 space_group	P 1
空间群编号 int_tables_number	1
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	3.200 Å
最低分辨率 resolution_low	— Å
R 因子 r_factor	—
R_work r_work	—
R_free r_free	—

分辨率 resolution	3.20 Å
分辨率测定方法 resolution_method	—
颗粒数 num_particles	593354

fit	/app/data/saxs_computation/bf/9bfc/9bfc.fit
pddf	/app/data/pr_computation/bf/9bfc/9bfc.pr.out
profile	/app/data/saxs_computation/bf/9bfc/9bfc.dat

Cryo-EM structure of importin alpha-1/beta bound to FG repeats

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Importin subunit beta-1

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Importin subunit alpha-1

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

冷冻电镜 EM 3D

6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (7)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 4 Entity 4 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 5 Entity 5 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 6 Entity 6 non-polymer

实体 7 Entity 7 non-polymer

8. 引用文献 (1)

9. 文件与曲线 (10)

Files (7)

Curves (3)