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9bw5

Human Vault Cage

Method: ELECTRON MICROSCOPY Dmax: 420.0 Å Quality: SUSPICIOUS

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

SAXS profile for 9bw5

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

P(r) distribution for 9bw5
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1. 结构基本信息 1. Structure Basics

条目编号 entry_id9bw5
沉积日期 deposition_date2024-05-20
结构标题 titleHuman Vault Cage
关键词 keywords;Vault, Vault Cage, MVP, Major Vault Protein, SPFH, PARP4, Poly(ADP-ribose)Polymerase 4, Poly(ADP-ribose)Polymerase, MINT, Ribonucleoprotein, Megadalton complex, TEP1, vault RNA, PROTEIN TRANSPORT ;; PROTEIN TRANSPORT
实验方法 methodELECTRON MICROSCOPY
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2. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 2. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier— Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron177.70 Å
零角强度 I(0) i0419330000.00
分子量 molecular_weight174300.0 kDa
排除体积 excluded_volume218440 ų
包络体积 envelope_volume1091200 ų
水化壳体积 shell_volume56103 ų
包络直径 envelope_diameter683.7 Å
壳层 Rg shell_rg99.92 Å
包络 Rg envelope_rg198.30 Å
形状 Rg shape_rg177.40 Å
总 Rg total_rg178.10 Å
总原子数 total_atoms12300
残基数 n_residues1550
球谐函数阶数 n_harmonics20
q 范围 q_range— – 0.5000 Å−1
数据点数 n_points101
壳层类型 shell_typedirectional
溶剂电子密度 solvent_density0.3340 e/ų
壳层衬度 contrast_shell0.0300 e/ų
CRYSOL 版本 crysol_version4.1.3
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3. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 3. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax420.0 Å
Rg (实空间) rg_real150.70 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error3.46 Å
I(0) (实空间) i0_real3.9160e+08
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error1.1630e+07
Rg (倒空间) rg_reciprocal105.90 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal340500000.0000
解质量估计 total_estimate0.4334
解质量评级 solution_quality SUSPICIOUS a SUSPICIOUS solution
P(r) 峰数 n_peaks3
主峰位置 r_peak_primary52.5 Å
偏度 Skewness skewness0.265
峰度 Kurtosis kurtosis-1.207
角度范围 angular_range— – 0.0400 Å−1
当前正则化参数 α current_alpha0.2554
最高正则化参数 α highest_alpha150900000.0000
实空间数据点数 n_real_points9
GNOM 版本 gnom_version4.1.3
质量判据 quality_criteria AN1: 0.556; Oscil: 0.040; Stabil: 0.876; Sysdev: 0.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.962; Smooth: 0.489
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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合体信息 (1)

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7. 引用文献 (4)

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8. 文件与曲线 (10)