9dm1

Mycobacterial supercomplex malate:quinone oxidoreductase assembly

Method: ELECTRON MICROSCOPY

▼

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Cytochrome c oxidase subunit 1

物种未注明

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 25	Cytochrome bc1 complex cytochrome b subunit × 2 （I7FGS8） Superoxide dismutase [Cu-Zn] × 2 （I7G2H6） Cytochrome aa3 subunit 2 × 2 （I7GD63） Cytochrome aa3 subunit 3 × 2 （A0R049） Cytochrome c oxidase polypeptide 4 × 2 （I7FPH7） Cytochrome c oxidase subunit CtaJ × 2 （I7FQK8） Uncharacterized protein MSMEG_4692/MSMEI_4575 × 2 （A0R1B5） Conserved transmembrane protein × 2 Cytochrome bc1 complex cytochrome c subunit × 2 （I7FPH1） LpqE protein × 2 （I7GFE1） Cytochrome bc1 complex Rieske iron-sulfur subunit × 2 （I7GD61） Probable malate:quinone oxidoreductase × 1 （A0QVL2） COPPER (II) ION × 6 HEME-A × 4 CARDIOLIPIN × 16 PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 4 MENAQUINONE-9 × 8 (2R)-3-(((2-aminoethoxy)(hydroxy)phosphoryl)oxy)-2-(palmitoyloxy)propyl (E)-octadec-9-enoate × 6 PALMITIC ACID × 4 (2S)-1-(hexadecanoyloxy)propan-2-yl (10S)-10-methyloctadecanoate × 4 HEME C × 4 ;(2R)-2-(hexadecanoyloxy)-3-{[(S)-hydroxy{[(1R,2R,3R,4R,5R,6S)-2,3,4,5,6-pentahydroxycyclohexyl]oxy}phosphoryl]oxy}propyl (9S)-9-methyloctadecanoate ; × 8 FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	A0A0K0XH24_MYCGD
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 L； PDB构建体 1–566； UniProt 10–575 作者链 R； PDB构建体 1–566； UniProt 10–575

Cytochrome bc1 complex cytochrome b subunit

物种未注明

UniProt I7FGS8

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 25	Cytochrome c oxidase subunit 1 × 2 （A0A0K0XH24） Superoxide dismutase [Cu-Zn] × 2 （I7G2H6） Cytochrome aa3 subunit 2 × 2 （I7GD63） Cytochrome aa3 subunit 3 × 2 （A0R049） Cytochrome c oxidase polypeptide 4 × 2 （I7FPH7） Cytochrome c oxidase subunit CtaJ × 2 （I7FQK8） Uncharacterized protein MSMEG_4692/MSMEI_4575 × 2 （A0R1B5） Conserved transmembrane protein × 2 Cytochrome bc1 complex cytochrome c subunit × 2 （I7FPH1） LpqE protein × 2 （I7GFE1） Cytochrome bc1 complex Rieske iron-sulfur subunit × 2 （I7GD61） Probable malate:quinone oxidoreductase × 1 （A0QVL2） COPPER (II) ION × 6 HEME-A × 4 CARDIOLIPIN × 16 PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 4 MENAQUINONE-9 × 8 (2R)-3-(((2-aminoethoxy)(hydroxy)phosphoryl)oxy)-2-(palmitoyloxy)propyl (E)-octadec-9-enoate × 6 PALMITIC ACID × 4 (2S)-1-(hexadecanoyloxy)propan-2-yl (10S)-10-methyloctadecanoate × 4 HEME C × 4 ;(2R)-2-(hexadecanoyloxy)-3-{[(S)-hydroxy{[(1R,2R,3R,4R,5R,6S)-2,3,4,5,6-pentahydroxycyclohexyl]oxy}phosphoryl]oxy}propyl (9S)-9-methyloctadecanoate ; × 8 FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	I7FGS8_MYCS2
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 E； PDB构建体 1–535； UniProt 4–538 作者链 F； PDB构建体 1–535； UniProt 4–538

Superoxide dismutase [Cu-Zn]

物种未注明

UniProt I7G2H6

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 25	Cytochrome c oxidase subunit 1 × 2 （A0A0K0XH24） Cytochrome bc1 complex cytochrome b subunit × 2 （I7FGS8） Cytochrome aa3 subunit 2 × 2 （I7GD63） Cytochrome aa3 subunit 3 × 2 （A0R049） Cytochrome c oxidase polypeptide 4 × 2 （I7FPH7） Cytochrome c oxidase subunit CtaJ × 2 （I7FQK8） Uncharacterized protein MSMEG_4692/MSMEI_4575 × 2 （A0R1B5） Conserved transmembrane protein × 2 Cytochrome bc1 complex cytochrome c subunit × 2 （I7FPH1） LpqE protein × 2 （I7GFE1） Cytochrome bc1 complex Rieske iron-sulfur subunit × 2 （I7GD61） Probable malate:quinone oxidoreductase × 1 （A0QVL2） COPPER (II) ION × 6 HEME-A × 4 CARDIOLIPIN × 16 PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 4 MENAQUINONE-9 × 8 (2R)-3-(((2-aminoethoxy)(hydroxy)phosphoryl)oxy)-2-(palmitoyloxy)propyl (E)-octadec-9-enoate × 6 PALMITIC ACID × 4 (2S)-1-(hexadecanoyloxy)propan-2-yl (10S)-10-methyloctadecanoate × 4 HEME C × 4 ;(2R)-2-(hexadecanoyloxy)-3-{[(S)-hydroxy{[(1R,2R,3R,4R,5R,6S)-2,3,4,5,6-pentahydroxycyclohexyl]oxy}phosphoryl]oxy}propyl (9S)-9-methyloctadecanoate ; × 8 FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	I7G2H6_MYCS2
Isoform	—
PDB实体	3
链与序列区间	作者链 D； PDB构建体 1–216； UniProt 21–236 作者链 G； PDB构建体 1–216； UniProt 21–236

Cytochrome aa3 subunit 2

物种未注明

UniProt I7GD63

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 25	Cytochrome c oxidase subunit 1 × 2 （A0A0K0XH24） Cytochrome bc1 complex cytochrome b subunit × 2 （I7FGS8） Superoxide dismutase [Cu-Zn] × 2 （I7G2H6） Cytochrome aa3 subunit 3 × 2 （A0R049） Cytochrome c oxidase polypeptide 4 × 2 （I7FPH7） Cytochrome c oxidase subunit CtaJ × 2 （I7FQK8） Uncharacterized protein MSMEG_4692/MSMEI_4575 × 2 （A0R1B5） Conserved transmembrane protein × 2 Cytochrome bc1 complex cytochrome c subunit × 2 （I7FPH1） LpqE protein × 2 （I7GFE1） Cytochrome bc1 complex Rieske iron-sulfur subunit × 2 （I7GD61） Probable malate:quinone oxidoreductase × 1 （A0QVL2） COPPER (II) ION × 6 HEME-A × 4 CARDIOLIPIN × 16 PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 4 MENAQUINONE-9 × 8 (2R)-3-(((2-aminoethoxy)(hydroxy)phosphoryl)oxy)-2-(palmitoyloxy)propyl (E)-octadec-9-enoate × 6 PALMITIC ACID × 4 (2S)-1-(hexadecanoyloxy)propan-2-yl (10S)-10-methyloctadecanoate × 4 HEME C × 4 ;(2R)-2-(hexadecanoyloxy)-3-{[(S)-hydroxy{[(1R,2R,3R,4R,5R,6S)-2,3,4,5,6-pentahydroxycyclohexyl]oxy}phosphoryl]oxy}propyl (9S)-9-methyloctadecanoate ; × 8 FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	I7GD63_MYCS2
Isoform	—
PDB实体	4
链与序列区间	作者链 K； PDB构建体 1–312； UniProt 27–338 作者链 Q； PDB构建体 1–312； UniProt 27–338

Cytochrome aa3 subunit 3

物种未注明

UniProt A0R049

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 25	Cytochrome c oxidase subunit 1 × 2 （A0A0K0XH24） Cytochrome bc1 complex cytochrome b subunit × 2 （I7FGS8） Superoxide dismutase [Cu-Zn] × 2 （I7G2H6） Cytochrome aa3 subunit 2 × 2 （I7GD63） Cytochrome c oxidase polypeptide 4 × 2 （I7FPH7） Cytochrome c oxidase subunit CtaJ × 2 （I7FQK8） Uncharacterized protein MSMEG_4692/MSMEI_4575 × 2 （A0R1B5） Conserved transmembrane protein × 2 Cytochrome bc1 complex cytochrome c subunit × 2 （I7FPH1） LpqE protein × 2 （I7GFE1） Cytochrome bc1 complex Rieske iron-sulfur subunit × 2 （I7GD61） Probable malate:quinone oxidoreductase × 1 （A0QVL2） COPPER (II) ION × 6 HEME-A × 4 CARDIOLIPIN × 16 PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 4 MENAQUINONE-9 × 8 (2R)-3-(((2-aminoethoxy)(hydroxy)phosphoryl)oxy)-2-(palmitoyloxy)propyl (E)-octadec-9-enoate × 6 PALMITIC ACID × 4 (2S)-1-(hexadecanoyloxy)propan-2-yl (10S)-10-methyloctadecanoate × 4 HEME C × 4 ;(2R)-2-(hexadecanoyloxy)-3-{[(S)-hydroxy{[(1R,2R,3R,4R,5R,6S)-2,3,4,5,6-pentahydroxycyclohexyl]oxy}phosphoryl]oxy}propyl (9S)-9-methyloctadecanoate ; × 8 FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	A0R049_MYCS2
Isoform	—
PDB实体	5
链与序列区间	作者链 S； PDB构建体 1–203； UniProt 1–203 作者链 X； PDB构建体 1–203； UniProt 1–203

Cytochrome c oxidase polypeptide 4

物种未注明

UniProt I7FPH7

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 25	Cytochrome c oxidase subunit 1 × 2 （A0A0K0XH24） Cytochrome bc1 complex cytochrome b subunit × 2 （I7FGS8） Superoxide dismutase [Cu-Zn] × 2 （I7G2H6） Cytochrome aa3 subunit 2 × 2 （I7GD63） Cytochrome aa3 subunit 3 × 2 （A0R049） Cytochrome c oxidase subunit CtaJ × 2 （I7FQK8） Uncharacterized protein MSMEG_4692/MSMEI_4575 × 2 （A0R1B5） Conserved transmembrane protein × 2 Cytochrome bc1 complex cytochrome c subunit × 2 （I7FPH1） LpqE protein × 2 （I7GFE1） Cytochrome bc1 complex Rieske iron-sulfur subunit × 2 （I7GD61） Probable malate:quinone oxidoreductase × 1 （A0QVL2） COPPER (II) ION × 6 HEME-A × 4 CARDIOLIPIN × 16 PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 4 MENAQUINONE-9 × 8 (2R)-3-(((2-aminoethoxy)(hydroxy)phosphoryl)oxy)-2-(palmitoyloxy)propyl (E)-octadec-9-enoate × 6 PALMITIC ACID × 4 (2S)-1-(hexadecanoyloxy)propan-2-yl (10S)-10-methyloctadecanoate × 4 HEME C × 4 ;(2R)-2-(hexadecanoyloxy)-3-{[(S)-hydroxy{[(1R,2R,3R,4R,5R,6S)-2,3,4,5,6-pentahydroxycyclohexyl]oxy}phosphoryl]oxy}propyl (9S)-9-methyloctadecanoate ; × 8 FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	I7FPH7_MYCS2
Isoform	—
PDB实体	6
链与序列区间	作者链 T； PDB构建体 1–139； UniProt 1–139 作者链 Z； PDB构建体 1–139； UniProt 1–139

Cytochrome c oxidase subunit CtaJ

物种未注明

UniProt I7FQK8

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 25	Cytochrome c oxidase subunit 1 × 2 （A0A0K0XH24） Cytochrome bc1 complex cytochrome b subunit × 2 （I7FGS8） Superoxide dismutase [Cu-Zn] × 2 （I7G2H6） Cytochrome aa3 subunit 2 × 2 （I7GD63） Cytochrome aa3 subunit 3 × 2 （A0R049） Cytochrome c oxidase polypeptide 4 × 2 （I7FPH7） Uncharacterized protein MSMEG_4692/MSMEI_4575 × 2 （A0R1B5） Conserved transmembrane protein × 2 Cytochrome bc1 complex cytochrome c subunit × 2 （I7FPH1） LpqE protein × 2 （I7GFE1） Cytochrome bc1 complex Rieske iron-sulfur subunit × 2 （I7GD61） Probable malate:quinone oxidoreductase × 1 （A0QVL2） COPPER (II) ION × 6 HEME-A × 4 CARDIOLIPIN × 16 PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 4 MENAQUINONE-9 × 8 (2R)-3-(((2-aminoethoxy)(hydroxy)phosphoryl)oxy)-2-(palmitoyloxy)propyl (E)-octadec-9-enoate × 6 PALMITIC ACID × 4 (2S)-1-(hexadecanoyloxy)propan-2-yl (10S)-10-methyloctadecanoate × 4 HEME C × 4 ;(2R)-2-(hexadecanoyloxy)-3-{[(S)-hydroxy{[(1R,2R,3R,4R,5R,6S)-2,3,4,5,6-pentahydroxycyclohexyl]oxy}phosphoryl]oxy}propyl (9S)-9-methyloctadecanoate ; × 8 FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	I7FQK8_MYCS2
Isoform	—
PDB实体	7
链与序列区间	作者链 U； PDB构建体 1–79； UniProt 1–79 作者链 a； PDB构建体 1–79； UniProt 1–79

Uncharacterized protein MSMEG_4692/MSMEI_4575

物种未注明

UniProt A0R1B5

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 25	Cytochrome c oxidase subunit 1 × 2 （A0A0K0XH24） Cytochrome bc1 complex cytochrome b subunit × 2 （I7FGS8） Superoxide dismutase [Cu-Zn] × 2 （I7G2H6） Cytochrome aa3 subunit 2 × 2 （I7GD63） Cytochrome aa3 subunit 3 × 2 （A0R049） Cytochrome c oxidase polypeptide 4 × 2 （I7FPH7） Cytochrome c oxidase subunit CtaJ × 2 （I7FQK8） Conserved transmembrane protein × 2 Cytochrome bc1 complex cytochrome c subunit × 2 （I7FPH1） LpqE protein × 2 （I7GFE1） Cytochrome bc1 complex Rieske iron-sulfur subunit × 2 （I7GD61） Probable malate:quinone oxidoreductase × 1 （A0QVL2） COPPER (II) ION × 6 HEME-A × 4 CARDIOLIPIN × 16 PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 4 MENAQUINONE-9 × 8 (2R)-3-(((2-aminoethoxy)(hydroxy)phosphoryl)oxy)-2-(palmitoyloxy)propyl (E)-octadec-9-enoate × 6 PALMITIC ACID × 4 (2S)-1-(hexadecanoyloxy)propan-2-yl (10S)-10-methyloctadecanoate × 4 HEME C × 4 ;(2R)-2-(hexadecanoyloxy)-3-{[(S)-hydroxy{[(1R,2R,3R,4R,5R,6S)-2,3,4,5,6-pentahydroxycyclohexyl]oxy}phosphoryl]oxy}propyl (9S)-9-methyloctadecanoate ; × 8 FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	Y4692_MYCS2
Isoform	—
PDB实体	8
链与序列区间	作者链 V； PDB构建体 1–145； UniProt 13–157 作者链 b； PDB构建体 1–145； UniProt 13–157

Cytochrome bc1 complex cytochrome c subunit

物种未注明

UniProt I7FPH1

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 25	Cytochrome c oxidase subunit 1 × 2 （A0A0K0XH24） Cytochrome bc1 complex cytochrome b subunit × 2 （I7FGS8） Superoxide dismutase [Cu-Zn] × 2 （I7G2H6） Cytochrome aa3 subunit 2 × 2 （I7GD63） Cytochrome aa3 subunit 3 × 2 （A0R049） Cytochrome c oxidase polypeptide 4 × 2 （I7FPH7） Cytochrome c oxidase subunit CtaJ × 2 （I7FQK8） Uncharacterized protein MSMEG_4692/MSMEI_4575 × 2 （A0R1B5） Conserved transmembrane protein × 2 LpqE protein × 2 （I7GFE1） Cytochrome bc1 complex Rieske iron-sulfur subunit × 2 （I7GD61） Probable malate:quinone oxidoreductase × 1 （A0QVL2） COPPER (II) ION × 6 HEME-A × 4 CARDIOLIPIN × 16 PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 4 MENAQUINONE-9 × 8 (2R)-3-(((2-aminoethoxy)(hydroxy)phosphoryl)oxy)-2-(palmitoyloxy)propyl (E)-octadec-9-enoate × 6 PALMITIC ACID × 4 (2S)-1-(hexadecanoyloxy)propan-2-yl (10S)-10-methyloctadecanoate × 4 HEME C × 4 ;(2R)-2-(hexadecanoyloxy)-3-{[(S)-hydroxy{[(1R,2R,3R,4R,5R,6S)-2,3,4,5,6-pentahydroxycyclohexyl]oxy}phosphoryl]oxy}propyl (9S)-9-methyloctadecanoate ; × 8 FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	I7FPH1_MYCS2
Isoform	—
PDB实体	10
链与序列区间	作者链 I； PDB构建体 1–223； UniProt 72–294 作者链 O； PDB构建体 1–223； UniProt 72–294

LpqE protein

物种未注明

UniProt I7GFE1

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 25	Cytochrome c oxidase subunit 1 × 2 （A0A0K0XH24） Cytochrome bc1 complex cytochrome b subunit × 2 （I7FGS8） Superoxide dismutase [Cu-Zn] × 2 （I7G2H6） Cytochrome aa3 subunit 2 × 2 （I7GD63） Cytochrome aa3 subunit 3 × 2 （A0R049） Cytochrome c oxidase polypeptide 4 × 2 （I7FPH7） Cytochrome c oxidase subunit CtaJ × 2 （I7FQK8） Uncharacterized protein MSMEG_4692/MSMEI_4575 × 2 （A0R1B5） Conserved transmembrane protein × 2 Cytochrome bc1 complex cytochrome c subunit × 2 （I7FPH1） Cytochrome bc1 complex Rieske iron-sulfur subunit × 2 （I7GD61） Probable malate:quinone oxidoreductase × 1 （A0QVL2） COPPER (II) ION × 6 HEME-A × 4 CARDIOLIPIN × 16 PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 4 MENAQUINONE-9 × 8 (2R)-3-(((2-aminoethoxy)(hydroxy)phosphoryl)oxy)-2-(palmitoyloxy)propyl (E)-octadec-9-enoate × 6 PALMITIC ACID × 4 (2S)-1-(hexadecanoyloxy)propan-2-yl (10S)-10-methyloctadecanoate × 4 HEME C × 4 ;(2R)-2-(hexadecanoyloxy)-3-{[(S)-hydroxy{[(1R,2R,3R,4R,5R,6S)-2,3,4,5,6-pentahydroxycyclohexyl]oxy}phosphoryl]oxy}propyl (9S)-9-methyloctadecanoate ; × 8 FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	I7GFE1_MYCS2
Isoform	—
PDB实体	11
链与序列区间	作者链 W； PDB构建体 1–159； UniProt 24–182 作者链 c； PDB构建体 1–159； UniProt 24–182

Cytochrome bc1 complex Rieske iron-sulfur subunit

物种未注明

UniProt I7GD61

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 25	Cytochrome c oxidase subunit 1 × 2 （A0A0K0XH24） Cytochrome bc1 complex cytochrome b subunit × 2 （I7FGS8） Superoxide dismutase [Cu-Zn] × 2 （I7G2H6） Cytochrome aa3 subunit 2 × 2 （I7GD63） Cytochrome aa3 subunit 3 × 2 （A0R049） Cytochrome c oxidase polypeptide 4 × 2 （I7FPH7） Cytochrome c oxidase subunit CtaJ × 2 （I7FQK8） Uncharacterized protein MSMEG_4692/MSMEI_4575 × 2 （A0R1B5） Conserved transmembrane protein × 2 Cytochrome bc1 complex cytochrome c subunit × 2 （I7FPH1） LpqE protein × 2 （I7GFE1） Probable malate:quinone oxidoreductase × 1 （A0QVL2） COPPER (II) ION × 6 HEME-A × 4 CARDIOLIPIN × 16 PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 4 MENAQUINONE-9 × 8 (2R)-3-(((2-aminoethoxy)(hydroxy)phosphoryl)oxy)-2-(palmitoyloxy)propyl (E)-octadec-9-enoate × 6 PALMITIC ACID × 4 (2S)-1-(hexadecanoyloxy)propan-2-yl (10S)-10-methyloctadecanoate × 4 HEME C × 4 ;(2R)-2-(hexadecanoyloxy)-3-{[(S)-hydroxy{[(1R,2R,3R,4R,5R,6S)-2,3,4,5,6-pentahydroxycyclohexyl]oxy}phosphoryl]oxy}propyl (9S)-9-methyloctadecanoate ; × 8 FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	I7GD61_MYCS2
Isoform	—
PDB实体	12
链与序列区间	作者链 M； PDB构建体 1–382； UniProt 40–421 作者链 Y； PDB构建体 1–382； UniProt 40–421

Probable malate:quinone oxidoreductase

物种未注明

UniProt A0QVL2

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 25	Cytochrome c oxidase subunit 1 × 2 （A0A0K0XH24） Cytochrome bc1 complex cytochrome b subunit × 2 （I7FGS8） Superoxide dismutase [Cu-Zn] × 2 （I7G2H6） Cytochrome aa3 subunit 2 × 2 （I7GD63） Cytochrome aa3 subunit 3 × 2 （A0R049） Cytochrome c oxidase polypeptide 4 × 2 （I7FPH7） Cytochrome c oxidase subunit CtaJ × 2 （I7FQK8） Uncharacterized protein MSMEG_4692/MSMEI_4575 × 2 （A0R1B5） Conserved transmembrane protein × 2 Cytochrome bc1 complex cytochrome c subunit × 2 （I7FPH1） LpqE protein × 2 （I7GFE1） Cytochrome bc1 complex Rieske iron-sulfur subunit × 2 （I7GD61） COPPER (II) ION × 6 HEME-A × 4 CARDIOLIPIN × 16 PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 4 MENAQUINONE-9 × 8 (2R)-3-(((2-aminoethoxy)(hydroxy)phosphoryl)oxy)-2-(palmitoyloxy)propyl (E)-octadec-9-enoate × 6 PALMITIC ACID × 4 (2S)-1-(hexadecanoyloxy)propan-2-yl (10S)-10-methyloctadecanoate × 4 HEME C × 4 ;(2R)-2-(hexadecanoyloxy)-3-{[(S)-hydroxy{[(1R,2R,3R,4R,5R,6S)-2,3,4,5,6-pentahydroxycyclohexyl]oxy}phosphoryl]oxy}propyl (9S)-9-methyloctadecanoate ; × 8 FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	MQO_MYCS2
Isoform	—
PDB实体	13
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–510； UniProt 1–510

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	9dm1
沉积日期 deposition_date	2024-09-11
结构标题 title	Mycobacterial supercomplex malate:quinone oxidoreductase assembly
关键词 keywords	Electron transport chain, mycobacterial CIII2CIV2 supercomplex, MEMBRANE PROTEIN; MEMBRANE PROTEIN
实验方法 method	ELECTRON MICROSCOPY

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

9dm1__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

9dm1__assembly_1__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

9dm1__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	65.64 Å
Rg（电子密度）	64.51 Å
总 Rg	64.20 Å
原子数	51339
残基数	6557
排除体积	925990 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`9dm1__assembly_1__model_1`	25-meric （25）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (24)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	Cytochrome c oxidase subunit 1
分子量 formula_weight	63296.9 kDa
EC 编号 ec_number	7.1.1.9
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	R,L
原子数 atom_count	51339

ELEARRPFPERMGPKGNLIYKLITTTDHKLIGIMYCVVCFAFFLVGGLMALFMRTELAMPGLQFLSNEQFNQLFTMHGTVMLLFYATPIVFGFANLVLPLQIGAPDVAFPRLNALSFWLFLFGALIAIAGFITPGGAADFGWTAYSPLTDAIHSPGAGGDLWIMGLAVGGLGTILGGVNMITTVVCMRAPGMTMFRMPIFTWNILVTSILVLIAFPILTAALFGLAADRHLGAHIYDPANGGVLLWQHLFWFFGHPEVYIIALPFFGIVSEIFPVFSRKPIFGYTTLIYATLAIAALSVAVWAHHMYATGAVLLPFFSFMTFLIAVPTGIKFFNWIGTMWKGQLTFETPMLFSVGFLITFLLGGLSGVLLASPPLDFHVTDSYFVIAHFHYVLFGTIVFATYAGIYFWFPKMTGRLLDERLGKLHFWLTFIGFHTTFLVQHWLGDEGMPRRYADYLPTDGFTTLNVISTVGAFILGVSMLPFVWNVFKSWRYGEPVTVDDPWGYGNSLEWATSCPPPRHNFTELPRIRSERPAFELHYPHMVERMRAEAHVGRAHHPELETADKSS

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	Cytochrome bc1 complex cytochrome b subunit
分子量 formula_weight	59110.8 kDa
EC 编号 ec_number	7.1.1.8
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	E,F

DFAKLAAAQGDAIDSRYHPSAAVRRQLNKVFPTHWSFLLGEIALYSFIILLLTGVWLTLFFDPSMAHVTYDGVYQPLRGVQMSRAYETALDISFEVRGGLFVRQVHHWAALMFAASIMVHLARIFFTGAFRRPREANWVIGSLLLILAMFEGFFGYSLPDDLLSGTGIRAALSGITMGIPVIGTWMHWALFGGDFPGEILIPRLYALHILLIPGIILALIGAHLALVWFQKHTQFPGPGRTETNVVGVRVMPVFAVKSGAFFAMITGVLGLMGGLLTINPIWNLGPYKPSQVSAGSQPDFYMMWTDGLIRLWPAWEFYPFGHTIPQGVWVAVGMGLVFALLIAYPFIEKKVTGDDAHHNLLQRPRDVPVRTAIGSMAIALYLLLTFACMNDIIALKFHISLNATTWIGRIGMVVLPAIVYFVAYRWAISLQRSDREVLEHGVETGIIKRLPHGAYVELHQPLGPVDEHGHPIPLEYAGAPLPKRMNKLGSGGAPGTGSFLFPDPAVEHEALTEAAHASEHKSLTALKEHQDRIHG

实体 3 Entity 3 polymer

描述 description	Superoxide dismutase [Cu-Zn]
分子量 formula_weight	21221.9 kDa
EC 编号 ec_number	1.15.1.1
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	D,G

CSPPGETASSEPGTTPAIWTGSPSPAAPSGEDHGGGHGAGAAGAGETLTAELKTADGTSVATADFQFADGFATVTIETTTPGRLTPGFHGVHIHSVGKCEANSVAPTGGAPGDFNSAGGHFQVSGHSGHPASGDLSSLQVRADGSGKLVTTTDAFTAEDLLDGAKTAIIIHEKADNFANIPPERYQQVNGAPGPDQTTMATGDAGSRVACGVISAG

实体 4 Entity 4 polymer

描述 description	Cytochrome aa3 subunit 2
分子量 formula_weight	35201.0 kDa
EC 编号 ec_number	7.1.1.9
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	Q,K

WSDALALGWPTGITPEAKLNRELWIGSVIASFAVGAIVWGLIFWTSAFHRKKATDTELPRQFGYNMPLELTLTVIPFLIISVLFYFTVVVQERMMHKDPNPEVVIDVTAFQWNWKFGYQKIAFADGSFDYDGADPERKEAMTSRPEGKDEHGIEKVGPIRGMTPEDRTYLNFDKIETLGTSSEIPVLVLPAGKRIEFVLNSADVIHGFWVPEFLFKRDVLPEPKANNSDNVFQVSEIQQTGAFVGRCTEMCGTFHAMMNFEVRVVEPNDFKAYIDQRNAGKTNAEALAAINQPPLAITTEPFESRRGELVPQ

实体 5 Entity 5 polymer

描述 description	Cytochrome aa3 subunit 3
分子量 formula_weight	22196.9 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	S,X

MTSAVGTSGTAITSRVHSLNRPNMVSVGTIVWLSSELMFFAGLFAMYFTARAQAGGAWPPEPTELNLALAVPVTLVLIASSFTCQMGVFAAERGDVFGLRRWYVITFLMGLFFVLGQGYEYIHLVEHGTTIPGSAYGSVFYLATGFHGLHVIGGLVAFVLLLARTKMSKFTPAQATAAIVVSYYWHFVDIVWIALFATIYFVR

实体 6 Entity 6 polymer

描述 description	Cytochrome c oxidase polypeptide 4
分子量 formula_weight	15177.4 kDa
EC 编号 ec_number	7.1.1.9
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	T,Z

MHIEARLFEILTAFFALAAVVYAVLTAMFATGGVEWAGTTALVLTTGLTLITGTFFRFVARRLDTRPEDYEDAEISDGAGELGFFAPHSWWPILISLSFSTAAVGAALWLPWLIAAGVAFVITSVCGLVFEYYWGPEKH

实体 7 Entity 7 polymer

描述 description	Cytochrome c oxidase subunit CtaJ
分子量 formula_weight	8365.5 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	U,a

MSTALTHGLIGGVPLVLFAVLALIFLTRKGPHPDTYKMSDPWTHAPILWAAEEPREHGHGGHGHDSHGVVIGGGASGKW

实体 8 Entity 8 polymer

描述 description	Uncharacterized protein MSMEG_4692/MSMEI_4575
分子量 formula_weight	14808.7 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	V,b

ELDLPYGSALTSSGRISAVTEPGELSVHYPFPTMDLVVLDDALKYGSRAAKARFAVYIGPLGADTAATAREILANVPTPENAVLLAVSPDQRAIEVVYGADVKGRGIESAAPLGVSAAAASFKEGNLIDGLISAVRVMSAGVSPA

实体 9 Entity 9 polymer

描述 description	Conserved transmembrane protein
分子量 formula_weight	11329.9 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	P,J

MSSTQDRSQLDPEEQPVANTEVERHTGVDVEDVPSAEWGWSHMPIGVMHIGGLLSAAFLLVMMRGNHVGHVEDWFLIGFAAVIVALVGRNWWLRRRGWIR

实体 10 Entity 10 polymer

描述 description	Cytochrome bc1 complex cytochrome c subunit
分子量 formula_weight	23184.0 kDa
EC 编号 ec_number	7.1.1.8
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	O,I

QSALLRTGKQLFETSCVSCHGANLQGVPDRGPSLIGTGEAAVYFQVSTGRMPAMRGEAQAPSKPPHFDESQIDALGAYVQANGGGPTVPRDDHGAVAQESLIGGDVARGGDLFRLNCASCHNFTGKGGALSSGKYAPDLGDANPAQIYTAMLTGPQNMPKFSDRQLTPDEKRDIVAYVRESAETPSYGGYGLGGFGPAPEGMAMWIIGMVAAIGVAMWIGSRA

实体 11 Entity 11 polymer

描述 description	LpqE protein
分子量 formula_weight	16412.9 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	c,W

CSAGQISQTTTQEPAVNGVNAQAGQVSLRNVHLRAPQQTDYVEPGTTVELLFVAANDSTEGSNKLKSITSDVGEVTLTGDSTVPADGVLIVGEPDGQIQAVENAEAADAVTAEVELTKPITNGLLYDFTFTFEDGETTVAVPISAGEQPRRPVPPAGPG

实体 12 Entity 12 polymer

描述 description	Cytochrome bc1 complex Rieske iron-sulfur subunit
分子量 formula_weight	42210.5 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	Y,M

GQPTDAELAEMSREELVKLGGKIDGVETIFKEPRWPVPGTKAEKRTERLVAYWLMLGGLSGLALLLVFLFWPWEYQPFGSEGEFLYSLATPLYGLTFGLSILSIGIGAVLFQKKFIPEEISVQDRHDGRSPEVHRKTVAANLTDALEGSTLKRRKVIGLSLGIGLGAFGAGTLVAFIGGLIKNPWKPVVPTAEGKKAVLWTSGWTPRFKGETIYLARATGRPGESPFVKMRPEDIDAGGMETVFPWRESDGDGTTVESEHKLTEIAMGVRNPVMLIRIKPADMHRVIKRKGQESFNFGELFAYTKVCSHLGCPSSLYEQQTYRILCPCHQSQFDALEFAKPIFGPAARALAQLPITIDEDGYLVANGDFVEPVGPAFWERKS

实体 13 Entity 13 polymer

描述 description	Probable malate:quinone oxidoreductase
分子量 formula_weight	54970.4 kDa
EC 编号 ec_number	1.1.5.4
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A

MSEANAGTNAKTDVVLVGAGIMSATLGTLIKLLEPNWSITMIERLDGAAAESSDPWNNAGTGHSALCELNYTPALPDGTIDISKAVNVNEQFQVSRQFWAHAVENGVLPDVRSFLNPVPHVSFVYGADNVQYLKARYNALVTNPLFASMEFIDDKDEFTRRLPLMAEKRDFSEPVALNWSQHGTDVDFGSLSRQLIGFAAGNGMTTMFGHDVRDLSKNSDGSWTVKVRNRRTGNNFKINAKFVFVGAGGGALPLLQKSGIPEAKGFGGFPVGGAFLRTNKQHLTSRHNAKVYGLPPLGAPPMSVPHLDTRVINGRQWLLFGPFAGWSPKFLKQGKVTDLPLSVKPNNLASMLGVGLTEVGLLKYLIGQLLLSEPARVETLREFAPSAVDSDWELDIAGQRVQVIRRKGAGGVLEFGTTVLAAADGSIAGLLGASPGASTAVPAMLDVLQRCFADRYQAWTPKLKEMVPSLGTKLSDEPKLFEEVWSWGTKVLKLDVQANTAEAANAPATV

实体 14 Entity 14 non-polymer

描述 description	COPPER (II) ION
分子量 formula_weight	63.5 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	6

实体 15 Entity 15 non-polymer

描述 description	HEME-A
分子量 formula_weight	852.8 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	4

实体 16 Entity 16 non-polymer

描述 description	CARDIOLIPIN
分子量 formula_weight	1464.0 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	16

实体 17 Entity 17 non-polymer

描述 description	PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE
分子量 formula_weight	616.5 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	4

实体 18 Entity 18 non-polymer

描述 description	MENAQUINONE-9
分子量 formula_weight	785.2 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	8

实体 19 Entity 19 non-polymer

描述 description	(2R)-3-(((2-aminoethoxy)(hydroxy)phosphoryl)oxy)-2-(palmitoyloxy)propyl (E)-octadec-9-enoate
分子量 formula_weight	718.0 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	6

实体 20 Entity 20 non-polymer

描述 description	PALMITIC ACID
分子量 formula_weight	256.4 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	4

实体 21 Entity 21 non-polymer

描述 description	(2S)-1-(hexadecanoyloxy)propan-2-yl (10S)-10-methyloctadecanoate
分子量 formula_weight	595.0 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	4

实体 22 Entity 22 non-polymer

描述 description	HEME C
分子量 formula_weight	618.5 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	4

实体 23 Entity 23 non-polymer

描述 description	;(2R)-2-(hexadecanoyloxy)-3-{[(S)-hydroxy{[(1R,2R,3R,4R,5R,6S)-2,3,4,5,6-pentahydroxycyclohexyl]oxy}phosphoryl]oxy}propyl (9S)-9-methyloctadecanoate ;
分子量 formula_weight	853.1 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	8

实体 24 Entity 24 non-polymer

描述 description	FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER
分子量 formula_weight	175.8 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	2

▶

分辨率 resolution	3.20 Å
分辨率测定方法 resolution_method	—
颗粒数 num_particles	145585

Mycobacterial supercomplex malate:quinone oxidoreductase assembly

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Cytochrome c oxidase subunit 1

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Cytochrome bc1 complex cytochrome b subunit

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Superoxide dismutase [Cu-Zn]

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Cytochrome aa3 subunit 2

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Cytochrome aa3 subunit 3

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Cytochrome c oxidase polypeptide 4

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Cytochrome c oxidase subunit CtaJ

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Uncharacterized protein MSMEG_4692/MSMEI_4575

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Cytochrome bc1 complex cytochrome c subunit

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

LpqE protein

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体