9efv

Cryo-EM structure of CSN-N8CUL1 in complex with CSN5i-3

Method: ELECTRON MICROSCOPY

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

COP9 signalosome complex subunit 1

Homo sapiens

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 11	COP9 signalosome complex subunit 2 × 1 （P61201） COP9 signalosome complex subunit 3 × 1 （Q9UNS2） COP9 signalosome complex subunit 4 × 1 （Q9BT78） COP9 signalosome complex subunit 5 × 1 （Q92905） COP9 signalosome complex subunit 6 × 1 （Q7L5N1） COP9 signalosome complex subunit 7b × 1 （Q9H9Q2） COP9 signalosome complex subunit 8 × 1 （Q99627） NEDD8 × 1 （Q15843） Cullin-1 × 1 （Q13616） E3 ubiquitin-protein ligase RBX1 × 1 （P62877） ;3-(difluoromethyl)-N-{6-[(5S,6S)-6-hydroxy-6,7,8,9-tetrahydro-5H-imidazo[1,5-a]azepin-5-yl][1,1'-biphenyl]-3-yl}-1-(propan-2-yl)-1H-pyrazole-5-carboxamide ; × 1 ZINC ION × 4	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	CSN1_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–491； UniProt 1–491

COP9 signalosome complex subunit 2

Homo sapiens

UniProt P61201

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 11	COP9 signalosome complex subunit 1 × 1 （Q13098） COP9 signalosome complex subunit 3 × 1 （Q9UNS2） COP9 signalosome complex subunit 4 × 1 （Q9BT78） COP9 signalosome complex subunit 5 × 1 （Q92905） COP9 signalosome complex subunit 6 × 1 （Q7L5N1） COP9 signalosome complex subunit 7b × 1 （Q9H9Q2） COP9 signalosome complex subunit 8 × 1 （Q99627） NEDD8 × 1 （Q15843） Cullin-1 × 1 （Q13616） E3 ubiquitin-protein ligase RBX1 × 1 （P62877） ;3-(difluoromethyl)-N-{6-[(5S,6S)-6-hydroxy-6,7,8,9-tetrahydro-5H-imidazo[1,5-a]azepin-5-yl][1,1'-biphenyl]-3-yl}-1-(propan-2-yl)-1H-pyrazole-5-carboxamide ; × 1 ZINC ION × 4	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	CSN2_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 B； PDB构建体 1–443； UniProt 1–443

COP9 signalosome complex subunit 3

Homo sapiens

UniProt Q9UNS2

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 11	COP9 signalosome complex subunit 1 × 1 （Q13098） COP9 signalosome complex subunit 2 × 1 （P61201） COP9 signalosome complex subunit 4 × 1 （Q9BT78） COP9 signalosome complex subunit 5 × 1 （Q92905） COP9 signalosome complex subunit 6 × 1 （Q7L5N1） COP9 signalosome complex subunit 7b × 1 （Q9H9Q2） COP9 signalosome complex subunit 8 × 1 （Q99627） NEDD8 × 1 （Q15843） Cullin-1 × 1 （Q13616） E3 ubiquitin-protein ligase RBX1 × 1 （P62877） ;3-(difluoromethyl)-N-{6-[(5S,6S)-6-hydroxy-6,7,8,9-tetrahydro-5H-imidazo[1,5-a]azepin-5-yl][1,1'-biphenyl]-3-yl}-1-(propan-2-yl)-1H-pyrazole-5-carboxamide ; × 1 ZINC ION × 4	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	CSN3_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	3
链与序列区间	作者链 C； PDB构建体 1–423； UniProt 1–423

COP9 signalosome complex subunit 4

Homo sapiens

UniProt Q9BT78

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 11	COP9 signalosome complex subunit 1 × 1 （Q13098） COP9 signalosome complex subunit 2 × 1 （P61201） COP9 signalosome complex subunit 3 × 1 （Q9UNS2） COP9 signalosome complex subunit 5 × 1 （Q92905） COP9 signalosome complex subunit 6 × 1 （Q7L5N1） COP9 signalosome complex subunit 7b × 1 （Q9H9Q2） COP9 signalosome complex subunit 8 × 1 （Q99627） NEDD8 × 1 （Q15843） Cullin-1 × 1 （Q13616） E3 ubiquitin-protein ligase RBX1 × 1 （P62877） ;3-(difluoromethyl)-N-{6-[(5S,6S)-6-hydroxy-6,7,8,9-tetrahydro-5H-imidazo[1,5-a]azepin-5-yl][1,1'-biphenyl]-3-yl}-1-(propan-2-yl)-1H-pyrazole-5-carboxamide ; × 1 ZINC ION × 4	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	CSN4_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	4
链与序列区间	作者链 D； PDB构建体 1–406； UniProt 1–406

COP9 signalosome complex subunit 5

Homo sapiens

UniProt Q92905

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 11	COP9 signalosome complex subunit 1 × 1 （Q13098） COP9 signalosome complex subunit 2 × 1 （P61201） COP9 signalosome complex subunit 3 × 1 （Q9UNS2） COP9 signalosome complex subunit 4 × 1 （Q9BT78） COP9 signalosome complex subunit 6 × 1 （Q7L5N1） COP9 signalosome complex subunit 7b × 1 （Q9H9Q2） COP9 signalosome complex subunit 8 × 1 （Q99627） NEDD8 × 1 （Q15843） Cullin-1 × 1 （Q13616） E3 ubiquitin-protein ligase RBX1 × 1 （P62877） ;3-(difluoromethyl)-N-{6-[(5S,6S)-6-hydroxy-6,7,8,9-tetrahydro-5H-imidazo[1,5-a]azepin-5-yl][1,1'-biphenyl]-3-yl}-1-(propan-2-yl)-1H-pyrazole-5-carboxamide ; × 1 ZINC ION × 4	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	CSN5_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	5
链与序列区间	作者链 E； PDB构建体 1–334； UniProt 1–334

COP9 signalosome complex subunit 6

Homo sapiens

UniProt Q7L5N1

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 11	COP9 signalosome complex subunit 1 × 1 （Q13098） COP9 signalosome complex subunit 2 × 1 （P61201） COP9 signalosome complex subunit 3 × 1 （Q9UNS2） COP9 signalosome complex subunit 4 × 1 （Q9BT78） COP9 signalosome complex subunit 5 × 1 （Q92905） COP9 signalosome complex subunit 7b × 1 （Q9H9Q2） COP9 signalosome complex subunit 8 × 1 （Q99627） NEDD8 × 1 （Q15843） Cullin-1 × 1 （Q13616） E3 ubiquitin-protein ligase RBX1 × 1 （P62877） ;3-(difluoromethyl)-N-{6-[(5S,6S)-6-hydroxy-6,7,8,9-tetrahydro-5H-imidazo[1,5-a]azepin-5-yl][1,1'-biphenyl]-3-yl}-1-(propan-2-yl)-1H-pyrazole-5-carboxamide ; × 1 ZINC ION × 4	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	CSN6_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	6
链与序列区间	作者链 F； PDB构建体 1–327； UniProt 1–327

COP9 signalosome complex subunit 7b

Homo sapiens

UniProt Q9H9Q2

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 11	COP9 signalosome complex subunit 1 × 1 （Q13098） COP9 signalosome complex subunit 2 × 1 （P61201） COP9 signalosome complex subunit 3 × 1 （Q9UNS2） COP9 signalosome complex subunit 4 × 1 （Q9BT78） COP9 signalosome complex subunit 5 × 1 （Q92905） COP9 signalosome complex subunit 6 × 1 （Q7L5N1） COP9 signalosome complex subunit 8 × 1 （Q99627） NEDD8 × 1 （Q15843） Cullin-1 × 1 （Q13616） E3 ubiquitin-protein ligase RBX1 × 1 （P62877） ;3-(difluoromethyl)-N-{6-[(5S,6S)-6-hydroxy-6,7,8,9-tetrahydro-5H-imidazo[1,5-a]azepin-5-yl][1,1'-biphenyl]-3-yl}-1-(propan-2-yl)-1H-pyrazole-5-carboxamide ; × 1 ZINC ION × 4	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	CSN7B_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	7
链与序列区间	作者链 G； PDB构建体 1–264； UniProt 1–264

COP9 signalosome complex subunit 8

Homo sapiens

UniProt Q99627

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 11	COP9 signalosome complex subunit 1 × 1 （Q13098） COP9 signalosome complex subunit 2 × 1 （P61201） COP9 signalosome complex subunit 3 × 1 （Q9UNS2） COP9 signalosome complex subunit 4 × 1 （Q9BT78） COP9 signalosome complex subunit 5 × 1 （Q92905） COP9 signalosome complex subunit 6 × 1 （Q7L5N1） COP9 signalosome complex subunit 7b × 1 （Q9H9Q2） NEDD8 × 1 （Q15843） Cullin-1 × 1 （Q13616） E3 ubiquitin-protein ligase RBX1 × 1 （P62877） ;3-(difluoromethyl)-N-{6-[(5S,6S)-6-hydroxy-6,7,8,9-tetrahydro-5H-imidazo[1,5-a]azepin-5-yl][1,1'-biphenyl]-3-yl}-1-(propan-2-yl)-1H-pyrazole-5-carboxamide ; × 1 ZINC ION × 4	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	CSN8_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	8
链与序列区间	作者链 H； PDB构建体 1–209； UniProt 1–209

NEDD8

Homo sapiens

UniProt Q15843

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 11	COP9 signalosome complex subunit 1 × 1 （Q13098） COP9 signalosome complex subunit 2 × 1 （P61201） COP9 signalosome complex subunit 3 × 1 （Q9UNS2） COP9 signalosome complex subunit 4 × 1 （Q9BT78） COP9 signalosome complex subunit 5 × 1 （Q92905） COP9 signalosome complex subunit 6 × 1 （Q7L5N1） COP9 signalosome complex subunit 7b × 1 （Q9H9Q2） COP9 signalosome complex subunit 8 × 1 （Q99627） Cullin-1 × 1 （Q13616） E3 ubiquitin-protein ligase RBX1 × 1 （P62877） ;3-(difluoromethyl)-N-{6-[(5S,6S)-6-hydroxy-6,7,8,9-tetrahydro-5H-imidazo[1,5-a]azepin-5-yl][1,1'-biphenyl]-3-yl}-1-(propan-2-yl)-1H-pyrazole-5-carboxamide ; × 1 ZINC ION × 4	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	NEDD8_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	9
链与序列区间	作者链 I； PDB构建体 1–81； UniProt 1–81

Cullin-1

Homo sapiens

UniProt Q13616

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 11	COP9 signalosome complex subunit 1 × 1 （Q13098） COP9 signalosome complex subunit 2 × 1 （P61201） COP9 signalosome complex subunit 3 × 1 （Q9UNS2） COP9 signalosome complex subunit 4 × 1 （Q9BT78） COP9 signalosome complex subunit 5 × 1 （Q92905） COP9 signalosome complex subunit 6 × 1 （Q7L5N1） COP9 signalosome complex subunit 7b × 1 （Q9H9Q2） COP9 signalosome complex subunit 8 × 1 （Q99627） NEDD8 × 1 （Q15843） E3 ubiquitin-protein ligase RBX1 × 1 （P62877） ;3-(difluoromethyl)-N-{6-[(5S,6S)-6-hydroxy-6,7,8,9-tetrahydro-5H-imidazo[1,5-a]azepin-5-yl][1,1'-biphenyl]-3-yl}-1-(propan-2-yl)-1H-pyrazole-5-carboxamide ; × 1 ZINC ION × 4	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	CUL1_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	10
链与序列区间	作者链 J； PDB构建体 1–776； UniProt 1–776

E3 ubiquitin-protein ligase RBX1

Homo sapiens

UniProt P62877

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 11	COP9 signalosome complex subunit 1 × 1 （Q13098） COP9 signalosome complex subunit 2 × 1 （P61201） COP9 signalosome complex subunit 3 × 1 （Q9UNS2） COP9 signalosome complex subunit 4 × 1 （Q9BT78） COP9 signalosome complex subunit 5 × 1 （Q92905） COP9 signalosome complex subunit 6 × 1 （Q7L5N1） COP9 signalosome complex subunit 7b × 1 （Q9H9Q2） COP9 signalosome complex subunit 8 × 1 （Q99627） NEDD8 × 1 （Q15843） Cullin-1 × 1 （Q13616） ;3-(difluoromethyl)-N-{6-[(5S,6S)-6-hydroxy-6,7,8,9-tetrahydro-5H-imidazo[1,5-a]azepin-5-yl][1,1'-biphenyl]-3-yl}-1-(propan-2-yl)-1H-pyrazole-5-carboxamide ; × 1 ZINC ION × 4	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	RBX1_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	11
链与序列区间	作者链 K； PDB构建体 1–108； UniProt 1–108

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	9efv
沉积日期 deposition_date	2024-11-20
结构标题 title	Cryo-EM structure of CSN-N8CUL1 in complex with CSN5i-3
关键词 keywords	COP9, COP9 signalosome, signalosome, deneddylation, N8CUL1, CSN5i-3, othosteric molecular glue, SIGNALING PROTEIN; SIGNALING PROTEIN
实验方法 method	ELECTRON MICROSCOPY

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

9efv__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

9efv__assembly_1__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

9efv__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	54.65 Å
Rg（电子密度）	54.69 Å
总 Rg	54.76 Å
原子数	24947
残基数	3099
排除体积	447120 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`9efv__assembly_1__model_1`	undecameric （11）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (13)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	COP9 signalosome complex subunit 1
分子量 formula_weight	55606.5 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A
原子数 atom_count	24947

MPLPVQVFNLQGAVEPMQIDVDPQEDPQNAPDVNYVVENPSLDLEQYAASYSGLMRIERLQFIADHCPTLRVEALKMALSFVQRTFNVDMYEEIHRKLSEATRSSLRELQNAPDAIPESGVEPPALDTAWVEATRKKALLKLEKLDTDLKNYKGNSIKESIRRGHDDLGDHYLDCGDLSNALKCYSRARDYCTSAKHVINMCLNVIKVSVYLQNWSHVLSYVSKAESTPEIAEQRGERDSQTQAILTKLKCAAGLAELAARKYKQAAKCLLLASFDHCDFPELLSPSNVAIYGGLCALATFDRQELQRNVISSSSFKLFLELEPQVRDIIFKFYESKYASCLKMLDEMKDNLLLDMYLAPHVRTLYTQIRNRALIQYFSPYVSADMHRMAAAFNTTVAALEDELTQLILEGLISARVDSHSKILYARDVDQRSTTFEKSLLMGKEFQRRAKAMMLRAAVLRNQIHVKSPPREGSQGELTPANSQSRMSTNM

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	COP9 signalosome complex subunit 2
分子量 formula_weight	51664.6 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	B

MSDMEDDFMCDDEEDYDLEYSEDSNSEPNVDLENQYYNSKALKEDDPKAALSSFQKVLELEGEKGEWGFKALKQMIKINFKLTNFPEMMNRYKQLLTYIRSAVTRNYSEKSINSILDYISTSKQMDLLQEFYETTLEALKDAKNDRLWFKTNTKLGKLYLEREEYGKLQKILRQLHQSCQTDDGEDDLKKGTQLLEIYALEIQMYTAQKNNKKLKALYEQSLHIKSAIPHPLIMGVIRECGGKMHLREGEFEKAHTDFFEAFKNYDESGSPRRTTCLKYLVLANMLMKSGINPFDSQEAKPYKNDPEILAMTNLVSAYQNNDITEFEKILKTNHSNIMDDPFIREHIEELLRNIRTQVLIKLIKPYTRIHIPFISKELNIDVADVESLLVQCILDNTIHGRIDQVNQLLELDHQKRGGARYTALDKWTNQLNSLNQAVVSKLA

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 3 Entity 3 polymer

描述 description	COP9 signalosome complex subunit 3
分子量 formula_weight	47924.0 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	C

MASALEQFVNSVRQLSAQGQMTQLCELINKSGELLAKNLSHLDTVLGALDVQEHSLGVLAVLFVKFSMPSVPDFETLFSQVQLFISTCNGEHIRYATDTFAGLCHQLTNALVERKQPLRGIGILKQAIDKMQMNTNQLTSIHADLCQLCLLAKCFKPALPYLDVDMMDICKENGAYDAKHFLCYYYYGGMIYTGLKNFERALYFYEQAITTPAMAVSHIMLESYKKYILVSLILLGKVQQLPKYTSQIVGRFIKPLSNAYHELAQVYSTNNPSELRNLVNKHSETFTRDNNMGLVKQCLSSLYKKNIQRLTKTFLTLSLQDMASRVQLSGPQEAEKYVLHMIEDGEIFASINQKDGMVSFHDNPEKYNNPAMLHNIDQEMLKCIELDERLKAMDQEITVNPQFVQKSMGSQEDDSGNKPSSYS

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 4 Entity 4 polymer

描述 description	COP9 signalosome complex subunit 4
分子量 formula_weight	46322.7 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	D

MAAAVRQDLAQLMNSSGSHKDLAGKYRQILEKAIQLSGAEQLEALKAFVEAMVNENVSLVISRQLLTDFCTHLPNLPDSTAKEIYHFTLEKIQPRVISFEEQVASIRQHLASIYEKEEDWRNAAQVLVGIPLETGQKQYNVDYKLETYLKIARLYLEDDDPVQAEAYINRASLLQNESTNEQLQIHYKVCYARVLDYRRKFIEAAQRYNELSYKTIVHESERLEALKHALHCTILASAGQQRSRMLATLFKDERCQQLAAYGILEKMYLDRIIRGNQLQEFAAMLMPHQKATTADGSSILDRAVIEHNLLSASKLYNNITFEELGALLEIPAAKAEKIASQMITEGRMNGFIDQIDGIVHFETREALPTWDKQIQSLCFQVNNLLEKISQTAPEWTAQAMEAQMAQ

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 5 Entity 5 polymer

描述 description	COP9 signalosome complex subunit 5
分子量 formula_weight	37621.7 kDa
EC 编号 ec_number	3.4.-.-
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	E

MAASGSGMAQKTWELANNMQEAQSIDEIYKYDKKQQQEILAAKPWTKDHHYFKYCKISALALLKMVMHARSGGNLEVMGLMLGKVDGETMIIMDSFALPVEGTETRVNAQAAAYEYMAAYIENAKQVGRLENAIGWYHSHPGYGCWLSGIDVSTQMLNQQFQEPFVAVVIDPTRTISAGKVNLGAFRTYPKGYKPPDEGPSEYQTIPLNKIEDFGVHCKQYYALEVSYFKSSLDRKLLELLWNKYWVNTLSSSSLLTNADYTTGQVFDLSEKLEQSEAQLGRGSFMLGLETHDRKSEDKLAKATRDSCKTTIEAIHGLMSQVIKDKLFNQINIS

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Spodoptera frugiperda

实体 6 Entity 6 polymer

描述 description	COP9 signalosome complex subunit 6
分子量 formula_weight	36203.4 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	F

MAAAAAAAAATNGTGGSSGMEVDAAVVPSVMACGVTGSVSVALHPLVILNISDHWIRMRSQEGRPVQVIGALIGKQEGRNIEVMNSFELLSHTVEEKIIIDKEYYYTKEEQFKQVFKELEFLGWYTTGGPPDPSDIHVHKQVCEIIESPLFLKLNPMTKHTDLPVSVFESVIDIINGEATMLFAELTYTLATEEAERIGVDHVARMTATGSGENSTVAEHLIAQHSAIKMLHSRVKLILEYVKASEAGEVPFNHEILREAYALCHCLPVLSTDKFKTDFYDQCNDVGLMAYLGTITKTCNTMNQFVNKFNVLYDRQGIGRRMRGLFF

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 7 Entity 7 polymer

描述 description	COP9 signalosome complex subunit 7b
分子量 formula_weight	29656.9 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	G

MAGEQKPSSNLLEQFILLAKGTSGSALTALISQVLEAPGVYVFGELLELANVQELAEGANAAYLQLLNLFAYGTYPDYIANKESLPELSTAQQNKLKHLTIVSLASRMKCIPYSVLLKDLEMRNLRELEDLIIEAVYTDIIQGKLDQRNQLLEVDFCIGRDIRKKDINNIVKTLHEWCDGCEAVLLGIEQQVLRANQYKENHNRTQQQVEAEVTNIKKTLKATASSSAQEMEQQLAERECPPHAEQRQPTKKMSKVKGLVSSRH

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 8 Entity 8 polymer

描述 description	COP9 signalosome complex subunit 8
分子量 formula_weight	23245.5 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	H

MPVAVMAESAFSFKKLLDQCENQELEAPGGIATPPVYGQLLALYLLHNDMNNARYLWKRIPPAIKSANSELGGIWSVGQRIWQRDFPGIYTTINAHQWSETVQPIMEALRDATRRRAFALVSQAYTSIIADDFAAFVGLPVEEAVKGILEQGWQADSTTRMVLPRKPVAGALDVSFNKFIPLSEPAPVPPIPNEQQLARLTDYVAFLEN

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 9 Entity 9 polymer

描述 description	NEDD8
分子量 formula_weight	9086.6 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	I

MLIKVKTLTGKEIEIDIEPTDKVERIKERVEEKEGIPPQQQRLIYSGKQMNDEKTAADYKILGGSVLHLVLALRGGGGLRQ

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 10 Entity 10 polymer

描述 description	Cullin-1
分子量 formula_weight	89800.4 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	J

MSSTRSQNPHGLKQIGLDQIWDDLRAGIQQVYTRQSMAKSRYMELYTHVYNYCTSVHQSNQARGAGVPPSKSKKGQTPGGAQFVGLELYKRLKEFLKNYLTNLLKDGEDLMDESVLKFYTQQWEDYRFSSKVLNGICAYLNRHWVRRECDEGRKGIYEIYSLALVTWRDCLFRPLNKQVTNAVLKLIEKERNGETINTRLISGVVQSYVELGLNEDDAFAKGPTLTVYKESFESQFLADTERFYTRESTEFLQQNPVTEYMKKAEARLLEEQRRVQVYLHESTQDELARKCEQVLIEKHLEIFHTEFQNLLDADKNEDLGRMYNLVSRIQDGLGELKKLLETHIHNQGLAAIEKCGEAALNDPKMYVQTVLDVHKKYNALVMSAFNNDAGFVAALDKACGRFINNNAVTKMAQSSSKSPELLARYCDSLLKKSSKNPEEAELEDTLNQVMVVFKYIEDKDVFQKFYAKMLAKRLVHQNSASDDAEASMISKLKQACGFEYTSKLQRMFQDIGVSKDLNEQFKKHLTNSEPLDLDFSIQVLSSGSWPFQQSCTFALPSELERSYQRFTAFYASRHSGRKLTWLYQLSKGELVTNCFKNRYTLQASTFQMAILLQYNTEDAYTVQQLTDSTQIKMDILAQVLQILLKSKLLVLEDENANVDEVELKPDTLIKLYLGYKNKKLRVNINVPMKTEQKQEQETTHKNIEEDRKLLIQAAIVRIMKMRKVLKHQQLLGEVLTQLSSRFKPRVPVIKKCIDILIEKEYLERVDGEKDTYSYLA

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 11 Entity 11 polymer

描述 description	E3 ubiquitin-protein ligase RBX1
分子量 formula_weight	12290.0 kDa
EC 编号 ec_number	2.3.2.27,2.3.2.32
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	K

MAAAMDVDTPSGTNSGAGKKRFEVKKWNAVALWAWDIVVDNCAICRNHIMDLCIECQANQASATSEECTVAWGVCNHAFHFHCISRWLKTRQVCPLDNREWEFQKYGH

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 12 Entity 12 non-polymer

描述 description	;3-(difluoromethyl)-N-{6-[(5S,6S)-6-hydroxy-6,7,8,9-tetrahydro-5H-imidazo[1,5-a]azepin-5-yl][1,1'-biphenyl]-3-yl}-1-(propan-2-yl)-1H-pyrazole-5-carboxamide ;
分子量 formula_weight	505.6 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

实体 13 Entity 13 non-polymer

描述 description	ZINC ION
分子量 formula_weight	65.4 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	4

▶

晶胞边长 a length_a	1.000 Å
晶胞边长 b length_b	1.000 Å
晶胞边长 c length_c	1.000 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	—

空间群 space_group	P 1
空间群编号 int_tables_number	1
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	3.03 Å
分辨率测定方法 resolution_method	—
颗粒数 num_particles	174577

Cryo-EM structure of CSN-N8CUL1 in complex with CSN5i-3

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

COP9 signalosome complex subunit 1

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

COP9 signalosome complex subunit 2

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

COP9 signalosome complex subunit 3

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

COP9 signalosome complex subunit 4

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

COP9 signalosome complex subunit 5

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

COP9 signalosome complex subunit 6

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

COP9 signalosome complex subunit 7b

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

COP9 signalosome complex subunit 8

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

NEDD8

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Cullin-1

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体