9euk

Cryo-EM structure of Staphylococcus aureus bacteriophage phi812 baseplate in the post-contraction state - sheath initiator, wedge module, and inner tripod proteins

Method: ELECTRON MICROSCOPY
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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Baseplate wedge subunit

物种未注明

UniProt A0A0U1UXD7

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 42 Baseplate component × 12 (A0A0U1WF63) TmpF × 6 (A0A0U1WGD3) DUF4815 domain-containing protein × 18 (A0A8E5NSA0) 待复核

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称 A0A0U1UXD7_9CAUD
Isoform —
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A; PDB构建体 1–234; UniProt 1–234

Baseplate component

物种未注明

UniProt A0A0U1WF63

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 42 Baseplate wedge subunit × 6 (A0A0U1UXD7) TmpF × 6 (A0A0U1WGD3) DUF4815 domain-containing protein × 18 (A0A8E5NSA0) 待复核

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 A0A0U1WF63_9CAUD
Isoform —
PDB实体 2
链与序列区间 作者链 B; PDB构建体 1–348; UniProt 1–348 作者链 C; PDB构建体 1–348; UniProt 1–348

TmpF

物种未注明

UniProt A0A0U1WGD3

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 42 Baseplate wedge subunit × 6 (A0A0U1UXD7) Baseplate component × 12 (A0A0U1WF63) DUF4815 domain-containing protein × 18 (A0A8E5NSA0) 待复核

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 A0A0U1WGD3_9CAUD
Isoform —
PDB实体 3
链与序列区间 作者链 D; PDB构建体 1–1019; UniProt 1–1019

DUF4815 domain-containing protein

物种未注明

UniProt A0A8E5NSA0

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 42 Baseplate wedge subunit × 6 (A0A0U1UXD7) Baseplate component × 12 (A0A0U1WF63) TmpF × 6 (A0A0U1WGD3) 待复核

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 A0A8E5NSA0_9CAUD
Isoform —
PDB实体 4
链与序列区间 作者链 E; PDB构建体 1–1152; UniProt 1–1152 作者链 F; PDB构建体 1–1152; UniProt 1–1152 作者链 G; PDB构建体 1–1152; UniProt 1–1152

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中;数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护,因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id9euk
沉积日期 deposition_date2024-03-27
结构标题 titleCryo-EM structure of Staphylococcus aureus bacteriophage phi812 baseplate in the post-contraction state - sheath initiator, wedge module, and inner tripod proteins
关键词 keywordsbacteriophage, phage, contractile, phi812, baseplate, VIRUS; VIRUS
实验方法 methodELECTRON MICROSCOPY
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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

9euk__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

9euk__assembly_1__model_1 | I(q)

10-2 10-1 106 107 108 109 1010 q (1/Angstrom) I(q)
100 个绘图点;横轴和纵轴均采用对数尺度。

9euk__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

新版 assembly/model P(r) 尚未计算 此处仅保留位置,不展示旧数据 r (Angstrom) P(r)
P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。
Rg(Guinier)0.00 Å
Rg(电子密度)131.40 Å
总 Rg131.40 Å
原子数178434
残基数22536
排除体积3159900 ų
最大 q0.500 Å⁻¹
Assembly Model 结构单元 聚集说明 状态 CRYSOL 操作
1 1 9euk__assembly_1__model_1 heptameric (7) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (4)

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7. 引用文献 (1)