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2E4H
Solution structure of cytoskeletal protein in complex with tubulin tail
提交 2006-12-08
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构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
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链 B
416–451(36 aa)
片段:C-tail, residues 416-451
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未记录
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未记录非水小分子
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SOLUTION NMR
NMR测量条件
pH 6.9;303 K;压力 ambient
NMR样品组成
0.9mM U-15N,13C CLIP: Nonlabel tubulin; 30mM BisTris buffer K; 1mM DTT; 100% D2O | 100% D2O
NMR样品组成
0.9mM U-15N CLIP: Nonlabel tubulin; 30mM BisTris buffer K; 1mM DTT; 90% H2O, 10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成
0.9mM U-15N,13C tubulin: Nonlabel CLIP; 30mM BisTris buffer K; 1mM DTT; 100% D2O | 100% D2O
NMR样品组成
0.9mM U-15N tubulin: Nonlabel CLIP; 30mM BisTris buffer K; 1mM DTT; 90% H2O, 10% D2O | 90% H2O/10% D2O
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分辨率未提供
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5IJ0
Cryo EM density of microtubule assembled from human TUBB3
提交 2016-03-01
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构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
1–437(437 aa)
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未记录
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GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1
MG MAGNESIUM ION × 1
GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1
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ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.9
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
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分辨率 3.80 Å
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5IJ9
Cryo EM density of microtubule assembled from human TUBB3-D417H mutant
提交 2016-03-01
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构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
1–437(437 aa)
|
未记录
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GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1
MG MAGNESIUM ION × 1
GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1
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ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.9
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
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分辨率 3.70 Å
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5N5N
Cryo-EM structure of tsA201 cell alpha1B and betaI and betaIVb microtubules
提交 2017-02-14
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 12
PDB 声明:dodecameric
|
链 G
1–437(437 aa)
链 H
1–437(437 aa)
链 I
1–437(437 aa)
链 J
1–437(437 aa)
链 K
1–437(437 aa)
链 L
1–437(437 aa)
|
未记录
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G2P PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 6
MG MAGNESIUM ION × 12
GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 6
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ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.8;BRB80 with GMPCPP (80mM PIPES, 2mM MgCl2, 1mM EGTA, 1mM DTT, 1mM GMPCPP)
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.20 Å
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6E7B
13-pf 3-start GMPCPP-human alpha1B/beta3 microtubules
提交 2018-07-25
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
1–437(437 aa)
|
未记录
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MG MAGNESIUM ION × 2
G2P PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1
GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1
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ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.50 Å
|
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6E7C
14-pf 3-start GMPCPP-human alpha1B/beta2B microtubules
提交 2018-07-25
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
1–437(437 aa)
|
未记录
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MG MAGNESIUM ION × 2
G2P PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1
GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.65 Å
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6I2I
Refined 13pf Hela Cell Tubulin microtubule (EML4-NTD decorated)
提交 2018-11-01
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构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
1–451(451 aa)
|
未记录
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GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1
MG MAGNESIUM ION × 2
G2P PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1
TA1 TAXOL × 1
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.8;25mM PIPES, 1.5mM MgCl2, 1mM EGTA, 1mM DTT, 30mM NaCl,1mM GMPCPP
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.60 Å
|
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6J4V
Structural basis of tubulin detyrosination by vasohibins-SVBP enzyme complex and functional implications
提交 2019-01-10
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 3
PDB 声明:trimeric
|
链 C
431–451(21 aa)
|
突变:E450C
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PO4 PHOSPHATE ION × 2
GOL GLYCEROL × 4
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
EVAPORATION;pH 8.2;293 K;For crystallization of V2c-SVBP C58S in complex with the maTail peptide the components were mixed in a 1:3 molar ratio and incubated at room temperature for 24 h before setting up crystallization trials. The resulting V2c-SVBP S58C-maTail complex was crystallized in 1.4 M sodium/potassium phosphate, pH 8.2.
|
分辨率 2.10 Å
R-free 0.200
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6QUS
HsCKK (human CAMSAP1) decorated 13pf taxol-GDP microtubule
提交 2019-02-28
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 5
PDB 声明:pentameric
|
链 O
1–451(451 aa)
链 X
1–451(451 aa)
|
未记录
|
GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2
MG MAGNESIUM ION × 2
GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2
TA1 TAXOL × 2
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.8;BRB20
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.70 Å
|
|
6QUY
NgCKK (N.Gruberi CKK) decorated 13pf taxol-GDP microtubule
提交 2019-02-28
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 5
PDB 声明:pentameric
|
链 A
1–451(451 aa)
链 C
1–451(451 aa)
|
未记录
|
GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2
MG MAGNESIUM ION × 2
GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2
TA1 TAXOL × 2
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.8;BRB20
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.80 Å
|
|
6QVE
NgCKK (Naegleria Gruberi CKK) decorated 14pf taxol-GDP microtubule
提交 2019-03-01
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 5
PDB 声明:pentameric
|
链 A
1–451(451 aa)
链 C
1–451(451 aa)
|
未记录
|
GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2
MG MAGNESIUM ION × 2
GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2
TA1 TAXOL × 2
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ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.8;BRB20
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.70 Å
|
|
6QVJ
HsCKK (human CAMSAP1) decorated 14pf taxol-GDP microtubule
提交 2019-03-02
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 5
PDB 声明:pentameric
|
链 O
1–451(451 aa)
链 X
1–451(451 aa)
|
未记录
|
GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2
MG MAGNESIUM ION × 2
GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2
TA1 TAXOL × 2
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.8;BRB20
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.80 Å
|
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6S8L
Structure, Thermodynamics, and Kinetics of Plinabulin Binding to two Tubulin Isotypes
提交 2019-07-10
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 3
PDB 声明:trimeric
|
链 A
1–451(451 aa)
|
未记录
|
GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1
MG MAGNESIUM ION × 2
PN6 (3Z,6Z)-3-benzylidene-6-[(5-tert-butyl-1H-imidazol-4-yl)methylidene]piperazine-2,5-dione × 1
GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 5.5;293 K;100 mM Bis-TrisMethane, pH 5.5, supplemented with 200 mM ammonium sulfate and 25% PEG3350
|
分辨率 1.80 Å
R-free 0.266
|
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7LXB
HeLa-tubulin in complex with cryptophycin 52
提交 2021-03-03
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 16
PDB 声明:hexadecameric
|
链 A
1–451(451 aa)
链 C
1–451(451 aa)
链 E
1–451(451 aa)
链 G
1–451(451 aa)
链 I
1–451(451 aa)
链 K
1–451(451 aa)
链 M
1–451(451 aa)
链 O
1–451(451 aa)
|
未记录
|
GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 8
YGY Cryptophycin 52 × 8
GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 8
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ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.9
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.26 Å
|
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7M18
HeLa-tubulin in complex with cryptophycin 1
提交 2021-03-12
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 16
PDB 声明:hexadecameric
|
链 A
1–451(451 aa)
链 C
1–451(451 aa)
链 E
1–451(451 aa)
链 G
1–451(451 aa)
链 I
1–451(451 aa)
链 K
1–451(451 aa)
链 M
1–451(451 aa)
链 O
1–451(451 aa)
|
未记录
|
YNP Cryptophycin 1 × 8
GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 8
GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 8
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ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.9
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.38 Å
|
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7M20
18-mer HeLa-tubulin rings in complex with Cryptophycin 1
提交 2021-03-15
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构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 18
PDB 声明:octadecameric
|
链 A
1–451(451 aa)
链 C
1–451(451 aa)
链 E
1–451(451 aa)
链 G
1–451(451 aa)
链 I
1–451(451 aa)
链 K
1–451(451 aa)
链 M
1–451(451 aa)
链 O
1–451(451 aa)
链 Q
1–451(451 aa)
|
未记录
|
GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 9
YNP Cryptophycin 1 × 9
GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 9
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ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.9
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.84 Å
|
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7PJF
Inhibiting parasite proliferation using a rationally designed anti-tubulin agent
提交 2021-08-24
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 3
PDB 声明:trimeric
|
链 A
1–451(451 aa)
|
未记录
|
GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2
MG MAGNESIUM ION × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION;pH 5.5;293 K;100 mM Bis-TrisMethane, pH 5.5, supplemented with 200 mM ammonium sulfate and 25% PEG3350
|
分辨率 1.86 Å
R-free 0.218
|
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7SJ7
Undecorated 13pf wildtype microtubule from recombinant human tubulin
提交 2021-10-16
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 12
PDB 声明:dodecameric
|
链 A
1–451(451 aa)
链 C
1–451(451 aa)
链 E
1–451(451 aa)
链 J
1–451(451 aa)
链 K
1–451(451 aa)
链 L
1–451(451 aa)
|
未记录
|
GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 6
MG MAGNESIUM ION × 6
GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.8;80 mM PIPES, 1 mM EGTA, 5 mM MgCl2, 2 mM GTP, pH 6.8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE
|
分辨率 3.80 Å
|
|
7SJ8
13pf wildtype microtubule from recombinant human tubulin decorated with kinesin
提交 2021-10-16
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 12
PDB 声明:dodecameric
|
链 A
1–451(451 aa)
链 C
1–451(451 aa)
链 E
1–451(451 aa)
链 J
1–451(451 aa)
链 K
1–451(451 aa)
链 L
1–451(451 aa)
|
未记录
|
GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 6
MG MAGNESIUM ION × 6
GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.8;80 mM PIPES, 1 mM EGTA, 5 mM MgCl2, 2 mM GTP, pH 6.8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE;30 second adsorption time onto grid. blot force 15, 4 second blot time, 37 degrees, and 100 percent humidity. 0.5 second drain time.
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分辨率 3.60 Å
|
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7SJ9
13pf E254A microtubule from recombinant human tubulin decorated with EB3
提交 2021-10-16
|
构建体不同
突变/修饰不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 14
PDB 声明:tetradecameric
|
链 A
1–451(451 aa)
链 C
1–451(451 aa)
链 E
1–451(451 aa)
链 J
1–451(451 aa)
链 K
1–451(451 aa)
链 L
1–451(451 aa)
|
突变:E254A
突变:E254A
突变:E254A
突变:E254A
突变:E254A
突变:E254A
|
GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 12
MG MAGNESIUM ION × 12
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.8;80 mM PIPES, 1 mM EGTA, 5 mM MgCl2, 2 mM GTP, pH 6.8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE
|
分辨率 3.80 Å
|
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7SJA
Undecorated 13pf E254N microtubule from recombinant human tubulin
提交 2021-10-16
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 12
PDB 声明:dodecameric
|
链 A
1–451(451 aa)
链 C
1–451(451 aa)
链 E
1–451(451 aa)
链 J
1–451(451 aa)
链 K
1–451(451 aa)
链 L
1–451(451 aa)
|
突变:E254N
突变:E254N
突变:E254N
突变:E254N
突变:E254N
突变:E254N
|
GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 12
MG MAGNESIUM ION × 12
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.8;80 mM PIPES, 1 mM EGTA, 5 mM MgCl2, 2 mM GTP, pH 6.8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE
|
分辨率 3.80 Å
|
|
7Z6S
MATCAP bound to a human 14 protofilament microtubule
提交 2022-03-14
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 6
PDB 声明:Hexameric
|
链 A
1–451(451 aa)
链 K
1–451(451 aa)
|
未记录
|
GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2
MG MAGNESIUM ION × 2
GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2
ZN ZINC ION × 2
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.9
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.90 Å
|
|
7ZCW
Cryo-EM structure of GMPCPP-microtubules in complex with VASH2-SVBP
提交 2022-03-29
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 8
PDB 声明:octameric
|
链 A
1–451(451 aa)
链 E
1–451(451 aa)
|
未记录
|
GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2
MG MAGNESIUM ION × 6
G2P PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 4
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.60 Å
|
|
8T42
Model of TTLL6 MTBH1-2 bound to microtubule
提交 2023-06-08
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 5
PDB 声明:pentameric
|
链 A
1–451(451 aa)
链 F
1–451(451 aa)
|
未记录
|
GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2
MG MAGNESIUM ION × 4
G2P PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 2
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE;The sample was blotted with Whatman #5 blotting paper on both sides of the grid for 3 s with a blot offset of -1 using a Vitrobot Mark IV (Thermo Fisher Scientific) with a chamber set to 30C at 100% humidity and subsequently plunged into liquid ethane.
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分辨率 3.60 Å
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8U3Z
Model of TTLL6 bound to microtubule from composite map
提交 2023-09-08
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 5
PDB 声明:pentameric
|
链 A
1–451(451 aa)
链 F
1–451(451 aa)
|
未记录
|
GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2
MG MAGNESIUM ION × 5
G2P PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 2
ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1
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ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
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分辨率 3.60 Å
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8V2J
Structure of alpha1B and betaI/IVb microtubule bound to GDP
提交 2023-11-22
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构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 4
PDB 声明:tetrameric
|
链 A
1–451(451 aa)
链 D
1–451(451 aa)
|
未记录
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GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2
GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2
MG MAGNESIUM ION × 2
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ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE;5 ul of microtubules were applied to glow-discharged cryo-EM grid and allowed to absorb for 30 sec.
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分辨率 2.90 Å
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8VA2
Symmetry expanded map of 2 gamma-tubulins bound to 2 alpha tubulins in gamma tubulin ring complex capped microtubule end.
提交 2023-12-10
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构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 4
PDB 声明:tetrameric
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链 a
1–451(451 aa)
链 b
1–451(451 aa)
|
未记录
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GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2
MG MAGNESIUM ION × 2
GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2
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ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
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分辨率 4.50 Å
|
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8VRJ
Rigid body fitted model for gamma tubulin ring complex capped microtubule
提交 2024-01-22
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构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 60
PDB 声明:60-meric
|
链 1
1–451(451 aa)
链 O
1–451(451 aa)
链 P
1–451(451 aa)
链 Q
1–451(451 aa)
链 R
1–451(451 aa)
链 S
1–451(451 aa)
链 T
1–451(451 aa)
链 U
1–451(451 aa)
链 V
1–451(451 aa)
链 W
1–451(451 aa)
链 X
1–451(451 aa)
链 Y
1–451(451 aa)
链 Z
1–451(451 aa)
|
突变:E254D
突变:E254D
突变:E254D
突变:E254D
突变:E254D
突变:E254D
突变:E254D
突变:E254D
突变:E254D
突变:E254D
突变:E254D
突变:E254D
突变:E254D
|
未记录非水小分子
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ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
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分辨率 7.70 Å
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8VRK
Rigid body fitted model for refined density map of gamma tubulin ring complex capped microtubule
提交 2024-01-22
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构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 60
PDB 声明:60-meric
|
链 1
1–451(451 aa)
链 O
1–451(451 aa)
链 P
1–451(451 aa)
链 Q
1–451(451 aa)
链 R
1–451(451 aa)
链 S
1–451(451 aa)
链 T
1–451(451 aa)
链 U
1–451(451 aa)
链 V
1–451(451 aa)
链 W
1–451(451 aa)
链 X
1–451(451 aa)
链 Y
1–451(451 aa)
链 Z
1–451(451 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
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ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 8.50 Å
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8VT7
Structure of the gamma tubulin ring complex nucleated microtubule protofilament.
提交 2024-01-25
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 4
PDB 声明:tetrameric
|
链 B
1–451(451 aa)
链 J
1–451(451 aa)
|
未记录
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GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2
GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2
MG MAGNESIUM ION × 2
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ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
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分辨率 2.66 Å
|
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9BP6
Structure of alpha1B and betaI/IVb microtubule bound to GMPCPP
提交 2024-05-07
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 4
PDB 声明:tetrameric
|
链 A
1–451(451 aa)
链 I
1–451(451 aa)
|
未记录
|
GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2
MG MAGNESIUM ION × 4
G2P PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 2
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ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE;Double-cycled GMPCPP microtubules were diluted to 2.5uM in Brb80 buffer. 5 ul of microtubules were applied to glow-discharged cryo-EM grid and allowed to absorb for 30 sec.
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分辨率 3.10 Å
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9CMM
Two protofilament structure of alpha1B and betaI/IVb microtubule bound to GMPCPP
提交 2024-07-15
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 8
PDB 声明:octameric
|
链 A
1–451(451 aa)
链 C
1–451(451 aa)
链 E
1–451(451 aa)
链 I
1–451(451 aa)
|
未记录
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G2P PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 4
MG MAGNESIUM ION × 8
GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE;Double-cycled GMPCPP microtubules were diluted to 2.5uM in Brb80 buffer. 5 ul of microtubules were applied to glow-discharged cryo-EM grid and allowed to absorb for 30 sec.
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分辨率 3.10 Å
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9COC
Two protofilament structure of alpha1B and betaI/IVb microtubule bound to GDP
提交 2024-07-16
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 8
PDB 声明:octameric
|
链 A
1–451(451 aa)
链 C
1–451(451 aa)
链 D
1–451(451 aa)
链 I
1–451(451 aa)
|
未记录
|
GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 4
GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4
MG MAGNESIUM ION × 4
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE;5 ul of microtubules were applied to glow-discharged electron microscopy grids and allowed to absorb for 30 sec.
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分辨率 2.90 Å
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9F3B
Undecorated 13pf E254Q microtubule from recombinant human tubulin
提交 2024-04-25
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聚集状态不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 12
PDB 声明:12-meric
|
链 A
1–42(42 aa)
链 A
47–441(395 aa)
链 C
1–42(42 aa)
链 C
47–441(395 aa)
链 E
1–42(42 aa)
链 E
47–441(395 aa)
链 G
1–42(42 aa)
链 G
47–441(395 aa)
链 I
1–42(42 aa)
链 I
47–441(395 aa)
链 K
1–42(42 aa)
链 K
47–441(395 aa)
|
未记录
|
GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 12
MG MAGNESIUM ION × 12
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.60 Å
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9F3H
Undecorated 13pf mosaic 20%E254Q - 80% E254QN microtubule from recombinant human tubulin
提交 2024-04-25
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构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 12
PDB 声明:12-meric
|
链 A
47–441(395 aa)
链 C
47–441(395 aa)
链 E
47–441(395 aa)
链 G
47–441(395 aa)
链 I
47–441(395 aa)
链 K
47–441(395 aa)
|
未记录
|
GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 12
MG MAGNESIUM ION × 12
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.30 Å
|
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9F3S
13pf mosaic 20%E254Q - 80% E254N microtubule from recombinant human tubulin decorated with EB3
提交 2024-04-25
|
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 14
PDB 声明:14-meric
|
链 A
1–42(42 aa)
链 A
47–441(395 aa)
链 C
1–42(42 aa)
链 C
47–441(395 aa)
链 E
1–42(42 aa)
链 E
47–441(395 aa)
链 G
1–42(42 aa)
链 G
47–441(395 aa)
链 I
1–42(42 aa)
链 I
47–441(395 aa)
链 K
1–42(42 aa)
链 K
47–441(395 aa)
|
未记录
|
GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 12
MG MAGNESIUM ION × 12
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.20 Å
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9HQ4
TTLL11 bound to microtubule
提交 2024-12-16
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
信息不足
异源复合物;蛋白 × 5
PDB 声明:pentameric
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链 A
1–451(451 aa)
链 C
1–451(451 aa)
|
未记录
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G2P PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 4
MG MAGNESIUM ION × 4
TA1 TAXOL × 2
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ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7;40 mM Tris-HCl, pH 7.0, 1 mM TCEP, 1 mM MgCl2, 5 % glycerol
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
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分辨率 3.28 Å
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9SMX
CM1-activated gTuRC in complex with nascent alpha-E254D mutant microtubules
提交 2025-09-09
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构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
信息不足
异源复合物;蛋白 × 73
PDB 声明:73-meric
|
链 BA
1–451(451 aa)
链 CA
1–451(451 aa)
链 DA
1–451(451 aa)
链 EA
1–451(451 aa)
链 FA
1–451(451 aa)
链 GA
1–451(451 aa)
链 HA
1–451(451 aa)
链 IA
1–451(451 aa)
链 JA
1–451(451 aa)
链 KA
1–451(451 aa)
链 LA
1–451(451 aa)
|
未记录
|
GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 11
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.9
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.67 Å
|