SAXSdb — 9fju

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Actin, cytoplasmic 1, N-terminally processed

物种未注明

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	其他组合异源复合物蛋白 × 10 其他聚合物 2 PDB 声明：decameric（10）与蛋白拷贝数一致	链 A； UniProt 2–375 链 B； UniProt 2–375 链 C； UniProt 2–375 链 D； UniProt 2–375	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	Deoxyribonuclease-1 × 2 （P00639） Phalloidin × 4 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 4 MG MAGNESIUM ION × 8 PO4 PHOSPHATE ION × 4	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7；1xKMEI plus phalloidin cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE-PROPANE；3 seconds, force 0.	分辨率 3.84 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 9FJU	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
1HLU STRUCTURE OF BOVINE BETA-ACTIN-PROFILIN COMPLEX WITH ACTIN BOUND ATP PHOSPHATES SOLVENT ACCESSIBLE 提交 1997-05-30	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 2–375（374 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	CA CALCIUM ION × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 7.5；pH 7.5	分辨率 2.65 Å R-free 0.330
2BTF THE STRUCTURE OF CRYSTALLINE PROFILIN-BETA-ACTIN 提交 1994-01-18	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 2–375（374 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	SR STRONTIUM ION × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 2.55 Å
2OAN Structure of oxidized beta-actin 提交 2006-12-16	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 1–375（375 aa）链 D 1–375（375 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	SO4 SULFATE ION × 3 CA CALCIUM ION × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；277 K；1.6 M (NH4)2SO4, 0.1 M HEPES, 0.1 M NaCl, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K	分辨率 2.61 Å R-free 0.288
2OAN Structure of oxidized beta-actin 提交 2006-12-16	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 C 1–375（375 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	SO4 SULFATE ION × 2 CA CALCIUM ION × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；277 K；1.6 M (NH4)2SO4, 0.1 M HEPES, 0.1 M NaCl, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K	分辨率 2.61 Å R-free 0.288
2OAN Structure of oxidized beta-actin 提交 2006-12-16	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–375（375 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	SO4 SULFATE ION × 2 CA CALCIUM ION × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；277 K；1.6 M (NH4)2SO4, 0.1 M HEPES, 0.1 M NaCl, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K	分辨率 2.61 Å R-free 0.288
3U4L Cryocooled bovine profilin:actin crystal structure to 2.4 A 提交 2011-10-09	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–375（375 aa）	未记录	ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 CA CALCIUM ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.3；277 K；1.3M KPO4, 0.5 mM ATP, 0.2 mM CaCl2, pH 7.3, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K	分辨率 2.40 Å R-free 0.331
3UB5 Profilin:actin with a wide open nucleotide cleft 提交 2011-10-23	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 2–375（374 aa）	未记录	ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 CA CALCIUM ION × 2 GOL GLYCEROL × 1 CL CHLORIDE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.3；277 K；1.3M potassium phosphate pH 7.3, 0.5M ATP, 0.2M CaCl2, 1mM DTT, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K	分辨率 2.20 Å R-free 0.290
7PDZ Structure of capping protein bound to the barbed end of a cytoplasmic actin filament 提交 2021-08-09	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：tridecameric	链 I 1–375（375 aa）链 J 1–375（375 aa）链 K 1–375（375 aa）链 L 1–375（375 aa）链 N 1–375（375 aa）链 O 1–375（375 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6 MG MAGNESIUM ION × 6 PO4 PHOSPHATE ION × 4	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7；KMEI buffer cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.80 Å
8OI6 Cryo-EM structure of the undecorated barbed end of filamentous beta/gamma actin 提交 2023-03-22	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric	链 A 1–375（375 aa）链 B 1–375（375 aa）链 C 1–375（375 aa）链 D 1–375（375 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 4 MG MAGNESIUM ION × 4	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.1；10 mM imidazole pH 7.1, 100 mM KCl, 2 mM MgCl2 and 1 mM EGTA cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.59 Å
9FJY Structure of the DNase I- and phalloidin-bound pointed end of F-actin (conformer 2). 提交 2024-05-31	结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric	链 A 2–375（374 aa）链 B 2–375（374 aa）链 C 2–375（374 aa）链 D 2–375（374 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 4 MG MAGNESIUM ION × 8 PO4 PHOSPHATE ION × 4	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7；1xKMEI plus phalloidin cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE；3 seconds, force 0.	分辨率 3.79 Å

共 8 个其他 PDB 条目、10 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	ACTB_BOVIN
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–374； UniProt 2–375 作者链 B； PDB构建体 1–374； UniProt 2–375 作者链 C； PDB构建体 1–374； UniProt 2–375 作者链 D； PDB构建体 1–374； UniProt 2–375

Deoxyribonuclease-1

物种未注明

UniProt P00639

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	其他组合异源复合物蛋白 × 10 其他聚合物 2 PDB 声明：decameric（10）与蛋白拷贝数一致	链 E； UniProt 1–282 链 F； UniProt 1–282	未记录	Actin, cytoplasmic 1, N-terminally processed × 4 （P60712） Phalloidin × 4 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 4 MG MAGNESIUM ION × 8 PO4 PHOSPHATE ION × 4	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7；1xKMEI plus phalloidin cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE-PROPANE；3 seconds, force 0.	分辨率 3.84 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 9FJU	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
1ATN Atomic structure of the actin:DNASE I complex 提交 1991-03-08	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 D 23–282（260 aa）	未记录	CA CALCIUM ION × 4 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 2.80 Å
1DNK THE X-RAY STRUCTURE OF THE DNASE I-D(GGTATACC)2 COMPLEX AT 2.3 ANGSTROMS RESOLUTION 提交 1992-08-10	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：trimeric	链 A 23–282（260 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293.00K	分辨率 2.30 Å
2A3Z Ternary complex of the WH2 domain of WASP with Actin-DNAse I 提交 2005-06-27	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 B 23–282（260 aa）	未记录	CA CALCIUM ION × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 GOL GLYCEROL × 3 MG MAGNESIUM ION × 1 FMT FORMIC ACID × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.2；293 K；sodium formate, PEG2000 MME, pH 7.2, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 2.08 Å R-free 0.210
2A40 Ternary complex of the WH2 domain of WAVE with Actin-DNAse I 提交 2005-06-27	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 B 23–282（260 aa）	未记录	CA CALCIUM ION × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 GOL GLYCEROL × 2 MG MAGNESIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.6；293 K；sodium formate, PEG3350, pH 6.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 1.80 Å R-free 0.215
2A40 Ternary complex of the WH2 domain of WAVE with Actin-DNAse I 提交 2005-06-27	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 其他组合异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 E 23–282（260 aa）	未记录	CA CALCIUM ION × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.6；293 K；sodium formate, PEG3350, pH 6.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 1.80 Å R-free 0.215
2A40 Ternary complex of the WH2 domain of WAVE with Actin-DNAse I 提交 2005-06-27	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 其他组合异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 B 23–282（260 aa）链 E 23–282（260 aa）	未记录	CA CALCIUM ION × 4 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 GOL GLYCEROL × 2 MG MAGNESIUM ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.6；293 K；sodium formate, PEG3350, pH 6.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 1.80 Å R-free 0.215
2A41 Ternary complex of the WH2 Domain of WIP with Actin-DNAse I 提交 2005-06-27	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 B 23–282（260 aa）	未记录	CA CALCIUM ION × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 FMT FORMIC ACID × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；293 K；sodium formate, PEG3350, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 2.60 Å R-free 0.219
2A42 Actin-DNAse I Complex 提交 2005-06-27	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 23–282（260 aa）	未记录	CA CALCIUM ION × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 GOL GLYCEROL × 3 MG MAGNESIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；293 K；sodium formate, PEG3350, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 1.85 Å R-free 0.199
2D1K Ternary complex of the WH2 domain of mim with actin-dnase I 提交 2005-08-26	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 B 23–282（260 aa）	未记录	CA CALCIUM ION × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；293 K；sodium formate, PEG3350, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 2.50 Å R-free 0.284
2DNJ DNASE I-INDUCED DNA CONFORMATION. 2 ANGSTROMS STRUCTURE OF A DNASE I-OCTAMER COMPLEX 提交 1986-10-21	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：hexameric	链 A 23–282（260 aa）	未记录	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 6；277 K；pH 6.00, VAPOR DIFFUSION, temperature 277.00K	分辨率 2.00 Å
3CJC Actin dimer cross-linked by V. cholerae MARTX toxin and complexed with DNase I and Gelsolin-segment 1 提交 2008-03-12	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 D 23–282（260 aa）	未记录	CA CALCIUM ION × 2 SO4 SULFATE ION × 6 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；298 K；1.5 M (NH4)SO4, 0.1 M Bis-Tris, 0.1 M NaCl, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K	分辨率 3.90 Å R-free 0.278
3DNI CRYSTALLOGRAPHIC REFINEMENT AND STRUCTURE OF DNASE I AT 2 ANGSTROMS RESOLUTION 提交 1992-08-20	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 23–282（260 aa）	未记录	CA CALCIUM ION × 4	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 2.00 Å
3W3D Crystal structure of smooth muscle G actin DNase I complex 提交 2012-12-20	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 23–282（260 aa）	未记录	ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 CA CALCIUM ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 precipitation；pH 6.6；300 K；4mM MgCl2, 0.1mM CaCl2, NaN3, PEG 6000, pH 6.6, precipitation , temperature 300K	分辨率 1.80 Å
7NXV Crystal structure of the complex of DNase I/G-actin/PPP1R15A_582-621 提交 2021-03-19	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 B 23–282（260 aa）	未记录	ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 CA CALCIUM ION × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 5；293 K；10% PEG4000, 0.1M Acetate	分辨率 2.55 Å R-free 0.248
7NXV Crystal structure of the complex of DNase I/G-actin/PPP1R15A_582-621 提交 2021-03-19	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 其他组合异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 F 23–282（260 aa）	未记录	ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 CA CALCIUM ION × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 5；293 K；10% PEG4000, 0.1M Acetate	分辨率 2.55 Å R-free 0.248
7NZM Cryo-EM structure of pre-dephosphorylation complex of phosphorylated eIF2alpha with trapped holophosphatase (PP1A_D64A/PPP1R15A/G-actin/DNase I) 提交 2021-03-24	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric	链 D 23–282（260 aa）	未记录	MN MANGANESE (II) ION × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4；0.22mM Triton X-100 was added into the solution before plunging. cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.96 Å
9FJY Structure of the DNase I- and phalloidin-bound pointed end of F-actin (conformer 2). 提交 2024-05-31	结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric	链 E 1–282（282 aa）链 F 1–282（282 aa）	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 4 MG MAGNESIUM ION × 8 PO4 PHOSPHATE ION × 4	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7；1xKMEI plus phalloidin cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE；3 seconds, force 0.	分辨率 3.79 Å
9NB9 Viral protein DP71L in complex with phosphorylated eIF2alpha (NTD) and protein phosphatase 1A (D64A), stabilized by G-actin/DNAseI 提交 2025-02-13	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric	链 E 1–282（282 aa）	未记录	MN MANGANESE (II) ION × 1 CA CALCIUM ION × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；3.5 uL volume, -5 blot force, 1.5 blot time	分辨率 3.03 Å

共 15 个其他 PDB 条目、18 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	DNAS1_BOVIN
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 E； PDB构建体 1–282； UniProt 1–282 作者链 F； PDB构建体 1–282； UniProt 1–282

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	9fju
沉积日期 deposition_date	2024-05-31
结构标题 title	Structure of the DNase I- and phalloidin-bound pointed end of F-actin (conformer 1)
关键词 keywords	actin, phalloidin, filament, pointed end, DNase I, STRUCTURAL PROTEIN; STRUCTURAL PROTEIN
实验方法 method	ELECTRON MICROSCOPY

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3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier	49.68 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron	50.66 Å
零角强度 I(0) i0	768432000.00
分子量 molecular_weight	227700.0 kDa
排除体积 excluded_volume	284130 Å³
包络体积 envelope_volume	385550 Å³
水化壳体积 shell_volume	68631 Å³
包络直径 envelope_diameter	188.7 Å
壳层 Rg shell_rg	48.47 Å
包络 Rg envelope_rg	50.45 Å
形状 Rg shape_rg	50.70 Å
总 Rg total_rg	50.45 Å
总原子数 total_atoms	15968
残基数 n_residues	1998
球谐函数阶数 n_harmonics	20
q 范围 q_range	— – 0.5000 Å⁻¹
数据点数 n_points	101
壳层类型 shell_type	directional
溶剂电子密度 solvent_density	0.3340 e/Å³
壳层衬度 contrast_shell	0.0300 e/Å³
CRYSOL 版本 crysol_version	4.1.3

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4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax	176.5 Å
Rg (实空间) rg_real	50.40 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error	2.28 Å
I(0) (实空间) i0_real	7.6840e+08
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error	1.5380e+07
Rg (倒空间) rg_reciprocal	49.69 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal	767700000.0000
解质量估计 total_estimate	0.8043
解质量评级 solution_quality	GOOD a GOOD solution
P(r) 峰数 n_peaks	2
主峰位置 r_peak_primary	49.6 Å
偏度 Skewness skewness	0.634
峰度 Kurtosis kurtosis	-0.039
角度范围 angular_range	— – 0.1600 Å⁻¹
当前正则化参数 α current_alpha	0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha	59620000.0000
实空间数据点数 n_real_points	33
GNOM 版本 gnom_version	4.1.3
质量判据 quality_criteria	AN1: 0.000; Oscil: 0.677; Stabil: 1.000; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.854; Smooth: 0.567

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5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

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6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (7)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	Actin, cytoplasmic 1, N-terminally processed
分子量 formula_weight	41664.5 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	4

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A,B,C,D
原子数 atom_count	15968

DDDIAALVVDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNTPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVMDSGDGVTHTVPIYEGYALPHAILRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFTTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFEQEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPEALFQPSFLGMESCGIHETTFNSIMKCDVDIRKDLYANTVLSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWISKQEYDESGPSIVHRKCF

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	Deoxyribonuclease-1
分子量 formula_weight	31374.4 kDa
EC 编号 ec_number	3.1.21.1
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	E,F

MRGTRLMGLLLALAGLLQLGLSLKIAAFNIRTFGETKMSNATLASYIVRIVRRYDIVLIQEVRDSHLVAVGKLLDYLNQDDPNTYHYVVSEPLGRNSYKERYLFLFRPNKVSVLDTYQYDDGCESCGNDSFSREPAVVKFSSHSTKVKEFAIVALHSAPSDAVAEINSLYDVYLDVQQKWHLNDVMLMGDFNADCSYVTSSQWSSIRLRTSSTFQWLIPDSADTTATSTNCAYDRIVVAGSLLQSSVVPGSAAPFDFQAAYGLSNEMALAISDHYPVEVTLT

实体 3 Entity 3 polymer

描述 description	Phalloidin
分子量 formula_weight	808.9 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	4

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	G,H,I,J

WXATCPA

实体 4 Entity 4 branched

描述 description	2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose
分子量 formula_weight	424.4 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

实体 5 Entity 5 non-polymer

描述 description	ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE
分子量 formula_weight	427.2 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	4

实体 6 Entity 6 non-polymer

描述 description	MAGNESIUM ION
分子量 formula_weight	24.3 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	8

实体 7 Entity 7 non-polymer

描述 description	PHOSPHATE ION
分子量 formula_weight	95.0 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	4

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8. 引用文献 (1)

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晶胞边长 a length_a	1.000 Å
晶胞边长 b length_b	1.000 Å
晶胞边长 c length_c	1.000 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	—

空间群 space_group	P 1
空间群编号 int_tables_number	1
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	3.84 Å
分辨率测定方法 resolution_method	—
颗粒数 num_particles	161657

fit	/app/data/saxs_computation/fj/9fju/9fju.fit
pddf	/app/data/pr_computation/fj/9fju/9fju.pr.out
profile	/app/data/saxs_computation/fj/9fju/9fju.dat

Structure of the DNase I- and phalloidin-bound pointed end of F-actin (conformer 1)

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Actin, cytoplasmic 1, N-terminally processed

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Deoxyribonuclease-1

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

冷冻电镜 EM 3D

6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (7)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

实体 3 Entity 3 polymer

聚合物 Polymer

实体 4 Entity 4 branched

实体 5 Entity 5 non-polymer

实体 6 Entity 6 non-polymer

实体 7 Entity 7 non-polymer

8. 引用文献 (1)

9. 文件与曲线 (10)

Files (7)

Curves (3)