9fof

Structure of heteromeric amyloid filament of TDP-43 and AXNA11 from FTLD-TDP Type C (variant 2)

Method: ELECTRON MICROSCOPY D_max: 84.6 Å Quality: GOOD

▼

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

TAR DNA-binding protein 43

物种未注明

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 12 PDB 声明：12-meric（12）与蛋白拷贝数一致	链 A； UniProt 282–345 链 C； UniProt 282–345 链 E； UniProt 282–345 链 G； UniProt 282–345 链 I； UniProt 282–345 链 q； UniProt 282–345	未记录	Annexin A11 × 6 （P50995）	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.90 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 9FOF	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
1WF0 Solution structure of RRM domain in TAR DNA-binding protein-43 提交 2004-05-25	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 193–267（75 aa）片段：RRM domain	未记录	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 7；298 K；离子强度（mmCIF原始值）120mM；压力 ambient NMR样品组成 0.8mM U-15, 13C; 20mM d-Tris-HCl(pH 7.0); 100mM NaCl; 1mM d-DTT; 0.02% NaN3; 90% H2O, 10% D2O \| 90% H2O/10% D2O	分辨率未提供
2CQG Solution structure of the RNA binding domain of TAR DNA-binding protein-43 提交 2005-05-20	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 96–185（90 aa）片段：RNA recognition motif	未记录	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 7；298 K；离子强度（mmCIF原始值）120mM；压力 ambient NMR样品组成 0.86mM 13C/15N-PROTEIN; 20mM d-Tris-HCl(pH7.0); 100mM NaCl; 1mM d-DTT; 0.02% NaN3 \| 90% H2O/10% D2O	分辨率未提供
2N2C NMR Structure of TDP-43 prion-like hydrophobic helix in DPC 提交 2015-05-06	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 307–349（43 aa）片段：UNP residues 307-349	未记录	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 4；313 K；离子强度（mmCIF原始值）1；压力 ambient NMR样品组成 300 uM [U-100% 15N] entity-1, 60 mM DPC-2, 90% H2O/10% D2O \| 90% H2O/10% D2O	分辨率未提供
2N3X Solution Structure of TDP-43 Amyloidogenic Core Region 提交 2015-06-11	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 311–360（50 aa）片段：UNP residues 311-360	未记录	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 6.5；298 K；离子强度（mmCIF原始值）80；压力 ambient NMR样品组成 600 uM [U-99% 13C; U-99% 15N] GB1-TDP(311 - 360)-1, 20 mM sodium phosphate-2, 50 mM sodium chloride-3, 8 v/v [U-99% 2H] D2O-4, 0.02 v/v sodium azide-5, 93% H2O/7% D2O \| 93% H2O/7% D2O	分辨率未提供
2N4G Solution Structure of the G335D Mutant of TDP-43 Amyloidogenic Core Region 提交 2015-06-17	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 311–360（50 aa）片段：UNP residues 311-360	未记录	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 6.5；298 K；离子强度（mmCIF原始值）80；压力 ambient NMR样品组成 600 uM [U-99% 13C; U-99% 15N] GB1-TDP(311-360)-G335D-1, 20 mM sodium phosphate-2, 50 mM sodium chloride-3, 8 % [U-99% 2H] D2O-4, 0.02 w/v sodium azide-5, 92 % H2O-6, 93% H2O/7% D2O \| 93% H2O/7% D2O	分辨率未提供
2N4H Solution Structure of the Q343R Mutant of TDP-43 Amyloidogenic Core Region 提交 2015-06-18	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 311–360（50 aa）片段：UNP residues 311-360	未记录	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 6.5；298 K；离子强度（mmCIF原始值）80；压力 ambient NMR样品组成 600 uM [U-99% 13C; U-99% 15N] GB1-TDP(311-360)-Q343R-1, 20 mM sodium phosphate-2, 50 mM sodium chloride-3, 0.02 w/v sodium azide-4, 8 % [U-99% 2H] D2O-5, 92 % H2O-6, 92% H2O/8% D2O \| 92% H2O/8% D2O	分辨率未提供
2N4P Solution structure of the n-terminal domain of tdp-43 提交 2015-06-26	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–77（77 aa）片段：N-terminal residues 1-77	未记录	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 3.8；298 K；压力 ambient NMR样品组成 0.5-0.7 mM [U-13C; U-15N] NTD, TCEP, CD3COOD/ CD3COO-Na+, NaN3, 90% H2O/10% D2O \| 90% H2O/10% D2O	分辨率未提供
4BS2 NMR structure of human TDP-43 tandem RRMs in complex with UG-rich RNA 提交 2013-06-06	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：dimeric	链 A 102–269（168 aa）片段：RNA BINDING DOMAIN, RESIDUES 102-269	未记录	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 6.8；298 K；离子强度（mmCIF原始值）50 NMR样品组成 94%WATER/6%D2O	分辨率未提供
4IUF Crystal Structure of Human TDP-43 RRM1 Domain in Complex with a Single-stranded DNA 提交 2013-01-21	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：dimeric	链 A 103–179（77 aa）片段：RRM1 Domain (UNP residues 103-179)	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；298 K；0.12M CH3COONH4, 0.05M Bis-Tris, 16% PEG 3350, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K	分辨率 2.75 Å R-free 0.259
4Y00 Crystal Structure of Human TDP-43 RRM1 Domain with D169G Mutation in Complex with an Unmodified Single-stranded DNA 提交 2015-02-05	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：dimeric	链 A 101–191（91 aa）片段：UNP residues 101-191	突变：D169G	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；298 K；0.05 M CH3COONH4, pH 5.0, 15% v/v Jeffamine ED-2001, pH 7.0	分辨率 3.00 Å R-free 0.295
4Y00 Crystal Structure of Human TDP-43 RRM1 Domain with D169G Mutation in Complex with an Unmodified Single-stranded DNA 提交 2015-02-05	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白–DNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：dimeric	链 B 101–191（91 aa）片段：UNP residues 101-191	突变：D169G	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；298 K；0.05 M CH3COONH4, pH 5.0, 15% v/v Jeffamine ED-2001, pH 7.0	分辨率 3.00 Å R-free 0.295
4Y00 Crystal Structure of Human TDP-43 RRM1 Domain with D169G Mutation in Complex with an Unmodified Single-stranded DNA 提交 2015-02-05	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白–DNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：dimeric	链 C 101–191（91 aa）片段：UNP residues 101-191	突变：D169G	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；298 K；0.05 M CH3COONH4, pH 5.0, 15% v/v Jeffamine ED-2001, pH 7.0	分辨率 3.00 Å R-free 0.295
4Y00 Crystal Structure of Human TDP-43 RRM1 Domain with D169G Mutation in Complex with an Unmodified Single-stranded DNA 提交 2015-02-05	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 4 蛋白–DNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：dimeric	链 D 101–191（91 aa）片段：UNP residues 101-191	突变：D169G	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；298 K；0.05 M CH3COONH4, pH 5.0, 15% v/v Jeffamine ED-2001, pH 7.0	分辨率 3.00 Å R-free 0.295
4Y0F Crystal Structure of Human TDP-43 RRM1 Domain in Complex with an Unmodified Single-stranded DNA 提交 2015-02-06	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：dimeric	链 A 101–191（91 aa）片段：UNP residues 101-191	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；0.12M ammonium acetate, 0.08M BIS-TRIS, pH 5.5, 20% PEG 3350	分辨率 2.65 Å R-free 0.288
4Y0F Crystal Structure of Human TDP-43 RRM1 Domain in Complex with an Unmodified Single-stranded DNA 提交 2015-02-06	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白–DNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：dimeric	链 B 101–191（91 aa）片段：UNP residues 101-191	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；0.12M ammonium acetate, 0.08M BIS-TRIS, pH 5.5, 20% PEG 3350	分辨率 2.65 Å R-free 0.288
5MRG Solution structure of TDP-43 (residues 1-102) 提交 2016-12-22	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–102（102 aa）片段：N-terminal domain, UNP residues 1-102	未记录	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 3.9；298 K；离子强度（mmCIF原始值）0；压力 1 NMR样品组成 0.35 mM 13C15N TDP-43(1-102), 90% H2O/10% D2O \| 90% H2O/10% D2O	分辨率未提供
5W50 Crystal structure of the segment, LIIKGI, from the RRM2 of TDP-43, residues 248-253 提交 2017-06-13	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric	链 A 248–253（6 aa）片段：RRM2 peptide (UNP residues 248-253) 链 B 248–253（6 aa）片段：RRM2 peptide (UNP residues 248-253)	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；298 K；100 mM CHES, pH 9.5, 20% PEG8000, 10 mM lithium hydroxide	分辨率 1.40 Å R-free 0.207
5W52 MicroED structure of the segment, DLIIKGISVHI, from the RRM2 of TDP-43, residues 247-257 提交 2017-06-13	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric	链 A 247–257（11 aa）片段：RRM2 peptide (UNP residues 247-257)	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON CRYSTALLOGRAPHY cryo-EM缓冲液 pH 8.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE X-ray结晶条件 BATCH；pH 8.5；310 K；50 mM CHES, pH 8.5	分辨率 1.40 Å R-free 0.306
5W7V CryoEM structure of the segment, DLIIKGISVHI, assembled into a triple-helical fibril 提交 2017-06-20	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 270 PDB 声明：270-meric	链 0 247–257（11 aa）片段：RRM2 peptide (UNP residues 247-257) 链 1 247–257（11 aa）片段：RRM2 peptide (UNP residues 247-257) 链 2 247–257（11 aa）片段：RRM2 peptide (UNP residues 247-257) 链 3 247–257（11 aa）片段：RRM2 peptide (UNP residues 247-257) 链 4 247–257（11 aa）片段：RRM2 peptide (UNP residues 247-257) 链 5 247–257（11 aa）片段：RRM2 peptide (UNP residues 247-257) 链 6 247–257（11 aa）片段：RRM2 peptide (UNP residues 247-257) 链 7 247–257（11 aa）片段：RRM2 peptide (UNP residues 247-257) 链 8 247–257（11 aa）片段：RRM2 peptide (UNP residues 247-257)	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.80 Å
5W7V CryoEM structure of the segment, DLIIKGISVHI, assembled into a triple-helical fibril 提交 2017-06-20	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric	链 0 247–257（11 aa）片段：RRM2 peptide (UNP residues 247-257) 链 1 247–257（11 aa）片段：RRM2 peptide (UNP residues 247-257) 链 2 247–257（11 aa）片段：RRM2 peptide (UNP residues 247-257) 链 3 247–257（11 aa）片段：RRM2 peptide (UNP residues 247-257) 链 4 247–257（11 aa）片段：RRM2 peptide (UNP residues 247-257) 链 5 247–257（11 aa）片段：RRM2 peptide (UNP residues 247-257) 链 6 247–257（11 aa）片段：RRM2 peptide (UNP residues 247-257) 链 7 247–257（11 aa）片段：RRM2 peptide (UNP residues 247-257) 链 8 247–257（11 aa）片段：RRM2 peptide (UNP residues 247-257)	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.80 Å
5W7V CryoEM structure of the segment, DLIIKGISVHI, assembled into a triple-helical fibril 提交 2017-06-20	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric	链 0 247–257（11 aa）片段：RRM2 peptide (UNP residues 247-257) 链 1 247–257（11 aa）片段：RRM2 peptide (UNP residues 247-257) 链 2 247–257（11 aa）片段：RRM2 peptide (UNP residues 247-257) 链 3 247–257（11 aa）片段：RRM2 peptide (UNP residues 247-257) 链 4 247–257（11 aa）片段：RRM2 peptide (UNP residues 247-257) 链 5 247–257（11 aa）片段：RRM2 peptide (UNP residues 247-257) 链 6 247–257（11 aa）片段：RRM2 peptide (UNP residues 247-257) 链 7 247–257（11 aa）片段：RRM2 peptide (UNP residues 247-257) 链 8 247–257（11 aa）片段：RRM2 peptide (UNP residues 247-257)	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.80 Å
5WHN Crystal structure of the segment, NFGAFS, from the low complexity domain of TDP-43, residues 312-317 提交 2017-07-17	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 15 PDB 声明：pentadecameric	链 A 312–317（6 aa）片段：UNP residues 312-317	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.2；298 K；100mM phosphate/citrate 4.2, 40% ethanol, 5% PEG 1000	分辨率 1.10 Å R-free 0.160
5WHP Crystal structure of the segment, NFGTFS, from the A315T familial variant of the low complexity domain of TDP-43, residues 312-317 提交 2017-07-17	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric	链 A 312–317（6 aa）片段：UNP residues 312-317	突变：A315T	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.6；298 K；100mM sodium acetate 4.6, 200mM ammonium acetate, 30% PEG 4000	分辨率 1.00 Å R-free 0.093
5WIA Crystal structure of the segment, GNNSYS, from the low complexity domain of TDP-43, residues 370-375 提交 2017-07-18	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric	链 A 370–375（6 aa）片段：UNP residues 370-375	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；298 K；100mM bis tris propane 8.5, 200mM sodium nitrate, 20% PEG 3350	分辨率 1.00 Å R-free 0.181
5WIQ Crystal structure of the segment, GFNGGFG, from the low complexity domain of TDP-43, residues 396-402 提交 2017-07-19	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric	链 A 396–402（7 aa）片段：UNP residues 396-402 链 B 396–402（7 aa）片段：UNP residues 396-402	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.5；298 K；100mM sodium acetate pH 4.5, 800mM sodium phosphate monobasic, 1200mM potassium phosphate dibasic	分辨率 1.25 Å R-free 0.168
5WKB MicroED structure of the segment, NFGEFS, from the A315E familial variant of the low complexity domain of TDP-43, residues 312-317 提交 2017-07-24	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric	链 A 312–317（6 aa）片段：UNP residues 312-317	突变：A315E	未记录非水小分子	ELECTRON CRYSTALLOGRAPHY cryo-EM缓冲液 pH 7.5；1x PBS, pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE X-ray结晶条件 Batch；pH 7.5；298 K；1x PBS, pH 7.5	分辨率 1.00 Å R-free 0.270
5WKD Crystal structure of the segment, GNNQGSN, from the low complexity domain of TDP-43, residues 300-306 提交 2017-07-25	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric	链 A 300–306（7 aa）片段：UNP residues 300-306	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；298 K；100mM Bis-Tris propane, pH 7.5, 200 mM sodium sulfate, 20% PEG3350	分辨率 1.80 Å R-free 0.195
5X4F Solution Structure of the N-terminal Domain of TDP-43 提交 2017-02-13	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–77（77 aa）片段：UNP residues 1-77	突变：C39S/C50S	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 6.5；298 K；离子强度（mmCIF原始值）0.08；压力 1 NMR样品组成 1 mM U-99% 13C; U-99% 15N TDP(1-77)-GB1-C39/C50S, 20 mM sodium phosphate, 50 mM sodium chloride, 0.05 v/v sodium azide, 90 % H2O, 10 % D2O, 90% H2O/10% D2O \| 90% H2O/10% D2O	分辨率未提供
6B1G Solution structure of TDP-43 N-terminal domain dimer. 提交 2017-09-18	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–80（80 aa）片段：NTD domain 链 B 1–80（80 aa）片段：NTD domain	突变：S48E 突变：Y4R	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 6.8；298 K；离子强度（mmCIF原始值）0；压力 1 NMR样品组成 0.7 mM [U-99% 13C; U-99% 15N] TDP-43 NTD S48E, 2.0 mM TDP-43 NTD Y4R, 20 mM HEPES, 1 mM DTT, 90% H2O/10% D2O \| 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 0.7 mM [U-99% 13C; U-99% 15N] TDP-43 NTD Y4R, 2 mM TDP-43 NTD S48E, 20 mM HEPES, 1 mM DTT, 90% H2O/10% D2O \| 90% H2O/10% D2O	分辨率未提供
6CFH SWGMMGMLASQ segment from the low complexity domain of TDP-43 提交 2018-02-15	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 20 PDB 声明：eicosameric	链 A 333–343（11 aa）片段：SWGMMGMLASQ segment 链 B 333–343（11 aa）片段：SWGMMGMLASQ segment	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON CRYSTALLOGRAPHY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE X-ray结晶条件 Batch；pH 7.5；303 K；phosphate buffered saline, shaken for 80 hours	分辨率 1.50 Å R-free 0.313
6N37 SegA-sym, conformation of TDP-43 low complexity domain segment A sym 提交 2018-11-14	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric	链 A 195–244（50 aa）链 B 195–244（50 aa）链 C 195–244（50 aa）链 D 195–244（50 aa）链 E 195–244（50 aa）链 F 195–244（50 aa）链 G 195–244（50 aa）链 H 195–244（50 aa）链 I 195–244（50 aa）链 J 195–244（50 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.80 Å
6N3A SegA-long, conformation of TDP-43 low complexity domain segment A long 提交 2018-11-14	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：eicosameric	链 A 195–244（50 aa）链 B 195–244（50 aa）链 C 195–244（50 aa）链 D 195–244（50 aa）链 E 195–244（50 aa）链 F 195–244（50 aa）链 G 195–244（50 aa）链 H 195–244（50 aa）链 I 195–244（50 aa）链 J 195–244（50 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.30 Å
6N3B SegA-asym, conformation of TDP-43 low complexity domain segment A asym 提交 2018-11-14	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric	链 A 195–244（50 aa）链 B 195–244（50 aa）链 C 195–244（50 aa）链 D 195–244（50 aa）链 E 195–244（50 aa）链 F 195–244（50 aa）链 G 195–244（50 aa）链 H 195–244（50 aa）链 I 195–244（50 aa）链 J 195–244（50 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.80 Å
6N3C SegB, conformation of TDP-43 low complexity domain segment A 提交 2018-11-14	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 20 PDB 声明：eicosameric	链 A 170–215（46 aa）链 B 170–215（46 aa）链 C 170–215（46 aa）链 D 170–215（46 aa）链 E 170–215（46 aa）链 F 170–215（46 aa）链 G 170–215（46 aa）链 H 170–215（46 aa）链 I 170–215（46 aa）链 J 170–215（46 aa）链 K 170–215（46 aa）链 L 170–215（46 aa）链 M 170–215（46 aa）链 N 170–215（46 aa）链 O 170–215（46 aa）链 P 170–215（46 aa）链 Q 170–215（46 aa）链 R 170–215（46 aa）链 S 170–215（46 aa）链 T 170–215（46 aa）	突变：A315E 突变：A315E 突变：A315E 突变：A315E 突变：A315E 突变：A315E 突变：A315E 突变：A315E 突变：A315E 突变：A315E 突变：A315E 突变：A315E 突变：A315E 突变：A315E 突变：A315E 突变：A315E 突变：A315E 突变：A315E 突变：A315E 突变：A315E	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.30 Å
6T4B CRYSTAL STRUCTURE OF HUMAN TDP-43 N-TERMINAL DOMAIN AT 2.55 A RESOLUTION 提交 2019-10-13	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–80（80 aa）	未记录	SO4 SULFATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；0.2M Sodium bromide, 0.1M Bis-Tris propane 6.5, 20% PEG 3350	分辨率 2.55 Å R-free 0.263
6T4B CRYSTAL STRUCTURE OF HUMAN TDP-43 N-TERMINAL DOMAIN AT 2.55 A RESOLUTION 提交 2019-10-13	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 C 1–80（80 aa）	未记录	SO4 SULFATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；0.2M Sodium bromide, 0.1M Bis-Tris propane 6.5, 20% PEG 3350	分辨率 2.55 Å R-free 0.263
6T4B CRYSTAL STRUCTURE OF HUMAN TDP-43 N-TERMINAL DOMAIN AT 2.55 A RESOLUTION 提交 2019-10-13	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 E 1–80（80 aa）	未记录	SO4 SULFATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；0.2M Sodium bromide, 0.1M Bis-Tris propane 6.5, 20% PEG 3350	分辨率 2.55 Å R-free 0.263
6T4B CRYSTAL STRUCTURE OF HUMAN TDP-43 N-TERMINAL DOMAIN AT 2.55 A RESOLUTION 提交 2019-10-13	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 4 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 G 1–80（80 aa）	未记录	SO4 SULFATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；0.2M Sodium bromide, 0.1M Bis-Tris propane 6.5, 20% PEG 3350	分辨率 2.55 Å R-free 0.263
6T4B CRYSTAL STRUCTURE OF HUMAN TDP-43 N-TERMINAL DOMAIN AT 2.55 A RESOLUTION 提交 2019-10-13	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 5 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 I 1–80（80 aa）	未记录	SO4 SULFATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；0.2M Sodium bromide, 0.1M Bis-Tris propane 6.5, 20% PEG 3350	分辨率 2.55 Å R-free 0.263
7KWZ TDP-43 LCD amyloid fibrils 提交 2020-12-02	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric	链 A 151–298（148 aa）链 B 151–298（148 aa）链 C 151–298（148 aa）链 D 151–298（148 aa）链 E 151–298（148 aa）	突变：low complexity domain (UNP residues 151-298) 突变：low complexity domain (UNP residues 151-298) 突变：low complexity domain (UNP residues 151-298) 突变：low complexity domain (UNP residues 151-298) 突变：low complexity domain (UNP residues 151-298)	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.20 Å
7N9H Structure of the mammalian importin a1 bound to the TDP-43 NLS 提交 2021-06-17	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 79–102（24 aa）片段：Nuclear localization signal motif, residues 79-102	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.6；293 K；0.5M sodium citrate, 10 mM mercaptoethanol	分辨率 2.20 Å R-free 0.215
7PY2 Structure of pathological TDP-43 filaments from ALS with FTLD 提交 2021-10-08	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 1–414（414 aa）链 B 1–414（414 aa）链 C 1–414（414 aa）链 D 1–414（414 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.59 Å
7Q3U Cryo-EM structure of TDP43 core peptide amyloid fiber 提交 2021-10-28	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric	链 A 279–360（82 aa）链 B 279–360（82 aa）链 C 279–360（82 aa）链 D 279–360（82 aa）链 E 279–360（82 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.70 Å
8A6I Structure of the low complexity domain of TDP-43 (fragment 309-350) with methionine sulfoxide modifications 提交 2022-06-17	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 309–350（42 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 6.8；288 K；离子强度（mmCIF原始值）10；压力 1 NMR样品组成 500 uM [U-13C; U-15N] TDP-43 fragment 309-350, 20 mM HEPES, 10 mM potassium chloride, 5 mM MgCl2, 1 mM ATP, 90% H2O/10% D2O \| 90% H2O/10% D2O	分辨率未提供
8CG3 Structure of TDP-43 amyloid filament from type A FTLD-TDP (variant 1) 提交 2023-02-03	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric	链 A 1–414（414 aa）链 B 1–414（414 aa）链 C 1–414（414 aa）链 D 1–414（414 aa）链 U 1–414（414 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.39 Å
8CGG Structure of TDP-43 amyloid filament from type A FTLD-TDP (variant 2) 提交 2023-02-04	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric	链 A 1–414（414 aa）链 B 1–414（414 aa）链 C 1–414（414 aa）链 D 1–414（414 aa）链 U 1–414（414 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.50 Å
8CGH Structure of TDP-43 amyloid filament from type A FTLD-TDP (variant 3) 提交 2023-02-04	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric	链 A 1–414（414 aa）链 B 1–414（414 aa）链 C 1–414（414 aa）链 D 1–414（414 aa）链 U 1–414（414 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.68 Å
8QX9 TDP-43 amyloid fibrils: Morphology-1a 提交 2023-10-24	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 12 PDB 声明：12-meric	链 A 1–414（414 aa）链 B 1–414（414 aa）链 C 1–414（414 aa）链 D 1–414（414 aa）链 E 1–414（414 aa）链 F 1–414（414 aa）链 G 1–414（414 aa）链 H 1–414（414 aa）链 I 1–414（414 aa）链 J 1–414（414 aa）链 K 1–414（414 aa）链 L 1–414（414 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.76 Å
8QXA TDP-43 amyloid fibrils: Morphology-1b 提交 2023-10-24	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 12 PDB 声明：12-meric	链 A 1–414（414 aa）链 B 1–414（414 aa）链 C 1–414（414 aa）链 D 1–414（414 aa）链 E 1–414（414 aa）链 F 1–414（414 aa）链 G 1–414（414 aa）链 H 1–414（414 aa）链 I 1–414（414 aa）链 J 1–414（414 aa）链 K 1–414（414 aa）链 L 1–414（414 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.05 Å
8QXB TDP-43 amyloid fibrils: Morphology-2 提交 2023-10-24	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 18 PDB 声明：18-meric	链 A 1–414（414 aa）链 B 1–414（414 aa）链 C 1–414（414 aa）链 D 1–414（414 aa）链 E 1–414（414 aa）链 F 1–414（414 aa）链 G 1–414（414 aa）链 H 1–414（414 aa）链 I 1–414（414 aa）链 J 1–414（414 aa）链 K 1–414（414 aa）链 L 1–414（414 aa）链 M 1–414（414 aa）链 N 1–414（414 aa）链 O 1–414（414 aa）链 P 1–414（414 aa）链 Q 1–414（414 aa）链 R 1–414（414 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.86 Å
9FOR Structure of heteromeric amyloid filament of TDP-43 and AXNA11 from FTLD-TDP Type C (variant 1) 提交 2024-06-12	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric	链 A 284–345（62 aa）链 C 284–345（62 aa）链 E 284–345（62 aa）链 G 284–345（62 aa）链 o 284–345（62 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.75 Å

共 41 个其他 PDB 条目、51 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	TADBP_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–64； UniProt 282–345 作者链 C； PDB构建体 1–64； UniProt 282–345 作者链 E； PDB构建体 1–64； UniProt 282–345 作者链 G； PDB构建体 1–64； UniProt 282–345 作者链 I； PDB构建体 1–64； UniProt 282–345 作者链 q； PDB构建体 1–64； UniProt 282–345

Annexin A11

物种未注明

UniProt P50995

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 12 PDB 声明：12-meric（12）与蛋白拷贝数一致	链 B； UniProt 39–74 链 D； UniProt 39–74 链 F； UniProt 39–74 链 H； UniProt 39–74 链 J； UniProt 39–74 链 r； UniProt 39–74	未记录	TAR DNA-binding protein 43 × 6 （Q13148）	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.90 Å

数据库中的同蛋白其他状态

其他 PDB	相对当前条目 9FOF	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
9FOR Structure of heteromeric amyloid filament of TDP-43 and AXNA11 from FTLD-TDP Type C (variant 1) 提交 2024-06-12	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric	链 B 39–74（36 aa）链 D 39–74（36 aa）链 F 39–74（36 aa）链 H 39–74（36 aa）链 p 39–74（36 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.75 Å

共 1 个其他 PDB 条目、1 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	ANX11_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 B； PDB构建体 1–36； UniProt 39–74 作者链 D； PDB构建体 1–36； UniProt 39–74 作者链 F； PDB构建体 1–36； UniProt 39–74 作者链 H； PDB构建体 1–36； UniProt 39–74 作者链 J； PDB构建体 1–36； UniProt 39–74 作者链 r； PDB构建体 1–36； UniProt 39–74

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

下载 Download SAXS (.dat) P(r) (.pr.out) CIF

▼

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	9fof
沉积日期 deposition_date	2024-06-11
结构标题 title	Structure of heteromeric amyloid filament of TDP-43 and AXNA11 from FTLD-TDP Type C (variant 2)
关键词 keywords	TDP-43, ANXA11, amyloid, heteromeric amyloid, FTLD-TDP, neurodegeneration, dementia, brain, protein filament, PROTEIN FIBRIL; PROTEIN FIBRIL
实验方法 method	ELECTRON MICROSCOPY

▼

3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier	25.48 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron	24.52 Å
零角强度 I(0) i0	72944900.00
分子量 molecular_weight	60006.0 kDa
排除体积 excluded_volume	72058 Å³
包络体积 envelope_volume	89323 Å³
水化壳体积 shell_volume	29978 Å³
包络直径 envelope_diameter	88.5 Å
壳层 Rg shell_rg	32.46 Å
包络 Rg envelope_rg	24.86 Å
形状 Rg shape_rg	24.61 Å
总 Rg total_rg	25.06 Å
总原子数 total_atoms	4176
残基数 n_residues	600
球谐函数阶数 n_harmonics	20
q 范围 q_range	— – 0.5000 Å⁻¹
数据点数 n_points	101
壳层类型 shell_type	directional
溶剂电子密度 solvent_density	0.3340 e/Å³
壳层衬度 contrast_shell	0.0300 e/Å³
CRYSOL 版本 crysol_version	4.1.3

▼

4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax	84.6 Å
Rg (实空间) rg_real	25.42 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error	0.62 Å
I(0) (实空间) i0_real	7.2940e+07
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error	9.9170e+05
Rg (倒空间) rg_reciprocal	25.44 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal	72950000.0000
解质量估计 total_estimate	0.8905
解质量评级 solution_quality	GOOD a GOOD solution
P(r) 峰数 n_peaks	2
主峰位置 r_peak_primary	28.7 Å
偏度 Skewness skewness	0.273
峰度 Kurtosis kurtosis	-0.428
角度范围 angular_range	— – 0.3100 Å⁻¹
当前正则化参数 α current_alpha	0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha	10940000.0000
实空间数据点数 n_real_points	63
GNOM 版本 gnom_version	4.1.3
质量判据 quality_criteria	AN1: 0.000; Oscil: 0.867; Stabil: 1.000; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.998; Smooth: 0.973

▶

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

▶

6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (2)

▶

8. 引用文献 (3)

▶

晶胞边长 a length_a	1.000 Å
晶胞边长 b length_b	1.000 Å
晶胞边长 c length_c	1.000 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	—

空间群 space_group	P 1
空间群编号 int_tables_number	1
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	2.900 Å
最低分辨率 resolution_low	96.000 Å
R 因子 r_factor	0.6862
R_work r_work	0.6862
R_free r_free	—

分辨率 resolution	2.90 Å
分辨率测定方法 resolution_method	—
颗粒数 num_particles	10842

描述 description	TAR DNA-binding protein 43
分子量 formula_weight	6231.9 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	6

Structure of heteromeric amyloid filament of TDP-43 and AXNA11 from FTLD-TDP Type C (variant 2)

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

TAR DNA-binding protein 43

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Annexin A11

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

冷冻电镜 EM 3D

6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (2)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

8. 引用文献 (3)

9. 文件与曲线 (10)

Files (7)

Curves (3)

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	q,A,C,E,G,I
原子数 atom_count	4176

fit	/app/data/saxs_computation/fo/9fof/9fof.fit
pddf	/app/data/pr_computation/fo/9fof/9fof.pr.out
profile	/app/data/saxs_computation/fo/9fof/9fof.dat