9g8n

80S-bound human Ski2-exosome complex

Method: ELECTRON MICROSCOPY D_max: 218.5 Å Quality: GOOD

▼

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Exosome complex component RRP41

Homo sapiens

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白–RNA 异源复合物蛋白 × 12 RNA 1 PDB 声明：13-meric（13）与全部聚合物数一致	链 L； UniProt 1–245	未记录	Exosome complex component RRP43 × 1 （Q96B26） Exosome complex component RRP46 × 1 （Q9NQT4） Exosome complex component RRP42 × 1 （Q15024） Exosome complex component RRP40 × 1 （Q9NQT5） Exosome complex component CSL4 × 1 （Q9Y3B2） CrPV-IRES RNA × 1 Helicase SKI2W × 1 （Q15477） Exosome complex component MTR3 × 1 （Q5RKV6） Exosome complex component RRP4 × 1 （Q13868） Isoform 2 of HBS1-like protein × 1 （Q9Y450） Exosome complex component RRP45 × 1 （Q06265） DIS3-like exonuclease 1 × 1 （Q8TF46）	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.70 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 9G8N	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
2NN6 Structure of the human RNA exosome composed of Rrp41, Rrp45, Rrp46, Rrp43, Mtr3, Rrp42, Csl4, Rrp4, and Rrp40 提交 2006-10-23	构建体不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric	链 B 1–244（244 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；291 K；4.5-8% w/v PEG4000, 0.1M Sodium citrate, 1 mM TCEP, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K	分辨率 3.35 Å R-free 0.344
6D6Q Human nuclear exosome-MTR4 RNA complex - overall reconstruction 提交 2018-04-22	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：pentadecameric	链 B 1–245（245 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 1 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；30 sec wait time, 2.5 sec blot time	分辨率 3.45 Å
6D6R Human nuclear exosome-MTR4 RNA complex - composite map after focused reconstruction 提交 2018-04-22	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：pentadecameric	链 B 1–245（245 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；30 sec wait time, 2.5 sec blot time	分辨率 3.45 Å
6H25 Human nuclear RNA exosome EXO-10-MPP6 complex 提交 2018-07-13	聚集状态不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：dodecameric	链 B 1–245（245 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.80 Å
9G8M human 80S ribosome bound by a SKI2-exosome complex 提交 2024-07-23	聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 87 PDB 声明：92-meric	链 L 1–245（245 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 232 ZN ZINC ION × 6	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.30 Å
9G8O human 40S ribosome bound by a SKI238-exosome complex 提交 2024-07-23	聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 49 PDB 声明：51-meric	链 N 1–245（245 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.40 Å
9G8P 40S-bound human SKI2-exosome complex 提交 2024-07-23	实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：13-meric	链 L 1–245（245 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 7.00 Å

共 7 个其他 PDB 条目、7 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	EXOS4_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 L； PDB构建体 1–245； UniProt 1–245

Exosome complex component RRP43

Homo sapiens

UniProt Q96B26

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白–RNA 异源复合物蛋白 × 12 RNA 1 PDB 声明：13-meric（13）与全部聚合物数一致	链 N； UniProt 1–276	未记录	Exosome complex component RRP41 × 1 （Q9NPD3） Exosome complex component RRP46 × 1 （Q9NQT4） Exosome complex component RRP42 × 1 （Q15024） Exosome complex component RRP40 × 1 （Q9NQT5） Exosome complex component CSL4 × 1 （Q9Y3B2） CrPV-IRES RNA × 1 Helicase SKI2W × 1 （Q15477） Exosome complex component MTR3 × 1 （Q5RKV6） Exosome complex component RRP4 × 1 （Q13868） Isoform 2 of HBS1-like protein × 1 （Q9Y450） Exosome complex component RRP45 × 1 （Q06265） DIS3-like exonuclease 1 × 1 （Q8TF46）	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.70 Å

数据库中的同蛋白其他状态

其他 PDB	相对当前条目 9G8N	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
2NN6 Structure of the human RNA exosome composed of Rrp41, Rrp45, Rrp46, Rrp43, Mtr3, Rrp42, Csl4, Rrp4, and Rrp40 提交 2006-10-23	聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric	链 C 1–276（276 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；291 K；4.5-8% w/v PEG4000, 0.1M Sodium citrate, 1 mM TCEP, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K	分辨率 3.35 Å R-free 0.344
6D6Q Human nuclear exosome-MTR4 RNA complex - overall reconstruction 提交 2018-04-22	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：pentadecameric	链 C 1–276（276 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 1 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；30 sec wait time, 2.5 sec blot time	分辨率 3.45 Å
6D6R Human nuclear exosome-MTR4 RNA complex - composite map after focused reconstruction 提交 2018-04-22	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：pentadecameric	链 C 1–276（276 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；30 sec wait time, 2.5 sec blot time	分辨率 3.45 Å
6H25 Human nuclear RNA exosome EXO-10-MPP6 complex 提交 2018-07-13	聚集状态不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：dodecameric	链 C 1–276（276 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.80 Å
9G8M human 80S ribosome bound by a SKI2-exosome complex 提交 2024-07-23	聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 87 PDB 声明：92-meric	链 N 1–276（276 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 232 ZN ZINC ION × 6	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.30 Å
9G8O human 40S ribosome bound by a SKI238-exosome complex 提交 2024-07-23	聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 49 PDB 声明：51-meric	链 L 1–276（276 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.40 Å
9G8P 40S-bound human SKI2-exosome complex 提交 2024-07-23	实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：13-meric	链 N 1–276（276 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 7.00 Å

共 7 个其他 PDB 条目、7 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	EXOS8_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 N； PDB构建体 5–280； UniProt 1–276

Exosome complex component RRP46

Homo sapiens

UniProt Q9NQT4

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白–RNA 异源复合物蛋白 × 12 RNA 1 PDB 声明：13-meric（13）与全部聚合物数一致	链 O； UniProt 1–235	未记录	Exosome complex component RRP41 × 1 （Q9NPD3） Exosome complex component RRP43 × 1 （Q96B26） Exosome complex component RRP42 × 1 （Q15024） Exosome complex component RRP40 × 1 （Q9NQT5） Exosome complex component CSL4 × 1 （Q9Y3B2） CrPV-IRES RNA × 1 Helicase SKI2W × 1 （Q15477） Exosome complex component MTR3 × 1 （Q5RKV6） Exosome complex component RRP4 × 1 （Q13868） Isoform 2 of HBS1-like protein × 1 （Q9Y450） Exosome complex component RRP45 × 1 （Q06265） DIS3-like exonuclease 1 × 1 （Q8TF46）	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.70 Å

数据库中的同蛋白其他状态

其他 PDB	相对当前条目 9G8N	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
2NN6 Structure of the human RNA exosome composed of Rrp41, Rrp45, Rrp46, Rrp43, Mtr3, Rrp42, Csl4, Rrp4, and Rrp40 提交 2006-10-23	聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric	链 D 1–235（235 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；291 K；4.5-8% w/v PEG4000, 0.1M Sodium citrate, 1 mM TCEP, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K	分辨率 3.35 Å R-free 0.344
6D6Q Human nuclear exosome-MTR4 RNA complex - overall reconstruction 提交 2018-04-22	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：pentadecameric	链 D 1–235（235 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 1 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；30 sec wait time, 2.5 sec blot time	分辨率 3.45 Å
6D6R Human nuclear exosome-MTR4 RNA complex - composite map after focused reconstruction 提交 2018-04-22	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：pentadecameric	链 D 1–235（235 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；30 sec wait time, 2.5 sec blot time	分辨率 3.45 Å
6H25 Human nuclear RNA exosome EXO-10-MPP6 complex 提交 2018-07-13	聚集状态不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：dodecameric	链 D 1–235（235 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.80 Å
9G8M human 80S ribosome bound by a SKI2-exosome complex 提交 2024-07-23	聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 87 PDB 声明：92-meric	链 O 1–235（235 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 232 ZN ZINC ION × 6	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.30 Å
9G8O human 40S ribosome bound by a SKI238-exosome complex 提交 2024-07-23	聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 49 PDB 声明：51-meric	链 O 1–235（235 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.40 Å
9G8P 40S-bound human SKI2-exosome complex 提交 2024-07-23	实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：13-meric	链 O 1–235（235 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 7.00 Å

共 7 个其他 PDB 条目、7 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	EXOS5_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	3
链与序列区间	作者链 O； PDB构建体 5–239； UniProt 1–235

Exosome complex component RRP42

Homo sapiens

UniProt Q15024

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白–RNA 异源复合物蛋白 × 12 RNA 1 PDB 声明：13-meric（13）与全部聚合物数一致	链 F； UniProt 1–291	未记录	Exosome complex component RRP41 × 1 （Q9NPD3） Exosome complex component RRP43 × 1 （Q96B26） Exosome complex component RRP46 × 1 （Q9NQT4） Exosome complex component RRP40 × 1 （Q9NQT5） Exosome complex component CSL4 × 1 （Q9Y3B2） CrPV-IRES RNA × 1 Helicase SKI2W × 1 （Q15477） Exosome complex component MTR3 × 1 （Q5RKV6） Exosome complex component RRP4 × 1 （Q13868） Isoform 2 of HBS1-like protein × 1 （Q9Y450） Exosome complex component RRP45 × 1 （Q06265） DIS3-like exonuclease 1 × 1 （Q8TF46）	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.70 Å

数据库中的同蛋白其他状态

其他 PDB	相对当前条目 9G8N	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
2NN6 Structure of the human RNA exosome composed of Rrp41, Rrp45, Rrp46, Rrp43, Mtr3, Rrp42, Csl4, Rrp4, and Rrp40 提交 2006-10-23	突变/修饰不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric	链 E 1–291（291 aa）	突变：L274V	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；291 K；4.5-8% w/v PEG4000, 0.1M Sodium citrate, 1 mM TCEP, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K	分辨率 3.35 Å R-free 0.344
6D6Q Human nuclear exosome-MTR4 RNA complex - overall reconstruction 提交 2018-04-22	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：pentadecameric	链 E 1–291（291 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 1 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；30 sec wait time, 2.5 sec blot time	分辨率 3.45 Å
6D6R Human nuclear exosome-MTR4 RNA complex - composite map after focused reconstruction 提交 2018-04-22	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：pentadecameric	链 E 1–291（291 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；30 sec wait time, 2.5 sec blot time	分辨率 3.45 Å
6H25 Human nuclear RNA exosome EXO-10-MPP6 complex 提交 2018-07-13	聚集状态不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：dodecameric	链 E 1–291（291 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.80 Å
9G8M human 80S ribosome bound by a SKI2-exosome complex 提交 2024-07-23	聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 87 PDB 声明：92-meric	链 F 1–291（291 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 232 ZN ZINC ION × 6	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.30 Å
9G8O human 40S ribosome bound by a SKI238-exosome complex 提交 2024-07-23	聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 49 PDB 声明：51-meric	链 F 1–291（291 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.40 Å
9G8P 40S-bound human SKI2-exosome complex 提交 2024-07-23	实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：13-meric	链 F 1–291（291 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 7.00 Å

共 7 个其他 PDB 条目、7 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	EXOS7_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	4
链与序列区间	作者链 F； PDB构建体 5–295； UniProt 1–291

Exosome complex component RRP40

Homo sapiens

UniProt Q9NQT5

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白–RNA 异源复合物蛋白 × 12 RNA 1 PDB 声明：13-meric（13）与全部聚合物数一致	链 H； UniProt 1–275	未记录	Exosome complex component RRP41 × 1 （Q9NPD3） Exosome complex component RRP43 × 1 （Q96B26） Exosome complex component RRP46 × 1 （Q9NQT4） Exosome complex component RRP42 × 1 （Q15024） Exosome complex component CSL4 × 1 （Q9Y3B2） CrPV-IRES RNA × 1 Helicase SKI2W × 1 （Q15477） Exosome complex component MTR3 × 1 （Q5RKV6） Exosome complex component RRP4 × 1 （Q13868） Isoform 2 of HBS1-like protein × 1 （Q9Y450） Exosome complex component RRP45 × 1 （Q06265） DIS3-like exonuclease 1 × 1 （Q8TF46）	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.70 Å

数据库中的同蛋白其他状态

其他 PDB	相对当前条目 9G8N	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
2NN6 Structure of the human RNA exosome composed of Rrp41, Rrp45, Rrp46, Rrp43, Mtr3, Rrp42, Csl4, Rrp4, and Rrp40 提交 2006-10-23	构建体不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric	链 G 0–274（275 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；291 K；4.5-8% w/v PEG4000, 0.1M Sodium citrate, 1 mM TCEP, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K	分辨率 3.35 Å R-free 0.344
6D6Q Human nuclear exosome-MTR4 RNA complex - overall reconstruction 提交 2018-04-22	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：pentadecameric	链 G 1–275（275 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 1 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；30 sec wait time, 2.5 sec blot time	分辨率 3.45 Å
6D6R Human nuclear exosome-MTR4 RNA complex - composite map after focused reconstruction 提交 2018-04-22	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：pentadecameric	链 G 1–275（275 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；30 sec wait time, 2.5 sec blot time	分辨率 3.45 Å
6H25 Human nuclear RNA exosome EXO-10-MPP6 complex 提交 2018-07-13	聚集状态不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：dodecameric	链 G 1–275（275 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.80 Å
9G8M human 80S ribosome bound by a SKI2-exosome complex 提交 2024-07-23	聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 87 PDB 声明：92-meric	链 H 1–275（275 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 232 ZN ZINC ION × 6	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.30 Å
9G8O human 40S ribosome bound by a SKI238-exosome complex 提交 2024-07-23	聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 49 PDB 声明：51-meric	链 H 1–275（275 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.40 Å
9G8P 40S-bound human SKI2-exosome complex 提交 2024-07-23	实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：13-meric	链 H 1–275（275 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 7.00 Å

共 7 个其他 PDB 条目、7 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	EXOS3_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	5
链与序列区间	作者链 H； PDB构建体 5–279； UniProt 1–275

Exosome complex component CSL4

Homo sapiens

UniProt Q9Y3B2

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白–RNA 异源复合物蛋白 × 12 RNA 1 PDB 声明：13-meric（13）与全部聚合物数一致	链 J； UniProt 1–195	未记录	Exosome complex component RRP41 × 1 （Q9NPD3） Exosome complex component RRP43 × 1 （Q96B26） Exosome complex component RRP46 × 1 （Q9NQT4） Exosome complex component RRP42 × 1 （Q15024） Exosome complex component RRP40 × 1 （Q9NQT5） CrPV-IRES RNA × 1 Helicase SKI2W × 1 （Q15477） Exosome complex component MTR3 × 1 （Q5RKV6） Exosome complex component RRP4 × 1 （Q13868） Isoform 2 of HBS1-like protein × 1 （Q9Y450） Exosome complex component RRP45 × 1 （Q06265） DIS3-like exonuclease 1 × 1 （Q8TF46）	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.70 Å

数据库中的同蛋白其他状态

其他 PDB	相对当前条目 9G8N	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
2NN6 Structure of the human RNA exosome composed of Rrp41, Rrp45, Rrp46, Rrp43, Mtr3, Rrp42, Csl4, Rrp4, and Rrp40 提交 2006-10-23	聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric	链 I 1–195（195 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；291 K；4.5-8% w/v PEG4000, 0.1M Sodium citrate, 1 mM TCEP, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K	分辨率 3.35 Å R-free 0.344
6D6Q Human nuclear exosome-MTR4 RNA complex - overall reconstruction 提交 2018-04-22	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：pentadecameric	链 I 1–195（195 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 1 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；30 sec wait time, 2.5 sec blot time	分辨率 3.45 Å
6D6R Human nuclear exosome-MTR4 RNA complex - composite map after focused reconstruction 提交 2018-04-22	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：pentadecameric	链 I 1–195（195 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；30 sec wait time, 2.5 sec blot time	分辨率 3.45 Å
6H25 Human nuclear RNA exosome EXO-10-MPP6 complex 提交 2018-07-13	聚集状态不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：dodecameric	链 I 1–195（195 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.80 Å
9G8M human 80S ribosome bound by a SKI2-exosome complex 提交 2024-07-23	聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 87 PDB 声明：92-meric	链 J 1–195（195 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 232 ZN ZINC ION × 6	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.30 Å
9G8O human 40S ribosome bound by a SKI238-exosome complex 提交 2024-07-23	聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 49 PDB 声明：51-meric	链 J 1–195（195 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.40 Å
9G8P 40S-bound human SKI2-exosome complex 提交 2024-07-23	实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：13-meric	链 J 1–195（195 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 7.00 Å

共 7 个其他 PDB 条目、7 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	EXOS1_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	6
链与序列区间	作者链 J； PDB构建体 5–199； UniProt 1–195

Helicase SKI2W

Homo sapiens

UniProt Q15477

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白–RNA 异源复合物蛋白 × 12 RNA 1 PDB 声明：13-meric（13）与全部聚合物数一致	链 A； UniProt 1–1246	未记录	Exosome complex component RRP41 × 1 （Q9NPD3） Exosome complex component RRP43 × 1 （Q96B26） Exosome complex component RRP46 × 1 （Q9NQT4） Exosome complex component RRP42 × 1 （Q15024） Exosome complex component RRP40 × 1 （Q9NQT5） Exosome complex component CSL4 × 1 （Q9Y3B2） CrPV-IRES RNA × 1 Exosome complex component MTR3 × 1 （Q5RKV6） Exosome complex component RRP4 × 1 （Q13868） Isoform 2 of HBS1-like protein × 1 （Q9Y450） Exosome complex component RRP45 × 1 （Q06265） DIS3-like exonuclease 1 × 1 （Q8TF46）	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.70 Å

数据库中的同蛋白其他状态

其他 PDB	相对当前条目 9G8N	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
7QDR Apo human SKI complex in the closed state 提交 2021-11-29	聚集状态不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 1–1246（1246 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.70 Å
7QDS Apo human SKI complex in the open state 提交 2021-11-30	聚集状态不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 1–1246（1246 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.80 Å
7QDY RNA-bound human SKI complex 提交 2021-12-01	聚集状态不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：pentameric	链 A 1–1246（1246 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.10 Å
7QDZ 80S-bound human SKI complex in the closed state 提交 2021-12-01	聚集状态不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：pentameric	链 A 1–1246（1246 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.60 Å
7QE0 80S-bound human SKI complex in the open state 提交 2021-12-01	聚集状态不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：dimeric	链 A 1–1246（1246 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 6.50 Å
9G8M human 80S ribosome bound by a SKI2-exosome complex 提交 2024-07-23	聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 87 PDB 声明：92-meric	链 A 1–1246（1246 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 232 ZN ZINC ION × 6	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.30 Å
9G8O human 40S ribosome bound by a SKI238-exosome complex 提交 2024-07-23	聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 49 PDB 声明：51-meric	链 A 1–1246（1246 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.40 Å
9G8P 40S-bound human SKI2-exosome complex 提交 2024-07-23	实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：13-meric	链 A 1–1246（1246 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 7.00 Å
9G8Q 40S-bound human SKI238 complex in the open state (Gatekeeping module) 提交 2024-07-23	聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 1–1246（1246 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 4.10 Å
9G8R human SKI7-SKI238 complex in the open state 提交 2024-07-23	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric	链 A 1–774（774 aa）链 A 1049–1246（198 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.40 Å

共 10 个其他 PDB 条目、10 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	SKIV2_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	8
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–1246； UniProt 1–1246

Exosome complex component MTR3

Homo sapiens

UniProt Q5RKV6

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白–RNA 异源复合物蛋白 × 12 RNA 1 PDB 声明：13-meric（13）与全部聚合物数一致	链 G； UniProt 1–272	未记录	Exosome complex component RRP41 × 1 （Q9NPD3） Exosome complex component RRP43 × 1 （Q96B26） Exosome complex component RRP46 × 1 （Q9NQT4） Exosome complex component RRP42 × 1 （Q15024） Exosome complex component RRP40 × 1 （Q9NQT5） Exosome complex component CSL4 × 1 （Q9Y3B2） CrPV-IRES RNA × 1 Helicase SKI2W × 1 （Q15477） Exosome complex component RRP4 × 1 （Q13868） Isoform 2 of HBS1-like protein × 1 （Q9Y450） Exosome complex component RRP45 × 1 （Q06265） DIS3-like exonuclease 1 × 1 （Q8TF46）	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.70 Å

数据库中的同蛋白其他状态

其他 PDB	相对当前条目 9G8N	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
2NN6 Structure of the human RNA exosome composed of Rrp41, Rrp45, Rrp46, Rrp43, Mtr3, Rrp42, Csl4, Rrp4, and Rrp40 提交 2006-10-23	聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric	链 F 1–272（272 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；291 K；4.5-8% w/v PEG4000, 0.1M Sodium citrate, 1 mM TCEP, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K	分辨率 3.35 Å R-free 0.344
6D6Q Human nuclear exosome-MTR4 RNA complex - overall reconstruction 提交 2018-04-22	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：pentadecameric	链 F 1–272（272 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 1 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；30 sec wait time, 2.5 sec blot time	分辨率 3.45 Å
6D6R Human nuclear exosome-MTR4 RNA complex - composite map after focused reconstruction 提交 2018-04-22	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：pentadecameric	链 F 1–272（272 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；30 sec wait time, 2.5 sec blot time	分辨率 3.45 Å
6H25 Human nuclear RNA exosome EXO-10-MPP6 complex 提交 2018-07-13	聚集状态不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：dodecameric	链 F 1–272（272 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.80 Å
9G8M human 80S ribosome bound by a SKI2-exosome complex 提交 2024-07-23	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 87 PDB 声明：92-meric	链 G 1–272（272 aa）链 H 181–272（92 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 232 ZN ZINC ION × 6	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.30 Å
9G8O human 40S ribosome bound by a SKI238-exosome complex 提交 2024-07-23	聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 49 PDB 声明：51-meric	链 G 1–272（272 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.40 Å
9G8P 40S-bound human SKI2-exosome complex 提交 2024-07-23	实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：13-meric	链 G 1–272（272 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 7.00 Å

共 7 个其他 PDB 条目、7 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	EXOS6_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	9
链与序列区间	作者链 G； PDB构建体 1–272； UniProt 1–272

Exosome complex component RRP4

Homo sapiens

UniProt Q13868

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白–RNA 异源复合物蛋白 × 12 RNA 1 PDB 声明：13-meric（13）与全部聚合物数一致	链 I； UniProt 1–293	未记录	Exosome complex component RRP41 × 1 （Q9NPD3） Exosome complex component RRP43 × 1 （Q96B26） Exosome complex component RRP46 × 1 （Q9NQT4） Exosome complex component RRP42 × 1 （Q15024） Exosome complex component RRP40 × 1 （Q9NQT5） Exosome complex component CSL4 × 1 （Q9Y3B2） CrPV-IRES RNA × 1 Helicase SKI2W × 1 （Q15477） Exosome complex component MTR3 × 1 （Q5RKV6） Isoform 2 of HBS1-like protein × 1 （Q9Y450） Exosome complex component RRP45 × 1 （Q06265） DIS3-like exonuclease 1 × 1 （Q8TF46）	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.70 Å

数据库中的同蛋白其他状态

其他 PDB	相对当前条目 9G8N	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
2NN6 Structure of the human RNA exosome composed of Rrp41, Rrp45, Rrp46, Rrp43, Mtr3, Rrp42, Csl4, Rrp4, and Rrp40 提交 2006-10-23	聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric	链 H 1–293（293 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；291 K；4.5-8% w/v PEG4000, 0.1M Sodium citrate, 1 mM TCEP, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K	分辨率 3.35 Å R-free 0.344
6D6Q Human nuclear exosome-MTR4 RNA complex - overall reconstruction 提交 2018-04-22	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：pentadecameric	链 H 1–293（293 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 1 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；30 sec wait time, 2.5 sec blot time	分辨率 3.45 Å
6D6R Human nuclear exosome-MTR4 RNA complex - composite map after focused reconstruction 提交 2018-04-22	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：pentadecameric	链 H 1–293（293 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；30 sec wait time, 2.5 sec blot time	分辨率 3.45 Å
6H25 Human nuclear RNA exosome EXO-10-MPP6 complex 提交 2018-07-13	聚集状态不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：dodecameric	链 H 1–293（293 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.80 Å
9G8M human 80S ribosome bound by a SKI2-exosome complex 提交 2024-07-23	聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 87 PDB 声明：92-meric	链 I 1–293（293 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 232 ZN ZINC ION × 6	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.30 Å
9G8O human 40S ribosome bound by a SKI238-exosome complex 提交 2024-07-23	聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 49 PDB 声明：51-meric	链 I 1–293（293 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.40 Å
9G8P 40S-bound human SKI2-exosome complex 提交 2024-07-23	实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：13-meric	链 I 1–293（293 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 7.00 Å

共 7 个其他 PDB 条目、7 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	EXOS2_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	10
链与序列区间	作者链 I； PDB构建体 5–297； UniProt 1–293

Isoform 2 of HBS1-like protein

Homo sapiens

UniProt Q9Y450

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白–RNA 异源复合物蛋白 × 12 RNA 1 PDB 声明：13-meric（13）与全部聚合物数一致	链 E； UniProt 369–632	未记录	Exosome complex component RRP41 × 1 （Q9NPD3） Exosome complex component RRP43 × 1 （Q96B26） Exosome complex component RRP46 × 1 （Q9NQT4） Exosome complex component RRP42 × 1 （Q15024） Exosome complex component RRP40 × 1 （Q9NQT5） Exosome complex component CSL4 × 1 （Q9Y3B2） CrPV-IRES RNA × 1 Helicase SKI2W × 1 （Q15477） Exosome complex component MTR3 × 1 （Q5RKV6） Exosome complex component RRP4 × 1 （Q13868） Exosome complex component RRP45 × 1 （Q06265） DIS3-like exonuclease 1 × 1 （Q8TF46）	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.70 Å

数据库中的同蛋白其他状态

其他 PDB	相对当前条目 9G8N	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
10AY Cryo-EM structure of CRBN-DDB1 in complex with HBS1L and TNG961 提交 2026-01-09	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 A 478–684（207 aa）片段：domain 2 + domain 3 链 D 478–684（207 aa）片段：domain 2 + domain 3	未记录	A1C4S N-{6-[(3R)-2,6-dioxopiperidin-3-yl]naphthalen-1-yl}-N'-{2-[6-(trifluoromethyl)-1-benzothiophen-2-yl]propan-2-yl}urea × 2 ZN ZINC ION × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5；0.1 M HEPES (pH 7.5), 0.24 M sodium chloride, 3 mM TCEP, 0.2 % n-octylglucoside cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.90 Å
11MR Cryo-EM structure of CRBN in complex with HBS1L and TNG-4857 (focused refinement) 提交 2026-03-05	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 478–684（207 aa）片段：domain 2 + domain 3 链 C 478–684（207 aa）片段：domain 2 + domain 3	未记录	ZN ZINC ION × 2 A1C9W N-[(3S)-2,6-dioxopiperidin-3-yl]-2-fluoro-3-[(2-{4-[1-(trifluoromethyl)cyclopropyl]phenyl}propan-2-yl)carbamamido]benzamide × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5；10 mM HEPES (pH 7.5), 240 mM NaCl, 3 mM TCEP cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.60 Å
5LZW Structure of the mammalian rescue complex with Pelota and Hbs1l assembled on a truncated mRNA. 提交 2016-10-02	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric	链 jj 1–684（684 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 281 ZN ZINC ION × 8 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.	分辨率 3.53 Å
5LZX Structure of the mammalian rescue complex with Pelota and Hbs1l assembled on a UGA stop codon. 提交 2016-10-02	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric	链 jj 1–684（684 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 264 ZN ZINC ION × 8 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.	分辨率 3.67 Å
5LZY Structure of the mammalian rescue complex with Pelota and Hbs1l assembled on a polyadenylated mRNA. 提交 2016-10-02	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：86-meric	链 jj 1–684（684 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 236 ZN ZINC ION × 8 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.	分辨率 3.99 Å
5LZZ Structure of the mammalian rescue complex with Pelota and Hbs1l (combined) 提交 2016-10-02	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric	链 jj 1–684（684 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 264 ZN ZINC ION × 8 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.	分辨率 3.47 Å
9G8M human 80S ribosome bound by a SKI2-exosome complex 提交 2024-07-23	聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 87 PDB 声明：92-meric	链 E 369–632（264 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 232 ZN ZINC ION × 6	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.30 Å
9G8O human 40S ribosome bound by a SKI238-exosome complex 提交 2024-07-23	聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 49 PDB 声明：51-meric	链 E 369–632（264 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.40 Å
9G8P 40S-bound human SKI2-exosome complex 提交 2024-07-23	实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：13-meric	链 E 369–632（264 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 7.00 Å
9G8R human SKI7-SKI238 complex in the open state 提交 2024-07-23	构建体不同聚集状态不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric	链 E 372–546（175 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.40 Å

共 10 个其他 PDB 条目、10 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	HBS1L_HUMAN
Isoform	Q9Y450-2
PDB实体	11
链与序列区间	作者链 E； PDB构建体 5–268； UniProt 369–632

Exosome complex component RRP45

Homo sapiens

UniProt Q06265

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白–RNA 异源复合物蛋白 × 12 RNA 1 PDB 声明：13-meric（13）与全部聚合物数一致	链 K； UniProt 1–439	未记录	Exosome complex component RRP41 × 1 （Q9NPD3） Exosome complex component RRP43 × 1 （Q96B26） Exosome complex component RRP46 × 1 （Q9NQT4） Exosome complex component RRP42 × 1 （Q15024） Exosome complex component RRP40 × 1 （Q9NQT5） Exosome complex component CSL4 × 1 （Q9Y3B2） CrPV-IRES RNA × 1 Helicase SKI2W × 1 （Q15477） Exosome complex component MTR3 × 1 （Q5RKV6） Exosome complex component RRP4 × 1 （Q13868） Isoform 2 of HBS1-like protein × 1 （Q9Y450） DIS3-like exonuclease 1 × 1 （Q8TF46）	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.70 Å

数据库中的同蛋白其他状态

其他 PDB	相对当前条目 9G8N	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
6D6Q Human nuclear exosome-MTR4 RNA complex - overall reconstruction 提交 2018-04-22	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：pentadecameric	链 A 1–456（456 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 1 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；30 sec wait time, 2.5 sec blot time	分辨率 3.45 Å
6D6R Human nuclear exosome-MTR4 RNA complex - composite map after focused reconstruction 提交 2018-04-22	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：pentadecameric	链 A 1–456（456 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；30 sec wait time, 2.5 sec blot time	分辨率 3.45 Å
6H25 Human nuclear RNA exosome EXO-10-MPP6 complex 提交 2018-07-13	聚集状态不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：dodecameric	链 A 1–439（439 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.80 Å
9G8M human 80S ribosome bound by a SKI2-exosome complex 提交 2024-07-23	聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 87 PDB 声明：92-meric	链 K 1–439（439 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 232 ZN ZINC ION × 6	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.30 Å
9G8O human 40S ribosome bound by a SKI238-exosome complex 提交 2024-07-23	聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 49 PDB 声明：51-meric	链 K 1–439（439 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.40 Å
9G8P 40S-bound human SKI2-exosome complex 提交 2024-07-23	实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：13-meric	链 K 1–439（439 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 7.00 Å

共 6 个其他 PDB 条目、6 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	EXOS9_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	12
链与序列区间	作者链 K； PDB构建体 5–443； UniProt 1–439

DIS3-like exonuclease 1

Homo sapiens

UniProt Q8TF46

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白–RNA 异源复合物蛋白 × 12 RNA 1 PDB 声明：13-meric（13）与全部聚合物数一致	链 M； UniProt 1–1054	未记录	Exosome complex component RRP41 × 1 （Q9NPD3） Exosome complex component RRP43 × 1 （Q96B26） Exosome complex component RRP46 × 1 （Q9NQT4） Exosome complex component RRP42 × 1 （Q15024） Exosome complex component RRP40 × 1 （Q9NQT5） Exosome complex component CSL4 × 1 （Q9Y3B2） CrPV-IRES RNA × 1 Helicase SKI2W × 1 （Q15477） Exosome complex component MTR3 × 1 （Q5RKV6） Exosome complex component RRP4 × 1 （Q13868） Isoform 2 of HBS1-like protein × 1 （Q9Y450） Exosome complex component RRP45 × 1 （Q06265）	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.70 Å

数据库中的同蛋白其他状态

其他 PDB	相对当前条目 9G8N	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
9G8M human 80S ribosome bound by a SKI2-exosome complex 提交 2024-07-23	聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 87 PDB 声明：92-meric	链 M 1–1054（1054 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 232 ZN ZINC ION × 6	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.30 Å
9G8O human 40S ribosome bound by a SKI238-exosome complex 提交 2024-07-23	聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 49 PDB 声明：51-meric	链 M 1–1054（1054 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.40 Å
9G8P 40S-bound human SKI2-exosome complex 提交 2024-07-23	实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：13-meric	链 M 1–1054（1054 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 7.00 Å

共 3 个其他 PDB 条目、3 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	DI3L1_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	13
链与序列区间	作者链 M； PDB构建体 3–1056； UniProt 1–1054

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

下载 Download SAXS (.dat) P(r) (.pr.out) CIF

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	9g8n
沉积日期 deposition_date	2024-07-23
结构标题 title	80S-bound human Ski2-exosome complex
关键词 keywords	Ribosome, RNase, Helicase, RNA-binding, mRNA-degradation, cytoplasm; RIBOSOME
实验方法 method	ELECTRON MICROSCOPY

▼

3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier	61.18 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron	61.83 Å
零角强度 I(0) i0	3585910000.00
分子量 molecular_weight	491260.0 kDa
排除体积 excluded_volume	610950 Å³
包络体积 envelope_volume	988150 Å³
水化壳体积 shell_volume	135650 Å³
包络直径 envelope_diameter	248.3 Å
壳层 Rg shell_rg	61.67 Å
包络 Rg envelope_rg	62.28 Å
形状 Rg shape_rg	61.88 Å
总 Rg total_rg	61.65 Å
总原子数 total_atoms	34405
残基数 n_residues	4348
球谐函数阶数 n_harmonics	20
q 范围 q_range	— – 0.5000 Å⁻¹
数据点数 n_points	101
壳层类型 shell_type	directional
溶剂电子密度 solvent_density	0.3340 e/Å³
壳层衬度 contrast_shell	0.0300 e/Å³
CRYSOL 版本 crysol_version	4.1.3

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4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax	218.5 Å
Rg (实空间) rg_real	61.58 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error	1.69 Å
I(0) (实空间) i0_real	3.5840e+09
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error	7.6650e+07
Rg (倒空间) rg_reciprocal	60.78 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal	3581000000.0000
解质量估计 total_estimate	0.8322
解质量评级 solution_quality	GOOD a GOOD solution
P(r) 峰数 n_peaks	2
主峰位置 r_peak_primary	67.2 Å
偏度 Skewness skewness	0.648
峰度 Kurtosis kurtosis	0.294
角度范围 angular_range	— – 0.1300 Å⁻¹
当前正则化参数 α current_alpha	0.0071
最高正则化参数 α highest_alpha	410500000.0000
实空间数据点数 n_real_points	27
GNOM 版本 gnom_version	4.1.3
质量判据 quality_criteria	AN1: 0.000; Oscil: 0.668; Stabil: 1.000; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.995; Smooth: 0.814

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5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

▶

6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (13)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	Exosome complex component RRP41
分子量 formula_weight	26417.0 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	L
原子数 atom_count	34405

MAGLELLSDQGYRVDGRRAGELRKIQARMGVFAQADGSAYIEQGNTKALAVVYGPHEIRGSRARALPDRALVNCQYSSATFSTGERKRRPHGDRKSCEMGLQLRQTFEAAILTQLHPRSQIDIYVQVLQADGGTYAACVNAATLAVLDAGIPMRDFVCACSAGFVDGTALADLSHVEEAAGGPQLALALLPASGQIALLEMDARLHEDHLERVLEAAAQAARDVHTLLDRVVRQHVREASILLGD

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	Exosome complex component RRP43
分子量 formula_weight	30429.9 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	N

GPDSMAAGFKTVEPLEYYRRFLKENCRPDGRELGEFRTTTVNIGSISTADGSALVKLGNTTVICGVKAEFAAPSTDAPDKGYVVPNVDLPPLCSSRFRSGPPGEEAQVASQFIADVIENSQIIQKEDLCISPGKLVWVLYCDLICLDYDGNILDACTFALLAALKNVQLPEVTINEETALAEVNLKKKSYLNIRTHPVATSFAVFDDTLLIVDPTGEEEHLATGTLTIVMDEEGKLCCLHKPGGSGLTGAKLQDCMSRAVTRHKEVKKLMDEVIKSMKPK

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 3 Entity 3 polymer

描述 description	Exosome complex component RRP46
分子量 formula_weight	25636.3 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	O

GPDSMEEETHTDAKIRAENGTGSSPRGPGCSLRHFACEQNLLSRPDGSASFLQGDTSVLAGVYGPAEVKVSKEIFNKATLEVILRPKIGLPGVAEKSRERLIRNTCEAVVLGTLHPRTSITVVLQVVSDAGSLLACCLNAACMALVDAGVPMRALFCGVACALDSDGTLVLDPTSKQEKEARAVLTFALDSVERKLLMSSTKGLYSDTELQQCLAAAQAASQHVFRFYRESLQRRYSKS

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 4 Entity 4 polymer

描述 description	Exosome complex component RRP42
分子量 formula_weight	32216.8 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	F

GPDSMASVTLSEAEKVYIVHGVQEDLRVDGRGCEDYRCVEVETDVVSNTSGSARVKLGHTDILVGVKAEMGTPKLEKPNEGYLEFFVDCSASATPEFEGRGGDDLGTEIANTLYRIFNNKSSVDLKTLCISPREHCWVLYVDVLLLECGGNLFDAISIAVKAALFNTRIPRVRVLEDEEGSKDIELSDDPYDCIRLSVENVPCIVTLCKIGYRHVVDATLQEEACSLASLLVSVTSKGVVTCMRKVGKGSLDPESIFEMMETGKRVGKVLHASLQSVVHKEESLGPKRQKVGFLG

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 5 Entity 5 polymer

描述 description	Exosome complex component RRP40
分子量 formula_weight	29940.5 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	H

GPDSMAEPASVAAESLAGSRARAARTVLGQVVLPGEELLLPEQEDAEGPGGAVERPLSLNARACSRVRVVCGPGLRRCGDRLLVTKCGRLRHKEPGSGSGGGVYWVDSQQKRYVPVKGDHVIGIVTAKSGDIFKVDVGGSEPASLSYLSFEGATKRNRPNVQVGDLIYGQFVVANKDMEPEMVCIDSCGRANGMGVIGQDGLLFKVTLGLIRKLLAPDCEIIQEVGKLHPLEIVFGMNGRIWVKAKTIQQTLILANILEACEHMTSDQRKQIFSRLAES

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 6 Entity 6 polymer

描述 description	Exosome complex component CSL4
分子量 formula_weight	21835.1 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	J

GPDSMAPPVRYCIPGERLCNLEEGSPGSGTYTRHGYIFSSLAGCLMKSSENGALPVVSVVRETESQLLPDVGAIVTCKVSSINSRFAKVHILYVGSMPLKNSFRGTIRKEDVRATEKDKVEIYKSFRPGDIVLAKVISLGDAQSNYLLTTAENELGVVVAHSESGIQMVPISWCEMQCPKTHTKEFRKVARVQPEFLQT

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 7 Entity 7 polymer

描述 description	CrPV-IRES RNA
分子量 formula_weight	13422.4 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polyribonucleotide
链编号 strand_id	X

UUUUUUUUUUUUUUUUUUUUUUUUUUCUCCUCUUUUUUUUUUUU

实体 8 Entity 8 polymer

描述 description	Helicase SKI2W
分子量 formula_weight	137913.7 kDa
EC 编号 ec_number	3.6.4.-
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A

MMETERLVLPPPDPLDLPLRAVELGCTGHWELLNLPGAPESSLPHGLPPCAPDLQQEAEQLFLSSPAWLPLHGVEHSARKWQRKTDPWSLLAVLGAPVPSDLQAQRHPTTGQILGYKEVLLENTNLSATTSLSLRRPPGPASQSLWGNPTQYPFWPGGMDEPTITDLNTREEAEEEIDFEKDLLTIPPGFKKGMDFAPKDCPTPAPGLLSLSCMLEPLDLGGGDEDENEAVGQPGGPRGDTVSASPCSAPLARASSLEDLVLKEASTAVSTPEAPEPPSQEQWAIPVDATSPVGDFYRLIPQPAFQWAFEPDVFQKQAILHLERHDSVFVAAHTSAGKTVVAEYAIALAQKHMTRTIYTSPIKALSNQKFRDFRNTFGDVGLLTGDVQLHPEASCLIMTTEILRSMLYSGSDVIRDLEWVIFDEVHYINDVERGVVWEEVLIMLPDHVSIILLSATVPNALEFADWIGRLKRRQIYVISTVTRPVPLEHYLFTGNSSKTQGELFLLLDSRGAFHTKGYYAAVEAKKERMSKHAQTFGAKQPTHQGGPAQDRGVYLSLLASLRTRAQLPVVVFTFSRGRCDEQASGLTSLDLTTSSEKSEIHLFLQRCLARLRGSDRQLPQVLHMSELLNRGLGVHHSGILPILKEIVEMLFSRGLVKVLFATETFAMGVNMPARTVVFDSMRKHDGSTFRDLLPGEYVQMAGRAGRRGLDPTGTVILLCKGRVPEMADLHRMMMGKPSQLQSQFRLTYTMILNLLRVDALRVEDMMKRSFSEFPSRKDSKAHEQALAELTKRLGALEEPDMTGQLVDLPEYYSWGEELTETQHMIQRRIMESVNGLKSLSAGRVVVVKNQEHHNALGVILQVSSNSTSRVFTTLVLCDKPLSQDPQDRGPATAEVPYPDDLVGFKLFLPEGPCDHTVVKLQPGDMAAITTKVLRVNGEKILEDFSKRQQPKFKKDPPLAAVTTAVQELLRLAQAHPAGPPTLDPVNDLQLKDMSVVEGGLRARKLEELIQGAQCVHSPRFPAQYLKLRERMQIQKEMERLRFLLSDQSLLLLPEYHQRVEVLRTLGYVDEAGTVKLAGRVACAMSSHELLLTELMFDNALSTLRPEEIAALLSGLVCQSPGDAGDQLPNTLKQGIERVRAVAKRIGEVQVACGLNQTVEEFVGELNFGLVEVVYEWARGMPFSELAGLSGTPEGLVVRCIQRLAEMCRSLRGAARLVGEPVLGAKMETAATLLRRDIVFAASLYTQ

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 9 Entity 9 polymer

描述 description	Exosome complex component MTR3
分子量 formula_weight	28267.1 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	G

MPGDHRRIRGPEESQPPQLYAADEEEAPGTRDPTRLRPVYARAGLLSQAKGSAYLEAGGTKVLCAVSGPRQAEGGERGGGPAGAGGEAPAALRGRLLCDFRRAPFAGRRRRAPPGGCEERELALALQEALEPAVRLGRYPRAQLEVSALLLEDGGSALAAALTAAALALADAGVEMYDLVVGCGLSLAPGPAPTWLLDPTRLEEERAAAGLTVALMPVLNQVAGLLGSGEGGLTESWAEAVRLGLEGCQRLYPVLQQSLVRAARRRGAAAQP

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 10 Entity 10 polymer

描述 description	Exosome complex component RRP4
分子量 formula_weight	33190.4 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	I

GPDSMAMEMRLPVARKPLSERLGRDTKKHLVVPGDTITTDTGFMRGHGTYMGEEKLIASVAGSVERVNKLICVKALKTRYIGEVGDIVVGRITEVQQKRWKVETNSRLDSVLLLSSMNLPGGELRRRSAEDELAMRGFLQEGDLISAEVQAVFSDGAVSLHTRSLKYGKLGQGVLVQVSPSLVKRQKTHFHDLPCGASVILGNNGFIWIYPTPEHKEEEAGGFIANLEPVSLADREVISRLRNCIISLVTQRMMLYDTSILYCYEASLPHQIKDILKPEIMEEIVMETRQRLLEQEG

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 11 Entity 11 polymer

描述 description	Isoform 2 of HBS1-like protein
分子量 formula_weight	30196.1 kDa
EC 编号 ec_number	3.6.5.-
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	E

GPDSSQCESPSLTELFQEHKENNISQCFTLSDLCNQSSASFTDLSLGSFPLSQLANRCQSSPGISELTGSLSSLAFHKASPTRDLENLSLSELIAETIDVDNSQIKKESFEVSLSEVRSPGIDSNIDLSVLIKNPDFVPKPVVDPSIAPSSRTKVLSSKLGKNSNFAKDNKKNNKGSLTRKPPFSLSWTKALAARPSAFASTLCLRYPLKSCKRRTLDLYKTFLYSRQVQDVKDKEISPLVAITPFDFKSASPDDIVKANQKKAFTRELEVLFQ

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 12 Entity 12 polymer

描述 description	Exosome complex component RRP45
分子量 formula_weight	49370.3 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	K

GPDSMKETPLSNCERRFLLRAIEEKKRLDGRQTYDYRNIRISFGTDYGCCIVELGKTRVLGQVSCELVSPKLNRATEGILFFNLELSQMAAPAFEPGRQSDLLVKLNRLMERCLRNSKCIDTESLCVVAGEKVWQIRVDLHLLNHDGNIIDAASIAAIVALCHFRRPDVSVQGDEVTLYTPEERDPVPLSIHHMPICVSFAFFQQGTYLLVDPNEREERVMDGLLVIAMNKHREICTIQSSGGIMLLKDQVLRCSKIAGVKVAEITELILKALENDQKVRKEGGKFGFAESIANQRITAFKMEKAPIDTSDVEEKAEEIIAEAEPPSEVVSTPVLWTPGTAQIGEGVENSWGDLEDSEKEDDEGGGDQAIILDGIKMDTGVEVSDIGSQDAPIILSDSEEEEMIILEPDKNPKKIRTQTTSAKQEKAPSKKPVKRRKKKRAAN

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 13 Entity 13 polymer

描述 description	DIS3-like exonuclease 1
分子量 formula_weight	121108.6 kDa
EC 编号 ec_number	3.1.13.1
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	M

GPMLQKREKVLLLRTFQGRTLRIVREHYLRPCVPCHSPLCPQPAACSHDGKLLSSDVTHYVIPDWKVVQDYLEILEFPELKGIIFMQTACQAVQHQRGRRQYNKLRNLLKDARHDCILFANEFQQCCYLPRERGESMEKWQTRSIYNAAVWYYHHCQDRMPIVMVTEDEEAIQQYGSETEGVFVITFKNYLDNFWPDLKAAHELCDSILQSRRERENESQESHGKEYPEHLPLEVLEAGIKSGRYIQGILNVNKHRAQIEAFVRLQGASSKDSDLVSDILIHGMKARNRSIHGDVVVVELLPKNEWKGRTVALCENDCDDKASGESPSEPMPTGRVVGILQKNWRDYVVTFPSKEEVQSQGKNAQKILVTPWDYRIPKIRISTQQAETLQDFRVVVRIDSWESTSVYPNGHFVRVLGRIGDLEGEIATILVENSISVIPFSEAQMCEMPVNTPESPWKVSPEEEQKRKDLRKSHLVFSIDPKGCEDVNDTLSVRTLNNGNLELGVHIADVTHFVAPNSYIDIEARTRATTYYLADRRYDMLPSVLSADLCSLLGGVDRYAVSIMWELDKASYEIKKVWYGRTIIRSAYKLFYEAAQELLDGNLSVVDDIPEFKDLDEKSRQAKLEELVWAIGKLTDIARHVRAKRDGCGALELEGVEVCVQLDDKKNIHDLIPKQPLEVHETVAECMILANHWVAKKIWESFPHQALLRQHPPPHQEFFSELRECAKAKGFFIDTRSNKTLADSLDNANDPHDPIVNRLLRSMATQAMSNALYFSTGSCAEEEFHHYGLALDKYTHFTSPIRRYSDIVVHRLLMAAISKDKKMEIKGNLFSNKDLEELCRHINNRNQAAQHSQKQSTELFQCMYFKDKDPATEERCISDGVIYSIRTNGVLLFIPRFGIKGAAYLKNKDGLVISCGPDSCSEWKPGSLQRFQNKITSTTTDGESVTFHLFDHVTVRISIQASRCHSDTIRLEIISNKPYKIPNTELIHQSSPLLKSELVKEVTKSVEEAQLAQEVKVNIIQEEYQEYRQTKGRSLYTLLEEIRDLALLDVSNNYGI

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

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8. 引用文献 (1)

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晶胞边长 a length_a	1.000 Å
晶胞边长 b length_b	1.000 Å
晶胞边长 c length_c	1.000 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	—

空间群 space_group	P 1
空间群编号 int_tables_number	1
晶系 crystal_system	triclinic

分辨率 resolution	3.70 Å
分辨率测定方法 resolution_method	—
颗粒数 num_particles	79353

fit	/app/data/saxs_computation/g8/9g8n/9g8n.fit
pddf	/app/data/pr_computation/g8/9g8n/9g8n.pr.out
profile	/app/data/saxs_computation/g8/9g8n/9g8n.dat

80S-bound human Ski2-exosome complex

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Exosome complex component RRP41

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Exosome complex component RRP43

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Exosome complex component RRP46

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Exosome complex component RRP42

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Exosome complex component RRP40

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Exosome complex component CSL4

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Helicase SKI2W

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Exosome complex component MTR3

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Exosome complex component RRP4

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Isoform 2 of HBS1-like protein

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Exosome complex component RRP45

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

DIS3-like exonuclease 1

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

冷冻电镜 EM 3D

6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (13)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 4 Entity 4 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 5 Entity 5 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 6 Entity 6 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 7 Entity 7 polymer

聚合物 Polymer

实体 8 Entity 8 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 9 Entity 9 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 10 Entity 10 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 11 Entity 11 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source